Result of FASTA (omim) for
pF1KB9458
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9458, 837 aa
1>>>pF1KB9458 837 - 837 aa - 837 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.7112+/-0.000423; mu= 4.5371+/- 0.026
mean_var=173.0879+/-34.923, 0's: 0 Z-trim(117.3): 63 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.097486
statistics sampled from 29080 (29143) to 29080 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.686), E-opt: 0.2 (0.342), width: 16
Scan time: 12.830
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_542437 (OMIM: 602076) transient receptor potent ( 839) 4545 652.1 2.9e-186
NP_542435 (OMIM: 602076) transient receptor potent ( 839) 4545 652.1 2.9e-186
NP_061197 (OMIM: 602076) transient receptor potent ( 839) 4545 652.1 2.9e-186
NP_542436 (OMIM: 602076) transient receptor potent ( 839) 4545 652.1 2.9e-186
NP_001170902 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18 ( 837) 2201 322.5 5e-87
NP_067638 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18409 ( 871) 2201 322.5 5.2e-87
XP_005253975 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18 ( 871) 2201 322.5 5.2e-87
XP_016875263 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18 ( 871) 2201 322.5 5.2e-87
XP_011536932 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18 ( 922) 2201 322.5 5.5e-87
XP_005256733 (OMIM: 606676) PREDICTED: transient r ( 763) 2024 297.6 1.5e-79
NP_057197 (OMIM: 606676) transient receptor potent ( 764) 2023 297.4 1.6e-79
XP_006721604 (OMIM: 606676) PREDICTED: transient r ( 733) 2013 296.0 4.1e-79
XP_011522224 (OMIM: 606676) PREDICTED: transient r ( 719) 1929 284.2 1.5e-75
XP_011536936 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18 ( 793) 1872 276.2 4.1e-73
NP_001170899 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18 ( 824) 1862 274.8 1.1e-72
XP_011536933 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18 ( 875) 1862 274.8 1.2e-72
XP_016880219 (OMIM: 606676) PREDICTED: transient r ( 679) 1780 263.2 2.8e-69
XP_006721606 (OMIM: 606676) PREDICTED: transient r ( 680) 1779 263.1 3.1e-69
XP_011536937 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18 ( 695) 1570 233.7 2.2e-60
XP_005256735 (OMIM: 606676) PREDICTED: transient r ( 548) 1382 207.2 1.7e-52
XP_016880221 (OMIM: 606676) PREDICTED: transient r ( 585) 1378 206.6 2.6e-52
XP_011522225 (OMIM: 606676) PREDICTED: transient r ( 531) 1376 206.3 2.9e-52
XP_016880220 (OMIM: 606676) PREDICTED: transient r ( 629) 1377 206.5 3e-52
XP_005256734 (OMIM: 606676) PREDICTED: transient r ( 630) 1376 206.4 3.4e-52
NP_659505 (OMIM: 607066,614594,616400) transient r ( 790) 1352 203.1 4.2e-51
NP_001245134 (OMIM: 607066,614594,616400) transien ( 791) 1352 203.1 4.2e-51
XP_011536938 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18 ( 603) 1298 195.4 6.5e-49
NP_001170904 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18 ( 764) 1280 192.9 4.6e-48
XP_011536935 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18 ( 815) 1280 192.9 4.9e-48
XP_011522227 (OMIM: 606676) PREDICTED: transient r ( 334) 942 145.2 4.6e-34
NP_671737 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18409 ( 811) 728 115.3 1.1e-24
XP_011536934 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18 ( 862) 728 115.3 1.2e-24
NP_062815 (OMIM: 606679) transient receptor potent ( 729) 519 85.9 7.3e-16
NP_061116 (OMIM: 606680) transient receptor potent ( 765) 513 85.0 1.4e-15
>>NP_542437 (OMIM: 602076) transient receptor potential (839 aa)
initn: 4545 init1: 4545 opt: 4545 Z-score: 3465.0 bits: 652.1 E(85289): 2.9e-186
Smith-Waterman score: 4550; 88.5% identity (91.8% similar) in 809 aa overlap (47-837:35-839)
20 30 40 50 60 70
pF1KB9 RPRAAPGSLGRVTRRRLSRWIALTRKVSWTPARPSQSALLSPSR--GQ---ETAPPVPGC
::.:. :. : .: :. : : :: :
NP_542 SSTDLGAAADPLQKDTCPDPLDGDPNSRPPPAKPQLSTAKSRTRLFGKGDSEEAFPVD-C
10 20 30 40 50 60
80 90 100 110
pF1KB9 ---------CPR-TLSPPAP-RRPSGSMIAGVSLKPLLRITARIWRACCSSCRRA--RST
:: :.:: .:: :. .:. : ..: .. ::. ...
