FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB9400, 841 aa 1>>>pF1KB9400 841 - 841 aa - 841 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4622+/-0.000455; mu= 20.9166+/- 0.028 mean_var=97.1203+/-21.128, 0's: 0 Z-trim(111.4): 115 B-trim: 0 in 0/49 Lambda= 0.130142 statistics sampled from 19912 (20030) to 19912 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.578), E-opt: 0.2 (0.235), width: 16 Scan time: 11.180 The best scores are: opt bits E(85289) NP_619642 (OMIM: 606225) taste receptor type 1 mem ( 841) 5767 1094.3 0 XP_016857891 (OMIM: 606225) PREDICTED: taste recep ( 843) 5318 1010.0 0 XP_011540505 (OMIM: 606225) PREDICTED: taste recep ( 763) 5200 987.8 0 XP_011540508 (OMIM: 606225) PREDICTED: taste recep ( 580) 3209 613.9 6.7e-175 NP_803884 (OMIM: 606225) taste receptor type 1 mem ( 587) 2929 561.3 4.5e-159 XP_016857892 (OMIM: 606225) PREDICTED: taste recep ( 589) 2929 561.3 4.5e-159 NP_689418 (OMIM: 606226) taste receptor type 1 mem ( 839) 1841 357.2 1.8e-97 NP_689414 (OMIM: 605865) taste receptor type 1 mem ( 852) 1553 303.1 3.5e-81 XP_016861760 (OMIM: 604099) PREDICTED: metabotropi ( 872) 867 174.3 2.1e-42 NP_000830 (OMIM: 604099) metabotropic glutamate re ( 872) 867 174.3 2.1e-42 XP_005247894 (OMIM: 145980,239200,601198,601199,61 ( 917) 771 156.3 5.8e-37 NP_000379 (OMIM: 145980,239200,601198,601199,61289 (1078) 705 144.0 3.5e-33 XP_006713852 (OMIM: 145980,239200,601198,601199,61 (1078) 705 144.0 3.5e-33 XP_016862813 (OMIM: 145980,239200,601198,601199,61 (1078) 705 144.0 3.5e-33 XP_016862814 (OMIM: 145980,239200,601198,601199,61 (1078) 705 144.0 3.5e-33 NP_001171536 (OMIM: 145980,239200,601198,601199,61 (1088) 705 144.0 3.5e-33 XP_011531940 (OMIM: 604099) PREDICTED: metabotropi ( 678) 671 137.4 2.1e-31 XP_011531939 (OMIM: 604099) PREDICTED: metabotropi ( 678) 671 137.4 2.1e-31 XP_011531943 (OMIM: 604099) PREDICTED: metabotropi ( 678) 671 137.4 2.1e-31 XP_011531941 (OMIM: 604099) PREDICTED: metabotropi ( 678) 671 137.4 2.1e-31 XP_011531942 (OMIM: 604099) PREDICTED: metabotropi ( 678) 671 137.4 2.1e-31 XP_016865965 (OMIM: 613572) PREDICTED: G-protein c ( 558) 643 132.1 7e-30 NP_001273284 (OMIM: 613572) G-protein coupled rece ( 855) 643 132.3 9.4e-30 NP_683766 (OMIM: 613572) G-protein coupled recepto ( 926) 643 132.3 1e-29 XP_016866277 (OMIM: 604473,614831) PREDICTED: meta ( 785) 612 126.4 5e-28 NP_000831 (OMIM: 601115) metabotropic glutamate re ( 879) 606 125.3 1.2e-27 XP_016865964 (OMIM: 613572) PREDICTED: G-protein c ( 879) 595 123.3 5e-27 NP_001269776 (OMIM: 604100) metabotropic glutamate ( 604) 578 119.9 3.5e-26 XP_011531938 (OMIM: 604099) PREDICTED: metabotropi ( 690) 525 110.0 3.8e-23 NP_001273283 (OMIM: 613572) G-protein coupled rece ( 751) 507 106.7 4.2e-22 XP_011531948 (OMIM: 604099) PREDICTED: metabotropi ( 494) 499 105.0 8.8e-22 XP_016867569 (OMIM: 601116) PREDICTED: metabotropi ( 629) 496 104.5 1.5e-21 XP_011514405 (OMIM: 601116) PREDICTED: metabotropi ( 629) 496 104.5 1.5e-21 XP_011514404 (OMIM: 601116) PREDICTED: metabotropi ( 703) 496 104.6 1.7e-21 XP_016867565 (OMIM: 601116) PREDICTED: metabotropi ( 703) 496 104.6 1.7e-21 XP_016867567 (OMIM: 601116) PREDICTED: metabotropi ( 703) 496 104.6 1.7e-21 XP_016867568 (OMIM: 601116) PREDICTED: metabotropi ( 703) 496 104.6 1.7e-21 XP_016867564 (OMIM: 601116) PREDICTED: metabotropi ( 703) 496 104.6 1.7e-21 XP_011514403 (OMIM: 601116) PREDICTED: metabotropi ( 703) 496 104.6 1.7e-21 XP_016867566 (OMIM: 601116) PREDICTED: metabotropi ( 703) 496 104.6 1.7e-21 XP_011514397 (OMIM: 601116) PREDICTED: metabotropi ( 714) 496 104.6 1.7e-21 XP_011514410 (OMIM: 601116) PREDICTED: metabotropi ( 552) 490 103.3 3.1e-21 XP_016857925 (OMIM: 605865) PREDICTED: taste recep ( 893) 482 102.0 1.2e-20 XP_016857924 (OMIM: 605865) PREDICTED: taste recep ( 894) 482 102.0 1.2e-20 XP_011531947 (OMIM: 604099) PREDICTED: metabotropi ( 403) 439 93.6 1.9e-18 XP_011531946 (OMIM: 604099) PREDICTED: metabotropi ( 403) 439 93.6 1.9e-18 XP_011531945 (OMIM: 604099) PREDICTED: metabotropi ( 440) 439 93.7 2e-18 XP_011531949 (OMIM: 604099) PREDICTED: metabotropi ( 459) 439 93.7 2.1e-18 NP_001243740 (OMIM: 604100) metabotropic glutamate ( 865) 432 92.6 8e-18 XP_016866280 (OMIM: 604100) PREDICTED: metabotropi ( 912) 432 92.7 8.3e-18 >>NP_619642 (OMIM: 606225) taste receptor type 1 member (841 aa) initn: 5767 init1: 5767 opt: 5767 Z-score: 5854.6 bits: 1094.3 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 5767; 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XP_011 IQWHGKDNQVPKSVCSSDCLEGHQRVVTGFHHCCFECVPCGAGTFLNKSATW-VRTCQRT 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KB9 EWAPEGSQT-CFPRTVVFLALREHTSWVLLAANTLLLLLLLGTAGLFAWHLDTPVVRSAG :. : . : XP_011 TTRPNVSPSACSSTSCPGSPSSPRPASTTASTCLRPT 550 560 570 580 >>NP_803884 (OMIM: 606225) taste receptor type 1 member (587 aa) initn: 4048 init1: 2929 opt: 2929 Z-score: 2976.8 bits: 561.3 E(85289): 4.5e-159 Smith-Waterman score: 3542; 69.8% identity (69.8% similar) in 841 aa overlap (1-841:1-587) 10 20 30 40 50 60 pF1KB9 MLLCTARLVGLQLLISCCWAFACHSTESSPDFTLPGDYLLAGLFPLHSGCLQVRHRPEVT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_803 MLLCTARLVGLQLLISCCWAFACHSTESSPDFTLPGDYLLAGLFPLHSGCLQVRHRPEVT 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB9 LCDRSCSFNEHGYHLFQAMRLGVEEINNSTALLPNITLGYQLYDVCSDSANVYATLRVLS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_803 LCDRSCSFNEHGYHLFQAMRLGVEEINNSTALLPNITLGYQLYDVCSDSANVYATLRVLS 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB9 LPGQHHIELQGDLLHYSPTVLAVIGPDSTNRAATTAALLSPFLVPMISYAASSETLSVKR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_803 