Result of FASTA (ccds) for
pF1KB9480
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9480, 832 aa
1>>>pF1KB9480 832 - 832 aa - 832 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8633+/-0.000873; mu= 18.3021+/- 0.053
mean_var=76.4493+/-15.576, 0's: 0 Z-trim(106.8): 17 B-trim: 42 in 1/49
Lambda= 0.146686
statistics sampled from 9202 (9207) to 9202 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.639), E-opt: 0.2 (0.283), width: 16
Scan time: 4.040
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS34461.1 TMEM63B gene_id:55362|Hs108|chr6 ( 832) 5630 1201.3 0
CCDS31042.1 TMEM63A gene_id:9725|Hs108|chr1 ( 807) 2896 622.7 7.8e-178
CCDS45141.1 TMEM63C gene_id:57156|Hs108|chr14 ( 806) 2156 466.1 1.1e-130
>>CCDS34461.1 TMEM63B gene_id:55362|Hs108|chr6 (832 aa)
initn: 5630 init1: 5630 opt: 5630 Z-score: 6432.9 bits: 1201.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5630; 100.0% identity (100.0% similar) in 832 aa overlap (1-832:1-832)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MLPFLLATLGTTALNNSNPKDYCYSARIRSTVLQGLPFGGVPTVLALDFMCFLALLFLFS
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CCDS34 MLPFLLATLGTTALNNSNPKDYCYSARIRSTVLQGLPFGGVPTVLALDFMCFLALLFLFS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 ILRKVAWDYGRLALVTDADRLRRQERDRVEQEYVASAMHGDSHDRYERLTSVSSSVDFDQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ILRKVAWDYGRLALVTDADRLRRQERDRVEQEYVASAMHGDSHDRYERLTSVSSSVDFDQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 RDNGFCSWLTAIFRIKDDEIRDKCGGDAVHYLSFQRHIIGLLVVVGVLSVGIVLPVNFSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RDNGFCSWLTAIFRIKDDEIRDKCGGDAVHYLSFQRHIIGLLVVVGVLSVGIVLPVNFSG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 DLLENNAYSFGRTTIANLKSGNNLLWLHTSFAFLYLLLTVYSMRRHTSKMRYKEDDLVKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DLLENNAYSFGRTTIANLKSGNNLLWLHTSFAFLYLLLTVYSMRRHTSKMRYKEDDLVKR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 TLFINGISKYAESEKIKKHFEEAYPNCTVLEARPCYNVARLMFLDAERKKAERGKLYFTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TLFINGISKYAESEKIKKHFEEAYPNCTVLEARPCYNVARLMFLDAERKKAERGKLYFTN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 LQSKENVPTMINPKPCGHLCCCVVRGCEQVEAIEYYTKLEQKLKEDYKREKEKVNEKPLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LQSKENVPTMINPKPCGHLCCCVVRGCEQVEAIEYYTKLEQKLKEDYKREKEKVNEKPLG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 MAFVTFHNETITAIILKDFNVCKCQGCTCRGEPRPSSCSESLHISNWTVSYAPDPQNIYW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MAFVTFHNETITAIILKDFNVCKCQGCTCRGEPRPSSCSESLHISNWTVSYAPDPQNIYW
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 EHLSIRGFIWWLRCLVINVVLFILLFFLTTPAIIITTMDKFNVTKPVEYLNNPIITQFFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 EHLSIRGFIWWLRCLVINVVLFILLFFLTTPAIIITTMDKFNVTKPVEYLNNPIITQFFP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 TLLLWCFSALLPTIVYYSAFFEAHWTRSGENRTTMHKCYTFLIFMVLLLPSLGLSSLDLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TLLLWCFSALLPTIVYYSAFFEAHWTRSGENRTTMHKCYTFLIFMVLLLPSLGLSSLDLF
