Result of FASTA (ccds) for
pF1KB9097
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9097, 1366 aa
1>>>pF1KB9097 1366 - 1366 aa - 1366 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.1058+/-0.00164; mu= 0.8091+/- 0.096
mean_var=507.2278+/-114.259, 0's: 0 Z-trim(107.2): 347 B-trim: 82 in 1/51
Lambda= 0.056947
statistics sampled from 9092 (9427) to 9092 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.637), E-opt: 0.2 (0.29), width: 16
Scan time: 4.370
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS73785.1 IGF1R gene_id:3480|Hs108|chr15 (1366) 9360 786.4 0
CCDS10378.1 IGF1R gene_id:3480|Hs108|chr15 (1367) 9340 784.7 0
CCDS42487.1 INSR gene_id:3643|Hs108|chr19 (1370) 4162 359.3 4.1e-98
CCDS12176.1 INSR gene_id:3643|Hs108|chr19 (1382) 2410 215.4 8.9e-55
CCDS1160.1 INSRR gene_id:3645|Hs108|chr1 (1297) 2325 208.4 1.1e-52
CCDS33172.1 ALK gene_id:238|Hs108|chr2 (1620) 939 94.6 2.3e-18
CCDS10078.1 LTK gene_id:4058|Hs108|chr15 ( 803) 889 90.1 2.7e-17
CCDS10077.1 LTK gene_id:4058|Hs108|chr15 ( 864) 889 90.1 2.8e-17
CCDS5116.1 ROS1 gene_id:6098|Hs108|chr6 (2347) 899 91.6 2.8e-17
CCDS35050.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9 ( 822) 847 86.7 3e-16
CCDS6671.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9 ( 838) 847 86.7 3e-16
CCDS30890.1 NTRK1 gene_id:4914|Hs108|chr1 ( 760) 836 85.7 5.3e-16
CCDS30891.1 NTRK1 gene_id:4914|Hs108|chr1 ( 790) 836 85.7 5.4e-16
CCDS1161.1 NTRK1 gene_id:4914|Hs108|chr1 ( 796) 836 85.7 5.5e-16
CCDS58399.1 NTRK3 gene_id:4916|Hs108|chr15 ( 817) 819 84.4 1.5e-15
CCDS10340.1 NTRK3 gene_id:4916|Hs108|chr15 ( 825) 819 84.4 1.5e-15
CCDS62677.1 AXL gene_id:558|Hs108|chr19 ( 626) 794 82.1 5.2e-15
CCDS12574.1 AXL gene_id:558|Hs108|chr19 ( 885) 794 82.4 6.3e-15
CCDS12575.1 AXL gene_id:558|Hs108|chr19 ( 894) 794 82.4 6.4e-15
CCDS45237.1 LTK gene_id:4058|Hs108|chr15 ( 734) 772 80.4 2e-14
CCDS2094.1 MERTK gene_id:10461|Hs108|chr2 ( 999) 759 79.6 5e-14
CCDS81866.1 TYRO3 gene_id:7301|Hs108|chr15 ( 845) 755 79.1 5.7e-14
CCDS10080.1 TYRO3 gene_id:7301|Hs108|chr15 ( 890) 755 79.2 5.9e-14
CCDS2922.1 EPHA3 gene_id:2042|Hs108|chr3 ( 983) 756 79.3 5.9e-14
CCDS169.1 EPHA2 gene_id:1969|Hs108|chr1 ( 976) 754 79.1 6.6e-14
CCDS2447.1 EPHA4 gene_id:2043|Hs108|chr2 ( 986) 720 76.3 4.6e-13
CCDS5706.1 EPHB4 gene_id:2050|Hs108|chr7 ( 987) 717 76.1 5.4e-13
CCDS43731.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 731) 710 75.3 6.8e-13
CCDS43730.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 733) 710 75.3 6.8e-13
CCDS43636.1 MET gene_id:4233|Hs108|chr7 (1390) 716 76.2 7e-13
CCDS47689.1 MET gene_id:4233|Hs108|chr7 (1408) 716 76.2 7e-13
CCDS55221.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 812) 710 75.4 7.2e-13
CCDS43732.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 820) 710 75.4 7.3e-13
CCDS55222.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 820) 710 75.4 7.3e-13
CCDS6107.2 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 822) 710 75.4 7.3e-13
CCDS55223.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 853) 710 75.4 7.4e-13
CCDS3268.1 EPHB3 gene_id:2049|Hs108|chr3 ( 998) 704 75.0 1.1e-12
CCDS78096.1 FGFR4 gene_id:2264|Hs108|chr5 ( 734) 695 74.1 1.6e-12
CCDS4411.1 FGFR4 gene_id:2264|Hs108|chr5 ( 762) 695 74.1 1.6e-12
CCDS626.1 ROR1 gene_id:4919|Hs108|chr1 ( 937) 697 74.4 1.6e-12
CCDS4410.1 FGFR4 gene_id:2264|Hs108|chr5 ( 802) 695 74.2 1.7e-12
CCDS3354.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4 ( 694) 693 73.9 1.7e-12
CCDS3353.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4 ( 806) 693 74.0 1.9e-12
CCDS54706.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4 ( 808) 693 74.0 1.9e-12
CCDS81514.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 593) 680 72.7 3.3e-12
CCDS44485.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 704) 680 72.9 3.7e-12
CCDS44487.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 705) 680 72.9 3.7e-12
CCDS44486.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 709) 680 72.9 3.7e-12
CCDS82777.1 MST1R gene_id:4486|Hs108|chr3 (1294) 686 73.7 3.7e-12
CCDS73210.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 732) 680 72.9 3.8e-12
>>CCDS73785.1 IGF1R gene_id:3480|Hs108|chr15 (1366 aa)
initn: 9360 init1: 9360 opt: 9360 Z-score: 4182.9 bits: 786.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 9360; 100.0% identity (100.0% similar) in 1366 aa overlap (1-1366:1-1366)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MKSGSGGGSPTSLWGLLFLSAALSLWPTSGEICGPGIDIRNDYQQLKRLENCTVIEGYLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 MKSGSGGGSPTSLWGLLFLSAALSLWPTSGEICGPGIDIRNDYQQLKRLENCTVIEGYLH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 ILLISKAEDYRSYRFPKLTVITEYLLLFRVAGLESLGDLFPNLTVIRGWKLFYNYALVIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 ILLISKAEDYRSYRFPKLTVITEYLLLFRVAGLESLGDLFPNLTVIRGWKLFYNYALVIF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 EMTNLKDIGLYNLRNITRGAIRIEKNADLCYLSTVDWSLILDAVSNNYIVGNKPPKECGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 EMTNLKDIGLYNLRNITRGAIRIEKNADLCYLSTVDWSLILDAVSNNYIVGNKPPKECGD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 LCPGTMEEKPMCEKTTINNEYNYRCWTTNRCQKMCPSTCGKRACTENNECCHPECLGSCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 LCPGTMEEKPMCEKTTINNEYNYRCWTTNRCQKMCPSTCGKRACTENNECCHPECLGSCS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 APDNDTACVACRHYYYAGVCVPACPPNTYRFEGWRCVDRDFCANILSAESSDSEGFVIHD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 APDNDTACVACRHYYYAGVCVPACPPNTYRFEGWRCVDRDFCANILSAESSDSEGFVIHD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 GECMQECPSGFIRNGSQSMYCIPCEGPCPKVCEEEKKTKTIDSVTSAQMLQGCTIFKGNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 GECMQECPSGFIRNGSQSMYCIPCEGPCPKVCEEEKKTKTIDSVTSAQMLQGCTIFKGNL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 LINIRRGNNIASELENFMGLIEVVTGYVKIRHSHALVSLSFLKNLRLILGEEQLEGNYSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 LINIRRGNNIASELENFMGLIEVVTGYVKIRHSHALVSLSFLKNLRLILGEEQLEGNYSF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 YVLDNQNLQQLWDWDHRNLTIKAGKMYFAFNPKLCVSEIYRMEEVTGTKGRQSKGDINTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 YVLDNQNLQQLWDWDHRNLTIKAGKMYFAFNPKLCVSEIYRMEEVTGTKGRQSKGDINTR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 NNGERASCESDVLHFTSTTTSKNRIIITWHRYRPPDYRDLISFTVYYKEAPFKNVTEYDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 NNGERASCESDVLHFTSTTTSKNRIIITWHRYRPPDYRDLISFTVYYKEAPFKNVTEYDG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB9 QDACGSNSWNMVDVDLPPNKDVEPGILLHGLKPWTQYAVYVKAVTLTMVENDHIRGAKSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 QDACGSNSWNMVDVDLPPNKDVEPGILLHGLKPWTQYAVYVKAVTLTMVENDHIRGAKSE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB9 ILYIRTNASVPSIPLDVLSASNSSSQLIVKWNPPSLPNGNLSYYIVRWQRQPQDGYLYRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 ILYIRTNASVPSIPLDVLSASNSSSQLIVKWNPPSLPNGNLSYYIVRWQRQPQDGYLYRH
