Result of FASTA (ccds) for pF1KB9487
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB9487, 1187 aa
  1>>>pF1KB9487 1187 - 1187 aa - 1187 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.1819+/-0.00105; mu= 10.3128+/- 0.064
 mean_var=162.4089+/-32.780, 0's: 0 Z-trim(109.9): 160  B-trim: 84 in 3/48
 Lambda= 0.100640
 statistics sampled from 11028 (11189) to 11028 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.67), E-opt: 0.2 (0.344), width:  16
 Scan time:  5.370

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS1514.1 PTPN14 gene_id:5784|Hs108|chr1          (1187) 7948 1166.9       0
CCDS9884.1 PTPN21 gene_id:11099|Hs108|chr14        (1174) 2539 381.5 6.4e-105
CCDS10280.1 PTPN9 gene_id:5780|Hs108|chr15         ( 593)  564 94.6 7.6e-19
CCDS48000.1 PTPN3 gene_id:5774|Hs108|chr9          ( 737)  555 93.4 2.3e-18
CCDS48001.1 PTPN3 gene_id:5774|Hs108|chr9          ( 782)  555 93.4 2.4e-18
CCDS13430.1 PTPN1 gene_id:5770|Hs108|chr20         ( 435)  539 90.9 7.3e-18
CCDS81741.1 PTPN11 gene_id:5781|Hs108|chr12        ( 597)  523 88.7 4.7e-17
CCDS56505.1 PTPRZ1 gene_id:5803|Hs108|chr7         (1448)  518 88.2 1.6e-16
CCDS2895.1 PTPRG gene_id:5793|Hs108|chr3           (1445)  512 87.3   3e-16
CCDS44820.1 PTPN6 gene_id:5777|Hs108|chr12         ( 595)  501 85.5 4.3e-16
CCDS41744.1 PTPN6 gene_id:5777|Hs108|chr12         ( 597)  501 85.5 4.3e-16
CCDS34740.1 PTPRZ1 gene_id:5803|Hs108|chr7         (2315)  512 87.4 4.4e-16
CCDS44821.1 PTPN6 gene_id:5777|Hs108|chr12         ( 624)  501 85.5 4.5e-16
CCDS2129.1 PTPN4 gene_id:5775|Hs108|chr2           ( 926)  482 82.8 4.2e-15
CCDS47474.1 EPB41L2 gene_id:2037|Hs108|chr6        ( 673)  459 79.4 3.3e-14
CCDS59037.1 EPB41L2 gene_id:2037|Hs108|chr6        ( 747)  459 79.4 3.6e-14
CCDS56450.1 EPB41L2 gene_id:2037|Hs108|chr6        ( 852)  459 79.5   4e-14
CCDS5141.1 EPB41L2 gene_id:2037|Hs108|chr6         (1005)  459 79.5 4.6e-14
CCDS54392.1 EPB41L5 gene_id:57669|Hs108|chr2       ( 505)  448 77.7 7.8e-14
CCDS54393.1 EPB41L5 gene_id:57669|Hs108|chr2       ( 687)  448 77.8   1e-13
CCDS82506.1 EPB41L5 gene_id:57669|Hs108|chr2       ( 732)  448 77.8 1.1e-13
CCDS2130.1 EPB41L5 gene_id:57669|Hs108|chr2        ( 733)  448 77.8 1.1e-13
