Result of FASTA (omim) for
pF1KB9461
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9461, 558 aa
1>>>pF1KB9461 558 - 558 aa - 558 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0174+/-0.000449; mu= 20.4388+/- 0.028
mean_var=72.4159+/-14.221, 0's: 0 Z-trim(109.9): 42 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.150715
statistics sampled from 18137 (18179) to 18137 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.578), E-opt: 0.2 (0.213), width: 16
Scan time: 8.840
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_056999 (OMIM: 182600,606439,613708) atlastin-1 ( 558) 3676 809.3 0
NP_001121185 (OMIM: 182600,606439,613708) atlastin ( 553) 3625 798.2 0
NP_853629 (OMIM: 182600,606439,613708) atlastin-1 ( 553) 3625 798.2 0
NP_001317388 (OMIM: 609368) atlastin-2 isoform 5 [ ( 566) 2561 566.8 6.3e-161
NP_001317391 (OMIM: 609368) atlastin-2 isoform 7 [ ( 579) 2561 566.8 6.4e-161
NP_001317392 (OMIM: 609368) atlastin-2 isoform 8 [ ( 584) 2561 566.8 6.4e-161
XP_016860176 (OMIM: 609368) PREDICTED: atlastin-2 ( 530) 2556 565.7 1.3e-160
XP_011531322 (OMIM: 609368) PREDICTED: atlastin-2 ( 530) 2556 565.7 1.3e-160
XP_016860175 (OMIM: 609368) PREDICTED: atlastin-2 ( 530) 2556 565.7 1.3e-160
NP_071769 (OMIM: 609368) atlastin-2 isoform 1 [Hom ( 579) 2540 562.3 1.5e-159
NP_001295005 (OMIM: 609368) atlastin-2 isoform 3 [ ( 565) 2517 557.3 4.8e-158
NP_001129145 (OMIM: 609368) atlastin-2 isoform 2 [ ( 583) 2517 557.3 4.9e-158
NP_001276977 (OMIM: 609369,615632) atlastin-3 isof ( 523) 2262 501.8 2.2e-141
NP_056274 (OMIM: 609369,615632) atlastin-3 isoform ( 541) 2262 501.8 2.3e-141
NP_001317390 (OMIM: 609368) atlastin-2 isoform 6 [ ( 413) 1995 443.6 5.5e-124
NP_001317389 (OMIM: 609368) atlastin-2 isoform 6 [ ( 413) 1995 443.6 5.5e-124
NP_001317387 (OMIM: 609368) atlastin-2 isoform 4 [ ( 412) 1951 434.1 4.2e-121
XP_011531325 (OMIM: 609368) PREDICTED: atlastin-2 ( 357) 1672 373.4 6.9e-103
NP_001317393 (OMIM: 609368) atlastin-2 isoform 9 [ ( 356) 1628 363.8 5.2e-100
XP_006718556 (OMIM: 609369,615632) PREDICTED: atla ( 522) 1399 314.1 6.8e-85
XP_006721636 (OMIM: 601237) PREDICTED: RING finger ( 615) 350 86.1 3.5e-16
XP_006721634 (OMIM: 601237) PREDICTED: RING finger ( 639) 350 86.1 3.6e-16
XP_006721635 (OMIM: 601237) PREDICTED: RING finger ( 638) 346 85.2 6.6e-16
NP_009079 (OMIM: 601237) RING finger protein 112 [ ( 631) 324 80.5 1.8e-14
NP_004111 (OMIM: 600412) guanylate-binding protein ( 591) 181 49.3 3.9e-05
NP_443174 (OMIM: 611467) guanylate-binding protein ( 586) 160 44.8 0.00093
NP_001127958 (OMIM: 611467) guanylate-binding prot ( 586) 160 44.8 0.00093
NP_060754 (OMIM: 600413) guanylate-binding protein ( 595) 155 43.7 0.002
XP_016856502 (OMIM: 600413) PREDICTED: guanylate-b ( 461) 149 42.3 0.0041
NP_001306109 (OMIM: 600413) guanylate-binding prot ( 461) 149 42.3 0.0041
NP_001306110 (OMIM: 600413) guanylate-binding prot ( 544) 149 42.4 0.0046
XP_006710637 (OMIM: 600413) PREDICTED: guanylate-b ( 568) 149 42.4 0.0048
>>NP_056999 (OMIM: 182600,606439,613708) atlastin-1 isof (558 aa)
initn: 3676 init1: 3676 opt: 3676 Z-score: 4320.5 bits: 809.3 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 3676; 100.0% identity (100.0% similar) in 558 aa overlap (1-558:1-558)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MAKNRRDRNSWGGFSEKTYEWSSEEEEPVKKAGPVQVLIVKDDHSFELDETALNRILLSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 MAKNRRDRNSWGGFSEKTYEWSSEEEEPVKKAGPVQVLIVKDDHSFELDETALNRILLSE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 AVRDKEVVAVSVAGAFRKGKSFLMDFMLRYMYNQESVDWVGDYNEPLTGFSWRGGSERET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 AVRDKEVVAVSVAGAFRKGKSFLMDFMLRYMYNQESVDWVGDYNEPLTGFSWRGGSERET
