FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB9128, 902 aa 1>>>pF1KB9128 902 - 902 aa - 902 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.0489+/-0.00128; mu= 12.1421+/- 0.077 mean_var=111.3843+/-20.950, 0's: 0 Z-trim(102.8): 103 B-trim: 54 in 1/51 Lambda= 0.121524 statistics sampled from 7026 (7131) to 7026 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.561), E-opt: 0.2 (0.219), width: 16 Scan time: 4.260 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS55516.1 MCF2 gene_id:4168|Hs108|chrX ( 941) 5584 991.1 0 CCDS55517.1 MCF2 gene_id:4168|Hs108|chrX (1001) 5584 991.1 0 CCDS14667.1 MCF2 gene_id:4168|Hs108|chrX ( 925) 3155 565.3 1.9e-160 CCDS48175.1 MCF2 gene_id:4168|Hs108|chrX ( 985) 3155 565.3 2e-160 CCDS55514.1 MCF2 gene_id:4168|Hs108|chrX ( 821) 2715 488.1 2.8e-137 CCDS55515.1 MCF2 gene_id:4168|Hs108|chrX ( 860) 2616 470.8 4.9e-132 CCDS9527.3 MCF2L gene_id:23263|Hs108|chr13 (1123) 1513 277.4 1e-73 CCDS45070.2 MCF2L gene_id:23263|Hs108|chr13 (1125) 1513 277.4 1e-73 CCDS81782.1 MCF2L gene_id:23263|Hs108|chr13 ( 984) 1467 269.3 2.4e-71 CCDS3243.1 MCF2L2 gene_id:23101|Hs108|chr3 (1114) 1259 232.9 2.6e-60 CCDS8947.1 ARHGEF25 gene_id:115557|Hs108|chr12 ( 580) 631 122.7 2e-27 CCDS44931.1 ARHGEF25 gene_id:115557|Hs108|chr12 ( 619) 631 122.7 2.1e-27 CCDS3883.1 TRIO gene_id:7204|Hs108|chr5 (3097) 609 119.1 1.2e-25 CCDS3027.1 KALRN gene_id:8997|Hs108|chr3 (1663) 576 113.2 4e-24 CCDS82829.1 KALRN gene_id:8997|Hs108|chr3 (1654) 574 112.9 5.1e-24 CCDS3028.1 KALRN gene_id:8997|Hs108|chr3 (1289) 501 100.0 2.9e-20 CCDS45512.1 PLEKHG4 gene_id:25894|Hs108|chr16 (1110) 464 93.5 2.3e-18 CCDS32466.1 PLEKHG4 gene_id:25894|Hs108|chr16 (1191) 464 93.5 2.5e-18 CCDS34124.1 PLEKHG4B gene_id:153478|Hs108|chr5 (1271) 462 93.2 3.3e-18 CCDS34552.1 PLEKHG1 gene_id:57480|Hs108|chr6 (1385) 447 90.6 2.2e-17 CCDS76690.1 PLEKHG3 gene_id:26030|Hs108|chr14 (1219) 394 81.3 1.2e-14 CCDS33022.2 PLEKHG2 gene_id:64857|Hs108|chr19 (1386) 368 76.7 3.3e-13 CCDS42754.1 ARHGEF4 gene_id:50649|Hs108|chr2 ( 670) 360 75.2 4.6e-13 CCDS2165.1 ARHGEF4 gene_id:50649|Hs108|chr2 ( 690) 360 75.2 4.7e-13 CCDS83477.1 ARHGEF9 gene_id:23229|Hs108|chrX ( 495) 346 72.7 2e-12 CCDS35315.1 ARHGEF9 gene_id:23229|Hs108|chrX ( 516) 346 72.7 2e-12 CCDS55430.1 ARHGEF9 gene_id:23229|Hs108|chrX ( 463) 344 72.3 2.4e-12 CCDS66517.1 SPATA13 gene_id:221178|Hs108|chr13 ( 574) 337 71.1 6.6e-12 CCDS66518.1 SPATA13 gene_id:221178|Hs108|chr13 ( 596) 337 71.1 6.8e-12 CCDS9305.1 SPATA13 gene_id:221178|Hs108|chr13 ( 652) 337 71.1 7.4e-12 CCDS55429.1 ARHGEF9 gene_id:23229|Hs108|chrX ( 414) 333 70.3 8.1e-12 CCDS53857.1 SPATA13 gene_id:221178|Hs108|chr13 (1277) 337 71.3 1.3e-11 >>CCDS55516.1 MCF2 gene_id:4168|Hs108|chrX (941 aa) initn: 5583 init1: 5583 opt: 5584 Z-score: 5295.6 bits: 991.1 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 5838; 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CCDS95 QGFREVKAILDAASQKIATFTDIGNSLAHVEHLLRDLASFEEKSGVAVERARALSLDGEQ 330 340 350 360 370 380 250 260 270 280 290 300 pF1KB9 LAANHHYALDLICQRCNELRYLSDILVNEIKAKRIQLSRTFKMHKLLQQARQCCDEGECL : .:.:::.: : .:.:::.: : . :: .: ::.....:. :. . . :::: : CCDS95 LIGNKHYAVDSIRPKCQELRHLCDQFSAEIARRRGLLSKSLELHRRLETSMKWCDEGIYL 390 400 410 420 430 440 310 320 330 340 350 360 pF1KB9 LANQEIDKFQSKEDAQKALQDIENFLEMALPFINYEPETLQYEFDVILSPELKVQMKTIQ ::.: .:: ::.. :. :::.::.::: . : ... :.. ::. .: ... . 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CCDS95 GDLGKLLMQGSFSVWTDHKRGHTKVKELARFKPMQRHLFLHEKAVLFCKKREENGEGYEK 800 810 820 830 840 850 730 740 750 760 770 780 pF1KB9 YPSYSFKHCWKMDEVGITEYVKGDNRKFEIWYGEKEEVYIVQASNVDVKMTWLKEIRNIL ::::.:. .: ::::: :::: .::::::. .:::::::: . ..: .:..:::..: CCDS95 APSYSYKQSLNMAAVGITENVKGDAKKFEIWYNAREEVYIVQAPTPEIKAAWVNEIRKVL 860 870 880 890 900 910 790 800 810 820 830 840 pF1KB9 LKQQELLTVKKRKQQDQLTERDKFQISLQQNDEKQQGA---FISTEETELEHTSTVVEVC .: : . .. .:. : . ... . . ..: . . :: . . : : CCDS95 TSQ--LQACREASQHRALEQSQSLPLPAPTSTSPSRGNSRNIKKLEERKTDPLSLEGYVS 920 930 940 950 960 970 850 860 870 880 890 900 pF1KB9 EAIASVQAEANTVWTEASQSAEISEEPAEWSSNYFYPTYDENEEENRPLMRPVSEMALLY : . : . :...:.: : :. . ::: . .. ::. CCDS95 SAPLTKPPEKGKGWSKTSHSLEAPEDDGGWSSAEEQINSSDAEEDGGLGPKKLVPGKYTV 980 990 1000 1010 1020 1030 CCDS95 VADHEKGGPDALRVRSGDVVELVQEGDEGLWYVRDPTTGKEGWVPASSLSVRLGPSGSAQ 1040 1050 1060 1070 1080 1090 >>CCDS45070.2 MCF2L gene_id:23263|Hs108|chr13 (1125 aa) initn: 2252 init1: 1455 opt: 1513 Z-score: 1437.0 bits: 277.4 E(32554): 1e-73 Smith-Waterman score: 2381; 43.8% identity (68.9% similar) in 915 aa overlap (15-887:121-1017) 10 20 30 40 pF1KB9 