Result of FASTA (omim) for pF1KB9419
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB9419, 543 aa
  1>>>pF1KB9419 543 - 543 aa - 543 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.2528+/-0.000808; mu= -18.7035+/- 0.048
 mean_var=914.1116+/-202.954, 0's: 0 Z-trim(116.0): 1163  B-trim: 1501 in 1/53
 Lambda= 0.042420
 statistics sampled from 25450 (26797) to 25450 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.659), E-opt: 0.2 (0.314), width:  16
 Scan time: 10.330

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_005424 (OMIM: 164880) tyrosine-protein kinase Y ( 543) 3672 241.4 5.3e-63
XP_016881449 (OMIM: 164880) PREDICTED: tyrosine-pr ( 543) 3672 241.4 5.3e-63
XP_005258196 (OMIM: 164880) PREDICTED: tyrosine-pr ( 499) 2875 192.6 2.4e-48
XP_011527315 (OMIM: 114500,190090,616937) PREDICTE ( 536) 2725 183.5 1.5e-45
NP_938033 (OMIM: 114500,190090,616937) proto-oncog ( 536) 2725 183.5 1.5e-45
NP_005408 (OMIM: 114500,190090,616937) proto-oncog ( 536) 2725 183.5 1.5e-45
XP_016883515 (OMIM: 114500,190090,616937) PREDICTE ( 542) 2703 182.1 3.7e-45
XP_016883516 (OMIM: 114500,190090,616937) PREDICTE ( 542) 2703 182.1 3.7e-45
XP_016883514 (OMIM: 114500,190090,616937) PREDICTE ( 542) 2703 182.1 3.7e-45
XP_016883513 (OMIM: 114500,190090,616937) PREDICTE ( 542) 2703 182.1 3.7e-45
XP_005266947 (OMIM: 137025) PREDICTED: tyrosine-pr ( 534) 2675 180.4 1.2e-44
NP_694592 (OMIM: 137025) tyrosine-protein kinase F ( 534) 2675 180.4 1.2e-44
NP_002028 (OMIM: 137025) tyrosine-protein kinase F ( 537) 2640 178.3 5.4e-44
XP_016866139 (OMIM: 137025) PREDICTED: tyrosine-pr ( 537) 2640 178.3 5.4e-44
XP_016866140 (OMIM: 137025) PREDICTED: tyrosine-pr ( 537) 2640 178.3 5.4e-44
XP_016866141 (OMIM: 137025) PREDICTED: tyrosine-pr ( 537) 2640 178.3 5.4e-44
XP_016866143 (OMIM: 137025) PREDICTED: tyrosine-pr ( 537) 2640 178.3 5.4e-44
XP_016866142 (OMIM: 137025) PREDICTED: tyrosine-pr ( 537) 2640 178.3 5.4e-44
NP_005239 (OMIM: 164940) tyrosine-protein kinase F ( 529) 2465 167.6 8.9e-41
XP_006710515 (OMIM: 164940) PREDICTED: tyrosine-pr ( 529) 2465 167.6 8.9e-41
NP_001036212 (OMIM: 164940) tyrosine-protein kinas ( 529) 2465 167.6 8.9e-41
XP_011539312 (OMIM: 164940) PREDICTED: tyrosine-pr ( 529) 2465 167.6 8.9e-41
NP_001036194 (OMIM: 164940) tyrosine-protein kinas ( 529) 2465 167.6 8.9e-41
NP_001165604 (OMIM: 142370) tyrosine-protein kinas ( 505) 2055 142.4 3.1e-33
NP_001165600 (OMIM: 142370) tyrosine-protein kinas ( 505) 2055 142.4 3.1e-33
NP_001165603 (OMIM: 142370) tyrosine-protein kinas ( 506) 2055 142.4 3.1e-33
NP_002101 (OMIM: 142370) tyrosine-protein kinase H ( 526) 2055 142.5 3.2e-33
NP_001165602 (OMIM: 142370) tyrosine-protein kinas ( 504) 2044 141.8   5e-33
NP_001165601 (OMIM: 142370) tyrosine-protein kinas ( 525) 2044 141.8 5.1e-33
XP_016868905 (OMIM: 165120) PREDICTED: tyrosine-pr ( 491) 1945 135.7 3.3e-31
NP_001104567 (OMIM: 165120) tyrosine-protein kinas ( 491) 1945 135.7 3.3e-31
NP_002341 (OMIM: 165120) tyrosine-protein kinase L ( 512) 1945 135.7 3.3e-31
NP_001036236 (OMIM: 153390,615758) tyrosine-protei ( 509) 1942 135.5 3.8e-31
NP_005347 (OMIM: 153390,615758) tyrosine-protein k ( 509) 1942 135.5 3.8e-31
XP_011515831 (OMIM: 165120) PREDICTED: tyrosine-pr ( 682) 1945 135.9 3.9e-31
XP_011539313 (OMIM: 164940) PREDICTED: tyrosine-pr ( 460) 1909 133.4 1.4e-30
NP_001706 (OMIM: 191305,613375) tyrosine-protein k ( 505) 1879 131.7 5.4e-30
NP_001317394 (OMIM: 191305,613375) tyrosine-protei ( 434) 1839 129.1 2.7e-29
XP_016856162 (OMIM: 164940) PREDICTED: tyrosine-pr ( 325) 1731 122.3 2.3e-27
XP_016856163 (OMIM: 164940) PREDICTED: tyrosine-pr ( 325) 1731 122.3 2.3e-27
XP_011539316 (OMIM: 164940) PREDICTED: tyrosine-pr ( 325) 1731 122.3 2.3e-27
XP_011539314 (OMIM: 164940) PREDICTED: tyrosine-pr ( 410) 1540 110.8 8.5e-24
XP_005266949 (OMIM: 137025) PREDICTED: tyrosine-pr ( 482) 1523 109.8 1.9e-23
NP_694593 (OMIM: 137025) tyrosine-protein kinase F ( 482) 1523 109.8 1.9e-23
XP_011533956 (OMIM: 606573) PREDICTED: tyrosine-pr ( 505) 1438 104.7 7.3e-22
XP_005266937 (OMIM: 606573) PREDICTED: tyrosine-pr ( 505) 1438 104.7 7.3e-22
NP_002022 (OMIM: 606573) tyrosine-protein kinase F ( 505) 1438 104.7 7.3e-22
XP_005266939 (OMIM: 606573) PREDICTED: tyrosine-pr ( 505) 1438 104.7 7.3e-22
XP_016866134 (OMIM: 606573) PREDICTED: tyrosine-pr ( 505) 1438 104.7 7.3e-22
XP_005266938 (OMIM: 606573) PREDICTED: tyrosine-pr ( 505) 1438 104.7 7.3e-22


