Result of FASTA (ccds) for
pF1KB9426
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9426, 683 aa
1>>>pF1KB9426 683 - 683 aa - 683 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.1068+/-0.00156; mu= -5.1794+/- 0.089
mean_var=349.6679+/-81.130, 0's: 0 Z-trim(105.7): 662 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.068588
statistics sampled from 7796 (8546) to 7796 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.607), E-opt: 0.2 (0.263), width: 16
Scan time: 3.440
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9752.1 PRKCH gene_id:5583|Hs108|chr14 ( 683) 4721 482.7 7.3e-136
CCDS1824.1 PRKCE gene_id:5581|Hs108|chr2 ( 737) 1747 188.5 3e-47
CCDS2870.1 PRKCD gene_id:5580|Hs108|chr3 ( 676) 1505 164.5 4.6e-40
CCDS10618.1 PRKCB gene_id:5579|Hs108|chr16 ( 671) 1367 150.8 5.8e-36
CCDS11664.1 PRKCA gene_id:5578|Hs108|chr17 ( 672) 1354 149.6 1.4e-35
CCDS10619.1 PRKCB gene_id:5579|Hs108|chr16 ( 673) 1345 148.7 2.7e-35
CCDS60482.1 PRKCQ gene_id:5588|Hs108|chr10 ( 581) 1311 145.2 2.5e-34
CCDS7079.1 PRKCQ gene_id:5588|Hs108|chr10 ( 706) 1311 145.3 2.8e-34
CCDS12867.1 PRKCG gene_id:5582|Hs108|chr19 ( 697) 1284 142.6 1.8e-33
CCDS41229.1 PRKCZ gene_id:5590|Hs108|chr1 ( 409) 1193 133.4 6.3e-31
CCDS55563.1 PRKCZ gene_id:5590|Hs108|chr1 ( 488) 1193 133.5 7.1e-31
CCDS37.1 PRKCZ gene_id:5590|Hs108|chr1 ( 592) 1193 133.6 8.2e-31
CCDS42513.1 PKN1 gene_id:5585|Hs108|chr19 ( 942) 1135 128.0 6e-29
CCDS42514.1 PKN1 gene_id:5585|Hs108|chr19 ( 948) 1135 128.0 6.1e-29
CCDS81350.1 PKN2 gene_id:5586|Hs108|chr1 ( 936) 1133 127.8 6.9e-29
CCDS714.1 PKN2 gene_id:5586|Hs108|chr1 ( 984) 1133 127.9 7.1e-29
CCDS12552.1 AKT2 gene_id:208|Hs108|chr19 ( 481) 1102 124.5 3.6e-28
CCDS9994.1 AKT1 gene_id:207|Hs108|chr14 ( 480) 1097 124.0 5.1e-28
CCDS31077.1 AKT3 gene_id:10000|Hs108|chr1 ( 479) 1096 123.9 5.5e-28
CCDS31076.1 AKT3 gene_id:10000|Hs108|chr1 ( 465) 1086 122.9 1.1e-27
CCDS3212.2 PRKCI gene_id:5584|Hs108|chr3 ( 596) 1027 117.1 7.2e-26
CCDS6908.1 PKN3 gene_id:29941|Hs108|chr9 ( 889) 986 113.3 1.6e-24
CCDS13321.1 SGK2 gene_id:10110|Hs108|chr20 ( 367) 971 111.4 2.4e-24
CCDS13320.1 SGK2 gene_id:10110|Hs108|chr20 ( 427) 971 111.5 2.7e-24
CCDS5170.1 SGK1 gene_id:6446|Hs108|chr6 ( 431) 963 110.7 4.7e-24
CCDS47478.1 SGK1 gene_id:6446|Hs108|chr6 ( 445) 963 110.7 4.8e-24
CCDS47477.1 SGK1 gene_id:6446|Hs108|chr6 ( 459) 963 110.7 4.9e-24
CCDS6195.1 SGK3 gene_id:23678|Hs108|chr8 ( 496) 963 110.7 5.1e-24
CCDS47476.1 SGK1 gene_id:6446|Hs108|chr6 ( 526) 963 110.8 5.3e-24
CCDS41677.1 RPS6KB2 gene_id:6199|Hs108|chr11 ( 482) 958 110.2 7.1e-24
CCDS62271.1 RPS6KB1 gene_id:6198|Hs108|chr17 ( 451) 944 108.8 1.8e-23
CCDS62273.1 RPS6KB1 gene_id:6198|Hs108|chr17 ( 472) 944 108.8 1.8e-23
CCDS11621.1 RPS6KB1 gene_id:6198|Hs108|chr17 ( 525) 944 108.9 2e-23
CCDS73313.1 RPS6KA4 gene_id:8986|Hs108|chr11 ( 765) 884 103.1 1.6e-21
CCDS8073.1 RPS6KA4 gene_id:8986|Hs108|chr11 ( 772) 884 103.1 1.6e-21
CCDS5294.1 RPS6KA2 gene_id:6196|Hs108|chr6 ( 733) 882 102.9 1.7e-21