CCDS43350.1 EPB41L4A gene_id:64097|Hs108|chr5      ( 686)  447 77.7 1.1e-13
CCDS58770.1 EPB41L1 gene_id:2036|Hs108|chr20       ( 701)  447 77.7 1.1e-13
CCDS13272.1 EPB41L1 gene_id:2036|Hs108|chr20       ( 779)  447 77.7 1.2e-13
CCDS58771.1 EPB41L1 gene_id:2036|Hs108|chr20       ( 880)  447 77.7 1.4e-13
CCDS13271.1 EPB41L1 gene_id:2036|Hs108|chr20       ( 881)  447 77.7 1.4e-13
CCDS63309.1 PTPN1 gene_id:5770|Hs108|chr20         ( 362)  437 76.0 1.8e-13
CCDS6776.1 PTPN3 gene_id:5774|Hs108|chr9           ( 913)  443 77.1 2.1e-13
CCDS43860.1 EPB41L4B gene_id:54566|Hs108|chr9      ( 518)  436 76.0 2.7e-13
CCDS62381.1 EPB41L3 gene_id:23136|Hs108|chr18      ( 865)  438 76.4 3.3e-13
CCDS62382.1 EPB41L3 gene_id:23136|Hs108|chr18      ( 883)  438 76.4 3.4e-13
CCDS73114.1 PTPN20 gene_id:26095|Hs108|chr10       ( 339)  430 75.0 3.5e-13
CCDS82237.1 EPB41L3 gene_id:23136|Hs108|chr18      ( 918)  438 76.4 3.5e-13
CCDS73105.1 PTPN20 gene_id:26095|Hs108|chr10       ( 411)  430 75.1   4e-13
CCDS73110.1 PTPN20 gene_id:26095|Hs108|chr10       ( 420)  430 75.1 4.1e-13
CCDS43859.1 EPB41L4B gene_id:54566|Hs108|chr9      ( 900)  436 76.1 4.2e-13
CCDS82236.1 EPB41L3 gene_id:23136|Hs108|chr18      ( 756)  434 75.8 4.5e-13
CCDS11838.1 EPB41L3 gene_id:23136|Hs108|chr18      (1087)  435 76.0 5.4e-13
CCDS9163.1 PTPN11 gene_id:5781|Hs108|chr12         ( 593)  430 75.1 5.5e-13
CCDS331.1 EPB41 gene_id:2035|Hs108|chr1            ( 588)  425 74.4   9e-13
CCDS332.1 EPB41 gene_id:2035|Hs108|chr1            ( 641)  425 74.4 9.6e-13
CCDS10107.2 FRMD5 gene_id:84978|Hs108|chr15        ( 570)  424 74.3 9.7e-13
CCDS53289.1 EPB41 gene_id:2035|Hs108|chr1          ( 720)  425 74.5 1.1e-12
CCDS53288.1 EPB41 gene_id:2035|Hs108|chr1          ( 864)  425 74.5 1.2e-12
CCDS75813.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9          (1496)  429 75.2 1.3e-12
CCDS55288.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9          (1502)  429 75.2 1.3e-12
CCDS6472.2 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9           (1505)  429 75.2 1.3e-12
CCDS55289.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9          (1505)  429 75.2 1.3e-12
CCDS55290.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9          (1506)  429 75.2 1.3e-12