>>NP_005424 (OMIM: 164880) tyrosine-protein kinase Yes [  (543 aa)
 initn: 3672 init1: 3672 opt: 3672  Z-score: 1252.1  bits: 241.4 E(85289): 5.3e-63
Smith-Waterman score: 3672; 100.0% identity (100.0% similar) in 543 aa overlap (1-543:1-543)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MGCIKSKENKSPAIKYRPENTPEPVSTSVSHYGAEPTTVSPCPSSSAKGTAVNFSSLSMT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MGCIKSKENKSPAIKYRPENTPEPVSTSVSHYGAEPTTVSPCPSSSAKGTAVNFSSLSMT
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 PFGGSSGVTPFGGASSSFSVVPSSYPAGLTGGVTIFVALYDYEARTTEDLSFKKGERFQI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 PFGGSSGVTPFGGASSSFSVVPSSYPAGLTGGVTIFVALYDYEARTTEDLSFKKGERFQI
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 INNTEGDWWEARSIATGKNGYIPSNYVAPADSIQAEEWYFGKMGRKDAERLLLNPGNQRG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 INNTEGDWWEARSIATGKNGYIPSNYVAPADSIQAEEWYFGKMGRKDAERLLLNPGNQRG
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 IFLVRESETTKGAYSLSIRDWDEIRGDNVKHYKIRKLDNGGYYITTRAQFDTLQKLVKHY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 IFLVRESETTKGAYSLSIRDWDEIRGDNVKHYKIRKLDNGGYYITTRAQFDTLQKLVKHY
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 TEHADGLCHKLTTVCPTVKPQTQGLAKDAWEIPRESLRLEVKLGQGCFGEVWMGTWNGTT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 TEHADGLCHKLTTVCPTVKPQTQGLAKDAWEIPRESLRLEVKLGQGCFGEVWMGTWNGTT
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB9 KVAIKTLKPGTMMPEAFLQEAQIMKKLRHDKLVPLYAVVSEEPIYIVTEFMSKGSLLDFL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 KVAIKTLKPGTMMPEAFLQEAQIMKKLRHDKLVPLYAVVSEEPIYIVTEFMSKGSLLDFL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB9 KEGDGKYLKLPQLVDMAAQIADGMAYIERMNYIHRDLRAANILVGENLVCKIADFGLARL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 KEGDGKYLKLPQLVDMAAQIADGMAYIERMNYIHRDLRAANILVGENLVCKIADFGLARL
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB9 IEDNEYTARQGAKFPIKWTAPEAALYGRFTIKSDVWSFGILQTELVTKGRVPYPGMVNRE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 IEDNEYTARQGAKFPIKWTAPEAALYGRFTIKSDVWSFGILQTELVTKGRVPYPGMVNRE
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB9 VLEQVERGYRMPCPQGCPESLHELMNLCWKKDPDERPTFEYIQSFLEDYFTATEPQYQPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 VLEQVERGYRMPCPQGCPESLHELMNLCWKKDPDERPTFEYIQSFLEDYFTATEPQYQPG
              490       500       510       520       530       540

