FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9403, 1272 aa
1>>>pF1KB9403 1272 - 1272 aa - 1272 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.0492+/-0.00103; mu= -6.7884+/- 0.062
mean_var=346.1402+/-72.202, 0's: 0 Z-trim(114.8): 35 B-trim: 416 in 1/54
Lambda= 0.068936
statistics sampled from 15286 (15316) to 15286 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.757), E-opt: 0.2 (0.47), width: 16
Scan time: 4.870
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31434.1 PLEKHA7 gene_id:144100|Hs108|chr11 (1121) 7632 773.7 0
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CCDS8682.1 PLEKHA5 gene_id:54477|Hs108|chr12 (1116) 929 107.0 2.8e-22
CCDS58213.1 PLEKHA5 gene_id:54477|Hs108|chr12 (1282) 909 105.1 1.3e-21
CCDS1444.1 PLEKHA6 gene_id:22874|Hs108|chr1 (1048) 606 74.9 1.3e-12
CCDS58214.1 PLEKHA5 gene_id:54477|Hs108|chr12 (1098) 565 70.8 2.2e-11
>>CCDS31434.1 PLEKHA7 gene_id:144100|Hs108|chr11 (1121 aa)
initn: 6304 init1: 6304 opt: 7632 Z-score: 4116.2 bits: 773.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7632; 99.9% identity (99.9% similar) in 1120 aa overlap (1-1120:1-1119)
10 20 30 40 50 60
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CCDS31 MAAATVGRDTLPEHWSYGVCRDGRVFFINDQLRCTTWLHPRTGEPVNSGHMIRSDLPRGW
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 EEGFTEEGASYFIDHNQQTTAFRHPVTGQFSPENSEFILQEEPNPHMSKQDRNQRPSSMV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SETSTAGTASTLEAKPGPKIIKSSSKVHSFGKRDQAIRRNPNVPVVVRGWLHKQDSSGMR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LWKRRWFVLADYCLFYYKDSREEAVLGSIPLPSYVISPVAPEDRISRKYSFKAVHTGMRA
190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LIYNSSTAGSQAEQSGMRTYYFSADTQEDMNAWVRAMNQAAQVLSRSSLKRDMEKVERQA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
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CCDS31 VPQANHTESCHECGRVGPGHTRDCPHRGHDDIVNFERQEQEGEQYRSQRDPLEGKRDRSK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ARSPYSPAEEDALFMDLPTGPRGQQAQPQRAEKNGMLPASYGPGEQNGTGGYQRAFPPRT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 NPEKHSQRKSNLAQVEHWARAQKGDSRSLPLDQTLPRQGPGQSLSFPENYQTLPKSTRHP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 SGGSSPPPRNLPSDYKYAQDRASHLKMSSEERRAHRDGTVWQLYEWQQRQQFRHGSPTAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SGGSSPPPRNLPSDYKYAQDRASHLKMSSEERRAHRDGTVWQLYEWQQRQQFRHGSPTAP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ICLGSPEFTDQGRSRSMLEVPRSISVPPSPSDIPPPGPPRVFPPRRPHTPAERVTVKPPD
550 560 570 580 590 600
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pF1KB9 QRRSVDISLGDSPRRARGHAVKNSSHVDRRSMPSMGYMTHTVSAPSLHGKSADDTYLQLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 QRRSVDISLGDSPRRARGHAVKNSSHVDRRSMPSMGYMTHTVSAPSLHGKSADDTYLQLK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB9 KDLEYLDLKMTGRDLLKDRSLKPVKIAESDTDVKLSIFCEQDRVLQDLEDKIRALKENKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 KDLEYLDLKMTGRDLLKDRSLKPVKIAESDTDVKLSIFCEQDRVLQDLEDKIRALKENKD
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB9 QLESVLEVLHRQMEQYRDQPQHLEKIAYQQKLLQEDLVHIRAELSRESTEMENAWNEYLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 QLESVLEVLHRQMEQYRDQPQHLEKIAYQQKLLQEDLVHIRAELSRESTEMENAWNEYLK