CCDS34570.1 RPS6KA2 gene_id:6196|Hs108|chr6 ( 741) 882 102.9 1.8e-21
CCDS83148.1 RPS6KA2 gene_id:6196|Hs108|chr6 ( 758) 882 102.9 1.8e-21
CCDS45149.1 RPS6KA5 gene_id:9252|Hs108|chr14 ( 549) 860 100.6 6.4e-21
CCDS81286.1 RPS6KA1 gene_id:6195|Hs108|chr1 ( 719) 861 100.8 7.2e-21
CCDS284.1 RPS6KA1 gene_id:6195|Hs108|chr1 ( 735) 861 100.8 7.4e-21
CCDS30649.1 RPS6KA1 gene_id:6195|Hs108|chr1 ( 744) 861 100.8 7.4e-21
CCDS9893.1 RPS6KA5 gene_id:9252|Hs108|chr14 ( 802) 860 100.7 8.4e-21
CCDS14197.1 RPS6KA3 gene_id:6197|Hs108|chrX ( 740) 857 100.4 9.7e-21
CCDS12305.1 PRKACA gene_id:5566|Hs108|chr19 ( 343) 844 98.8 1.4e-20
CCDS12304.1 PRKACA gene_id:5566|Hs108|chr19 ( 351) 844 98.8 1.4e-20
CCDS72816.1 PRKACB gene_id:5567|Hs108|chr1 ( 338) 834 97.8 2.7e-20
CCDS14451.1 RPS6KA6 gene_id:27330|Hs108|chrX ( 745) 841 98.8 2.9e-20
CCDS62272.1 RPS6KB1 gene_id:6198|Hs108|chr17 ( 502) 836 98.2 3.1e-20
CCDS83480.1 RPS6KA6 gene_id:27330|Hs108|chrX ( 745) 839 98.6 3.4e-20
>>CCDS9752.1 PRKCH gene_id:5583|Hs108|chr14 (683 aa)
initn: 4721 init1: 4721 opt: 4721 Z-score: 2552.6 bits: 482.7 E(32554): 7.3e-136
Smith-Waterman score: 4721; 100.0% identity (100.0% similar) in 683 aa overlap (1-683:1-683)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MSSGTMKFNGYLRVRIGEAVGLQPTRWSLRHSLFKKGHQLLDPYLTVSVDQVRVGQTSTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 MSSGTMKFNGYLRVRIGEAVGLQPTRWSLRHSLFKKGHQLLDPYLTVSVDQVRVGQTSTK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 QKTNKPTYNEEFCANVTDGGHLELAVFHETPLGYDHFVANCTLQFQELLRTTGASDTFEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 QKTNKPTYNEEFCANVTDGGHLELAVFHETPLGYDHFVANCTLQFQELLRTTGASDTFEG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 WVDLEPEGKVFVVITLTGSFTEATLQRDRIFKHFTRKRQRAMRRRVHQINGHKFMATYLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 WVDLEPEGKVFVVITLTGSFTEATLQRDRIFKHFTRKRQRAMRRRVHQINGHKFMATYLR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 QPTYCSHCREFIWGVFGKQGYQCQVCTCVVHKRCHHLIVTACTCQNNINKVDSKIAEQRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 QPTYCSHCREFIWGVFGKQGYQCQVCTCVVHKRCHHLIVTACTCQNNINKVDSKIAEQRF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 GINIPHKFSIHNYKVPTFCDHCGSLLWGIMRQGLQCKICKMNVHIRCQANVAPNCGVNAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 GINIPHKFSIHNYKVPTFCDHCGSLLWGIMRQGLQCKICKMNVHIRCQANVAPNCGVNAV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 ELAKTLAGMGLQPGNISPTSKLVSRSTLRRQGKESSKEGNGIGVNSSNRLGIDNFEFIRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 ELAKTLAGMGLQPGNISPTSKLVSRSTLRRQGKESSKEGNGIGVNSSNRLGIDNFEFIRV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 LGKGSFGKVMLARVKETGDLYAVKVLKKDVILQDDDVECTMTEKRILSLARNHPFLTQLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 LGKGSFGKVMLARVKETGDLYAVKVLKKDVILQDDDVECTMTEKRILSLARNHPFLTQLF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 CCFQTPDRLFFVMEFVNGGDLMFHIQKSRRFDEARARFYAAEIISALMFLHDKGIIYRDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 CCFQTPDRLFFVMEFVNGGDLMFHIQKSRRFDEARARFYAAEIISALMFLHDKGIIYRDL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 KLDNVLLDHEGHCKLADFGMCKEGICNGVTTATFCGTPDYIAPEILQEMLYGPAVDWWAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 KLDNVLLDHEGHCKLADFGMCKEGICNGVTTATFCGTPDYIAPEILQEMLYGPAVDWWAM
