Result of FASTA (ccds) for
pF1KB9404
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9404, 794 aa
1>>>pF1KB9404 794 - 794 aa - 794 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.1781+/-0.00108; mu= 6.8758+/- 0.064
mean_var=148.3515+/-30.927, 0's: 0 Z-trim(108.1): 132 B-trim: 43 in 1/50
Lambda= 0.105300
statistics sampled from 9864 (10006) to 9864 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.659), E-opt: 0.2 (0.307), width: 16
Scan time: 3.060
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS59214.1 ARHGAP12 gene_id:94134|Hs108|chr10 ( 794) 5284 815.2 0
CCDS73082.1 ARHGAP12 gene_id:94134|Hs108|chr10 ( 799) 5264 812.1 0
CCDS59216.1 ARHGAP12 gene_id:94134|Hs108|chr10 ( 841) 3170 494.0 4.1e-139
CCDS7170.1 ARHGAP12 gene_id:94134|Hs108|chr10 ( 846) 3157 492.1 1.6e-138
CCDS59215.1 ARHGAP12 gene_id:94134|Hs108|chr10 ( 816) 2533 397.3 5.4e-110
CCDS11498.1 ARHGAP27 gene_id:201176|Hs108|chr17 ( 548) 1376 221.4 3.1e-57
CCDS74082.1 ARHGAP27 gene_id:201176|Hs108|chr17 ( 889) 1376 221.5 4.8e-57
CCDS2184.1 ARHGAP15 gene_id:55843|Hs108|chr2 ( 475) 1023 167.8 3.9e-41
CCDS44928.1 ARHGAP9 gene_id:64333|Hs108|chr12 ( 547) 669 114.0 6.7e-25
CCDS44929.1 ARHGAP9 gene_id:64333|Hs108|chr12 ( 640) 669 114.0 7.7e-25
CCDS8941.2 ARHGAP9 gene_id:64333|Hs108|chr12 ( 731) 669 114.1 8.6e-25
CCDS7144.2 ARHGAP21 gene_id:57584|Hs108|chr10 (1958) 501 88.8 9.7e-17
CCDS56027.1 ARHGAP23 gene_id:57636|Hs108|chr17 (1491) 456 81.9 8.8e-15
CCDS54254.1 ARHGAP33 gene_id:115703|Hs108|chr19 (1123) 447 80.4 1.8e-14
CCDS12477.1 ARHGAP33 gene_id:115703|Hs108|chr19 (1126) 447 80.4 1.8e-14
CCDS47566.1 CHN2 gene_id:1124|Hs108|chr7 ( 332) 429 77.5 4.1e-14
CCDS1215.1 ARHGAP30 gene_id:257106|Hs108|chr1 ( 890) 435 78.6 5.1e-14
CCDS5420.1 CHN2 gene_id:1124|Hs108|chr7 ( 468) 429 77.5 5.6e-14
CCDS30918.1 ARHGAP30 gene_id:257106|Hs108|chr1 (1101) 435 78.6 6.2e-14
CCDS44769.1 ARHGAP32 gene_id:9743|Hs108|chr11 (2087) 439 79.3 7e-14
CCDS56147.1 CHN1 gene_id:1123|Hs108|chr2 ( 334) 420 76.1 1.1e-13
CCDS58497.1 ABR gene_id:29|Hs108|chr17 ( 310) 418 75.8 1.2e-13
CCDS46454.1 CHN1 gene_id:1123|Hs108|chr2 ( 433) 420 76.1 1.3e-13
CCDS46455.1 CHN1 gene_id:1123|Hs108|chr2 ( 459) 420 76.2 1.4e-13
CCDS73936.1 ABR gene_id:29|Hs108|chr17 ( 641) 421 76.4 1.7e-13
CCDS54060.1 ABR gene_id:29|Hs108|chr17 ( 813) 421 76.4 2.1e-13
CCDS11000.1 ABR gene_id:29|Hs108|chr17 ( 822) 421 76.4 2.1e-13
CCDS10999.1 ABR gene_id:29|Hs108|chr17 ( 859) 421 76.4 2.2e-13
CCDS13806.1 BCR gene_id:613|Hs108|chr22 (1271) 422 76.7 2.7e-13
CCDS46127.1 ARHGAP35 gene_id:2909|Hs108|chr19 (1499) 420 76.4 3.9e-13
CCDS13807.1 BCR gene_id:613|Hs108|chr22 (1227) 413 75.3 6.9e-13
CCDS31718.1 ARHGAP32 gene_id:9743|Hs108|chr11 (1738) 415 75.7 7.5e-13
CCDS81705.1 ARHGAP9 gene_id:64333|Hs108|chr12 ( 821) 390 71.7 5.5e-12
CCDS34075.1 ARHGAP10 gene_id:79658|Hs108|chr4 ( 786) 388 71.4 6.5e-12
CCDS78219.1 CHN2 gene_id:1124|Hs108|chr7 ( 274) 373 68.9 1.3e-11
CCDS14388.1 OPHN1 gene_id:4983|Hs108|chrX ( 802) 380 70.2 1.5e-11
CCDS43135.1 ARHGAP31 gene_id:57514|Hs108|chr3 (1444) 384 70.9 1.7e-11
