Result of FASTA (ccds) for
pF1KB9464
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9464, 1190 aa
1>>>pF1KB9464 1190 - 1190 aa - 1190 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.8811+/-0.00115; mu= 2.5083+/- 0.070
mean_var=283.8528+/-57.152, 0's: 0 Z-trim(112.0): 98 B-trim: 210 in 1/50
Lambda= 0.076125
statistics sampled from 12729 (12818) to 12729 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.704), E-opt: 0.2 (0.394), width: 16
Scan time: 4.370
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS6627.1 TJP2 gene_id:9414|Hs108|chr9 (1190) 7952 888.0 0
CCDS55316.1 TJP2 gene_id:9414|Hs108|chr9 (1221) 7804 871.7 0
CCDS6628.1 TJP2 gene_id:9414|Hs108|chr9 (1043) 6410 718.6 2e-206
CCDS55315.1 TJP2 gene_id:9414|Hs108|chr9 (1157) 6270 703.2 9e-202
CCDS55317.1 TJP2 gene_id:9414|Hs108|chr9 (1020) 6234 699.2 1.3e-200
CCDS42007.1 TJP1 gene_id:7082|Hs108|chr15 (1748) 1908 224.3 2e-57
CCDS81858.1 TJP1 gene_id:7082|Hs108|chr15 (1768) 1908 224.3 2e-57
CCDS45199.1 TJP1 gene_id:7082|Hs108|chr15 (1668) 1886 221.9 1e-56
CCDS73702.1 TJP1 gene_id:7082|Hs108|chr15 (1692) 1886 221.9 1e-56
CCDS32873.2 TJP3 gene_id:27134|Hs108|chr19 ( 919) 1479 177.0 1.9e-43
CCDS59332.1 TJP3 gene_id:27134|Hs108|chr19 ( 928) 1479 177.0 1.9e-43
>>CCDS6627.1 TJP2 gene_id:9414|Hs108|chr9 (1190 aa)
initn: 7952 init1: 7952 opt: 7952 Z-score: 4734.1 bits: 888.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7952; 99.7% identity (99.9% similar) in 1190 aa overlap (1-1190:1-1190)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MPVRGDRGFPPRRELSGWLRAPGMEELIWEQYTVTLQKDSKRGFGIAVSGGRDNPHFENG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 MPVRGDRGFPPRRELSGWLRAPGMEELIWEQYTVTLQKDSKRGFGIAVSGGRDNPHFENG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 ETSIVISDVLPGGPADGLLQENDRVVMVNGTPMEDVLHSFAVQQLRKSGKVAAIVVKRPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 ETSIVISDVLPGGPADGLLQENDRVVMVNGTPMEDVLHSFAVQQLRKSGKVAAIVVKRPR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 KVQVAALQASPPLDQDDRAFEVMDEFDGRSFRSGYSERSRLNSHGGRSRSWEDSPERGRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 KVQVAALQASPPLDQDDRAFEVMDEFDGRSFRSGYSERSRLNSHGGRSRSWEDSPERGRP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 HERARSRERDLSRDRSRGRSLERGLDQDHARTRDRSRGRSLERGLDHDFGPSRDRDRDRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 HERARSRERDLSRDRSRGRSLERGLDQDHARTRDRSRGRSLERGLDHDFGPSRDRDRDRS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 RGRSIDQDYERAYHRAYDPDYERAYSPEYRRGARHDARSRGPRSRSREHPHSRSPSPEPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 RGRSIDQDYERAYHRAYDPDYERAYSPEYRRGARHDARSRGPRSRSREHPHSRSPSPEPR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 GRPGPIGVLLMKSRANEEYGLRLGSQIFVKEMTRTGLATKDGNLHEGDIILKINGTVTEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 GRPGPIGVLLMKSRANEEYGLRLGSQIFVKEMTRTGLATKDGNLHEGDIILKINGTVTEN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 MSLTDARKLIEKSRGKLQLVVLRDSQQTLINIPSLNDSDSEIEDISEIESNRSFSPEERR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 MSLTDARKLIEKSRGKLQLVVLRDSQQTLINIPSLNDSDSEIEDISEIESNRSFSPEERR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 HQYSDYDYHSSSEKLKERPSSREDTPSRLSRMGATPTPFKSTGDIAGTVVPETNKEPRYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 HQYSDYDYHSSSEKLKERPSSREDTPSRLSRMGATPTPFKSTGDIAGTVVPETNKEPRYQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 EEPPAPQPKAAPRTFLRPSPEDEAIYGPNTKMVRFKKGDSVGLRLAGGNDVGIFVAGIQE
:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 EDPPAPQPKAAPRTFLRPSPEDEAIYGPNTKMVRFKKGDSVGLRLAGGNDVGIFVAGIQE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB9 GTSAEQEGLQEGDQILKVNTQDFRGLVREDAVLYLLEIPKGEMVTILAQSRADVYRDILA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 GTSAEQEGLQEGDQILKVNTQDFRGLVREDAVLYLLEIPKGEMVTILAQSRADVYRDILA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB9 CGRGDSFFIRSHFECEKETPQSLAFTRGEVFRVVDTLYDGKLGNWLAVRIGNELEKGLIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 CGRGDSFFIRSHFECEKETPQSLAFTRGEVFRVVDTLYDGKLGNWLAVRIGNELEKGLIP
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB9 NKSRAEQIASVQNAQRDNAGDRADFWRMRGQRSGVKKNLRKSREDLTAVVSVSTKFPAYE
:::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 NKSRAEQMASVQNAQRDNAGDRADFWRMRGQRSGVKKNLRKSREDLTAVVSVSTKFPAYE
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB9 RVLLREAGFKRPVVLFGPIADIAMEKLANELPDWFQTAKTEPKDAGSEKSTGVVRLNTVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 RVLLREAGFKRPVVLFGPIADIAMEKLANELPDWFQTAKTEPKDAGSEKSTGVVRLNTVR
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB9 QIIEQDKHALLDVTPKAVDLLNYTQWFPIVIFFNPDSRQGVKTMRQRLNPTSNKSSRKLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 QIIEQDKHALLDVTPKAVDLLNYTQWFPIVIFFNPDSRQGVKTMRQRLNPTSNKSSRKLF
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB9 DQANKLKKTCAHLFTATINLNSANDSWFGSLKDTIQHQQGEAVWVSEGKMEGMDDHPEDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::
CCDS66 DQANKLKKTCAHLFTATINLNSANDSWFGSLKDTIQHQQGEAVWVSEGKMEGMDDDPEDR
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB9 MSYLTAMGADYLSCDSRLISDFEDTDGEGGAYTDNELDEPAEEPLVSSITRSSEPVQHEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 MSYLTAMGADYLSCDSRLISDFEDTDGEGGAYTDNELDEPAEEPLVSSITRSSEPVQHEE
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB9 SIRKPSPEPRAQMRRAASSDQLRDNSPPPAFKPEPPKAKTQNKEESYDFSKSYEYKSNPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 SIRKPSPEPRAQMRRAASSDQLRDNSPPPAFKPEPPKAKTQNKEESYDFSKSYEYKSNPS
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB9 AVAGNETPGASTKGYPPPVAAKPTFGRSILKPSTPIPPQEGEEVGESSEEQDNAPKSVLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 AVAGNETPGASTKGYPPPVAAKPTFGRSILKPSTPIPPQEGEEVGESSEEQDNAPKSVLG
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB9 KVKIFEKMDHKARLQRMQELQEAQNARIEIAQKHPDIYAVPIKTHKPDPGTPQHTSSRPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 KVKIFEKMDHKARLQRMQELQEAQNARIEIAQKHPDIYAVPIKTHKPDPGTPQHTSSRPP
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190
pF1KB9 EPQKAPSRPYQDTRGSYGSDAEEEEYRQQLSEHSKRGYYGQSARYRDTEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 EPQKAPSRPYQDTRGSYGSDAEEEEYRQQLSEHSKRGYYGQSARYRDTEL
1150 1160 1170 1180 1190
>>CCDS55316.1 TJP2 gene_id:9414|Hs108|chr9 (1221 aa)
initn: 7803 init1: 7803 opt: 7804 Z-score: 4646.1 bits: 871.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7804; 98.6% identity (98.9% similar) in 1190 aa overlap (9-1190:35-1221)
