FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB9259, 979 aa 1>>>pF1KB9259 979 - 979 aa - 979 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.0628+/-0.000346; mu= 0.9286+/- 0.022 mean_var=278.3390+/-55.289, 0's: 0 Z-trim(123.7): 60 B-trim: 0 in 0/61 Lambda= 0.076875 statistics sampled from 43841 (43912) to 43841 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.789), E-opt: 0.2 (0.515), width: 16 Scan time: 16.550 The best scores are: opt bits E(85289) NP_001073887 (OMIM: 611413) disks large-associated ( 979) 6853 773.9 0 XP_011540181 (OMIM: 611413) PREDICTED: disks large ( 979) 6853 773.9 0 XP_011540182 (OMIM: 611413) PREDICTED: disks large ( 482) 3262 375.4 3.9e-103 NP_004736 (OMIM: 605438) disks large-associated pr ( 975) 1492 179.3 8.4e-44 NP_001003809 (OMIM: 605445) disks large-associated ( 675) 1157 142.1 9.6e-33 NP_001229693 (OMIM: 605445) disks large-associated ( 683) 1157 142.1 9.7e-33 XP_016881572 (OMIM: 605445) PREDICTED: disks large ( 685) 1157 142.1 9.7e-33 XP_016881570 (OMIM: 605445) PREDICTED: disks large ( 689) 1157 142.1 9.8e-33 XP_016881569 (OMIM: 605445) PREDICTED: disks large ( 721) 1157 142.1 1e-32 NP_004737 (OMIM: 605445) disks large-associated pr ( 977) 1157 142.2 1.3e-32 XP_011526990 (OMIM: 616191) PREDICTED: disks large ( 992) 1089 134.7 2.4e-30 NP_055717 (OMIM: 616191) disks large-associated pr ( 989) 1081 133.8 4.5e-30 NP_001264090 (OMIM: 605438) disks large-associated ( 961) 1070 132.5 1e-29 NP_001229695 (OMIM: 605445) disks large-associated ( 685) 1037 128.8 9.9e-29 NP_001295319 (OMIM: 605445) disks large-associated ( 693) 1037 128.8 1e-28 XP_005258231 (OMIM: 605445) PREDICTED: disks large ( 695) 1037 128.8 1e-28 NP_001229692 (OMIM: 605445) disks large-associated ( 699) 1037 128.8 1e-28 XP_006722430 (OMIM: 605445) PREDICTED: disks large ( 731) 1037 128.8 1e-28 XP_005258230 (OMIM: 605445) PREDICTED: disks large ( 764) 1037 128.8 1.1e-28 XP_005258229 (OMIM: 605445) PREDICTED: disks large ( 987) 1037 128.9 1.3e-28 XP_005258228 (OMIM: 605445) PREDICTED: disks large ( 987) 1037 128.9 1.3e-28 NP_001229691 (OMIM: 605445) disks large-associated ( 661) 925 116.3 5.3e-25 NP_892118 (OMIM: 616191) disks large-associated pr ( 453) 889 112.2 6.3e-24 XP_016883214 (OMIM: 616191) PREDICTED: disks large ( 450) 885 111.8 8.5e-24 NP_001035951 (OMIM: 616191) disks large-associated ( 285) 877 110.7 1.1e-23 XP_011526993 (OMIM: 616191) PREDICTED: disks