FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB9417, 885 aa 1>>>pF1KB9417 885 - 885 aa - 885 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.9433+/-0.000489; mu= -3.4529+/- 0.030 mean_var=672.5618+/-153.047, 0's: 0 Z-trim(120.4): 700 B-trim: 756 in 1/60 Lambda= 0.049455 statistics sampled from 34808 (35669) to 34808 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.729), E-opt: 0.2 (0.418), width: 16 Scan time: 13.790 The best scores are: opt bits E(85289) NP_001690 (OMIM: 109135) tyrosine-protein kinase r ( 885) 6126 453.7 1.8e-126 NP_001265528 (OMIM: 109135) tyrosine-protein kinas ( 626) 3114 238.6 7.2e-62 NP_068713 (OMIM: 109135) tyrosine-protein kinase r ( 894) 3114 238.8 8.8e-62 NP_001317193 (OMIM: 600341) tyrosine-protein kinas ( 845) 2244 176.7 4.1e-43 NP_006284 (OMIM: 600341) tyrosine-protein kinase r ( 890) 2244 176.7 4.2e-43 XP_016858653 (OMIM: 604705,613862) PREDICTED: tyro ( 936) 2129 168.6 1.3e-40 XP_011508792 (OMIM: 604705,613862) PREDICTED: tyro ( 936) 2129 168.6 1.3e-40 NP_006334 (OMIM: 604705,613862) tyrosine-protein k ( 999) 2129 168.6 1.3e-40 XP_016878032 (OMIM: 600341) PREDICTED: tyrosine-pr ( 771) 2059 163.4 3.7e-39 XP_005263622 (OMIM: 604705,613862) PREDICTED: tyro ( 832) 1977 157.6 2.2e-37 XP_016858654 (OMIM: 604705,613862) PREDICTED: tyro ( 594) 1661 134.9 1.1e-30 XP_005263625 (OMIM: 604705,613862) PREDICTED: tyro ( 733) 1381 115.0 1.3e-24 XP_011519819 (OMIM: 147370,270450) PREDICTED: insu ( 922) 794 73.3 6e-12 NP_001311331 (OMIM: 114550,164860,605074,607278,61 ( 960) 793 73.3 6.4e-12 XP_006716053 (OMIM: 114550,164860,605074,607278,61 ( 960) 793 73.3 6.4e-12 XP_011519818 (OMIM: 147370,270450) PREDICTED: insu (1064) 794 73.4 6.5e-12 XP_016877628 (OMIM: 147370,270450) PREDICTED: insu (1246) 794 73.5 7.1e-12 NP_001278787 (OMIM: 147370,270450) insulin-like gr (1366) 794 73.6 7.4e-12 NP_000866 (OMIM: 147370,270450) insulin-like growt (1367) 794 73.6 7.4e-12 XP_016877627 (OMIM: 147370,270450) PREDICTED: insu (1391) 794 73.6 7.5e-12 XP_016877626 (OMIM: 147370,270450) PREDICTED: insu (1392) 794 73.6 7.5e-12 XP_016877625 (OMIM: 147370,270450) PREDICTED: insu (1392) 794 73.6 7.5e-12 NP_000236 (OMIM: 114550,164860,605074,607278,61670 (1390) 793 73.5 7.9e-12 NP_001120972 (OMIM: 114550,164860,605074,607278,61 (1408) 793 73.5 7.9e-12 XP_011514525 (OMIM: 114550,164860,605074,607278,61 (1409) 793 73.5 7.9e-12 XP_005271220 (OMIM: 600222) PREDICTED: tyrosine-pr (1095) 789 73.1 8.4e-12 NP_001240286 (OMIM: 600222) tyrosine-protein kinas (1093) 781 72.5 1.3e-11 NP_005415 (OMIM: 600222) tyrosine-protein kinase r (1138) 781 72.5 1.3e-11 XP_006710932 (OMIM: 