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB9 NYCSKDKIPIRKYADGTIDIEEVTENPKTEVCGGEKGPCCACPKTEAEKQAEKEEAEYRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 NYCSKDKIPIRKYADGTIDIEEVTENPKTEVCGGEKGPCCACPKTEAEKQAEKEEAEYRK
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB9 VFENFLHNSIFVPRPERKRRDVMQVANTTMSSRSRNTTAADTYNITDPEELETEYPFFES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 VFENFLHNSIFVPRPERKRRDVMQVANTTMSSRSRNTTAADTYNITDPEELETEYPFFES
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB9 RVDNKERTVISNLRPFTLYRIDIHSCNHEAEKLGCSASNFVFARTMPAEGADDIPGPVTW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 RVDNKERTVISNLRPFTLYRIDIHSCNHEAEKLGCSASNFVFARTMPAEGADDIPGPVTW
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB9 EPRPENSIFLKWPEPENPNGLILMYEIKYGSQVEDQRECVSRQEYRKYGGAKLNRLNPGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 EPRPENSIFLKWPEPENPNGLILMYEIKYGSQVEDQRECVSRQEYRKYGGAKLNRLNPGN
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB9 YTARIQATSLSGNGSWTDPVFFYVQAKRYENFIHLIIALPVAVLLIVGGLVIMLYVFHRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 YTARIQATSLSGNGSWTDPVFFYVQAKRYENFIHLIIALPVAVLLIVGGLVIMLYVFHRK
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB9 RNNSRLGNGVLYASVNPEYFSAADVYVPDEWEVAREKITMSRELGQGSFGMVYEGVAKGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 RNNSRLGNGVLYASVNPEYFSAADVYVPDEWEVAREKITMSRELGQGSFGMVYEGVAKGV
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB9 VKDEPETRVAIKTVNEAASMRERIEFLNEASVMKEFNCHHVVRLLGVVSQGQPTLVIMEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 VKDEPETRVAIKTVNEAASMRERIEFLNEASVMKEFNCHHVVRLLGVVSQGQPTLVIMEL
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB9 MTRGDLKSYLRSLRPEMENNPVLAPPSLSKMIQMAGEIADGMAYLNANKFVHRDLAARNC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 MTRGDLKSYLRSLRPEMENNPVLAPPSLSKMIQMAGEIADGMAYLNANKFVHRDLAARNC
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KB9 MVAEDFTVKIGDFGMTRDIYETDYYRKGGKGLLPVRWMSPESLKDGVFTTYSDVWSFGVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 MVAEDFTVKIGDFGMTRDIYETDYYRKGGKGLLPVRWMSPESLKDGVFTTYSDVWSFGVV
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KB9 LWEIATLAEQPYQGLSNEQVLRFVMEGGLLDKPDNCPDMLFELMRMCWQYNPKMRPSFLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 LWEIATLAEQPYQGLSNEQVLRFVMEGGLLDKPDNCPDMLFELMRMCWQYNPKMRPSFLE
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KB9 IISSIKEEMEPGFREVSFYYSEENKLPEPEELDLEPENMESVPLDPSASSSSLPLPDRHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 IISSIKEEMEPGFREVSFYYSEENKLPEPEELDLEPENMESVPLDPSASSSSLPLPDRHS
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360
pF1KB9 GHKAENGPGPGVLVLRASFDERQPYAHMNGGRKNERALPLPQSSTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 GHKAENGPGPGVLVLRASFDERQPYAHMNGGRKNERALPLPQSSTC
1330 1340 1350 1360
>>CCDS10378.1 IGF1R gene_id:3480|Hs108|chr15 (1367 aa)
initn: 6428 init1: 6428 opt: 9340 Z-score: 4174.0 bits: 784.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 9340; 99.9% identity (99.9% similar) in 1367 aa overlap (1-1366:1-1367)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MKSGSGGGSPTSLWGLLFLSAALSLWPTSGEICGPGIDIRNDYQQLKRLENCTVIEGYLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MKSGSGGGSPTSLWGLLFLSAALSLWPTSGEICGPGIDIRNDYQQLKRLENCTVIEGYLH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 ILLISKAEDYRSYRFPKLTVITEYLLLFRVAGLESLGDLFPNLTVIRGWKLFYNYALVIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ILLISKAEDYRSYRFPKLTVITEYLLLFRVAGLESLGDLFPNLTVIRGWKLFYNYALVIF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 EMTNLKDIGLYNLRNITRGAIRIEKNADLCYLSTVDWSLILDAVSNNYIVGNKPPKECGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 EMTNLKDIGLYNLRNITRGAIRIEKNADLCYLSTVDWSLILDAVSNNYIVGNKPPKECGD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 LCPGTMEEKPMCEKTTINNEYNYRCWTTNRCQKMCPSTCGKRACTENNECCHPECLGSCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LCPGTMEEKPMCEKTTINNEYNYRCWTTNRCQKMCPSTCGKRACTENNECCHPECLGSCS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 APDNDTACVACRHYYYAGVCVPACPPNTYRFEGWRCVDRDFCANILSAESSDSEGFVIHD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 APDNDTACVACRHYYYAGVCVPACPPNTYRFEGWRCVDRDFCANILSAESSDSEGFVIHD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 GECMQECPSGFIRNGSQSMYCIPCEGPCPKVCEEEKKTKTIDSVTSAQMLQGCTIFKGNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GECMQECPSGFIRNGSQSMYCIPCEGPCPKVCEEEKKTKTIDSVTSAQMLQGCTIFKGNL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 LINIRRGNNIASELENFMGLIEVVTGYVKIRHSHALVSLSFLKNLRLILGEEQLEGNYSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LINIRRGNNIASELENFMGLIEVVTGYVKIRHSHALVSLSFLKNLRLILGEEQLEGNYSF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 YVLDNQNLQQLWDWDHRNLTIKAGKMYFAFNPKLCVSEIYRMEEVTGTKGRQSKGDINTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 YVLDNQNLQQLWDWDHRNLTIKAGKMYFAFNPKLCVSEIYRMEEVTGTKGRQSKGDINTR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 NNGERASCESDVLHFTSTTTSKNRIIITWHRYRPPDYRDLISFTVYYKEAPFKNVTEYDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 NNGERASCESDVLHFTSTTTSKNRIIITWHRYRPPDYRDLISFTVYYKEAPFKNVTEYDG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB9 QDACGSNSWNMVDVDLPPNKDVEPGILLHGLKPWTQYAVYVKAVTLTMVENDHIRGAKSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QDACGSNSWNMVDVDLPPNKDVEPGILLHGLKPWTQYAVYVKAVTLTMVENDHIRGAKSE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB9 ILYIRTNASVPSIPLDVLSASNSSSQLIVKWNPPSLPNGNLSYYIVRWQRQPQDGYLYRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ILYIRTNASVPSIPLDVLSASNSSSQLIVKWNPPSLPNGNLSYYIVRWQRQPQDGYLYRH
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB9 NYCSKDKIPIRKYADGTIDIEEVTENPKTEVCGGEKGPCCACPKTEAEKQAEKEEAEYRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 NYCSKDKIPIRKYADGTIDIEEVTENPKTEVCGGEKGPCCACPKTEAEKQAEKEEAEYRK