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB9 GVLLYEMLCGHAPFEAENEDDLFEAILNDEVVYPTWLHEDATGILKSFMTKNPTMRLGSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 GVLLYEMLCGHAPFEAENEDDLFEAILNDEVVYPTWLHEDATGILKSFMTKNPTMRLGSL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB9 TQGGEHAILRHPFFKEIDWAQLNHRQIEPPFRPRIKSREDVSNFDPDFIKEEPVLTPIDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 TQGGEHAILRHPFFKEIDWAQLNHRQIEPPFRPRIKSREDVSNFDPDFIKEEPVLTPIDE
610 620 630 640 650 660
670 680
pF1KB9 GHLPMINQDEFRNFSYVSPELQP
:::::::::::::::::::::::
CCDS97 GHLPMINQDEFRNFSYVSPELQP
670 680
>>CCDS1824.1 PRKCE gene_id:5581|Hs108|chr2 (737 aa)
initn: 2498 init1: 1394 opt: 1747 Z-score: 961.8 bits: 188.5 E(32554): 3e-47
Smith-Waterman score: 3010; 61.4% identity (82.2% similar) in 718 aa overlap (27-683:23-737)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MSSGTMKFNGYLRVRIGEAVGLQPTRWSLRHSLFKKGHQ-LLDPYLTVSVDQVRVGQTST
:::::.. . . :::::....::. :.:::.:
CCDS18 MVVFNGLLKIKICEAVSLKPTAWSLRHAVGPRPQTFLLDPYIALNVDDSRIGQTAT
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 KQKTNKPTYNEEFCANVTDGGHLELAVFHETPLGYDHFVANCTLQFQELLRTTGASDTFE
:::::.:....:: ..: .: ..::::::..:.::: ::::::.::.:::.. .: ::
CCDS18 KQKTNSPAWHDEFVTDVCNGRKIELAVFHDAPIGYDDFVANCTIQFEELLQN--GSRHFE
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 GWVDLEPEGKVFVVITLTGSFTEATLQ-RDRIFKHFTR--KRQRAMRRRVHQINGHKFMA
:.::::::.:.:.: :.:: :: . ..:.:.. : ::: :.::::::.:::::::
CCDS18 DWIDLEPEGRVYVIIDLSGSSGEAPKDNEERVFRERMRPRKRQGAVRRRVHQVNGHKFMA
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 TYLRQPTYCSHCREFIWGVFGKQGYQCQVCTCVVHKRCHHLIVTACTCQNNINKVDSKIA
:::::::::::::.:::::.:::::::::::::::::::.::.: :. .. . : ...
CCDS18 TYLRQPTYCSHCRDFIWGVIGKQGYQCQVCTCVVHKRCHELIITKCAGLKKQETPD-QVG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 EQRFGINIPHKFSIHNYKVPTFCDHCGSLLWGIMRQGLQCKICKMNVHIRCQANVAPNCG
:::..:.::::.:::::::::::::::::::..:::::::.:::::: ::..:::::::
CCDS18 SQRFSVNMPHKFGIHNYKVPTFCDHCGSLLWGLLRQGLQCKVCKMNVHRRCETNVAPNCG
240 250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KB9 VNAVELAKTLAGMGLQPGNI-----------------------SPTSKLVSRST------
:.: .::.:: .:. : .: ::. . :.:.
CCDS18 VDARGIAKVLADLGVTPDKITNSGQRRKKLIAGAESPQPASGSSPSEEDRSKSAPTSPCD
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360
pF1KB9 ---------LRR------QGKE----SSKEG-------NG-IGVNSSNRLGIDNFEFIRV
.:. .:.: :: .: :: . ....:::.:.:.::.:
CCDS18 QEIKELENNIRKALSFDNRGEEHRAASSPDGQLMSPGENGEVRQGQAKRLGLDEFNFIKV
360 370 380 390 400 410
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 LGKGSFGKVMLARVKETGDLYAVKVLKKDVILQDDDVECTMTEKRILSLARNHPFLTQLF
::::::::::::..: ..:::::::::::::::::.:::::::::.:::.::.::::.