10 20 30
pF1KB9 MPVRGDRGFPPRRELSGW--------LRAPGMEELIWE
:: .::.: : ::::::::::
CCDS55 QALHRMWIQAVKKLRRWKGRVSPSASSPLVFP---NLSSWEGEGSKTILTAPGMEELIWE
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 QYTVTLQKDSKRGFGIAVSGGRDNPHFENGETSIVISDVLPGGPADGLLQENDRVVMVNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 QYTVTLQKDSKRGFGIAVSGGRDNPHFENGETSIVISDVLPGGPADGLLQENDRVVMVNG
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 TPMEDVLHSFAVQQLRKSGKVAAIVVKRPRKVQVAALQASPPLDQDDRAFEVMDEFDGRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TPMEDVLHSFAVQQLRKSGKVAAIVVKRPRKVQVAALQASPPLDQDDRAFEVMDEFDGRS
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 FRSGYSERSRLNSHGGRSRSWEDSPERGRPHERARSRERDLSRDRSRGRSLERGLDQDHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 FRSGYSERSRLNSHGGRSRSWEDSPERGRPHERARSRERDLSRDRSRGRSLERGLDQDHA
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 RTRDRSRGRSLERGLDHDFGPSRDRDRDRSRGRSIDQDYERAYHRAYDPDYERAYSPEYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RTRDRSRGRSLERGLDHDFGPSRDRDRDRSRGRSIDQDYERAYHRAYDPDYERAYSPEYR
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 RGARHDARSRGPRSRSREHPHSRSPSPEPRGRPGPIGVLLMKSRANEEYGLRLGSQIFVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RGARHDARSRGPRSRSREHPHSRSPSPEPRGRPGPIGVLLMKSRANEEYGLRLGSQIFVK
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 EMTRTGLATKDGNLHEGDIILKINGTVTENMSLTDARKLIEKSRGKLQLVVLRDSQQTLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EMTRTGLATKDGNLHEGDIILKINGTVTENMSLTDARKLIEKSRGKLQLVVLRDSQQTLI
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KB9 NIPSLNDSDSEIEDISEIESNRSFSPEERRHQYSDYDYHSSSEKLKERPSSREDTPSRLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NIPSLNDSDSEIEDISEIESNRSFSPEERRHQYSDYDYHSSSEKLKERPSSREDTPSRLS
430 440 450 460 470 480
460 470 480 490 500 510
pF1KB9 RMGATPTPFKSTGDIAGTVVPETNKEPRYQEEPPAPQPKAAPRTFLRPSPEDEAIYGPNT
:::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RMGATPTPFKSTGDIAGTVVPETNKEPRYQEDPPAPQPKAAPRTFLRPSPEDEAIYGPNT
490 500 510 520 530 540
520 530 540 550 560 570
pF1KB9 KMVRFKKGDSVGLRLAGGNDVGIFVAGIQEGTSAEQEGLQEGDQILKVNTQDFRGLVRED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 KMVRFKKGDSVGLRLAGGNDVGIFVAGIQEGTSAEQEGLQEGDQILKVNTQDFRGLVRED
550 560 570 580 590 600
580 590 600 610 620 630
pF1KB9 AVLYLLEIPKGEMVTILAQSRADVYRDILACGRGDSFFIRSHFECEKETPQSLAFTRGEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 AVLYLLEIPKGEMVTILAQSRADVYRDILACGRGDSFFIRSHFECEKETPQSLAFTRGEV
610 620 630 640 650 660
640 650 660 670 680 690
pF1KB9 FRVVDTLYDGKLGNWLAVRIGNELEKGLIPNKSRAEQIASVQNAQRDNAGDRADFWRMRG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::
CCDS55 FRVVDTLYDGKLGNWLAVRIGNELEKGLIPNKSRAEQMASVQNAQRDNAGDRADFWRMRG
670 680 690 700 710 720
700 710 720 730 740 750
pF1KB9 QRSGVKKNLRKSREDLTAVVSVSTKFPAYERVLLREAGFKRPVVLFGPIADIAMEKLANE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 QRSGVKKNLRKSREDLTAVVSVSTKFPAYERVLLREAGFKRPVVLFGPIADIAMEKLANE
730 740 750 760 770 780
760 770 780 790 800 810
pF1KB9 LPDWFQTAKTEPKDAGSEKSTGVVRLNTVRQIIEQDKHALLDVTPKAVDLLNYTQWFPIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LPDWFQTAKTEPKDAGSEKSTGVVRLNTVRQIIEQDKHALLDVTPKAVDLLNYTQWFPIV