LPGQHHIELQGDLLHYSPTVLAVIGPDSTNRAATTAALLSPFLVPM-------------- 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 pF1KB9 QYPSFLRTIPNDKYQVETMVLLLQKFGWTWISLVGSSDDYGQLGVQALENQATGQGICIA NP_803 ------------------------------------------------------------ 250 260 270 280 290 300 pF1KB9 FKDIMPFSAQVGDERMQCLMRHLAQAGATVVVVFSSRQLARVFFESVVLTNLTGKVWVAS NP_803 ------------------------------------------------------------ 310 320 330 340 350 360 pF1KB9 EAWALSRHITGVPGIQRIGMVLGVAIQKRAVPGLKAFEEAYARADKEAPRPCHKGSWCSS NP_803 ------------------------------------------------------------ 370 380 390 400 410 420 pF1KB9 NQLCRECQAFMAHTMPKLKAFSMSSAYNAYRAVYAVAHGLHQLLGCASGACSRGRVYPWQ NP_803 ------------------------------------------------------------ 430 440 450 460 470 480 pF1KB9 LLEQIHKVHFLLHKDTVAFNDNRDPLSSYNIIAWDWNGPKWTFTVLGSSTWSPVQLNINE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_803 LLEQIHKVHFLLHKDTVAFNDNRDPLSSYNIIAWDWNGPKWTFTVLGSSTWSPVQLNINE 170 180 190 200 210 220 490 500 510 520 530 540 pF1KB9 TKIQWHGKDNQVPKSVCSSDCLEGHQRVVTGFHHCCFECVPCGAGTFLNKSDLYRCQPCG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_803 TKIQWHGKDNQVPKSVCSSDCLEGHQRVVTGFHHCCFECVPCGAGTFLNKSDLYRCQPCG 230 240 250 260 270 280 550 560 570 580 590 600 pF1KB9 KEEWAPEGSQTCFPRTVVFLALREHTSWVLLAANTLLLLLLLGTAGLFAWHLDTPVVRSA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_803 KEEWAPEGSQTCFPRTVVFLALREHTSWVLLAANTLLLLLLLGTAGLFAWHLDTPVVRSA 290 300 310 320 330 340 610 620 630 640 650 660 pF1KB9 GGRLCFLMLGSLAAGSGSLYGFFGEPTRPACLLRQALFALGFTIFLSCLTVRSFQLIIIF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_803 GGRLCFLMLGSLAAGSGSLYGFFGEPTRPACLLRQALFALGFTIFLSCLTVRSFQLIIIF 350 360 370 380 390 400 670 680 690 700 710 720 pF1KB9 KFSTKVPTFYHAWVQNHGAGLFVMISSAAQLLICLTWLVVWTPLPAREYQRFPHLVMLEC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_803 KFSTKVPTFYHAWVQNHGAGLFVMISSAAQLLICLTWLVVWTPLPAREYQRFPHLVMLEC 410 420 430 440 450 460 730 740 750 760 770 780 pF1KB9 TETNSLGFILAFLYNGLLSISAFACSYLGKDLPENYNEAKCVTFSLLFNFVSWIAFFTTA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_803 TETNSLGFILAFLYNGLLSISAFACSYLGKDLPENYNEAKCVTFSLLFNFVSWIAFFTTA 470 480 490 500 510 520 790 800 810 820 830 840 pF1KB9 SVYDGKYLPAANMMAGLSSLSSGFGGYFLPKCYVILCRPDLNSTEHFQASIQDYTRRCGS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_803 SVYDGKYLPAANMMAGLSSLSSGFGGYFLPKCYVILCRPDLNSTEHFQASIQDYTRRCGS 530 540 550 560 570 580 pF1KB9 T : NP_803 T >>XP_016857892 (OMIM: 606225) PREDICTED: taste receptor (589 aa) initn: 2929 init1: 2929 opt: 2929 Z-score: 2976.8 bits: 561.3 E(85289): 4.5e-159 Smith-Waterman score: 3093; 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NP_689 IAFQETLPTLQPNQNMTSEERQRLVTIVDKLQQSTARVVVVFSPDLTLYHFFNEVLRQNF 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB9 TGKVWVASEAWALSRHITGVPGIQRIGMVLGVAIQKRAVPGLKAFEEAYARADKEAPRPC :: ::.:::.::.. . .. ....: ::..::. .::.. :.: .: .: : NP_689 TGAVWIASESWAIDPVLHNLTELRHLGTFLGITIQSVPIPGFSEFREWGPQA---GPPPL 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KB9 HKGSWC-SSNQLCRECQAFMAHTMPKLKAFSMSSAYNAYRAVYAVAHGLHQLLGCASGAC . : . :: : .: :. . .:..: :::::::.::.:::: ...: NP_689 SRTSQSYTCNQECDNCLNATLSFNTILRLSGERVVYSVYSAVYAVAHALHSLLGCDKSTC 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KB9 SRGRVYPWQLLEQIHKVHFLLHKDTVAFNDNRDPLSSYNIIAWDWNGPKWTFTVLGSSTW .. ::::::::.: ::.: : . :. . : .:. :.:. . : ..: . NP_689 TKRVVYPWQLLEEIWKVNFTLLDHQIFFDPQGDVALHLEIVQWQWDRSQNPFQSVAS--Y 420 430 440 450 460 480 490 500 510 520 530 pF1KB9 SPVQLNINETK-IQWHGKDNQVPKSVCSSDCLEGHQRVVTGFHHCCFECVPCGAGTFLNK :.: .... . :.:: .: .: :.::. : :... .:.: :::::. : :::::. NP_689 YPLQRQLKNIQDISWHTINNTIPMSMCSKRCQSGQKKKPVGIHVCCFECIDCLPGTFLNH 470 480 490 500 510 520 540 550 560 570 580 pF1KB9 S-DLYRCQPCGKEEWAPEGSQTCFPRTVVFLALREHTSWVLLAANTLLLLLLLGTAGLFA . : :.:: : ..::. .. .:: : .::: .: . .. .: .: :. .: NP_689 TEDEYECQACPNNEWSYQSETSCFKRQLVFLEWHEAPTIAVALLAALGFLSTLAILVIFW 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 pF1KB9 WHLDTPVVRSAGGRLCFLMLGSLAAGSGSLYGFFGEPTRPACLLRQALFALGFTIFLSCL :..::.:::::: .::::: : .. . . : : .:: ::::: : ::: .::. NP_689 RHFQTPIVRSAGGPMCFLMLTLLLVAYMVVPVYVGPPKVSTCLCRQALFPLCFTICISCI 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 pF1KB9 TVRSFQLIIIFKFSTKVPTFYHAWVQNHGAGLFVMISSAAQLLICLTWLVVWTPLPA-RE .:::::.. ::.... : : ::. .: . . . .. ...: . ... :. : NP_689 AVRSFQIVCAFKMASRFPRAYSYWVRYQGPYVSMAFITVLKMVIVVIGMLATGLSPTTRT 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 pF1KB9 YQRFPHLVMLECTET--NSLGFILAFLYNGLLSISAFACSYLGKDLPENYNEAKCVTFSL :..... :. . ::: : .. . :::. .:. .:.::.:: :::::: .:.:. NP_689 DPDDPKITIVSCNPNYRNSLLFNTSL--DLLLSVVGFSFAYMGKELPTNYNEAKFITLSM 710 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 pF1KB9 LFNFVSWIAFFTTASVYDGKYLPAANMMAGLSSLSSGFGGYFLPKCYVILCRPDLNSTEH : :.: ... : :.:.: . ..... . .: . ::: ::::.:: :. :. . NP_689 TFYFTSSVSLCTFMSAYSGVLVTIVDLLVTVLNLLAISLGYFGPKCYMILFYPERNTPAY 770 780 790 800 810 820 830 840 pF1KB9 FQASIQDYTRRCGST :.. :: :: : NP_689 FNSMIQGYTMRRD 830 >>NP_689414 (OMIM: 605865) taste receptor type 1 member (852 aa) initn: 1493 init1: 687 opt: 1553 Z-score: 1578.5 bits: 303.1 E(85289): 3.5e-81 Smith-Waterman score: 1558; 32.8% identity (62.7% similar) in 848 aa overlap (8-827:1-829) 10 20 30 40 50 pF1KB9 MLLCTARLVGLQLLISCCWAFACHSTESSP-----DFTLPGDYLLAGLFPL---HSGCLQ ..: .: ::. : ..: .. . :::.:.::::: . . :. NP_689 MLGPAVLGLSLWALL-HPGTGAPLCLSQQLRMKGDYVLGGLFPLGEAEEAGLR 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB9 VRHRPEVTLCDRSCSFNEHGYHLFQAMRLGVEEINNSTALLPNITLGYQLYDVCSDSA-N : :: .: : :. .: ::...::::::.. :::.. :::.:.:.::. . 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