FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB9484, 2045 aa 1>>>pF1KB9484 2045 - 2045 aa - 2045 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.7885+/-0.00126; mu= 6.9888+/- 0.076 mean_var=353.4466+/-69.340, 0's: 0 Z-trim(113.7): 134 B-trim: 29 in 1/52 Lambda= 0.068220 statistics sampled from 14218 (14350) to 14218 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.732), E-opt: 0.2 (0.441), width: 16 Scan time: 7.530 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS30551.1 AGRN gene_id:375790|Hs108|chr1 (2045) 14597 1452.6 0 CCDS30625.1 HSPG2 gene_id:3339|Hs108|chr1 (4391) 701 85.3 6e-15 CCDS3925.1 EGFLAM gene_id:133584|Hs108|chr5 ( 775) 671 81.6 1.5e-14 CCDS3924.1 EGFLAM gene_id:133584|Hs108|chr5 (1009) 671 81.7 1.7e-14 CCDS56363.1 EGFLAM gene_id:133584|Hs108|chr5 (1017) 671 81.7 1.7e-14 CCDS47445.1 EYS gene_id:346007|Hs108|chr6 (3144) 570 72.3 3.6e-11 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: .: . : . CCDS30 ASGPGPEQEASFTVTVPPSEGSSYRLRSPVISIDPPS-STVQQGQDASFKCLIHDGAAPI 3000 3010 3020 3030 3040 3050 750 760 770 780 790 pF1KB9 AAQGACRGPTFAPLPPVAPLHCAQTPYGCCQDN-----ITAARGVGLAGCPSACQCNPHG . . :. . ..: : : .: .:. . :.: :. . . :: CCDS30 SLEWKTRNQELEDNVHISPNGSIITIVGTRPSNHGTYRCVASNAYGVA--QSVVNLSVHG 3060 3070 3080 3090 3100 3110 800 810 820 830 840 850 pF1KB9 SYGGTCDPATGQCSCRPGVG-GLRC-DRCEPGFWNFRGIVTDGRSGCTPCSCDPQGAVRD . : : . : . :.: . :: :. . : . :: . . . CCDS30 PPTVSVLPE-GPVWVKVGKAVTLECVSAGEP-----RSSARWTRISSTPAKLEQRTYGLM 3120 3130 3140 3150 3160 860 870 880 890 900 910 pF1KB9 DCEQMTGLCSCKPGVAGPKCGQCPDGRALGPAGCEA----DASAPATCA-EMRCEFGARC : . . . : ::. :: : ::: : .. :..: : : ... : . CCDS30 DSHAVLQISSAKPSDAGTYV--CLAQNALGTAQKQVEVIVDTGAMAPGAPQVQAEEAELT 3170 3180 3190 3200 3210 3220 920 930 940 950 960 970 pF1KB9 VEESGSAHCVCPMLTCPEANATKVCGSDGVTYGNECQLKT-IACRQGLQISIQSLGPCQE :: . .: : : . . . . .. . : : : . : : : . :. CCDS30 VEAGHTATLRCSATGSPAPTIHWSKLRSPLPWQHRLEGDTLIIPRVAQQDSGQYI--CN- 3230 3240 3250 3260 3270 980 990 1000 1010 1020 pF1KB9 AVAPSTHPTSASVT-VTTPGLLLSQALPAPPGALPLAPSST-----AHSQTTPPPSSR-P :..:. : .. . : .: : .: : : .. ::. ::: . . CCDS30 ATSPAGHAEATIILHVESP----PYATTVPEHASVQAGETVQLQCLAHG--TPPLTFQWS 3280 3290 3300 3310 3320 3330 1030 1040 