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB9 VFENFLHNSIFVPRPERKRRDVMQVANTTMSSRSRNTTAADTYNITDPEELETEYPFFES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VFENFLHNSIFVPRPERKRRDVMQVANTTMSSRSRNTTAADTYNITDPEELETEYPFFES
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB9 RVDNKERTVISNLRPFTLYRIDIHSCNHEAEKLGCSASNFVFARTMPAEGADDIPGPVTW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RVDNKERTVISNLRPFTLYRIDIHSCNHEAEKLGCSASNFVFARTMPAEGADDIPGPVTW
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB9 EPRPENSIFLKWPEPENPNGLILMYEIKYGSQVEDQRECVSRQEYRKYGGAKLNRLNPGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 EPRPENSIFLKWPEPENPNGLILMYEIKYGSQVEDQRECVSRQEYRKYGGAKLNRLNPGN
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950
pF1KB9 YTARIQATSLSGNGSWTDPVFFYVQAKR-YENFIHLIIALPVAVLLIVGGLVIMLYVFHR
::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 YTARIQATSLSGNGSWTDPVFFYVQAKTGYENFIHLIIALPVAVLLIVGGLVIMLYVFHR
910 920 930 940 950 960
960 970 980 990 1000 1010
pF1KB9 KRNNSRLGNGVLYASVNPEYFSAADVYVPDEWEVAREKITMSRELGQGSFGMVYEGVAKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KRNNSRLGNGVLYASVNPEYFSAADVYVPDEWEVAREKITMSRELGQGSFGMVYEGVAKG
970 980 990 1000 1010 1020
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KB9 VVKDEPETRVAIKTVNEAASMRERIEFLNEASVMKEFNCHHVVRLLGVVSQGQPTLVIME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VVKDEPETRVAIKTVNEAASMRERIEFLNEASVMKEFNCHHVVRLLGVVSQGQPTLVIME
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KB9 LMTRGDLKSYLRSLRPEMENNPVLAPPSLSKMIQMAGEIADGMAYLNANKFVHRDLAARN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LMTRGDLKSYLRSLRPEMENNPVLAPPSLSKMIQMAGEIADGMAYLNANKFVHRDLAARN
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KB9 CMVAEDFTVKIGDFGMTRDIYETDYYRKGGKGLLPVRWMSPESLKDGVFTTYSDVWSFGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 CMVAEDFTVKIGDFGMTRDIYETDYYRKGGKGLLPVRWMSPESLKDGVFTTYSDVWSFGV
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KB9 VLWEIATLAEQPYQGLSNEQVLRFVMEGGLLDKPDNCPDMLFELMRMCWQYNPKMRPSFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VLWEIATLAEQPYQGLSNEQVLRFVMEGGLLDKPDNCPDMLFELMRMCWQYNPKMRPSFL
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1260 1270 1280 1290 1300 1310
pF1KB9 EIISSIKEEMEPGFREVSFYYSEENKLPEPEELDLEPENMESVPLDPSASSSSLPLPDRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 EIISSIKEEMEPGFREVSFYYSEENKLPEPEELDLEPENMESVPLDPSASSSSLPLPDRH
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1320 1330 1340 1350 1360
pF1KB9 SGHKAENGPGPGVLVLRASFDERQPYAHMNGGRKNERALPLPQSSTC
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SGHKAENGPGPGVLVLRASFDERQPYAHMNGGRKNERALPLPQSSTC
1330 1340 1350 1360
>>CCDS42487.1 INSR gene_id:3643|Hs108|chr19 (1370 aa)
initn: 3830 init1: 1796 opt: 4162 Z-score: 1874.9 bits: 359.3 E(32554): 4.1e-98
Smith-Waterman score: 5373; 58.0% identity (80.6% similar) in 1374 aa overlap (17-1364:21-1368)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MKSGSGGGSPTSLWGLLFLSAALSLWPTSGEICGPGIDIRNDYQQLKRLENCTVIE
:.:.:: :.: ::.: ::.::::. .:..::::.:::
CCDS42 MATGGRRGAAAAPLLVAVAALLLGAAGHLYP--GEVC-PGMDIRNNLTRLHELENCSVIE
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 GYLHILLI--SKAEDYRSYRFPKLTVITEYLLLFRVAGLESLGDLFPNLTVIRGWKLFYN
:.:.:::. .. ::.:. :::: .::.::::::: ::::: ::::::::::: .::.:
CCDS42 GHLQILLMFKTRPEDFRDLSFPKLIMITDYLLLFRVYGLESLKDLFPNLTVIRGSRLFFN
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 YALVIFEMTNLKDIGLYNLRNITRGAIRIEKNADLCYLSTVDWSLILDAVSNNYIVGNKP
::::::::..::..::::: :::::..::::: .::::.:.::: :::.: .:::: ::
CCDS42 YALVIFEMVHLKELGLYNLMNITRGSVRIEKNNELCYLATIDWSRILDSVEDNYIVLNKD
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 P-KECGDLCPGTMEEKPMCEKTTINNEYNYRCWTTNRCQKMCPSTCGKRACTENNECCHP
.::::.:::: . : : :.::... :::: ..:::.::. : ...:: .. :::
CCDS42 DNEECGDICPGTAKGKTNCPATVINGQFVERCWTHSHCQKVCPTICKSHGCTAEGLCCHS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 ECLGSCSAPDNDTACVACRHYYYAGVCVPACPPNTYRFEGWRCVDRDFCANIL-SAESSD
::::.:: ::. : :::::..: : :: .::: :.:. ::::. .:: .. . ..:
CCDS42 ECLGNCSQPDDPTKCVACRNFYLDGRCVETCPPPYYHFQDWRCVNFSFCQDLHHKCKNSR
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KB9 SEG---FVIHDGECMQECPSGFIRNGSQSMYCIPCEGPCPKVCEEEKKTKTIDSVTSAQM
.: .:::...:. :::::. : :... : :: :::::::. . ::::::::::
CCDS42 RQGCHQYVIHNNKCIPECPSGYTMN-SSNLLCTPCLGPCPKVCHLLEGEKTIDSVTSAQE
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB9 LQGCTIFKGNLLINIRRGNNIASELENFMGLIEVVTGYVKIRHSHALVSLSFLKNLRLIL
:.:::...:.:.:::: :::.:.::: .:::: ..::.:::.:.:::::::...::::
CCDS42 LRGCTVINGSLIINIRGGNNLAAELEANLGLIEEISGYLKIRRSYALVSLSFFRKLRLIR
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KB9 GEEQLEGNYSFYVLDNQNLQQLWDWDHRNLTIKAGKMYFAFNPKLCVSEIYRMEEVTGTK
:: ::::::.::::::.:::::...:::: ::..: .:::::.:::..::::.:::
CCDS42 GETLEIGNYSFYALDNQNLRQLWDWSKHNLTITQGKLFFHYNPKLCLSEIHKMEEVSGTK
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KB9 GRQSKGDINTRNNGERASCESDVLHFTSTTTSKNRIIITWHRYRPPDYRDLISFTVYYKE
::: ..:: ..::..::::...:.:. :: ..:.. :. : :::.:::..: ..:::
CCDS42 GRQERNDIALKTNGDQASCENELLKFSYIRTSFDKILLRWEPYWPPDFRDLLGFMLFYKE
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KB9 APFKNVTEYDGQDACGSNSWNMVDVDLP-----PNKDVEPGILLHGLKPWTQYAVYVKAV
::..::::.:::::::::::..::.: : :... .:: :..:::::::::..::..
CCDS42 APYQNVTEFDGQDACGSNSWTVVDIDPPLRSNDPKSQNHPGWLMRGLKPWTQYAIFVKTL
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KB9 TLTMVENDHIRGAKSEILYIRTNASVPSIPLDVLSASNSSSQLIVKWNPPSLPNGNLSYY
.:. .. . ::::.:.:..:.:. ::.::: .:.::::::.:.::.::: ::::...:
CCDS42 -VTFSDERRTYGAKSDIIYVQTDATNPSVPLDPISVSNSSSQIILKWKPPSDPNGNITHY
600 610 620 630 640 650
650 660 670 680 690 700
pF1KB9 IVRWQRQPQDGYLYRHNYCSKD-KIPIRKYADGTIDIEEVTENPKTEVCGGEKGPCCACP
.: :.:: .:. :.. .:: : :.: : .. .. :. .. ..: . : ::.::
CCDS42 LVFWERQAEDSELFELDYCLKGLKLPSRTWSP-PFESEDSQKHNQSEYEDSA-GECCSCP
660 670 680 690 700 710
710 720 730 740 750 760
pF1KB9 KTEAEKQAEKEEAEYRKVFENFLHNSIFVPRPERKRRDVMQVANTTMSSRSRNTTAA--D
::... : ::. .::.::..::: .::::: ::::.. .:.:.:.. :.:: .
CCDS42 KTDSQILKELEESSFRKTFEDYLHNVVFVPRPSRKRRSLGDVGNVTVAV---PTVAAFPN
720 730 740 750 760 770
770 780 790 800 810 820
pF1KB9 TYNITDPEELETEYPFFESRVDNKERTVISNLRPFTLYRIDIHSCNHEAEKLGCSASNFV
: . . : : . :: .: ::: :::.:: :: :::....::... . ::.. .:
CCDS42 TSSTSVPTSPEEHRPF--EKVVNKESLVISGLRHFTGYRIELQACNQDTPEERCSVAAYV
780 790 800 810 820
830 840 850 860 870
pF1KB9 FARTMPAEGADDIPGPVTWEPRPENSIFLKWPEPENPNGLILMYEI---KYGSQVEDQRE
::::: :::: :::: : .: . : : ::..:::::..::. .::. :. .
