FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB9394, 388 aa 1>>>pF1KB9394 388 - 388 aa - 388 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7236+/-0.000913; mu= 13.9339+/- 0.055 mean_var=60.8099+/-12.665, 0's: 0 Z-trim(104.8): 20 B-trim: 417 in 1/49 Lambda= 0.164470 statistics sampled from 8100 (8113) to 8100 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.622), E-opt: 0.2 (0.249), width: 16 Scan time: 2.680 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS13420.1 B4GALT5 gene_id:9334|Hs108|chr20 ( 388) 2676 643.6 8.9e-185 CCDS11900.1 B4GALT6 gene_id:9331|Hs108|chr18 ( 382) 1966 475.1 4.5e-134 CCDS82245.1 B4GALT6 gene_id:9331|Hs108|chr18 ( 343) 1683 408.0 6.7e-114 CCDS1222.1 B4GALT3 gene_id:8703|Hs108|chr1 ( 393) 853 211.0 1.5e-54 CCDS6535.1 B4GALT1 gene_id:2683|Hs108|chr9 ( 398) 833 206.3 4e-53 CCDS506.1 B4GALT2 gene_id:8704|Hs108|chr1 ( 372) 811 201.1 1.4e-51 CCDS55596.1 B4GALT2 gene_id:8704|Hs108|chr1 ( 401) 811 201.1 1.5e-51 CCDS2986.1 B4GALT4 gene_id:8702|Hs108|chr3 ( 344) 723 180.2 2.5e-45 CCDS4429.1 B4GALT7 gene_id:11285|Hs108|chr5 ( 327) 426 109.7 3.9e-24 >>CCDS13420.1 B4GALT5 gene_id:9334|Hs108|chr20 (388 aa) initn: 2676 init1: 2676 opt: 2676 Z-score: 3430.8 bits: 643.6 E(32554): 8.9e-185 Smith-Waterman score: 2676; 100.0% identity (100.0% similar) in 388 aa overlap (1-388:1-388) 10 20 30 40 50 60 pF1KB9 MRARRGLLRLPRRSLLAALFFFSLSSSLLYFVYVAPGIVNTYLFMMQAQGILIRDNVRTI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS13 MRARRGLLRLPRRSLLAALFFFSLSSSLLYFVYVAPGIVNTYLFMMQAQGILIRDNVRTI 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB9 GAQVYEQVLRSAYAKRNSSVNDSDYPLDLNHSETFLQTTTFLPEDFTYFANHTCPERLPS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS13 GAQVYEQVLRSAYAKRNSSVNDSDYPLDLNHSETFLQTTTFLPEDFTYFANHTCPERLPS 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB9 MKGPIDINMSEIGMDYIHELFSKDPTIKLGGHWKPSDCMPRWKVAILIPFRNRHEHLPVL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS13 MKGPIDINMSEIGMDYIHELFSKDPTIKLGGHWKPSDCMPRWKVAILIPFRNRHEHLPVL 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB9 FRHLLPMLQRQRLQFAFYVVEQVGTQPFNRAMLFNVGFQEAMKDLDWDCLIFHDVDHIPE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS13 FRHLLPMLQRQRLQFAFYVVEQVGTQPFNRAMLFNVGFQEAMKDLDWDCLIFHDVDHIPE 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB9 SDRNYYGCGQMPRHFATKLDKYMYLLPYTEFFGGVSGLTVEQFRKINGFPNAFWGWGGED :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS13 SDRNYYGCGQMPRHFATKLDKYMYLLPYTEFFGGVSGLTVEQFRKINGFPNAFWGWGGED 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KB9 DDLWNRVQNAGYSVSRPEGDTGKYKSIPHHHRGEVQFLGRYALLRKSKERQGLDGLNNLN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS13 DDLWNRVQNAGYSVSRPEGDTGKYKSIPHHHRGEVQFLGRYALLRKSKERQGLDGLNNLN 310 320 330 340 350 360 370 380 pF1KB9 YFANITYDALYKNITVNLTPELAQVNEY :::::::::::::::::::::::::::: CCDS13 YFANITYDALYKNITVNLTPELAQVNEY 370 380 >>CCDS11900.1 B4GALT6 gene_id:9331|Hs108|chr18 (382 aa) initn: 1966 init1: 1706 opt: 1966 Z-score: 2520.5 bits: 475.1 E(32554): 4.5e-134 Smith-Waterman score: 1966; 70.6% identity (87.1% similar) in 388 aa overlap (1-388:1-382) 10 20 30 40 50 60 pF1KB9 MRARRGLLRLPRRSLLAALFFFSLSSSLLYFVYVAPGIVNTYLFMMQAQGILIRDNVRTI : . : ..:. ::::: .:::::::: :::.::::::.::::::.::.::..:.::.:: CCDS11 MSVLRRMMRVSNRSLLAFIFFFSLSSSCLYFIYVAPGIANTYLFMVQARGIMLRENVKTI 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB9 GAQVYEQVLRSAYAKRNSSVNDSDYPLDLNHSETFLQTTTFLPEDFTYFANHTCPERLPS : ...: :...::..: .::: : :. ..::::.:::.::: :::.:: CCDS11 G-----HMIR-LYTNKNSTLNGTDYPEGNNSSDYLVQTTTYLPENFTYSPYLPCPEKLPY 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KB9 MKGPIDINMSEIGMDYIHELFSKDPTIKLGGHWKPSDCMPRWKVAILIPFRNRHEHLPVL :.: ...:.::...: ::.::::: :. ::::.:.:: ::::::.::::::::::::.. 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CCDS12 NEENPHRFDLLVRTQNSWTQDGMNSLTYQLLARELGPLYTNITADIGTDPRGPRAPSGPR 300 310 320 330 340 350 CCDS12 YPPGSSQAFRQEMLQRRPPARPGPLSTANHTALRGSH 360 370 380 390 >>CCDS6535.1 B4GALT1 gene_id:2683|Hs108|chr9 (398 aa) initn: 786 init1: 713 opt: 833 Z-score: 1067.2 bits: 206.3 E(32554): 4e-53 Smith-Waterman score: 833; 43.6% identity (71.6% similar) in 303 aa overlap (82-380:99-397) 60 70 80 90 100 110 pF1KB9 LIRDNVRTIGAQVYEQVLRSAYAKRNSSVNDSDYPLDLNHSETFLQTTTFLPEDFTYFAN ::. .: . . . :.. .:. : .. CCDS65 AIGQSSGELRTGGARPPPPLGASSQPRPGGDSSPVVDSGPGPASNLTSVPVPHT-TALSL 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KB9 HTCPERLPSMKGPIDINMSEIGMDYIHELFSK-DPTIKLGGHWKPSDCMPRWKVAILIPF .:::. : . ::. : :..: :: .: .:..:.::.. : ::. ::::.::: CCDS65 PACPEESPLLVGPMLI---EFNMPVDLELVAKQNPNVKMGGRYAPRDCVSPHKVAIIIPF 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KB9 RNRHEHLPVLFRHLLPMLQRQRLQFAFYVVEQVGTQPFNRAMLFNVGFQEAMKDLDWDCL :::.::: . .: :.::::.:....::..:.: :::: :.:::::::.:: :. :. CCDS65 