1050 1060 1070 1080 pF1KB9 RTTASVP-RTTVW-PVLTVPPTAPSPAPSLVASAFGESGSTDGSSDEELSGDQEASGGGS :. .:.: :.:. .: .:: . . .. ::... .. ..: :. CCDS30 RVGSSLPGRATARNELLHFERAAPEDSGRYRCRVTNKVGSAEAFAQLLVQG---PPGSLP 3340 3350 3360 3370 3380 3390 1090 1100 1110 1120 1130 pF1KB9 GGLEPLEGSSVATPGPPVERASCYNSALGCC---SD-GKTPSLDAEGSNCPATKVFQ-GV . : .. .. : .: : :. : :: : ::.. : . : :: CCDS30 ATSIPAGSTPTVQVTPQLETKSIGASVEFHCAVPSDRGTQLRWFKEGGQLPPGHSVQDGV 3400 3410 3420 3430 3440 3450 1140 1150 1160 1170 1180 1190 pF1KB9 LELEGVEGQ-ELFYTPEMADPKSELFGETARSIESTLDDLFRNSDVKKDFRSVRLRDLGP :...... . . : . : .:.. : . ... : .: ..:. .. . CCDS30 LRIQNLDQSCQGTYICQAHGP----WGKAQASAQLVIQAL---PSVLINIRT-SVQTVVV 3460 3470 3480 3490 3500 1200 1210 1220 1230 1240 1250 pF1KB9 GKSVRAIVDVHFDPTTAFRAPDVARALLRQIQVSRRRSLGVRRPLQEHVRFMDFDWFPAF :..:. . :: :. . :: : .: :: : ::.. : . CCDS30 GHAVEFECLALGDPKPQVTWSKVG-GHLRPGIV---QSGGVVRI--AHVELADAGQYRCT 3510 3520 3530 3540 3550 1260 1270 1280 1290 1300 1310 pF1KB9 ITGATSGAIAAGATARATTASRLPSSAVTPRAPHPSHTSQPVAKTTAAP--TTRRP-PTT :.: ::.: . : .:. :. :... :...... : .. : : CCDS30 ATNA------AGTTQSHVL---LLVQAL-PQISMPQEVRVPAGSAAVFPCIASGYPTPDI 3560 3570 3580 3590 3600 1320 1330 1340 1350 1360 1370 pF1KB9 APSRVPGRRPPAPQQPPKPCDSQPCFHGGTCQDWALGGGFTCSCPAGRGGAVCEKVLGAP . :.. : :: . ... . . :: .: ..:. .: . : .: CCDS30 SWSKLDGSLPPDSRLE----NNMLMLPSVRPQD---AGTYVCTATNRQGKVKAFAHLQVP 3610 3620 3630 3640 3650 1380 1390 1400 1410 pF1KB9 ---VPAFEGR--SFLAFPTLR-AYHTLRLALEFRALEPQGLLLYNGNAR--GK------- :: : ::: .::.. ::. ... . :: .:.:::::. : :. CCDS30 ERVVPYFTQTPYSFLPLPTIKDAYRKFEIKITFRPDSADGMLLYNGQKRVPGSPTNLANR 3660 3670 3680 3690 3700 3710 1420 1430 1440 1450 1460 1470 pF1KB9 --DFLALALLDGRVQLRFDTGSGPAVLTSAVPVEPGQWHRLELSRHWRRGTLSVDGETPV ::....:. :: ..:::.::: :.. .:. :..: . : : .:.: : .:: CCDS30 QPDFISFGLVGGRPEFRFDAGSGMATIRHPTPLALGHFHTVTLLRSLTQGSLIVGDLAPV 3720 3730 3740 3750 3760 3770 1480 1490 1500 1510 1520 1530 pF1KB9 LGESPSGTDGLNLDTDLFVGGVPEDQAAVALERTFVGAGLRGCIRLLDVNNQRLELGIGP : : . .::.:. .:..:: : : .:. .. ...:. ::.: : ...... . CCDS30 NGTSQGKFQGLDLNEELYLGGYP-DYGAIP--KAGLSSGFIGCVRELRIQGEEI---VFH 3780 3790 3800 3810 3820 3830 1540 1550 1560 1570 1580 1590 pF1KB9 GAATRGSGVGECGDHPCLPNPCHGGAPCQNLEAGRFHCQCPPGRVGPTCADEKS-PCQPN . :...: : ::..:. :.. :.. . : :: : .: : .. :.:. CCDS30 DLNLTAHGISHCPT--CRDRPCQNGGQCHDSESSSYVCVCPAGFTGSRCEHSQALHCHPE 3840 3850 3860 3870 3880 3890 1600 1610 1620 1630 1640 1650 pF1KB9 PCHGAAPCRVLPEG-GAQCECPLGREGTFCQTASGQDGSGPFLADFNGFSHLELRGLHTF : : : :.: : :.: ::: : :. : . : :. . :.: : .: CCDS30 ACGPDATCVNRPDGRGYTCRCHLGRSGLRCE--EGVTVTTPSLSGAG--SYLALPAL--- 3900 3910 3920 3930 3940 1660 1670 1680 1690 1700 1710 pF1KB9 ARDLGEKMALEVVFLARGPSGLLLYNGQKTDGKGDFVSLALRDRRLEFRYDLGKGAAVIR . ... :.: : .:.:.::..: :. ::::::. .:::::.::.: ::.: CCDS30 -TNTHHELRLDVEFKPLAPDGVLLFSGGKSGPVEDFVSLAMVGGHLEFRYELGSGLAVLR 3950 3960 3970 3980 3990 4000 1720 1730 1740 1750 1760 1770 pF1KB9 SREPVTLGAWTRVSLERNGRKGALRVGDGPRVLGESPVPHTVLNLKEPLYVGGAPDFSKL : ::..:: : ::: :: .. :.:::. : :: :: :::. ::.::. : CCDS30 SAEPLALGRWHRVSAERLNKDGSLRVNGGRPVLRSSPGKSQGLNLHTLLYLGGVEPSVPL 4010 4020 4030 4040 4050 4060 1780 1790 1800 1810 1820 1830 pF1KB9 ARAAAVSSGFDGAIQLVSLGGRQL-LTPEHVLRQVDVTSFAGHPCTRASGHPCLNGASCV . :. .:. : : . ::..:..: :: . : . . :: : .:: .::.:. CCDS30 SPATNMSAHFRGCVGEVSVNGKRLDLTYSFLGSQGIGQCYDSSPCER---QPCQHGATCM 4070 4080 4090 4100 4110 4120 1840 1850 pF1KB9 P----------------------------REAAY--------VCLCPGGFSGPHCEKGL- : :: ::: :::::.:..: CCDS30 PAGEYEFQCLCRDGFKGDLCEHEENPCQLREPCLHGGTCQGTRCLCLPGFSGPRCQQGSG 4130 4140 4150 4160 4170 4180 1860 1870 1880 1890 pF1KB9 ---------VEKSAG------------DVDTLAFDGRTFVEYLNAVTESEKALQSNHFEL .: :.: : ::: :..: . : : :. .:: CCDS30 HGIAESDWHLEGSGGNDAPGQYGAYFHDDGFLAFPGHVFSRSLPEVPET--------IEL 4190 4200 4210 4220 4230 1900 1910 1920 1930 1940 1950 pF1KB9 SLRTEATQGLVLWSG----KATERADYVALAIVDGHLQLSYNLGSQPVVLRSTVPVNTNR .:: ...::.::.: .: . :...:.. :::: . :.::: . : : :.: .. CCDS30 EVRTSTASGLLLWQGVEVGEAGQGKDFISLGLQDGHLVFRYQLGSGEARLVSEDPINDGE 4240 4250 4260 4270 4280 4290 1960 1970 1980 1990 2000 2010 pF1KB9 WLRVVAHREQREGSLQVGNEAPVTGSSPLGATQLDTDGALWLGGLPELPVGPALPKAYGT : ::.: :: :.::.:: .: :.: :: . ... :....:: :. :. ... CCDS30 WHRVTALREGRRGSIQVDGEELVSGRSPGPNVAVNAKGSVYIGGAPD--VATLTGGRFSS 4300 4310 4320 4330 4340 4350 2020 2030 2040 pF1KB9 GFVGCLRDVVVGRHPLHLLEDAVTKPELRPCPTP :..::....:. CCDS30 GITGCVKNLVLHSARPGAPPPQPLDLQHRAQAGANTRPCPS 4360 4370 4380 4390 >>CCDS3925.1 EGFLAM gene_id:133584|Hs108|chr5 (775 aa) initn: 741 init1: 347 opt: 671 Z-score: 374.9 bits: 81.6 E(32554): 1.5e-14 Smith-Waterman score: 933; 31.4% identity (57.7% similar) in 577 aa overlap (1290-1857:67-590) 1260 1270 1280 1290 1300 1310 pF1KB9 ATSGAIAAGATARATTASRLPSSAVTPRAPHPSHTSQPVAKTTAA-PTTRRPPTTAPSRV .:. :. . :.:. :.: : : . 