CCDS18 LGKGSFGKVMLAELKGKDEVYAVKVLKKDVILQDDDVDCTMTEKRILALARKHPYLTQLY
420 430 440 450 460 470
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 CCFQTPDRLFFVMEFVNGGDLMFHIQKSRRFDEARARFYAAEIISALMFLHDKGIIYRDL
::::: ::::::::.::::::::.::.::.::: :.::::::. :::::::..:.:::::
CCDS18 CCFQTKDRLFFVMEYVNGGDLMFQIQRSRKFDEPRSRFYAAEVTSALMFLHQHGVIYRDL
480 490 500 510 520 530
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 KLDNVLLDHEGHCKLADFGMCKEGICNGVTTATFCGTPDYIAPEILQEMLYGPAVDWWAM
::::.::: :::::::::::::::: :::::.::::::::::::::::. :::.:::::.
CCDS18 KLDNILLDAEGHCKLADFGMCKEGILNGVTTTTFCGTPDYIAPEILQELEYGPSVDWWAL
540 550 560 570 580 590
550 560 570 580 590 600
pF1KB9 GVLLYEMLCGHAPFEAENEDDLFEAILNDEVVYPTWLHEDATGILKSFMTKNPTMRLGSL
:::.:::. :. ::::.:::::::.::.:.:.::.:: ..:..:::.:::::: ::: .
CCDS18 GVLMYEMMAGQPPFEADNEDDLFESILHDDVLYPVWLSKEAVSILKAFMTKNPHKRLGCV
600 610 620 630 640 650
610 620 630 640 650
pF1KB9 -TQGGEHAILRHPFFKEIDWAQLNHRQIEPPFRPRIKSREDVSNFDPDFIKEEPVLTPID
.:.:: :: .:::::::::. :....:.:::.::::...::.::: :: .:::::: .:
CCDS18 ASQNGEDAIKQHPFFKEIDWVLLEQKKIKPPFKPRIKTKRDVNNFDQDFTREEPVLTLVD
660 670 680 690 700 710
660 670 680
pF1KB9 EGHLPMINQDEFRNFSYVSPELQP
:. . .:::.::..::: . .:.:
CCDS18 EAIVKQINQEEFKGFSYFGEDLMP
720 730
>>CCDS2870.1 PRKCD gene_id:5580|Hs108|chr3 (676 aa)
initn: 1733 init1: 1078 opt: 1505 Z-score: 832.8 bits: 164.5 E(32554): 4.6e-40
Smith-Waterman score: 1907; 44.8% identity (74.3% similar) in 643 aa overlap (55-682:41-671)
30 40 50 60 70 80
pF1KB9 TRWSLRHSLFKKGHQLLDPYLTVSVDQVRVGQTSTKQK-TNKPTYNEEFCANVTDGGHLE
:.: ...: : : .. : :.. .: ..
CCDS28 SYELGSLQAEDEANQPFCAVKMKEALSTERGKTLVQKKPTMYPEWKSTFDAHIYEGRVIQ
20 30 40 50 60 70
90 100 110 120 130 140
pF1KB9 LAVFHETPLGYDHFVANCTLQFQELLRTTGASDTFEGWVDLEPEGKVFVVIT--LTGSFT
..... . .. ... .. .. ...: . : :.::.:..::.. . :
CCDS28 IVLMRAAEEPVSEVTVGVSVLAERCKKNNGKA---EFWLDLQPQAKVLMSVQYFLEDVDC
80 90 100 110 120
150 160 170 180 190 200
pF1KB9 EATLQRDRIFKHFTRKRQRAMRR-RVHQINGHKFMATYLRQPTYCSHCREFIWGVFGKQG
. ... . : : .:. :... ..: :..:.:.::.. :::.:: :..:.::. .:::
CCDS28 KQSMRSEDEAKFPTMNRRGAIKQAKIHYIKNHEFIATFFGQPTFCSVCKDFVWGL-NKQG
130 140 150 160 170 180
210 220 230 240 250 260
pF1KB9 YQCQVCTCVVHKRCHHLIVTACTCQNNINKVDSKIAEQRFGINIPHKFSIHNYKVPTFCD
:.:. :. ..::.: :. :: . :. :. . ..::.:..::.:..::: :::::
CCDS28 YKCRQCNAAIHKKCIDKIIGRCT-GTAANSRDTIFQKERFNIDMPHRFKVHNYMSPTFCD
190 200 210 220 230 240
270 280 290 300 310 320
pF1KB9 HCGSLLWGIMRQGLQCKICKMNVHIRCQANVAPNCGVNAVELAKTLAGMGLQPGNISPTS
::::::::...:::.:. : :::: .:. .:: ::.: ::..: . . . : ..