large ( 285) 877 110.7 1.1e-23 XP_016883215 (OMIM: 616191) PREDICTED: disks large ( 285) 877 110.7 1.1e-23 XP_005260390 (OMIM: 616191) PREDICTED: disks large ( 285) 877 110.7 1.1e-23 XP_016883216 (OMIM: 616191) PREDICTED: disks large ( 285) 877 110.7 1.1e-23 XP_011526994 (OMIM: 616191) PREDICTED: disks large ( 285) 877 110.7 1.1e-23 XP_005260389 (OMIM: 616191) PREDICTED: disks large ( 298) 877 110.7 1.1e-23 NP_001229694 (OMIM: 605445) disks large-associated ( 627) 853 108.3 1.3e-22 XP_016881574 (OMIM: 605445) PREDICTED: disks large ( 635) 853 108.3 1.3e-22 XP_016881573 (OMIM: 605445) PREDICTED: disks large ( 637) 853 108.3 1.3e-22 XP_016881571 (OMIM: 605445) PREDICTED: disks large ( 706) 853 108.4 1.4e-22 NP_001229690 (OMIM: 605445) disks large-associated ( 929) 853 108.5 1.7e-22 XP_011526991 (OMIM: 616191) PREDICTED: disks large ( 922) 782 100.6 4.1e-20 XP_011524073 (OMIM: 605445) PREDICTED: disks large ( 543) 484 67.4 2.4e-10 XP_011524072 (OMIM: 605445) PREDICTED: disks large ( 570) 484 67.4 2.5e-10 >>NP_001073887 (OMIM: 611413) disks large-associated pro (979 aa) initn: 6853 init1: 6853 opt: 6853 Z-score: 4120.7 bits: 773.9 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 6853; 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NP_004 ALQSPFGDLSLKTSKSNNDVKCSACEGLALTPDAKYLKRSSWSTLTVSQAKEAYRKSSLN 250 260 270 280 290 300 360 370 380 390 400 pF1KB9 --KGLLGPETKAKARTYHYLQVPQDDWGGYPTGGKDGEIPCRRMRSGSYIKAMGDEESGD : :: ..: : ::::::::.:::::::::: ::::::::::::::::::::::. 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NP_001 DDFDTDFDPSILPPPDP---------WIDSITEDPLEAVQRSVCHRDGHWFLKLLQAERD 460 470 480 490 500 810 820 830 840 850 860 pF1KB9 KLEHWCQQMEREAEDYELPEEILEKIRSAVGSTQLLLSQKVQQFFRLCQQSMDPTAFPVP ..: :::::::: .. .:::.:: :::.::::.:::..:: :: .::.....:.: : : NP_001 RMEGWCQQMEREERENNLPEDILGKIRTAVGSAQLLMAQKFYQFRELCEENLNPNAHPRP 510 520 530 540 550 560 870 880 890 900 910 920 pF1KB9 TFQDLAGFWDLLQLSIEDVTLKFLELQQLKANSWKLLEP--KEEKKVPPPIPKKPLRGRG : ::::::::.::::::....:: ::.:::::.:: ..: :.:...:::.:::: .: . 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NP_001 KAMGDEDSGDSDTSPKPSPKVAARRESYLKATQPSLTELTTLKISNEHSPKLQIRSHSYL 60 70 80 90 100 110 440 450 460 470 pF1KB9 --VDQARINCCV----PPRI--HP--RSSIPGYSRSLTT-GQLSD-ELNQQLEAVCGSVF :... :: . : . : :: .: :...: .:.:. :.: :.:.:: ::: NP_001 RAVSEVSINRSLDSLDPAGLLTSPKFRSRNESYMRAMSTISQVSEMEVNGQFESVCESVF 120 130 140 150 160 170 480 490 500 510 520 530 