Result of FASTA (ccds) for
pF1KB9259
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9259, 979 aa
1>>>pF1KB9259 979 - 979 aa - 979 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.2966+/-0.000866; mu= 5.9392+/- 0.052
mean_var=252.3419+/-51.281, 0's: 0 Z-trim(115.9): 34 B-trim: 108 in 1/52
Lambda= 0.080738
statistics sampled from 16459 (16489) to 16459 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.786), E-opt: 0.2 (0.507), width: 16
Scan time: 5.780
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS30670.1 DLGAP3 gene_id:58512|Hs108|chr1 ( 979) 6853 811.8 0
CCDS47760.1 DLGAP2 gene_id:9228|Hs108|chr8 ( 975) 1492 187.3 1.3e-46
CCDS42406.1 DLGAP1 gene_id:9229|Hs108|chr18 ( 675) 1157 148.2 5.4e-35
CCDS56051.1 DLGAP1 gene_id:9229|Hs108|chr18 ( 683) 1157 148.2 5.4e-35
CCDS11836.1 DLGAP1 gene_id:9229|Hs108|chr18 ( 977) 1157 148.3 7.1e-35
CCDS13274.1 DLGAP4 gene_id:22839|Hs108|chr20 ( 989) 1081 139.5 3.3e-32
CCDS75689.1 DLGAP2 gene_id:9228|Hs108|chr8 ( 961) 1070 138.2 7.9e-32
CCDS56050.1 DLGAP1 gene_id:9229|Hs108|chr18 ( 685) 1037 134.2 8.7e-31
CCDS77146.1 DLGAP1 gene_id:9229|Hs108|chr18 ( 693) 1037 134.2 8.8e-31
CCDS74191.1 DLGAP1 gene_id:9229|Hs108|chr18 ( 699) 1037 134.2 8.9e-31
CCDS56052.1 DLGAP1 gene_id:9229|Hs108|chr18 ( 661) 925 121.1 7.2e-27
CCDS13275.1 DLGAP4 gene_id:22839|Hs108|chr20 ( 453) 889 116.8 9.9e-26
CCDS56049.1 DLGAP1 gene_id:9229|Hs108|chr18 ( 627) 853 112.7 2.3e-24
CCDS56053.1 DLGAP1 gene_id:9229|Hs108|chr18 ( 929) 853 112.9 3.1e-24
>>CCDS30670.1 DLGAP3 gene_id:58512|Hs108|chr1 (979 aa)
initn: 6853 init1: 6853 opt: 6853 Z-score: 4325.3 bits: 811.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6853; 100.0% identity (100.0% similar) in 979 aa overlap (1-979:1-979)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MRGYHGDRGSHPRPARFADQQHMDVGPAARAPYLLGSREAFSTEPRFCAPRAGLGHISPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 MRGYHGDRGSHPRPARFADQQHMDVGPAARAPYLLGSREAFSTEPRFCAPRAGLGHISPE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 GPLSLSEGPSVGPEGGPAGAGVGGGSSTFPRMYPGQGPFDTCEDCVGHPQGKGAPRLPPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 GPLSLSEGPSVGPEGGPAGAGVGGGSSTFPRMYPGQGPFDTCEDCVGHPQGKGAPRLPPT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 LLDQFEKQLPVQQDGFHTLPYQRGPAGAGPGPAPGTGTAPEPRSESPSRIRHLVHSVQKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LLDQFEKQLPVQQDGFHTLPYQRGPAGAGPGPAPGTGTAPEPRSESPSRIRHLVHSVQKL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 FAKSHSLEAPGKRDYNGPKAEGRGGSGGDSYPGPGSGGPHTSHHHHHHHHHHHHQSRHGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 FAKSHSLEAPGKRDYNGPKAEGRGGSGGDSYPGPGSGGPHTSHHHHHHHHHHHHQSRHGK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 RSKSKDRKGDGRHQAKSTGWWSSDDNLDSDSGFLAGGRPPGEPGGPFCLEGPDGSYRDLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 RSKSKDRKGDGRHQAKSTGWWSSDDNLDSDSGFLAGGRPPGEPGGPFCLEGPDGSYRDLS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 FKGRSGGSEGRCLACTGMSMSLDGQSVKRSAWHTMMVSQGRDGYPGAGPGKGLLGPETKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 FKGRSGGSEGRCLACTGMSMSLDGQSVKRSAWHTMMVSQGRDGYPGAGPGKGLLGPETKA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 KARTYHYLQVPQDDWGGYPTGGKDGEIPCRRMRSGSYIKAMGDEESGDSDGSPKTSPKAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 KARTYHYLQVPQDDWGGYPTGGKDGEIPCRRMRSGSYIKAMGDEESGDSDGSPKTSPKAV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 ARRFTTRRSSSVDQARINCCVPPRIHPRSSIPGYSRSLTTGQLSDELNQQLEAVCGSVFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 ARRFTTRRSSSVDQARINCCVPPRIHPRSSIPGYSRSLTTGQLSDELNQQLEAVCGSVFG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 ELESQAVDALDLPGCFRMRSHSYLRAIQAGCSQDDDCLPLLATPAAVSGRPGSSFNFRKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 ELESQAVDALDLPGCFRMRSHSYLRAIQAGCSQDDDCLPLLATPAAVSGRPGSSFNFRKA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB9 PPPIPPGSQAPPRISITAQSSTDSAHESFTAAEGPARRCSSADGLDGPAMGARTLELAPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 PPPIPPGSQAPPRISITAQSSTDSAHESFTAAEGPARRCSSADGLDGPAMGARTLELAPV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB9 PPRASPKPPTLIIKTIPGREELRSLARQRKWRPSIGVQVETISDSDTENRSRREFHSIGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 PPRASPKPPTLIIKTIPGREELRSLARQRKWRPSIGVQVETISDSDTENRSRREFHSIGV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB9 QVEEDKRRARFKRSNSVTAGVQADLELEGLAGLATVATEDKALQFGRSFQRHASEPQPGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 QVEEDKRRARFKRSNSVTAGVQADLELEGLAGLATVATEDKALQFGRSFQRHASEPQPGP
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB9 RAPTYSVFRTVHTQGQWAYREGYPLPYEPPATDGSPGPAPAPTPGPGAGRRDSWIERGSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 RAPTYSVFRTVHTQGQWAYREGYPLPYEPPATDGSPGPAPAPTPGPGAGRRDSWIERGSR
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB9 SLPDSGRASPCPRDGEWFIKMLRAEVEKLEHWCQQMEREAEDYELPEEILEKIRSAVGST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 SLPDSGRASPCPRDGEWFIKMLRAEVEKLEHWCQQMEREAEDYELPEEILEKIRSAVGST
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB9 QLLLSQKVQQFFRLCQQSMDPTAFPVPTFQDLAGFWDLLQLSIEDVTLKFLELQQLKANS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 QLLLSQKVQQFFRLCQQSMDPTAFPVPTFQDLAGFWDLLQLSIEDVTLKFLELQQLKANS
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB9 WKLLEPKEEKKVPPPIPKKPLRGRGVPVKERSLDSVDRQRQEARKRLLAAKRAASFRHSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 WKLLEPKEEKKVPPPIPKKPLRGRGVPVKERSLDSVDRQRQEARKRLLAAKRAASFRHSS
910 920 930 940 950 960
970
pF1KB9 ATESADSIEIYIPEAQTRL
:::::::::::::::::::
CCDS30 ATESADSIEIYIPEAQTRL
970
>>CCDS47760.1 DLGAP2 gene_id:9228|Hs108|chr8 (975 aa)
initn: 2006 init1: 606 opt: 1492 Z-score: 950.5 bits: 187.3 E(32554): 1.3e-46
Smith-Waterman score: 2776; 47.5% identity (67.2% similar) in 1055 aa overlap (1-979:1-975)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MRGYHGDRGSHP----RPARFA---DQQHMDVGPAARAPYLLGSREAFSTEPRFCAPRAG
:.: :.: . : . .: : .:. :: :: ::::. .. . :.::..
