FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9271, 588 aa
1>>>pF1KB9271 588 - 588 aa - 588 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.0118+/-0.00228; mu= 12.3900+/- 0.137
mean_var=298.2167+/-55.013, 0's: 0 Z-trim(104.9): 969 B-trim: 38 in 1/49
Lambda= 0.074269
statistics sampled from 7077 (8124) to 7077 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.57), E-opt: 0.2 (0.25), width: 16
Scan time: 2.510
The best scores are: opt bits E(32554)
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CCDS46208.1 ZNF805 gene_id:390980|Hs108|chr19 ( 494) 1932 222.0 1.4e-57
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CCDS32973.1 ZNF93 gene_id:81931|Hs108|chr19 ( 620) 1788 206.7 6.9e-53
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CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 1779 205.9 1.5e-52
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CCDS12497.1 ZNF345 gene_id:25850|Hs108|chr19 ( 488) 1765 204.1 3.4e-52
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CCDS56092.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 580) 1762 203.9 4.6e-52
CCDS42558.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 644) 1762 204.0 4.9e-52
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 ( 738) 1745 202.2 1.9e-51
CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3 ( 544) 1741 201.6 2.1e-51
CCDS82341.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 527) 1736 201.0 3e-51
CCDS12503.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 686) 1736 201.2 3.5e-51
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CCDS47352.1 ZNF879 gene_id:345462|Hs108|chr5 ( 563) 1723 199.7 8.2e-51
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CCDS54259.1 ZNF607 gene_id:84775|Hs108|chr19 ( 695) 1718 199.3 1.3e-50
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CCDS13174.1 ZNF337 gene_id:26152|Hs108|chr20 ( 751) 1700 197.4 5.3e-50
CCDS77297.1 ZNF546 gene_id:339327|Hs108|chr19 ( 810) 1693 196.7 9.3e-50
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CCDS46044.1 ZNF30 gene_id:90075|Hs108|chr19 ( 624) 1690 196.2 1e-49
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CCDS46097.1 ZNF283 gene_id:284349|Hs108|chr19 ( 679) 1685 195.8 1.5e-49
CCDS12096.1 ZNF555 gene_id:148254|Hs108|chr19 ( 628) 1680 195.2 2.1e-49
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CCDS42504.1 ZNF709 gene_id:163051|Hs108|chr19 ( 641) 1677 194.9 2.7e-49
CCDS33097.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 839) 1678 195.2 2.9e-49
CCDS54314.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 840) 1678 195.2 2.9e-49
CCDS33026.2 ZNF780A gene_id:284323|Hs108|chr19 ( 641) 1674 194.5 3.4e-49
>>CCDS32991.1 ZNF599 gene_id:148103|Hs108|chr19 (588 aa)
initn: 4189 init1: 4189 opt: 4189 Z-score: 2453.5 bits: 464.0 E(32554): 2.4e-130
Smith-Waterman score: 4189; 100.0% identity (100.0% similar) in 588 aa overlap (1-588:1-588)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MAAPALALVSFEDVVVTFTGEEWGHLDLAQRTLYQEVMLETCRLLVSLGHPVPKPELIYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MAAPALALVSFEDVVVTFTGEEWGHLDLAQRTLYQEVMLETCRLLVSLGHPVPKPELIYL