790 800 810 820 830 840
820 830 840 850 860 870
pF1KB9 IFFNPDSRQGVKTMRQRLNPTSNKSSRKLFDQANKLKKTCAHLFTATINLNSANDSWFGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 IFFNPDSRQGVKTMRQRLNPTSNKSSRKLFDQANKLKKTCAHLFTATINLNSANDSWFGS
850 860 870 880 890 900
880 890 900 910 920 930
pF1KB9 LKDTIQHQQGEAVWVSEGKMEGMDDHPEDRMSYLTAMGADYLSCDSRLISDFEDTDGEGG
::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LKDTIQHQQGEAVWVSEGKMEGMDDDPEDRMSYLTAMGADYLSCDSRLISDFEDTDGEGG
910 920 930 940 950 960
940 950 960 970 980 990
pF1KB9 AYTDNELDEPAEEPLVSSITRSSEPVQHEESIRKPSPEPRAQMRRAASSDQLRDNSPPPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 AYTDNELDEPAEEPLVSSITRSSEPVQHEESIRKPSPEPRAQMRRAASSDQLRDNSPPPA
970 980 990 1000 1010 1020
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KB9 FKPEPPKAKTQNKEESYDFSKSYEYKSNPSAVAGNETPGASTKGYPPPVAAKPTFGRSIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 FKPEPPKAKTQNKEESYDFSKSYEYKSNPSAVAGNETPGASTKGYPPPVAAKPTFGRSIL
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KB9 KPSTPIPPQEGEEVGESSEEQDNAPKSVLGKVKIFEKMDHKARLQRMQELQEAQNARIEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 KPSTPIPPQEGEEVGESSEEQDNAPKSVLGKVKIFEKMDHKARLQRMQELQEAQNARIEI
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KB9 AQKHPDIYAVPIKTHKPDPGTPQHTSSRPPEPQKAPSRPYQDTRGSYGSDAEEEEYRQQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 AQKHPDIYAVPIKTHKPDPGTPQHTSSRPPEPQKAPSRPYQDTRGSYGSDAEEEEYRQQL
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1180 1190
pF1KB9 SEHSKRGYYGQSARYRDTEL
::::::::::::::::::::
CCDS55 SEHSKRGYYGQSARYRDTEL
1210 1220
>>CCDS6628.1 TJP2 gene_id:9414|Hs108|chr9 (1043 aa)
initn: 6391 init1: 6391 opt: 6410 Z-score: 3819.6 bits: 718.6 E(32554): 2e-206
Smith-Waterman score: 6664; 87.4% identity (87.6% similar) in 1190 aa overlap (1-1190:1-1043)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MPVRGDRGFPPRRELSGWLRAPGMEELIWEQYTVTLQKDSKRGFGIAVSGGRDNPHFENG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 MPVRGDRGFPPRRELSGWLRAPGMEELIWEQYTVTLQKDSKRGFGIAVSGGRDNPHFENG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 ETSIVISDVLPGGPADGLLQENDRVVMVNGTPMEDVLHSFAVQQLRKSGKVAAIVVKRPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 ETSIVISDVLPGGPADGLLQENDRVVMVNGTPMEDVLHSFAVQQLRKSGKVAAIVVKRPR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 KVQVAALQASPPLDQDDRAFEVMDEFDGRSFRSGYSERSRLNSHGGRSRSWEDSPERGRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 KVQVAALQASPPLDQDDRAFEVMDEFDGRSFRSGYSERSRLNSHGGRSRSWEDSPERGRP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 HERARSRERDLSRDRSRGRSLERGLDQDHARTRDRSRGRSLERGLDHDFGPSRDRDRDRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 HERARSRERDLSRDRSRGRSLERGLDQDHARTRDRSRGRSLERGLDHDFGPSRDRDRDRS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 RGRSIDQDYERAYHRAYDPDYERAYSPEYRRGARHDARSRGPRSRSREHPHSRSPSPEPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 RGRSIDQDYERAYHRAYDPDYERAYSPEYRRGARHDARSRGPRSRSREHPHSRSPSPEPR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 GRPGPIGVLLMKSRANEEYGLRLGSQIFVKEMTRTGLATKDGNLHEGDIILKINGTVTEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 GRPGPIGVLLMKSRANEEYGLRLGSQIFVKEMTRTGLATKDGNLHEGDIILKINGTVTEN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 