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB9 FRWLFDKKFLAEAAIRFECVFLPDNGAFFVNYVIASAFIGNAMDLLRIPGLLMYMIRLCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 FRWLFDKKFLAEAAIRFECVFLPDNGAFFVNYVIASAFIGNAMDLLRIPGLLMYMIRLCL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB9 ARSAAERRNVKRHQAYEFQFGAAYAWMMCVFTVVMTYSITCPIIVPFGLMYMLLKHLVDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ARSAAERRNVKRHQAYEFQFGAAYAWMMCVFTVVMTYSITCPIIVPFGLMYMLLKHLVDR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB9 YNLYYAYLPAKLDKKIHSGAVNQVVAAPILCLFWLLFFSTMRTGFLAPTSMFTFVVLVIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 YNLYYAYLPAKLDKKIHSGAVNQVVAAPILCLFWLLFFSTMRTGFLAPTSMFTFVVLVIT
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB9 IVICLCHVCFGHFKYLSAHNYKIEHTETDTVDPRSNGRPPTAAAVPKSAKYIAQVLQDSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 IVICLCHVCFGHFKYLSAHNYKIEHTETDTVDPRSNGRPPTAAAVPKSAKYIAQVLQDSE
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830
pF1KB9 VDGDGDGAPGSSGDEPPSSSSQDEELLMPPDALTDTDFQSCEDSLIENEIHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VDGDGDGAPGSSGDEPPSSSSQDEELLMPPDALTDTDFQSCEDSLIENEIHQ
790 800 810 820 830
>>CCDS31042.1 TMEM63A gene_id:9725|Hs108|chr1 (807 aa)
initn: 2150 init1: 1866 opt: 2896 Z-score: 3306.2 bits: 622.7 E(32554): 7.8e-178
Smith-Waterman score: 3089; 59.0% identity (83.8% similar) in 752 aa overlap (19-767:27-755)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MLPFLLATLGTTALNNSNPKD-YCYSARIRSTVLQGLPFGGVPTVLALDFMC
:.: :::.. ::::::. :::.:::: .: :
CCDS31 MMDSPFLELWQSKAVSIREQLGLGDRPNDSYCYNSAKNSTVLQGVTFGGIPTVLLIDVSC
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 FLALLFLFSILRKVAWDYGRLALVTDADRLRRQERDRVEQEYVASAMHGDSHDRYERLTS
:: :...:::.:. :::::.:::..:: :..:..::.:
CCDS31 FLFLILVFSIIRRRFWDYGRIALVSEAD----------------------SESRFQRLSS
70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 VSSSVDFD-QRDNGFCSWLTAIFRIKDDEIRDKCGGDAVHYLSFQRHIIGLLVVVGVLSV
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CCDS31 TSSSGQQDFENELGCCPWLTAIFRLHDDQILEWCGEDAIHYLSFQRHIIFLLVVVSFLSL
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 GIVLPVNFSGDLLENNAYSFGRTTIANLKSGNNLLWLHTSFAFLYLLLTVYSMRRHTSKM
..::::.:::::... :::::::::::.. :.:::::: :: .::.::: ::.::...
CCDS31 CVILPVNLSGDLLDKDPYSFGRTTIANLQTDNDLLWLHTIFAVIYLFLTVGFMRHHTQSI
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 RYKEDDLVKRTLFINGISKYAESEKIKKHFEEAYPNCTVLEARPCYNVARLMFLDAERKK
.:::..::.:::::.:. . :..: ...::..:::.: :.... :::::.:..: :.::
CCDS31 KYKEENLVRRTLFITGLPRDARKETVESHFRDAYPTCEVVDVQLCYNVAKLIYLCKEKKK
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 AERGKLYFTNLQSKENVPTMINPKPCGHLCCCVVRGCEQVEAIEYYTKLEQKLKEDYKRE
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CCDS31 TEKSLTYYTNLQVKTGQRTLINPKPCGQFCCCEVLGCEWEDAISYYTRMKDRLLERITEE
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KB9 KEKVNEKPLGMAFVTFHNETITAIILKDFNVCKCQGCTCRGEPRPSSCSESLHISNWTVS
...:...:::::::::....... ::::::.::::. :.:::.::: :. :. :.:::.