CCDS28 HCGSLLWGLVKQGLKCEDCGMNVHHKCREKVANLCGINQKLLAEALNQVTQRASRRSDSA
250 260 270 280 290 300
330 340 350 360
pF1KB9 KLVSRSTLRRQG--KESSKEGNGIGVNS---------SNRLGIDNFEFIRVLGKGSFGKV
. :. . :: :... :. . :: :.. .:.:: : .::::::::::
CCDS28 S--SEPVGIYQGFEKKTGVAGEDMQDNSGTYGKIWEGSSKCNINNFIFHKVLGKGSFGKV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 MLARVKETGDLYAVKVLKKDVILQDDDVECTMTEKRILSLARNHPFLTQLFCCFQTPDRL
.:...: :. .:.:.:::::.: ::::::::.:::.:.:: ..::::.:.: ::: :.:
CCDS28 LLGELKGRGEYFAIKALKKDVVLIDDDVECTMVEKRVLTLAAENPFLTHLICTFQTKDHL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 FFVMEFVNGGDLMFHIQKSRRFDEARARFYAAEIISALMFLHDKGIIYRDLKLDNVLLDH
::::::.::::::.::: . ::. :: ::::::. .:.:::.::::::::::::::::.
CCDS28 FFVMEFLNGGDLMYHIQDKGRFELYRATFYAAEIMCGLQFLHSKGIIYRDLKLDNVLLDR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 EGHCKLADFGMCKEGICNGVTTATFCGTPDYIAPEILQEMLYGPAVDWWAMGVLLYEMLC
.:: :.::::::::.: . ..::::::::::::::: . : .::::..::::::::
CCDS28 DGHIKIADFGMCKENIFGESRASTFCGTPDYIAPEILQGLKYTFSVDWWSFGVLLYEMLI
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB9 GHAPFEAENEDDLFEAILNDEVVYPTWLHEDATGILKSFMTKNPTMRLGSLTQGGEHAIL
:..::....::.:::.: : :: :. ... ::.... ..:: ::: :. :
CCDS28 GQSPFHGDDEDELFESIRVDTPHYPRWITKESKDILEKLFEREPTKRLGVT---GNIKI-
550 560 570 580 590
610 620 630 640 650 660
pF1KB9 RHPFFKEIDWAQLNHRQIEPPFRPRIKSREDVSNFDPDFIKEEPVLTPIDEGHLPMINQD
::::: :.:. :..:..::::::..:: .: :::: .:..:. :. :.. . ..:.
CCDS28 -HPFFKTINWTLLEKRRLEPPFRPKVKSPRDYSNFDQEFLNEKARLSYSDKNLIDSMDQS
600 610 620 630 640 650
670 680
pF1KB9 EFRNFSYVSPELQP
: .::.:.:...
CCDS28 AFAGFSFVNPKFEHLLED
660 670
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130 140 150 160 170 180
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:. :.:.. ::....::: : ...:::.::
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:: .:::: :::::.::::: :::::::.... .: .. :. .. :
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::.::.:. :::::::::::.:...::..: : :::: :: :: ::.. .:
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::.:. : ::. .. : : :..
CCDS10 YIQAHIDRDVLIVLVRDAKNLVPMDPNGLSDPYVKLKLIPDPKSESKQKTKTIKCSLNPE
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330
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:.: : :::.: :
CCDS10 WNETFRFQLKESDKDRRLSVEIWDWDLTSRNDFMGSLSFGISELQKASVDGWFKLLSQEE
230 240 250 260 270 280
340 350
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:. ..: :..:: . . .:
CCDS10 GEYFNVPVPPEGSEANEELRQKFERAKISQGTKVPEEKTTNTVSKFDNNGNRDRMKLTDF
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.:. ::::::::::::.. : : .:::::.:::::..:::::::::.:::.:.: . ::
CCDS10 NFLMVLGKGSFGKVMLSERKGTDELYAVKILKKDVVIQDDDVECTMVEKRVLALPGKPPF
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:::: :::: :::.::::.:::::::.:::. :: : .: :::::: .:.::..:::
CCDS10 LTQLHSCFQTMDRLYFVMEYVNGGDLMYHIQQVGRFKEPHAVFYAAEIAIGLFFLQSKGI
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pF1KB9 IYRDLKLDNVLLDHEGHCKLADFGMCKEGICNGVTTATFCGTPDYIAPEILQEMLYGPAV
::::::::::.:: ::: :.::::::::.: .:::: :::::::::::::. . :: .:
CCDS10 IYRDLKLDNVMLDSEGHIKIADFGMCKENIWDGVTTKTFCGTPDYIAPEIIAYQPYGKSV
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pF1KB9 DWWAMGVLLYEMLCGHAPFEAENEDDLFEAILNDEVVYPTWLHEDATGILKSFMTKNPTM
::::.:::::::: :.::::.:.::.::..:.. .:.:: . ..:..: :..:::.:
CCDS10 DWWAFGVLLYEMLAGQAPFEGEDEDELFQSIMEHNVAYPKSMSKEAVAICKGLMTKHPGK
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pF1KB9 RLGSLTQGGEHAILRHPFFKEIDWAQLNHRQIEPPFRPRIKSREDVSNFDPDFIKEEPVL
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CCDS10 RLGCGPEG-ERDIKEHAFFRYIDWEKLERKEIQPPYKPKARDKRDTSNFDKEFTRQPVEL
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pF1KB9 TPIDEGHLPMINQDEFRNFSYVSPELQP
:: :. . ..:.:: .:::..::.