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 TGIQIWSEIFLINKPDGKKVAVLLMDTQGTFDSQSTLRDSATVFALSTMISSIQVYNLSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 TGIQIWSEIFLINKPDGKKVAVLLMDTQGTFDSQSTLRDSATVFALSTMISSIQVYNLSQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 NVQEDDLQHLQLFTEYGRLAMEETFLKPFQSLIFLVRDWSFPYEFSYGADGGAKFLEKRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 NVQEDDLQHLQLFTEYGRLAMEETFLKPFQSLIFLVRDWSFPYEFSYGADGGAKFLEKRL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 KVSGNQHEELQNVRKHIHSCFTNISCFLLPHPGLKVATNPNFDGKLKEIDDEFIKNLKIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 KVSGNQHEELQNVRKHIHSCFTNISCFLLPHPGLKVATNPNFDGKLKEIDDEFIKNLKIL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 IPWLLSPESLDIKEINGNKITCRGLVEYFKAYIKIYQGEELPHPKSMLQATAEANNLAAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 IPWLLSPESLDIKEINGNKITCRGLVEYFKAYIKIYQGEELPHPKSMLQATAEANNLAAV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 ATAKDTYNKKMEEICGGDKPFLAPNDLQTKHLQLKEESVKLFRGVKKMGGEEFSRRYLQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 ATAKDTYNKKMEEICGGDKPFLAPNDLQTKHLQLKEESVKLFRGVKKMGGEEFSRRYLQQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 LESEIDELYIQYIKHNDSKNIFHAARTPATLFVVIFITYVIAGVTGFIGLDIIASLCNMI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 LESEIDELYIQYIKHNDSKNIFHAARTPATLFVVIFITYVIAGVTGFIGLDIIASLCNMI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 MGLTLITLCTWAYIRYSGEYRELGAVIDQVAAALWDQGSTNEALYKLYSAAATHRHLYHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 MGLTLITLCTWAYIRYSGEYRELGAVIDQVAAALWDQGSTNEALYKLYSAAATHRHLYHQ
490 500 510 520 530 540
550
pF1KB9 AFPTPKSESTEQSEKKKM
::::::::::::::::::
NP_056 AFPTPKSESTEQSEKKKM
550
>>NP_001121185 (OMIM: 182600,606439,613708) atlastin-1 i (553 aa)
initn: 3412 init1: 3412 opt: 3625 Z-score: 4260.6 bits: 798.2 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 3625; 99.1% identity (99.1% similar) in 558 aa overlap (1-558:1-553)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MAKNRRDRNSWGGFSEKTYEWSSEEEEPVKKAGPVQVLIVKDDHSFELDETALNRILLSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MAKNRRDRNSWGGFSEKTYEWSSEEEEPVKKAGPVQVLIVKDDHSFELDETALNRILLSE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 AVRDKEVVAVSVAGAFRKGKSFLMDFMLRYMYNQESVDWVGDYNEPLTGFSWRGGSERET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AVRDKEVVAVSVAGAFRKGKSFLMDFMLRYMYNQESVDWVGDYNEPLTGFSWRGGSERET
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 TGIQIWSEIFLINKPDGKKVAVLLMDTQGTFDSQSTLRDSATVFALSTMISSIQVYNLSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TGIQIWSEIFLINKPDGKKVAVLLMDTQGTFDSQSTLRDSATVFALSTMISSIQVYNLSQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 NVQEDDLQHLQLFTEYGRLAMEETFLKPFQSLIFLVRDWSFPYEFSYGADGGAKFLEKRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NVQEDDLQHLQLFTEYGRLAMEETFLKPFQSLIFLVRDWSFPYEFSYGADGGAKFLEKRL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 KVSGNQHEELQNVRKHIHSCFTNISCFLLPHPGLKVATNPNFDGKLKEIDDEFIKNLKIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KVSGNQHEELQNVRKHIHSCFTNISCFLLPHPGLKVATNPNFDGKLKEIDDEFIKNLKIL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 IPWLLSPESLDIKEINGNKITCRGLVEYFKAYIKIYQGEELPHPKSMLQATAEANNLAAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IPWLLSPESLDIKEINGNKITCRGLVEYFKAYIKIYQGEELPHPKSMLQATAEANNLAAV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 