MSLTDARKLIEKSRGKLQLVVLRDSQQTLINIPSLNDSDSEIEDISEIESNRSFSPEERR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 MSLTDARKLIEKSRGKLQLVVLRDSQQTLINIPSLNDSDSEIEDISEIESNRSFSPEERR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 HQYSDYDYHSSSEKLKERPSSREDTPSRLSRMGATPTPFKSTGDIAGTVVPETNKEPRYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 HQYSDYDYHSSSEKLKERPSSREDTPSRLSRMGATPTPFKSTGDIAGTVVPETNKEPRYQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 EEPPAPQPKAAPRTFLRPSPEDEAIYGPNTKMVRFKKGDSVGLRLAGGNDVGIFVAGIQE
:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 EDPPAPQPKAAPRTFLRPSPEDEAIYGPNTKMVRFKKGDSVGLRLAGGNDVGIFVAGIQE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB9 GTSAEQEGLQEGDQILKVNTQDFRGLVREDAVLYLLEIPKGEMVTILAQSRADVYRDILA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 GTSAEQEGLQEGDQILKVNTQDFRGLVREDAVLYLLEIPKGEMVTILAQSRADVYRDILA
550 560 570 580 590 600
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 CGRGDSFFIRSHFECEKETPQSLAFTRGEVFRVVDTLYDGKLGNWLAVRIGNELEKGLIP
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
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:::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 NKSRAEQMASVQNAQRDNAGDRADFWRMRGQRSGVKKNLRKSREDLTAVVSVSTKFPAYE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 RVLLREAGFKRPVVLFGPIADIAMEKLANELPDWFQTAKTEPKDAGSEKSTGVVRLNTVR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 QIIEQDKHALLDVTPKAVDLLNYTQWFPIVIFFNPDSRQGVKTMRQRLNPTSNKSSRKLF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::
CCDS66 DQANKLKKTCAHLFTATINLNSANDSWFGSLKDTIQHQQGEAVWVSEGKMEGMDDDPEDR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 MSYLTAMGADYLSCDSRLISDFEDTDGEGGAYTDNELDEPAEEPLVSSITRSSEPVQHEE
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:::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 EPQKAPSRPYQDTRGSYGSDAEEEEYRQQLSEHSKRGYYGQSARYRDTEL
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..: : :::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 FENGETSIVISDVLPGGPADGLLQENDRVVMVNGTPMEDVLHSFAVQQLRKSGKVAAIVV
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CCDS55 KRPRKVQVAALQASPPLDQDDRAFEVMDEFDGRSFRSGYSERSRLNSHGGRSRSWEDSPE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RGRPHERARSRERDLSRDRSRGRSLERGLDQDHARTRDRSRGRSLERGLDHDFGPSRDRD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RDRSRGRSIDQDYERAYHRAYDPDYERAYSPEYRRGARHDARSRGPRSRSREHPHSRSPS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 PEPRGRPGPIGVLLMKSRANEEYGLRLGSQIFVKEMTRTGLATKDGNLHEGDIILKINGT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VTENMSLTDARKLIEKSRGKLQLVVLRDSQQTLINIPSLNDSDSEIEDISEIESNRSFSP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EERRHQYSDYDYHSSSEKLKERPSSREDTPSRLSRMGATPTPFKSTGDIAGTVVPETNKE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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550 560 570 580 590 600
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 DILACGRGDSFFIRSHFECEKETPQSLAFTRGEVFRVVDTLYDGKLGNWLAVRIGNELEK
610 620 630 640 650 660