CCDS47297.1 ARHGAP26 gene_id:23092|Hs108|chr5 ( 759) 364 67.7 7.9e-11
CCDS4277.1 ARHGAP26 gene_id:23092|Hs108|chr5 ( 814) 364 67.8 8.4e-11
>>CCDS59214.1 ARHGAP12 gene_id:94134|Hs108|chr10 (794 aa)
initn: 5284 init1: 5284 opt: 5284 Z-score: 4347.0 bits: 815.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5284; 100.0% identity (100.0% similar) in 794 aa overlap (1-794:1-794)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MKMADRSGKIIPGQVYIEVEYDYEYEAKDRKIVIKQGERYILVKKTNDDWWQVKPDENSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 MKMADRSGKIIPGQVYIEVEYDYEYEAKDRKIVIKQGERYILVKKTNDDWWQVKPDENSK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 AFYVPAQYVKEVTRKALMPPVKQVAGLPNNSTKIMQSLHLQRSTENVNKLPELSSFGKPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 AFYVPAQYVKEVTRKALMPPVKQVAGLPNNSTKIMQSLHLQRSTENVNKLPELSSFGKPS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 SSVQGTGLIRDANQNFGPSYNQGQTVNLSLDLTHNNGKFNNDSHSPKVSSQNRTRSFGHF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 SSVQGTGLIRDANQNFGPSYNQGQTVNLSLDLTHNNGKFNNDSHSPKVSSQNRTRSFGHF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 PGPEFLDVEKTSFSQEQSCDSAGEGSERIHQDSESGDELSSSSTEQIRATTPPNQGRPDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 PGPEFLDVEKTSFSQEQSCDSAGEGSERIHQDSESGDELSSSSTEQIRATTPPNQGRPDS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 PVYANLQELKISQSALPPLPGSPAIQINGEWETHKDSSGRCYYYNRGTQERTWKPPRWTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 PVYANLQELKISQSALPPLPGSPAIQINGEWETHKDSSGRCYYYNRGTQERTWKPPRWTR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 DASISKGDFQNPGDQEWLKHVDDQGRQYYYSADGSRSEWELPKYNASSQQQREIIKSRSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 DASISKGDFQNPGDQEWLKHVDDQGRQYYYSADGSRSEWELPKYNASSQQQREIIKSRSL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 DRRLQEPIVLTKWRHSTIVLDTNDKESPTASKPCFPENESSPSSPKHQDTDQEKYGLLNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 DRRLQEPIVLTKWRHSTIVLDTNDKESPTASKPCFPENESSPSSPKHQDTDQEKYGLLNV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 TKIAENGKKVRKNWLSSWAVLQGSSLLFTKTQGSSTSWFGSNQSKPEFTVDLKGATIEMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 TKIAENGKKVRKNWLSSWAVLQGSSLLFTKTQGSSTSWFGSNQSKPEFTVDLKGATIEMA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 SKDKSSKKNVFELKTRQGTELLIQSDNDTVINDWFKVLSSTINNQAVETDEGIEEEIPDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 SKDKSSKKNVFELKTRQGTELLIQSDNDTVINDWFKVLSSTINNQAVETDEGIEEEIPDS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB9 PGIEKHDKEKEQKDPKKLRSFKVSSIDSSEQKKTKKNLKKFLTRRPTLQAVREKGYIKDQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 PGIEKHDKEKEQKDPKKLRSFKVSSIDSSEQKKTKKNLKKFLTRRPTLQAVREKGYIKDQ