ATAKDTYNKKMEEICGGDKPFLAPNDLQTKHLQLKEESVKLFRGVKKMGGEEFSRRYLQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ATAKDTYNKKMEEICGGDKPFLAPNDLQTKHLQLKEESVKLFRGVKKMGGEEFSRRYLQQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 LESEIDELYIQYIKHNDSKNIFHAARTPATLFVVIFITYVIAGVTGFIGLDIIASLCNMI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LESEIDELYIQYIKHNDSKNIFHAARTPATLFVVIFITYVIAGVTGFIGLDIIASLCNMI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 MGLTLITLCTWAYIRYSGEYRELGAVIDQVAAALWDQGSTNEALYKLYSAAATHRHLYHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::
NP_001 MGLTLITLCTWAYIRYSGEYRELGAVIDQVAAALWDQ-----ALYKLYSAAATHRHLYHQ
490 500 510 520 530
550
pF1KB9 AFPTPKSESTEQSEKKKM
::::::::::::::::::
NP_001 AFPTPKSESTEQSEKKKM
540 550
>>NP_853629 (OMIM: 182600,606439,613708) atlastin-1 isof (553 aa)
initn: 3412 init1: 3412 opt: 3625 Z-score: 4260.6 bits: 798.2 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 3625; 99.1% identity (99.1% similar) in 558 aa overlap (1-558:1-553)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MAKNRRDRNSWGGFSEKTYEWSSEEEEPVKKAGPVQVLIVKDDHSFELDETALNRILLSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_853 MAKNRRDRNSWGGFSEKTYEWSSEEEEPVKKAGPVQVLIVKDDHSFELDETALNRILLSE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 AVRDKEVVAVSVAGAFRKGKSFLMDFMLRYMYNQESVDWVGDYNEPLTGFSWRGGSERET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_853 AVRDKEVVAVSVAGAFRKGKSFLMDFMLRYMYNQESVDWVGDYNEPLTGFSWRGGSERET
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 TGIQIWSEIFLINKPDGKKVAVLLMDTQGTFDSQSTLRDSATVFALSTMISSIQVYNLSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_853 TGIQIWSEIFLINKPDGKKVAVLLMDTQGTFDSQSTLRDSATVFALSTMISSIQVYNLSQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 NVQEDDLQHLQLFTEYGRLAMEETFLKPFQSLIFLVRDWSFPYEFSYGADGGAKFLEKRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_853 NVQEDDLQHLQLFTEYGRLAMEETFLKPFQSLIFLVRDWSFPYEFSYGADGGAKFLEKRL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 KVSGNQHEELQNVRKHIHSCFTNISCFLLPHPGLKVATNPNFDGKLKEIDDEFIKNLKIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_853 KVSGNQHEELQNVRKHIHSCFTNISCFLLPHPGLKVATNPNFDGKLKEIDDEFIKNLKIL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 IPWLLSPESLDIKEINGNKITCRGLVEYFKAYIKIYQGEELPHPKSMLQATAEANNLAAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_853 IPWLLSPESLDIKEINGNKITCRGLVEYFKAYIKIYQGEELPHPKSMLQATAEANNLAAV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 ATAKDTYNKKMEEICGGDKPFLAPNDLQTKHLQLKEESVKLFRGVKKMGGEEFSRRYLQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_853 ATAKDTYNKKMEEICGGDKPFLAPNDLQTKHLQLKEESVKLFRGVKKMGGEEFSRRYLQQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 LESEIDELYIQYIKHNDSKNIFHAARTPATLFVVIFITYVIAGVTGFIGLDIIASLCNMI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_853 LESEIDELYIQYIKHNDSKNIFHAARTPATLFVVIFITYVIAGVTGFIGLDIIASLCNMI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 MGLTLITLCTWAYIRYSGEYRELGAVIDQVAAALWDQGSTNEALYKLYSAAATHRHLYHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::
NP_853 MGLTLITLCTWAYIRYSGEYRELGAVIDQVAAALWDQ-----ALYKLYSAAATHRHLYHQ
490 500 510 520 530
550
pF1KB9 AFPTPKSESTEQSEKKKM
::::::::::::::::::
NP_853 AFPTPKSESTEQSEKKKM
540 550
>>NP_001317388 (OMIM: 609368) atlastin-2 isoform 5 [Homo (566 aa)
initn: 2506 init1: 2506 opt: 2561 Z-score: 3010.1 bits: 566.8 E(85289): 6.3e-161
Smith-Waterman score: 2561; 68.3% identity (89.7% similar) in 533 aa overlap (26-557:34-564)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MAKNRRDRNSWGGFSEKTYEWSSEEEEPVKKAGPVQVLIV-KDDHSFELDETALN
.: .:: :::.... .:::.::::: ::.