10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LEHGQELWTVKRGLSQSTCAGEKAKPKITEPTASQLAFSEESSFQELLAQRSSRDSRLGQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 ARDEEKLIKIQEGNLRPGTNPHKEICPEKLSYKHDDLEPDDSLGLRVLQERVTPQDALHE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ARDEEKLIKIQEGNLRPGTNPHKEICPEKLSYKHDDLEPDDSLGLRVLQERVTPQDALHE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 CDSQGPGKDPMTDARNNPYTCTECGKGFSKKWALVRHQQIHAGVKPYECNECGKACRYMA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 DVIRHMRLHTGEKPYKCIECGKAFKRRFHLTEHQRIHTGDKPYECKECGKAFTHRSSFIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DVIRHMRLHTGEKPYKCIECGKAFKRRFHLTEHQRIHTGDKPYECKECGKAFTHRSSFIQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 HNMTHTREKPFLCKECGKAFYYSSSFAQHMRIHTGKKLYECGECGKAFTHRSTFIQHNVT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 HTGEKPFLCKECGKTFCLNSSFTQHMRIHTGEKPYECGECGKAFTHRSTFIRHKRTHTGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 HTGEKPFLCKECGKTFCLNSSFTQHMRIHTGEKPYECGECGKAFTHRSTFIRHKRTHTGE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 KPFECKECGKAFCDSSSLIQHMRIHTGEKPYECSECGKAFTHHSVFIRHNRTHSGQKPLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KPFECKECGKAFCDSSSLIQHMRIHTGEKPYECSECGKAFTHHSVFIRHNRTHSGQKPLE
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pF1KB9 CKECAKAFYYSSSFTRHMRIHTGEKPYVCRECGKAFTQPANFVRHNRIHTGEKPFECKEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 CKECAKAFYYSSSFTRHMRIHTGEKPYVCRECGKAFTQPANFVRHNRIHTGEKPFECKEC
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550 560 570 580
pF1KB9 EKAFCDNFALTQHMRTHTGEKPFECNECGKTFSHSSSFTHHRKIHTRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EKAFCDNFALTQHMRTHTGEKPFECNECGKTFSHSSSFTHHRKIHTRV
550 560 570 580
>>CCDS46207.1 ZNF805 gene_id:390980|Hs108|chr19 (627 aa)
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Smith-Waterman score: 2456; 58.2% identity (80.4% similar) in 577 aa overlap (1-577:5-581)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MAAPALALVSFEDVVVTFTGEEWGHLDLAQRTLYQEVMLETCRLLVSLGHPVPKPE
.. :: . :.:.::.:::: ::::.:::::::::::::::.: :::::: :::.::
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pF1KB9 LIYLLEHGQELWTVKRGLSQSTCAGEKAKPKITEPTASQLAFSEESSFQELLAQRSSRDS
::: :::::: :: :. :::.:: :.:.::: ::::. .::.:: :: :.: .: ::
CCDS46 LIYHLEHGQEPWTRKEDLSQGTCPGDKGKPKSTEPTTCELALSEGISFWGQLTQGASGDS
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pF1KB9 RLGQARDEEKLIKIQEGNLRPGTNPHKEICPEKLSYKHDDLEPDDSLGLRVLQERVTPQD
.::: .:.. . ..: :::: . .:: : :.: ::: : ::. :..:.::. :
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pF1KB9 ALHECDSQGPGKDPMTDARNNPYTCTECGKGFSKKWALVRHQQIHAGVKPYECNECGKAC
.:.:::.: ::.:. . ..: . :.:: : :.:: :.::..::.:::::::.::::.
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pF1KB9 RYMADVIRHMRLHTGEKPYKCIECGKAFKRRFHLTEHQRIHTGDKPYECKECGKAFTHRS
. ...: .:::::::::.::::::.:. :::.:::::.:.:::.:.::::::::::
CCDS46 SKSTYLLQHHMVHTGEKPYKCMECGKAFNRKSHLTQHQRIHSGEKPYKCSECGKAFTHRS
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.:. :: .:: ::::.:::::::: .: .:. ::.:.. ::: ::::.: ::: ..
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pF1KB9 HNVTHTGEKPFLCKECGKTFCLNSSFTQHMRIHTGEKPYECGECGKAFTHRSTFIRHKRT
:. :::::::. :.::::.:: .... .:. :::::::.:: ::::::.::: . ::.:
CCDS46 HQQTHTGEKPYECSECGKAFCESAALIHHYVIHTGEKPFECLECGKAFNHRSYLKRHQRI
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pF1KB9 HTGEKPFECKECGKAFCDSSSLIQHMRIHTGEKPYECSECGKAFTHHSVFIRHNRTHSGQ
::::::. :.:::::: :..: : : ::::::.::.::::::.... .::: :.:.
CCDS46 HTGEKPYVCSECGKAFTHCSTFILHKRAHTGEKPFECKECGKAFSNRADLIRHFSIHTGE
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pF1KB9 KPLECKECAKAFYYSSSFTRHMRIHTGEKPYVCRECGKAFTQPANFVRHNRIHTGEKPFE
:: :: ::.::: :..:::.:::.::::: : ::::.: .:..::. :::::::.:
CCDS46 KPYECMECGKAFNRRSGLTRHQRIHSGEKPYECIECGKTFCWSTNLIRHSIIHTGEKPYE
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:.:: ::: . .::::.: :::..:. .. :. :. ...