CCDS42 SARTMPEAKADDIVGPVTHEIFENNVVHLMWQEPKEPNGLIVLYEVSYRRYGD--EELHL
830 840 850 860 870 880
880 890 900 910 920 930
pF1KB9 CVSRQEYRKYGGAKLNRLNPGNYTARIQATSLSGNGSWTDPVFFYVQAK-RYENFIHLII
::::... : .: :.::::..::.::::.::::::.:..::: . : ::
CCDS42 CVSRKHFALERGCRLRGLSPGNYSVRIRATSLAGNGSWTEPTYFYVTDYLDVPSNIAKII
890 900 910 920 930 940
940 950 960 970 980 990
pF1KB9 ALPVAVLLIVGGLVIMLYVFHRKRN-NSRLGNGVLYASVNPEYFSAADV-----YVPDEW
:. ... . .. .:.: :::. .. :: :::: ::::.::.:: ::::::
CCDS42 IGPLIFVFLFSVVIGSIYLFLRKRQPDGPLGP--LYASSNPEYLSASDVFPCSVYVPDEW
950 960 970 980 990 1000
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KB9 EVAREKITMSRELGQGSFGMVYEGVAKGVVKDEPETRVAIKTVNEAASMRERIEFLNEAS
::.:::::. :::::::::::::: :. ..: : :::::.:::::.::.:::::::::::
CCDS42 EVSREKITLLRELGQGSFGMVYEGNARDIIKGEAETRVAVKTVNESASLRERIEFLNEAS
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KB9 VMKEFNCHHVVRLLGVVSQGQPTLVIMELMTRGDLKSYLRSLRPEMENNPVLAPPSLSKM
::: :.::::::::::::.::::::.::::..::::::::::::: :::: ::.:..:
CCDS42 VMKGFTCHHVVRLLGVVSKGQPTLVVMELMAHGDLKSYLRSLRPEAENNPGRPPPTLQEM
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KB9 IQMAGEIADGMAYLNANKFVHRDLAARNCMVAEDFTVKIGDFGMTRDIYETDYYRKGGKG
::::.:::::::::::.:::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 IQMAAEIADGMAYLNAKKFVHRDLAARNCMVAHDFTVKIGDFGMTRDIYETDYYRKGGKG
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KB9 LLPVRWMSPESLKDGVFTTYSDVWSFGVVLWEIATLAEQPYQGLSNEQVLRFVMEGGLLD
:::::::.::::::::::: ::.::::::::::..:::::::::::::::.:::.:: ::
CCDS42 LLPVRWMAPESLKDGVFTTSSDMWSFGVVLWEITSLAEQPYQGLSNEQVLKFVMDGGYLD
1190 1200 1210 1220 1230 1240
1240 1250 1260 1270 1280 1290
pF1KB9 KPDNCPDMLFELMRMCWQYNPKMRPSFLEIISSIKEEMEPGFREVSFYYSEENKLPEPEE
.:::::. . .:::::::.::::::.::::.. .:....:.: ::::..::::: :: ::
CCDS42 QPDNCPERVTDLMRMCWQFNPKMRPTFLEIVNLLKDDLHPSFPEVSFFHSEENKAPESEE
1250 1260 1270 1280 1290 1300
1300 1310 1320 1330 1340 1350
pF1KB9 LDLEPENMESVPLDPSASSSSLPLPDRHSGHKAENG-PGPGVLVLRASFDERQPYAHMNG
:..: :.::.:::: :. : .. .: : . : .. :..:. ::.::::
CCDS42 LEMEFEDMENVPLDRSS----------HCQREEAGGRDGGSSLGFKRSYEEHIPYTHMNG
1310 1320 1330 1340 1350
1360
pF1KB9 GRKNERALPLPQSSTC
:.:: : : ::.:.
CCDS42 GKKNGRILTLPRSNPS
1360 1370
>>CCDS12176.1 INSR gene_id:3643|Hs108|chr19 (1382 aa)
initn: 4465 init1: 1796 opt: 2410 Z-score: 1096.9 bits: 215.4 E(32554): 8.9e-55
Smith-Waterman score: 5339; 57.5% identity (79.9% similar) in 1386 aa overlap (17-1364:21-1380)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MKSGSGGGSPTSLWGLLFLSAALSLWPTSGEICGPGIDIRNDYQQLKRLENCTVIE
:.:.:: :.: ::.: ::.::::. .:..::::.:::
CCDS12 MATGGRRGAAAAPLLVAVAALLLGAAGHLYP--GEVC-PGMDIRNNLTRLHELENCSVIE
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 GYLHILLI--SKAEDYRSYRFPKLTVITEYLLLFRVAGLESLGDLFPNLTVIRGWKLFYN
:.:.:::. .. ::.:. :::: .::.::::::: ::::: ::::::::::: .::.:
CCDS12 GHLQILLMFKTRPEDFRDLSFPKLIMITDYLLLFRVYGLESLKDLFPNLTVIRGSRLFFN
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 YALVIFEMTNLKDIGLYNLRNITRGAIRIEKNADLCYLSTVDWSLILDAVSNNYIVGNKP
::::::::..::..::::: :::::..::::: .::::.:.::: :::.: .:::: ::
CCDS12 YALVIFEMVHLKELGLYNLMNITRGSVRIEKNNELCYLATIDWSRILDSVEDNYIVLNKD
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 P-KECGDLCPGTMEEKPMCEKTTINNEYNYRCWTTNRCQKMCPSTCGKRACTENNECCHP
.::::.:::: . : : :.::... :::: ..:::.::. : ...:: .. :::
CCDS12 DNEECGDICPGTAKGKTNCPATVINGQFVERCWTHSHCQKVCPTICKSHGCTAEGLCCHS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 ECLGSCSAPDNDTACVACRHYYYAGVCVPACPPNTYRFEGWRCVDRDFCANIL-SAESSD
::::.:: ::. : :::::..: : :: .::: :.:. ::::. .:: .. . ..:
CCDS12 ECLGNCSQPDDPTKCVACRNFYLDGRCVETCPPPYYHFQDWRCVNFSFCQDLHHKCKNSR
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KB9 SEG---FVIHDGECMQECPSGFIRNGSQSMYCIPCEGPCPKVCEEEKKTKTIDSVTSAQM
.: .:::...:. :::::. : :... : :: :::::::. . ::::::::::
CCDS12 RQGCHQYVIHNNKCIPECPSGYTMN-SSNLLCTPCLGPCPKVCHLLEGEKTIDSVTSAQE
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB9 LQGCTIFKGNLLINIRRGNNIASELENFMGLIEVVTGYVKIRHSHALVSLSFLKNLRLIL
:.:::...:.:.:::: :::.:.::: .:::: ..::.:::.:.:::::::...::::
CCDS12 LRGCTVINGSLIINIRGGNNLAAELEANLGLIEEISGYLKIRRSYALVSLSFFRKLRLIR
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KB9 GEEQLEGNYSFYVLDNQNLQQLWDWDHRNLTIKAGKMYFAFNPKLCVSEIYRMEEVTGTK
:: ::::::.::::::.:::::...:::: ::..: .:::::.:::..::::.:::
CCDS12 GETLEIGNYSFYALDNQNLRQLWDWSKHNLTITQGKLFFHYNPKLCLSEIHKMEEVSGTK
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KB9 GRQSKGDINTRNNGERASCESDVLHFTSTTTSKNRIIITWHRYRPPDYRDLISFTVYYKE
::: ..:: ..::..::::...:.:. :: ..:.. :. : :::.:::..: ..:::
CCDS12 GRQERNDIALKTNGDQASCENELLKFSYIRTSFDKILLRWEPYWPPDFRDLLGFMLFYKE
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KB9 APFKNVTEYDGQDACGSNSWNMVDVDLP-----PNKDVEPGILLHGLKPWTQYAVYVKAV
::..::::.:::::::::::..::.: : :... .:: :..:::::::::..::..
CCDS12 APYQNVTEFDGQDACGSNSWTVVDIDPPLRSNDPKSQNHPGWLMRGLKPWTQYAIFVKTL
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KB9 TLTMVENDHIRGAKSEILYIRTNASVPSIPLDVLSASNSSSQLIVKWNPPSLPNGNLSYY
.:. .. . ::::.:.:..:.:. ::.::: .:.::::::.:.::.::: ::::...:
CCDS12 -VTFSDERRTYGAKSDIIYVQTDATNPSVPLDPISVSNSSSQIILKWKPPSDPNGNITHY
600 610 620 630 640 650
650 660 670 680 690 700
pF1KB9 IVRWQRQPQDGYLYRHNYCSKD-KIPIRKYADGTIDIEEVTENPKTEVCGGEKGPCCACP
.: :.:: .:. :.. .:: : :.: : .. .. :. .. ..: . : ::.::
CCDS12 LVFWERQAEDSELFELDYCLKGLKLPSRTWSP-PFESEDSQKHNQSEYEDSA-GECCSCP
660 670 680 690 700 710
710 720 730 740 750
pF1KB9 KTEAEKQAEKEEAEYRKVFENFLHNSIFVPR------------PERKRRDVMQVANTTMS
::... : ::. .::.::..::: .:::: : ::::.. .:.:.:..
CCDS12 KTDSQILKELEESSFRKTFEDYLHNVVFVPRKTSSGTGAEDPRPSRKRRSLGDVGNVTVA
720 730 740 750 760 770
760 770 780 790 800
pF1KB9 SRSRNTTAA--DTYNITDPEELETEYPFFESRVDNKERTVISNLRPFTLYRIDIHSCNHE
:.:: .: . . : : . :: .: ::: :::.:: :: :::....::..