CCDS47 MKGLSGSRTQPPLCSGHTCGLAPPEDCEHLHHGPDARPPYLLSPADSCPGGRHRCSPRSS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 LGHISPEGPLSLSEGPSVGPEGGPAGAGVGGGSSTFPRMYPGQGPFDTCEDCVGHPQGKG
. :. :.. : :::::::. .. .:: .::. :
CCDS47 VHSECVMMPVVLGDHVS---------------SSTFPRMHYSSH-YDTRDDCAVAHAGAK
70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 APRLPPTLLDQFEKQLPVQQDGFHTLPYQRGPAGAGPGPAPGTGTAPEPRSESPSRIRHL
:.: .::::::::::...:::::: ::: :..: : :::::.:::::
CCDS47 INRIPANLLDQFEKQLPLHRDGFHTLQYQR------------TSAAAEQRSESPGRIRHL
110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 VHSVQKLFAKSHSLEAPGKRDYNGPKAEGRGGSGGDSYPGPGSGGPHTSHHHHHHHHHHH
::::::::.::::::. .: . :: ::.::. . :::
CCDS47 VHSVQKLFTKSHSLEGSSKSNANGTKADGRADD-----------------------HHHA
160 170 180
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 HQSRHGKRSKSKDRKGDGRHQAKSTGWWSSDDNLDSDSGFLAGGRPPGEPGGPFCLEGPD
:...:.::::::.:: .:. . ..:::::::::::: . . . . :: ::
CCDS47 HHAKHSKRSKSKERKPEGKPRPGMSSWWSSDDNLDSDSTYRTPSVLNRHHLGPVAHCYPD
190 200 210 220 230 240
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 G---SYRDLSFKGRSGGSEGRCLACTGMSMSLDGQSVKRSAWHTMMVSQGRDGYPGAGPG
. . :::.: ..... .: :: :.... :.. .:::.: :. :::....: .. .
CCDS47 ALQSPFGDLSLKTSKSNNDVKCSACEGLALTPDAKYLKRSSWSTLTVSQAKEAYRKSSLN
250 260 270 280 290 300
360 370 380 390 400
pF1KB9 --KGLLGPETKAKARTYHYLQVPQDDWGGYPTGGKDGEIPCRRMRSGSYIKAMGDEESGD
: :: ..: : ::::::::.:::::::::: ::::::::::::::::::::::.
CCDS47 LDKPLLHQDAKPALRPCHYLQVPQDEWGGYPTGGKDEEIPCRRMRSGSYIKAMGDEESGE
310 320 330 340 350 360
410 420 430 440
pF1KB9 SDGSPKTSPKAVA-----------RRFTTRRSSSVDQARINCCVPPRIHP---------R
::.:::::::.. : . ..... :: . : . : :
CCDS47 SDSSPKTSPKSAILPEPLLKSIGQRPLGEHQTQTYLQAASDVPVGHSLDPAANYNSPKFR
370 380 390 400 410 420
450 460 470 480 490 500
pF1KB9 SSIPGYSRSLTT-------GQLSD-ELNQQLEAVCGSVFGELESQAVDALDLPGCFRMRS
: .: :...: .:.:. :.: :.:.:: :::.:.::::.:::::::::: ::
CCDS47 SRNQSYMRAVSTLSQASCVSQVSEAEINGQFESVCESVFSEVESQAMDALDLPGCFRTRS
430 440 450 460 470 480
510 520 530 540 550
pF1KB9 HSYLRAIQAGCSQDDDCLPLLATPAAVSGRPGSS-----FNFRKAPPPIPPGSQAPPRIS
:::::::::: ::::.:.:.. ::. ... :. :..:.:::.:: . . : ::
CCDS47 HSYLRAIQAGYSQDDECIPMM-TPSDITSTIRSTAAVSYTNYKKTPPPVPPRTTSKPLIS
490 500 510 520 530 540
560 570 580 590 600
pF1KB9 ITAQSSTDSAHESFTAAEGPARRCS-----------SADGLDGPAMGARTLELAPVPPRA
.::::::.:..... .. :.: : :.:.::. .:: : . :
CCDS47 VTAQSSTESTQDAYQ--DSRAQRMSPWPQDSRGLYNSTDSLDSNKAMNLALETA-AAQRH
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640
pF1KB9 SPKPPTLIIKTIPGREELRSLARQR-KWR-PSIGVQ--------------VETISDSDTE
:. . ..: . : : :.. : : :::.: ::: .:::::
CCDS47 LPESQSSSVRT-SDKAILVSKAEELLKSRCSSIGIQDSEFPEHQPYPRSDVETATDSDTE
610 620 630 640 650 660
650 660 670 680 690 700
pF1KB9 NRSRREFHSIGVQVEEDKRRARFKRSNSVTAGVQADLELEGLAGLATVATEDKALQFGRS
.:. ::.::.:::::..::..::::::::::.:::::::::. : ..::::.:::: :
CCDS47 SRGLREYHSVGVQVEDEKRHGRFKRSNSVTAAVQADLELEGFPG--HITTEDKGLQFGSS
670 680 690 700 710 720
710 720 730 740 750 760
pF1KB9 FQRHASEPQPGPRAPT-YSVFRTVHTQGQWAYREGYPLPYEPPATDGSPGPAPAPTPGPG
:::: :::. .:: ::. :::.::: ..::: : .: : : : :
CCDS47 FQRH-SEPS----TPTQYSAVRTVRTQGLFSYREDY-----RTQVDTSTLPPPDP-----
730 740 750 760
770 780 790 800 810 820
pF1KB9 AGRRDSWIERGSRSLPDSGRASPCPRDGEWFIKMLRAEVEKLEHWCQQMEREAEDYELPE
:.: . .. ..:: ::: ::: ::.:.:.::....: ::..::::::. .: :
CCDS47 ------WLEPAIDTV-ETGRMSPCRRDGSWFLKLLHAETKRMEGWCKEMEREAEENDLSE
770 780 790 800 810 820
830 840 850 860 870 880
pF1KB9 EILEKIRSAVGSTQLLLSQKVQQFFRLCQQSMDPTAFPVPTFQDLAGFWDLLQLSIEDVT
::: ::::::::.:::.::: :::. ::::.:::.:.: :: :::::.::.::::::::.
CCDS47 EILGKIRSAVGSAQLLMSQKFQQFYWLCQQNMDPSAMPRPTSQDLAGYWDMLQLSIEDVS
830 840 850 860 870 880
890 900 910 920 930 940
pF1KB9 LKFLELQQLKANSWKLLE-P--KEEKKVPPPIPKKPLRGRGVPVKERSLDSVDRQRQEAR
.:: :::.:. :.::..: : :::.:::::::::: .:. ..:.::: ::::::::
CCDS47 MKFDELQRLRLNDWKMMESPERKEERKVPPPIPKKPPKGKFPITREKSLDLPDRQRQEAR
890 900 910 920 930 940
950 960 970
pF1KB9 KRLLAAKRAASFRHSSATESADSIEIYIPEAQTRL
.::.:::::::::..::.: :::::::::::::::
CCDS47 RRLMAAKRAASFRQNSASERADSIEIYIPEAQTRL
950 960 970
>>CCDS42406.1 DLGAP1 gene_id:9229|Hs108|chr18 (675 aa)
initn: 1508 init1: 772 opt: 1157 Z-score: 741.8 bits: 148.2 E(32554): 5.4e-35
Smith-Waterman score: 1622; 45.2% identity (66.1% similar) in 684 aa overlap (369-979:17-675)
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 QGRDGYPGAGPGKGLLGPETKAKARTYHYLQVPQDDWGGYPTGGKDGEIPCRRMRSGSYI
.::::.: :: ::: :::::::::::::
CCDS42 MNLIFHKDILFGIPANKVPQDEWTGYTPRGKDDEIPCRRMRSGSYI
10 20 30 40
400 410 420 430
pF1KB9 KAMGDEESGDSDGSPKTSPKAVARR-------------FTTRRSSS--------------
::::::.::::: ::: :::..::: .:: . :.