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB9 LENDVEQLKQTLQEQHRRAFFFQEKSQIQKDLWRIEDVTAGLSANKENFRILVESVKNPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LENDVEQLKQTLQEQHRRAFFFQEKSQIQKDLWRIEDVTAGLSANKENFRILVESVKNPE
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB9 RKTVPLFPHPPVPSLSTSESKPPPQPSPPTSPVRTPLEVRLFPQLQTYVPYRPHPPQLRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 RKTVPLFPHPPVPSLSTSESKPPPQPSPPTSPVRTPLEVRLFPQLQTYVPYRPHPPQLRK
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB9 VTSPLQSPTKAKPKVQEDEAPPRPPLPELYSPEDQPPAVPPLPREATIIRHTSVRGLKRQ
::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VTSPLQSPTKAKPKV-EDEAPPRPPLPELYSPEDQPPAVPPLPREATIIRHTSVRGLKRQ
910 920 930 940 950
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB9 SDERKRDRELGQCVNGDSRVELRSYVSEPELATLSGDMAQPSLGLVGPESRYQTLPGRGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SDERKRDRELGQCVNGDSRVELRSYVSEPELATLSGDMAQPSLGLVGPESRYQTLPGRGL
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1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB9 SGSTSRLQQSSTIAPYVTLRRGLNAESSKATFPRPKSALERLYSGDHQRGKMSAEEQLER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SGSTSRLQQSSTIAPYVTLRRGLNAESSKATFPRPKSALERLYSGDHQRGKMSAEEQLER
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB9 MKRHQKALVRERKRTLGQGERTGLPSSRYLSRPLPGDLGSWKREQDFDLQLLERVVQGEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MKRHQKALVRERKRTLGQGERTGLPSSRYLSRPLPGDLGSVC
1080 1090 1100 1110 1120
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KB9 KDKEENGWLKVQAMPVTELDLEPQDYDLDISRELSKPEKVSIPERYVELDPEEPPSLEEL
>>CCDS44840.2 PLEKHA5 gene_id:54477|Hs108|chr12 (1174 aa)
initn: 1494 init1: 481 opt: 1231 Z-score: 675.4 bits: 137.1 E(32554): 2.7e-31
Smith-Waterman score: 1650; 31.3% identity (56.0% similar) in 1338 aa overlap (10-1270:11-1148)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MAAATVGRDTLPEHWSYGVCRDGRVFFINDQLRCTTWLHPRTGEPVNSGHMIRS-DLPR
.::. :.::. : :::::::.. . :::::: ::: : .:: .: :::
CCDS44 MAADLNLEWISLPRSWTYGITRGGRVFFINEEAKSTTWLHPVTGEAVVTGHRRQSTDLPT
10 20 30 40 50 60
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pF1KB9 GWEEGFTEEGASYFIDHNQQTTAFRHPVTGQFSPENSEFILQEEPNPHMSKQDRNQRPSS
::::..: ::: :.:.::.. .. .:::::: : .: :...:. :.......:: :
CCDS44 GWEEAYTFEGARYYINHNERKVTCKHPVTGQPSQDNCIFVVNEQTVATMTSEEKKERPIS
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 MVSETSTAGTASTLEAKP-GP--KIIKSSSKVHSFGKRDQAIRRNPNVPVVVRGWLHKQD
:..:.:. ...: ..: .: . ..:.:::.::::...:.::::.::: ::::.:::
CCDS44 MINEASNYNVTSDYAVHPMSPVGRTSRASKKVHNFGKRSNSIKRNPNAPVVRRGWLYKQD
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 SSGMRLWKRRWFVLADYCLFYYKDSREEAVLGSIPLPSYVISPVAPEDRISRKYSFKAVH
:.::.:::.:::::.: :::::.: .::..:::: :::. :. .. ::.:.:::.:::.:
CCDS44 STGMKLWKKRWFVLSDLCLFYYRDEKEEGILGSILLPSFQIALLTSEDHINRKYAFKAAH
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 TGMRALIYNSSTAGSQAEQSGMRTYYFSADTQEDMNAWVRAMNQAAQVLSRSSLKRDMEK
.:: :::: .:: ..:. :..:: .:: : .. .:: ..:
CCDS44 PNMR-------------------TYYFCTDTGKEMELWMKAMLDAALVQTEP-VKR-VDK
250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 VERQAVPQANHTESCHECGRVGPGHTRDCPHRGHDDIVNFERQEQEGEQYRSQRDPLEGK
. . .: . .. .. . : . .. . : :.. :.:.: :.: :.
