FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9280, 579 aa
1>>>pF1KB9280 579 - 579 aa - 579 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.0742+/-0.00109; mu= 8.2759+/- 0.066
mean_var=221.4945+/-46.673, 0's: 0 Z-trim(110.2): 39 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.086177
statistics sampled from 11414 (11441) to 11414 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.674), E-opt: 0.2 (0.351), width: 16
Scan time: 3.620
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4114.1 KCNN2 gene_id:3781|Hs108|chr5 ( 579) 3747 479.1 6.4e-135
CCDS30880.1 KCNN3 gene_id:3782|Hs108|chr1 ( 731) 2561 331.8 1.8e-90
CCDS67611.1 KCNN1 gene_id:3780|Hs108|chr19 ( 543) 2343 304.6 2.1e-82
CCDS1072.1 KCNN3 gene_id:3782|Hs108|chr1 ( 426) 2199 286.5 4.4e-77
CCDS43352.1 KCNN2 gene_id:3781|Hs108|chr5 ( 231) 1472 195.9 4.7e-50
CCDS72928.1 KCNN3 gene_id:3782|Hs108|chr1 ( 746) 1386 185.7 1.8e-46
CCDS12630.1 KCNN4 gene_id:3783|Hs108|chr19 ( 427) 1131 153.8 4.2e-37
>>CCDS4114.1 KCNN2 gene_id:3781|Hs108|chr5 (579 aa)
initn: 3747 init1: 3747 opt: 3747 Z-score: 2535.8 bits: 479.1 E(32554): 6.4e-135
Smith-Waterman score: 3747; 100.0% identity (100.0% similar) in 579 aa overlap (1-579:1-579)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MSSCRYNGGVMRPLSNLSASRRNLHEMDSEAQPLQPPASVGGGGGASSPSAAAAAAAAVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MSSCRYNGGVMRPLSNLSASRRNLHEMDSEAQPLQPPASVGGGGGASSPSAAAAAAAAVS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 SSAPEIVVSKPEHNNSNNLALYGTGGGGSTGGGGGGGGSGHGSSSGTKSSKKKNQNIGYK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SSAPEIVVSKPEHNNSNNLALYGTGGGGSTGGGGGGGGSGHGSSSGTKSSKKKNQNIGYK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 LGHRRALFEKRKRLSDYALIFGMFGIVVMVIETELSWGAYDKASLYSLALKCLISLSTII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LGHRRALFEKRKRLSDYALIFGMFGIVVMVIETELSWGAYDKASLYSLALKCLISLSTII
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 LLGLIIVYHAREIQLFMVDNGADDWRIAMTYERIFFICLEILVCAIHPIPGNYTFTWTAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LLGLIIVYHAREIQLFMVDNGADDWRIAMTYERIFFICLEILVCAIHPIPGNYTFTWTAR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 LAFSYAPSTTTADVDIILSIPMFLRLYLIARVMLLHSKLFTDASSRSIGALNKINFNTRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LAFSYAPSTTTADVDIILSIPMFLRLYLIARVMLLHSKLFTDASSRSIGALNKINFNTRF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 VMKTLMTICPGTVLLVFSISLWIIAAWTVRACERYHDQQDVTSNFLGAMWLISITFLSIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 VMKTLMTICPGTVLLVFSISLWIIAAWTVRACERYHDQQDVTSNFLGAMWLISITFLSIG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 YGDMVPNTYCGKGVCLLTGIMGAGCTALVVAVVARKLELTKAEKHVHNFMMDTQLTKRVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 YGDMVPNTYCGKGVCLLTGIMGAGCTALVVAVVARKLELTKAEKHVHNFMMDTQLTKRVK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 NAAANVLRETWLIYKNTKLVKKIDHAKVRKHQRKFLQAIHQLRSVKMEQRKLNDQANTLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 NAAANVLRETWLIYKNTKLVKKIDHAKVRKHQRKFLQAIHQLRSVKMEQRKLNDQANTLV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 DLAKTQNIMYDMISDLNERSEDFEKRIVTLETKLETLIGSIHALPGLISQTIRQQQRDFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 DLAKTQNIMYDMISDLNERSEDFEKRIVTLETKLETLIGSIHALPGLISQTIRQQQRDFI
490 500 510 520 530 540
550 560 570
pF1KB9 EAQMESYDKHVTYNAERSRSSSRRRRSSSTAPPTSSESS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 EAQMESYDKHVTYNAERSRSSSRRRRSSSTAPPTSSESS
550 560 570
>>CCDS30880.1 KCNN3 gene_id:3782|Hs108|chr1 (731 aa)
initn: 2689 init1: 2525 opt: 2561 Z-score: 1737.6 bits: 331.8 E(32554): 1.8e-90
Smith-Waterman score: 2687; 73.7% identity (86.7% similar) in 579 aa overlap (1-579:175-728)
10 20 30
pF1KB9 MSSCRYNGGVMRPLSNLSASRRNLHEMDSE
::::.:.::::.::: :::::::: : ..:
CCDS30 ATSGPGGGSRHRQASPLVHRRDSNPFTEIAMSSCKYSGGVMKPLSRLSASRRNLIEAETE
150 160 170 180 190 200
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 AQPLQPPASVGGGGGASSPSAAAAAAAAVSSSAPEIVVSKPEHNNSNNLALYGTGGGGST
.:::: ::: . ::::.:. : :.... :. .. .