CCDS46 CSECGKAFSRSSSLTQHQRMHTGRNPISVTDVGRPFTSGQTSVNIQELLLGKNFLNVTTE
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CCDS46 ENLLQEEASYMASDRTYQRETPQVSSL
610 620
>>CCDS33130.1 ZNF543 gene_id:125919|Hs108|chr19 (600 aa)
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Smith-Waterman score: 2348; 57.2% identity (79.4% similar) in 572 aa overlap (1-572:1-572)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MAAPALALVSFEDVVVTFTGEEWGHLDLAQRTLYQEVMLETCRLLVSLGHPVPKPELIYL
::: : . :.::::.:::: ::::.:: :::::::::::::: ::.::: :. ::::::
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pF1KB9 LEHGQELWTVKRGLSQSTCAGEKAKPKITEPTASQLAFSEESSFQELLAQRSSRDSRLGQ
:.: :::: . . ::::. :...::: :::: :.::. :: .:: :.: .:..:.:::
CCDS33 LDHRQELWMATKDLSQSSYPGDNTKPKTTEPTFSHLALPEEVLLQEQLTQGASKNSQLGQ
70 80 90 100 110 120
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pF1KB9 ARDEEKLIKIQEGNLRPGTNPHKEICPEKLSYKHDDLEPDDSLGLRVLQERVTPQDALHE
..:.. ..:: .:. : .:.. ::.: ..: : ::.. .. :..:. . :.:
CCDS33 SKDQDGPSEMQEVHLKIGIGPQRGKLLEKMSSERDGLGSDDGVCTKITQKQVSTEGDLYE
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pF1KB9 CDSQGPGKDPMTDARNNPYTCTECGKGFSKKWALVRHQQIHAGVKPYECNECGKACRYMA
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CCDS33 CDSHGPVTDALIREEKNSYKCEECGKVFKKNALLVQHERIHTQVKPYECTECGKTFSKST
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pF1KB9 DVIRHMRLHTGEKPYKCIECGKAFKRRFHLTEHQRIHTGDKPYECKECGKAFTHRSSFIQ
...:. .:::::::::.::::::.:: :::.:::::.:.:::.:.::::::::::.:.
CCDS33 HLLQHLIIHTGEKPYKCMECGKAFNRRSHLTRHQRIHSGEKPYKCSECGKAFTHRSTFVL
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pF1KB9 HNMTHTREKPFLCKECGKAFYYSSSFAQHMRIHTGKKLYECGECGKAFTHRSTFIQHNVT
:. .:: ::::.:::::::: .: .:. ::::.: ::: ::::::..:: . :.
CCDS33 HHRSHTGEKPFVCKECGKAFRDRPGFIRHYIIHTGEKPYECIECGKAFNRRSYLTWHQQI
310 320 330 340 350 360
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pF1KB9 HTGEKPFLCKECGKTFCLNSSFTQHMRIHTGEKPYECGECGKAFTHRSTFIRHKRTHTGE
::: ::: :.::::.:: .... ::. ::::::::.: ::::::..:: . .:.: ::::
CCDS33 HTGVKPFECNECGKAFCESADLIQHYIIHTGEKPYKCMECGKAFNRRSHLKQHQRIHTGE
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pF1KB9 KPFECKECGKAFCDSSSLIQHMRIHTGEKPYECSECGKAFTHHSVFIRHNRTHSGQKPLE
::.::.:::::: :... : : :::::::::.::::::. .. .::: :.:.:: :
CCDS33 KPYECSECGKAFTHCSTFVLHKRTHTGEKPYECKECGKAFSDRADLIRHFSIHTGEKPYE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 CKECAKAFYYSSSFTRHMRIHTGEKPYVCRECGKAFTQPANFVRHNRIHTGEKPFECKEC
: ::.::: :: .:::..:::::::: : .::::: . ::..::. :::::::.::.::
CCDS33 CVECGKAFNRSSHLTRHQQIHTGEKPYECIQCGKAFCRSANLIRHSIIHTGEKPYECSEC
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580
pF1KB9 EKAFCDNFALTQHMRTHTGEKPFECNECGKTFSHSSSFTHHRKIHTRV
::: . .::.:.: :::..: .. :. :
CCDS33 GKAFNRGSSLTHHQRIHTGRNPTIVTDVGRPFMTAQTSVNIQELLLGKEFLNITTEENLW
550 560 570 580 590 600
>>CCDS33127.1 ZNF264 gene_id:9422|Hs108|chr19 (627 aa)
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10 20 30 40 50
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10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
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CCDS33 ELICHLEHGQEPWTRKEDLSQDTCPGDKGKPKTTEPTTCEPALSEGISLQGQVTQGNSVD
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