MAEANPRRGKMRFRRNAASFPGNLHLVLVLRPTSFLQRTFTDIG : :::::.::.::::::::.:.:::..::. CCDS45 IPSLQDAGIGFILVIDRRRDKWTSVKASVLRIAASFPANLQLVLVLRPTGFFQRTLSDIA 100 110 120 130 140 150 50 60 pF1KB9 FWFSQEDFMLKLP---------------------------------------AIENFALT : :...:: .:.: :::.::: CCDS45 FKFNRDDFKMKVPVIMLSSVPDLHGYIDKSQLTEDLGGTLDYCHSRWLCQRTAIESFALM 160 170 180 190 200 210 70 80 90 100 110 120 pF1KB9 VKEMAQMLQSFGTELAETELPDDIPSIEEILAIRAERYHLLKNDITAVTKEGKILLTNLE ::. :::::::::::::::::.:. : .: ..:. :.:. . :::. .: .:. 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CCDS45 AYVEELLCVLEGYAAEMDNPLMAHLLSTGLHNKKDVLFGNMEEIYHFHNRIFLRELENYT 620 630 640 650 660 670 550 560 570 580 590 600 pF1KB9 HAPERVGPCFLERKDDFQMYAKYCQNKPRSETIWRKYSECAFFQECQRKLKHRLRLDSYL :: :: ::::: .:::.: ::::::::::..::. :.: ::::::::: :.: ::::: CCDS45 DCPELVGRCFLERMEDFQIYEKYCQNKPRSESLWRQCSDCPFFQECQRKLDHKLSLDSYL 680 690 700 710 720 730 610 620 630 640 650 660 pF1KB9 LKPVQRITKYQLLLKELLKYSKDCEGSALLKKALDAMLDLLKSVNDSMHQIAINGYIGNL ::::::::::::::::.::::..:::. :..::...: .::.:::::: :::.:: ::: CCDS45 LKPVQRITKYQLLLKEMLKYSRNCEGAEDLQEALSSILGILKAVNDSMHLIAITGYDGNL 740 750 760 770 780 790 670 680 690 700 710 720 pF1KB9 NELGKMIMQGGFSVWIGHKKGATKMKDLARFKPMQRHLFLYEKAIVFCKRRVESGEGSDR ..:::..:::.:::: ::.: ::.:.:::::::::::::.:::..:::.: :.::: .. CCDS45 GDLGKLLMQGSFSVWTDHKRGHTKVKELARFKPMQRHLFLHEKAVLFCKKREENGEGYEK 800 810 820 830 840 850 730 740 750 760 770 780 pF1KB9 YPSYSFKHCWKMDEVGITEYVKGDNRKFEIWYGEKEEVYIVQASNVDVKMTWLKEIRNIL ::::.:. .: ::::: :::: .::::::. .:::::::: . ..: .:..:::..: CCDS45 APSYSYKQSLNMAAVGITENVKGDAKKFEIWYNAREEVYIVQAPTPEIKAAWVNEIRKVL 860 870 880 890 900 910 790 800 810 820 830 840 pF1KB9 LKQQELLTVKKRKQQDQLTERDKFQISLQQNDEKQQGA---FISTEETELEHTSTVVEVC .: : . .. .:. : . ... . . ..: . . :: . . : : CCDS45 TSQ--LQACREASQHRALEQSQSLPLPAPTSTSPSRGNSRNIKKLEERKTDPLSLEGYVS 920 930 940 950 960 970 850 860 870 880 890 900 pF1KB9 EAIASVQAEANTVWTEASQSAEISEEPAEWSSNYFYPTYDENEEENRPLMRPVSEMALLY : . : . :...:.: : :. . ::: . .. ::. CCDS45 SAPLTKPPEKGKGWSKTSHSLEAPEDDGGWSSAEEQINSSDAEEDGGLGPKKLVPGKYTV 980 990 1000 1010 1020 1030 CCDS45 VADHEKGGPDALRVRSGDVVELVQEGDEGLWYVRDPTTGKEGWVPASSLSVRLGPSGSAQ 1040 1050 1060 1070 1080 1090 >>CCDS81782.1 MCF2L gene_id:23263|Hs108|chr13 (984 aa) initn: 2252 init1: 1455 opt: 1467 Z-score: 1394.3 bits: 269.3 E(32554): 2.4e-71 