          
pF1KB9 ENL
       :::
NP_005 ENL
          

>>XP_016881449 (OMIM: 164880) PREDICTED: tyrosine-protei  (543 aa)
 initn: 3672 init1: 3672 opt: 3672  Z-score: 1252.1  bits: 241.4 E(85289): 5.3e-63
Smith-Waterman score: 3672; 100.0% identity (100.0% similar) in 543 aa overlap (1-543:1-543)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MGCIKSKENKSPAIKYRPENTPEPVSTSVSHYGAEPTTVSPCPSSSAKGTAVNFSSLSMT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MGCIKSKENKSPAIKYRPENTPEPVSTSVSHYGAEPTTVSPCPSSSAKGTAVNFSSLSMT
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 PFGGSSGVTPFGGASSSFSVVPSSYPAGLTGGVTIFVALYDYEARTTEDLSFKKGERFQI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PFGGSSGVTPFGGASSSFSVVPSSYPAGLTGGVTIFVALYDYEARTTEDLSFKKGERFQI
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 INNTEGDWWEARSIATGKNGYIPSNYVAPADSIQAEEWYFGKMGRKDAERLLLNPGNQRG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 INNTEGDWWEARSIATGKNGYIPSNYVAPADSIQAEEWYFGKMGRKDAERLLLNPGNQRG
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 IFLVRESETTKGAYSLSIRDWDEIRGDNVKHYKIRKLDNGGYYITTRAQFDTLQKLVKHY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IFLVRESETTKGAYSLSIRDWDEIRGDNVKHYKIRKLDNGGYYITTRAQFDTLQKLVKHY
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 TEHADGLCHKLTTVCPTVKPQTQGLAKDAWEIPRESLRLEVKLGQGCFGEVWMGTWNGTT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TEHADGLCHKLTTVCPTVKPQTQGLAKDAWEIPRESLRLEVKLGQGCFGEVWMGTWNGTT
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB9 KVAIKTLKPGTMMPEAFLQEAQIMKKLRHDKLVPLYAVVSEEPIYIVTEFMSKGSLLDFL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KVAIKTLKPGTMMPEAFLQEAQIMKKLRHDKLVPLYAVVSEEPIYIVTEFMSKGSLLDFL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB9 KEGDGKYLKLPQLVDMAAQIADGMAYIERMNYIHRDLRAANILVGENLVCKIADFGLARL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KEGDGKYLKLPQLVDMAAQIADGMAYIERMNYIHRDLRAANILVGENLVCKIADFGLARL
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB9 IEDNEYTARQGAKFPIKWTAPEAALYGRFTIKSDVWSFGILQTELVTKGRVPYPGMVNRE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IEDNEYTARQGAKFPIKWTAPEAALYGRFTIKSDVWSFGILQTELVTKGRVPYPGMVNRE
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB9 VLEQVERGYRMPCPQGCPESLHELMNLCWKKDPDERPTFEYIQSFLEDYFTATEPQYQPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VLEQVERGYRMPCPQGCPESLHELMNLCWKKDPDERPTFEYIQSFLEDYFTATEPQYQPG
              490       500       510       520       530       540