CCDS12 V---PTVAAFPNTSSTSVPTSPEEHRPF--EKVVNKESLVISGLRHFTGYRIELQACNQD
780 790 800 810 820
810 820 830 840 850 860
pF1KB9 AEKLGCSASNFVFARTMPAEGADDIPGPVTWEPRPENSIFLKWPEPENPNGLILMYEI--
. . ::.. .: ::::: :::: :::: : .: . : : ::..:::::..::.
CCDS12 TPEERCSVAAYVSARTMPEAKADDIVGPVTHEIFENNVVHLMWQEPKEPNGLIVLYEVSY
830 840 850 860 870 880
870 880 890 900 910 920
pF1KB9 -KYGSQVEDQRECVSRQEYRKYGGAKLNRLNPGNYTARIQATSLSGNGSWTDPVFFYVQA
.::. :. . ::::... : .: :.::::..::.::::.::::::.:..:::
CCDS12 RRYGD--EELHLCVSRKHFALERGCRLRGLSPGNYSVRIRATSLAGNGSWTEPTYFYVTD
890 900 910 920 930 940
930 940 950 960 970 980
pF1KB9 K-RYENFIHLIIALPVAVLLIVGGLVIMLYVFHRKRN-NSRLGNGVLYASVNPEYFSAAD
. : :: :. ... . .. .:.: :::. .. :: :::: ::::.::.:
CCDS12 YLDVPSNIAKIIIGPLIFVFLFSVVIGSIYLFLRKRQPDGPLGP--LYASSNPEYLSASD
950 960 970 980 990 1000
990 1000 1010 1020 1030
pF1KB9 V-----YVPDEWEVAREKITMSRELGQGSFGMVYEGVAKGVVKDEPETRVAIKTVNEAAS
: ::::::::.:::::. :::::::::::::: :. ..: : :::::.:::::.::
CCDS12 VFPCSVYVPDEWEVSREKITLLRELGQGSFGMVYEGNARDIIKGEAETRVAVKTVNESAS
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1040 1050 1060 1070 1080 1090
pF1KB9 MRERIEFLNEASVMKEFNCHHVVRLLGVVSQGQPTLVIMELMTRGDLKSYLRSLRPEMEN
.:::::::::::::: :.::::::::::::.::::::.::::..::::::::::::: ::
CCDS12 LRERIEFLNEASVMKGFTCHHVVRLLGVVSKGQPTLVVMELMAHGDLKSYLRSLRPEAEN
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1100 1110 1120 1130 1140 1150
pF1KB9 NPVLAPPSLSKMIQMAGEIADGMAYLNANKFVHRDLAARNCMVAEDFTVKIGDFGMTRDI
:: ::.:..:::::.:::::::::::.:::::::::::::::.:::::::::::::::
CCDS12 NPGRPPPTLQEMIQMAAEIADGMAYLNAKKFVHRDLAARNCMVAHDFTVKIGDFGMTRDI
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1160 1170 1180 1190 1200 1210
pF1KB9 YETDYYRKGGKGLLPVRWMSPESLKDGVFTTYSDVWSFGVVLWEIATLAEQPYQGLSNEQ
:::::::::::::::::::.::::::::::: ::.::::::::::..:::::::::::::
CCDS12 YETDYYRKGGKGLLPVRWMAPESLKDGVFTTSSDMWSFGVVLWEITSLAEQPYQGLSNEQ
1190 1200 1210 1220 1230 1240
1220 1230 1240 1250 1260 1270
pF1KB9 VLRFVMEGGLLDKPDNCPDMLFELMRMCWQYNPKMRPSFLEIISSIKEEMEPGFREVSFY
::.:::.:: ::.:::::. . .:::::::.::::::.::::.. .:....:.: ::::.
CCDS12 VLKFVMDGGYLDQPDNCPERVTDLMRMCWQFNPKMRPTFLEIVNLLKDDLHPSFPEVSFF
1250 1260 1270 1280 1290 1300
1280 1290 1300 1310 1320 1330
pF1KB9 YSEENKLPEPEELDLEPENMESVPLDPSASSSSLPLPDRHSGHKAENG-PGPGVLVLRAS
.::::: :: :::..: :.::.:::: :. : .. .: : . : .. :
CCDS12 HSEENKAPESEELEMEFEDMENVPLDRSS----------HCQREEAGGRDGGSSLGFKRS
1310 1320 1330 1340 1350
1340 1350 1360
pF1KB9 FDERQPYAHMNGGRKNERALPLPQSSTC
..:. ::.:::::.:: : : ::.:.
CCDS12 YEEHIPYTHMNGGKKNGRILTLPRSNPS
1360 1370 1380
>>CCDS1160.1 INSRR gene_id:3645|Hs108|chr1 (1297 aa)
initn: 4532 init1: 1686 opt: 2325 Z-score: 1059.5 bits: 208.4 E(32554): 1.1e-52
Smith-Waterman score: 4912; 56.3% identity (78.5% similar) in 1316 aa overlap (14-1307:9-1289)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MKSGSGGGSPTSLWG----LLFLSAALSLWPTSGEICGPGIDIRNDYQQLKRLENCTVIE
:: ..::: ...: . :.: :..:::.. .:..::::.:.:
CCDS11 MAVPSLWPWGACLPVIFLSLGFGL--DTVEVC-PSLDIRSEVAELRQLENCSVVE
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 GYLHILLISKA--EDYRSYRFPKLTVITEYLLLFRVAGLESLGDLFPNLTVIRGWKLFYN
:.:.:::. : ::.:. ::.:: .:.::::::: ::::: ::::::.:::: .:: .
CCDS11 GHLQILLMFTATGEDFRGLSFPRLTQVTDYLLLFRVYGLESLRDLFPNLAVIRGTRLFLG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 YALVIFEMTNLKDIGLYNLRNITRGAIRIEKNADLCYLSTVDWSLILDAVSNNYIVGNKP
:::::::: .:.:..: : . :::.:.::: .::.:::.::.:. : . :.:::::
CCDS11 YALVIFEMPHLRDVALPALGAVLRGAVRVEKNQELCHLSTIDWGLLQPAPGANHIVGNKL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 PKECGDLCPGTMEE--KPMCEKTTINNEYNYRCWTTNRCQKMCPSTCGKRACTENNECCH
.::.:.:::.. .: : :::.... .:::::...::..:: : ::: .::::
CCDS11 GEECADVCPGVLGAAGEP-CAKTTFSGHTDYRCWTSSHCQRVCPCPHGM-ACTARGECCH
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 PECLGSCSAPDNDTACVACRHYYYAGVCVPACPPNTYRFEGWRCVDRDFCANILSAESSD
::::.:: :.. ::::::: :. :.:. ::::.::..:.:::: . ::.. :. .
CCDS11 TECLGGCSQPEDPRACVACRHLYFQGACLWACPPGTYQYESWRCVTAERCASLHSVPGRA
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 SEGFVIHDGECMQECPSGFIRNGSQSMYCIPCEGPCPKVCEEEKKTKTIDSVTSAQMLQG
: : ::.: :. .::::: :: :.:..: ::: ::: :. ::::::. .:: : :
CCDS11 ST-FGIHQGSCLAQCPSGFTRN-SSSIFCHKCEGLCPKECKV--GTKTIDSIQAAQDLVG
300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB9 CTIFKGNLLINIRRGNNIASELENFMGLIEVVTGYVKIRHSHALVSLSFLKNLRLILGEE
:: .:.:..:.:.: :. .:.. .::.:..::..::.:: :::::.:.:::.:: :.
CCDS11 CTHVEGSLILNLRQGYNLEPQLQHSLGLVETITGFLKIKHSFALVSLGFFKNLKLIRGDA
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KB9 QLEGNYSFYVLDNQNLQQLWDWDHRNLTIKAGKMYFAFNPKLCVSEIYRMEEVTGTKGRQ
...:::..::::::::::: .: .::: .::.::::::.::. .:::.::::::.:::
CCDS11 MVDGNYTLYVLDNQNLQQLGSWVAAGLTIPVGKIYFAFNPRLCLEHIYRLEEVTGTRGRQ
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KB9 SKGDINTRNNGERASCESDVLHFTSTTTSKNRIIITWHRYRPPDYRDLISFTVYYKEAPF
.:..:: :.::.::.:.. .:.:.:..: .::.. :.::.: . :::.:: :::::.::
CCDS11 NKAEINPRTNGDRAACQTRTLRFVSNVTEADRILLRWERYEPLEARDLLSFIVYYKESPF
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KB9 KNVTEYDGQDACGSNSWNMVDVDLPPNKDVEPGILLHGLKPWTQYAVYVKAVTLTMVEND
.:.::. : ::::..:::..::.:: .. :::. : .:::::::::.:.:.::: :..