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB9 VFGSNLANLCQRENGTVPKFVKLCIEHVEEHGLDIDGIYRVSGNLAVIQKLRFAVNHDEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 VFGSNLANLCQRENGTVPKFVKLCIEHVEEHGLDIDGIYRVSGNLAVIQKLRFAVNHDEK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB9 LDLNDSKWEDIHVITGALKMFFRELPEPLFTFNHFNDFVNAIKQEPRQRVAAVKDLIRQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LDLNDSKWEDIHVITGALKMFFRELPEPLFTFNHFNDFVNAIKQEPRQRVAAVKDLIRQL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB9 PKPNQDTMQILFRHLRRVIENGEKNRMTYQSIAIVFGPTLLKPEKETGNIAVHTVYQNQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 PKPNQDTMQILFRHLRRVIENGEKNRMTYQSIAIVFGPTLLKPEKETGNIAVHTVYQNQI
730 740 750 760 770 780
790
pF1KB9 VELILLELSSIFGR
::::::::::::::
CCDS59 VELILLELSSIFGR
790
>>CCDS73082.1 ARHGAP12 gene_id:94134|Hs108|chr10 (799 aa)
initn: 5270 init1: 2792 opt: 5264 Z-score: 4330.5 bits: 812.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5264; 99.4% identity (99.4% similar) in 799 aa overlap (1-794:1-799)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MKMADRSGKIIPGQVYIEVEYDYEYEAKDRKIVIKQGERYILVKKTNDDWWQVKPDENSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 MKMADRSGKIIPGQVYIEVEYDYEYEAKDRKIVIKQGERYILVKKTNDDWWQVKPDENSK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 AFYVPAQYVKEVTRKALMPPVKQVAGLPNNSTKIMQSLHLQRSTENVNKLPELSSFGKPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 AFYVPAQYVKEVTRKALMPPVKQVAGLPNNSTKIMQSLHLQRSTENVNKLPELSSFGKPS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 SSVQGTGLIRDANQNFGPSYNQGQTVNLSLDLTHNNGKFNNDSHSPKVSSQNRTRSFGHF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 SSVQGTGLIRDANQNFGPSYNQGQTVNLSLDLTHNNGKFNNDSHSPKVSSQNRTRSFGHF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 PGPEFLDVEKTSFSQEQSCDSAGEGSERIHQDSESGDELSSSSTEQIRATTPPNQGRPDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 PGPEFLDVEKTSFSQEQSCDSAGEGSERIHQDSESGDELSSSSTEQIRATTPPNQGRPDS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 PVYANLQELKISQSALPPLPGSPAIQINGEWETHKDSSGRCYYYNRGTQERTWKPPRWTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 PVYANLQELKISQSALPPLPGSPAIQINGEWETHKDSSGRCYYYNRGTQERTWKPPRWTR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 DASISKGDFQNPGDQEWLKHVDDQGRQYYYSADGSRSEWELPKYNASSQQQREIIKSRSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 DASISKGDFQNPGDQEWLKHVDDQGRQYYYSADGSRSEWELPKYNASSQQQREIIKSRSL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KB9 DRRLQEPIVLTKWRHSTIVLDTNDKESPTASKPCFPENESSPSSPKHQDT-----DQEKY
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::
CCDS73 DRRLQEPIVLTKWRHSTIVLDTNDKESPTASKPCFPENESSPSSPKHQDTASSPKDQEKY
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KB9 GLLNVTKIAENGKKVRKNWLSSWAVLQGSSLLFTKTQGSSTSWFGSNQSKPEFTVDLKGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 GLLNVTKIAENGKKVRKNWLSSWAVLQGSSLLFTKTQGSSTSWFGSNQSKPEFTVDLKGA
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KB9 TIEMASKDKSSKKNVFELKTRQGTELLIQSDNDTVINDWFKVLSSTINNQAVETDEGIEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 TIEMASKDKSSKKNVFELKTRQGTELLIQSDNDTVINDWFKVLSSTINNQAVETDEGIEE
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KB9 EIPDSPGIEKHDKEKEQKDPKKLRSFKVSSIDSSEQKKTKKNLKKFLTRRPTLQAVREKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 EIPDSPGIEKHDKEKEQKDPKKLRSFKVSSIDSSEQKKTKKNLKKFLTRRPTLQAVREKG