CCDS42 KAMGDEDSGDSDTSPKPSPKVAARRESYLKATQPSLTELTTLKISNEHSPKLQIRSHSYL
50 60 70 80 90 100
440 450 460 470
pF1KB9 --VDQARINCCV----PPRI--HP--RSSIPGYSRSLTT-GQLSD-ELNQQLEAVCGSVF
:... :: . : . : :: .: :...: .:.:. :.: :.:.:: :::
CCDS42 RAVSEVSINRSLDSLDPAGLLTSPKFRSRNESYMRAMSTISQVSEMEVNGQFESVCESVF
110 120 130 140 150 160
480 490 500 510 520 530
pF1KB9 GELESQAVDALDLP--GCFRMRSHSYLRAIQAGCSQDDDCLPLLA-----TPAAVSGRPG
.:::::::.::::: ::::::::::.:::. ::::::.:. : . : ..: .
CCDS42 SELESQAVEALDLPMPGCFRMRSHSYVRAIEKGCSQDDECVSLRSSSPPRTTTTVRTIQS
170 180 190 200 210 220
540 550 560 570 580
pF1KB9 SSFN-----FRKAPPPIPPGSQAPPRISITAQSSTDSAHESFTAAEGPARRCSSADGLDG
:. . ..:.:::.:: . . : :::::::::.::.... ..: : .::..
CCDS42 STVSSCITTYKKTPPPVPPRTTTKPFISITAQSSTESAQDAYMDGQGQRGDIISQSGLSN
230 240 250 260 270 280
590 600 610 620 630
pF1KB9 P-----AMGART--LELA------PVPPRASPKPPTLIIKTIPGR--EELRSLARQRKWR
.: : : .: : :. . . . :. : . : :. . .: :
CCDS42 STESLDSMKALTAAIEAANAQIHGPASQHMGNNTATVTTTTTIATVTTEDRKKDHFKKNR
290 300 310 320 330 340
640 650 660 670 680
pF1KB9 P-SIGVQVETISDSDT--ENRSRREFHSIGVQVEEDKRRARFKRSNSVTAGVQADLELEG
:::.::. . : ::.. .:.:.::::::.: :: ::::::..:::::...
CCDS42 CLSIGIQVDDAEEPDKTGENKAPSKFQSVGVQVEEEKCFRRFTRSNSVTTAVQADLDFHD
350 360 370 380 390 400
690 700 710 720 730 740
pF1KB9 LAGLATVATEDKALQ--FGRSFQRHASEPQPGPRAPTYSVFRTVHTQGQWAYREGYPLPY
. . ::.. ..:.:.: :: :: ::. . ..
CCDS42 NLENSLESIEDNSCPGPMARQFSRDASTS-------------TVSIQGSGNHYHACAAD-
410 420 430 440 450
750 760 770 780 790 800
pF1KB9 EPPATDGSPGPAPAPTPGPGAGRRDSWIERGSRSLPDSGRASPCPRDGEWFIKMLRAEVE
. :: .:. : : : ::. ... .. . : : :::.::.:.:.:: .
CCDS42 DDFDTDFDPSILPPPDP---------WIDSITEDPLEAVQRSVCHRDGHWFLKLLQAERD
460 470 480 490 500
810 820 830 840 850 860
pF1KB9 KLEHWCQQMEREAEDYELPEEILEKIRSAVGSTQLLLSQKVQQFFRLCQQSMDPTAFPVP
..: :::::::: .. .:::.:: :::.::::.:::..:: :: .::.....:.: : :
CCDS42 RMEGWCQQMEREERENNLPEDILGKIRTAVGSAQLLMAQKFYQFRELCEENLNPNAHPRP
510 520 530 540 550 560
870 880 890 900 910 920
pF1KB9 TFQDLAGFWDLLQLSIEDVTLKFLELQQLKANSWKLLEP--KEEKKVPPPIPKKPLRGRG
: ::::::::.::::::....:: ::.:::::.:: ..: :.:...:::.:::: .: .
CCDS42 TSQDLAGFWDMLQLSIENISMKFDELHQLKANNWKQMDPLDKKERRAPPPVPKKPAKGPA
570 580 590 600 610 620
930 940 950 960 970
pF1KB9 VPVKERSLDSVDRQRQEARKRLLAAKRAASFRHSSATESADSIEIYIPEAQTRL
..::::.: :::::::::.::::::: :..::::::.:::::::::::::
CCDS42 PLIRERSLES--SQRQEARKRLMAAKRAASVRQNSATESAESIEIYIPEAQTRL
630 640 650 660 670
>>CCDS56051.1 DLGAP1 gene_id:9229|Hs108|chr18 (683 aa)
initn: 1513 init1: 772 opt: 1157 Z-score: 741.7 bits: 148.2 E(32554): 5.4e-35
Smith-Waterman score: 1627; 45.3% identity (66.1% similar) in 684 aa overlap (369-979:25-683)
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 QGRDGYPGAGPGKGLLGPETKAKARTYHYLQVPQDDWGGYPTGGKDGEIPCRRMRSGSYI
:::::.: :: ::: :::::::::::::
CCDS56 MIDLFKAEWVSSVCVQVSRNGRTDQVPQDEWTGYTPRGKDDEIPCRRMRSGSYI
10 20 30 40 50
400 410 420 430
pF1KB9 KAMGDEESGDSDGSPKTSPKAVARR-------------FTTRRSSS--------------
::::::.::::: ::: :::..::: .:: . :.
CCDS56 KAMGDEDSGDSDTSPKPSPKVAARRESYLKATQPSLTELTTLKISNEHSPKLQIRSHSYL
60 70 80 90 100 110
440 450 460 470
pF1KB9 --VDQARINCCV----PPRI--HP--RSSIPGYSRSLTT-GQLSD-ELNQQLEAVCGSVF
:... :: . : . : :: .: :...: .:.:. :.: :.:.:: :::
CCDS56 RAVSEVSINRSLDSLDPAGLLTSPKFRSRNESYMRAMSTISQVSEMEVNGQFESVCESVF
120 130 140 150 160 170
480 490 500 510 520 530
pF1KB9 GELESQAVDALDLP--GCFRMRSHSYLRAIQAGCSQDDDCLPLLA-----TPAAVSGRPG
.:::::::.::::: ::::::::::.:::. ::::::.:. : . : ..: .
CCDS56 SELESQAVEALDLPMPGCFRMRSHSYVRAIEKGCSQDDECVSLRSSSPPRTTTTVRTIQS
180 190 200 210 220 230
540 550 560 570 580
pF1KB9 SSFN-----FRKAPPPIPPGSQAPPRISITAQSSTDSAHESFTAAEGPARRCSSADGLDG
:. . ..:.:::.:: . . : :::::::::.::.... ..: : .::..
CCDS56 STVSSCITTYKKTPPPVPPRTTTKPFISITAQSSTESAQDAYMDGQGQRGDIISQSGLSN
240 250 260 270 280 290
590 600 610 620 630
pF1KB9 P-----AMGART--LELA------PVPPRASPKPPTLIIKTIPGR--EELRSLARQRKWR
.: : : .: : :. . . . :. : . : :. . .: :
CCDS56 STESLDSMKALTAAIEAANAQIHGPASQHMGNNTATVTTTTTIATVTTEDRKKDHFKKNR
300 310 320 330 340 350
640 650 660 670 680
pF1KB9 P-SIGVQVETISDSDT--ENRSRREFHSIGVQVEEDKRRARFKRSNSVTAGVQADLELEG
:::.::. . : ::.. .:.:.::::::.: :: ::::::..:::::...
CCDS56 CLSIGIQVDDAEEPDKTGENKAPSKFQSVGVQVEEEKCFRRFTRSNSVTTAVQADLDFHD
360 370 380 390 400 410
690 700 710 720 730 740
pF1KB9 LAGLATVATEDKALQ--FGRSFQRHASEPQPGPRAPTYSVFRTVHTQGQWAYREGYPLPY
. . ::.. ..:.:.: :: :: ::. . ..
CCDS56 NLENSLESIEDNSCPGPMARQFSRDASTS-------------TVSIQGSGNHYHACAAD-
420 430 440 450 460
750 760 770 780 790 800
pF1KB9 EPPATDGSPGPAPAPTPGPGAGRRDSWIERGSRSLPDSGRASPCPRDGEWFIKMLRAEVE
. :: .:. : : : ::. ... .. . : : :::.::.:.:.:: .