CCDS11 QNATEHVGPDACGTQSWNLLDVELPLSRTQEPGVTLASLKPWTQYAVFVRAITLTTEEDS
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630 640 650
pF1KB9 HIRGAKSEILYIRTNASVPSIPLDVLSASNSSSQLIVKWNPPSLPNGNLSYYIVRWQRQP
.::.: :.:.:: ..:..: ::.:.:::::.:.:.:.::. ::::.::.: :::
CCDS11 PHQGAQSPIVYLRTLPAAPTVPQDVISTSNSSSHLLVRWKPPTQRNGNLTYYLVLWQRLA
590 600 610 620 630 640
660 670 680 690 700
pF1KB9 QDGYLYRHNYCSKD-KIPIRKYADGTIDIEEVTENPKTEVCGGEKGPCCAC---PKTEAE
.:: :: ..:: . ..: . : .: :. .:..:. .. :: : : ..
CCDS11 EDGDLYLNDYCHRGLRLPTSN-NDPRFDGED--GDPEAEM----ESDCCPCQHPPPGQVL
650 660 670 680 690
710 720 730 740 750 760
pF1KB9 KQAEKEEAEYRKVFENFLHNSIFVPRPERKRRDVMQVANTTMSSRSRNTTAADTYNITDP
: .:: ..: :::::::.: .: : : .. .. . . .:. :: .
CCDS11 PPLEAQEASFQKKFENFLHNAITIPISPWK---VTSINKSPQRDSGRHRRAAGPLRLGGN
700 710 720 730 740 750
770 780 790 800 810 820
pF1KB9 EELETEYPFFESRVDNKERTVISNLRPFTLYRIDIHSCNHEAEKLGCSASNFVFARTMPA
... . :..: .::.:.:.:: :: ::::::.::: :. .::::..::::::::
CCDS11 ---SSDFEIQEDKVP-RERAVLSGLRHFTEYRIDIHACNHAAHTVGCSAATFVFARTMPH
760 770 780 790 800 810
830 840 850 860 870 880
pF1KB9 EGADDIPGPVTWEPRPENSIFLKWPEPENPNGLILMYEIKYGSQVEDQRE-CVSRQEYRK
. :: ::: :.:: .::..:.: :: .:::::: ::::: :. :::: .: :
CCDS11 READGIPGKVAWEASSKNSVLLRWLEPPDPNGLILKYEIKYRRLGEEATVLCVSRLRYAK
820 830 840 850 860 870
890 900 910 920 930 940
pF1KB9 YGGAKLNRLNPGNYTARIQATSLSGNGSWTDPVFFYVQAKRYENF--IH-LIIALPVAV-
.::..: : ::::.::..::::.::::::: : ::. . . :. .: :. : ::..
CCDS11 FGGVHLALLPPGNYSARVRATSLAGNGSWTDSVAFYILGPEEEDAGGLHVLLTATPVGLT
880 890 900 910 920 930
950 960 970 980 990 1000
pF1KB9 LLIVGGLVIMLYVFHRKRNNSRLGNGVLYASVNPEYFSAADVYVPDEWEVAREKITMSRE
:::: :. . . . .::: . ::::::::::::.:.:::::::: ::.:.. ::
CCDS11 LLIV--LAALGFFYGKKRNRT------LYASVNPEYFSASDMYVPDEWEVPREQISIIRE
940 950 960 970 980
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KB9 LGQGSFGMVYEGVAKGVVKDEPETRVAIKTVNEAASMRERIEFLNEASVMKEFNCHHVVR
::::::::::::.:.:. : : ::.::::: :: :: ::::.:::::: :.::::::
CCDS11 LGQGSFGMVYEGLARGLEAGEESTPVALKTVNELASPRECIEFLKEASVMKAFKCHHVVR
990 1000 1010 1020 1030 1040
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KB9 LLGVVSQGQPTLVIMELMTRGDLKSYLRSLRPEMENNPVLAPPSLSKMIQMAGEIADGMA
:::::::::::::::::::::::::.::::::: :::: : :.:..:::::::::::::
CCDS11 LLGVVSQGQPTLVIMELMTRGDLKSHLRSLRPEAENNPGLPQPALGEMIQMAGEIADGMA
1050 1060 1070 1080 1090 1100
1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KB9 YLNANKFVHRDLAARNCMVAEDFTVKIGDFGMTRDIYETDYYRKGGKGLLPVRWMSPESL
:: ::::::::::::::::..::::::::::::::.:::::::::::::::::::.::::
CCDS11 YLAANKFVHRDLAARNCMVSQDFTVKIGDFGMTRDVYETDYYRKGGKGLLPVRWMAPESL
1110 1120 1130 1140 1150 1160
1190 1200 1210 1220 1230 1240
pF1KB9 KDGVFTTYSDVWSFGVVLWEIATLAEQPYQGLSNEQVLRFVMEGGLLDKPDNCPDMLFEL
:::.:::.:::::::::::::.::::::::::::::::.:::.::.:.. ..:: .: ::
CCDS11 KDGIFTTHSDVWSFGVVLWEIVTLAEQPYQGLSNEQVLKFVMDGGVLEELEGCPLQLQEL
1170 1180 1190 1200 1210 1220
1250 1260 1270 1280 1290
pF1KB9 MRMCWQYNPKMRPSFLEIISSIKEEMEPGFREVSFYYSEENK-----LPEPEELDLEPEN
: ::: ::..:::: .:..::.::..:.:: .::::: : . :: : ::..
CCDS11 MSRCWQPNPRLRPSFTHILDSIQEELRPSFRLLSFYYSPECRGARGSLPT---TDAEPDS
1230 1240 1250 1260 1270 1280
1300 1310 1320 1330 1340 1350
pF1KB9 MESVPLDPSASSSSLPLPDRHSGHKAENGPGPGVLVLRASFDERQPYAHMNGGRKNERAL
. : : :
CCDS11 SPT-PRDCSPQNGGPGH
1290
>>CCDS33172.1 ALK gene_id:238|Hs108|chr2 (1620 aa)
initn: 735 init1: 735 opt: 939 Z-score: 443.1 bits: 94.6 E(32554): 2.3e-18
Smith-Waterman score: 949; 38.2% identity (68.3% similar) in 401 aa overlap (964-1349:1081-1477)
940 950 960 970 980 990
pF1KB9 HLIIALPVAVLLIVGGLVIMLYVFHRKRNNSRLGNGVLYASVNPEY-FSAADVYVPDEWE
:.: ....... ::.: :.. . : :
CCDS33 AFSGIMIVYRRKHQELQAMQMELQSPEYKLSKLRTSTIMTDYNPNYCFAGKTSSISDLKE
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KB9 VAREKITMSRELGQGSFGMVYEGVAKGVVKDEPETRVAIKTVNEAASMRERIEFLNEASV
: :..::. : ::.:.:: :::: ..:. .: .::.::. :. : .....:: :: .
CCDS33 VPRKNITLIRGLGHGAFGEVYEGQVSGMPNDPSPLQVAVKTLPEVCSEQDELDFLMEALI
1120 1130 1140 1150 1160 1170
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KB9 MKEFNCHHVVRLLGVVSQGQPTLVIMELMTRGDLKSYLRSLRPEMENNPVLAPPSLSKMI
...:: ...:: .:: :. : ....:::. :::::.:: ::. . :: . ..
CCDS33 ISKFNHQNIVRCIGVSLQSLPRFILLELMAGGDLKSFLRETRPRPSQPSSLA---MLDLL
1180 1190 1200 1210 1220
1120 1130 1140 1150 1160
pF1KB9 QMAGEIADGMAYLNANKFVHRDLAARNCMVA---EDFTVKIGDFGMTRDIYETDYYRKGG
..: .:: : ::. :.:.:::.:::::... ..:::::::.::::...::::::
CCDS33 HVARDIACGCQYLEENHFIHRDIAARNCLLTCPGPGRVAKIGDFGMARDIYRASYYRKGG
1230 1240 1250 1260 1270 1280
1170 1180 1190 1200 1210 1220
pF1KB9 KGLLPVRWMSPESLKDGVFTTYSDVWSFGVVLWEIATLAEQPYQGLSNEQVLRFVMEGGL
..:::.:: ::.. .:.::. .:.:::::.:::: .:. .:: . ::..::.:: ::
CCDS33 CAMLPVKWMPPEAFMEGIFTSKTDTWSFGVLLWEIFSLGYMPYPSKSNQEVLEFVTSGGR
1290 1300 1310 1320 1330 1340
1230 1240 1250 1260 1270 1280
pF1KB9 LDKPDNCPDMLFELMRMCWQYNPKMRPSFLEIISSIKE-EMEPGFREVSFYYSEENKLPE
.: : ::: ....: .:::..:. ::.: :. :. ..: .... . :
CCDS33 MDPPKNCPGPVYRIMTQCWQHQPEDRPNFAIILERIEYCTQDPDVINTALPIEYGPLVEE
1350 1360 1370 1380 1390 1400
1290 1300 1310 1320 1330
pF1KB9 PEELDLEPENMESVP----------LDPSASSSSLPLPDRHSGHKAENGPGPGVLVLRAS
:.. ..:.. :.:: . . .. ::: :: :: . : . . .:.