CCDS30 GQPLQ----------LFSPS-----------NPPEIVISSREDNHAHQTLLHHPNATHNH
210 220 230 240
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 GGGGGGGGSGHGSSSGTKSSKKKNQNIGYKLGHRRALFEKRKRLSDYALIFGMFGIVVMV
.: . .:.. :..:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 QHAG----TTASSTTFPKANKRKNQNIGYKLGHRRALFEKRKRLSDYALIFGMFGIVVMV
250 260 270 280 290
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 IETELSWGAYDKASLYSLALKCLISLSTIILLGLIIVYHAREIQLFMVDNGADDWRIAMT
:::::::: :.: :..::::::::::::::::::::.::.::.:::..::::::::::::
CCDS30 IETELSWGLYSKDSMFSLALKCLISLSTIILLGLIIAYHTREVQLFVIDNGADDWRIAMT
300 310 320 330 340 350
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 YERIFFICLEILVCAIHPIPGNYTFTWTARLAFSYAPSTTTADVDIILSIPMFLRLYLIA
::::..: ::.::::::::::.: : :::::::::.:: . :::::::::::::::::::
CCDS30 YERILYISLEMLVCAIHPIPGEYKFFWTARLAFSYTPSRAEADVDIILSIPMFLRLYLIA
360 370 380 390 400 410
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 RVMLLHSKLFTDASSRSIGALNKINFNTRFVMKTLMTICPGTVLLVFSISLWIIAAWTVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 RVMLLHSKLFTDASSRSIGALNKINFNTRFVMKTLMTICPGTVLLVFSISLWIIAAWTVR
420 430 440 450 460 470
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 ACERYHDQQDVTSNFLGAMWLISITFLSIGYGDMVPNTYCGKGVCLLTGIMGAGCTALVV
.:::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::
CCDS30 VCERYHDQQDVTSNFLGAMWLISITFLSIGYGDMVPHTYCGKGVCLLTGIMGAGCTALVV
480 490 500 510 520 530
400 410 420 430 440 450
pF1KB9 AVVARKLELTKAEKHVHNFMMDTQLTKRVKNAAANVLRETWLIYKNTKLVKKIDHAKVRK
::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::.:::.::::::::::
CCDS30 AVVARKLELTKAEKHVHNFMMDTQLTKRIKNAAANVLRETWLIYKHTKLLKKIDHAKVRK
540 550 560 570 580 590
460 470 480 490 500 510
pF1KB9 HQRKFLQAIHQLRSVKMEQRKLNDQANTLVDLAKTQNIMYDMISDLNERSEDFEKRIVTL
::::::::::::::::::::::.:::::::::.: ::.:::.:..::.::::.::.: .:
CCDS30 HQRKFLQAIHQLRSVKMEQRKLSDQANTLVDLSKMQNVMYDLITELNDRSEDLEKQIGSL
600 610 620 630 640 650
520 530 540 550 560 570
pF1KB9 ETKLETLIGSIHALPGLISQTIRQQQRDFIEAQMESYDKHVTYNAERSRSSSRRRRSSST
:.::: : .:...:: ::..:.::::.... : .:. :. .. .. :. :::
CCDS30 ESKLEHLTASFNSLPLLIADTLRQQQQQLLSAIIEARGVSVAVGTTHTPISDSPIGVSST
660 670 680 690 700 710
pF1KB9 APPTSSESS
. :: ::
CCDS30 SFPTPYTSSSSC
720 730
>>CCDS67611.1 KCNN1 gene_id:3780|Hs108|chr19 (543 aa)
initn: 2082 init1: 2031 opt: 2343 Z-score: 1592.7 bits: 304.6 E(32554): 2.1e-82
Smith-Waterman score: 2362; 70.3% identity (85.1% similar) in 538 aa overlap (1-533:1-508)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MSSCRYNGGVMRPL-SNLSASRRNLHEMDSEA-QPLQPPASVGGGGGASSPSAAAAAAAA
:.: :::.: ::: :. .: :. : :: .: ::: : : . .: . :
CCDS67 MNSHSYNGSVGRPLGSGPGALGRD--PPDPEAGHPPQPPHSPG-----LQVVVAKSEPAR