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KB9 YIKDQVFGSNLANLCQRENGTVPKFVKLCIEHVEEHGLDIDGIYRVSGNLAVIQKLRFAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 YIKDQVFGSNLANLCQRENGTVPKFVKLCIEHVEEHGLDIDGIYRVSGNLAVIQKLRFAV
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700 710
pF1KB9 NHDEKLDLNDSKWEDIHVITGALKMFFRELPEPLFTFNHFNDFVNAIKQEPRQRVAAVKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 NHDEKLDLNDSKWEDIHVITGALKMFFRELPEPLFTFNHFNDFVNAIKQEPRQRVAAVKD
670 680 690 700 710 720
720 730 740 750 760 770
pF1KB9 LIRQLPKPNQDTMQILFRHLRRVIENGEKNRMTYQSIAIVFGPTLLKPEKETGNIAVHTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 LIRQLPKPNQDTMQILFRHLRRVIENGEKNRMTYQSIAIVFGPTLLKPEKETGNIAVHTV
730 740 750 760 770 780
780 790
pF1KB9 YQNQIVELILLELSSIFGR
:::::::::::::::::::
CCDS73 YQNQIVELILLELSSIFGR
790
>>CCDS59216.1 ARHGAP12 gene_id:94134|Hs108|chr10 (841 aa)
initn: 3145 init1: 3145 opt: 3170 Z-score: 2611.0 bits: 494.0 E(32554): 4.1e-139
Smith-Waterman score: 5081; 94.3% identity (94.3% similar) in 826 aa overlap (16-794:16-841)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MKMADRSGKIIPGQVYIEVEYDYEYEAKDRKIVIKQGERYILVKKTNDDWWQVKPDENSK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 MKMADRSGKIIPGQVYIEVEYDYEYEAKDRKIVIKQGERYILVKKTNDDWWQVKPDENSK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 AFYVPAQYVKEVTRKALMPPVKQVAGLPNNSTKIMQSLHLQRSTENVNKLPELSSFGKPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 AFYVPAQYVKEVTRKALMPPVKQVAGLPNNSTKIMQSLHLQRSTENVNKLPELSSFGKPS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 SSVQGTGLIRDANQNFGPSYNQGQTVNLSLDLTHNNGKFNNDSHSPKVSSQNRTRSFGHF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 SSVQGTGLIRDANQNFGPSYNQGQTVNLSLDLTHNNGKFNNDSHSPKVSSQNRTRSFGHF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 PGPEFLDVEKTSFSQEQSCDSAGEGSERIHQDSESGDELSSSSTEQIRATTPPNQGRPDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 PGPEFLDVEKTSFSQEQSCDSAGEGSERIHQDSESGDELSSSSTEQIRATTPPNQGRPDS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 PVYANLQELKISQSALPPLPGSPAIQINGEWETHKDSSGRCYYYNRGTQERTWKPPRWTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 PVYANLQELKISQSALPPLPGSPAIQINGEWETHKDSSGRCYYYNRGTQERTWKPPRWTR
250 260 270 280 290 300
310
pF1KB9 DASISKGDFQNPGDQE--------------------------------------------
::::::::::::::::
CCDS59 DASISKGDFQNPGDQELLSSEENYYSTSYSQSDSQCGSPPRGWSEELDERGHTLYTSDYT
310 320 330 340 350 360
320 330 340 350 360 370
pF1KB9 ---WLKHVDDQGRQYYYSADGSRSEWELPKYNASSQQQREIIKSRSLDRRLQEPIVLTKW
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 NEKWLKHVDDQGRQYYYSADGSRSEWELPKYNASSQQQREIIKSRSLDRRLQEPIVLTKW
370 380 390 400 410 420
380 390 400 410 420 430
pF1KB9 RHSTIVLDTNDKESPTASKPCFPENESSPSSPKHQDTDQEKYGLLNVTKIAENGKKVRKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 RHSTIVLDTNDKESPTASKPCFPENESSPSSPKHQDTDQEKYGLLNVTKIAENGKKVRKN
430 440 450 460 470 480
440 450 460 470 480 490
pF1KB9 WLSSWAVLQGSSLLFTKTQGSSTSWFGSNQSKPEFTVDLKGATIEMASKDKSSKKNVFEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 WLSSWAVLQGSSLLFTKTQGSSTSWFGSNQSKPEFTVDLKGATIEMASKDKSSKKNVFEL
490 500 510 520 530 540
