FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB9127, 819 aa 1>>>pF1KB9127 819 - 819 aa - 819 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.6741+/-0.00256; mu= 9.9166+/- 0.149 mean_var=263.8222+/-54.399, 0's: 0 Z-trim(99.4): 965 B-trim: 2 in 1/48 Lambda= 0.078962 statistics sampled from 4703 (5722) to 4703 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.436), E-opt: 0.2 (0.176), width: 16 Scan time: 3.440 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS75846.1 ZNF658 gene_id:26149|Hs108|chr9 (1059) 5706 665.9 1e-190 CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1058) 2695 322.9 1.8e-87 CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1090) 2693 322.6 2.2e-87 CCDS46170.1 ZNF845 gene_id:91664|Hs108|chr19 ( 970) 2678 320.9 6.6e-87 CCDS74322.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1159) 2676 320.7 8.6e-87 CCDS42541.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1191) 2676 320.8 8.8e-87 CCDS59368.1 ZNF729 gene_id:100287226|Hs108|chr19 (1252) 2652 318.1 6e-86 CCDS46162.1 ZNF836 gene_id:162962|Hs108|chr19 ( 936) 2590 310.8 6.7e-84 CCDS82391.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 782) 2548 305.9 1.7e-82 CCDS12859.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 818) 2548 306.0 1.7e-82 CCDS46212.1 ZNF814 gene_id:730051|Hs108|chr19 ( 855) 2539 305.0 3.6e-82 CCDS33090.1 ZNF616 gene_id:90317|Hs108|chr19 ( 781) 2528 303.7 8.1e-82 CCDS12499.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 ( 714) 2520 302.7 1.4e-81 CCDS74353.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 ( 769) 2520 302.7 1.5e-81 CCDS54240.1 ZNF208 gene_id:7757|Hs108|chr19 (1280) 2516 302.6 2.8e-81 CCDS47357.2 ZFP62 gene_id:643836|Hs108|chr5 ( 867) 2502 300.8 6.7e-81 CCDS54955.1 ZFP62 gene_id:643836|Hs108|chr5 ( 900) 2502 300.8 6.9e-81 CCDS46167.1 ZNF808 gene_id:388558|Hs108|chr19 ( 903) 2499 300.4 8.7e-81 CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 2486 298.8 2.1e-80 CCDS33097.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 839) 2484 298.7 2.7e-80 CCDS54314.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 840) 2484 298.7 2.7e-80 CCDS82388.1 ZNF841 gene_id:284371|Hs108|chr19 ( 808) 2481 298.3 3.4e-80 CCDS46161.1 ZNF841 gene_id:284371|Hs108|chr19 ( 924) 2481 298.4 3.7e-80 CCDS11180.1 ZNF624 gene_id:57547|Hs108|chr17 ( 865) 2466 296.7 1.1e-79 CCDS46991.1 ZNF721 gene_id:170960|Hs108|chr4 ( 923) 2443 294.1 7.4e-79 CCDS12500.1 ZNF585B gene_id:92285|Hs108|chr19 ( 769) 2439 293.5 9e-79 CCDS77297.1 ZNF546 gene_id:339327|Hs108|chr19 ( 810) 2426 292.1 2.6e-78 CCDS12548.1 ZNF546 gene_id:339327|Hs108|chr19 ( 836) 2426 292.1 2.7e-78 CCDS45012.1 ZNF268 gene_id:10795|Hs108|chr12 ( 947) 2397 288.8 2.8e-77 CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 ( 738) 2386 287.5 5.8e-77 CCDS59369.1 ZNF99 gene_id:7652|Hs108|chr19 ( 864) 2369 285.6 2.4e-76 CCDS46077.1 ZNF780B gene_id:163131|Hs108|chr19 ( 833) 2361 284.7 4.5e-76 CCDS2717.1 ZNF197 gene_id:10168|Hs108|chr3 (1029) 2362 284.9 4.7e-76 CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19 ( 678) 2356 284.0 5.9e-76 CCDS5527.1 ZNF107 gene_id:51427|Hs108|chr7 ( 783) 2340 282.2 2.3e-75 CCDS75606.1 ZNF107 gene_id:51427|Hs108|chr7 ( 820) 2340 282.3 2.3e-75 CCDS75605.1 ZNF107 gene_id:51427|Hs108|chr7 ( 852) 2340 282.3 2.4e-75 CCDS62706.1 ZNF229 gene_id:7772|Hs108|chr19 ( 819) 2320 280.0 1.1e-74 CCDS42574.1 ZNF229 gene_id:7772|Hs108|chr19 ( 825) 2320 280.0 1.1e-74 CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 2302 277.9 4.4e-74 CCDS14279.1 ZNF41 gene_id:7592|Hs108|chrX ( 779) 2290 276.5 1.2e-73 CCDS12503.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 686) 2282 275.6 2e-73 CCDS12856.1 ZNF600 gene_id:162966|Hs108|chr19 ( 722) 2282 275.6 2.1e-73 CCDS82341.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 527) 2269 273.9 4.9e-73 CCDS59367.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 803) 2268 274.1 6.8e-73 CCDS12413.2 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 809) 2268 274.1 6.8e-73 CCDS74321.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 818) 2268 274.1 6.9e-73 CCDS35067.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 816) 2259 273.0 1.4e-72 CCDS35066.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 852) 2259 273.1 1.4e-72 CCDS59136.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 854) 2259 273.1 1.4e-72 >>CCDS75846.1 ZNF658 gene_id:26149|Hs108|chr9 (1059 aa) initn: 4862 init1: 4862 opt: 5706 Z-score: 3537.5 bits: 665.9 E(32554): 1e-190 Smith-Waterman score: 5706; 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CCDS59 TSRSALIQHQRIHTGEKPYHCKECGKSFTVGSTLLQHQQIHTGEKPYDCKECGKAFRLRL 580 590 600 610 620 630 580 590 600 610 620 630 pF1KB9 ALIVHQRIHTGEKPYECNECGKTFSQRTHLCAHQRIHTGEKPYECNECGKTFADNSALRA : ::.::::::::.:.::::.: . . : :.::::::::::: .:::.: . . : CCDS59 RLTQHQQIHTGEKPYQCQECGKAFVSVSGLTQHHRIHTGEKPYECPDCGKAFRQRTYLNQ 640 650 660 670 680 690 640 650 660 670 680 690 pF1KB9 HHRIHTGEKPYECNDCGKTFSKTSHLRAHLRTRSGEKPYECSECGKTFSEKSYVSAHQRV :.:::::::::::..:::.:. : : : .... ::::. .::::.:. .: . ::.. 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CCDS46 NNFLNSSLLTQKQEVHMREKSFQCNESGKAFNYSSVLRKHQIIHLGAKQYKCDVCGKVFN 200 210 220 230 240 250 100 110 120 130 140 150 pF1KB9 QSSAHIVHQKTQAGDKFGEHNECTDALYQKLDFTAHQRIHTDFTAHQKFYLSDEHGKCRK :. :.. ..: : . :.: .. :.: .: :.:.:: .: : .: : : CCDS46 QKRYLACHRRCHTGKKPYKCNDCGKTFSQELTLTCHHRLHTG----EKHYKCSE---CGK 260 270 280 290 300 160 170 180 190 200 210 pF1KB9 SFYWKAHLIQHERPHSGEKTYQYEECAKSFCSSSHPIQHPGTYVGFKLYECNECGKAFCQ .: .. :. :. :.:::.:. .::.:.: ..:. . : ..: : :.:.:: ::: CCDS46 TFSRNSALVIHKAIHTGEKSYKCNECGKTFSQTSYLVYHRRLHTGEKPYKCEECDKAFSF 310 320 330 340 350 360 220 230 240 250 260 270 pF1KB9 NSNLSKHLRIHTKEKPCDNNGCGRSYKSPLIGHQKTDAEMELCGGSEYGKTSHLKGHQRI .::: .: .::: ::: : :.:... . : : :.:. CCDS46 KSNLERHRKIHTGEKPYKCNECSRTFS----------------------RKSSLTRHRRL 370 380 390 400 280 290 300 310 320 330 pF1KB9 LMGEKPYECIECGKTFSKTSHLRAHQRIHTGEKPYECVECEKTFSHKTHLSVHQRVHTGE :::::.: .::::::. : : :.:.:::::::.: ::...:: :..: :.:.:::: CCDS46 HTGEKPYKCNDCGKTFSQMSSLVYHRRLHTGEKPYKCEECDEAFSFKSNLERHRRIHTGE 410 420 430 440 450 460 340 350 360 370 380 390 pF1KB9 KPYECNDCGKSFTYNSALRAHQRIHTGEKPYECSDCEKTFAHNSALRAHHRIHTGEKPYE :::.::::::.:. .:.: :.:.:::::::.: .:...:. .: :. :. :::::: :. 