CCDS56 DDFDTDFDPSILPPPDP---------WIDSITEDPLEAVQRSVCHRDGHWFLKLLQAERD
470 480 490 500 510
810 820 830 840 850 860
pF1KB9 KLEHWCQQMEREAEDYELPEEILEKIRSAVGSTQLLLSQKVQQFFRLCQQSMDPTAFPVP
..: :::::::: .. .:::.:: :::.::::.:::..:: :: .::.....:.: : :
CCDS56 RMEGWCQQMEREERENNLPEDILGKIRTAVGSAQLLMAQKFYQFRELCEENLNPNAHPRP
520 530 540 550 560 570
870 880 890 900 910 920
pF1KB9 TFQDLAGFWDLLQLSIEDVTLKFLELQQLKANSWKLLEP--KEEKKVPPPIPKKPLRGRG
: ::::::::.::::::....:: ::.:::::.:: ..: :.:...:::.:::: .: .
CCDS56 TSQDLAGFWDMLQLSIENISMKFDELHQLKANNWKQMDPLDKKERRAPPPVPKKPAKGPA
580 590 600 610 620 630
930 940 950 960 970
pF1KB9 VPVKERSLDSVDRQRQEARKRLLAAKRAASFRHSSATESADSIEIYIPEAQTRL
..::::.: :::::::::.::::::: :..::::::.:::::::::::::
CCDS56 PLIRERSLES--SQRQEARKRLMAAKRAASVRQNSATESAESIEIYIPEAQTRL
640 650 660 670 680
>>CCDS11836.1 DLGAP1 gene_id:9229|Hs108|chr18 (977 aa)
initn: 1911 init1: 772 opt: 1157 Z-score: 739.6 bits: 148.3 E(32554): 7.1e-35
Smith-Waterman score: 2173; 41.1% identity (62.5% similar) in 1065 aa overlap (1-979:1-977)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MRGYHGDRGSHPRPARFADQQHMDVGPAARAPYLLGSREAFSTEPRFCAPRAGLGHISPE
:.: :.: :: . . . . : ::::. : .. . . : ..
CCDS11 MKGLSGSR-SHHHGVTCDSACDSLSHHSDRKPYLLSPVEHHPADHPYYTQRNSF------
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB9 GPLSLSEGPSVGPEGGPAGAGVGGGSSTFPR-MYPGQGPF-DTCEDCVGHPQGKGAPRLP
.. ::: . : .:::::: : .: . : : : . . : :.:
CCDS11 ------QAECVGPFSDPL------ASSTFPRRHYTSQQELKDECA-LVPRTLATKANRIP
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 PTLLDQFEKQLPVQQDGFHTLPYQRGPAGAGPGPAPGTGTAPEPRSESPSRIRHLVHSVQ
.::::::.:::...::.::: :.: :: : ::.::.::::::::::
CCDS11 ANLLDQFERQLPLSRDGYHTLQYKR--------------TAVEHRSDSPGRIRHLVHSVQ
110 120 130 140
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 KLFAKSHSLEAPGKRDYNGPKAEGRGGSGGDSYPGPGSGGPHTSHHHHHHHHHHHHQSRH
:::.::::::.:.: . :: :: .: .. .:.
CCDS11 KLFTKSHSLEGPSKGSVNGGKA-----------------SPDEAQ-----------AARY
150 160 170
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 GKRSKSKDRKGDGRHQ-AKSTGWWSSDDNLDSD-------SGFLAGGRPPGEPGGPFCLE
:::::::.:... . . . : ::::::::::.: :: .. :: : . .. . ::
CCDS11 GKRSKSKERRAEPKARPSTSPGWWSSDDNLDGDMCIYHAPSGVMTMGRCPDRSASQYFLE
180 190 200 210 220 230
300 310 320 330 340
pF1KB9 GPDGSYRDLSFKGRSGGSEGRCLACTGMSMSLDGQSVKRSAWH-TMMVSQGRDGYPGAGP
. . . . . :. .... .: .:... .::: .:.::: :. ::..:. : :.
CCDS11 AYN-TISEQAVKASRSNNDVKCSTCANLPVSLDTPLLKKSAWSSTLTVSRAREVYQKASV
240 250 260 270 280 290
350 360 370 380 390 400
pF1KB9 G--KGLLGPETKAKARTYHYLQVPQDDWGGYPTGGKDGEIPCRRMRSGSYIKAMGDEESG
. .... :. . :. .:::::::.: :: ::: :::::::::::::::::::.::
CCDS11 NMDQAMVKSESCQQERSCQYLQVPQDEWTGYTPRGKDDEIPCRRMRSGSYIKAMGDEDSG
300 310 320 330 340 350
410 420 430
pF1KB9 DSDGSPKTSPKAVARR-------------FTTRRSSS----------------VDQARIN
::: ::: :::..::: .:: . :. :... ::
CCDS11 DSDTSPKPSPKVAARRESYLKATQPSLTELTTLKISNEHSPKLQIRSHSYLRAVSEVSIN
360 370 380 390 400 410
440 450 460 470 480
pF1KB9 CCV----PPRI--HP--RSSIPGYSRSLTT-GQLSD-ELNQQLEAVCGSVFGELESQAVD
. : . : :: .: :...: .:.:. :.: :.:.:: :::.:::::::.
CCDS11 RSLDSLDPAGLLTSPKFRSRNESYMRAMSTISQVSEMEVNGQFESVCESVFSELESQAVE
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530
pF1KB9 ALDLP--GCFRMRSHSYLRAIQAGCSQDDDCLPLLA-----TPAAVSGRPGSSFN-----
::::: ::::::::::.:::. ::::::.:. : . : ..: .:. .
CCDS11 ALDLPMPGCFRMRSHSYVRAIEKGCSQDDECVSLRSSSPPRTTTTVRTIQSSTVSSCITT
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB9 FRKAPPPIPPGSQAPPRISITAQSSTDSAHESFTAAEGPARRCSSADGLDGP-----AMG
..:.:::.:: . . : :::::::::.::.... ..: : .::.. .:
CCDS11 YKKTPPPVPPRTTTKPFISITAQSSTESAQDAYMDGQGQRGDIISQSGLSNSTESLDSMK
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640
pF1KB9 ART--LELA------PVPPRASPKPPTLIIKTIPGR--EELRSLARQRKWRP-SIGVQVE
: : .: : :. . . . :. : . : :. . .: : :::.::.
CCDS11 ALTAAIEAANAQIHGPASQHMGNNTATVTTTTTIATVTTEDRKKDHFKKNRCLSIGIQVD
600 610 620 630 640 650
650 660 670 680 690
pF1KB9 TISDSDT--ENRSRREFHSIGVQVEEDKRRARFKRSNSVTAGVQADLELEGLAGLATVAT
. : ::.. .:.:.::::::.: :: ::::::..:::::... . .
CCDS11 DAEEPDKTGENKAPSKFQSVGVQVEEEKCFRRFTRSNSVTTAVQADLDFHDNLENSLESI
660 670 680 690 700 710
700 710 720 730 740 750
pF1KB9 EDKALQ--FGRSFQRHASEPQPGPRAPTYSVFRTVHTQGQWAYREGYPLPYEPPATDGSP
::.. ..:.:.: :: :: ::. . .. . :: .:
CCDS11 EDNSCPGPMARQFSRDASTS-------------TVSIQGSGNHYHACAAD-DDFDTDFDP
720 730 740 750 760
760 770 780 790 800 810
pF1KB9 GPAPAPTPGPGAGRRDSWIERGSRSLPDSGRASPCPRDGEWFIKMLRAEVEKLEHWCQQM
. : : : ::. ... .. . : : :::.::.:.:.:: ...: :::::
CCDS11 SILPPPDP---------WIDSITEDPLEAVQRSVCHRDGHWFLKLLQAERDRMEGWCQQM
770 780 790 800 810
820 830 840 850 860 870
pF1KB9 EREAEDYELPEEILEKIRSAVGSTQLLLSQKVQQFFRLCQQSMDPTAFPVPTFQDLAGFW
::: .. .:::.:: :::.::::.:::..:: :: .::.....:.: : :: :::::::
CCDS11 EREERENNLPEDILGKIRTAVGSAQLLMAQKFYQFRELCEENLNPNAHPRPTSQDLAGFW
820 830 840 850 860 870
880 890 900 910 920 930
pF1KB9 DLLQLSIEDVTLKFLELQQLKANSWKLLEP--KEEKKVPPPIPKKPLRGRGVPVKERSLD
:.::::::....:: ::.:::::.:: ..: :.:...:::.:::: .: . ..::::.