pF1KB9 GELESQAVDALDLP--GCFRMRSHSYLRAIQAGCSQDDDCLPLLA-----TPAAVSGRPG .:::::::.::::: ::::::::::.:::. ::::::.:. : . : ..: . NP_001 SELESQAVEALDLPMPGCFRMRSHSYVRAIEKGCSQDDECVSLRSSSPPRTTTTVRTIQS 180 190 200 210 220 230 540 550 560 570 580 pF1KB9 SSFN-----FRKAPPPIPPGSQAPPRISITAQSSTDSAHESFTAAEGPARRCSSADGLDG :. . ..:.:::.:: . . : :::::::::.::.... ..: : .::.. NP_001 STVSSCITTYKKTPPPVPPRTTTKPFISITAQSSTESAQDAYMDGQGQRGDIISQSGLSN 240 250 260 270 280 290 590 600 610 620 630 pF1KB9 P-----AMGART--LELA------PVPPRASPKPPTLIIKTIPGR--EELRSLARQRKWR .: : : .: : :. . . . :. : . : :. . .: : NP_001 STESLDSMKALTAAIEAANAQIHGPASQHMGNNTATVTTTTTIATVTTEDRKKDHFKKNR 300 310 320 330 340 350 640 650 660 670 680 pF1KB9 P-SIGVQVETISDSDT--ENRSRREFHSIGVQVEEDKRRARFKRSNSVTAGVQADLELEG :::.::. . : ::.. .:.:.::::::.: :: ::::::..:::::... NP_001 CLSIGIQVDDAEEPDKTGENKAPSKFQSVGVQVEEEKCFRRFTRSNSVTTAVQADLDFHD 360 370 380 390 400 410 690 700 710 720 730 740 pF1KB9 LAGLATVATEDKALQ--FGRSFQRHASEPQPGPRAPTYSVFRTVHTQGQWAYREGYPLPY . . ::.. ..:.:.: :: :: ::. . .. NP_001 NLENSLESIEDNSCPGPMARQFSRDASTS-------------TVSIQGSGNHYHACAAD- 420 430 440 450 460 750 760 770 780 790 800 pF1KB9 EPPATDGSPGPAPAPTPGPGAGRRDSWIERGSRSLPDSGRASPCPRDGEWFIKMLRAEVE . :: .:. : : : ::. ... .. . : : :::.::.:.:.:: . NP_001 DDFDTDFDPSILPPPDP---------WIDSITEDPLEAVQRSVCHRDGHWFLKLLQAERD 470 480 490 500 510 810 820 830 840 850 860 pF1KB9 KLEHWCQQMEREAEDYELPEEILEKIRSAVGSTQLLLSQKVQQFFRLCQQSMDPTAFPVP ..: :::::::: .. .:::.:: :::.::::.:::..:: :: .::.....:.: : : NP_001 RMEGWCQQMEREERENNLPEDILGKIRTAVGSAQLLMAQKFYQFRELCEENLNPNAHPRP 520 530 540 550 560 570 870 880 890 900 910 920 pF1KB9 TFQDLAGFWDLLQLSIEDVTLKFLELQQLKANSWKLLEP--KEEKKVPPPIPKKPLRGRG : ::::::::.::::::....:: ::.:::::.:: ..: :.:...:::.:::: .: . NP_001 TSQDLAGFWDMLQLSIENISMKFDELHQLKANNWKQMDPLDKKERRAPPPVPKKPAKGPA 580 590 600 610 620 630 930 940 950 960 970 pF1KB9 VPVKERSLDSVDRQRQEARKRLLAAKRAASFRHSSATESADSIEIYIPEAQTRL ..::::.: :::::::::.::::::: :..::::::.::::::::::::: NP_001 PLIRERSLES--SQRQEARKRLMAAKRAASVRQNSATESAESIEIYIPEAQTRL 640 650 660 670 680 >>XP_016881572 (OMIM: 605445) PREDICTED: disks large-ass (685 aa) initn: 1506 init1: 772 opt: 1157 Z-score: 708.7 bits: 142.1 E(85289): 9.7e-33 Smith-Waterman score: 1620; 45.2% identity (66.0% similar) in 683 aa overlap (370-979:28-685) 340 350 360 370 380 390 pF1KB9 GRDGYPGAGPGKGLLGPETKAKARTYHYLQVPQDDWGGYPTGGKDGEIPCRRMRSGSYIK ::::.: :: ::: :::::::::::::: XP_016 MIDLFKAEWVSSVCVQVSRNGRTDQVWVPQDEWTGYTPRGKDDEIPCRRMRSGSYIK 10 20 30 40 50 400 410 420 430 pF1KB9 AMGDEESGDSDGSPKTSPKAVARR-------------FTTRRSSS--------------- :::::.::::: ::: :::..::: .:: . :. 