CCDS31 ERHVQDQPLGMAFVTFQEKSMATYILKDFNACKCQSLQCKGEPQPSSHSRELYTSKWTVT
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KB9 YAPDPQNIYWEHLSIRGFIWWLRCLVINVVLFILLFFLTTPAIIITTMDKFNVTKPVEYL
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CCDS31 FAADPEDICWKNLSIQGLRWWLQWLGINFTLFLGLFFLTTPSIILSTMDKFNVTKPIHAL
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KB9 NNPIITQFFPTLLLWCFSALLPTIVYYSAFFEAHWTRSGENRTTMHKCYTFLIFMVLLLP
:::::.::::::::: ::::::.:::::...:.:::.::::. : : : :::::::.::
CCDS31 NNPIISQFFPTLLLWSFSALLPSIVYYSTLLESHWTKSGENQIMMTKVYIFLIFMVLILP
460 470 480 490 500 510
540 550 560 570 580 590
pF1KB9 SLGLSSLDLFFRWLFDKKFLAEAAIRFECVFLPDNGAFFVNYVIASAFIGNAMDLLRIPG
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CCDS31 SLGLTSLDFFFRWLFDKTS-SEASIRLECVFLPDQGAFFVNYVIASAFIGNGMELLRLPG
520 530 540 550 560 570
600 610 620 630 640 650
pF1KB9 LLMYMIRLCLARSAAERRNVKRHQAYEFQFGAAYAWMMCVFTVVMTYSITCPIIVPFGLM
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CCDS31 LILYTFRMIMAKTAADRRNVKQNQAFQYEFGAMYAWMLCVFTVIVAYSITCPIIAPFGLI
580 590 600 610 620 630
660 670 680 690 700 710
pF1KB9 YMLLKHLVDRYNLYYAYLPAKLDKKIHSGAVNQVVAAPILCLFWLLFFSTMRTGFLAPTS
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CCDS31 YILLKHMVDRHNLYFVYLPAKLEKGIHFAAVNQALAAPILCLFWLYFFSFLRLGMKAPAT
640 650 660 670 680 690
720 730 740 750 760
pF1KB9 MFTFVVLVITIVICLCHVCFGHFKYLSAHNYKIEHTETDT-VDPRSNGRPPTAAAVPKSA
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CCDS31 LFTFLVLLLTILVCLAHTCFGCFKHLSPLNYKTEEPASDKGSEAEAHMPPPFTPYVPRIL
700 710 720 730 740 750
770 780 790 800 810 820
pF1KB9 KYIAQVLQDSEVDGDGDGAPGSSGDEPPSSSSQDEELLMPPDALTDTDFQSCEDSLIENE
CCDS31 NGLASERTALSPQQQQQQTYGAIHNISGTIPGQCLAQSATGSVAAAPQEA
760 770 780 790 800
>>CCDS45141.1 TMEM63C gene_id:57156|Hs108|chr14 (806 aa)
initn: 2050 init1: 1428 opt: 2156 Z-score: 2459.9 bits: 466.1 E(32554): 1.1e-130
Smith-Waterman score: 2337; 43.0% identity (74.4% similar) in 817 aa overlap (21-831:20-806)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MLPFLLATLGTTALNNSNPKDYCYSARIRSTVLQGLPFGGVPTVLALDFMCFLALLFLFS
: :...: .::::: ::::::::: :.. .. .: ..:
CCDS45 MSASPDDLSTGGRLQNMTVDECFQSR--NTVLQGQPFGGVPTVLCLNIALWVLVLVVYS
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 ILRKVAWDYGRLALVTDADRLRRQERDRVEQEYVASAMHGDSHDRYERLTSVSSSVDFDQ
.:::.:::::::::. : : .: ..:. . :. . .:.....