          
pF1KB9 ENL
       :::
XP_016 ENL
          

>>XP_005258196 (OMIM: 164880) PREDICTED: tyrosine-protei  (499 aa)
 initn: 2875 init1: 2875 opt: 2875  Z-score: 988.9  bits: 192.6 E(85289): 2.4e-48
Smith-Waterman score: 3272; 91.9% identity (91.9% similar) in 543 aa overlap (1-543:1-499)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MGCIKSKENKSPAIKYRPENTPEPVSTSVSHYGAEPTTVSPCPSSSAKGTAVNFSSLSMT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MGCIKSKENKSPAIKYRPENTPEPVSTSVSHYGAEPTTVSPCPSSSAKGTAVNFSSLSMT
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 PFGGSSGVTPFGGASSSFSVVPSSYPAGLTGGVTIFVALYDYEARTTEDLSFKKGERFQI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PFGGSSGVTPFGGASSSFSVVPSSYPAGLTGGVTIFVALYDYEARTTEDLSFKKGERFQI
               70        80        90       100       110       120

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pF1KB9 INNTEGDWWEARSIATGKNGYIPSNYVAPADSIQAEEWYFGKMGRKDAERLLLNPGNQRG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 INNTEGDWWEARSIATGKNGYIPSNYVAPADSIQAEEWYFGKMGRKDAERLLLNPGNQRG
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 IFLVRESETTKGAYSLSIRDWDEIRGDNVKHYKIRKLDNGGYYITTRAQFDTLQKLVKHY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 IFLVRESETTKGAYSLSIRDWDEIRGDNVKHYKIRKLDNGGYYITTRAQFDTLQKLVKHY
              190       200       210       220       230       240

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pF1KB9 TEHADGLCHKLTTVCPTVKPQTQGLAKDAWEIPRESLRLEVKLGQGCFGEVWMGTWNGTT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TEHADGLCHKLTTVCPTVKPQTQGLAKDAWEIPRESLRLEVKLGQGCFGEVWMGTWNGTT
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB9 KVAIKTLKPGTMMPEAFLQEAQIMKKLRHDKLVPLYAVVSEEPIYIVTEFMSKGSLLDFL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KVAIKTLKPGTMMPEAFLQEAQIMKKLRHDKLVPLYAVVSEEPIYIVTEFMSKGSLLDFL
              310       320       330       340       350       360

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pF1KB9 KEGDGKYLKLPQLVDMAAQIADGMAYIERMNYIHRDLRAANILVGENLVCKIADFGLARL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KEGDGKYLKLPQLVDMAAQIADGMAYIERMNYIHRDLRAANILVGENLVCKIADFGLARL
              370       380       390       400       410       420

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pF1KB9 IEDNEYTARQGAKFPIKWTAPEAALYGRFTIKSDVWSFGILQTELVTKGRVPYPGMVNRE
       :::::::::::                                            :::::
XP_005 IEDNEYTARQG--------------------------------------------MVNRE
              430                                                  