RNRQEHLKYWLYYLHPVLQRQQLDYGIYVINQAGDTIFNRAKLLNVGFQEALKDYDYTCF 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KB9 IFHDVDHIPESDRNYYGCGQMPRHFATKLDKYMYLLPYTEFFGGVSGLTVEQFRKINGFP .: ::: :: .:.: : : ..:::... .::. . :::...:::::.:. .:: ::::: CCDS65 VFSDVDLIPMNDHNAYRCFSQPRHISVAMDKFGFSLPYVQYFGGVSALSKQQFLTINGFP 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 pF1KB9 NAFWGWGGEDDDLWNRVQNAGYSVSRPEGDTGKYKSIPHHH-RGEVQFLGRYALLRKSKE : .:::::::::..::. :.:.:::.. .:. . : : . . . :. . ..:: CCDS65 NNYWGWGGEDDDIFNRLVFRGMSISRPNAVVGRCRMIRHSRDKKNEPNPQRFDRIAHTKE 310 320 330 340 350 360 350 360 370 380 pF1KB9 RQGLDGLNNLNY-FANITYDALYKNITVNL-TPELAQVNEY . ::::.:.: .. :: .:::.. :: CCDS65 TMLSDGLNSLTYQVLDVQRYPLYTQITVDIGTPS 370 380 390 >>CCDS506.1 B4GALT2 gene_id:8704|Hs108|chr1 (372 aa) initn: 711 init1: 437 opt: 811 Z-score: 1039.5 bits: 201.1 E(32554): 1.4e-51 Smith-Waterman score: 811; 39.7% identity (69.2% similar) in 312 aa overlap (74-378:58-362) 50 60 70 80 90 100 pF1KB9 FMMQAQGILIRDNVRTIGAQVYEQVLRSAYAKRNSSVNDSDYPLDLNHSETFLQTTTFLP :. .:: .. . : : . .. . :: CCDS50 VILYFDVYAQHLAFFSRFSARGPAHALHPAASSSSSSSNCSRPNATASSSGLPEVPSALP 30 40 50 60 70 80 110 120 130 140 150 160 pF1KB9 EDFTYFANHTCPERLPSMKGPIDINM-SEIGMDYIHELFSKDPTIKLGGHWKPSDCMPRW : . ::. :.. : . :.. : . .. ... ..: . .::.. : :: : CCDS50 GP-TAPTLPPCPDSPPGLVGRLLIEFTSPMPLERVQR---ENPGVLMGGRYTPPDCTPAQ 90 100 110 120 130 140 170 180 190 200 210 220 pF1KB9 KVAILIPFRNRHEHLPVLFRHLLPMLQRQRLQFAFYVVEQVGTQPFNRAMLFNVGFQEAM ::..::::.:..:: ...: :.:.::::... ::..: : . :::: :.:::: ::. CCDS50 TVAVIIPFRHREHHLRYWLHYLHPILRRQRLRYGVYVINQHGEDTFNRAKLLNVGFLEAL 150 160 170 180 190 200 230 240 250 260 270 280 pF1KB9 K-DLDWDCLIFHDVDHIPESDRNYYGCGQMPRHFATKLDKYMYLLPYTEFFGGVSGLTVE : : .::.:: ::: .: .::: : ::..::::: .::. . :::. .:::::::. CCDS50 KEDAAYDCFIFSDVDLVPMDDRNLYRCGDQPRHFAIAMDKFGFRLPYAGYFGGVSGLSKA 210 220 230 240 250 260 290 300 310 320 330 pF1KB9 QFRKINGFPNAFWGWGGEDDDLWNRVQNAGYSVSRPEGDTGKYKSIPH----HHRGEVQF :: .:::::: .:::::::::..::.. .:...:::. :.:. : : :.. . : CCDS50 QFLRINGFPNEYWGWGGEDDDIFNRISLTGMKISRPDIRIGRYRMIKHDRDKHNEPNPQ- 270 280 290 300 310 320 340 350 360 370 380 pF1KB9 LGRYALLRKSKERQGLDGLNNLNY-FANITYDALYKNITVNLTPELAQVNEY :.. ....: . ::.... : ... . :. ::::.. CCDS50 --RFTKIQNTKLTMKRDGIGSVRYQVLEVSRQPLFTNITVDIGRPPSWPPRG 330 340 350 360 370 >>CCDS55596.1 B4GALT2 gene_id:8704|Hs108|chr1 (401 aa) initn: 711 init1: 437 opt: 811 