NP_001 KKGIKFFQRLINSKSLRFGENYEDDDLVNSDEVMKKPCPVQIVLAHEDDHNFELDEEALE
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 RILLSEAVRDKEVVAVSVAGAFRKGKSFLMDFMLRYMYNQESVDWVGDYNEPLTGFSWRG
.:::.: .:: ..:.::::::::::::::.:::::::::..: .:.: :::::::.:::
NP_001 QILLQEHIRDLNIVVVSVAGAFRKGKSFLLDFMLRYMYNKDSQSWIGGNNEPLTGFTWRG
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 GSERETTGIQIWSEIFLINKPDGKKVAVLLMDTQGTFDSQSTLRDSATVFALSTMISSIQ
: ::::::::.:.:.:.:..:.: :::::::::::.::::::..: ::::::::: ::.:
NP_001 GCERETTGIQVWNEVFVIDRPNGTKVAVLLMDTQGAFDSQSTIKDCATVFALSTMTSSVQ
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 VYNLSQNVQEDDLQHLQLFTEYGRLAMEETFLKPFQSLIFLVRDWSFPYEFSYGADGGAK
:::::::.::::::::::::::::::::: . ::::.:.::.::::.::: ::: .:: .
NP_001 VYNLSQNIQEDDLQHLQLFTEYGRLAMEEIYQKPFQTLMFLIRDWSYPYEHSYGLEGGKQ
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 FLEKRLKVSGNQHEELQNVRKHIHSCFTNISCFLLPHPGLKVATNPNFDGKLKEIDDEFI
::::::.:. ::::::::::::::.::.:..:::::::::::::::.:::.::.::..:
NP_001 FLEKRLQVKQNQHEELQNVRKHIHNCFSNLGCFLLPHPGLKVATNPSFDGRLKDIDEDFK
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 KNLKILIPWLLSPESLDIKEINGNKITCRGLVEYFKAYIKIYQGEELPHPKSMLQATAEA
..:. :.: ::.::.: :::.:.:.::: ::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RELRNLVPLLLAPENLVEKEISGSKVTCRDLVEYFKAYIKIYQGEELPHPKSMLQATAEA
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB9 NNLAAVATAKDTYNKKMEEICGGDKPFLAPNDLQTKHLQLKEESVKLFRGVKKMGGEEFS
::::::: :.::: :.::..::::::..::.::. :::.::: ..: ::.::::::.::
NP_001 NNLAAVAGARDTYCKSMEQVCGGDKPYIAPSDLERKHLDLKEVAIKQFRSVKKMGGDEFC
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KB9 RRYLQQLESEIDELYIQYIKHNDSKNIFHAARTPATLFVVIFITYVIAGVTGFIGLDIIA
::: .:::.::.: : ..:::::.::::.:::::::::.:.: :.:.:.::::::. ::
NP_001 RRYQDQLEAEIEETYANFIKHNDGKNIFYAARTPATLFAVMFAMYIISGLTGFIGLNSIA
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KB9 SLCNMIMGLTLITLCTWAYIRYSGEYRELGAVIDQVAAALWDQGSTNEALYKLYSAAATH
:::..:::.:: ::::::..::::.::.:.::::.: .::.: : ... ::. .:.
NP_001 VLCNLVMGLALIFLCTWAYVKYSGEFREIGTVIDQIAETLWEQRSPRKVFSKLFE--VTR
490 500 510 520 530 540
540 550
pF1KB9 RHLYHQAFPTPKSESTEQSEKKKM
:.. :.:. . . . ....::
NP_001 RRMVHRALSSAQRQRLSSNNNKKKN
550 560
>>NP_001317391 (OMIM: 609368) atlastin-2 isoform 7 [Homo (579 aa)
initn: 2506 init1: 2506 opt: 2561 Z-score: 3010.0 bits: 566.8 E(85289): 6.4e-161
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10 20 30 40 50
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.: .:: :::.... .:::.::::: ::.