              490       500       510       520       530       540
pF1KB9 VLEQVERGYRMPCPQGCPESLHELMNLCWKKDPDERPTFEYIQSFLEDYFTATEPQYQPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VLEQVERGYRMPCPQGCPESLHELMNLCWKKDPDERPTFEYIQSFLEDYFTATEPQYQPG
        440       450       460       470       480       490      

          
pF1KB9 ENL
       :::
XP_005 ENL
          

>>XP_011527315 (OMIM: 114500,190090,616937) PREDICTED: p  (536 aa)
 initn: 2696 init1: 2696 opt: 2725  Z-score: 939.0  bits: 183.5 E(85289): 1.5e-45
Smith-Waterman score: 2725; 74.5% identity (86.8% similar) in 546 aa overlap (1-543:1-536)

               10        20        30        40           50       
pF1KB9 MGCIKSKENKSPAIKYRPENTPEPVSTSVSHYGAEPTTVSPCPSSSA---KGTAVNFSSL
       ::  :::  :. . . :  .  : :  . .  :: :.. .:   .::   .: .. :.  
XP_011 MGSNKSKP-KDASQRRRSLEPAENVHGAGG--GAFPASQTPSKPASADGHRGPSAAFAPA
                10        20          30        40        50       

        60        70        80        90       100       110       
pF1KB9 SMTPFGGSSGVTPFGGASSSFSVVPSSYPAGLTGGVTIFVALYDYEARTTEDLSFKKGER
       .  :         ::: .:: .:.  .  . :.:::: ::::::::.::  :::::::::
XP_011 AAEP-------KLFGGFNSSDTVTSPQRAGPLAGGVTTFVALYDYESRTETDLSFKKGER
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pF1KB9 FQIINNTEGDWWEARSIATGKNGYIPSNYVAPADSIQAEEWYFGKMGRKDAERLLLNPGN
       .::.:::::::: :.:..::..::::::::::.::::::::::::. :...::::::  :
XP_011 LQIVNNTEGDWWLAHSLSTGQTGYIPSNYVAPSDSIQAEEWYFGKITRRESERLLLNAEN
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pF1KB9 QRGIFLVRESETTKGAYSLSIRDWDEIRGDNVKHYKIRKLDNGGYYITTRAQFDTLQKLV
        :: ::::::::::::: ::. :.:. .: :::::::::::.::.:::.:.::..::.::
XP_011 PRGTFLVRESETTKGAYCLSVSDFDNAKGLNVKHYKIRKLDSGGFYITSRTQFNSLQQLV
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       240       250       260       270       280       290       
pF1KB9 KHYTEHADGLCHKLTTVCPTVKPQTQGLAKDAWEIPRESLRLEVKLGQGCFGEVWMGTWN
        .:..:::::::.::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AYYSKHADGLCHRLTTVCPTSKPQTQGLAKDAWEIPRESLRLEVKLGQGCFGEVWMGTWN
              240       250       260       270       280       290

       300       310       320       330       340       350       
pF1KB9 GTTKVAIKTLKPGTMMPEAFLQEAQIMKKLRHDKLVPLYAVVSEEPIYIVTEFMSKGSLL
       :::.::::::::::: :::::::::.::::::.::: :::::::::::::::.:::::::
XP_011 GTTRVAIKTLKPGTMSPEAFLQEAQVMKKLRHEKLVQLYAVVSEEPIYIVTEYMSKGSLL
              300       310       320       330       340       350

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pF1KB9 DFLKEGDGKYLKLPQLVDMAAQIADGMAYIERMNYIHRDLRAANILVGENLVCKIADFGL
       ::::   ::::.::::::::::::.::::.:::::.::::::::::::::::::.:::::
XP_011 DFLKGETGKYLRLPQLVDMAAQIASGMAYVERMNYVHRDLRAANILVGENLVCKVADFGL
              360       370       380       390       400       410

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pF1KB9 ARLIEDNEYTARQGAKFPIKWTAPEAALYGRFTIKSDVWSFGILQTELVTKGRVPYPGMV
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::.:::::::::::
XP_011 ARLIEDNEYTARQGAKFPIKWTAPEAALYGRFTIKSDVWSFGILLTELTTKGRVPYPGMV
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pF1KB9 NREVLEQVERGYRMPCPQGCPESLHELMNLCWKKDPDERPTFEYIQSFLEDYFTATEPQY
       :::::.:::::::::::  ::::::.::  ::.:.:.:::::::.:.:::::::.:::::
XP_011 NREVLDQVERGYRMPCPPECPESLHDLMCQCWRKEPEERPTFEYLQAFLEDYFTSTEPQY
              480       490       500       510       520       530