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130 140 150 160 170
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. ...: .::::.::.:.::::::.:. .::.:::::.:.:::.:.:::::::::
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240 250 260 270 280 290
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300 310 320 330 340 350
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CCDS33 EANILPEETSSSASDQPYQRETPQVSSL
600 610 620
>>CCDS46208.1 ZNF805 gene_id:390980|Hs108|chr19 (494 aa)
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100 110 120 130 140 150
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CCDS46 TNLIRHSIIHTGEKPYECSECGKAFSRSSSLTQHQRMHTGRNPISVTDVGRPFTSGQTSV
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580
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CCDS46 NIQELLLGKNFLNVTTEENLLQEEASYMASDRTYQRETPQVSSL
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>>CCDS42636.1 ZNF17 gene_id:7565|Hs108|chr19 (662 aa)
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10 20 30 40 50
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CCDS42 MNLTEDYMVFEDVAIHFSQEEWGILNDVQRHLHSDVMLENFALLSSVGCWHGAKD----
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CCDS42 ---EEAPSKQCVSVGVSQVTTLKPALSTQKAQPCETCSSL-LKDILHLAEHDGTHPKRTA
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CCDS42 KLYLHQKEHLREKLTRSDEG--RPSFVNDSVHLAKRNLTCMQGGKDFTGDSDLQQQALHS
120 130 140 150 160
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CCDS42 GWKPHRDTH-------GVEAFQSGQNN-YSCTQCGKDFCHQHTLFEHQKIHTEERPYECS
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CCDS42 ECGKLFRYNSDLIKHQRNHTGERPYKCSECGKAFSLKYNVVQHQKIHTGERPYECSECGK
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CCDS42 AFLRKSHLLQHQRIHTRPRPYVCSECGKAFLTQAHLVGHQKIHTGERPYGCNECGKYFMY
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CCDS42 SSALIRHQKVHTGERPFYCCECGKFFMDSCTLIIHQRVHTGEKPYECNECGKFFRYRSTL
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CCDS42 IRHQKVHTGEKPYECSECGKFFMDTSTLIIHQRVHTGEKPYECNKCGKFFRYCFTLNRHQ
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CCDS42 RVHSGERPYECSECGKFFVDSCTLKSHQRVHTGERPFECSICGKSFRCRSTLDTHQRIHT
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CCDS42 GERPYECSECGKFFRHNSNHIRHRRNHFGERSFECTECGRVFSQNSHLIRHQKVHTRERT
530 540 550 560 570 580
CCDS42 YKCSKCGKFFMDSSTLISHERVHTGEKPYECSECGKVFRYNSSLIKHRRIHTGERPYQCS
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>>CCDS82405.1 ZNF17 gene_id:7565|Hs108|chr19 (664 aa)
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Smith-Waterman score: 1820; 45.1% identity (71.9% similar) in 587 aa overlap (11-587:12-580)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MAAPALALVSFEDVVVTFTGEEWGHLDLAQRTLYQEVMLETCRLLVSLG--HPVPKPEL
::::.. :. :::: :. .:: :...::::. :: :.: : .
CCDS82 MLMDAGQDYMVFEDVAIHFSQEEWGILNDVQRHLHSDVMLENFALLSSVGCWHGAKD---
10 20 30 40 50
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CCDS82 ----EEAPSKQCVSVGVSQVTTLKPALSTQKAQPCETCSSL-LKDILHLAEHDGTHPKRT
60 70 80 90 100 110
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pF1KB9 SRLGQARDE---EKLIKIQEGNLRPG-TNPHKEICPEKLSYKHD--DLEPDDSLGLRVLQ
..: . : ::: . .:: ::. .: .. ..:. . :. :..: ..:.