CCDS33 EEKVPVRPKDPEGVPPLLVSQQAKREEERSPAAPPPLPTTSSG-KAAKKPTAAEISVRVP
1410 1420 1430 1440 1450 1460
1340 1350 1360
pF1KB9 FDERQPYAHMNGGRKNERALPLPQSSTC
.:.:
CCDS33 RGPAVEGGHVNMAFSQSNPPSELHKVHGSRNKPTSLWNPTYGSWFTEKPTKKNNPIAKKE
1470 1480 1490 1500 1510 1520
>>CCDS10078.1 LTK gene_id:4058|Hs108|chr15 (803 aa)
initn: 764 init1: 724 opt: 889 Z-score: 424.0 bits: 90.1 E(32554): 2.7e-17
Smith-Waterman score: 909; 38.1% identity (66.9% similar) in 399 aa overlap (964-1330:409-799)
940 950 960 970 980 990
pF1KB9 HLIIALPVAVLLIVGGLVIMLYVFHRKRNNSRLGNGVLYASVNPEYFSAADVYVPDEW--
:.: .... .. :: :. . . . :
CCDS10 LMVCGVLILVKQKKWQGLQEMRLPSPELELSKLRTSAIRTAPNP-YYCQVGLGPAQSWPL
380 390 400 410 420 430
1000 1010 1020 1030 1040
pF1KB9 -----EVAREKITMSRELGQGSFGMVYEGVAKGVVKDEPETRVAIKTVNEAASMRERIEF
::. ..:. : ::.:.:: ::::.. :. : .:::::. : : .....:
CCDS10 PPGVTEVSPANVTLLRALGHGAFGEVYEGLVIGLPGDSSPLQVAIKTLPELCSPQDELDF
440 450 460 470 480 490
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KB9 LNEASVMKEFNCHHVVRLLGVVSQGQPTLVIMELMTRGDLKSYLRSLRPEMENNPVLAPP
: :: ....: ...:: .:. .. : :...:::. ::.::.:: ::.. ..: .:
CCDS10 LMEALIISKFRHQNIVRCVGLSLRATPRLILLELMSGGDMKSFLRHSRPHL-GQP--SPL
500 510 520 530 540 550
1110 1120 1130 1140 1150 1160
pF1KB9 SLSKMIQMAGEIADGMAYLNANKFVHRDLAARNCMVA---EDFTVKIGDFGMTRDIYETD
. ..:.: .::.: ::. :.:.:::.:::::... . ..:::::::.::::...
CCDS10 VMRDLLQLAQDIAQGCHYLEENHFIHRDIAARNCLLSCAGPSRVAKIGDFGMARDIYRAS
560 570 580 590 600 610
1170 1180 1190 1200 1210 1220
pF1KB9 YYRKGGKGLLPVRWMSPESLKDGVFTTYSDVWSFGVVLWEIATLAEQPYQGLSNEQVLRF
:::.: ..::::.:: ::.. .:.::. .: :::::.:::: .:. .:: : .:..:: :
CCDS10 YYRRGDRALLPVKWMPPEAFLEGIFTSKTDSWSFGVLLWEIFSLGYMPYPGRTNQEVLDF
620 630 640 650 660 670
1230 1240 1250 1260
pF1KB9 VMEGGLLDKPDNCPDMLFELMRMCWQYNPKMRPSFLEII--------------SSIKEEM
:. :: .: : .:: ....: .:::..:..:::: :. : . :.
CCDS10 VVGGGRMDPPRGCPGPVYRIMTQCWQHEPELRPSFASILERLQYCTQDPDVLNSLLPMEL
680 690 700 710 720 730
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KB9 EP-----GFREVSFYYSEENKLPEPEELDLEPENMES---VPLDPSASSSSLPLPDRHSG
: : .. : . :.:.::. ::...: :: : ::. :: .: :
CCDS10 GPTPEEEGTSGLGNRSLECLRPPQPQELS--PEKLKSWGGSPLGPWLSSGLKPLKSR--G
740 750 760 770 780 790
1330 1340 1350 1360
pF1KB9 HKAENGPGPGVLVLRASFDERQPYAHMNGGRKNERALPLPQSSTC
. .: .:
CCDS10 LQPQNLWNPTYRS
800
>>CCDS10077.1 LTK gene_id:4058|Hs108|chr15 (864 aa)
initn: 764 init1: 724 opt: 889 Z-score: 423.7 bits: 90.1 E(32554): 2.8e-17
Smith-Waterman score: 909; 38.1% identity (66.9% similar) in 399 aa overlap (964-1330:470-860)
940 950 960 970 980 990
pF1KB9 HLIIALPVAVLLIVGGLVIMLYVFHRKRNNSRLGNGVLYASVNPEYFSAADVYVPDEW--
:.: .... .. :: :. . . . :
CCDS10 LMVCGVLILVKQKKWQGLQEMRLPSPELELSKLRTSAIRTAPNP-YYCQVGLGPAQSWPL
440 450 460 470 480 490
1000 1010 1020 1030 1040
pF1KB9 -----EVAREKITMSRELGQGSFGMVYEGVAKGVVKDEPETRVAIKTVNEAASMRERIEF
::. ..:. : ::.:.:: ::::.. :. : .:::::. : : .....:
CCDS10 PPGVTEVSPANVTLLRALGHGAFGEVYEGLVIGLPGDSSPLQVAIKTLPELCSPQDELDF
500 510 520 530 540 550
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KB9 LNEASVMKEFNCHHVVRLLGVVSQGQPTLVIMELMTRGDLKSYLRSLRPEMENNPVLAPP
: :: ....: ...:: .:. .. : :...:::. ::.::.:: ::.. ..: .:
CCDS10 LMEALIISKFRHQNIVRCVGLSLRATPRLILLELMSGGDMKSFLRHSRPHL-GQP--SPL
560 570 580 590 600 610
1110 1120 1130 1140 1150 1160
pF1KB9 SLSKMIQMAGEIADGMAYLNANKFVHRDLAARNCMVA---EDFTVKIGDFGMTRDIYETD
. ..:.: .::.: ::. :.:.:::.:::::... . ..:::::::.::::...
CCDS10 VMRDLLQLAQDIAQGCHYLEENHFIHRDIAARNCLLSCAGPSRVAKIGDFGMARDIYRAS
620 630 640 650 660 670
1170 1180 1190 1200 1210 1220
pF1KB9 YYRKGGKGLLPVRWMSPESLKDGVFTTYSDVWSFGVVLWEIATLAEQPYQGLSNEQVLRF
:::.: ..::::.:: ::.. .:.::. .: :::::.:::: .:. .:: : .:..:: :
CCDS10 YYRRGDRALLPVKWMPPEAFLEGIFTSKTDSWSFGVLLWEIFSLGYMPYPGRTNQEVLDF
680 690 700 710 720 730
1230 1240 1250 1260
pF1KB9 VMEGGLLDKPDNCPDMLFELMRMCWQYNPKMRPSFLEII--------------SSIKEEM
:. :: .: : .:: ....: .:::..:..:::: :. : . :.
CCDS10 VVGGGRMDPPRGCPGPVYRIMTQCWQHEPELRPSFASILERLQYCTQDPDVLNSLLPMEL
740 750 760 770 780 790
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KB9 EP-----GFREVSFYYSEENKLPEPEELDLEPENMES---VPLDPSASSSSLPLPDRHSG
: : .. : . :.:.::. ::...: :: : ::. :: .: :
CCDS10 GPTPEEEGTSGLGNRSLECLRPPQPQELS--PEKLKSWGGSPLGPWLSSGLKPLKSR--G
800 810 820 830 840 850
1330 1340 1350 1360
pF1KB9 HKAENGPGPGVLVLRASFDERQPYAHMNGGRKNERALPLPQSSTC
. .: .:
CCDS10 LQPQNLWNPTYRS
860
>>CCDS5116.1 ROS1 gene_id:6098|Hs108|chr6 (2347 aa)
initn: 867 init1: 532 opt: 899 Z-score: 423.6 bits: 91.6 E(32554): 2.8e-17
Smith-Waterman score: 936; 30.3% identity (57.2% similar) in 746 aa overlap (567-1266:1516-2216)
540 550 560 570 580 590
pF1KB9 EYDGQDACGSNSWNMVDVDLPPNKDVEPGILLHGLKPWTQYAVYVKAVTLTMVENDHIRG
:.. :.:.. : . . . . .:.