600222) PREDICTED: tyrosine-pr ( 783) 774 71.8 1.5e-11 XP_011534355 (OMIM: 165020) PREDICTED: proto-oncog (2299) 773 72.4 2.8e-11 XP_016866662 (OMIM: 165020) PREDICTED: proto-oncog (2333) 773 72.4 2.8e-11 XP_016866661 (OMIM: 165020) PREDICTED: proto-oncog (2334) 773 72.4 2.8e-11 XP_006715611 (OMIM: 165020) PREDICTED: proto-oncog (2342) 773 72.4 2.8e-11 XP_011534354 (OMIM: 165020) PREDICTED: proto-oncog (2343) 773 72.4 2.8e-11 NP_002935 (OMIM: 165020) proto-oncogene tyrosine-p (2347) 773 72.4 2.8e-11 XP_011534353 (OMIM: 165020) PREDICTED: proto-oncog (2348) 773 72.4 2.8e-11 XP_011534352 (OMIM: 165020) PREDICTED: proto-oncog (2356) 773 72.4 2.8e-11 XP_011534351 (OMIM: 165020) PREDICTED: proto-oncog (2357) 773 72.4 2.8e-11 NP_001277006 (OMIM: 600195,600221) angiopoietin-1 (1081) 761 71.0 3.3e-11 NP_000450 (OMIM: 600195,600221) angiopoietin-1 rec (1124) 761 71.1 3.4e-11 NP_996844 (OMIM: 151520) leukocyte tyrosine kinase ( 803) 757 70.6 3.5e-11 NP_004295 (OMIM: 105590,613014) ALK tyrosine kinas (1620) 764 71.5 3.6e-11 NP_002335 (OMIM: 151520) leukocyte tyrosine kinase ( 864) 757 70.6 3.6e-11 XP_011526291 (OMIM: 147670,246200,262190,609968,61 (1369) 751 70.5 6.2e-11 NP_001073285 (OMIM: 147670,246200,262190,609968,61 (1370) 751 70.5 6.2e-11 XP_011526290 (OMIM: 147670,246200,262190,609968,61 (1381) 751 70.5 6.3e-11 NP_000199 (OMIM: 147670,246200,262190,609968,61054 (1382) 751 70.5 6.3e-11 NP_001305842 (OMIM: 600168,617075) macrophage-stim (1294) 749 70.3 6.7e-11 XP_011532046 (OMIM: 600168,617075) PREDICTED: macr (1295) 749 70.3 6.7e-11 NP_001231866 (OMIM: 600168,617075) macrophage-stim (1351) 749 70.3 6.8e-11 >>NP_001690 (OMIM: 109135) tyrosine-protein kinase recep (885 aa) initn: 6126 init1: 6126 opt: 6126 Z-score: 2391.7 bits: 453.7 E(85289): 1.8e-126 Smith-Waterman score: 6126; 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99.0% identity (99.0% similar) in 894 aa overlap (1-885:1-894) 10 20 30 40 50 60 pF1KB9 MAWRCPRMGRVPLAWCLALCGWACMAPRGTQAEESPFVGNPGNITGARGLTGTLRCQLQV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_068 MAWRCPRMGRVPLAWCLALCGWACMAPRGTQAEESPFVGNPGNITGARGLTGTLRCQLQV 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB9 QGEPPEVHWLRDGQILELADSTQTQVPLGEDEQDDWIVVSQLRITSLQLSDTGQYQCLVF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_068 QGEPPEVHWLRDGQILELADSTQTQVPLGEDEQDDWIVVSQLRITSLQLSDTGQYQCLVF 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB9 LGHQTFVSQPGYVGLEGLPYFLEEPEDRTVAANTPFNLSCQAQGPPEPVDLLWLQDAVPL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_068 LGHQTFVSQPGYVGLEGLPYFLEEPEDRTVAANTPFNLSCQAQGPPEPVDLLWLQDAVPL 