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CCDS39 YLGGAP---SAYWLVRATGTNRGFQGCVQSLAVNGRRIDMRPWPLGKALSGADVGECSSG 280 290 300 310 320 330 1560 1570 1580 1590 1600 1610 pF1KB9 PCLPNPC-HGGAPCQNLEAGRFHCQCPPGRVGPTCADEKSPCQPNPCHGAAPCRVLPEGG : : :::. : ..: . : :: : : : : : ..:. CCDS39 ICDEASCIHGGT-CTAIKADSYICLCPLGFKGRHCED-------------AFTLTIPQ-- 340 350 360 370 1620 1630 1640 1650 1660 1670 pF1KB9 AQCECPLGREGTFCQTASGQDGSGPFLADFNGFSHLELRGLHTFARDLGEKMALEVVFLA ::. .:. :. :: . .: : .:..: CCDS39 -------FRESLRSYAAT------PW--------PLEPQHYLSF-------MEFEITFRP 380 390 400 1680 1690 1700 1710 1720 1730 pF1KB9 RGPSGLLLYNGQKTDGKGDFVSLALRDRRLEFRYDLGKGAAVIRSREPVTLGAWTRVSLE . .:.:::. . :. ::.:. : ..:::.: :.:..:.::..:.::: : .. . CCDS39 DSGDGVLLYSYDT--GSKDFLSINLAGGHVEFRFDCGSGTGVLRSEDPLTLGNWHELRVS 410 420 430 440 450 460 1740 1750 1760 1770 1780 1790 pF1KB9 RNGRKGALRVGDGPRVLGESPVPHTVLNLKEPLYVGGAPDFSKLARAAAVSSGFDGAIQL :....: :.: : : . : .. . ...::.:... . . ..: . :.:.:: CCDS39 RTAKNGILQVDKQKIVEGMAEGGFTQIKCNTDIFIGGVPNYDDVKKNSGVLKPFSGSIQK 470 480 490 500 510 520 1800 1810 1820 1830 1840 1850 pF1KB9 VSLGGRQLLTPEHVLRQVDVTSFAGHPCTRASGHPCLNGASCVPREAAYVCLCPGGFSGP . :. : . . . :.: . :.:::.:: :: .:.:: ::. .: : :: :: : CCDS39 IILNDRTIHVKHDFTSGVNVEN-AAHPCVRA---PCAHGGSCRPRKEGYDCDCPLGFEGL 530 540 550 560 570 580 1860 1870 1880 1890 1900 1910 pF1KB9 HCEKGLVEKSAGDVDTLAFDGRTFVEYLNAVTESEKALQSNHFELSLRTEATQGLVLWSG ::.:... CCDS39 HCQKAIIEAIEIPQFIGRSYLTYDNPDILKRVSGSRSNVFMRFKTTAKDGLLLWRGDSPM 590 600 610 620 630 640 >>CCDS3924.1 EGFLAM gene_id:133584|Hs108|chr5 (1009 aa) initn: 741 init1: 347 opt: 671 Z-score: 373.6 bits: 81.7 E(32554): 1.7e-14 Smith-Waterman score: 933; 31.4% identity (57.7% similar) in 577 aa overlap (1290-1857:301-824) 1260 1270 1280 1290 1300 1310 pF1KB9 ATSGAIAAGATARATTASRLPSSAVTPRAPHPSHTSQPVAKTTAA-PTTRRPPTTAPSRV .:. :. . :.:. :.: : : . CCDS39 