NP_542 PHEEGELDSCPTITVSPVITIQRP-GDGPTGARLLSQDSVAASTEKTLRLYDRRSIFEAV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 SQTTSSKVAPALGSGRAPALACPDPPLCLSDPETGKTCLLKAMLNLHDGQNTTIPLLLEI
.:.. . . : . : . .::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 AQNNCQDLESLLLFLQKSKKHLTDNEF--KDPETGKTCLLKAMLNLHDGQNTTIPLLLEI
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 ARQTDSLKELVNASYTDSYYKGQTALHIAIERRNMALVTLLVENGADVQAAAHGDFFKKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 ARQTDSLKELVNASYTDSYYKGQTALHIAIERRNMALVTLLVENGADVQAAAHGDFFKKT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 KGRPGFYFGELPLSLAACTNQLGIVKFLLQNSWQTADISARDSVGNTVLHALVEVADNTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 KGRPGFYFGELPLSLAACTNQLGIVKFLLQNSWQTADISARDSVGNTVLHALVEVADNTA
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 DNTKFVTSMYNEILILGAKLHPTLKLEELTNKKGMTPLALAAGTGKIGVLAYILQREIQE
::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 DNTKFVTSMYNEILMLGAKLHPTLKLEELTNKKGMTPLALAAGTGKIGVLAYILQREIQE
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB9 PECRHLSRKFTEWAYGPVHSSLYDLSCIDTCEKNSVLEVIAYSSSETPNRHDMLLVEPLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 PECRHLSRKFTEWAYGPVHSSLYDLSCIDTCEKNSVLEVIAYSSSETPNRHDMLLVEPLN
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KB9 RLLQDKWDRFVKRIFYFNFLVYCLYMIIFTMAAYYRPVDGLPPFKMEKTGDYFRVTGEIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 RLLQDKWDRFVKRIFYFNFLVYCLYMIIFTMAAYYRPVDGLPPFKMEKTGDYFRVTGEIL
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KB9 SVLGGVYFFFRGIQYFLQRRPSMKTLFVDSYSEMLFFLQSLFMLATVVLYFSHLKEYVAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 SVLGGVYFFFRGIQYFLQRRPSMKTLFVDSYSEMLFFLQSLFMLATVVLYFSHLKEYVAS
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KB9 MVFSLALGWTNMLYYTRGFQQMGIYAVMIEKMILRDLCRFMFVYIVFLFGFSTAVVTLIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 MVFSLALGWTNMLYYTRGFQQMGIYAVMIEKMILRDLCRFMFVYIVFLFGFSTAVVTLIE
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KB9 DGKNDSLPSESTSHRWRGPACRPPDSSYNSLYSTCLELFKFTIGMGDLEFTENYDFKAVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 DGKNDSLPSESTSHRWRGPACRPPDSSYNSLYSTCLELFKFTIGMGDLEFTENYDFKAVF
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700 710
pF1KB9 IILLLAYVILTYILLLNMLIALMGETVNKIAQESKNIWKLQRAITILDTEKSFLKCMRKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 IILLLAYVILTYILLLNMLIALMGETVNKIAQESKNIWKLQRAITILDTEKSFLKCMRKA
670 680 690 700 710 720
720 730 740 750 760 770
pF1KB9 FRSGKLLQVGYTPDGKDDYRWCFRVDEVNWTTWNTNVGIINEDPGNCEGVKRTLSFSLRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 FRSGKLLQVGYTPDGKDDYRWCFRVDEVNWTTWNTNVGIINEDPGNCEGVKRTLSFSLRS
730 740 750 760 770 780
780 790 800 810 820 830
pF1KB9 SRVSGRHWKNFALVPLLREASARDRQSAQPEEVYLRQFSGSLKPEDAEVFKSPAASGEK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 SRVSGRHWKNFALVPLLREASARDRQSAQPEEVYLRQFSGSLKPEDAEVFKSPAASGEK
790 800 810 820 830
>>NP_542435 (OMIM: 602076) transient receptor potential (839 aa)
initn: 4545 init1: 4545 opt: 4545 Z-score: 3465.0 bits: 652.1 E(85289): 2.9e-186
Smith-Waterman score: 4550; 88.5% identity (91.8% similar) in 809 aa overlap (47-837:35-839)
20 30 40 50 60 70
pF1KB9 RPRAAPGSLGRVTRRRLSRWIALTRKVSWTPARPSQSALLSPSR--GQ---ETAPPVPGC
::.:. :. : .: :. : : :: :
NP_542 SSTDLGAAADPLQKDTCPDPLDGDPNSRPPPAKPQLSTAKSRTRLFGKGDSEEAFPVD-C
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80 90 100 110
pF1KB9 ---------CPR-TLSPPAP-RRPSGSMIAGVSLKPLLRITARIWRACCSSCRRA--RST
:: :.:: .:: :. .:. : ..: .. ::. ...