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB9 ATAPGHGPQRSLHVPGLNKTSSFSCEAHNAKGVTTSRTATITVLPQQPRNLHLVSRQPTE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_068 ATAPGHGPQRSLHVPGLNKTSSFSCEAHNAKGVTTSRTATITVLPQQPRNLHLVSRQPTE 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB9 LEVAWTPGLSGIYPLTHCTLQAVLSDDGMGIQAGEPDPPEEPLTSQASVPPHQLRLGSLH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_068 LEVAWTPGLSGIYPLTHCTLQAVLSDDGMGIQAGEPDPPEEPLTSQASVPPHQLRLGSLH 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KB9 PHTPYHIRVACTSSQGPSSWTHWLPVETPEGVPLGPPENISATRNGSQAFVHWQEPRAPL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_068 PHTPYHIRVACTSSQGPSSWTHWLPVETPEGVPLGPPENISATRNGSQAFVHWQEPRAPL 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KB9 QGTLLGYRLAYQGQDTPEVLMDIGLRQEVTLELQGDGSVSNLTVCVAAYTAAGDGPWSLP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_068 QGTLLGYRLAYQGQDTPEVLMDIGLRQEVTLELQGDGSVSNLTVCVAAYTAAGDGPWSLP 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KB9 VPLEAWRP---------VKEPSTPAFSWPWWYVLLGAVVAAACVLILALFLVHRRKKETR :::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_068 VPLEAWRPGQAQPVHQLVKEPSTPAFSWPWWYVLLGAVVAAACVLILALFLVHRRKKETR 430 440 450 460 470 480 480 490 500 510 520 530 pF1KB9 YGEVFEPTVERGELVVRYRVRKSYSRRTTEATLNSLGISEELKEKLRDVMVDRHKVALGK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_068 YGEVFEPTVERGELVVRYRVRKSYSRRTTEATLNSLGISEELKEKLRDVMVDRHKVALGK 490 500 510 520 530 540 540 550 560 570 580 590 pF1KB9 TLGEGEFGAVMEGQLNQDDSILKVAVKTMKIAICTRSELEDFLSEAVCMKEFDHPNVMRL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_068 TLGEGEFGAVMEGQLNQDDSILKVAVKTMKIAICTRSELEDFLSEAVCMKEFDHPNVMRL 550 560 570 580 590 600 600 610 620 630 640 650 pF1KB9 IGVCFQGSERESFPAPVVILPFMKHGDLHSFLLYSRLGDQPVYLPTQMLVKFMADIASGM :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_068 IGVCFQGSERESFPAPVVILPFMKHGDLHSFLLYSRLGDQPVYLPTQMLVKFMADIASGM 610 620 630 640 650 660 660 670 680 690 700 710 pF1KB9 EYLSTKRFIHRDLAARNCMLNENMSVCVADFGLSKKIYNGDYYRQGRIAKMPVKWIAIES :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_068 EYLSTKRFIHRDLAARNCMLNENMSVCVADFGLSKKIYNGDYYRQGRIAKMPVKWIAIES 670 680 690 700 710 720 720 730 740 750 760 770 pF1KB9 LADRVYTSKSDVWSFGVTMWEIATRGQTPYPGVENSEIYDYLRQGNRLKQPADCLDGLYA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_068 LADRVYTSKSDVWSFGVTMWEIATRGQTPYPGVENSEIYDYLRQGNRLKQPADCLDGLYA 730 740 750 760 770 780 780 790 800 810 820 830 pF1KB9 LMSRCWELNPQDRPSFTELREDLENTLKALPPAQEPDEILYVNMDEGGGYPEPPGAAGGA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_068 LMSRCWELNPQDRPSFTELREDLENTLKALPPAQEPDEILYVNMDEGGGYPEPPGAAGGA 790 800 810 820 830 840 840 850 860 870 880 pF1KB9 