DISFEEVKPLPATKGGNKKFLVESKKMSISNPKTISRLIPPTSASLPVTTVAPQPIPIQR 280 290 300 310 320 330 1320 1330 1340 1350 1360 1370 pF1KB9 PGRRPPAPQQP--PKPCDSQPCFHGGTCQDWALGGGFTCSCPAGRGGAVCEKVLGAPVPA :. : .. ::: : . : . :: :.: :.:: : . . : CCDS39 KGKNGVAIMSRLFDMPCDETLCSADSFCVNDYTWGGSRCQCTLGKGGESCSEDIVIQYPQ 340 350 360 370 380 390 1380 1390 1400 1410 1420 1430 pF1KB9 FEGRSFLAFPTLR-AYHTLRLALEFRALEPQGLLLYNG-NARGK-DFLALALLDGRVQLR : :.:...: :. .:......::::: .::::: : : .:. ::..::.. .:.: CCDS39 FFGHSYVTFEPLKNSYQAFQITLEFRAEAEDGLLLYCGENEHGRGDFMSLAIIRRSLQFR 400 410 420 430 440 450 1440 1450 1460 1470 1480 1490 pF1KB9 FDTGSGPAVLTSAVPVEPGQWHRLELSRHWRRGTLSVDGETPVLGESPSGTDGLNLDTDL :. :.: :...: . .. : :: . : : : :.... ::: :.: . . ... : : CCDS39 FNCGTGVAIIVSETKIKLGGWHTVMLYRDGLNGLLQLNNGTPVTGQSQGQYSKITFRTPL 460 470 480 490 500 510 1500 1510 1520 1530 1540 1550 pF1KB9 FVGGVPEDQAAVALER-TFVGAGLRGCIRLLDVNNQRLELGIGP-GAATRGSGVGECGDH ..::.: .: : : : .. :..::.. : ::..:... : : : :. ::::.. CCDS39 YLGGAP---SAYWLVRATGTNRGFQGCVQSLAVNGRRIDMRPWPLGKALSGADVGECSSG 520 530 540 550 560 1560 1570 1580 1590 1600 1610 pF1KB9 PCLPNPC-HGGAPCQNLEAGRFHCQCPPGRVGPTCADEKSPCQPNPCHGAAPCRVLPEGG : : :::. : ..: . : :: : : : : : ..:. CCDS39 ICDEASCIHGGT-CTAIKADSYICLCPLGFKGRHCED-------------AFTLTIPQ-- 570 580 590 600 610 1620 1630 1640 1650 1660 1670 pF1KB9 AQCECPLGREGTFCQTASGQDGSGPFLADFNGFSHLELRGLHTFARDLGEKMALEVVFLA ::. .:. :. :: . .: : .:..: CCDS39 -------FRESLRSYAAT------PW--------PLEPQHYLSF-------MEFEITFRP 620 630 640 1680 1690 1700 1710 1720 1730 pF1KB9 RGPSGLLLYNGQKTDGKGDFVSLALRDRRLEFRYDLGKGAAVIRSREPVTLGAWTRVSLE . .:.:::. . :. ::.:. : ..:::.: :.:..:.::..:.::: : .. . CCDS39 DSGDGVLLYSYDT--GSKDFLSINLAGGHVEFRFDCGSGTGVLRSEDPLTLGNWHELRVS 650 660 670 680 690 700 1740 1750 1760 1770 1780 1790 pF1KB9 RNGRKGALRVGDGPRVLGESPVPHTVLNLKEPLYVGGAPDFSKLARAAAVSSGFDGAIQL :....: :.: : : . : .. . ...::.:... . . ..: . :.:.:: CCDS39 RTAKNGILQVDKQKIVEGMAEGGFTQIKCNTDIFIGGVPNYDDVKKNSGVLKPFSGSIQK 710 720 730 740 750 760 1800 1810 1820 1830 1840 1850 pF1KB9 VSLGGRQLLTPEHVLRQVDVTSFAGHPCTRASGHPCLNGASCVPREAAYVCLCPGGFSGP . :. : . . . :.: . :.:::.:: :: .:.:: ::. .: : :: :: : CCDS39 IILNDRTIHVKHDFTSGVNVEN-AAHPCVRA---PCAHGGSCRPRKEGYDCDCPLGFEGL 770 780 790 800 810 1860 1870 1880 1890 1900 1910 