>>CCDS1514.1 PTPN14 gene_id:5784|Hs108|chr1               (1187 aa)
 initn: 7948 init1: 7948 opt: 7948  Z-score: 6241.5  bits: 1166.9 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 7948; 100.0% identity (100.0% similar) in 1187 aa overlap (1-1187:1-1187)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MPFGLKLRRTRRYNVLSKNCFVTRIRLLDSNVIECTLSVESTGQECLEAVAQRLELRETH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 MPFGLKLRRTRRYNVLSKNCFVTRIRLLDSNVIECTLSVESTGQECLEAVAQRLELRETH
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 YFGLWFLSKSQQARWVELEKPLKKHLDKFANEPLLFFGVMFYVPNVSWLQQEATRYQYYL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 YFGLWFLSKSQQARWVELEKPLKKHLDKFANEPLLFFGVMFYVPNVSWLQQEATRYQYYL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 QVKKDVLEGRLRCTLDQVIRLAGLAVQADFGDYNQFDSQDFLREYVLFPMDLALEEAVLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 QVKKDVLEGRLRCTLDQVIRLAGLAVQADFGDYNQFDSQDFLREYVLFPMDLALEEAVLE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 ELTQKVAQEHKAHSGILPAEAELMYINEVERLDGFGQEIFPVKDNHGNCVHLGIFFMGIF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 ELTQKVAQEHKAHSGILPAEAELMYINEVERLDGFGQEIFPVKDNHGNCVHLGIFFMGIF
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 VRNRIGRQAVIYRWNDMGNITHNKSTILVELINKEETALFHTDDIENAKYISRLFATRHK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 VRNRIGRQAVIYRWNDMGNITHNKSTILVELINKEETALFHTDDIENAKYISRLFATRHK
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB9 FYKQNKICTEQSNSPPPIRRQPTWSRSSLPRQQPYILPPVHVQCGEHYSETHTSQDSIFH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 FYKQNKICTEQSNSPPPIRRQPTWSRSSLPRQQPYILPPVHVQCGEHYSETHTSQDSIFH
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB9 GNEEALYCNSHNSLDLNYLNGTVTNGSVCSVHSVNSLNCSQSFIQASPVSSNLSIPGSDI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 GNEEALYCNSHNSLDLNYLNGTVTNGSVCSVHSVNSLNCSQSFIQASPVSSNLSIPGSDI
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB9 MRADYIPSHRHSAIIVPSYRPTPDYETVMRQMKRGILHTDSQSQSLRNLNIINTHAYNQP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 MRADYIPSHRHSAIIVPSYRPTPDYETVMRQMKRGILHTDSQSQSLRNLNIINTHAYNQP
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB9 EDLVYSQPEMRERHPYTVPYGPQGVYSNKLVSPSDQRNPKNNVVPSKPGASAISHTVSTP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 EDLVYSQPEMRERHPYTVPYGPQGVYSNKLVSPSDQRNPKNNVVPSKPGASAISHTVSTP
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB9 ELANMQLQGSHNYSTAHMLKNYLFRPPPPYPRPRPATSTPDLASHRHKYVSGSSPDLVTR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 ELANMQLQGSHNYSTAHMLKNYLFRPPPPYPRPRPATSTPDLASHRHKYVSGSSPDLVTR
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB9 KVQLSVKTFQEDSSPVVHQSLQEVSEPLTATKHHGTVNKRHSLEVMNSMVRGMEAMTLKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 KVQLSVKTFQEDSSPVVHQSLQEVSEPLTATKHHGTVNKRHSLEVMNSMVRGMEAMTLKS
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB9 LHLPMARRNTLREQGPPEEGSGSHEVPQLPQYHHKKTFSDATMLIHSSESEEEEEEAPES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 LHLPMARRNTLREQGPPEEGSGSHEVPQLPQYHHKKTFSDATMLIHSSESEEEEEEAPES
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB9 VPQIPMLREKMEYSAQLQAALARIPNKPPPEYPGPRKSVSNGALRQDQASLPPAMARARV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 VPQIPMLREKMEYSAQLQAALARIPNKPPPEYPGPRKSVSNGALRQDQASLPPAMARARV
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB9 LRHGPAKAISMSRTDPPAVNGASLGPSISEPDLTSVKERVKKEPVKERPVSEMFSLEDSI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 LRHGPAKAISMSRTDPPAVNGASLGPSISEPDLTSVKERVKKEPVKERPVSEMFSLEDSI
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB9 IEREMMIRNLEKQKMAGLEAQKRPLMLAALNGLSVARVSGREENRVDATRVPMDERFRTL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 IEREMMIRNLEKQKMAGLEAQKRPLMLAALNGLSVARVSGREENRVDATRVPMDERFRTL
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KB9 KKKLEEGMVFTEYEQIPKKKANGIFSTAALPENAERSRIREVVPYEENRVELIPTKENNT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 KKKLEEGMVFTEYEQIPKKKANGIFSTAALPENAERSRIREVVPYEENRVELIPTKENNT
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KB9 GYINASHIKVVVGGAEWHYIATQGPLPHTCHDFWQMVWEQGVNVIAMVTAEEEGGRTKSH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 GYINASHIKVVVGGAEWHYIATQGPLPHTCHDFWQMVWEQGVNVIAMVTAEEEGGRTKSH
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KB9 RYWPKLGSKHSSATYGKFKVTTKFRTDSVCYATTGLKVKHLLSGQERTVWHLQYTDWPDH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 RYWPKLGSKHSSATYGKFKVTTKFRTDSVCYATTGLKVKHLLSGQERTVWHLQYTDWPDH
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KB9 GCPEDVQGFLSYLEEIQSVRRHTNSMLEGTKNRHPPIVVHCSAGVGRTGVLILSELMIYC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 GCPEDVQGFLSYLEEIQSVRRHTNSMLEGTKNRHPPIVVHCSAGVGRTGVLILSELMIYC
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180       
pF1KB9 LEHNEKVEVPMMLRLLREQRMFMIQTIAQYKFVYQVLIQFLQNSRLI
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 LEHNEKVEVPMMLRLLREQRMFMIQTIAQYKFVYQVLIQFLQNSRLI
             1150      1160      1170      1180       