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.:::.: .:: ..:.::::::::::::::.:::::::::..: .:.: :::::::.:::
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: ::::::::.:.:.:.:..:.: :::::::::::.::::::..: ::::::::: ::.:
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::::::.:. ::::::::::::::.::.:..:::::::::::::::.:::.::.::..:
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..:. :.: ::.::.: :::.:.:.::: ::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::: :.::: :.::..::::::..::.::. :::.::: ..: ::.::::::.::
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540 550
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:.. :.:. . . . ....::
NP_001 RRMVHRALSSAQRQRLSSNNNKKKN
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>>NP_001317392 (OMIM: 609368) atlastin-2 isoform 8 [Homo (584 aa)
initn: 2506 init1: 2506 opt: 2561 Z-score: 3010.0 bits: 566.8 E(85289): 6.4e-161
Smith-Waterman score: 2561; 68.3% identity (89.7% similar) in 533 aa overlap (26-557:52-582)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MAKNRRDRNSWGGFSEKTYEWSSEEEEPVKKAGPVQVLIV-KDDHSFELDETALN
.: .:: :::.... .:::.::::: ::.
NP_001 RTSDPSAAVNHVSSTTSLGENYEDDDLVNSDEVMKKPCPVQIVLAHEDDHNFELDEEALE
30 40 50 60 70 80
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 RILLSEAVRDKEVVAVSVAGAFRKGKSFLMDFMLRYMYNQESVDWVGDYNEPLTGFSWRG
.:::.: .:: ..:.::::::::::::::.:::::::::..: .:.: :::::::.:::
NP_001 QILLQEHIRDLNIVVVSVAGAFRKGKSFLLDFMLRYMYNKDSQSWIGGNNEPLTGFTWRG
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120 130 140 150 160 170
pF1KB9 GSERETTGIQIWSEIFLINKPDGKKVAVLLMDTQGTFDSQSTLRDSATVFALSTMISSIQ
: ::::::::.:.:.:.:..:.: :::::::::::.::::::..: ::::::::: ::.:
NP_001 GCERETTGIQVWNEVFVIDRPNGTKVAVLLMDTQGAFDSQSTIKDCATVFALSTMTSSVQ
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180 190 200 210 220 230
pF1KB9 VYNLSQNVQEDDLQHLQLFTEYGRLAMEETFLKPFQSLIFLVRDWSFPYEFSYGADGGAK
:::::::.::::::::::::::::::::: . ::::.:.::.::::.::: ::: .:: .
NP_001 VYNLSQNIQEDDLQHLQLFTEYGRLAMEEIYQKPFQTLMFLIRDWSYPYEHSYGLEGGKQ
210 220 230 240 250 260
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 FLEKRLKVSGNQHEELQNVRKHIHSCFTNISCFLLPHPGLKVATNPNFDGKLKEIDDEFI
::::::.:. ::::::::::::::.::.:..:::::::::::::::.:::.::.::..:
NP_001 FLEKRLQVKQNQHEELQNVRKHIHNCFSNLGCFLLPHPGLKVATNPSFDGRLKDIDEDFK
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300 310 320 330 340 350
pF1KB9 KNLKILIPWLLSPESLDIKEINGNKITCRGLVEYFKAYIKIYQGEELPHPKSMLQATAEA
..:. :.: ::.::.: :::.:.:.::: ::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RELRNLVPLLLAPENLVEKEISGSKVTCRDLVEYFKAYIKIYQGEELPHPKSMLQATAEA
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360 370 380 390 400 410
pF1KB9 NNLAAVATAKDTYNKKMEEICGGDKPFLAPNDLQTKHLQLKEESVKLFRGVKKMGGEEFS
::::::: :.::: :.::..::::::..::.::. :::.::: ..: ::.::::::.::
NP_001 NNLAAVAGARDTYCKSMEQVCGGDKPYIAPSDLERKHLDLKEVAIKQFRSVKKMGGDEFC
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420 430 440 450 460 470
pF1KB9 RRYLQQLESEIDELYIQYIKHNDSKNIFHAARTPATLFVVIFITYVIAGVTGFIGLDIIA
::: .:::.::.: : ..:::::.::::.:::::::::.:.: :.:.:.::::::. ::
NP_001 RRYQDQLEAEIEETYANFIKHNDGKNIFYAARTPATLFAVMFAMYIISGLTGFIGLNSIA
450 460 470 480 490 500
480 490 500 510 520 530
pF1KB9 SLCNMIMGLTLITLCTWAYIRYSGEYRELGAVIDQVAAALWDQGSTNEALYKLYSAAATH
:::..:::.:: ::::::..::::.::.:.::::.: .::.: : ... ::. .:.