CCDS51 TYLVYYAEVNDRKNSSDLKYRILEFQDSIALIEDLQPFSTYMIQIAVKNYYSDPLEHLPP
1490 1500 1510 1520 1530 1540
600 610 620 630 640 650
pF1KB9 AKSEILYIRTNASVPSIPLDVLSASNSSSQLIVKWNPPSLPNGNLSYYIVRWQRQPQDGY
.: :: . .:. .:: . .. :...::..: ::: ::.: .
CCDS51 GK-EI-WGKTKNGVPEAVQLINTTVRSDTSLIISWRESHKPNG--PKESVRYQLAISHLA
1550 1560 1570 1580 1590 1600
660 670 680 690 700
pF1KB9 LYRHNYCSKDKIP-------IRKYADGTIDIEEVTENPKTEVCGGEKGPCCACPKTEAEK
: .. ....: . . . :.: . .: .: .:. : . .:
CCDS51 LIPETPLRQSEFPNGRLTLLVTRLSGGNIYVLKVL------ACHSEEMWCTESHPVTVE-
1610 1620 1630 1640 1650
710 720 730 740 750 760
pF1KB9 QAEKEEAEYRKVFENFLHNSIFVPRPERKRRDVMQVANTTMSSRSRNTTAADTYNITDPE
. . : : : :: .:. . . . ..: . . .. . :..
CCDS51 MFNTPEKPYSLVPEN---TSL-----QFNWKAPLNVNLIRFWVELQKWKYNEFYHVKTSC
1660 1670 1680 1690 1700
770 780 790 800 810 820
pF1KB9 ELETEYPFFESRVDNKERTVISNLRPFTLYRIDIHSCNHEAEKLGCSASNFVFARTMPAE
.. : . : : :.::.:.: : . . . : : ..... . :
CCDS51 ---SQGPAY---VCN-----ITNLQPYTSYNVRVVV----VYKTGENSTSLPESFKTKA-
1710 1720 1730 1740 1750
830 840 850 860 870 880
pF1KB9 GADDIPGPVTWEPRPENSIFLKWPEPENPNGLILMY---EIKYGSQVEDQRECVSRQEYR
:. . :: .::: .: . :. :: . : ::. ... . : . . : ..
CCDS51 GVPNKPGIPKLLEGSKNSI--QWEKAED-NGCRITYYILEIRKSTSNNLQNQNL-RWKMT
1760 1770 1780 1790 1800
890 900 910 920 930
pF1KB9 KYGGA------KLNRLNPGNYTARIQATSLSGNGSWT--DPVFFYVQAKRYENFIHLIIA
:. : . :. : . :. :.. : : .. . .. : . .:..
CCDS51 FNGSCSSVCTWKSKNLK-GIFQFRVVAANNLGFGEYSGISENIILVGDDFWIPETSFILT
1810 1820 1830 1840 1850 1860
940 950 960 970 980
pF1KB9 LPVAVLLIVGGLVIMLYVFHRK-RNNSRLGNGV---------------LYASVNPEYFSA
. :...:.: . . .:.::. .:.. .:: : :.:.
CCDS51 IIVGIFLVV--TIPLTFVWHRRLKNQKSAKEGVTVLINEDKELAELRGLAAGVGLANACY
1870 1880 1890 1900 1910 1920
990 1000 1010 1020 1030
pF1KB9 ADVYVPDEWEVA------REKITMSRELGQGSFGMVYEGVAKGVVK-DEPETRVAIKTVN
: .: . :. :::.:. ::.:.:: ::::.: .. : .::.::..
CCDS51 AIHTLPTQEEIENLPAFPREKLTLRLLLGSGAFGEVYEGTAVDILGVGSGEIKVAVKTLK
1930 1940 1950 1960 1970 1980
1040 1050 1060 1070 1080 1090
pF1KB9 EAASMRERIEFLNEASVMKEFNCHHVVRLLGVVSQGQPTLVIMELMTRGDLKSYLRSLRP
.... .:.::::.:: .:..:: .... ::: ..: .:.::: ::: .:::. :
CCDS51 KGSTDQEKIEFLKEAHLMSKFNHPNILKQLGVCLLNEPQYIILELMEGGDLLTYLRKARM
1990 2000 2010 2020 2030 2040
1100 1110 1120 1130 1140 1150
pF1KB9 EMENNPVLAPPSLSKMIQMAGEIADGMAYLNANKFVHRDLAARNCMVA-EDFT----VKI
.:.: .: .... .:. : .::. .:.:::::::::.:. .:.: :::
CCDS51 ATFYGPLL---TLVDLVDLCVDISKGCVYLERMHFIHRDLAARNCLVSVKDYTSPRIVKI
2050 2060 2070 2080 2090 2100
1160 1170 1180 1190 1200 1210
pF1KB9 GDFGMTRDIYETDYYRKGGKGLLPVRWMSPESLKDGVFTTYSDVWSFGVVLWEIATLAEQ
::::..::::..::::: :.::::::::.:::: ::.::: :::::::...::: ::..:
CCDS51 GDFGLARDIYKNDYYRKRGEGLLPVRWMAPESLMDGIFTTQSDVWSFGILIWEILTLGHQ
2110 2120 2130 2140 2150 2160
1220 1230 1240 1250 1260 1270
pF1KB9 PYQGLSNEQVLRFVMEGGLLDKPDNCPDMLFELMRMCWQYNPKMRPSFLEIISSIKEEME
:: . :: .:: .:. :: :. : :::: :..:: .:: .: .::.: .: ....
CCDS51 PYPAHSNLDVLNYVQTGGRLEPPRNCPDDLWNLMTQCWAQEPDQRPTFHRIQDQLQLFRN
2170 2180 2190 2200 2210 2220
1280 1290 1300 1310 1320 1330
pF1KB9 PGFREVSFYYSEENKLPEPEELDLEPENMESVPLDPSASSSSLPLPDRHSGHKAENGPGP
CCDS51 FFLNSIYKSRDEANNSGVINESFEGEDGDVICLNSDDIMPVALMETKNREGLNYMVLATE
2230 2240 2250 2260 2270 2280
>>CCDS35050.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9 (822 aa)
initn: 714 init1: 612 opt: 847 Z-score: 405.3 bits: 86.7 E(32554): 3e-16
Smith-Waterman score: 847; 44.3% identity (74.7% similar) in 289 aa overlap (976-1255:513-797)
950 960 970 980 990 1000
pF1KB9 IVGGLVIMLYVFHRKRNNSRLGNGVLYASVNPEYFSAADVYV-PDEW--EVAREKITMSR
::.::. .. . :: . .. :..:...:
CCDS35 HISNGSNTPSSSEGGPDAVIIGMTKIPVIENPQYFGITNSQLKPDTFVQHIKRHNIVLKR
490 500 510 520 530 540
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KB9 ELGQGSFGMVYEGVAKGVVKDEPETRVAIKTVNEAASMRERIEFLNEASVMKEFNCHHVV
:::.:.:: :. . .. .. . ::.::...: : : .: :: .. ... .:.:
CCDS35 ELGEGAFGKVFLAECYNLCPEQDKILVAVKTLKDA-SDNARKDFHREAELLTNLQHEHIV
550 560 570 580 590 600
1070 1080 1090 1100 1110
pF1KB9 RLLGVVSQGQPTLVIMELMTRGDLKSYLRSLRPEM----ENNPVLAPPSL--SKMIQMAG
.. :: .:.: ....: : .:::...::. :. :.:: : : :.:...:
CCDS35 KFYGVCVEGDPLIMVFEYMKHGDLNKFLRAHGPDAVLMAEGNP---PTELTQSQMLHIAQ
610 620 630 640 650
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KB9 EIADGMAYLNANKFVHRDLAARNCMVAEDFTVKIGDFGMTRDIYETDYYRKGGKGLLPVR
.:: ::.:: ...:::::::.:::.:.:.. ::::::::.::.: ::::: ::. .::.:
CCDS35 QIAAGMVYLASQHFVHRDLATRNCLVGENLLVKIGDFGMSRDVYSTDYYRVGGHTMLPIR
660 670 680 690 700 710
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KB9 WMSPESLKDGVFTTYSDVWSFGVVLWEIATLAEQPYQGLSNEQVLRFVMEGGLLDKPDNC
:: :::. ::: :::::.::::::: : ..::. :::..:.. . .: .:..: .:
CCDS35 WMPPESIMYRKFTTESDVWSLGVVLWEIFTYGKQPWYQLSNNEVIECITQGRVLQRPRTC
720 730 740 750 760 770
1240 1250 1260 1270 1280 1290
pF1KB9 PDMLFELMRMCWQYNPKMRPSFLEIISSIKEEMEPGFREVSFYYSEENKLPEPEELDLEP
:. ..::: ::: .:.::
CCDS35 PQEVYELMLGCWQREPHMRKNIKGIHTLLQNLAKASPVYLDILG
780 790 800 810 820
1366 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 18:18:59 2016 done: Thu Nov 3 18:19:00 2016
Total Scan time: 4.370 Total Display time: 0.540
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]