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CCDS46 HRRIHTGEKPYKCKVCDKAFGRDSHLAQHTRIHTGEKPYKCNECGKNFRHNSALVIHKAI 770 780 790 800 810 820 700 710 720 730 740 750 pF1KB9 HTGEKPYECNVCGKPFAHNSTLRVHQRIHTGEKSYECNDCGKTFSQKSHLSAHQRIHTGE :.:::::.:: ::: : :::.:..:. :::::: :.:..:::.:..:..:: :.:.:::: CCDS46 HSGEKPYKCNECGKTFRHNSALEIHKAIHTGEKPYKCSECGKVFNRKANLSRHHRLHTGE 830 840 850 860 870 880 760 770 780 790 800 810 pF1KB9 KPYECNECGKAFAQNSTLRVHQRIHTGEKPYECDECGKTFVRKAALRVHHTRMHTREKTL :::.::.:::.: :.. : :.:::::::::.:.:::::: CCDS46 KPYKCNKCGKVFNQQAHLACHHRIHTGEKPYKCNECGKTFRHNSVLVIHKTIHTGEKPYK 890 900 910 920 930 940 pF1KB9 ACNGFGKS CCDS46 CNECGKVFNRKAKLARHHRIHTGKKH 950 960 970 >>CCDS74322.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1159 aa) initn: 17511 init1: 2266 opt: 2676 Z-score: 1671.6 bits: 320.7 E(32554): 8.6e-87 Smith-Waterman score: 2737; 47.8% identity (74.8% similar) in 822 aa overlap (6-819:297-1110) 10 20 30 pF1KB9 MMNLEKNFDKT-TLFNHMRTDKRGKCSDLNEYGTS : :... :: .: : : .: : . CCDS74 CGKAFSHSSTLAKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFSRSSTLAKHKRIHTGEKPYKCKECGKA 270 280 290 300 310 320 40 50 60 70 80 90 pF1KB9 CDKTTAVEYNKV-HMAMTHYECNERGINFSRKSPLTQSQRTITGWSAFESNKCEENFSQS ...... .:. : :.:.: :.: : ::. . .: . .. ..: . :..: CCDS74 FSNSSTLANHKITHTEEKPYKCKECDKAFKRLSTLTKHKIIHAGEKLYKCEECGKAFNRS 330 340 350 360 370 380 100 110 120 130 140 150 pF1KB9 SAHIVHQKTQAGDKFGEHNECTDALYQKLDFTAHQRIHTDFTAHQKFYLSDEHGKCRKSF : .:. ..:.: . .:: :. . ..: :.:.:: ..: . : : :.: CCDS74 SNLTIHKFIHTGEKPYKCEECGKAFNWSSSLTKHKRFHT----REKPFKCKE---CGKAF 390 400 410 420 430 160 170 180 190 200 210 pF1KB9 YWKAHLIQHERPHSGEKTYQYEECAKSFCSSSHPIQHPGTYVGFKLYECNECGKAFCQNS :.. : .:.: :.::: :. :::.:.: .:: .: ..: : :. .:::::: :. CCDS74 IWSSTLTRHKRIHTGEKPYKCEECGKAFRQSSTLTKHKIIHTGEKPYKFEECGKAFRQSL 440 450 460 470 480 490 220 230 240 250 260 pF1KB9 NLSKHLRIHTKEKPCDNNGCGRSYK--SPLIGHQKTDAEMEL--CG--GSEYGKTSHLKG .:.:: ::..::: . ::...: : : :. : .: : :. ....: :. 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CCDS82 KVFRYNSYLGRHRRVHTGEKPYKCNECGKAFSMHSNLATHQVIHTGTKPFKCNECSKVFT 400 410 420 430 440 450 490 500 510 520 530 540 pF1KB9 HNSALRAHQNIHTGEKLYECSECGKTFFQKTRLSTHRRIHTGEKPYECSKCGKTFSQKSY .:: : :. :::::: :.:.::::.: .. :.::. ::.:::::.: .:::.:.:::. CCDS82 QNSQLANHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSVRSSLTTHQAIHSGEKPYKCIECGKSFTQKSH 460 470 480 490 500 510 550 560 570 580 590 600 pF1KB9 LSGHERIHTGEKPYECNVCGKTFVYKAALIVHQRIHTGEKPYECNECGKTFSQRTHLCAH : .:. ::.:::::.:: :::.:. . : : :.:::::::.::.::..::.:. : : CCDS82 LRSHRGIHSGEKPYKCNECGKVFAQTSQLARHWRVHTGEKPYKCNDCGRAFSDRSSLTFH 520 530 540 550 560 570 610 620 630 640 650 660 pF1KB9 QRIHTGEKPYECNECGKTFADNSALRAHHRIHTGEKPYECNDCGKTFSKTSHLRAHLRTR : ::::::::.:.::::.: :: : .:.:::::::::.::.:::.:: :.: .: . 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