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XP_016 TVSSCITTYKKTPPPVPPRTTTKPFISITAQSSTESAQDAYMDGQGQRGDIISQSGLSNS 240 250 260 270 280 290 590 600 610 620 630 pF1KB9 -----AMGART--LELA------PVPPRASPKPPTLIIKTIPGR--EELRSLARQRKWRP .: : : .: : :. . . . :. : . : :. . .: : XP_016 TESLDSMKALTAAIEAANAQIHGPASQHMGNNTATVTTTTTIATVTTEDRKKDHFKKNRC 300 310 320 330 340 350 640 650 660 670 680 690 pF1KB9 -SIGVQVETISDSDT--ENRSRREFHSIGVQVEEDKRRARFKRSNSVTAGVQADLELEGL :::.::. . : ::.. .:.:.::::::.: :: ::::::..:::::... XP_016 LSIGIQVDDAEEPDKTGENKAPSKFQSVGVQVEEEKCFRRFTRSNSVTTAVQADLDFHDN 360 370 380 390 400 410 700 710 720 730 740 pF1KB9 AGLATVATEDKALQ--FGRSFQRHASEPQPGPRAPTYSVFRTVHTQGQWAYREGYPLPYE . . ::.. ..:.:.: :: :: ::. . .. . XP_016 LENSLESIEDNSCPGPMARQFSRDASTS-------------TVSIQGSGNHYHACAAD-D 420 430 440 450 460 750 760 770 780 790 800 pF1KB9 PPATDGSPGPAPAPTPGPGAGRRDSWIERGSRSLPDSGRASPCPRDGEWFIKMLRAEVEK :: .:. : : : ::. ... .. . : : :::.::.:.:.:: .. XP_016 DFDTDFDPSILPPPDP---------WIDSITEDPLEAVQRSVCHRDGHWFLKLLQAERDR 470 480 490 500 510 810 820 830 840 850 860 pF1KB9 LEHWCQQMEREAEDYELPEEILEKIRSAVGSTQLLLSQKVQQFFRLCQQSMDPTAFPVPT .: :::::::: .. .:::.:: :::.::::.:::..:: :: .::.....:.: : :: XP_016 MEGWCQQMEREERENNLPEDILGKIRTAVGSAQLLMAQKFYQFRELCEENLNPNAHPRPT 520 530 540 550 560 570 870 880 890 900 910 920 pF1KB9 FQDLAGFWDLLQLSIEDVTLKFLELQQLKANSWKLLEP--KEEKKVPPPIPKKPLRGRGV ::::::::.::::::....:: ::.:::::.:: ..: :.:...:::.:::: .: . 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XP_016 RMRSGSYIKAMGDEDSGDSDTSPKPSPKVAARRESYLKATQPSLTELTTLKISNEHSPKL 60 70 80 90 100 110 440 450 460 470 pF1KB9 ----------VDQARINCCV----PPRI--HP--RSSIPGYSRSLTT-GQLSD-ELNQQL :... :: . : . : :: .: :...: .:.:. :.: :. XP_016 QIRSHSYLRAVSEVSINRSLDSLDPAGLLTSPKFRSRNESYMRAMSTISQVSEMEVNGQF 120 130 140 150 160 170 480 490 500 510 520 pF1KB9 EAVCGSVFGELESQAVDALDLP--GCFRMRSHSYLRAIQAGCSQDDDCLPLLA-----TP :.:: :::.:::::::.::::: ::::::::::.:::. ::::::.:. : . : XP_016 ESVCESVFSELESQAVEALDLPMPGCFRMRSHSYVRAIEKGCSQDDECVSLRSSSPPRTT 180 190 200 210 220 230 530 540 550 560 570 pF1KB9 AAVSGRPGSSFN-----FRKAPPPIPPGSQAPPRISITAQSSTDSAHESFTAAEGPARRC ..: .:. . ..:.:::.:: . . : :::::::::.::.... ..: XP_016 TTVRTIQSSTVSSCITTYKKTPPPVPPRTTTKPFISITAQSSTESAQDAYMDGQGQRGDI 240 250 260 