CCDS44 ITSENAPTKETNNIPNHRVLIKPEIQNNQKNKEMSKIE--EKKALEAEKYGFQKD---GQ
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400
pF1KB9 RDRSKARSPYSPAEEDALFMDLPTGPRGQQAQPQRAEKNGMLPASYGPGEQ--------N
:: : . . : .::. .. .: : :. . : . . .:. .
CCDS44 -DR-----PLTKINSVKL-NSLPSEYESGSACP--AQTVHYRPINLSSSENKIVNVSLAD
340 350 360 370 380
410 420 430 440 450 460
pF1KB9 GTGGYQRAFPP-RTNPEKHSQRKSNLAQVEHWARAQKG-----DSRSLPLDQTLPRQGPG
:: . : :. .. :: ... :.:.: . ::: ..:.. :::::. :.
CCDS44 LRGGNRPNTGPLYTEADRVIQRTNSMQQLEQWIKIQKGRGHEEETRGVISYQTLPRNMPS
390 400 410 420 430 440
470 480 490 500 510
pF1KB9 QSLS----FPENYQTLPKSTRHPSGGSSPPPRNLPSDYKYAQDRASHLKMSSEE-RRAHR
. . .::.:.:::.... :... : ..:.. : ..:: ::. :
CCDS44 HRAQIMARYPEGYRTLPRNSK-------TRPESICSVTPSTHDKT--LGPGAEEKRRSMR
450 460 470 480 490
520 530 540 550 560 570
pF1KB9 DGTVWQLYEWQQRQQFRHGSPTAP--ICLGSPEFTDQGRSRSMLEVPRSISVPPSPSDIP
: :.:::::::::: : . . : : :.::. . ...: .: : :: ..:
CCDS44 DDTMWQLYEWQQRQ-FYNKQSTLPRHSTLSSPKTMVNISDQTMHSIPTS----PSHGSI-
500 510 520 530 540 550
580 590 600 610 620 630
pF1KB9 PPGPPRVFPPRRPHTPAERVTVKPPDQRRSVDISLGDSPRRARGHAVKNSSHVDRRSMPS
. . . :.: . : :. : :: .: :. :: :.: :. ::::.:.
CCDS44 --AAYQGYSPQRTY----RSEVSSPIQRGDVTID-----RRHRAHHPKHVYVPDRRSVPA
560 570 580 590
640 650 660 670
pF1KB9 MGYMTHTVSAPSLHGKSADDTYLQLKK------DL---------EYLDLKMTGRD-----
: ..:: ::.::. .. : : : .: . ..::. ...
CCDS44 -GLTLQSVSPQSLQGKTPEELTLLLIKLRRQQAELSSIREHTLAQLMQLKLEAHSPKNEI
600 610 620 630 640 650
680 690 700 710
pF1KB9 ---------------LLKDR---SLKPVKIAESDTDVKLSIFCEQDRVLQDLEDKIRALK
: .:. .: . : : :.::: .::::.:.. ::.:.. :.
CCDS44 LSHHLQRNTIYLDHQLSQDEGRGTLYKYRPEEVDIDAKLSRLCEQDKVVHALEEKLQQLH
660 670 680 690 700 710
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pF1KB9 ENKDQLESVLEVLHRQMEQYRDQPQHLEKIAYQQKLLQEDLVHIRAELSRESTEMENAWN
..: ::..: ...:.. :.: .. .. :. ::. :. :::: ..:.: ::
CCDS44 KEKYTLEQALLSASQEIEMHADNPAAIQTVVLQRDDLQNGLLSTCRELSRATAELERAWR
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820 830
pF1KB9 EYLKLENDVEQLKQTLQEQHRRAFFFQ------EKSQIQKDLWRIEDVTAGLSANKENFR
:: ::: :: .. .::: . : ...::::.::::.:: ::: .:.