CCDS11 DMLQLSIENISMKFDELHQLKANNWKQMDPLDKKERRAPPPVPKKPAKGPAPLIRERSLE
880 890 900 910 920 930
940 950 960 970
pF1KB9 SVDRQRQEARKRLLAAKRAASFRHSSATESADSIEIYIPEAQTRL
: :::::::::.::::::: :..::::::.:::::::::::::
CCDS11 S--SQRQEARKRLMAAKRAASVRQNSATESAESIEIYIPEAQTRL
940 950 960 970
>>CCDS13274.1 DLGAP4 gene_id:22839|Hs108|chr20 (989 aa)
initn: 1377 init1: 535 opt: 1081 Z-score: 691.7 bits: 139.5 E(32554): 3.3e-32
Smith-Waterman score: 1762; 36.6% identity (58.3% similar) in 1083 aa overlap (1-979:1-989)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MRGYHGDRGSHPRP-ARFADQQHMDV-GPAARAPYLLGSREAFSTEPRFCAPRAGLGHIS
:.: :: :.:: . : : . . . : ::::. :::. : :: : : . .
CCDS13 MKGL-GD--SRPRHLSDSLDPPHEPLFAGTDRNPYLLSPTEAFAREARF--P--GQNTLP
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 PEGPLSLSEGPSVGPEGGPAGAGVGGGSSTFPRMY-------PGQGPFDTCEDCVGHPQG
.: . :.. .. : : ::::::.. : ..:: . : :.
CCDS13 GDGLFPLNN--QLPP---P--------SSTFPRIHYNSHFEVPEESPFPS------HAQA
60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 KGAPRLPPTLLDQFEKQLPVQQDGFHTLPYQRGPAGAGPGPAPGTGTAPEPRSESPSRIR
::: .::::::::::...::: :: . :: : : :.:::.:::
CCDS13 TKINRLPANLLDQFEKQLPIHRDGFSTLQFPRGEAKA--------------RGESPGRIR
100 110 120 130 140
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 HLVHSVQKLFAKSHSLEAPGKRDYNGPKAEGRGGS-GGDSYPGPGSGGPHTSHHHHHHHH
:::::::.:: . .:. :: .:. ::. : .::
CCDS13 HLVHSVQRLFFTK------------APSLEGTAGKVGGN---GSKKGG------------
150 160 170
240 250 260 270 280
pF1KB9 HHHHQSRHGKRSKSKDRK--GDGRHQAKS--TGWWSSDDNLDSDSG-FLAGGRPPG----
.. .:.:.:::.: :. .....: .::::::::::...: : ..: :
CCDS13 ---MEDGKGRRAKSKERAKAGEPKRRSRSNISGWWSSDDNLDGEAGAFRSSGPASGLMTL
180 190 200 210 220 230
290 300 310 320
pF1KB9 ----EPGGPFCLEGPDGSYRDLSFKG-RSGGSEGRC--------LACTGMSMSLDGQSVK
: . : . .. .: ... .: .: ..... : . ::
CCDS13 GRQAERSQPRYFMHAYNTISGHMLKTTKNNTTELTAPPPPPAPPATCPSLGVGTDTNYVK
240 250 260 270 280 290
330 340 350 360 370 380
pF1KB9 RSAWHTMMVSQGRD--GYPGAGPGKGLLGPETKAKARTYHYLQVPQD--DWGGY---PT-
:..: :. .:.... .: :.:: .. .. .::::::: .:. :
CCDS13 RGSWSTLTLSHAHEVCQKTSATLDKSLLKSKSCHQGLAYHYLQVPGGGGEWSTTLLSPRE
300 310 320 330 340 350
390 400 410 420
pF1KB9 --GGKDGEIPCRRMRSGSYIKAMGDEESGDSDGSPKTSPKAVARRFT-------------
.. .: ::::::::::::::::::.: .: :::: :::..::: .
CCDS13 TDAAAEGPIPCRRMRSGSYIKAMGDEDSDESGGSPKPSPKTAARRQSYLRATQQSLGEQS
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460
pF1KB9 -TRRS----SSVDQARINCC---------VPPRIHPRSSIPG-YSRSLTTGQL-------
::: .:::. . : : .. : : .... ::
CCDS13 NPRRSLDRLDSVDMLLPSKCPSWEEDYTPVSDSLNDSSCISQIFGQASLIPQLFGHEQQV
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KB9 -SDELNQQLEAVCGSVFGELESQAVDALDLP--GCFRMRSHSYLRAIQAGCSQDDDCLPL
::..: ::.: :. .: :: :...:::: . :: :::::::::::::::..: . :
CCDS13 REAELSDQYEAACESACSEAESTAAETLDLPLPSYFRSRSHSYLRAIQAGCSQEEDSVSL
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570
pF1KB9 LA-TPAAVSGR-------PGSS--FNFRKAPPPIPPGSQAPPRISITAQSSTDSAHESFT
. .: .: :.:: ..:.:::.:: . . : ::.:.::::.::....
CCDS13 QSLSPPPSTGSLSNSRTLPSSSCLVAYKKTPPPVPPRTTSKPFISVTVQSSTESAQDTYL
540 550 560 570 580 590
580 590 600 610 620
pF1KB9 AAEGPARRCSSADGLDGPAMGARTLELAPVPPRASPKPPTLIIKTI-PGREELRSLARQR
.. . .: .::.. .. .:. .: .::.. . :. : . ..
CCDS13 DSQDHKSEVTSQSGLSN---SSDSLD-------SSTRPPSVTRGGVAPAPEAPEPPPKHA
600 610 620 630 640
630 640 650 660 670 680
pF1KB9 KWRPSIGVQVETISDSDTENRSRREFHSIGVQVEEDKRRARFKRSNSVTA-GVQADLELE
. :. : :.: : .:.. :::.: . . ......:. : :.:
CCDS13 ALKSEQGTL--TSSESHPEAAPKRKLSSIGIQERTRRNGSHLSEDNGPKAIDVMAPSSES
650 660 670 680 690
690 700 710 720 730 740
pF1KB9 GLAGLATVA-------TEDKALQFGRSFQRHASEPQPGPRAPTYSVF-RTVHTQGQWAYR
.. . . . :.: . .: .: . : : . . .. : . .:
CCDS13 SVPSHSMSSRRDTDSDTQDANDSSCKSSERSLPDCTPHPNSISIDAGPRQAPKIAQIKRN
700 710 720 730 740 750
750 760 770 780 790 800
pF1KB9 EGYPLPYEPPATDGSPGPAPAPTPGPGAGRRDSWIERGSRSLPDSGRASPCPRDGEWFIK
.: :: ..: : : : :.: .: : . .. . : ::: ::.:
CCDS13 LSYG-DNSDPALEASSLPPPDP-----------WLETSSSSPAEPAQPGACRRDGYWFLK
760 770 780 790 800
810 820 830 840 850 860
pF1KB9 MLRAEVEKLEHWCQQMEREAEDYELPEEILEKIRSAVGSTQLLLSQKVQQFFRLCQQSMD
.:.::.:.:: :: ::..:... .: ::.: :. :::::.:::.::: ::: ::.:...
CCDS13 LLQAETERLEGWCCQMDKETKENNLSEEVLGKVLSAVGSAQLLMSQKFQQFRGLCEQNLN
810 820 830 840 850 860
870 880 890 900 910
pF1KB9 PTAFPVPTFQDLAGFWDLLQLSIEDVTLKFLELQQLKANSWKLLE-P---KEEKKVPPPI
: : : :: ::::::::::::::::...:: :: .::::::.:.: : ::::: :::.