500 510 520 530 540 550
pF1KB9 KTRQGTELLIQSDNDTVINDWFKVLSSTINNQAVETDEGIEEEIPDSPGIEKHDKEKEQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 KTRQGTELLIQSDNDTVINDWFKVLSSTINNQAVETDEGIEEEIPDSPGIEKHDKEKEQK
550 560 570 580 590 600
560 570 580 590 600 610
pF1KB9 DPKKLRSFKVSSIDSSEQKKTKKNLKKFLTRRPTLQAVREKGYIKDQVFGSNLANLCQRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 DPKKLRSFKVSSIDSSEQKKTKKNLKKFLTRRPTLQAVREKGYIKDQVFGSNLANLCQRE
610 620 630 640 650 660
620 630 640 650 660 670
pF1KB9 NGTVPKFVKLCIEHVEEHGLDIDGIYRVSGNLAVIQKLRFAVNHDEKLDLNDSKWEDIHV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 NGTVPKFVKLCIEHVEEHGLDIDGIYRVSGNLAVIQKLRFAVNHDEKLDLNDSKWEDIHV
670 680 690 700 710 720
680 690 700 710 720 730
pF1KB9 ITGALKMFFRELPEPLFTFNHFNDFVNAIKQEPRQRVAAVKDLIRQLPKPNQDTMQILFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 ITGALKMFFRELPEPLFTFNHFNDFVNAIKQEPRQRVAAVKDLIRQLPKPNQDTMQILFR
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740 750 760 770 780 790
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 HLRRVIENGEKNRMTYQSIAIVFGPTLLKPEKETGNIAVHTVYQNQIVELILLELSSIFG
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:
CCDS59 R
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 AFYVPAQYVKEVTRKALMPPVKQVAGLPNNSTKIMQSLHLQRSTENVNKLPELSSFGKPS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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CCDS71 PVYANLQELKISQSALPPLPGSPAIQINGEWETHKDSSGRCYYYNRGTQERTWKPPRWTR
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310
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CCDS71 DASISKGDFQNPGDQELLSSEENYYSTSYSQSDSQCGSPPRGWSEELDERGHTLYTSDYT
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 NEKWLKHVDDQGRQYYYSADGSRSEWELPKYNASSQQQREIIKSRSLDRRLQEPIVLTKW
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380 390 400 410 420
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::
CCDS71 RHSTIVLDTNDKESPTASKPCFPENESSPSSPKHQDTASSPKDQEKYGLLNVTKIAENGK
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430 440 450 460 470 480
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 KVRKNWLSSWAVLQGSSLLFTKTQGSSTSWFGSNQSKPEFTVDLKGATIEMASKDKSSKK
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490 500 510 520 530 540
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 NVFELKTRQGTELLIQSDNDTVINDWFKVLSSTINNQAVETDEGIEEEIPDSPGIEKHDK
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550 560 570 580 590 600
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 EKEQKDPKKLRSFKVSSIDSSEQKKTKKNLKKFLTRRPTLQAVREKGYIKDQVFGSNLAN
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610 620 630 640 650 660
pF1KB9 LCQRENGTVPKFVKLCIEHVEEHGLDIDGIYRVSGNLAVIQKLRFAVNHDEKLDLNDSKW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 LCQRENGTVPKFVKLCIEHVEEHGLDIDGIYRVSGNLAVIQKLRFAVNHDEKLDLNDSKW
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670 680 690 700 710 720
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 EDIHVITGALKMFFRELPEPLFTFNHFNDFVNAIKQEPRQRVAAVKDLIRQLPKPNQDTM
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730 740 750 760 770 780