       540   
pF1KB9 QPGENL
       ::::::
XP_011 QPGENL
             

>>NP_938033 (OMIM: 114500,190090,616937) proto-oncogene   (536 aa)
 initn: 2696 init1: 2696 opt: 2725  Z-score: 939.0  bits: 183.5 E(85289): 1.5e-45
Smith-Waterman score: 2725; 74.5% identity (86.8% similar) in 546 aa overlap (1-543:1-536)

               10        20        30        40           50       
pF1KB9 MGCIKSKENKSPAIKYRPENTPEPVSTSVSHYGAEPTTVSPCPSSSA---KGTAVNFSSL
       ::  :::  :. . . :  .  : :  . .  :: :.. .:   .::   .: .. :.  
NP_938 MGSNKSKP-KDASQRRRSLEPAENVHGAGG--GAFPASQTPSKPASADGHRGPSAAFAPA
                10        20          30        40        50       

        60        70        80        90       100       110       
pF1KB9 SMTPFGGSSGVTPFGGASSSFSVVPSSYPAGLTGGVTIFVALYDYEARTTEDLSFKKGER
       .  :         ::: .:: .:.  .  . :.:::: ::::::::.::  :::::::::
NP_938 AAEP-------KLFGGFNSSDTVTSPQRAGPLAGGVTTFVALYDYESRTETDLSFKKGER
        60               70        80        90       100       110

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pF1KB9 FQIINNTEGDWWEARSIATGKNGYIPSNYVAPADSIQAEEWYFGKMGRKDAERLLLNPGN
       .::.:::::::: :.:..::..::::::::::.::::::::::::. :...::::::  :
NP_938 LQIVNNTEGDWWLAHSLSTGQTGYIPSNYVAPSDSIQAEEWYFGKITRRESERLLLNAEN
              120       130       140       150       160       170

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pF1KB9 QRGIFLVRESETTKGAYSLSIRDWDEIRGDNVKHYKIRKLDNGGYYITTRAQFDTLQKLV
        :: ::::::::::::: ::. :.:. .: :::::::::::.::.:::.:.::..::.::
NP_938 PRGTFLVRESETTKGAYCLSVSDFDNAKGLNVKHYKIRKLDSGGFYITSRTQFNSLQQLV
              180       190       200       210       220       230

       240       250       260       270       280       290       
pF1KB9 KHYTEHADGLCHKLTTVCPTVKPQTQGLAKDAWEIPRESLRLEVKLGQGCFGEVWMGTWN
        .:..:::::::.::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_938 AYYSKHADGLCHRLTTVCPTSKPQTQGLAKDAWEIPRESLRLEVKLGQGCFGEVWMGTWN
              240       250       260       270       280       290

       300       310       320       330       340       350       
pF1KB9 GTTKVAIKTLKPGTMMPEAFLQEAQIMKKLRHDKLVPLYAVVSEEPIYIVTEFMSKGSLL
       :::.::::::::::: :::::::::.::::::.::: :::::::::::::::.:::::::
NP_938 GTTRVAIKTLKPGTMSPEAFLQEAQVMKKLRHEKLVQLYAVVSEEPIYIVTEYMSKGSLL
              300       310       320       330       340       350

       360       370       380       390       400       410       
pF1KB9 DFLKEGDGKYLKLPQLVDMAAQIADGMAYIERMNYIHRDLRAANILVGENLVCKIADFGL
       ::::   ::::.::::::::::::.::::.:::::.::::::::::::::::::.:::::
NP_938 DFLKGETGKYLRLPQLVDMAAQIASGMAYVERMNYVHRDLRAANILVGENLVCKVADFGL
              360       370       380       390       400       410