CCDS45 FLRKAAWDYGRLALLIHNDSL-------------TSLIYGE---QSEKTSPSETSLEMER
60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 RDNGFCSWLTAIFRIKDDEIRDKCGGDAVHYLSFQRHIIGLLVVVGVLSVGIVLPVNFSG
::.:::::. . .::... .::: :: :. :: :.: ..... . :.::.::.:..:
CCDS45 RDKGFCSWFFNSITMKDEDLINKCGDDARIYIVFQYHLIIFVLIICIPSLGIILPINYTG
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 DLLENNAYSFGRTTIANLKSGNNLLWLHTSFAFLYLLLTVYSMRRHTSKMRYKEDDLVKR
..:. ... :.::::.:... ..:::::. ..:.:.. . . : .: . .... : :
CCDS45 SVLDWSSH-FARTTIVNVSTESKLLWLHSLLSFFYFITNFMFMAHHCLGFAPRNSQKVTR
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290
pF1KB9 TLFINGISKYAES-EKIKKHFEEAYPNCTVLEARPCYNVARLMFLDAERKKAERGKLYFT
::.:. . : :. : : :::.::::. .: ... ::.: :. :: .:..: ::.:..:
CCDS45 TLMITYVPKDIEDPELIIKHFHEAYPGSVVTRVHFCYDVRNLIDLDDQRRHAMRGRLFYT
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 NLQSKENVPTMINPKPCGHLCCCVVRGC-EQVEAIEYYTKLEQKLKEDYKREKEKVNEKP
..:.. .:: .::..:: : : ..:.: .::..::..: .... : ..: :
CCDS45 A-KAKKTGKVMIRIHPCARLCFCKCWTCFKEVDAEQYYSELEEQLTDEFNAELNRVPLKR
290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KB9 LGMAFVTFHNETITAIILKDFNVCKCQGCTCRGEPRPSSCSESLHISNWTVSYAPDPQNI
: . ::::.. .. . ::.. .: : .:. :: . .. : :..:: :..:
CCDS45 LDLIFVTFQDSRMAKRVRKDYKYVQC-GV----QPQQSSVTTIVKSYYWRVTMAPHPKDI
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KB9 YWEHLSIRGFIWWLRCLVINVVLFILLFFLTTPAIIITTMDKFNVTKPVEYLNNPIITQF
:.:::.: :.:: : ..::. ::.:.:::::::::..:.: .:::.:.: :.:::.:::
CCDS45 IWKHLSVRRFFWWARFIAINTFLFFLFFFLTTPAIIMNTIDMYNVTRPIEKLQNPIVTQF
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KB9 FPTLLLWCFSALLPTIVYYSAFFEAHWTRSGENRTTMHKCYTFLIFMVLLLPSLGLSSLD
::...:: :...:: :::.:::.:::::::..: . .:::: ::.:::..:::.::.:::
CCDS45 FPSVMLWGFTVILPLIVYFSAFLEAHWTRSSQNLVMVHKCYIFLVFMVVILPSMGLTSLD
460 470 480 490 500 510
540 550 560 570 580 590
pF1KB9 LFFRWLFDKKFLAEAAIRFECVFLPDNGAFFVNYVIASAFIGNAMDLLRIPGLLMYMIRL
.:.::::: .: .:.:::.::::::::::::::::..:..:..:.:::. .:. : ::
CCDS45 VFLRWLFDIYYLEQASIRFQCVFLPDNGAFFVNYVITAALLGTGMELLRLGSLFCYSTRL
520 530 540 550 560 570
600 610 620 630 640 650
pF1KB9 CLARSAAERRNVKRHQAYEFQFGAAYAWMMCVFTVVMTYSITCPIIVPFGLMYMLLKHLV
..:: :: :....:: .:::: ::::: ::.:::.:::::::::::::.:. .:::.
CCDS45 FFSRSEPERVNIRKNQAIDFQFGREYAWMMNVFSVVMAYSITCPIIVPFGLLYLCMKHLT
580 590 600 610 620 630
660 670 680 690 700 710
pF1KB9 DRYNLYYAYLPAKLDKKIHSGAVNQVVAAPILCLFWLLFFSTMRTGFLAPTSMFTFVVLV
::::.::.. :.::...:: .::.:.. ::.: :::.:::: .: : : ..:.. .:.
CCDS45 DRYNMYYSFAPTKLNEQIHMAAVSQAIFAPLLGLFWMLFFSILRLGSLHAITIFSLSTLL
640 650 660 670 680 690
720 730 740 750 760 770
pF1KB9 ITIVICLCHVCFGHFKYLSAHNYKIEHTETDTVDPRSNGRPPTAAAVPKSAKYIAQVLQD
:..:: . . .:...... .:. :. : .:: . .: .....: : :.: :::.
CCDS45 IAMVIAFVGIFLGKLRMVA--DYEPEEEEIQTV---FDMEPSSTSSTPTSLLYVATVLQE
700 710 720 730 740
780 790 800 810 820 830
pF1KB9 SEVDGDGDGAPG----SSGDEPPSSSSQDEELLMPPDALTDTDFQSCEDSLIENEIHQ
:.. ..:. .. .. : . .. : : ...:: . .:. :
CCDS45 PELNLTPASSPARHTYGTMNNQPEEGEEESGLRGFARELDSAQFQEGLELEGQNQYH
750 760 770 780 790 800
832 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 22:17:55 2016 done: Sat Nov 5 22:17:55 2016
Total Scan time: 4.040 Total Display time: 0.090
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]