CCDS10 TPTDKLFIMNLDQNEFAGFSYTNPEFVINV
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..: ..: . ..:.:: :.:.. ::...
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CCDS11 DHKFIARFFKQPTFCSHCTDFIWG-FGKQGFQCQVCCFVVHKRCHEFVTFSCPGADKGPD
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pF1KB9 VDSKIAEQRFGINIPHKFSIHNYKVPTFCDHCGSLLWGIMRQGLQCKICKMNVHIRCQAN
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CCDS11 TDDPRSK--------HKFKIHTYGSPTFCDHCGSLLYGLIHQGMKCDTCDMNVHKQCVIN
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: ::.. .: ::.: : ::. : :
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pF1KB9 ISPTSKLVSRSTLRRQGKES----------------------------------------
: . . :::: : .::
CCDS11 ESKQKTKTIRSTLNPQWNESFTFKLKPSDKDRRLSVEIWDWDRTTRNDFMGSLSFGVSEL
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pF1KB9 ---------------------------SKEGN---------------GIGV---------
..::: : :
CCDS11 MKMPASGWYKLLNQEEGEYYNVPIPEGDEEGNMELRQKFEKAKLGPAGNKVISPSEDRKQ
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pF1KB9 --NSSNRLGIDNFEFIRVLGKGSFGKVMLARVKETGDLYAVKVLKKDVILQDDDVECTMT
:. .:. . .:.:. ::::::::::::: : : .:::.:.:::::..:::::::::.
CCDS11 PSNNLDRVKLTDFNFLMVLGKGSFGKVMLADRKGTEELYAIKILKKDVVIQDDDVECTMV
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:::.:.: . :::::: :::: :::.::::.:::::::.:::. .: : .: :::::
CCDS11 EKRVLALLDKPPFLTQLHSCFQTVDRLYFVMEYVNGGDLMYHIQQVGKFKEPQAVFYAAE
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: .:.::: .::::::::::::.:: ::: :.:::::::: . .:::: ::::::::::
CCDS11 ISIGLFFLHKRGIIYRDLKLDNVMLDSEGHIKIADFGMCKEHMMDGVTTRTFCGTPDYIA
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CCDS11 PEIIAYQPYGKSVDWWAYGVLLYEMLAGQPPFDGEDEDELFQSIMEHNVSYPKSLSKEAV
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.. :..:::.:. ::: .: :. . .: ::..::: .:..:.:.:::.:.. .. .
CCDS11 SVCKGLMTKHPAKRLGCGPEG-ERDVREHAFFRRIDWEKLENREIQPPFKPKVCGK-GAE
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::: : . .::::: :. . :.:..:..::::.:..
CCDS11 NFDKFFTRGQPVLTPPDQLVIANIDQSDFEGFSYVNPQFVHPILQSAV
630 640 650 660 670
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pF1KB9 HCREFIWGVFGKQGYQCQVCTCVVHKRCHHLIVTACTCQNNINKVDSKIAEQRFGINIPH
:: .:::: :::::.::::: :::::::.... .: .. :. .. :
CCDS10 HCTDFIWG-FGKQGFQCQVCCFVVHKRCHEFVTFSCPGADKGPASDDPRSK--------H
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pF1KB9 KFSIHNYKVPTFCDHCGSLLWGIMRQGLQCKICKMNVHIRCQANVAPNCGVNAVEL----
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CCDS10 KFKIHTYSSPTFCDHCGSLLYGLIHQGMKCDTCMMNVHKRCVMNVPSLCGTDHTERRGRI
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pF1KB9 -----------------AKTLAGM---GLQPGNIS----PTSKLVSRS------------
::.:. : ::. .. : : :..