NP_001 VLCNLVMGLALIFLCTWAYVKYSGEFREIGTVIDQIAETLWEQRSPRKVFSKLFE--VTR
510 520 530 540 550
540 550
pF1KB9 RHLYHQAFPTPKSESTEQSEKKKM
:.. :.:. . . . ....::
NP_001 RRMVHRALSSAQRQRLSSNNNKKKN
560 570 580
>>XP_016860176 (OMIM: 609368) PREDICTED: atlastin-2 isof (530 aa)
initn: 2506 init1: 2506 opt: 2556 Z-score: 3004.7 bits: 565.7 E(85289): 1.3e-160
Smith-Waterman score: 2556; 68.5% identity (89.8% similar) in 530 aa overlap (29-557:1-528)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MAKNRRDRNSWGGFSEKTYEWSSEEEEPVKKAGPVQVLIV-KDDHSFELDETALNRILLS
.:: :::.... .:::.::::: ::..:::.
XP_016 MKKPCPVQIVLAHEDDHNFELDEEALEQILLQ
10 20 30
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 EAVRDKEVVAVSVAGAFRKGKSFLMDFMLRYMYNQESVDWVGDYNEPLTGFSWRGGSERE
: .:: ..:.::::::::::::::.:::::::::..: .:.: :::::::.:::: :::
XP_016 EHIRDLNIVVVSVAGAFRKGKSFLLDFMLRYMYNKDSQSWIGGNNEPLTGFTWRGGCERE
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:::::.:.:.:.:..:.: :::::::::::.::::::..: ::::::::: ::.::::::
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pF1KB9 QNVQEDDLQHLQLFTEYGRLAMEETFLKPFQSLIFLVRDWSFPYEFSYGADGGAKFLEKR
::.::::::::::::::::::::: . ::::.:.::.::::.::: ::: .:: .:::::
XP_016 QNIQEDDLQHLQLFTEYGRLAMEEIYQKPFQTLMFLIRDWSYPYEHSYGLEGGKQFLEKR
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 LKVSGNQHEELQNVRKHIHSCFTNISCFLLPHPGLKVATNPNFDGKLKEIDDEFIKNLKI
:.:. ::::::::::::::.::.:..:::::::::::::::.:::.::.::..: ..:.
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220 230 240 250 260 270
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:.: ::.::.: :::.:.:.::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LVPLLLAPENLVEKEISGSKVTCRDLVEYFKAYIKIYQGEELPHPKSMLQATAEANNLAA
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pF1KB9 VATAKDTYNKKMEEICGGDKPFLAPNDLQTKHLQLKEESVKLFRGVKKMGGEEFSRRYLQ
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XP_016 VAGARDTYCKSMEQVCGGDKPYIAPSDLERKHLDLKEVAIKQFRSVKKMGGDEFCRRYQD
340 350 360 370 380 390
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:::.::.: : ..:::::.::::.:::::::::.:.: :.:.:.::::::. :: :::.
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XP_016 VMGLALIFLCTWAYVKYSGEFREIGTVIDQIAETLWEQRSPRKVFSKLFE--VTRRRMVH
460 470 480 490 500 510
540 550
pF1KB9 QAFPTPKSESTEQSEKKKM
.:. . . . ....::
XP_016 RALSSAQRQRLSSNNNKKKN
520 530
>>XP_011531322 (OMIM: 609368) PREDICTED: atlastin-2 isof (530 aa)
initn: 2506 init1: 2506 opt: 2556 Z-score: 3004.7 bits: 565.7 E(85289): 1.3e-160
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10 20 30 40 50
pF1KB9 MAKNRRDRNSWGGFSEKTYEWSSEEEEPVKKAGPVQVLIV-KDDHSFELDETALNRILLS
.:: :::.... .:::.::::: ::..:::.