CCDS82 AKLYLHQKEHLREKLTRSDEG--RPSFVNDSVHLAKRNLTCMQGGKDFTGDSDLQQQALH
120 130 140 150 160 170
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CCDS82 SGWKPHRDTH-------GVEAFQSGQNN-YSCTQCGKDFCHQHTLFEHQKIHTEERPYEC
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CCDS82 SECGKLFRYNSDLIKHQRNHTGERPYKCSECGKAFSLKYNVVQHQKIHTGERPYECSECG
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::: ..: ..::. ::: .:..:.:::::: .. .. :..::::.. : :.:::: :
CCDS82 KAFLRKSHLLQHQRIHTRPRPYVCSECGKAFLTQAHLVGHQKIHTGERPYGCNECGKYFM
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CCDS82 YSSALIRHQKVHTGERPFYCCECGKFFMDSCTLIIHQRVHTGEKPYECNECGKFFRYRST
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CCDS82 LIRHQKVHTGEKPYECSECGKFFMDTSTLIIHQRVHTGEKPYECNKCGKFFRYCFTLNRH
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CCDS82 QRVHSGERPYECSECGKFFVDSCTLKSHQRVHTGERPFECSICGKSFRCRSTLDTHQRIH
470 480 490 500 510 520
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pF1KB9 TGEKPFECKECEKAFCDNFALTQHMRTHTGEKPFECNECGKTFSHSSSFTHHRKIHTRV
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CCDS82 TGERPYECSECGKFFRHNSNHIRHRRNHFGERSFECTECGRVFSQNSHLIRHQKVHTRER
530 540 550 560 570 580
CCDS82 TYKCSKCGKFFMDSSTLISHERVHTGEKPYECSECGKVFRYNSSLIKHRRIHTGERPYQC
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>>CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 (616 aa)
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pF1KB9 LVSFEDVVVTFTGEEWGHLDLAQRTLYQEVMLETCRLLVSLGHPVPKPELIYLLEHGQEL
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CCDS74 MLDTFRLLVSVGHWLPKPNVISLLEQEAEL
10 20 30
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pF1KB9 WTVKRGLSQSTCAGEKAKPKITEPTASQLAFSEESSFQELLAQRSSRDSR-LGQARDEEK
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CCDS74 WAVESRLPQGVYPDLETRPKVKLSVLKQ-GISEEISNSVILVERFLWDGLWYCRGEDTEG
40 50 60 70 80
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 LIKIQEGNLRPGTNPHKEICPEKL----SYKHDDLEPDDSLGLRVLQERVTPQ-DALHEC
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CCDS74 HWEWSCESLESLAVP-VAFTPVKTPVLEQWQRNGFGENISLNPDLPHQPMTPERQSPHTW
90 100 110 120 130 140
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pF1KB9 DSQGPGKDP------MTDARNNPYTCTECGKGFSKKWALVRHQQIHAGVKPYECNECGKA
..: . : : ....:: : ::::.::.. ::..:.. :.: .::::.:: :.
CCDS74 GTRGKREKPDLNVLQKTCVKEKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECLKG
150 160 170 180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 CRYMADVIRHMRLHTGEKPYKCIECGKAFKRRFHLTEHQRIHTGDKPYECKECGKAFTHR
: . . .:.:.::::::::: .::..:.. : .::: :::.:::::.::::.:. :
CCDS74 FRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFR
210 220 230 240 250 260
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pF1KB9 SSFIQHNMTHTREKPFLCKECGKAFYYSSSFAQHMRIHTGKKLYECGECGKAFTHRSTFI
::: ::. ::: :::. :.:::::: : ..::.:::::.: :.::::::::.: :..
CCDS74 SSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLT
270 280 290 300 310 320
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.:. ::::::. :.::::.: . . ::.: ::::::::::::::::.. . . .:.:
CCDS74 KHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRR
330 340 350 360 370 380
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pF1KB9 THTGEKPFECKECGKAFCDSSSLIQHMRIHTGEKPYECSECGKAFTHHSVFIRHNRTHSG
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CCDS74 IHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTG
390 400 410 420 430 440
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.:: ::..:.::: .:::.:.:.::::::::: : .::.::.: : ...:.::::::::.
CCDS74 EKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPY
450 460 470 480 490 500
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::..: .:: .. : .:.: :: :::. ::::::.::::::...:.. ::
CCDS74 ECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHD
510 520 530 540 550 560
CCDS74 CGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]