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:::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KB9 PAYERVLLREAGFKRPVVLFGPIADIAMEKLANELPDWFQTAKTEPKDAGSEKSTGVVRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 PAYERVLLREAGFKRPVVLFGPIADIAMEKLANELPDWFQTAKTEPKDAGSEKSTGVVRL
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pF1KB9 NTVRQIIEQDKHALLDVTPKAVDLLNYTQWFPIVIFFNPDSRQGVKTMRQRLNPTSNKSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NTVRQIIEQDKHALLDVTPKAVDLLNYTQWFPIVIFFNPDSRQGVKTMRQRLNPTSNKSS
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pF1KB9 RKLFDQANKLKKTCAHLFTATINLNSANDSWFGSLKDTIQHQQGEAVWVSEGKMEGMDDH
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RKLFDQANKLKKTCAHLFTATINLNSANDSWFGSLKDTIQHQQGEAVWVSEGKMEGMDDD
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pF1KB9 PEDRMSYLTAMGADYLSCDSRLISDFEDTDGEGGAYTDNELDEPAEEPLVSSITRSSEPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 PEDRMSYLTAMGADYLSCDSRLISDFEDTDGEGGAYTDNELDEPAEEPLVSSITRSSEPV
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:::: :::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SNPSAVAGNETPGASTKGYPPPVAAKPTFGRSILKPSTPIPPQEGEEVGESSEEQDNAPK
990 1000 1010 1020 1030 1040
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pF1KB9 SVLGKVKIFEKMDHKARLQRMQELQEAQNARIEIAQKHPDIYAVPIKTHKPDPGTPQHTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SVLGKVKIFEKMDHKARLQRMQELQEAQNARIEIAQKHPDIYAVPIKTHKPDPGTPQHTS
1050 1060 1070 1080 1090 1100
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SRPPEPQKAPSRPYQDTRGSYGSDAEEEEYRQQLSEHSKRGYYGQSARYRDTEL
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ETSIVISDVLPGGPADGLLQENDRVVMVNGTPMEDVLHSFAVQQLRKSGKVAAIVVKRPR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 HERARSRERDLSRDRSRGRSLERGLDQDHARTRDRSRGRSLERGLDHDFGPSRDRDRDRS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RGRSIDQDYERAYHRAYDPDYERAYSPEYRRGARHDARSRGPRSRSREHPHSRSPSPEPR
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pF1KB9 GRPGPIGVLLMKSRANEEYGLRLGSQIFVKEMTRTGLATKDGNLHEGDIILKINGTVTEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 GRPGPIGVLLMKSRANEEYGLRLGSQIFVKEMTRTGLATKDGNLHEGDIILKINGTVTEN
280 290 300 310 320 330
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pF1KB9 MSLTDARKLIEKSRGKLQLVVLRDSQQTLINIPSLNDSDSEIEDISEIESNRSFSPEERR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MSLTDARKLIEKSRGKLQLVVLRDSQQTLINIPSLNDSDSEIEDISEIESNRSFSPEERR
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pF1KB9 HQYSDYDYHSSSEKLKERPSSREDTPSRLSRMGATPTPFKSTGDIAGTVVPETNKEPRYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 HQYSDYDYHSSSEKLKERPSSREDTPSRLSRMGATPTPFKSTGDIAGTVVPETNKEPRYQ
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:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EDPPAPQPKAAPRTFLRPSPEDEAIYGPNTKMVRFKKGDSVGLRLAGGNDVGIFVAGIQE
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pF1KB9 GTSAEQEGLQEGDQILKVNTQDFRGLVREDAVLYLLEIPKGEMVTILAQSRADVYRDILA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 GTSAEQEGLQEGDQILKVNTQDFRGLVREDAVLYLLEIPKGEMVTILAQSRADVYRDILA
520 530 540 550 560 570
610 620 630 640 650 660
pF1KB9 CGRGDSFFIRSHFECEKETPQSLAFTRGEVFRVVDTLYDGKLGNWLAVRIGNELEKGLIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 CGRGDSFFIRSHFECEKETPQSLAFTRGEVFRVVDTLYDGKLGNWLAVRIGNELEKGLIP
580 590 600 610 620 630
