Result of FASTA (ccds) for
pF1KB9394
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9394, 388 aa
1>>>pF1KB9394 388 - 388 aa - 388 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7236+/-0.000913; mu= 13.9339+/- 0.055
mean_var=60.8099+/-12.665, 0's: 0 Z-trim(104.8): 20 B-trim: 417 in 1/49
Lambda= 0.164470
statistics sampled from 8100 (8113) to 8100 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.622), E-opt: 0.2 (0.249), width: 16
Scan time: 2.680
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS13420.1 B4GALT5 gene_id:9334|Hs108|chr20 ( 388) 2676 643.6 8.9e-185
CCDS11900.1 B4GALT6 gene_id:9331|Hs108|chr18 ( 382) 1966 475.1 4.5e-134
CCDS82245.1 B4GALT6 gene_id:9331|Hs108|chr18 ( 343) 1683 408.0 6.7e-114
CCDS1222.1 B4GALT3 gene_id:8703|Hs108|chr1 ( 393) 853 211.0 1.5e-54
CCDS6535.1 B4GALT1 gene_id:2683|Hs108|chr9 ( 398) 833 206.3 4e-53
CCDS506.1 B4GALT2 gene_id:8704|Hs108|chr1 ( 372) 811 201.1 1.4e-51
CCDS55596.1 B4GALT2 gene_id:8704|Hs108|chr1 ( 401) 811 201.1 1.5e-51
CCDS2986.1 B4GALT4 gene_id:8702|Hs108|chr3 ( 344) 723 180.2 2.5e-45
CCDS4429.1 B4GALT7 gene_id:11285|Hs108|chr5 ( 327) 426 109.7 3.9e-24
>>CCDS13420.1 B4GALT5 gene_id:9334|Hs108|chr20 (388 aa)
initn: 2676 init1: 2676 opt: 2676 Z-score: 3430.8 bits: 643.6 E(32554): 8.9e-185
Smith-Waterman score: 2676; 100.0% identity (100.0% similar) in 388 aa overlap (1-388:1-388)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MRARRGLLRLPRRSLLAALFFFSLSSSLLYFVYVAPGIVNTYLFMMQAQGILIRDNVRTI
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CCDS13 MRARRGLLRLPRRSLLAALFFFSLSSSLLYFVYVAPGIVNTYLFMMQAQGILIRDNVRTI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 GAQVYEQVLRSAYAKRNSSVNDSDYPLDLNHSETFLQTTTFLPEDFTYFANHTCPERLPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GAQVYEQVLRSAYAKRNSSVNDSDYPLDLNHSETFLQTTTFLPEDFTYFANHTCPERLPS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 MKGPIDINMSEIGMDYIHELFSKDPTIKLGGHWKPSDCMPRWKVAILIPFRNRHEHLPVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MKGPIDINMSEIGMDYIHELFSKDPTIKLGGHWKPSDCMPRWKVAILIPFRNRHEHLPVL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 FRHLLPMLQRQRLQFAFYVVEQVGTQPFNRAMLFNVGFQEAMKDLDWDCLIFHDVDHIPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 FRHLLPMLQRQRLQFAFYVVEQVGTQPFNRAMLFNVGFQEAMKDLDWDCLIFHDVDHIPE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 SDRNYYGCGQMPRHFATKLDKYMYLLPYTEFFGGVSGLTVEQFRKINGFPNAFWGWGGED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SDRNYYGCGQMPRHFATKLDKYMYLLPYTEFFGGVSGLTVEQFRKINGFPNAFWGWGGED
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 DDLWNRVQNAGYSVSRPEGDTGKYKSIPHHHRGEVQFLGRYALLRKSKERQGLDGLNNLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 DDLWNRVQNAGYSVSRPEGDTGKYKSIPHHHRGEVQFLGRYALLRKSKERQGLDGLNNLN
310 320 330 340 350 360
370 380
pF1KB9 YFANITYDALYKNITVNLTPELAQVNEY
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 YFANITYDALYKNITVNLTPELAQVNEY
370 380
>>CCDS11900.1 B4GALT6 gene_id:9331|Hs108|chr18 (382 aa)
initn: 1966 init1: 1706 opt: 1966 Z-score: 2520.5 bits: 475.1 E(32554): 4.5e-134
Smith-Waterman score: 1966; 70.6% identity (87.1% similar) in 388 aa overlap (1-388:1-382)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MRARRGLLRLPRRSLLAALFFFSLSSSLLYFVYVAPGIVNTYLFMMQAQGILIRDNVRTI
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CCDS11 MSVLRRMMRVSNRSLLAFIFFFSLSSSCLYFIYVAPGIANTYLFMVQARGIMLRENVKTI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 GAQVYEQVLRSAYAKRNSSVNDSDYPLDLNHSETFLQTTTFLPEDFTYFANHTCPERLPS
: ...: :...::..: .::: : :. ..::::.:::.::: :::.::
CCDS11 G-----HMIR-LYTNKNSTLNGTDYPEGNNSSDYLVQTTTYLPENFTYSPYLPCPEKLPY
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 MKGPIDINMSEIGMDYIHELFSKDPTIKLGGHWKPSDCMPRWKVAILIPFRNRHEHLPVL
:.: ...:.::...: ::.::::: :. ::::.:.:: ::::::.::::::::::::..