CCDS13 PDANPRPTAQDLAGFWDLLQLSIEDISMKFDELYHLKANSWQLVETPEKRKEEKKPPPPV
870 880 890 900 910 920
920 930 940 950 960 970
pF1KB9 PKKPLRGRGVPVKERSLDSVDRQRQEARKRLLAAKRAASFRHSSATESADSIEIYIPEAQ
:::: ... . .... :. :.::::::::::::::::: :..::::::::::::.::::
CCDS13 PKKPAKSKPAVSRDKASDASDKQRQEARKRLLAAKRAASVRQNSATESADSIEIYVPEAQ
930 940 950 960 970 980
pF1KB9 TRL
:::
CCDS13 TRL
>>CCDS75689.1 DLGAP2 gene_id:9228|Hs108|chr8 (961 aa)
initn: 2035 init1: 606 opt: 1070 Z-score: 685.0 bits: 138.2 E(32554): 7.9e-32
Smith-Waterman score: 2814; 48.1% identity (68.1% similar) in 1041 aa overlap (1-979:1-961)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MRGYHGDRGSHP----RPARFA---DQQHMDVGPAARAPYLLGSREAFSTEPRFCAPRAG
:.: :.: . : . .: : .:. :: :: ::::. .. . :.::..
CCDS75 MKGLSGSRTQPPLCSGHTCGLAPPEDCEHLHHGPDARPPYLLSPADSCPGGRHRCSPRSS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 LGHISPEGPLSLSEGPSVGPEGGPAGAGVGGGSSTFPRMYPGQGPFDTCEDCVGHPQGKG
. :. :.. : :::::::. .. .:: .::. :
CCDS75 VHSECVMMPVVLGDHVS---------------SSTFPRMHYSSH-YDTRDDCAVAHAGAK
70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 APRLPPTLLDQFEKQLPVQQDGFHTLPYQRGPAGAGPGPAPGTGTAPEPRSESPSRIRHL
:.: .::::::::::...:::::: ::: :..: : :::::.:::::
CCDS75 INRIPANLLDQFEKQLPLHRDGFHTLQYQR------------TSAAAEQRSESPGRIRHL
110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 VHSVQKLFAKSHSLEAPGKRDYNGPKAEGRGGSGGDSYPGPGSGGPHTSHHHHHHHHHHH
::::::::.::::::. .: . :: ::.::. . :::
CCDS75 VHSVQKLFTKSHSLEGSSKSNANGTKADGRADD-----------------------HHHA
160 170 180
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 HQSRHGKRSKSKDRKGDGRHQAKSTGWWSSDDNLDSDSGFLAGGRPPGEPGGPFCLEGPD
:...:.::::::.:: .:. . ..:::::::::::: . . . . :: ::
CCDS75 HHAKHSKRSKSKERKPEGKPRPGMSSWWSSDDNLDSDSTYRTPSVLNRHHLGPVAHCYPD
190 200 210 220 230 240
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 G---SYRDLSFKGRSGGSEGRCLACTGMSMSLDGQSVKRSAWHTMMVSQGRDGYPGAGPG
. . :::.: ..... .: :: :.... :.. .:::.: :. :::....: .. .
CCDS75 ALQSPFGDLSLKTSKSNNDVKCSACEGLALTPDAKYLKRSSWSTLTVSQAKEAYRKSSLN
250 260 270 280 290 300
360 370 380 390 400
pF1KB9 --KGLLGPETKAKARTYHYLQVPQDDWGGYPTGGKDGEIPCRRMRSGSYIKAMGDEESGD
: :: ..: : ::::::::.:::::::::: ::::::::::::::::::::::.
CCDS75 LDKPLLHQDAKPALRPCHYLQVPQDEWGGYPTGGKDEEIPCRRMRSGSYIKAMGDEESGE
310 320 330 340 350 360
410 420 430 440
pF1KB9 SDGSPKTSPKAVA-----------RRFTTRRSSSVDQARINCCVPPRIHP---------R
::.:::::::.. : . ..... :: . : . : :
CCDS75 SDSSPKTSPKSAILPEPLLKSIGQRPLGEHQTQTYLQAASDVPVGHSLDPAANYNSPKFR
370 380 390 400 410 420
450 460 470 480 490 500
pF1KB9 SSIPGYSRSLTT-------GQLSD-ELNQQLEAVCGSVFGELESQAVDALDLPGCFRMRS
: .: :...: .:.:. :.: :.:.:: :::.:.::::.:::::::::: ::
CCDS75 SRNQSYMRAVSTLSQASCVSQVSEAEINGQFESVCESVFSEVESQAMDALDLPGCFRTRS
430 440 450 460 470 480
510 520 530 540 550
pF1KB9 HSYLRAIQAGCSQDDDCLPLLATPAAVSGRPGSS-----FNFRKAPPPIPPGSQAPPRIS
:::::::::: ::::.:.:.. ::. ... :. :..:.:::.:: . . : ::
CCDS75 HSYLRAIQAGYSQDDECIPMM-TPSDITSTIRSTAAVSYTNYKKTPPPVPPRTTSKPLIS
490 500 510 520 530 540
560 570 580 590 600
pF1KB9 ITAQSSTDSAHESFTAAEGPARRCS-----------SADGLDGPAMGARTLELAPVPPRA
.::::::.:..... .. :.: : :.:.::. .:: : . :
CCDS75 VTAQSSTESTQDAYQ--DSRAQRMSPWPQDSRGLYNSTDSLDSNKAMNLALETA-AAQRH
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB9 SPKPPTLIIKTIPGREELRSLARQR-KWR-PSIGVQVETISDSDTENRSRREFHSIGVQV
:. . ..: . : : :.. : : :::.:::: .:::::.:. ::.::.::::
CCDS75 LPESQSSSVRT-SDKAILVSKAEELLKSRCSSIGIQVETATDSDTESRGLREYHSVGVQV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB9 EEDKRRARFKRSNSVTAGVQADLELEGLAGLATVATEDKALQFGRSFQRHASEPQPGPRA
:..::..::::::::::.:::::::::. : ..::::.:::: ::::: :::. .
CCDS75 EDEKRHGRFKRSNSVTAAVQADLELEGFPG--HITTEDKGLQFGSSFQRH-SEPS----T
670 680 690 700 710
730 740 750 760 770 780
pF1KB9 PT-YSVFRTVHTQGQWAYREGYPLPYEPPATDGSPGPAPAPTPGPGAGRRDSWIERGSRS
:: ::. :::.::: ..::: : .: : : : : :.: . .
CCDS75 PTQYSAVRTVRTQGLFSYREDY-----RTQVDTSTLPPPDP-----------WLEPAIDT
720 730 740 750 760
790 800 810 820 830 840
pF1KB9 LPDSGRASPCPRDGEWFIKMLRAEVEKLEHWCQQMEREAEDYELPEEILEKIRSAVGSTQ
. ..:: ::: ::: ::.:.:.::....: ::..::::::. .: :::: ::::::::.:
CCDS75 V-ETGRMSPCRRDGSWFLKLLHAETKRMEGWCKEMEREAEENDLSEEILGKIRSAVGSAQ
770 780 790 800 810 820
850 860 870 880 890 900
pF1KB9 LLLSQKVQQFFRLCQQSMDPTAFPVPTFQDLAGFWDLLQLSIEDVTLKFLELQQLKANSW
::.::: :::. ::::.:::.:.: :: :::::.::.::::::::..:: :::.:. :.:
CCDS75 LLMSQKFQQFYWLCQQNMDPSAMPRPTSQDLAGYWDMLQLSIEDVSMKFDELQRLRLNDW
830 840 850 860 870 880
910 920 930 940 950
pF1KB9 KLLE-P--KEEKKVPPPIPKKPLRGRGVPVKERSLDSVDRQRQEARKRLLAAKRAASFRH
:..: : :::.:::::::::: .:. ..:.::: ::::::::.::.:::::::::.
CCDS75 KMMESPERKEERKVPPPIPKKPPKGKFPITREKSLDLPDRQRQEARRRLMAAKRAASFRQ
890 900 910 920 930 940
960 970
pF1KB9 SSATESADSIEIYIPEAQTRL
.::.: :::::::::::::::
CCDS75 NSASERADSIEIYIPEAQTRL
950 960
>>CCDS56050.1 DLGAP1 gene_id:9229|Hs108|chr18 (685 aa)
initn: 1508 init1: 772 opt: 1037 Z-score: 666.2 bits: 134.2 E(32554): 8.7e-31
Smith-Waterman score: 1603; 44.7% identity (65.4% similar) in 694 aa overlap (369-979:17-685)
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 QGRDGYPGAGPGKGLLGPETKAKARTYHYLQVPQDDWGGYPTGGKDGEIPCRRMRSGSYI
.::::.: :: ::: :::::::::::::
CCDS56 MNLIFHKDILFGIPANKVPQDEWTGYTPRGKDDEIPCRRMRSGSYI
10 20 30 40
400 410 420 430
pF1KB9 KAMGDEESGDSDGSPKTSPKAVARR-------------FTTRRSSS--------------
::::::.::::: ::: :::..::: .:: . :.