Smith-Waterman score: 2335; 45.1% identity (70.2% similar) in 860 aa overlap (15-835:119-960) 10 20 30 40 pF1KB9 MAEANPRRGKMRFRRNAASFPGNLHLVLVLRPTSFLQRTFTDIG : :::::.::.::::::::.:.:::..::. CCDS81 IPSLQDAGIGFILVIDRRRDKWTSVKASVLRIAASFPANLQLVLVLRPTGFFQRTLSDIA 90 100 110 120 130 140 50 60 pF1KB9 FWFSQEDFMLKLP---------------------------------------AIENFALT : :...:: .:.: :::.::: CCDS81 FKFNRDDFKMKVPVIMLSSVPDLHGYIDKSQLTEDLGGTLDYCHSRWLCQRTAIESFALM 150 160 170 180 190 200 70 80 90 100 110 120 pF1KB9 VKEMAQMLQSFGTELAETELPDDIPSIEEILAIRAERYHLLKNDITAVTKEGKILLTNLE ::. :::::::::::::::::.:. : .: ..:. :.:. . :::. .: .:. 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CCDS81 LASQPVDKCQSQDGAEAALQEIEKFLETGAENKIQELNAIYKEYESILNQDLMEHVRKVF 450 460 470 480 490 500 370 380 390 400 410 420 pF1KB9 LKLENIRSIFENQQAGFRNLADKHVRPIQFVVPTPENLVTSGTPFFSSKQVGVGYSFFQA : ... .:. .::....:: ...::.: :.: :: :. : : : . : . CCDS81 QKQASMEEVFHRRQASLKKLAARQTRPVQPVAPRPEALAKSPCP---SPGIRRG-----S 510 520 530 540 550 430 440 450 460 470 480 pF1KB9 CKLFSKGKKTWRQNQSNLKIEVVPDCQEKRSSGPSSSLDNGNSLDVLKNHVLNELIQTER . :.: : : :. . : . :.: .. .:: .:. ::..::..::: CCDS81 ENSSSEGGALRRGPYRRAKSEMSESRQGRGSAG-----EEEESLAILRRHVMSELLDTER 560 570 580 590 600 610 490 500 510 520 530 540 pF1KB9 VYVRELYTVLLGYRAEMDNPEMFDLMPPLLRNKKDILFGNMAEIYEFHNDIFLSSLENCA .::.:: :: :: :::::: : :. :.::::.::::: :::.::: ::: ::: . 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CCDS81 GDLGKLLMQGSFSVWTDHKRGHTKVKELARFKPMQRHLFLHEKAVLFCKKREENGEGYEK 800 810 820 830 840 850 730 740 750 760 770 780 pF1KB9 YPSYSFKHCWKMDEVGITEYVKGDNRKFEIWYGEKEEVYIVQASNVDVKMTWLKEIRNIL ::::.:. .: ::::: :::: .::::::. .:::::::: . ..: .:..:::..: CCDS81 APSYSYKQSLNMAAVGITENVKGDAKKFEIWYNAREEVYIVQAPTPEIKAAWVNEIRKVL 860 870 880 890 900 910 790 800 810 820 830 840 pF1KB9 LKQQELLTVKKRKQQDQLTERDKFQISLQQNDEKQQGAFISTEETELEHTSTVVEVCEAI .: : . .. .:. : . ... . . ..: . .. : ..: CCDS81 TSQ--LQACREASQHRALEQSQSLPLPAPTSTSPSRGNSRNIKKLEERKTDPLSLEGYVS 920 930 940 950 960 970 850 860 870 880 890 900 pF1KB9 ASVQAEANTVWTEASQSAEISEEPAEWSSNYFYPTYDENEEENRPLMRPVSEMALLY CCDS81 SAPLTKPPEKGKEP 980 >>CCDS3243.1 MCF2L2 gene_id:23101|Hs108|chr3 (1114 aa) initn: 1555 init1: 607 opt: 1259 Z-score: 1196.4 bits: 232.9 E(32554): 2.6e-60 Smith-Waterman score: 1700; 35.4% identity (65.0% similar) in 892 aa