670 680 690 700 710 720
pF1KB9 NKSRAEQIASVQNAQRDNAGDRADFWRMRGQRSGVKKNLRKSREDLTAVVSVSTKFPAYE
:::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NKSRAEQMASVQNAQRDNAGDRADFWRMRGQRSGVKKNLRKSREDLTAVVSVSTKFPAYE
640 650 660 670 680 690
730 740 750 760 770 780
pF1KB9 RVLLREAGFKRPVVLFGPIADIAMEKLANELPDWFQTAKTEPKDAGSEKSTGVVRLNTVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RVLLREAGFKRPVVLFGPIADIAMEKLANELPDWFQTAKTEPKDAGSEKSTGVVRLNTVR
700 710 720 730 740 750
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pF1KB9 QIIEQDKHALLDVTPKAVDLLNYTQWFPIVIFFNPDSRQGVKTMRQRLNPTSNKSSRKLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 QIIEQDKHALLDVTPKAVDLLNYTQWFPIVIFFNPDSRQGVKTMRQRLNPTSNKSSRKLF
760 770 780 790 800 810
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pF1KB9 DQANKLKKTCAHLFTATINLNSANDSWFGSLKDTIQHQQGEAVWVSEGKMEGMDDHPEDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::
CCDS55 DQANKLKKTCAHLFTATINLNSANDSWFGSLKDTIQHQQGEAVWVSEGKMEGMDDDPEDR
820 830 840 850 860 870
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pF1KB9 MSYLTAMGADYLSCDSRLISDFEDTDGEGGAYTDNELDEPAEEPLVSSITRSSEPVQHEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MSYLTAMGADYLSCDSRLISDFEDTDGEGGAYTDNELDEPAEEPLVSSITRSSEPVQHEE
880 890 900 910 920 930
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pF1KB9 SIRKPSPEPRAQMRRAASSDQLRDNSPPPAFKPEPPKAKTQNKEESYDFSKSYEYKSNPS
CCDS55 ------------------------------------------------------------
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB9 AVAGNETPGASTKGYPPPVAAKPTFGRSILKPSTPIPPQEGEEVGESSEEQDNAPKSVLG
CCDS55 ------------------------------------------------------------
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB9 KVKIFEKMDHKARLQRMQELQEAQNARIEIAQKHPDIYAVPIKTHKPDPGTPQHTSSRPP
:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ---------------------------IEIAQKHPDIYAVPIKTHKPDPGTPQHTSSRPP
940 950 960 970
1150 1160 1170 1180 1190
pF1KB9 EPQKAPSRPYQDTRGSYGSDAEEEEYRQQLSEHSKRGYYGQSARYRDTEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EPQKAPSRPYQDTRGSYGSDAEEEEYRQQLSEHSKRGYYGQSARYRDTEL
980 990 1000 1010 1020
>>CCDS42007.1 TJP1 gene_id:7082|Hs108|chr15 (1748 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KB9 MPVRGDRGFPPRRELSGWLRAPGMEEL-IWEQYTVTLQKDSKRGFGIAVSGGRDNPHFEN
.. .::: ::::.::::.. :::::.:::::::::..
CCDS42 MSARAAAAKSTAMEETAIWEQHTVTLHRAPGFGFGIAISGGRDNPHFQS
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 GETSIVISDVLPGGPADGLLQENDRVVMVNGTPMEDVLHSFAVQQLRKSGKVAAIVVKRP
::::::::::: ::::.: :::::::.::::. :..: :.::::::::::: : :...:
CCDS42 GETSIVISDVLKGGPAEGQLQENDRVAMVNGVSMDNVEHAFAVQQLRKSGKNAKITIRRK
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 RKVQVAALQASP-PLDQDDRAFEVMDE--FDGRSFRSGYSERSRLNSHGGRSRSWEDSPE
.:::. . . .: :...... . .:: : :: ::: .: :: :
CCDS42 KKVQIPVSRPDPEPVSDNEE--DSYDEEIHDPRSGRSGVVNR----------RS-----E
110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 RGRPHERARSRERDLSRDRSRGRSLERGLDQDHARTRDRSRGRSLERGLDHDFGPSRDRD
. :..:. ::::.:: : ::
CCDS42 KIWPRDRSASRERSLS--------------------------------------PRSDR-
160 170
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 RDRSRGRSIDQDYERAYHRAYDPDYERAYSPEYRRGARHDARSRGPRSRSREHPHSRSPS
::. : .:.