XP_011 MKKPCPVQIVLAHEDDHNFELDEEALEQILLQ
10 20 30
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 EAVRDKEVVAVSVAGAFRKGKSFLMDFMLRYMYNQESVDWVGDYNEPLTGFSWRGGSERE
: .:: ..:.::::::::::::::.:::::::::..: .:.: :::::::.:::: :::
XP_011 EHIRDLNIVVVSVAGAFRKGKSFLLDFMLRYMYNKDSQSWIGGNNEPLTGFTWRGGCERE
40 50 60 70 80 90
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pF1KB9 TTGIQIWSEIFLINKPDGKKVAVLLMDTQGTFDSQSTLRDSATVFALSTMISSIQVYNLS
:::::.:.:.:.:..:.: :::::::::::.::::::..: ::::::::: ::.::::::
XP_011 TTGIQVWNEVFVIDRPNGTKVAVLLMDTQGAFDSQSTIKDCATVFALSTMTSSVQVYNLS
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pF1KB9 QNVQEDDLQHLQLFTEYGRLAMEETFLKPFQSLIFLVRDWSFPYEFSYGADGGAKFLEKR
::.::::::::::::::::::::: . ::::.:.::.::::.::: ::: .:: .:::::
XP_011 QNIQEDDLQHLQLFTEYGRLAMEEIYQKPFQTLMFLIRDWSYPYEHSYGLEGGKQFLEKR
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 LKVSGNQHEELQNVRKHIHSCFTNISCFLLPHPGLKVATNPNFDGKLKEIDDEFIKNLKI
:.:. ::::::::::::::.::.:..:::::::::::::::.:::.::.::..: ..:.
XP_011 LQVKQNQHEELQNVRKHIHNCFSNLGCFLLPHPGLKVATNPSFDGRLKDIDEDFKRELRN
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pF1KB9 LIPWLLSPESLDIKEINGNKITCRGLVEYFKAYIKIYQGEELPHPKSMLQATAEANNLAA
:.: ::.::.: :::.:.:.::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LVPLLLAPENLVEKEISGSKVTCRDLVEYFKAYIKIYQGEELPHPKSMLQATAEANNLAA
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pF1KB9 VATAKDTYNKKMEEICGGDKPFLAPNDLQTKHLQLKEESVKLFRGVKKMGGEEFSRRYLQ
:: :.::: :.::..::::::..::.::. :::.::: ..: ::.::::::.:: ::: .
XP_011 VAGARDTYCKSMEQVCGGDKPYIAPSDLERKHLDLKEVAIKQFRSVKKMGGDEFCRRYQD
340 350 360 370 380 390
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pF1KB9 QLESEIDELYIQYIKHNDSKNIFHAARTPATLFVVIFITYVIAGVTGFIGLDIIASLCNM
:::.::.: : ..:::::.::::.:::::::::.:.: :.:.:.::::::. :: :::.
XP_011 QLEAEIEETYANFIKHNDGKNIFYAARTPATLFAVMFAMYIISGLTGFIGLNSIAVLCNL
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pF1KB9 IMGLTLITLCTWAYIRYSGEYRELGAVIDQVAAALWDQGSTNEALYKLYSAAATHRHLYH
.:::.:: ::::::..::::.::.:.::::.: .::.: : ... ::. .:.:.. :
XP_011 VMGLALIFLCTWAYVKYSGEFREIGTVIDQIAETLWEQRSPRKVFSKLFE--VTRRRMVH
460 470 480 490 500 510
540 550
pF1KB9 QAFPTPKSESTEQSEKKKM
.:. . . . ....::
XP_011 RALSSAQRQRLSSNNNKKKN
520 530
>>XP_016860175 (OMIM: 609368) PREDICTED: atlastin-2 isof (530 aa)
initn: 2506 init1: 2506 opt: 2556 Z-score: 3004.7 bits: 565.7 E(85289): 1.3e-160
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10 20 30 40 50
pF1KB9 MAKNRRDRNSWGGFSEKTYEWSSEEEEPVKKAGPVQVLIV-KDDHSFELDETALNRILLS
.:: :::.... .:::.::::: ::..:::.