CCDS44 EYDKLEYDVTVTRNQMQEQLDHLGEVQTESAGIQRAQIQKELWRIQDVMEGLSKHKQ---
780 790 800 810 820 830
840 850 860 870 880 890
pF1KB9 ILVESVKNPERKTVPLFPHPPVPSLSTSESKPPPQPSPPTSPVRTPLEVRLFPQLQTYVP
.: :. .. ::: : . :
CCDS44 ---------QRGTTE---------IGMIGSKP-------------------F----STVK
840 850
900 910 920 930 940 950
pF1KB9 YRPHPPQLRKVTSPLQSPTKAKPKVQEDEAPPRPPLPELYSPEDQPPAVPPLPREATIIR
:. . :. : ::. : : : : .
CCDS44 YKNEGPDYR-----------------------------LYKSE------PELTTVAEV--
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pF1KB9 HTSVRGLKRQSDERKRDRELGQCVNGDSRVELRSYVSEPELATLSGDMAQPSLGLVGPES
:: ::. . : ::: : ....: .. .:.: :..
CCDS44 -----------DES----------NGEEKSE---PVSEIETSVVKG--SHFPVGVVPPRA
880 890 900 910
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KB9 RYQTLPGRGLSGSTSRLQQSSTIAPYVTLRRGLNAESSKATFPRPKSALERLYSGDHQRG
. : : .::::: :::::. . . .. ::.::.:.: .. :
CCDS44 KSPT-P------------ESSTIASYVTLRKTKKMMDLRT--ERPRSAVEQLCLAESTRP
920 930 940 950
1080 1090 1100 1110 1120
pF1KB9 KMSAEEQLERMKRHQKALVRERKRTL---GQGERTGLPSSRYLSRPLPGDLGSWKREQDF
.:..:::.::..:::.: .::.:. : : .... : : : : : . .:..:
CCDS44 RMTVEEQMERIRRHQQACLREKKKGLNVIGASDQSPLQSPSNL-RDNPFRTTQTRRRDDK
960 970 980 990 1000 1010
1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KB9 DLQLLERVVQGEKKDKEENGWLKVQAMPVTEL-DLEPQDYDLDISRELSKPEKVSIPERY
.:. : . : :.: . : ...: . ::: ..:.:.::.: :..: :
CCDS44 ELDTAIRE-NDVKPDHE------TPATEIVQLKETEPQ--NVDFSKELKKTENISY-EML
1020 1030 1040 1050 1060
1190 1200 1210 1220 1230 1240
pF1KB9 VELDPEEPPSLEELQARYRKAEKIRNIL----ARSSMCNLQPTSGQDQNSVADLDLQLQE
: .:. :.: .. . : . ... ... : .: ..:. ..: :
CCDS44 FEPEPNGVNSVEMMDKERNKDKMPEDVTFSPQDETQTANHKPEEHPEENTKNSVD----E
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1250 1260 1270
pF1KB9 QERIINISYALASEASQRSKQVAAQAVTDP
::. . ::: . :.:. .. .:.....