CCDS11 MRGFLNVNVSEVSFDEIHQLFSKDLDIEPGGHWRPKDCKPRWKVAVLIPFRNRHEHLPIF
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 FRHLLPMLQRQRLQFAFYVVEQVGTQPFNRAMLFNVGFQEAMKDLDWDCLIFHDVDHIPE
: ::.::::.:::.:::::.::.:::::::::::::::.::::: :::.:::::::.::
CCDS11 FLHLIPMLQKQRLEFAFYVIEQTGTQPFNRAMLFNVGFKEAMKDSVWDCVIFHDVDHLPE
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 SDRNYYGCGQMPRHFATKLDKYMYLLPYTEFFGGVSGLTVEQFRKINGFPNAFWGWGGED
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CCDS11 NDRNYYGCGEMPRHFAAKLDKYMYILPYKEFFGGVSGLTVEQFRKINGFPNAFWGWGGED
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 DDLWNRVQNAGYSVSRPEGDTGKYKSIPHHHRGEVQFLGRYALLRKSKERQGLDGLNNLN
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CCDS11 DDLWNRVHYAGYNVTRPEGDLGKYKSIPHHHRGEVQFLGRYKLLRYSKERQYIDGLNNLI
300 310 320 330 340 350
370 380
pF1KB9 YFANITYDALYKNITVNLTPELAQVNEY
: .: : :: ::.::: :::: ...:
CCDS11 YRPKILVDRLYTNISVNLMPELAPIEDY
360 370 380
>>CCDS82245.1 B4GALT6 gene_id:9331|Hs108|chr18 (343 aa)
initn: 1827 init1: 1683 opt: 1683 Z-score: 2158.3 bits: 408.0 E(32554): 6.7e-114
Smith-Waterman score: 1741; 65.2% identity (77.6% similar) in 388 aa overlap (1-388:1-343)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MRARRGLLRLPRRSLLAALFFFSLSSSLLYFVYVAPGIVNTYLFMMQAQGILIRDNVRTI
: . : ..:. ::::: .:::::::: :::.::::::
CCDS82 MSVLRRMMRVSNRSLLAFIFFFSLSSSCLYFIYVAPGI----------------------
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 GAQVYEQVLRSAYAKRNSSVNDSDYPLDLNHSETFLQTTTFLPEDFTYFANHTCPERLPS
::: : :. ..::::.:::.::: :::.::
CCDS82 -----------------------DYPEGNNSSDYLVQTTTYLPENFTYSPYLPCPEKLPY
40 50 60 70
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 MKGPIDINMSEIGMDYIHELFSKDPTIKLGGHWKPSDCMPRWKVAILIPFRNRHEHLPVL
:.: ...:.::...: ::.::::: :. ::::.:.:: ::::::.::::::::::::..