XP_016 MKKPCPVQIVLAHEDDHNFELDEEALEQILLQ
10 20 30
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 EAVRDKEVVAVSVAGAFRKGKSFLMDFMLRYMYNQESVDWVGDYNEPLTGFSWRGGSERE
: .:: ..:.::::::::::::::.:::::::::..: .:.: :::::::.:::: :::
XP_016 EHIRDLNIVVVSVAGAFRKGKSFLLDFMLRYMYNKDSQSWIGGNNEPLTGFTWRGGCERE
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pF1KB9 TTGIQIWSEIFLINKPDGKKVAVLLMDTQGTFDSQSTLRDSATVFALSTMISSIQVYNLS
:::::.:.:.:.:..:.: :::::::::::.::::::..: ::::::::: ::.::::::
XP_016 TTGIQVWNEVFVIDRPNGTKVAVLLMDTQGAFDSQSTIKDCATVFALSTMTSSVQVYNLS
100 110 120 130 140 150
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pF1KB9 QNVQEDDLQHLQLFTEYGRLAMEETFLKPFQSLIFLVRDWSFPYEFSYGADGGAKFLEKR
::.::::::::::::::::::::: . ::::.:.::.::::.::: ::: .:: .:::::
XP_016 QNIQEDDLQHLQLFTEYGRLAMEEIYQKPFQTLMFLIRDWSYPYEHSYGLEGGKQFLEKR
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 LKVSGNQHEELQNVRKHIHSCFTNISCFLLPHPGLKVATNPNFDGKLKEIDDEFIKNLKI
:.:. ::::::::::::::.::.:..:::::::::::::::.:::.::.::..: ..:.
XP_016 LQVKQNQHEELQNVRKHIHNCFSNLGCFLLPHPGLKVATNPSFDGRLKDIDEDFKRELRN
220 230 240 250 260 270
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pF1KB9 LIPWLLSPESLDIKEINGNKITCRGLVEYFKAYIKIYQGEELPHPKSMLQATAEANNLAA
:.: ::.::.: :::.:.:.::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LVPLLLAPENLVEKEISGSKVTCRDLVEYFKAYIKIYQGEELPHPKSMLQATAEANNLAA
280 290 300 310 320 330
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pF1KB9 VATAKDTYNKKMEEICGGDKPFLAPNDLQTKHLQLKEESVKLFRGVKKMGGEEFSRRYLQ
:: :.::: :.::..::::::..::.::. :::.::: ..: ::.::::::.:: ::: .
XP_016 VAGARDTYCKSMEQVCGGDKPYIAPSDLERKHLDLKEVAIKQFRSVKKMGGDEFCRRYQD
340 350 360 370 380 390
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pF1KB9 QLESEIDELYIQYIKHNDSKNIFHAARTPATLFVVIFITYVIAGVTGFIGLDIIASLCNM
:::.::.: : ..:::::.::::.:::::::::.:.: :.:.:.::::::. :: :::.
XP_016 QLEAEIEETYANFIKHNDGKNIFYAARTPATLFAVMFAMYIISGLTGFIGLNSIAVLCNL
400 410 420 430 440 450
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pF1KB9 IMGLTLITLCTWAYIRYSGEYRELGAVIDQVAAALWDQGSTNEALYKLYSAAATHRHLYH
.:::.:: ::::::..::::.::.:.::::.: .::.: : ... ::. .:.:.. :
XP_016 VMGLALIFLCTWAYVKYSGEFREIGTVIDQIAETLWEQRSPRKVFSKLFE--VTRRRMVH
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pF1KB9 QAFPTPKSESTEQSEKKKM
.:. . . . ....::
XP_016 RALSSAQRQRLSSNNNKKKN
520 530
>>NP_071769 (OMIM: 609368) atlastin-2 isoform 1 [Homo sa (579 aa)
initn: 2589 init1: 2491 opt: 2540 Z-score: 2985.3 bits: 562.3 E(85289): 1.5e-159
Smith-Waterman score: 2540; 68.1% identity (89.3% similar) in 533 aa overlap (26-557:52-577)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MAKNRRDRNSWGGFSEKTYEWSSEEEEPVKKAGPVQVLIV-KDDHSFELDETALN
.: .:: :::.... .:::.::::: ::.
NP_071 RTSDPSAAVNHVSSTTSLGENYEDDDLVNSDEVMKKPCPVQIVLAHEDDHNFELDEEALE
30 40 50 60 70 80
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pF1KB9 RILLSEAVRDKEVVAVSVAGAFRKGKSFLMDFMLRYMYNQESVDWVGDYNEPLTGFSWRG
.:::.: .:: ..:.::::::::::::::.:::::::::..: .:.: :::::::.:::
NP_071 QILLQEHIRDLNIVVVSVAGAFRKGKSFLLDFMLRYMYNKDSQSWIGGNNEPLTGFTWRG
90 100 110 120 130 140
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