CCDS44 QEETV-ISYESTPEVSRGNQTMAVKSLSPSPESSASPVPSTQPQLTEGSHFMCV
1130 1140 1150 1160 1170
>>CCDS8682.1 PLEKHA5 gene_id:54477|Hs108|chr12 (1116 aa)
initn: 1494 init1: 481 opt: 929 Z-score: 513.4 bits: 107.0 E(32554): 2.8e-22
Smith-Waterman score: 1679; 32.0% identity (56.6% similar) in 1300 aa overlap (10-1270:11-1090)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MAAATVGRDTLPEHWSYGVCRDGRVFFINDQLRCTTWLHPRTGEPVNSGHMIRS-DLPR
.::. :.::. : :::::::.. . :::::: ::: : .:: .: :::
CCDS86 MAADLNLEWISLPRSWTYGITRGGRVFFINEEAKSTTWLHPVTGEAVVTGHRRQSTDLPT
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 GWEEGFTEEGASYFIDHNQQTTAFRHPVTGQFSPENSEFILQEEPNPHMSKQDRNQRPSS
::::..: ::: :.:.::.. .. .:::::: : .: :...:. :.......:: :
CCDS86 GWEEAYTFEGARYYINHNERKVTCKHPVTGQPSQDNCIFVVNEQTVATMTSEEKKERPIS
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 MVSETSTAGTASTLEAKP-GP--KIIKSSSKVHSFGKRDQAIRRNPNVPVVVRGWLHKQD
:..:.:. ...: ..: .: . ..:.:::.::::...:.::::.::: ::::.:::
CCDS86 MINEASNYNVTSDYAVHPMSPVGRTSRASKKVHNFGKRSNSIKRNPNAPVVRRGWLYKQD
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 SSGMRLWKRRWFVLADYCLFYYKDSREEAVLGSIPLPSYVISPVAPEDRISRKYSFKAVH
:.::.:::.:::::.: :::::.: .::..:::: :::. :. .. ::.:.:::.:::.:
CCDS86 STGMKLWKKRWFVLSDLCLFYYRDEKEEGILGSILLPSFQIALLTSEDHINRKYAFKAAH
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 TGMRALIYNSSTAGSQAEQSGMRTYYFSADTQEDMNAWVRAMNQAAQVLSRSSLKRDMEK
.:: :::: .:: ..:. :..:: .:: : .. .:: ..:
CCDS86 PNMR-------------------TYYFCTDTGKEMELWMKAMLDAALVQTEP-VKR-VDK
250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 VERQAVPQANHTESCHECGRVGPGHTRDCPHRGHDDIVNFERQEQEGEQYRSQRDPLEGK
. . .: . .. .. . : . .. . : :.. :.:.: :.: :.
CCDS86 ITSENAPTKETNNIPNHRVLIKPEIQNNQKNKEMSKIE--EKKALEAEKYGFQKD---GQ
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400
pF1KB9 RDRSKARSPYSPAEEDALFMDLPTGPRGQQAQPQRAEKNGMLPASYGPGEQ--------N
:: : . . : .::. .. .: : :. . : . . .:. .
CCDS86 -DR-----PLTKINSVKL-NSLPSEYESGSACP--AQTVHYRPINLSSSENKIVNVSLAD
340 350 360 370 380
410 420 430 440 450 460
pF1KB9 GTGGYQRAFPP-RTNPEKHSQRKSNLAQVEHWARAQKG-----DSRSLPLDQTLPRQGPG
:: . : :. .. :: ... :.:.: . ::: ..:.. :::::. :.
CCDS86 LRGGNRPNTGPLYTEADRVIQRTNSMQQLEQWIKIQKGRGHEEETRGVISYQTLPRNMPS
390 400 410 420 430 440
470 480 490 500 510
pF1KB9 QSLS----FPENYQTLPKSTRHPSGGSSPPPRNLPSDYKYAQDRASHLKMSSEE-RRAHR
. . .::.:.:::.... :... : ..:.. : ..:: ::. :
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. . . :.: . : :. : :: .: :. :: :.: :. ::::.:.
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CCDS86 PSTQPQLTEGSHFMCV
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CCDS58 YESTPEVSRGNQTMAVKSLSPSPESSASPVPSTQPQLTEGSHFMCV
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CCDS14 QYYPPGVRPESICSMP-----------AYDRISPPWALEDKRHAFRNGGGPAYQLREWKE
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CCDS14 PASY--GRQDATVWIPSPSRQPVYYDELDAASSSLRRLSLQPRSHSVPRSPSQ-GSYSRA
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pF1KB9 HTVSAPSLHGKSADDTYLQLKKDLEYLDLKMTGRDLLKDRSLKPVKIAESDTDVKLSIFC
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CCDS14 RSISSPKV------PPYPEVFRD-----------------SLHTYKLNEQDTDKLLGKLC
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