>>CCDS9884.1 PTPN21 gene_id:11099|Hs108|chr14             (1174 aa)
 initn: 3257 init1: 1359 opt: 2539  Z-score: 1997.2  bits: 381.5 E(32554): 6.4e-105
Smith-Waterman score: 4164; 54.5% identity (78.6% similar) in 1210 aa overlap (1-1187:3-1174)

                 10        20        30        40        50        
pF1KB9   MPFGLKLRRTRRYNVLSKNCFVTRIRLLDSNVIECTLSVESTGQECLEAVAQRLELRE
         .::::::.:::::.: ::.:.:.::.::... .: :::::::::: ::::::::::::
CCDS98 MPLPFGLKLKRTRRYTVSSKSCLVARIQLLNNEFVEFTLSVESTGQESLEAVAQRLELRE
               10        20        30        40        50        60

       60        70        80        90       100       110        
pF1KB9 THYFGLWFLSKSQQARWVELEKPLKKHLDKFANEPLLFFGVMFYVPNVSWLQQEATRYQY
       . ::.::. .:..: :::.:::::::.:::.: :: ..:::.::::.:: :::: :::::
CCDS98 VTYFSLWYYNKQNQRRWVDLEKPLKKQLDKYALEPTVYFGVVFYVPSVSQLQQEITRYQY
               70        80        90       100       110       120

      120       130       140       150       160       170        
pF1KB9 YLQVKKDVLEGRLRCTLDQVIRLAGLAVQADFGDYNQFDSQDFLREYVLFPMDLALEEAV
       :::.:::.::: . :::.:.:.::::::::::::..:..:::::....:::.    .: :
CCDS98 YLQLKKDILEGSIPCTLEQAIQLAGLAVQADFGDFDQYESQDFLQKFALFPVGWLQDEKV
              130       140       150       160       170       180

      180       190       200       210       220       230        
pF1KB9 LEELTQKVAQEHKAHSGILPAEAELMYINEVERLDGFGQEIFPVKDNHGNCVHLGIFFMG
       ::: :::::  :. . :.   .::..:..::::.::.:.: .:.::..:. . .:  . :
CCDS98 LEEATQKVALLHQKYRGLTAPDAEMLYMQEVERMDGYGEESYPAKDSQGSDISIGACLEG
              190       200       210       220       230       240

      240       250       260       270       280       290        
pF1KB9 IFVRNRIGRQAVIYRWNDMGNITHNKSTILVELINKEETALFHTDDIENAKYISRLFATR
       :::... ::. :..::.:..:..:::: . .:: :::::  :.:.:.:.:::: :: ..:
CCDS98 IFVKHKNGRHPVVFRWHDIANMSHNKSFFALELANKEETIQFQTEDMETAKYIWRLCVAR
              250       260       270       280       290       300

      300       310         320       330       340        350     
pF1KB9 HKFYKQNKICTEQSNSPP--PIRRQPTWSRSSLPRQQPYILPPV-HVQCGEHYSETH-TS
       ::::. :. :. :...    ::::. . :: :::. :::..::  ... . ::.: . .:
CCDS98 HKFYRLNQ-CNLQTQTVTVNPIRRRSS-SRMSLPKPQPYVMPPPPQLHYNGHYTEPYASS
               310       320        330       340       350        

          360       370         380       390       400       410  
pF1KB9 QDSIFHGNEEALYCNSHNSLDLNY--LNGTVTNGSVCSVHSVNSLNCSQSFIQASPVSSN
       ::..:  :... ::.:..:::     ::: . :::: :.::.::::  : ..: ::.:::
CCDS98 QDNLFVPNQNGYYCHSQTSLDRAQIDLNGRIRNGSVYSAHSTNSLNNPQPYLQPSPMSSN
      360       370       380       390       400       410        