CCDS10 YIQAHIDRDVLIVLVRDAKNLVPMDPNGLSDPYVKLKLIPDPKSESKQKTKTIKCSLNPE
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330
pF1KB9 ---TLRRQGKESSK---------------------------------------------E
:.: : :::.: :
CCDS10 WNETFRFQLKESDKDRRLSVEIWDWDLTSRNDFMGSLSFGISELQKASVDGWFKLLSQEE
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pF1KB9 GNGIGV-----------------------------------------NSSNR--LGIDNF
:. ..: :..:: . . .:
CCDS10 GEYFNVPVPPEGSEANEELRQKFERAKISQGTKVPEEKTTNTVSKFDNNGNRDRMKLTDF
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pF1KB9 EFIRVLGKGSFGKVMLARVKETGDLYAVKVLKKDVILQDDDVECTMTEKRILSLARNHPF
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CCDS10 NFLMVLGKGSFGKVMLSERKGTDELYAVKILKKDVVIQDDDVECTMVEKRVLALPGKPPF
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pF1KB9 LTQLFCCFQTPDRLFFVMEFVNGGDLMFHIQKSRRFDEARARFYAAEIISALMFLHDKGI
:::: :::: :::.::::.:::::::.:::. :: : .: :::::: .:.::..:::
CCDS10 LTQLHSCFQTMDRLYFVMEYVNGGDLMYHIQQVGRFKEPHAVFYAAEIAIGLFFLQSKGI
410 420 430 440 450 460
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pF1KB9 IYRDLKLDNVLLDHEGHCKLADFGMCKEGICNGVTTATFCGTPDYIAPEILQEMLYGPAV
::::::::::.:: ::: :.::::::::.: .:::: :::::::::::::. . :: .:
CCDS10 IYRDLKLDNVMLDSEGHIKIADFGMCKENIWDGVTTKTFCGTPDYIAPEIIAYQPYGKSV
470 480 490 500 510 520
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pF1KB9 DWWAMGVLLYEMLCGHAPFEAENEDDLFEAILNDEVVYPTWLHEDATGILKSFMTKNPTM
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CCDS10 DWWAFGVLLYEMLAGQAPFEGEDEDELFQSIMEHNVAYPKSMSKEAVAICKGLMTKHPGK
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pF1KB9 RLGSLTQGGEHAILRHPFFKEIDWAQLNHRQIEPPFRPRIKSREDVSNFDPDFIKEEPVL
::: .: :. : .: ::. ::: .:....:.::..:. .: .. ::: : .. :::
CCDS10 RLGCGPEG-ERDIKEHAFFRYIDWEKLERKEIQPPYKPKACGR-NAENFDRFFTRHPPVL
590 600 610 620 630 640
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pF1KB9 TPIDEGHLPMINQDEFRNFSYVSPE-LQP
:: :. . :.:.::..::.:. : :.:
CCDS10 TPPDQEVIRNIDQSEFEGFSFVNSEFLKPEVKS
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pF1KB9 EGKVFVVITLTGSFTEATLQRDRIFKHFTRKRQRAMRR-RVHQINGHKFMATYLRQPTYC
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CCDS60 MDTKDMNEFETEGFFALHQRRGAIKQAKVHHVKCHEFTATFFPQPTFC
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pF1KB9 SHCREFIWGVFGKQGYQCQVCTCVVHKRCHHLIVTACTCQNNINKVDSKIAEQRFGINIP
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CCDS60 SVCHEFVWGL-NKQGYQCRQCNAAIHKKCIDKVIAKCT-GSAINSRETMFHKERFKIDMP
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pF1KB9 HKFSIHNYKVPTFCDHCGSLLWGIMRQGLQCKICKMNVHIRCQANVAPNCGVNAVELAKT
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CCDS60 HRFKVYNYKSPTFCEHCGTLLWGLARQGLKCDACGMNVHHRCQTKVANLCGINQKLMAEA
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pF1KB9 LAGM-GLQPGNISPTSKLVSRS---------TLRRQGKE------SSKEGNGIGVNS---
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CCDS60 LAMIESTQQARCLRDTEQIFREGPVEIGLPCSIKNEARPPCLPTPGKREPQGISWESPLD
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pF1KB9 --------------------SNRLGIDNFEFIRVLGKGSFGKVMLARVKETGDLYAVKVL
. .: :..: . ..:::::::::.::. :.:....:.:.:
CCDS60 EVDKMCHLPEPELNKERPSLQIKLKIEDFILHKMLGKGSFGKVFLAEFKKTNQFFAIKAL
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CCDS60 KKDVVLMDDDVECTMVEKRVLSLAWEHPFLTHMFCTFQTKENLFFVMEYLNGGDLMYHIQ
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pF1KB9 KSRRFDEARARFYAAEIISALMFLHDKGIIYRDLKLDNVLLDHEGHCKLADFGMCKEGIC
. ..:: .:: ::::::: .:.:::.:::.::::::::.:::..:: :.::::::::..