       420       430       440       450       460       470       
pF1KB9 ARLIEDNEYTARQGAKFPIKWTAPEAALYGRFTIKSDVWSFGILQTELVTKGRVPYPGMV
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::.:::::::::::
NP_938 ARLIEDNEYTARQGAKFPIKWTAPEAALYGRFTIKSDVWSFGILLTELTTKGRVPYPGMV
              420       430       440       450       460       470

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pF1KB9 NREVLEQVERGYRMPCPQGCPESLHELMNLCWKKDPDERPTFEYIQSFLEDYFTATEPQY
       :::::.:::::::::::  ::::::.::  ::.:.:.:::::::.:.:::::::.:::::
NP_938 NREVLDQVERGYRMPCPPECPESLHDLMCQCWRKEPEERPTFEYLQAFLEDYFTSTEPQY
              480       490       500       510       520       530

       540   
pF1KB9 QPGENL
       ::::::
NP_938 QPGENL
             

>>NP_005408 (OMIM: 114500,190090,616937) proto-oncogene   (536 aa)
 initn: 2696 init1: 2696 opt: 2725  Z-score: 939.0  bits: 183.5 E(85289): 1.5e-45
Smith-Waterman score: 2725; 74.5% identity (86.8% similar) in 546 aa overlap (1-543:1-536)

               10        20        30        40           50       
pF1KB9 MGCIKSKENKSPAIKYRPENTPEPVSTSVSHYGAEPTTVSPCPSSSA---KGTAVNFSSL
       ::  :::  :. . . :  .  : :  . .  :: :.. .:   .::   .: .. :.  
NP_005 MGSNKSKP-KDASQRRRSLEPAENVHGAGG--GAFPASQTPSKPASADGHRGPSAAFAPA
                10        20          30        40        50       

        60        70        80        90       100       110       
pF1KB9 SMTPFGGSSGVTPFGGASSSFSVVPSSYPAGLTGGVTIFVALYDYEARTTEDLSFKKGER
       .  :         ::: .:: .:.  .  . :.:::: ::::::::.::  :::::::::
NP_005 AAEP-------KLFGGFNSSDTVTSPQRAGPLAGGVTTFVALYDYESRTETDLSFKKGER
        60               70        80        90       100       110

       120       130       140       150       160       170       
pF1KB9 FQIINNTEGDWWEARSIATGKNGYIPSNYVAPADSIQAEEWYFGKMGRKDAERLLLNPGN
       .::.:::::::: :.:..::..::::::::::.::::::::::::. :...::::::  :
NP_005 LQIVNNTEGDWWLAHSLSTGQTGYIPSNYVAPSDSIQAEEWYFGKITRRESERLLLNAEN
              120       130       140       150       160       170

       180       190       200       210       220       230       
pF1KB9 QRGIFLVRESETTKGAYSLSIRDWDEIRGDNVKHYKIRKLDNGGYYITTRAQFDTLQKLV
        :: ::::::::::::: ::. :.:. .: :::::::::::.::.:::.:.::..::.::
NP_005 PRGTFLVRESETTKGAYCLSVSDFDNAKGLNVKHYKIRKLDSGGFYITSRTQFNSLQQLV
              180       190       200       210       220       230

       240       250       260       270       280       290       
pF1KB9 KHYTEHADGLCHKLTTVCPTVKPQTQGLAKDAWEIPRESLRLEVKLGQGCFGEVWMGTWN
        .:..:::::::.::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 AYYSKHADGLCHRLTTVCPTSKPQTQGLAKDAWEIPRESLRLEVKLGQGCFGEVWMGTWN
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pF1KB9 GTTKVAIKTLKPGTMMPEAFLQEAQIMKKLRHDKLVPLYAVVSEEPIYIVTEFMSKGSLL
       :::.::::::::::: :::::::::.::::::.::: :::::::::::::::.:::::::
NP_005 GTTRVAIKTLKPGTMSPEAFLQEAQVMKKLRHEKLVQLYAVVSEEPIYIVTEYMSKGSLL
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       ::::   ::::.::::::::::::.::::.:::::.::::::::::::::::::.:::::
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pF1KB9 ARLIEDNEYTARQGAKFPIKWTAPEAALYGRFTIKSDVWSFGILQTELVTKGRVPYPGMV
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::.:::::::::::
NP_005 ARLIEDNEYTARQGAKFPIKWTAPEAALYGRFTIKSDVWSFGILLTELTTKGRVPYPGMV
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       :::::.:::::::::::  ::::::.::  ::.:.:.:::::::.:.:::::::.:::::
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       540   
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       ::::::
NP_005 QPGENL
             