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 VSSSAPEIVVSKPEHNNSNNLALYGTGGGGSTGGGGGGGGSGHGSSSGTKSSKKKNQNIG
: ..:. ..:. ..... . . . .: . .. : .:.:
CCDS67 PSPGSPR---GQPQDQDDDE--------------------DDEEDEAGRQRASGKPSNVG
60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 YKLGHRRALFEKRKRLSDYALIFGMFGIVVMVIETELSWGAYDKASLYSLALKCLISLST
..:::::::::::::::::::::::::::::: :::::::.: : ::::.::::::::::
CCDS67 HRLGHRRALFEKRKRLSDYALIFGMFGIVVMVTETELSWGVYTKESLYSFALKCLISLST
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 IILLGLIIVYHAREIQLFMVDNGADDWRIAMTYERIFFICLEILVCAIHPIPGNYTFTWT
:::::...::::::::::::::::::::::: ::.:.: ::. ::::::.::.: ::::
CCDS67 AILLGLVVLYHAREIQLFMVDNGADDWRIAMTCERVFLISLELAVCAIHPVPGHYRFTWT
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 ARLAFSYAPSTTTADVDIILSIPMFLRLYLIARVMLLHSKLFTDASSRSIGALNKINFNT
:::::.::::.. ::::..:::::::::::..::::::::.:::::::::::::::.:::
CCDS67 ARLAFTYAPSVAEADVDVLLSIPMFLRLYLLGRVMLLHSKIFTDASSRSIGALNKITFNT
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 RFVMKTLMTICPGTVLLVFSISLWIIAAWTVRACERYHDQQDVTSNFLGAMWLISITFLS
:::::::::::::::::::::: :::::::::.::::::.:.::::::::::::::::::
CCDS67 RFVMKTLMTICPGTVLLVFSISSWIIAAWTVRVCERYHDKQEVTSNFLGAMWLISITFLS
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KB9 IGYGDMVPNTYCGKGVCLLTGIMGAGCTALVVAVVARKLELTKAEKHVHNFMMDTQLTKR
::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 IGYGDMVPHTYCGKGVCLLTGIMGAGCTALVVAVVARKLELTKAEKHVHNFMMDTQLTKR
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KB9 VKNAAANVLRETWLIYKNTKLVKKIDHAKVRKHQRKFLQAIHQ---LRSVKMEQRKLNDQ
:::::::::::::::::.:.:::: :.:.:::::::::::::: :::::.:: :::::
CCDS67 VKNAAANVLRETWLIYKHTRLVKKPDQARVRKHQRKFLQAIHQAQKLRSVKIEQGKLNDQ
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KB9 ANTLVDLAKTQNIMYDMISDLNERSEDFEKRIVTLETKLETLIGSIHALPGLISQTIRQQ
::::.::::::..:::..:.:. . :..: :..:::..:..: .:..::::::.:.::
CCDS67 ANTLTDLAKTQTVMYDLVSELHAQHEELEARLATLESRLDALGASLQALPGLIAQAIRPP
460 470 480 490 500 510
540 550 560 570
pF1KB9 QRDFIEAQMESYDKHVTYNAERSRSSSRRRRSSSTAPPTSSESS
CCDS67 PPPLPPRPGPGPQDQAARSSPCRWTPVAPSDCG
520 530 540
>>CCDS1072.1 KCNN3 gene_id:3782|Hs108|chr1 (426 aa)
initn: 2199 init1: 2199 opt: 2199 Z-score: 1497.3 bits: 286.5 E(32554): 4.4e-77
Smith-Waterman score: 2199; 81.1% identity (92.8% similar) in 418 aa overlap (162-579:6-423)
140 150 160 170 180 190
pF1KB9 KRLSDYALIFGMFGIVVMVIETELSWGAYDKASLYSLALKCLISLSTIILLGLIIVYHAR
: :..::::::::::::::::::::.::.:
CCDS10 MERPIKDSMFSLALKCLISLSTIILLGLIIAYHTR
10 20 30
200 210 220 230 240 250
pF1KB9 EIQLFMVDNGADDWRIAMTYERIFFICLEILVCAIHPIPGNYTFTWTARLAFSYAPSTTT
:.:::..::::::::::::::::..: ::.::::::::::.: : :::::::::.:: .