CCDS56 KAMGDEDSGDSDTSPKPSPKVAARRESYLKATQPSLTELTTLKISNEHSPKLQIRSHSYL
50 60 70 80 90 100
440 450 460 470
pF1KB9 --VDQARINCCV----PPRI--HP--RSSIPGYSRSLTT-GQLSD-ELNQQLEAVCGSVF
:... :: . : . : :: .: :...: .:.:. :.: :.:.:: :::
CCDS56 RAVSEVSINRSLDSLDPAGLLTSPKFRSRNESYMRAMSTISQVSEMEVNGQFESVCESVF
110 120 130 140 150 160
480 490 500 510 520
pF1KB9 GELESQAVDALDLP--GCFRMRSHSYLRAIQAGCSQDDDCLPLLAT-PA-------AVSG
.:::::::.::::: ::::::::::.:::. ::::::.:. : .. : ....
CCDS56 SELESQAVEALDLPMPGCFRMRSHSYVRAIEKGCSQDDECVSLRSSSPPRTTTTVRTIQS
170 180 190 200 210 220
530 540 550 560 570
pF1KB9 RPG----SS--------FNFRKAPPPIPPGSQAPPRISITAQSSTDSAHESFTAAEGPAR
: :: ...:.:::.:: . . : :::::::::.::.... ..:
CCDS56 STGVIKLSSAVEVSSCITTYKKTPPPVPPRTTTKPFISITAQSSTESAQDAYMDGQGQRG
230 240 250 260 270 280
580 590 600 610 620
pF1KB9 RCSSADGLDGP-----AMGART--LELA------PVPPRASPKPPTLIIKTIPGR--EEL
: .::.. .: : : .: : :. . . . :. : . :
CCDS56 DIISQSGLSNSTESLDSMKALTAAIEAANAQIHGPASQHMGNNTATVTTTTTIATVTTED
290 300 310 320 330 340
630 640 650 660 670
pF1KB9 RSLARQRKWRP-SIGVQVETISDSDT--ENRSRREFHSIGVQVEEDKRRARFKRSNSVTA
:. . .: : :::.::. . : ::.. .:.:.::::::.: :: ::::::.
CCDS56 RKKDHFKKNRCLSIGIQVDDAEEPDKTGENKAPSKFQSVGVQVEEEKCFRRFTRSNSVTT
350 360 370 380 390 400
680 690 700 710 720 730
pF1KB9 GVQADLELEGLAGLATVATEDKALQ--FGRSFQRHASEPQPGPRAPTYSVFRTVHTQGQW
.:::::... . . ::.. ..:.:.: :: :: ::.
CCDS56 AVQADLDFHDNLENSLESIEDNSCPGPMARQFSRDASTS-------------TVSIQGSG
410 420 430 440 450
740 750 760 770 780 790
pF1KB9 AYREGYPLPYEPPATDGSPGPAPAPTPGPGAGRRDSWIERGSRSLPDSGRASPCPRDGEW
. .. . :: .:. : : : ::. ... .. . : : :::.:
CCDS56 NHYHACAAD-DDFDTDFDPSILPPPDP---------WIDSITEDPLEAVQRSVCHRDGHW
460 470 480 490 500
800 810 820 830 840 850
pF1KB9 FIKMLRAEVEKLEHWCQQMEREAEDYELPEEILEKIRSAVGSTQLLLSQKVQQFFRLCQQ
:.:.:.:: ...: :::::::: .. .:::.:: :::.::::.:::..:: :: .::..
CCDS56 FLKLLQAERDRMEGWCQQMEREERENNLPEDILGKIRTAVGSAQLLMAQKFYQFRELCEE
510 520 530 540 550 560
860 870 880 890 900 910
pF1KB9 SMDPTAFPVPTFQDLAGFWDLLQLSIEDVTLKFLELQQLKANSWKLLEP--KEEKKVPPP
...:.: : :: ::::::::.::::::....:: ::.:::::.:: ..: :.:...:::
CCDS56 NLNPNAHPRPTSQDLAGFWDMLQLSIENISMKFDELHQLKANNWKQMDPLDKKERRAPPP
570 580 590 600 610 620
920 930 940 950 960 970
pF1KB9 IPKKPLRGRGVPVKERSLDSVDRQRQEARKRLLAAKRAASFRHSSATESADSIEIYIPEA
.:::: .: . ..::::.: :::::::::.::::::: :..::::::.:::::::::
CCDS56 VPKKPAKGPAPLIRERSLES--SQRQEARKRLMAAKRAASVRQNSATESAESIEIYIPEA
630 640 650 660 670 680
pF1KB9 QTRL
::::
CCDS56 QTRL
>>CCDS77146.1 DLGAP1 gene_id:9229|Hs108|chr18 (693 aa)
initn: 1513 init1: 772 opt: 1037 Z-score: 666.1 bits: 134.2 E(32554): 8.8e-31
Smith-Waterman score: 1608; 44.8% identity (65.4% similar) in 694 aa overlap (369-979:25-693)
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 QGRDGYPGAGPGKGLLGPETKAKARTYHYLQVPQDDWGGYPTGGKDGEIPCRRMRSGSYI
:::::.: :: ::: :::::::::::::
CCDS77 MIDLFKAEWVSSVCVQVSRNGRTDQVPQDEWTGYTPRGKDDEIPCRRMRSGSYI
10 20 30 40 50
400 410 420 430
pF1KB9 KAMGDEESGDSDGSPKTSPKAVARR-------------FTTRRSSS--------------
::::::.::::: ::: :::..::: .:: . :.
CCDS77 KAMGDEDSGDSDTSPKPSPKVAARRESYLKATQPSLTELTTLKISNEHSPKLQIRSHSYL
60 70 80 90 100 110
440 450 460 470
pF1KB9 --VDQARINCCV----PPRI--HP--RSSIPGYSRSLTT-GQLSD-ELNQQLEAVCGSVF
:... :: . : . : :: .: :...: .:.:. :.: :.:.:: :::
CCDS77 RAVSEVSINRSLDSLDPAGLLTSPKFRSRNESYMRAMSTISQVSEMEVNGQFESVCESVF
120 130 140 150 160 170
480 490 500 510 520
pF1KB9 GELESQAVDALDLP--GCFRMRSHSYLRAIQAGCSQDDDCLPLLAT-PA-------AVSG
.:::::::.::::: ::::::::::.:::. ::::::.:. : .. : ....
CCDS77 SELESQAVEALDLPMPGCFRMRSHSYVRAIEKGCSQDDECVSLRSSSPPRTTTTVRTIQS
180 190 200 210 220 230
530 540 550 560 570
pF1KB9 RPG----SS--------FNFRKAPPPIPPGSQAPPRISITAQSSTDSAHESFTAAEGPAR
: :: ...:.:::.:: . . : :::::::::.::.... ..:
CCDS77 STGVIKLSSAVEVSSCITTYKKTPPPVPPRTTTKPFISITAQSSTESAQDAYMDGQGQRG
240 250 260 270 280 290
580 590 600 610 620
pF1KB9 RCSSADGLDGP-----AMGART--LELA------PVPPRASPKPPTLIIKTIPGR--EEL
: .::.. .: : : .: : :. . . . :. : . :
CCDS77 DIISQSGLSNSTESLDSMKALTAAIEAANAQIHGPASQHMGNNTATVTTTTTIATVTTED
300 310 320 330 340 350
630 640 650 660 670
pF1KB9 RSLARQRKWRP-SIGVQVETISDSDT--ENRSRREFHSIGVQVEEDKRRARFKRSNSVTA
:. . .: : :::.::. . : ::.. .:.:.::::::.: :: ::::::.