NP_542 PHEEGELDSCPTITVSPVITIQRP-GDGPTGARLLSQDSVAASTEKTLRLYDRRSIFEAV
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120 130 140 150 160 170
pF1KB9 SQTTSSKVAPALGSGRAPALACPDPPLCLSDPETGKTCLLKAMLNLHDGQNTTIPLLLEI
.:.. . . : . : . .::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 AQNNCQDLESLLLFLQKSKKHLTDNEF--KDPETGKTCLLKAMLNLHDGQNTTIPLLLEI
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180 190 200 210 220 230
pF1KB9 ARQTDSLKELVNASYTDSYYKGQTALHIAIERRNMALVTLLVENGADVQAAAHGDFFKKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 ARQTDSLKELVNASYTDSYYKGQTALHIAIERRNMALVTLLVENGADVQAAAHGDFFKKT
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240 250 260 270 280 290
pF1KB9 KGRPGFYFGELPLSLAACTNQLGIVKFLLQNSWQTADISARDSVGNTVLHALVEVADNTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 KGRPGFYFGELPLSLAACTNQLGIVKFLLQNSWQTADISARDSVGNTVLHALVEVADNTA
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pF1KB9 DNTKFVTSMYNEILILGAKLHPTLKLEELTNKKGMTPLALAAGTGKIGVLAYILQREIQE
::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 DNTKFVTSMYNEILMLGAKLHPTLKLEELTNKKGMTPLALAAGTGKIGVLAYILQREIQE
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360 370 380 390 400 410
pF1KB9 PECRHLSRKFTEWAYGPVHSSLYDLSCIDTCEKNSVLEVIAYSSSETPNRHDMLLVEPLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 PECRHLSRKFTEWAYGPVHSSLYDLSCIDTCEKNSVLEVIAYSSSETPNRHDMLLVEPLN
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pF1KB9 RLLQDKWDRFVKRIFYFNFLVYCLYMIIFTMAAYYRPVDGLPPFKMEKTGDYFRVTGEIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 RLLQDKWDRFVKRIFYFNFLVYCLYMIIFTMAAYYRPVDGLPPFKMEKTGDYFRVTGEIL
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pF1KB9 SVLGGVYFFFRGIQYFLQRRPSMKTLFVDSYSEMLFFLQSLFMLATVVLYFSHLKEYVAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 SVLGGVYFFFRGIQYFLQRRPSMKTLFVDSYSEMLFFLQSLFMLATVVLYFSHLKEYVAS
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pF1KB9 MVFSLALGWTNMLYYTRGFQQMGIYAVMIEKMILRDLCRFMFVYIVFLFGFSTAVVTLIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 MVFSLALGWTNMLYYTRGFQQMGIYAVMIEKMILRDLCRFMFVYIVFLFGFSTAVVTLIE
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pF1KB9 DGKNDSLPSESTSHRWRGPACRPPDSSYNSLYSTCLELFKFTIGMGDLEFTENYDFKAVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 DGKNDSLPSESTSHRWRGPACRPPDSSYNSLYSTCLELFKFTIGMGDLEFTENYDFKAVF
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700 710
pF1KB9 IILLLAYVILTYILLLNMLIALMGETVNKIAQESKNIWKLQRAITILDTEKSFLKCMRKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 IILLLAYVILTYILLLNMLIALMGETVNKIAQESKNIWKLQRAITILDTEKSFLKCMRKA
670 680 690 700 710 720
720 730 740 750 760 770
pF1KB9 FRSGKLLQVGYTPDGKDDYRWCFRVDEVNWTTWNTNVGIINEDPGNCEGVKRTLSFSLRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 FRSGKLLQVGYTPDGKDDYRWCFRVDEVNWTTWNTNVGIINEDPGNCEGVKRTLSFSLRS
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pF1KB9 SRVSGRHWKNFALVPLLREASARDRQSAQPEEVYLRQFSGSLKPEDAEVFKSPAASGEK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 SRVSGRHWKNFALVPLLREASARDRQSAQPEEVYLRQFSGSLKPEDAEVFKSPAASGEK
790 800 810 820 830
>>NP_061197 (OMIM: 602076) transient receptor potential (839 aa)
initn: 4545 init1: 4545 opt: 4545 Z-score: 3465.0 bits: 652.1 E(85289): 2.9e-186
Smith-Waterman score: 4550; 88.5% identity (91.8% similar) in 809 aa overlap (47-837:35-839)
20 30 40 50 60 70
pF1KB9 RPRAAPGSLGRVTRRRLSRWIALTRKVSWTPARPSQSALLSPSR--GQ---ETAPPVPGC
::.:. :. : .: :. : : :: :
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10 20 30 40 50 60
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pF1KB9 ---------CPR-TLSPPAP-RRPSGSMIAGVSLKPLLRITARIWRACCSSCRRA--RST
:: :.:: .:: :. .:. : ..: .. ::. ...