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       ::  :::  :. . . :  .  : :  . .  :: :.. .:   .::   .: .. :.  
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       .  :         ::: .:: .:.  .  . :.:::: ::::::::.::  :::::::::
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       .::.:::      ::::: :.:..::..::::::::::.::::::::::::. :...:::
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       .::.:: .:..:::::::.::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::
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       :::::::::.::::::::::: :::::::::.::::::.::: :::::::::::::::.:
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       ::::::::::   ::::.::::::::::::.::::.:::::.::::::::::::::::::
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       .::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::.:::::
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       :::::::::::.:::::::::::  ::::::.::  ::.:.:.:::::::.:.:::::::
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       .:::::::::::
XP_016 STEPQYQPGENL
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       .::.:::      ::::: :.:..::..::::::::::.::::::::::::. :...:::
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       :::  : :: ::::::::::::: ::. :.:. .: :::::::::::.::.:::.:.::.
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       .::.:: .:..:::::::.::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::
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       :::::::::.::::::::::: :::::::::.::::::.::: :::::::::::::::.:
XP_016 WMGTWNGTTRVAIKTLKPGTMSPEAFLQEAQVMKKLRHEKLVQLYAVVSEEPIYIVTEYM
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       ::::::::::   ::::.::::::::::::.::::.:::::.::::::::::::::::::
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       .::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::.:::::
XP_016 VADFGLARLIEDNEYTARQGAKFPIKWTAPEAALYGRFTIKSDVWSFGILLTELTTKGRV
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       :::::::::::.:::::::::::  ::::::.::  ::.:.:.:::::::.:.:::::::
XP_016 PYPGMVNREVLDQVERGYRMPCPPECPESLHDLMCQCWRKEPEERPTFEYLQAFLEDYFT
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pF1KB9 ATEPQYQPGENL
       .:::::::::::
XP_016 STEPQYQPGENL
              540  

>>XP_016883514 (OMIM: 114500,190090,616937) PREDICTED: p  (542 aa)
 initn: 2481 init1: 2481 opt: 2703  Z-score: 931.6  bits: 182.1 E(85289): 3.7e-45
Smith-Waterman score: 2703; 73.7% identity (85.9% similar) in 552 aa overlap (1-543:1-542)

               10        20        30        40           50       
pF1KB9 MGCIKSKENKSPAIKYRPENTPEPVSTSVSHYGAEPTTVSPCPSSSA---KGTAVNFSSL
       ::  :::  :. . . :  .  : :  . .  :: :.. .:   .::   .: .. :.  
XP_016 MGSNKSKP-KDASQRRRSLEPAENVHGAGG--GAFPASQTPSKPASADGHRGPSAAFAPA
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pF1KB9 SMTPFGGSSGVTPFGGASSSFSVVPSSYPAGLTGGVTIFVALYDYEARTTEDLSFKKGER
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XP_016 AAEP-------KLFGGFNSSDTVTSPQRAGPLAGGVTTFVALYDYESRTETDLSFKKGER
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pF1KB9 FQIINNT------EGDWWEARSIATGKNGYIPSNYVAPADSIQAEEWYFGKMGRKDAERL
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XP_016 LQIVNNTRKVDVREGDWWLAHSLSTGQTGYIPSNYVAPSDSIQAEEWYFGKITRRESERL
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       :::::::::.::::::::::: :::::::::.::::::.::: :::::::::::::::.:
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       .::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::.:::::
XP_016 VADFGLARLIEDNEYTARQGAKFPIKWTAPEAALYGRFTIKSDVWSFGILLTELTTKGRV
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       .:::::::::::
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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