overlap (10-829:115-988) 10 20 30 pF1KB9 MAEANPRRGKMRFRRNAASFPGNLHLVLVLRPTSFLQRT : . : :..:::::.:...:::. :.::: CCDS32 TYLTSIPSVEAASIGFIVVIDRRRDKWSSVKASLTRIAVAFPGNLQLIFILRPSRFIQRT 90 100 110 120 130 140 40 50 60 pF1KB9 FTDIGFWFSQEDFMLKLP---------------------------------------AIE :::::. . ...: :.: ::: CCDS32 FTDIGIKYYRNEFKTKVPIIMVNSVSDLHGYIDKSQLTRELGGTLEYRHGQWVNHRTAIE 150 160 170 180 190 200 70 80 90 100 110 120 pF1KB9 NFALTVKEMAQMLQSFGTELAETELPDDIPSIEEILAIRAERYHLLKNDITAVTKEGKIL :::::.: :::::.::. :: .::: .. : :..: .... :.... . :.: : CCDS32 NFALTLKTTAQMLQTFGSCLATAELPRSMLSTEDLLMSHTRQRDKLQDELKLLGKQGTTL 210 220 230 240 250 260 130 140 150 160 170 180 pF1KB9 LTNLEVPDTEGAVSSRLECHRQISGDWQTINKLLTQVHDMETAFDGFWEKHQLKMEQYLQ :. .. : :. .:.:. . :. . :...::.:. . : ::. :: .:.::..: :: CCDS32 LSCIQEPATKCP-NSKLNLN-QLE-NVTTMERLLVQLDETEKAFSHFWSEHHLKLNQCLQ 270 280 290 300 310 320 190 200 210 220 230 240 pF1KB9 LWKFEQDFQQLVTEVEFLLNQQAELADVTGTIAQVKQKIKKLENLDENSQELLSKAQFVI : .::.:: . .. ::..:::.. . .. .:.: .:. ..:.:.::: : :::.. CCDS32 LQHFEHDFCKAKLALDNLLEEQAEFTGIGDSVMHVEQILKEHKKLEEKSQEPLEKAQLLA 330 340 350 360 370 380 250 260 270 280 290 300 pF1KB9 LHGHKLAANHHYALDLICQRCNELRYLSDILVNEIKAKRIQLSRTFKMHKLLQQARQCCD : : .: .:::: : : :: :::.: : ..: : : :......:. :... : :. CCDS32 LVGDQLIQSHHYAADAIRPRCVELRHLCDDFINGNKKKWDILGKSLEFHRQLDKVSQWCE 390 400 410 420 430 440 310 320 330 340 350 360 pF1KB9 EGECLLANQEIDKFQSKEDAQKALQDIENFLEMALPFINYEPETLQYEFDVILSPELKVQ : :::.: .:: ::.: .. ::.:: .:: . . :. . ::...:. . :.. 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CCDS32 YKMKDLIRFKPSQRQIYLFERGIVFCKIRMEPGD-QGLSPHYSFKKTMKLMTLSIRQLGR 860 870 880 890 900 910 750 760 770 780 790 800 pF1KB9 GDNRKFEIWYGEKEEVYIVQASNVDVKMTWLKEIRNILLKQQELLTVKKRKQQDQLTERD :..::::: . : ::.::.. ... :..:: ..:..::. ..: :: . CCDS32 GSHRKFEIASRNGLEKYILQAASKEIRDCWFSEISKLLMEQQN--NIK-----DQGN--P 920 930 940 950 960 810 820 830 840 850 860 pF1KB9 KFQISLQQNDEKQQGAFISTEETELEHTSTVVEVCEAIASVQAEANTVWTEASQSAEISE .:..: .... .: .:.. : CCDS32 QFEMSTSKGSGAGSGPWIKNMERATTSKEDPASSTGGIKGCSSREFSSMDTFEDCEGAED 970 980 990 1000 1010 1020 902 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Thu Nov 3 23:03:03 2016 done: Thu Nov 3 23:03:04 2016 Total Scan time: 4.260 Total Display time: 0.310 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]