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CCDS71 QILFRHLRRVIENGEKNRMTYQSIAIVFGPTLLKPEKETGNIAVHTVYQNQIVELILLEL
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790
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CCDS71 SSIFGR
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CCDS59 MKMADRSGKIIPGQVYIEVEYDYEYEAKDRKIVIKQGERYILVKKTNDDWWQVKPDENSK
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CCDS59 AFYVPAQYVKEVTRKALMPPVKQVAGLPNNSTKIMQSLHLQRSTENVNKLPELSSFGKPS
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CCDS59 PGPEFLDVEKTSFSQEQSCDSAGEGSERIHQDSESGDELSSSSTEQIRATTPPNQGRPDS
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CCDS59 PVYANLQELKISQSALPPLPGSPAIQINGEWETHKDSSGRCYYYNRGTQERTWKPPRWTR
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310
pF1KB9 DASISKGDFQNPGDQE--------------------------------------------
::::::::::::::::
CCDS59 DASISKGDFQNPGDQELLSSEENYYSTSYSQSDSQCGSPPRGWSEELDERGHTLYTSDYT
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320 330 340 350 360 370
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 NEKWLKHVDDQGRQYYYSADGSRSEWELPKYNASSQQQREIIKSRSLDRRLQEPIVLTKW
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380 390 400 410 420 430
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:::::::::::: :::::::::::::::::::::::
CCDS59 RHSTIVLDTNDK-------------------------DQEKYGLLNVTKIAENGKKVRKN
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440 450 460 470 480 490
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 WLSSWAVLQGSSLLFTKTQGSSTSWFGSNQSKPEFTVDLKGATIEMASKDKSSKKNVFEL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 KTRQGTELLIQSDNDTVINDWFKVLSSTINNQAVETDEGIEEEIPDSPGIEKHDKEKEQK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 DPKKLRSFKVSSIDSSEQKKTKKNLKKFLTRRPTLQAVREKGYIKDQVFGSNLANLCQRE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 NGTVPKFVKLCIEHVEEHGLDIDGIYRVSGNLAVIQKLRFAVNHDEKLDLNDSKWEDIHV
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pF1KB9 ITGALKMFFRELPEPLFTFNHFNDFVNAIKQEPRQRVAAVKDLIRQLPKPNQDTMQILFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 ITGALKMFFRELPEPLFTFNHFNDFVNAIKQEPRQRVAAVKDLIRQLPKPNQDTMQILFR
700 710 720 730 740 750
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pF1KB9 HLRRVIENGEKNRMTYQSIAIVFGPTLLKPEKETGNIAVHTVYQNQIVELILLELSSIFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 HLRRVIENGEKNRMTYQSIAIVFGPTLLKPEKETGNIAVHTVYQNQIVELILLELSSIFG
760 770 780 790 800 810
pF1KB9 R
:
CCDS59 R
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: :: :. .: .: . : :: :.. : .:. :.:. . : .::::
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: . ::. . :. :: . :: : : . :
CCDS11 -------QVPVPAPRSIHKSSQDG-------------DTPAQASPPEEKVPAELDEVGSW
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.: ::.. . .: :.:. :: :..::..:: .: .::.::.:. : : : :.:
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: : :. : ::.::.:.:::. : :::::.:::.::..:.:.: ::: :....:
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. : :.... :.. ..: : : : . :. .:::. . . .. .