CCDS10 EVQLFVIDNGADDWRIAMTYERILYISLEMLVCAIHPIPGEYKFFWTARLAFSYTPSRAE
40 50 60 70 80 90
260 270 280 290 300 310
pF1KB9 ADVDIILSIPMFLRLYLIARVMLLHSKLFTDASSRSIGALNKINFNTRFVMKTLMTICPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ADVDIILSIPMFLRLYLIARVMLLHSKLFTDASSRSIGALNKINFNTRFVMKTLMTICPG
100 110 120 130 140 150
320 330 340 350 360 370
pF1KB9 TVLLVFSISLWIIAAWTVRACERYHDQQDVTSNFLGAMWLISITFLSIGYGDMVPNTYCG
:::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::
CCDS10 TVLLVFSISLWIIAAWTVRVCERYHDQQDVTSNFLGAMWLISITFLSIGYGDMVPHTYCG
160 170 180 190 200 210
380 390 400 410 420 430
pF1KB9 KGVCLLTGIMGAGCTALVVAVVARKLELTKAEKHVHNFMMDTQLTKRVKNAAANVLRETW
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::
CCDS10 KGVCLLTGIMGAGCTALVVAVVARKLELTKAEKHVHNFMMDTQLTKRIKNAAANVLRETW
220 230 240 250 260 270
440 450 460 470 480 490
pF1KB9 LIYKNTKLVKKIDHAKVRKHQRKFLQAIHQLRSVKMEQRKLNDQANTLVDLAKTQNIMYD
::::.:::.::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::.: ::.:::
CCDS10 LIYKHTKLLKKIDHAKVRKHQRKFLQAIHQLRSVKMEQRKLSDQANTLVDLSKMQNVMYD
280 290 300 310 320 330
500 510 520 530 540 550
pF1KB9 MISDLNERSEDFEKRIVTLETKLETLIGSIHALPGLISQTIRQQQRDFIEAQMESYDKHV
.:..::.::::.::.: .::.::: : .:...:: ::..:.::::.... : .:. :
CCDS10 LITELNDRSEDLEKQIGSLESKLEHLTASFNSLPLLIADTLRQQQQQLLSAIIEARGVSV
340 350 360 370 380 390
560 570
pF1KB9 TYNAERSRSSSRRRRSSSTAPPTSSESS
. .. .. :. :::. :: ::
CCDS10 AVGTTHTPISDSPIGVSSTSFPTPYTSSSSC
400 410 420
>>CCDS43352.1 KCNN2 gene_id:3781|Hs108|chr5 (231 aa)
initn: 1472 init1: 1472 opt: 1472 Z-score: 1012.1 bits: 195.9 E(32554): 4.7e-50
Smith-Waterman score: 1472; 100.0% identity (100.0% similar) in 231 aa overlap (349-579:1-231)
320 330 340 350 360 370
pF1KB9 ISLWIIAAWTVRACERYHDQQDVTSNFLGAMWLISITFLSIGYGDMVPNTYCGKGVCLLT
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MWLISITFLSIGYGDMVPNTYCGKGVCLLT
10 20 30
380 390 400 410 420 430
pF1KB9 GIMGAGCTALVVAVVARKLELTKAEKHVHNFMMDTQLTKRVKNAAANVLRETWLIYKNTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GIMGAGCTALVVAVVARKLELTKAEKHVHNFMMDTQLTKRVKNAAANVLRETWLIYKNTK
40 50 60 70 80 90
440 450 460 470 480 490
pF1KB9 LVKKIDHAKVRKHQRKFLQAIHQLRSVKMEQRKLNDQANTLVDLAKTQNIMYDMISDLNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LVKKIDHAKVRKHQRKFLQAIHQLRSVKMEQRKLNDQANTLVDLAKTQNIMYDMISDLNE
100 110 120 130 140 150
500 510 520 530 540 550