CCDS82 MRGFLNVNVSEVSFDEIHQLFSKDLDIEPGGHWRPKDCKPRWKVAVLIPFRNRHEHLPIF
80 90 100 110 120 130
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 FRHLLPMLQRQRLQFAFYVVEQVGTQPFNRAMLFNVGFQEAMKDLDWDCLIFHDVDHIPE
: ::.::::.:::.:::::.::.:::::::::::::::.::::: :::.:::::::.::
CCDS82 FLHLIPMLQKQRLEFAFYVIEQTGTQPFNRAMLFNVGFKEAMKDSVWDCVIFHDVDHLPE
140 150 160 170 180 190
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 SDRNYYGCGQMPRHFATKLDKYMYLLPYTEFFGGVSGLTVEQFRKINGFPNAFWGWGGED
.::::::::.::::::.:::::::.::: :::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 NDRNYYGCGEMPRHFAAKLDKYMYILPYKEFFGGVSGLTVEQFRKINGFPNAFWGWGGED
200 210 220 230 240 250
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 DDLWNRVQNAGYSVSRPEGDTGKYKSIPHHHRGEVQFLGRYALLRKSKERQGLDGLNNLN
:::::::. :::.:.::::: :::::::::::::::::::: ::: ::::: .::::::
CCDS82 DDLWNRVHYAGYNVTRPEGDLGKYKSIPHHHRGEVQFLGRYKLLRYSKERQYIDGLNNLI
260 270 280 290 300 310
370 380
pF1KB9 YFANITYDALYKNITVNLTPELAQVNEY
: .: : :: ::.::: :::: ...:
CCDS82 YRPKILVDRLYTNISVNLMPELAPIEDY
320 330 340
>>CCDS1222.1 B4GALT3 gene_id:8703|Hs108|chr1 (393 aa)
initn: 801 init1: 416 opt: 853 Z-score: 1093.0 bits: 211.0 E(32554): 1.5e-54
Smith-Waterman score: 853; 39.6% identity (70.3% similar) in 316 aa overlap (69-378:34-342)
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 VNTYLFMMQAQGILIRDNVRTIGAQVYEQVLRSAYAKRNSSVNDSDYPLDLNHSETFLQT
: . ... .. . : ..: :. . . :
CCDS12 RLLERPCTLALLVGSQLAVMMYLSLGGFRSLSALFGRDQGPTFDYSHPRDVYSNLSHLPG
10 20 30 40 50 60
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 TTF---LPEDFTYFANHTCPERLPSMKGPIDINMSEIGMDYIHELFSKDPTIKLGGHWKP
. :. . : :::: : . ::.....: . . :. ..: .. ::...:
CCDS12 APGGPPAPQGLPY-----CPERSPLLVGPVSVSFSPV--PSLAEIVERNPRVEPGGRYRP
70 80 90 100 110
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 SDCMPRWKVAILIPFRNRHEHLPVLFRHLLPMLQRQRLQFAFYVVEQVGTQPFNRAMLFN
. : :: ..::..: : :..:: .:. :: :.::::.: ...::..:.:. :::: :.:
CCDS12 AGCEPRSRTAIIVPHRAREHHLRLLLYHLHPFLQRQQLAYGIYVIHQAGNGTFNRAKLLN
120 130 140 150 160 170
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 VGFQEAMKDLDWDCLIFHDVDHIPESDRNYYGCG-QMPRHFATKLDKYMYLLPYTEFFGG
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CCDS12 VGVREALRDEEWDCLFLHDVDLLPENDHNLYVCDPRGPRHVAVAMNKFGYSLPYPQYFGG
180 190 200 210 220 230
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 VSGLTVEQFRKINGFPNAFWGWGGEDDDLWNRVQNAGYSVSRPEGDTGKYKSIPHH-HRG
::.:: .:. :.::::: .:::::::::. .::. ::...::: ..:.:: . :. .:
CCDS12 VSALTPDQYLKMNGFPNEYWGWGGEDDDIATRVRLAGMKISRPPTSVGHYKMVKHRGDKG
240 250 260 270 280 290
340 350 360 370 380
pF1KB9 EVQFLGRYALLRKSKERQGLDGLNNLNY-FANITYDALYKNITVNLTPELAQVNEY
. . :. :: .... ::.:.:.: . :: :::...
CCDS12 NEENPHRFDLLVRTQNSWTQDGMNSLTYQLLARELGPLYTNITADIGTDPRGPRAPSGPR
300 310 320 330 340 350
CCDS12 YPPGSSQAFRQEMLQRRPPARPGPLSTANHTALRGSH
360 370 380 390
>>CCDS6535.1 B4GALT1 gene_id:2683|Hs108|chr9 (398 aa)
initn: 786 init1: 713 opt: 833 Z-score: 1067.2 bits: 206.3 E(32554): 4e-53
Smith-Waterman score: 833; 43.6% identity (71.6% similar) in 303 aa overlap (82-380:99-397)
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 LIRDNVRTIGAQVYEQVLRSAYAKRNSSVNDSDYPLDLNHSETFLQTTTFLPEDFTYFAN
::. .: . . . :.. .:. : ..