CCDS42 ------RSVA---------------------------------------------SSQPA
180
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 PEPRGRPGPIGVLLMKSRANEEYGLRLGSQIFVKEMTRTGLATKDGNLHEGDIILKINGT
: : :.::: ::::::::.:.:::::... .::..:::..:::..::::::
CCDS42 K-------PTKVTLVKSRKNEEYGLRLASHIFVKEISQDSLAARDGNIQEGDVVLKINGT
190 200 210 220 230
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pF1KB9 VTENMSLTDARKLIEKSRGKLQLVVLRDSQQTLINIPSLNDS-----DSEIEDISEIES-
::::::::::. :::.:.:::..:: :: . ::.:.:.:.:: :: .:::::.:
CCDS42 VTENMSLTDAKTLIERSKGKLKMVVQRDERATLLNVPDLSDSIHSANASERDDISEIQSL
240 250 260 270 280 290
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pF1KB9 ---------------NRSFSPEERRHQYSDYDYHSSSEKLKERPSSREDTPSRLSRMGAT
.:: ::..: . ::.. :: .. . ::.. :.:. ::.
CCDS42 ASDHSGRSHDRPPRRSRSRSPDQRSEP-SDHSRHSPQQPSNGSLRSRDEE--RISKPGAV
300 310 320 330 340 350
460 470 480 490 500
pF1KB9 PTPFKSTGDIAGTVVPETNKEPRYQEEPPAPQPKAA------PRTFLRPSPED-------
:: : . : . .: :.. : .. : :.:: . : . : :: :
CCDS42 STPVKHADDHTPKTVEEVTVERNEKQTPSLPEPKPVYAQVGQPDVDLPVSPSDGVLPNST
360 370 380 390 400 410
510 520 530 540 550 560
pF1KB9 --EAIYGPNTKMVRFKKGDSVGLRLAGGNDVGIFVAGIQEGTSAEQEGLQEGDQILKVNT
..: :. :.:.:.:::::::::::::::::::::. : . : .:::.::::::.::.
CCDS42 HEDGILRPSMKLVKFRKGDSVGLRLAGGNDVGIFVAGVLEDSPAAKEGLEEGDQILRVNN
420 430 440 450 460 470
570 580 590 600 610 620
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:: ...::.:::.::..:::: ::::::.. :::: :. ::::.::.::: :::.:
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.::::::::.:: ::. :.:::::::::.: :.:::::::::.:::::: :::..:
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:::::.: :::: : :: .: ::.::.:::.. .:.:..::.:..:::.:::::::::::
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.::: :::.::.:::.:.::::.:::::::.:: : : ::.:::.....::.:. ::::
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.:::::: ::.:.:.::..::.::.. ::::::: .: .: : .::.:::.: :..
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.:. : :.:: . :. :.::: .:.: :. . ..:
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: :. : :.. . .. :. : :. . : : : :. .. ..:. . .
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CCDS45 HENQTYPPYSPQAQPQPIHRIDS-------PGFKPASQQVYRKDPYPEEMMRQNHVLKQ-
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.. ....:. : . . : : . . : .:. :. . :. : . ::
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CCDS45 SAGPKPAESKQYFEQYSRSYEQVPPQGFTSRAGHFEPLHGAAAVPPLIPSSQHKPEALPS
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:: ...::.:::.::..:::: ::::::.. :::: :. ::::.::.::: :::.:
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:::::.: :::: : :: .: ::.::.:::.. .:.:..::.:..:::.:::::::::::
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.::: :::.::.:::.:.::::.:::::::.:: : : ::.:::.....::.:. ::::
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.:::::: ::.:.:.::..::.::.. ::::::: .: .: : .::.:::.: :..
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.:. : :.:: . :. :.::: .. .. . ... :.
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.. ....:. : . . : : . . : .:. :. . :. : . ::
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CCDS73 ESSERGYFPRFEEPAPLSYDSRPRYEQAPRASALRHE--EQPAPGYDTHGRLRPEAQPHP
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10 20 30 40 50
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CCDS32 G--SMVVSDVVPGGPAEGRLQTGDHIVMVNGVSMENATSAFAIQILKTCTKMANITVKRP
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CCDS32 QDIFWKMVQSRVGDSFYIRTHFELEPSPPSGLGFTRGDVFHVLDTLHPGPGQSHARGGHW
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