Z-score: 1039.0 bits: 201.1 E(32554): 1.5e-51 Smith-Waterman score: 811; 39.7% identity (69.2% similar) in 312 aa overlap (74-378:87-391) 50 60 70 80 90 100 pF1KB9 FMMQAQGILIRDNVRTIGAQVYEQVLRSAYAKRNSSVNDSDYPLDLNHSETFLQTTTFLP :. .:: .. . : : . .. . :: CCDS55 VILYFDVYAQHLAFFSRFSARGPAHALHPAASSSSSSSNCSRPNATASSSGLPEVPSALP 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KB9 EDFTYFANHTCPERLPSMKGPIDINM-SEIGMDYIHELFSKDPTIKLGGHWKPSDCMPRW : . ::. :.. : . :.. : . .. ... ..: . .::.. : :: : CCDS55 GP-TAPTLPPCPDSPPGLVGRLLIEFTSPMPLERVQR---ENPGVLMGGRYTPPDCTPAQ 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KB9 KVAILIPFRNRHEHLPVLFRHLLPMLQRQRLQFAFYVVEQVGTQPFNRAMLFNVGFQEAM ::..::::.:..:: ...: :.:.::::... ::..: : . :::: :.:::: ::. CCDS55 TVAVIIPFRHREHHLRYWLHYLHPILRRQRLRYGVYVINQHGEDTFNRAKLLNVGFLEAL 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KB9 K-DLDWDCLIFHDVDHIPESDRNYYGCGQMPRHFATKLDKYMYLLPYTEFFGGVSGLTVE : : .::.:: ::: .: .::: : ::..::::: .::. . :::. .:::::::. CCDS55 KEDAAYDCFIFSDVDLVPMDDRNLYRCGDQPRHFAIAMDKFGFRLPYAGYFGGVSGLSKA 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 pF1KB9 QFRKINGFPNAFWGWGGEDDDLWNRVQNAGYSVSRPEGDTGKYKSIPH----HHRGEVQF :: .:::::: .:::::::::..::.. .:...:::. :.:. : : :.. . : CCDS55 QFLRINGFPNEYWGWGGEDDDIFNRISLTGMKISRPDIRIGRYRMIKHDRDKHNEPNPQ- 300 310 320 330 340 350 340 350 360 370 380 pF1KB9 LGRYALLRKSKERQGLDGLNNLNY-FANITYDALYKNITVNLTPELAQVNEY :.. ....: . ::.... : ... . :. ::::.. CCDS55 --RFTKIQNTKLTMKRDGIGSVRYQVLEVSRQPLFTNITVDIGRPPSWPPRG 360 370 380 390 400 >>CCDS2986.1 B4GALT4 gene_id:8702|Hs108|chr3 (344 aa) initn: 649 init1: 620 opt: 723 Z-score: 927.2 bits: 180.2 E(32554): 2.5e-45 Smith-Waterman score: 723; 40.7% identity (71.3% similar) in 268 aa overlap (114-378:77-340) 90 100 110 120 130 140 pF1KB9 DYPLDLNHSETFLQTTTFLPEDFTYFANHTCPERLPSMKGPIDINMSEIGMDY-IHELFS :: : ..: . .. : ..:. . CCDS29 FMANFHKTLILGKGKTLTNEASTKKVELDNCPSVSPYLRGQSKLIFKP---DLTLEEVQA 50 60 70 80 90 100 150 160 170 180 190 200 pF1KB9 KDPTIKLGGHWKPSDCMPRWKVAILIPFRNRHEHLPVLFRHLLPMLQRQRLQFAFYVVEQ ..: .. : ...:..: .::::.: :::..:: :..:: :.::::.:....::..: CCDS29 ENPKVSRG-RYRPQECKALQRVAILVPHRNREKHLMYLLEHLHPFLQRQQLDYGIYVIHQ 110 120 130 140 150 160 210 220 230 240 250 260 pF1KB9 VGTQPFNRAMLFNVGFQEAMKDLDWDCLIFHDVDHIPESDRNYYGCGQMPRHFATKLDKY . . :::: :.:::. ::.:. .:::.:::::: .::.: : : : . :.:... .. 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