CCDS65 AIGQSSGELRTGGARPPPPLGASSQPRPGGDSSPVVDSGPGPASNLTSVPVPHT-TALSL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 HTCPERLPSMKGPIDINMSEIGMDYIHELFSK-DPTIKLGGHWKPSDCMPRWKVAILIPF
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CCDS65 PACPEESPLLVGPMLI---EFNMPVDLELVAKQNPNVKMGGRYAPRDCVSPHKVAIIIPF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 RNRHEHLPVLFRHLLPMLQRQRLQFAFYVVEQVGTQPFNRAMLFNVGFQEAMKDLDWDCL
:::.::: . .: :.::::.:....::..:.: :::: :.:::::::.:: :. :.
CCDS65 RNRQEHLKYWLYYLHPVLQRQQLDYGIYVINQAGDTIFNRAKLLNVGFQEALKDYDYTCF
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 IFHDVDHIPESDRNYYGCGQMPRHFATKLDKYMYLLPYTEFFGGVSGLTVEQFRKINGFP
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CCDS65 VFSDVDLIPMNDHNAYRCFSQPRHISVAMDKFGFSLPYVQYFGGVSALSKQQFLTINGFP
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340
pF1KB9 NAFWGWGGEDDDLWNRVQNAGYSVSRPEGDTGKYKSIPHHH-RGEVQFLGRYALLRKSKE
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CCDS65 NNYWGWGGEDDDIFNRLVFRGMSISRPNAVVGRCRMIRHSRDKKNEPNPQRFDRIAHTKE
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380
pF1KB9 RQGLDGLNNLNY-FANITYDALYKNITVNL-TPELAQVNEY
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CCDS65 TMLSDGLNSLTYQVLDVQRYPLYTQITVDIGTPS
370 380 390
>>CCDS506.1 B4GALT2 gene_id:8704|Hs108|chr1 (372 aa)
initn: 711 init1: 437 opt: 811 Z-score: 1039.5 bits: 201.1 E(32554): 1.4e-51
Smith-Waterman score: 811; 39.7% identity (69.2% similar) in 312 aa overlap (74-378:58-362)
50 60 70 80 90 100
pF1KB9 FMMQAQGILIRDNVRTIGAQVYEQVLRSAYAKRNSSVNDSDYPLDLNHSETFLQTTTFLP
:. .:: .. . : : . .. . ::
CCDS50 VILYFDVYAQHLAFFSRFSARGPAHALHPAASSSSSSSNCSRPNATASSSGLPEVPSALP
30 40 50 60 70 80
110 120 130 140 150 160
pF1KB9 EDFTYFANHTCPERLPSMKGPIDINM-SEIGMDYIHELFSKDPTIKLGGHWKPSDCMPRW
: . ::. :.. : . :.. : . .. ... ..: . .::.. : :: :
CCDS50 GP-TAPTLPPCPDSPPGLVGRLLIEFTSPMPLERVQR---ENPGVLMGGRYTPPDCTPAQ
90 100 110 120 130 140
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 KVAILIPFRNRHEHLPVLFRHLLPMLQRQRLQFAFYVVEQVGTQPFNRAMLFNVGFQEAM
::..::::.:..:: ...: :.:.::::... ::..: : . :::: :.:::: ::.
CCDS50 TVAVIIPFRHREHHLRYWLHYLHPILRRQRLRYGVYVINQHGEDTFNRAKLLNVGFLEAL
150 160 170 180 190 200
230 240 250 260 270 280
pF1KB9 K-DLDWDCLIFHDVDHIPESDRNYYGCGQMPRHFATKLDKYMYLLPYTEFFGGVSGLTVE
: : .::.:: ::: .: .::: : ::..::::: .::. . :::. .:::::::.