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pF1KB9 SSEQKKTKKNLKKFLTRRPTLQAVREKGYIKDQVFGSNLANLCQRENGTVPKFVKLCIEH
:. .:....:.::: ::::::..:::::::::::: :: ::.:: . ::.::. ::.
CCDS11 ESDLSKVRHKLRKFLQRRPTLQSLREKGYIKDQVFGCALAALCERERSRVPRFVQQCIRA
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pF1KB9 VEEHGLDIDGIYRVSGNLAVIQKLRFAVNHDEKLDLNDSKWEDIHVITGALKMFFRELPE
:: .::::::.::.:::::.:::::. :.:::.:::.:..:::.::::::::.:::::::
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pF1KB9 PLFTFNHFNDFVNAIK-QEPRQRVAAVKDLIRQLPKPNQDTMQILFRHLRRVIENGEKNR
::: :.:: .:. ::: :. .: :.::.:.:: ::.::...::.:: ::::.::.::
CCDS11 PLFPFSHFRQFIAAIKLQDQARRSRCVRDLVRSLPAPNHDTLRMLFQHLCRVIEHGEQNR
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pF1KB9 MTYQSIAIVFGPTLLKPEKETGNIAVHTVYQNQIVELILLELSSIFGR
:. ::.:::::::::.:: : .. . :.:::.::::: . ..::
CCDS11 MSVQSVAIVFGPTLLRPEVEETSMPMTMVFQNQVVELILQQCADIFPPH
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pF1KB9 RATTPPNQGRPDSPVYANLQELKISQSALPPLPGSPAIQINGEWETH--KDSSGRCYYYN
: : .: . .. .: : . .
CCDS74 GETAWEDEAENEPEEELEMQPGLSPGSPGDPRPPTPETDYPESLTSYPEEDYSPVGSFGE
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pF1KB9 RGTQERTWKPPRWTRDASISKGD-FQNPGDQE-WLKHVDDQGRQYYYSADGSRSEWELPK
: :: :. .: .: . : :: :.. : .:. :.:. . : .::::
CCDS74 PGPTSPLTTPPGWSCHVSQDKQMLYTNHFTQEQWVRLEDPHGKPYFYNPEDSSVRWELP-
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pF1KB9 YNASSQQQREIIKSRSLDRRLQEPIVLTKWRHSTIVLDTNDKESPTASK-PC-FPE----
: . ::. . :. :: . :: : : . :
CCDS74 -------QVPVPAPRSIHKSSQDG-------------DTPAQASPPEEKVPAELDEVGSW
450 460 470 480
400 410 420 430 440 450
pF1KB9 NESSPSSPKHQDTDQEKYGLLNVTKIAENGKKVRK-NWLSSWAVLQGSSLLFTKTQGSST
.: ::.. . .: :.:. :: :..::..:: .: .::.::.:. : : : :.:
CCDS74 EEVSPATAAVRTKTLDKAGVLHRTKTADKGKRLRKKHWSASWTVLEGGVLTFFK--DSKT
490 500 510 520 530 540
460 470 480 490 500 510
pF1KB9 SWFG-----SNQSKPEFTVDLKGATIEMASKDKSSKKNVFELKTRQGTELLIQSDNDTVI
: : :. : ::.::.:.:::. : :::::.:::.::..:.:.: ::: :....:
CCDS74 SAAGGLRQPSKFSTPEYTVELRGATLSWAPKDKSSRKNVLELRSRDGSEYLIQHDSEAII
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pF1KB9 NDWFKVLSSTINNQAVETD-EGIEEEIPDSPGIEKHD--KEKEQKDPKKLRSFKVSSID-
. : :.... :.. ..: : : : . :. .:::. . . .. .
CCDS74 STWHKAIAQGIQELSAELPPEESESSRVDFGSSERLGSWQEKEEDARPNAAAPALGPVGL
610 620 630 640 650 660
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pF1KB9 SSEQKKTKKNLKKFLTRRPTLQAVREKGYIKDQVFGSNLANLCQRENGTVPKFVKLCIEH
:. .:....:.::: ::::::..:::::::::::: :: ::.:: . ::.::. ::.