NP_061 PHEEGELDSCPTITVSPVITIQRP-GDGPTGARLLSQDSVAASTEKTLRLYDRRSIFEAV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 SQTTSSKVAPALGSGRAPALACPDPPLCLSDPETGKTCLLKAMLNLHDGQNTTIPLLLEI
.:.. . . : . : . .::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 AQNNCQDLESLLLFLQKSKKHLTDNEF--KDPETGKTCLLKAMLNLHDGQNTTIPLLLEI
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 ARQTDSLKELVNASYTDSYYKGQTALHIAIERRNMALVTLLVENGADVQAAAHGDFFKKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 ARQTDSLKELVNASYTDSYYKGQTALHIAIERRNMALVTLLVENGADVQAAAHGDFFKKT
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pF1KB9 KGRPGFYFGELPLSLAACTNQLGIVKFLLQNSWQTADISARDSVGNTVLHALVEVADNTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 KGRPGFYFGELPLSLAACTNQLGIVKFLLQNSWQTADISARDSVGNTVLHALVEVADNTA
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pF1KB9 DNTKFVTSMYNEILILGAKLHPTLKLEELTNKKGMTPLALAAGTGKIGVLAYILQREIQE
::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 DNTKFVTSMYNEILMLGAKLHPTLKLEELTNKKGMTPLALAAGTGKIGVLAYILQREIQE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 PECRHLSRKFTEWAYGPVHSSLYDLSCIDTCEKNSVLEVIAYSSSETPNRHDMLLVEPLN
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 RLLQDKWDRFVKRIFYFNFLVYCLYMIIFTMAAYYRPVDGLPPFKMEKTGDYFRVTGEIL
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pF1KB9 SVLGGVYFFFRGIQYFLQRRPSMKTLFVDSYSEMLFFLQSLFMLATVVLYFSHLKEYVAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 SVLGGVYFFFRGIQYFLQRRPSMKTLFVDSYSEMLFFLQSLFMLATVVLYFSHLKEYVAS
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540 550 560 570 580 590
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 MVFSLALGWTNMLYYTRGFQQMGIYAVMIEKMILRDLCRFMFVYIVFLFGFSTAVVTLIE
550 560 570 580 590 600
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pF1KB9 DGKNDSLPSESTSHRWRGPACRPPDSSYNSLYSTCLELFKFTIGMGDLEFTENYDFKAVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 IILLLAYVILTYILLLNMLIALMGETVNKIAQESKNIWKLQRAITILDTEKSFLKCMRKA
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NP_061 SRVSGRHWKNFALVPLLREASARDRQSAQPEEVYLRQFSGSLKPEDAEVFKSPAASGEK
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:: :.:: .:: :. .:. : ..: .. ::. ...