270 280 290 580 590 600 610 620 pF1KB9 SSADGLDGP-----AMGART--LELA------PVPPRASPKPPTLIIKTIPGR--EELRS : .::.. .: : : .: : :. . . . :. : . : :. XP_016 ISQSGLSNSTESLDSMKALTAAIEAANAQIHGPASQHMGNNTATVTTTTTIATVTTEDRK 300 310 320 330 340 350 630 640 650 660 670 680 pF1KB9 LARQRKWRP-SIGVQVETISDSDT--ENRSRREFHSIGVQVEEDKRRARFKRSNSVTAGV . .: : :::.::. . : ::.. .:.:.::::::.: :: ::::::..: XP_016 KDHFKKNRCLSIGIQVDDAEEPDKTGENKAPSKFQSVGVQVEEEKCFRRFTRSNSVTTAV 360 370 380 390 400 410 690 700 710 720 730 pF1KB9 QADLELEGLAGLATVATEDKALQ--FGRSFQRHASEPQPGPRAPTYSVFRTVHTQGQWAY ::::... . . ::.. ..:.:.: :: :: ::. . XP_016 QADLDFHDNLENSLESIEDNSCPGPMARQFSRDASTS-------------TVSIQGSGNH 420 430 440 450 740 750 760 770 780 790 pF1KB9 REGYPLPYEPPATDGSPGPAPAPTPGPGAGRRDSWIERGSRSLPDSGRASPCPRDGEWFI .. . :: .:. : : : ::. ... .. . : : :::.::. XP_016 YHACAAD-DDFDTDFDPSILPPPDP---------WIDSITEDPLEAVQRSVCHRDGHWFL 460 470 480 490 500 800 810 820 830 840 850 pF1KB9 KMLRAEVEKLEHWCQQMEREAEDYELPEEILEKIRSAVGSTQLLLSQKVQQFFRLCQQSM :.:.:: ...: :::::::: .. .:::.:: :::.::::.:::..:: :: .::.... XP_016 KLLQAERDRMEGWCQQMEREERENNLPEDILGKIRTAVGSAQLLMAQKFYQFRELCEENL 510 520 530 540 550 560 860 870 880 890 900 910 pF1KB9 DPTAFPVPTFQDLAGFWDLLQLSIEDVTLKFLELQQLKANSWKLLEP--KEEKKVPPPIP .:.: : :: ::::::::.::::::....:: ::.:::::.:: ..: :.:...:::.: XP_016 NPNAHPRPTSQDLAGFWDMLQLSIENISMKFDELHQLKANNWKQMDPLDKKERRAPPPVP 570 580 590 600 610 620 920 930 940 950 960 970 pF1KB9 KKPLRGRGVPVKERSLDSVDRQRQEARKRLLAAKRAASFRHSSATESADSIEIYIPEAQT ::: .: . ..::::.: :::::::::.::::::: :..::::::.::::::::::: XP_016 KKPAKGPAPLIRERSLES--SQRQEARKRLMAAKRAASVRQNSATESAESIEIYIPEAQT 630 640 650 660 670 680 pF1KB9 RL :: XP_016 RL >>XP_016881569 (OMIM: 605445) PREDICTED: disks large-ass (721 aa) initn: 1507 init1: 772 opt: 1157 Z-score: 708.4 bits: 142.1 E(85289): 1e-32 Smith-Waterman score: 1624; 44.9% identity (66.0% similar) in 691 aa overlap (362-979:56-721) 340 350 360 370 380 390 pF1KB9 WHTMMVSQGRDGYPGAGPGKGLLGPETKAKARTYHYLQVPQDDWGGYPTGGKDGEIPCRR :. .. .::::.: :: ::: :::::: XP_016 SKLKRLKGHLSQVAFVKVKAVWSRKAVLPAAKKMQRNRVPQDEWTGYTPRGKDDEIPCRR 30 40 50 60 70 80 400 410 420 430 pF1KB9 MRSGSYIKAMGDEESGDSDGSPKTSPKAVARR-------------FTTRRSSS------- :::::::::::::.::::: ::: :::..::: .:: . :. XP_016 MRSGSYIKAMGDEDSGDSDTSPKPSPKVAARRESYLKATQPSLTELTTLKISNEHSPKLQ 90 100 110 120 130 140 440 450 460 470 pF1KB9 ---------VDQARINCCV----PPRI--HP--RSSIPGYSRSLTT-GQLSD-ELNQQLE :... :: . : . : :: .: :...: .:.:. :.: :.: XP_016 IRSHSYLRAVSEVSINRSLDSLDPAGLLTSPKFRSRNESYMRAMSTISQVSEMEVNGQFE 150 160 170 180 190 200 480 490 500 510 520 pF1KB9 AVCGSVFGELESQAVDALDLP--GCFRMRSHSYLRAIQAGCSQDDDCLPLLA-----TPA .:: :::.:::::::.::::: ::::::::::.:::. ::::::.:. : . : . XP_016 SVCESVFSELESQAVEALDLPMPGCFRMRSHSYVRAIEKGCSQDDECVSLRSSSPPRTTT 210 220 230 240 250 260 530 540 550 560 570 580 pF1KB9 AVSGRPGSSFN-----FRKAPPPIPPGSQAPPRISITAQSSTDSAHESFTAAEGPARRCS .: .:. . ..:.:::.:: . . : :::::::::.::.... ..: XP_016 TVRTIQSSTVSSCITTYKKTPPPVPPRTTTKPFISITAQSSTESAQDAYMDGQGQRGDII 270 280 290 300 310 320 590 600 610 620 pF1KB9 SADGLDGP-----AMGART--LELA------PVPPRASPKPPTLIIKTIPGR--EELRSL : .::.. .: : : .: : :. . . . :. : . : :. XP_016 SQSGLSNSTESLDSMKALTAAIEAANAQIHGPASQHMGNNTATVTTTTTIATVTTEDRKK 330 340 350 360 370 380 630 640 650 660 670 680 pF1KB9 ARQRKWRP-SIGVQVETISDSDT--ENRSRREFHSIGVQVEEDKRRARFKRSNSVTAGVQ . .: : :::.::. . : ::.. .:.:.::::::.: :: ::::::..:: XP_016 DHFKKNRCLSIGIQVDDAEEPDKTGENKAPSKFQSVGVQVEEEKCFRRFTRSNSVTTAVQ 390 400 410 420 430 440 690 700 710 720 730 740 pF1KB9 ADLELEGLAGLATVATEDKALQ--FGRSFQRHASEPQPGPRAPTYSVFRTVHTQGQWAYR :::... . . ::.. ..:.:.: :: :: ::. . XP_016 ADLDFHDNLENSLESIEDNSCPGPMARQFSRDASTS-------------TVSIQGSGNHY 450 460 470 480 490 750 760 770 780 790 800 pF1KB9 EGYPLPYEPPATDGSPGPAPAPTPGPGAGRRDSWIERGSRSLPDSGRASPCPRDGEWFIK .. . :: .:. : : : ::. ... .. . : : :::.::.: XP_016 HACAAD-DDFDTDFDPSILPPPDP---------WIDSITEDPLEAVQRSVCHRDGHWFLK 500 510 520 530 540 810 820 830 840 850 860 pF1KB9 MLRAEVEKLEHWCQQMEREAEDYELPEEILEKIRSAVGSTQLLLSQKVQQFFRLCQQSMD .:.:: ...: :::::::: .. .:::.:: :::.::::.:::..:: :: .::..... XP_016 LLQAERDRMEGWCQQMEREERENNLPEDILGKIRTAVGSAQLLMAQKFYQFRELCEENLN 550 560 570 580 590 600 870 880 890 900 910 pF1KB9 PTAFPVPTFQDLAGFWDLLQLSIEDVTLKFLELQQLKANSWKLLEP--KEEKKVPPPIPK :.: : :: ::::::::.::::::....:: ::.:::::.:: ..: :.:...:::.:: XP_016 PNAHPRPTSQDLAGFWDMLQLSIENISMKFDELHQLKANNWKQMDPLDKKERRAPPPVPK 610 620 630 640 650 660 920 930 940 950 960 970 pF1KB9 KPLRGRGVPVKERSLDSVDRQRQEARKRLLAAKRAASFRHSSATESADSIEIYIPEAQTR :: .: . ..::::.: :::::::::.::::::: :..::::::.:::::::::::: XP_016 KPAKGPAPLIRERSLES--SQRQEARKRLMAAKRAASVRQNSATESAESIEIYIPEAQTR 670 680 690 700 710 720 pF1KB9 L : XP_016 L >>NP_004737 (OMIM: 605445) disks large-associated protei (977 aa) initn: 1911 init1: 772 opt: 1157 Z-score: 706.6 bits: 142.2 E(85289): 1.3e-32 Smith-Waterman score: 2173; 41.1% identity (62.5% similar) in 1065 aa overlap (1-979:1-977) 10 20 30 40 50 60 pF1KB9 MRGYHGDRGSHPRPARFADQQHMDVGPAARAPYLLGSREAFSTEPRFCAPRAGLGHISPE :.: :.: :: . . . . : ::::. : .. . . : .. 