CCDS50 KEDAAYDCFIFSDVDLVPMDDRNLYRCGDQPRHFAIAMDKFGFRLPYAGYFGGVSGLSKA
210 220 230 240 250 260
290 300 310 320 330
pF1KB9 QFRKINGFPNAFWGWGGEDDDLWNRVQNAGYSVSRPEGDTGKYKSIPH----HHRGEVQF
:: .:::::: .:::::::::..::.. .:...:::. :.:. : : :.. . :
CCDS50 QFLRINGFPNEYWGWGGEDDDIFNRISLTGMKISRPDIRIGRYRMIKHDRDKHNEPNPQ-
270 280 290 300 310 320
340 350 360 370 380
pF1KB9 LGRYALLRKSKERQGLDGLNNLNY-FANITYDALYKNITVNLTPELAQVNEY
:.. ....: . ::.... : ... . :. ::::..
CCDS50 --RFTKIQNTKLTMKRDGIGSVRYQVLEVSRQPLFTNITVDIGRPPSWPPRG
330 340 350 360 370
>>CCDS55596.1 B4GALT2 gene_id:8704|Hs108|chr1 (401 aa)
initn: 711 init1: 437 opt: 811 Z-score: 1039.0 bits: 201.1 E(32554): 1.5e-51
Smith-Waterman score: 811; 39.7% identity (69.2% similar) in 312 aa overlap (74-378:87-391)
50 60 70 80 90 100
pF1KB9 FMMQAQGILIRDNVRTIGAQVYEQVLRSAYAKRNSSVNDSDYPLDLNHSETFLQTTTFLP
:. .:: .. . : : . .. . ::
CCDS55 VILYFDVYAQHLAFFSRFSARGPAHALHPAASSSSSSSNCSRPNATASSSGLPEVPSALP
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB9 EDFTYFANHTCPERLPSMKGPIDINM-SEIGMDYIHELFSKDPTIKLGGHWKPSDCMPRW
: . ::. :.. : . :.. : . .. ... ..: . .::.. : :: :
CCDS55 GP-TAPTLPPCPDSPPGLVGRLLIEFTSPMPLERVQR---ENPGVLMGGRYTPPDCTPAQ
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 KVAILIPFRNRHEHLPVLFRHLLPMLQRQRLQFAFYVVEQVGTQPFNRAMLFNVGFQEAM
::..::::.:..:: ...: :.:.::::... ::..: : . :::: :.:::: ::.
CCDS55 TVAVIIPFRHREHHLRYWLHYLHPILRRQRLRYGVYVINQHGEDTFNRAKLLNVGFLEAL
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB9 K-DLDWDCLIFHDVDHIPESDRNYYGCGQMPRHFATKLDKYMYLLPYTEFFGGVSGLTVE
: : .::.:: ::: .: .::: : ::..::::: .::. . :::. .:::::::.
CCDS55 KEDAAYDCFIFSDVDLVPMDDRNLYRCGDQPRHFAIAMDKFGFRLPYAGYFGGVSGLSKA
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330
pF1KB9 QFRKINGFPNAFWGWGGEDDDLWNRVQNAGYSVSRPEGDTGKYKSIPH----HHRGEVQF
:: .:::::: .:::::::::..::.. .:...:::. :.:. : : :.. . :
CCDS55 QFLRINGFPNEYWGWGGEDDDIFNRISLTGMKISRPDIRIGRYRMIKHDRDKHNEPNPQ-
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380
pF1KB9 LGRYALLRKSKERQGLDGLNNLNY-FANITYDALYKNITVNLTPELAQVNEY
:.. ....: . ::.... : ... . :. ::::..
CCDS55 --RFTKIQNTKLTMKRDGIGSVRYQVLEVSRQPLFTNITVDIGRPPSWPPRG
360 370 380 390 400
>>CCDS2986.1 B4GALT4 gene_id:8702|Hs108|chr3 (344 aa)
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..: .. : ...:..: .::::.: :::..:: :..:: :.::::.:....::..:
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: : :. .::::..:. ::: :.::: : .:::::::::: ::. ...::: ..:
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:: . : . .:. :. ::.. .. :::.. .: .... .. :: ::::..
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CCDS29 GA
>>CCDS4429.1 B4GALT7 gene_id:11285|Hs108|chr5 (327 aa)
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:. .:.:.... .::..:: :::: :.:::: :. .. :. . .:::: .: .
CCDS44 PHMRRFLSRKKIRHHIYVLNQVDHFRFNRAALINVGFLESSNSTDY--IAMHDVDLLPLN
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]