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.:.. . . : . : . .::::::::::::::::::::::::::::::
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NP_542 DGKNDSLPSESTSHRWRGPACRPPDSSYNSLYSTCLELFKFTIGMGDLEFTENYDFKAVF
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NP_542 IILLLAYVILTYILLLNMLIALMGETVNKIAQESKNIWKLQRAITILDTEKSFLKCMRKA
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NP_542 SRVSGRHWKNFALVPLLREASARDRQSAQPEEVYLRQFSGSLKPEDAEVFKSPAASGEK
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pF1KB9 SQTTSSKVAPALGSGRAPALACPDPPLCLSDPETGKTCLLKAMLNLHDGQNTTIPLLLEI
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. . ::::::: .::::::.::::::: .::: :. ::::...:.: . :::.:: :::
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..... :: ::: .:. :... :....::.:. ..:.:. :........::.. .. :
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.: :::.:.::: : ::.:::.. : :..::.:....:: ::..::..:..:...:.:.
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:.. : .. .:. .. :.:: :: ... . :.:::.::::::::. .
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pF1KB9 FKAVFIILLLAYVILTYILLLNMLIALMGETVNKIAQESKNIWKLQRAITILDTEKSFLK
. .::::::..:.:::..::::::::::::::.....:::.::::: : :::: :.::
NP_001 YPVVFIILLVTYIILTFVLLLNMLIALMGETVGQVSKESKHIWKLQWATTILDIERSFPV
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pF1KB9 CMRKAFRSGKLLQVGYTPDGKDDYRWCFRVDEVNWTTWNTNVGIINEDPGNCEGVKRTLS
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NP_001 FLRKAFRSGEMVTVGKSSDGTPDRRWCFRVDEVNWSHWNQNLGIINEDPGKNETYQY-YG
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:: .:. .:.. .:: . : . ....:.::
NP_001 FSHTVGRLRRDRWSS--VVPRVVELN----KNSNPDEVVVPLDSMGNPRCDGHQQGYPRK
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pF1KB9 SGEK
NP_001 WRTDDAPL
830
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pF1KB9 ADNTKFVTSMYNEILILGAKLHPTLKLEELTNKKGMTPLALAAGTGKIGVLAYILQREIQ
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pF1KB9 EPECRHLSRKFTEWAYGPVHSSLYDLSCIDTC-EKNSVLEVIAYSSSETPNRHDMLLVEP
. . ::::::: .::::::.::::::: .::: :. ::::...:.: . :::.:: :::
NP_067 DEDTRHLSRKFKDWAYGPVYSSLYDLSSLDTCGEEASVLEILVYNS-KIENRHEMLAVEP
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pF1KB9 LNRLLQDKWDRFVKRIFYFNFLVYCLYMIIFTMAAYYRPVDGLPPFKMEKTGDYFRVTGE
.:.::.::: .: ::.: . : :.:::..:::.:..: ::. .. : ::.:..::
NP_067 INELLRDKWRKFGAVSFYINVVSYLCAMVIFTLTAYYQPLEGTPPYPYRTTVDYLRLAGE
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pF1KB9 ILSVLGGVYFFFRGIQ-YFLQRRPSMKTLFVDSYSEMLFFLQSLFMLATVVLYFSHLKEY
..... :: ::: .:. :... :....::.:. ..:.:. :........::.. .. :
NP_067 VITLFTGVLFFFTNIKDLFMKKCPGVNSLFIDGSFQLLYFIYSVLVIVSAALYLAGIEAY
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540 550 560 570 580 590
pF1KB9 VASMVFSLALGWTNMLYYTRGFQQMGIYAVMIEKMILRDLCRFMFVYIVFLFGFSTAVVT
.: :::.:.::: : ::.:::.. : :..::.:....:: ::..::..:..:...:.:.
NP_067 LAVMVFALVLGWMNALYFTRGLKLTGTYSIMIQKILFKDLFRFLLVYLLFMIGYASALVS
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pF1KB9 LIEDGKNDSLPSESTSHRW--RGPACRPPDSSYNSLYSTCLELFKFTIGMGDLEFTENYD
:.. : .. .:. .. :.:: :: ... . :.:::.::::::::. .
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pF1KB9 FKAVFIILLLAYVILTYILLLNMLIALMGETVNKIAQESKNIWKLQRAITILDTEKSFLK
. .::::::..:.:::..::::::::::::::.....:::.::::: : :::: :.::
NP_067 YPVVFIILLVTYIILTFVLLLNMLIALMGETVGQVSKESKHIWKLQWATTILDIERSFPV
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pF1KB9 CMRKAFRSGKLLQVGYTPDGKDDYRWCFRVDEVNWTTWNTNVGIINEDPGNCEGVKRTLS
.:::::::... :: . :: : :::::::::::. :: :.::::::::. : . .