CCDS60 SCHKFDLSRATFYAAEIILGLQFLHSKGIVYRDLKLDNILLDKDGHIKIADFGMCKENML
350 360 370 380 390 400
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pF1KB9 NGVTTATFCGTPDYIAPEILQEMLYGPAVDWWAMGVLLYEMLCGHAPFEAENEDDLFEAI
. . : :::::::::::::: . :. .::::..:::::::: :..::....:..::..:
CCDS60 GDAKTNTFCGTPDYIAPEILLGQKYNHSVDWWSFGVLLYEMLIGQSPFHGQDEEELFHSI
410 420 430 440 450 460
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pF1KB9 LNDEVVYPTWLHEDATGILKSFMTKNPTMRLGSLTQGGEHAILRHPFFKEIDWAQLNHRQ
:. :: ::...: .: ......: ::: ..: : .::.:.::.: .:....
CCDS60 RMDNPFYPRWLEKEAKDLLVKLFVREPEKRLG--VRGD---IRQHPLFREINWEELERKE
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pF1KB9 IEPPFRPRIKSREDVSNFDPDFIKEEPVLTPIDEGHLPMINQDEFRNFSYVSPELQP
:.:::::..:: : :::: .:..:.: :. :.. . ..:. :::::...: ..
CCDS60 IDPPFRPKVKSPFDCSNFDKEFLNEKPRLSFADRALINSMDQNMFRNFSFMNPGMERLIS
530 540 550 560 570 580
>>CCDS7079.1 PRKCQ gene_id:5588|Hs108|chr10 (706 aa)
initn: 1759 init1: 1049 opt: 1311 Z-score: 728.8 bits: 145.3 E(32554): 2.8e-34
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pF1KB9 YLRVRIGEAVGLQPTRWSLRHSLFKKGHQLLDPYLTVSVDQV---RVGQTSTKQK-TNKP
..:: .: : . . :: ..: : :
CCDS70 MSPFLRIGLSNFDCGSCQSCQGEAVNPYCAVLVKEYVESENGQMYIQKKPTMYP
10 20 30 40 50
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pF1KB9 TYNEEFCANVTDGGHLELAVFHETPLGYDHFVANCTLQFQELL-RTTGASDTFEGWVDLE
.. : :... : ... : .. : .... :... : : . : :..:.
CCDS70 PWDSTFDAHINKGRVMQIIVKGKN---VD-LISETTVELYSLAERCRKNNGKTEIWLELK
60 70 80 90 100 110
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pF1KB9 PEGKVFV----VITLTGSFTEATLQRDRIFKHFTRKRQRAMRR-RVHQINGHKFMATYLR
:.:.... . .. . .. . .: ..:. :... .::... :.: ::..
CCDS70 PQGRMLMNARYFLEMSDTKDMNEFETEGFFA--LHQRRGAIKQAKVHHVKCHEFTATFFP
120 130 140 150 160
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pF1KB9 QPTYCSHCREFIWGVFGKQGYQCQVCTCVVHKRCHHLIVTACTCQNNINKVDSKIAEQRF
:::.:: :.::.::. .::::::. :. ..::.: ... :: . ::. .. . ..::
CCDS70 QPTFCSVCHEFVWGL-NKQGYQCRQCNAAIHKKCIDKVIAKCT-GSAINSRETMFHKERF
170 180 190 200 210 220
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pF1KB9 GINIPHKFSIHNYKVPTFCDHCGSLLWGIMRQGLQCKICKMNVHIRCQANVAPNCGVNAV
:..::.:...::: ::::.:::.::::. ::::.: : :::: :::..:: ::.:
CCDS70 KIDMPHRFKVYNYKSPTFCEHCGTLLWGLARQGLKCDACGMNVHHRCQTKVANLCGINQK
230 240 250 260 270 280
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pF1KB9 ELAKTLAGM-GLQPGNISPTSKLVSRS---------TLRRQGKE------SSKEGNGIGV
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CCDS70 ERLIS
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CCDS12 -ENFDKFFTRAAPALTPPDRLVLASIDQADFQGFTYVNPDFVHPDARSPTSPVPVPVM
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]