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NP_004 AYN-TISEQAVKASRSNNDVKCSTCANLPVSLDTPLLKKSAWSSTLTVSRAREVYQKASV 240 250 260 270 280 290 350 360 370 380 390 400 pF1KB9 G--KGLLGPETKAKARTYHYLQVPQDDWGGYPTGGKDGEIPCRRMRSGSYIKAMGDEESG . .... :. . :. .:::::::.: :: ::: :::::::::::::::::::.:: NP_004 NMDQAMVKSESCQQERSCQYLQVPQDEWTGYTPRGKDDEIPCRRMRSGSYIKAMGDEDSG 300 310 320 330 340 350 410 420 430 pF1KB9 DSDGSPKTSPKAVARR-------------FTTRRSSS----------------VDQARIN ::: ::: :::..::: .:: . :. :... :: NP_004 DSDTSPKPSPKVAARRESYLKATQPSLTELTTLKISNEHSPKLQIRSHSYLRAVSEVSIN 360 370 380 390 400 410 440 450 460 470 480 pF1KB9 CCV----PPRI--HP--RSSIPGYSRSLTT-GQLSD-ELNQQLEAVCGSVFGELESQAVD . : . : :: .: :...: .:.:. :.: :.:.:: :::.:::::::. NP_004 RSLDSLDPAGLLTSPKFRSRNESYMRAMSTISQVSEMEVNGQFESVCESVFSELESQAVE 420 430 440 450 460 470 490 500 510 520 530 pF1KB9 ALDLP--GCFRMRSHSYLRAIQAGCSQDDDCLPLLA-----TPAAVSGRPGSSFN----- ::::: ::::::::::.:::. ::::::.:. : . : ..: .:. . NP_004 ALDLPMPGCFRMRSHSYVRAIEKGCSQDDECVSLRSSSPPRTTTTVRTIQSSTVSSCITT 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 pF1KB9 FRKAPPPIPPGSQAPPRISITAQSSTDSAHESFTAAEGPARRCSSADGLDGP-----AMG ..:.:::.:: . . : :::::::::.::.... ..: : .::.. .: NP_004 YKKTPPPVPPRTTTKPFISITAQSSTESAQDAYMDGQGQRGDIISQSGLSNSTESLDSMK 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 pF1KB9 ART--LELA------PVPPRASPKPPTLIIKTIPGR--EELRSLARQRKWRP-SIGVQVE : : .: : :. . . . :. : . : :. . .: : :::.::. NP_004 ALTAAIEAANAQIHGPASQHMGNNTATVTTTTTIATVTTEDRKKDHFKKNRCLSIGIQVD 600 610 620 630 640 650 650 660 670 680 690 pF1KB9 TISDSDT--ENRSRREFHSIGVQVEEDKRRARFKRSNSVTAGVQADLELEGLAGLATVAT . : ::.. .:.:.::::::.: :: ::::::..:::::... . . 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NP_004 DMLQLSIENISMKFDELHQLKANNWKQMDPLDKKERRAPPPVPKKPAKGPAPLIRERSLE 880 890 900 910 920 930 940 950 960 970 pF1KB9 SVDRQRQEARKRLLAAKRAASFRHSSATESADSIEIYIPEAQTRL : :::::::::.::::::: :..::::::.::::::::::::: NP_004 S--SQRQEARKRLMAAKRAASVRQNSATESAESIEIYIPEAQTRL 940 950 960 970 979 residues in 1 query sequences 60827320 residues in 85289 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sat Nov 5 07:23:49 2016 done: Sat Nov 5 07:23:51 2016 Total Scan time: 16.550 Total Display time: 0.300 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]