NP_067 FLRKAFRSGEMVTVGKSSDGTPDRRWCFRVDEVNWSHWNQNLGIINEDPGKNETYQY-YG
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pF1KB9 FSLRSSRVSGRHWKNFALVPLLREASARDRQSAQPEEVYLRQFSGSLKPEDAEVFKSPAA
:: .:. .:.. .:: . : . ....:.::
NP_067 FSHTVGRLRRDRWSS--VVPRVVELN----KNSNPDEVVVPLDSMGNPRCDGHQQGYPRK
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pF1KB9 SGEK
NP_067 WRTDDAPL
870
>>XP_005253975 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,184095 (871 aa)
initn: 1910 init1: 1236 opt: 2201 Z-score: 1683.1 bits: 322.5 E(85289): 5.2e-87
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pF1KB9 SQTTSSKVAPALGSGRAPALACPDPPLCLSDPETGKTCLLKAMLNLHDGQNTTIPLLLEI
.: :::::: ::.::: .:.: :::.::.:
XP_005 IVSRGSTADLDGLLPFLLTHKKRLTDEEFREPSTGKTCLPKALLNLSNGRNDTIPVLLDI
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pF1KB9 ARQTDSLKELVNASYTDSYYKGQTALHIAIERRNMALVTLLVENGADVQAAAHGDFFKKT
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XP_005 AERTGNMREFINSPFRDIYYRGQTALHIAIERRCKHYVELLVAQGADVHAQARGRFFQP-
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pF1KB9 KGRPG-FYFGELPLSLAACTNQLGIVKFLLQNSWQTADISARDSVGNTVLHALVEVADNT
: . : :::::::::::::::: ::..: .: . ::. .:: ::::::::: .::::
XP_005 KDEGGYFYFGELPLSLAACTNQPHIVNYLTENPHKKADMRRQDSRGNTVLHALVAIADNT
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pF1KB9 ADNTKFVTSMYNEILILGAKLHPTLKLEELTNKKGMTPLALAAGTGKIGVLAYILQREIQ
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XP_005 RENTKFVTKMYDLLLLKCARLFPDSNLEAVLNNDGLSPLMMAAKTGKIGIFQHIIRREVT
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360 370 380 390 400 410
pF1KB9 EPECRHLSRKFTEWAYGPVHSSLYDLSCIDTC-EKNSVLEVIAYSSSETPNRHDMLLVEP
. . ::::::: .::::::.::::::: .::: :. ::::...:.: . :::.:: :::
XP_005 DEDTRHLSRKFKDWAYGPVYSSLYDLSSLDTCGEEASVLEILVYNS-KIENRHEMLAVEP
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420 430 440 450 460 470
pF1KB9 LNRLLQDKWDRFVKRIFYFNFLVYCLYMIIFTMAAYYRPVDGLPPFKMEKTGDYFRVTGE
.:.::.::: .: ::.: . : :.:::..:::.:..: ::. .. : ::.:..::
XP_005 INELLRDKWRKFGAVSFYINVVSYLCAMVIFTLTAYYQPLEGTPPYPYRTTVDYLRLAGE
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pF1KB9 ILSVLGGVYFFFRGIQ-YFLQRRPSMKTLFVDSYSEMLFFLQSLFMLATVVLYFSHLKEY
..... :: ::: .:. :... :....::.:. ..:.:. :........::.. .. :
XP_005 VITLFTGVLFFFTNIKDLFMKKCPGVNSLFIDGSFQLLYFIYSVLVIVSAALYLAGIEAY
520 530 540 550 560 570
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pF1KB9 VASMVFSLALGWTNMLYYTRGFQQMGIYAVMIEKMILRDLCRFMFVYIVFLFGFSTAVVT
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XP_005 LAVMVFALVLGWMNALYFTRGLKLTGTYSIMIQKILFKDLFRFLLVYLLFMIGYASALVS
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pF1KB9 LIEDGKNDSLPSESTSHRW--RGPACRPPDSSYNSLYSTCLELFKFTIGMGDLEFTENYD
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XP_005 LLNPCANMKVCNEDQTNCTVPTYPSCR--DS--ETFSTFLLDLFKLTIGMGDLEMLSSTK
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pF1KB9 SGEK
XP_016 WRTDDAPL
870
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pF1KB9 SGEK
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920
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:
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837 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 23:31:03 2016 done: Thu Nov 3 23:31:05 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]