pF1KB9 RSEDFEKRIVTLETKLETLIGSIHALPGLISQTIRQQQRDFIEAQMESYDKHVTYNAERS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RSEDFEKRIVTLETKLETLIGSIHALPGLISQTIRQQQRDFIEAQMESYDKHVTYNAERS
160 170 180 190 200 210
560 570
pF1KB9 RSSSRRRRSSSTAPPTSSESS
:::::::::::::::::::::
CCDS43 RSSSRRRRSSSTAPPTSSESS
220 230
>>CCDS72928.1 KCNN3 gene_id:3782|Hs108|chr1 (746 aa)
initn: 2668 init1: 1332 opt: 1386 Z-score: 948.0 bits: 185.7 E(32554): 1.8e-46
Smith-Waterman score: 2639; 71.7% identity (84.3% similar) in 594 aa overlap (1-579:175-743)
10 20 30
pF1KB9 MSSCRYNGGVMRPLSNLSASRRNLHEMDSE
::::.:.::::.::: :::::::: : ..:
CCDS72 ATSGPGGGSRHRQASPLVHRRDSNPFTEIAMSSCKYSGGVMKPLSRLSASRRNLIEAETE
150 160 170 180 190 200
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 AQPLQPPASVGGGGGASSPSAAAAAAAAVSSSAPEIVVSKPEHNNSNNLALYGTGGGGST
.:::: ::: . ::::.:. : :.... :. .. .
CCDS72 GQPLQ----------LFSPS-----------NPPEIVISSREDNHAHQTLLHHPNATHNH
210 220 230 240
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 GGGGGGGGSGHGSSSGTKSSKKKNQNIGYKLGHRRALFEKRKRLSDYALIFGMFGIVVMV
.: . .:.. :..:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 QHAG----TTASSTTFPKANKRKNQNIGYKLGHRRALFEKRKRLSDYALIFGMFGIVVMV
250 260 270 280 290
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 IETELSWGAYDKASLYSLALKCLISLSTIILLGLIIVYHAREIQLFMVDNGADDWRIAMT
:::::::: :.: :..::::::::::::::::::::.::.::.:::..::::::::::::
CCDS72 IETELSWGLYSKDSMFSLALKCLISLSTIILLGLIIAYHTREVQLFVIDNGADDWRIAMT
300 310 320 330 340 350
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 YERIFFICLEILVCAIHPIPGNYTFTWTARLAFSYAPSTTTADVDIILSIPMFLRLYLIA
::::..: ::.::::::::::.: : :::::::::.:: . :::::::::::::::::::
CCDS72 YERILYISLEMLVCAIHPIPGEYKFFWTARLAFSYTPSRAEADVDIILSIPMFLRLYLIA
360 370 380 390 400 410
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 RVMLLHSKLFTDASSRSIGALNKINFNTRFVMKTLMTICPGTVLLVFSISLWIIAAWTVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 RVMLLHSKLFTDASSRSIGALNKINFNTRFVMKTLMTICPGTVLLVFSISLWIIAAWTVR
420 430 440 450 460 470
340 350 360 370
pF1KB9 ACER---------------YHDQQDVTSNFLGAMWLISITFLSIGYGDMVPNTYCGKGVC
.:: ::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::
CCDS72 VCESPESPAQPSGSSLPAWYHDQQDVTSNFLGAMWLISITFLSIGYGDMVPHTYCGKGVC
480 490 500 510 520 530
380 390 400 410 420 430
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