pF1KB9 HCEKGLVEKSAGDVDTLAFDGRTFVEYLNAVTESEKALQSNHFELSLRTEATQGLVLWSG ::.:... CCDS39 HCQKAIIEAIEIPQFIGRSYLTYDNPDILKRVSGSRSNVFMRFKTTAKDGLLLWRGDSPM 820 830 840 850 860 870 >>CCDS56363.1 EGFLAM gene_id:133584|Hs108|chr5 (1017 aa) initn: 741 init1: 347 opt: 671 Z-score: 373.5 bits: 81.7 E(32554): 1.7e-14 Smith-Waterman score: 927; 31.5% identity (57.5% similar) in 574 aa overlap (1290-1854:301-821) 1260 1270 1280 1290 1300 1310 pF1KB9 ATSGAIAAGATARATTASRLPSSAVTPRAPHPSHTSQPVAKTTAA-PTTRRPPTTAPSRV .:. :. . :.:. :.: : : . CCDS56 DISFEEVKPLPATKGGNKKFLVESKKMSISNPKTISRLIPPTSASLPVTTVAPQPIPIQR 280 290 300 310 320 330 1320 1330 1340 1350 1360 1370 pF1KB9 PGRRPPAPQQP--PKPCDSQPCFHGGTCQDWALGGGFTCSCPAGRGGAVCEKVLGAPVPA :. : .. ::: : . : . :: :.: :.:: : . . : CCDS56 KGKNGVAIMSRLFDMPCDETLCSADSFCVNDYTWGGSRCQCTLGKGGESCSEDIVIQYPQ 340 350 360 370 380 390 1380 1390 1400 1410 1420 1430 pF1KB9 FEGRSFLAFPTLR-AYHTLRLALEFRALEPQGLLLYNG-NARGK-DFLALALLDGRVQLR : :.:...: :. .:......::::: .::::: : : .:. ::..::.. .:.: CCDS56 FFGHSYVTFEPLKNSYQAFQITLEFRAEAEDGLLLYCGENEHGRGDFMSLAIIRRSLQFR 400 410 420 430 440 450 1440 1450 1460 1470 1480 1490 pF1KB9 FDTGSGPAVLTSAVPVEPGQWHRLELSRHWRRGTLSVDGETPVLGESPSGTDGLNLDTDL :. :.: :...: . .. : :: . : : : :.... ::: :.: . . ... : : CCDS56 FNCGTGVAIIVSETKIKLGGWHTVMLYRDGLNGLLQLNNGTPVTGQSQGQYSKITFRTPL 460 470 480 490 500 510 1500 1510 1520 1530 1540 1550 pF1KB9 FVGGVPEDQAAVALER-TFVGAGLRGCIRLLDVNNQRLELGIGP-GAATRGSGVGECGDH ..::.: .: : : : .. :..::.. : ::..:... : : : :. ::::.. CCDS56 YLGGAP---SAYWLVRATGTNRGFQGCVQSLAVNGRRIDMRPWPLGKALSGADVGECSSG 520 530 540 550 560 1560 1570 1580 1590 1600 1610 pF1KB9 PCLPNPC-HGGAPCQNLEAGRFHCQCPPGRVGPTCADEKSPCQPNPCHGAAPCRVLPEGG : : :::. : ..: . : :: : : : : : ..:. CCDS56 ICDEASCIHGGT-CTAIKADSYICLCPLGFKGRHCED-------------AFTLTIPQF- 570 580 590 600 610 1620 1630 1640 1650 1660 1670 pF1KB9 AQCECPLGREGTFCQTASGQDGSGPFLADFNGFSHLELRGLHTFARDLGEKMALEVVFLA ::. .:. :. :: . .: : .:..: CCDS56 --------RESLRSYAAT------PW--------PLEPQHYLSF-------MEFEITFRP 620 630 640 1680 1690 1700 1710 1720 1730 pF1KB9 RGPSGLLLYNGQKTDGKGDFVSLALRDRRLEFRYDLGKGAAVIRSREPVTLGAWTRVSLE . .:.:::. . :. ::.:. : ..:::.: :.:..:.::..:.::: : .. . 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