CCDS77 RKKDHFKKNRCLSIGIQVDDAEEPDKTGENKAPSKFQSVGVQVEEEKCFRRFTRSNSVTT
360 370 380 390 400 410
680 690 700 710 720 730
pF1KB9 GVQADLELEGLAGLATVATEDKALQ--FGRSFQRHASEPQPGPRAPTYSVFRTVHTQGQW
.:::::... . . ::.. ..:.:.: :: :: ::.
CCDS77 AVQADLDFHDNLENSLESIEDNSCPGPMARQFSRDASTS-------------TVSIQGSG
420 430 440 450 460
740 750 760 770 780 790
pF1KB9 AYREGYPLPYEPPATDGSPGPAPAPTPGPGAGRRDSWIERGSRSLPDSGRASPCPRDGEW
. .. . :: .:. : : : ::. ... .. . : : :::.:
CCDS77 NHYHACAAD-DDFDTDFDPSILPPPDP---------WIDSITEDPLEAVQRSVCHRDGHW
470 480 490 500 510
800 810 820 830 840 850
pF1KB9 FIKMLRAEVEKLEHWCQQMEREAEDYELPEEILEKIRSAVGSTQLLLSQKVQQFFRLCQQ
:.:.:.:: ...: :::::::: .. .:::.:: :::.::::.:::..:: :: .::..
CCDS77 FLKLLQAERDRMEGWCQQMEREERENNLPEDILGKIRTAVGSAQLLMAQKFYQFRELCEE
520 530 540 550 560 570
860 870 880 890 900 910
pF1KB9 SMDPTAFPVPTFQDLAGFWDLLQLSIEDVTLKFLELQQLKANSWKLLEP--KEEKKVPPP
...:.: : :: ::::::::.::::::....:: ::.:::::.:: ..: :.:...:::
CCDS77 NLNPNAHPRPTSQDLAGFWDMLQLSIENISMKFDELHQLKANNWKQMDPLDKKERRAPPP
580 590 600 610 620 630
920 930 940 950 960 970
pF1KB9 IPKKPLRGRGVPVKERSLDSVDRQRQEARKRLLAAKRAASFRHSSATESADSIEIYIPEA
.:::: .: . ..::::.: :::::::::.::::::: :..::::::.:::::::::
CCDS77 VPKKPAKGPAPLIRERSLES--SQRQEARKRLMAAKRAASVRQNSATESAESIEIYIPEA
640 650 660 670 680
pF1KB9 QTRL
::::
CCDS77 QTRL
690
>>CCDS74191.1 DLGAP1 gene_id:9229|Hs108|chr18 (699 aa)
initn: 1514 init1: 772 opt: 1037 Z-score: 666.0 bits: 134.2 E(32554): 8.9e-31
Smith-Waterman score: 1610; 44.7% identity (65.2% similar) in 702 aa overlap (361-979:24-699)
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 AWHTMMVSQGRDGYPGAGPGKGLLGPETKAKARTYHYLQVPQDDWGGYPTGGKDGEIPCR
:: : :.::::.: :: ::: :::::
CCDS74 MDLKTLKLFNSQLRCGWLLYIWNKAFMAH-LRVPQDEWTGYTPRGKDDEIPCR
10 20 30 40 50
400 410 420 430
pF1KB9 RMRSGSYIKAMGDEESGDSDGSPKTSPKAVARR-------------FTTRRSSS------
::::::::::::::.::::: ::: :::..::: .:: . :.
CCDS74 RMRSGSYIKAMGDEDSGDSDTSPKPSPKVAARRESYLKATQPSLTELTTLKISNEHSPKL
60 70 80 90 100 110
440 450 460 470
pF1KB9 ----------VDQARINCCV----PPRI--HP--RSSIPGYSRSLTT-GQLSD-ELNQQL
:... :: . : . : :: .: :...: .:.:. :.: :.
CCDS74 QIRSHSYLRAVSEVSINRSLDSLDPAGLLTSPKFRSRNESYMRAMSTISQVSEMEVNGQF
120 130 140 150 160 170
480 490 500 510 520
pF1KB9 EAVCGSVFGELESQAVDALDLP--GCFRMRSHSYLRAIQAGCSQDDDCLPLLAT-PA---
:.:: :::.:::::::.::::: ::::::::::.:::. ::::::.:. : .. :
CCDS74 ESVCESVFSELESQAVEALDLPMPGCFRMRSHSYVRAIEKGCSQDDECVSLRSSSPPRTT
180 190 200 210 220 230
530 540 550 560
pF1KB9 ----AVSGRPG----SS--------FNFRKAPPPIPPGSQAPPRISITAQSSTDSAHESF
.... : :: ...:.:::.:: . . : :::::::::.::....
CCDS74 TTVRTIQSSTGVIKLSSAVEVSSCITTYKKTPPPVPPRTTTKPFISITAQSSTESAQDAY
240 250 260 270 280 290
570 580 590 600 610
pF1KB9 TAAEGPARRCSSADGLDGP-----AMGART--LELA------PVPPRASPKPPTLIIKTI
..: : .::.. .: : : .: : :. . . . :. :
CCDS74 MDGQGQRGDIISQSGLSNSTESLDSMKALTAAIEAANAQIHGPASQHMGNNTATVTTTTT
300 310 320 330 340 350
620 630 640 650 660 670
pF1KB9 PGR--EELRSLARQRKWRP-SIGVQVETISDSDT--ENRSRREFHSIGVQVEEDKRRARF
. : :. . .: : :::.::. . : ::.. .:.:.::::::.: ::
CCDS74 IATVTTEDRKKDHFKKNRCLSIGIQVDDAEEPDKTGENKAPSKFQSVGVQVEEEKCFRRF
360 370 380 390 400 410
680 690 700 710 720
pF1KB9 KRSNSVTAGVQADLELEGLAGLATVATEDKALQ--FGRSFQRHASEPQPGPRAPTYSVFR
::::::..:::::... . . ::.. ..:.:.: ::
CCDS74 TRSNSVTTAVQADLDFHDNLENSLESIEDNSCPGPMARQFSRDASTS-------------
420 430 440 450
730 740 750 760 770 780
pF1KB9 TVHTQGQWAYREGYPLPYEPPATDGSPGPAPAPTPGPGAGRRDSWIERGSRSLPDSGRAS
:: ::. . .. . :: .:. : : : ::. ... .. . :
CCDS74 TVSIQGSGNHYHACAAD-DDFDTDFDPSILPPPDP---------WIDSITEDPLEAVQRS
460 470 480 490 500
790 800 810 820 830 840
pF1KB9 PCPRDGEWFIKMLRAEVEKLEHWCQQMEREAEDYELPEEILEKIRSAVGSTQLLLSQKVQ
: :::.::.:.:.:: ...: :::::::: .. .:::.:: :::.::::.:::..::
CCDS74 VCHRDGHWFLKLLQAERDRMEGWCQQMEREERENNLPEDILGKIRTAVGSAQLLMAQKFY
510 520 530 540 550 560
850 860 870 880 890 900
pF1KB9 QFFRLCQQSMDPTAFPVPTFQDLAGFWDLLQLSIEDVTLKFLELQQLKANSWKLLEP--K
:: .::.....:.: : :: ::::::::.::::::....:: ::.:::::.:: ..: :
CCDS74 QFRELCEENLNPNAHPRPTSQDLAGFWDMLQLSIENISMKFDELHQLKANNWKQMDPLDK
570 580 590 600 610 620
910 920 930 940 950 960
pF1KB9 EEKKVPPPIPKKPLRGRGVPVKERSLDSVDRQRQEARKRLLAAKRAASFRHSSATESADS
.:...:::.:::: .: . ..::::.: :::::::::.::::::: :..::::::.:
CCDS74 KERRAPPPVPKKPAKGPAPLIRERSLES--SQRQEARKRLMAAKRAASVRQNSATESAES
630 640 650 660 670 680
970
pF1KB9 IEIYIPEAQTRL
::::::::::::
CCDS74 IEIYIPEAQTRL
690
979 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 07:23:47 2016 done: Sat Nov 5 07:23:48 2016
Total Scan time: 5.780 Total Display time: 0.360
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]