DPPTQPDPKDSCSCLTAAEVHPAGRYVLCPSTTPSPAQPADRGSPAAPGQEDGA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_068 DPPTQPDPKDSCSCLTAAEVHPAGRYVLCPSTTPSPAQPADRGSPAAPGQEDGA 850 860 870 880 890 >>NP_001317193 (OMIM: 600341) tyrosine-protein kinase re (845 aa) initn: 1847 init1: 1194 opt: 2244 Z-score: 895.0 bits: 176.7 E(85289): 4.1e-43 Smith-Waterman score: 2332; 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NP_001 PLGPYKLSWVQDNGTQDELTVEGTRANLT----GWDPQKDLIVRVCVSNAVGCGPWSQPL 310 320 330 340 350 360 430 440 450 460 470 480 pF1KB9 PLEAWRPVKEPSTPAFSWPWWYVLLGAVVAAACVLILALFLVHRRKKETRYGEVFEPTVE . . . . . : : :.::...: . . :::.:...:.::::.:..:. .. NP_001 VVSSHDRAGQQGPPHSRTSWVPVVLGVLTALVTAAALALILLRKRRKETRFGQAFDSVMA 370 380 390 400 410 420 490 500 510 520 530 pF1KB9 RGELVVRYRVRKSYSRRTTE---ATLNSLGISEELKEKLRDVMVDRHKVALGKTLGEGEF ::: .:..:. .:..:. : :::.:::::.::::::.::.. ... .::. ::.::: NP_001 RGEPAVHFRAARSFNRERPERIEATLDSLGISDELKEKLEDVLIPEQQFTLGRMLGKGEF 430 440 450 460 470 480 540 550 560 570 580 590 pF1KB9 GAVMEGQLNQDD-SILKVAVKTMKIAICTRSELEDFLSEAVCMKEFDHPNVMRLIGVCFQ :.: :.::.:.: :..::::: .: : . :..:.:: ::.::::::::.: .:.:: .. NP_001 GSVREAQLKQEDGSFVKVAVKMLKADIIASSDIEEFLREAACMKEFDHPHVAKLVGVSLR 490 500 510 520 530 540 600 610 620 630 640 650 pF1KB9 GSERESFPAPVVILPFMKHGDLHSFLLYSRLGDQPVYLPTQMLVKFMADIASGMEYLSTK . . .: :.::::::::::::.::: ::.:..: :: : :..::.::: ::::::.. NP_001 SRAKGRLPIPMVILPFMKHGDLHAFLLASRIGENPFNLPLQTLIRFMVDIACGMEYLSSR 550 560 570 580 590 600 660 670 680 690 700 710 pF1KB9 RFIHRDLAARNCMLNENMSVCVADFGLSKKIYNGDYYRQGRIAKMPVKWIAIESLADRVY ::::::::::::: :.:.:::::::::.:::.::::::: .:.::::.:.::::: .: NP_001 NFIHRDLAARNCMLAEDMTVCVADFGLSRKIYSGDYYRQGCASKLPVKWLALESLADNLY 610 620 630 640 650 660 720 730 740 750 760 770 pF1KB9 TSKSDVWSFGVTMWEIATRGQTPYPGVENSEIYDYLRQGNRLKQPADCLDGLYALMSRCW : .::::.:::::::: ::::::: :.::.:::.:: ::::::: .:.. .: :: .:: NP_001 TVQSDVWAFGVTMWEIMTRGQTPYAGIENAEIYNYLIGGNRLKQPPECMEDVYDLMYQCW 670 680 690 700 710 720 780 790 800 810 820 830 pF1KB9 ELNPQDRPSFTELREDLENTLKALPPAQEPDEILYVNMDEGGGYPEPPGAAGGADPPTQP .:..::::: :: .::: : : . .. ::.:.... : : :.:. . : . 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XP_011 GGSEEWEDLTSAPSAAVTAEKNS-VLPGERLVRNGVSWSHSSMLPLGSSLPDELLFADDS 870 880 890 900 910 920 >>NP_006334 (OMIM: 604705,613862) tyrosine-protein kinas (999 aa) initn: 1687 init1: 1263 opt: 2129 Z-score: 849.9 bits: 168.6 E(85289): 1.3e-40 Smith-Waterman score: 2265; 43.1% identity (69.0% similar) in 903 aa overlap (27-881:81-960) 10 20 30 40 50 pF1KB9 MAWRCPRMGRVPLAWCLALCGWACMAPRGTQAEESP-----FVGNPGNITGARGLT :. :..: .: : . :.: .. 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