CCDS74 ESDLSKVRHKLRKFLQRRPTLQSLREKGYIKDQVFGCALAALCERERSRVPRFVQQCIRA
670 680 690 700 710 720
630 640 650 660 670 680
pF1KB9 VEEHGLDIDGIYRVSGNLAVIQKLRFAVNHDEKLDLNDSKWEDIHVITGALKMFFRELPE
:: .::::::.::.:::::.:::::. :.:::.:::.:..:::.::::::::.:::::::
CCDS74 VEARGLDIDGLYRISGNLATIQKLRYKVDHDERLDLDDGRWEDVHVITGALKLFFRELPE
730 740 750 760 770 780
690 700 710 720 730 740
pF1KB9 PLFTFNHFNDFVNAIK-QEPRQRVAAVKDLIRQLPKPNQDTMQILFRHLRRVIENGEKNR
::: :.:: .:. ::: :. .: :.::.:.:: ::.::...::.:: ::::.::.::
CCDS74 PLFPFSHFRQFIAAIKLQDQARRSRCVRDLVRSLPAPNHDTLRMLFQHLCRVIEHGEQNR
790 800 810 820 830 840
750 760 770 780 790
pF1KB9 MTYQSIAIVFGPTLLKPEKETGNIAVHTVYQNQIVELILLELSSIFGR
:. ::.:::::::::.:: : .. . :.:::.::::: . ..::
CCDS74 MSVQSVAIVFGPTLLRPEVEETSMPMTMVFQNQVVELILQQCADIFPPH
850 860 870 880
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pF1KB9 NDKESPTASKPCFPENESSPSSPKHQDTDQEKYGLLNVTKIAENGKKVRKNWLSSWAVLQ
:: : :. .:::..:::.:::: .:: ::.
CCDS21 KVTEPISRHRRNHSQHILKDVIPPLEQLMVEKEGYLQKAKIADGGKKLRKNWSTSWIVLS
60 70 80 90 100 110
450 460 470 480 490 500
pF1KB9 GSSLLFTKTQGSSTSWFGSNQSKPEFTVDLKGATIEMASKDKSSKKNVFELKTRQGTELL
. . : : . ... .. ::: .::: :: :: : :.:::.::::.. : .:.:.:
CCDS21 SRRIEFYKESKQQALSNMKTGHKPE-SVDLCGAHIEWA-KEKSSRKNVFQITTVSGNEFL
120 130 140 150 160
510 520 530 540 550
pF1KB9 IQSDNDTVINDWFKVLSSTINNQAVETD---EGIEE-EIPDSPGIE---KHDKEKEQKDP
.::: : .: :::......:. ... ...: .: : . : ..:.. ... :
CCDS21 LQSDIDFIILDWFHAIKNAIDRLPKDSSCPSRNLELFKIQRSSSTELLSHYDSDIKEQKP
170 180 190 200 210 220
560 570 580 590 600 610
pF1KB9 KKLRS--FKV--SSIDSSEQKKTKKNLKKFLTRRPTLQAVREKGYIKDQVFGSNLANLCQ
.. .: :.. :. :.:.....:. ::::.::::.:....::: ::::.:::.: ..:.
CCDS21 EHRKSLMFRLHHSASDTSDKNRVKSRLKKFITRRPSLKTLQEKGLIKDQIFGSHLHKVCE
230 240 250 260 270 280
620 630 640 650 660 670
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:::.::: ::: ::: ::..:::.:::::::::::.:::::: ::..:::.:.::.::::
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::.:::::::::::::::: .. :..::.::: :. :. :::.:...:: ::.:::..
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:: :: ... .. :: :. ::..::::::::. :.::::.:.: ::::::.::.: : :.
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:::.:..::: :...:::.::::::::::::.::::: :....
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.:::....:.::::.:::::.:.::::.:: . : :. .: .: .. ...:
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: . : . : ... . .:.:..:..:::.:
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:: .. : .:. ..::: :. : . .:..:
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]