            420       430       440       450       460       470  
pF1KB9 LSIPGSDIMRADYIPSHRHSAIIVPSYRPTPDYETVMRQMKRGILHTDSQSQSLRNLNII
        :: :::.:: ::.:::::::.: :::::::::::::.:..::..:.. ::.::::::: 
CCDS98 PSITGSDVMRPDYLPSHRHSAVIPPSYRPTPDYETVMKQLNRGLVHAERQSHSLRNLNIG
      420       430       440       450       460       470        

            480       490       500         510       520       530
pF1KB9 NTHAYNQPEDLVYSQPEMRERHPYTVPYGPQGVYS--NKLVSPSDQRNPKNNVVPSKPGA
       ...::..:  :::::::.::.     : . .  .:   .. :::    : .     .: .
CCDS98 SSYAYSRPAALVYSQPEIREHAQLPSPAAAHCPFSLSYSFHSPSPYPYPAER----RPVV
      480       490       500       510       520       530        

              540       550       560       570       580       590
pF1KB9 SAISHTVSTPELANMQLQGSHNYSTAHMLKNYLFRPPPPYPRPRPATSTPDLASHRHKYV
       .:    ::.:::.: ::: ...: . ..... ..::::::: ::::.:::::.  :: :.
CCDS98 GA----VSVPELTNAQLQ-AQDYPSPNIMRTQVYRPPPPYPPPRPANSTPDLS--RHLYI
              540        550       560       570       580         

              600       610       620       630       640       650
pF1KB9 SGSSPDLVTRKVQLSVKTFQEDSSPVVHQSLQEVSEPLTATKHHGTVNKRHSLEVMNSMV
       :.:.:::.::.:. ::.:::::: ::.: :::::::::::..: . ..::.:.:: . . 
CCDS98 SSSNPDLITRRVHHSVQTFQEDSLPVAH-SLQEVSEPLTAARH-AQLHKRNSIEVAG-LS
       590       600       610        620        630       640     

              660            670            680       690       700
pF1KB9 RGMEAMTLKSLHLP-----MARRNTLREQGPP-----EEGSGSHEVPQLPQYHHKKTFSD
       .:.:.. ::   :      .: : .   . :       .  : .:.  : .: :::..::
CCDS98 HGLEGLRLKERTLSASAAEVAPRAVSVGSQPSVFTERTQREGPEEAEGL-RYGHKKSLSD
          650       660       670       680       690        700   

              710       720       730       740       750       760
pF1KB9 ATMLIHSSESEEEEEEAPESVPQIPMLREKMEYSAQLQAALARIPNKPPPEYPGPRKSVS
       ::::::::: ::.:.   ::  . :  : .     . . .::. :       ::  . . 
CCDS98 ATMLIHSSEEEEDEDFEEESGARAPPARAR-----EPRPGLAQDP-------PGCPRVLL
           710       720       730            740              750 

                770       780       790       800       810        
pF1KB9 NGALR--QDQASLPPAMARARVLRHGPAKAISMSRTDPPAVNGASLGPSISEPDLT-SVK
        : :.  . .: .:   :. :..  .:..  . .... :  .:  : ::.:: ::: : .
CCDS98 AGPLHILEPKAHVPD--AEKRMMDSSPVR--TTAEAQRPWRDGL-LMPSMSESDLTTSGR
             760         770         780       790        800      

       820       830       840       850       860        870      
pF1KB9 ERVKKEPVKERPVSEMFSLEDSIIEREMMIRNLEKQKMAGLEAQK-RPLMLAALNGLSVA
        :.... .:.::::...: . .:.:    . ...: ..   .:.:  :: ::::::::..
CCDS98 YRARRDSLKKRPVSDLLSGKKNIVEGLPPLGGMKKTRV---DAKKIGPLKLAALNGLSLS
        810       820       830       840          850       860   

        880       890       900       910       920        930     
pF1KB9 RVSGREENRVDATRVPMDERFRTLKKKLEEGMVFTEYEQIPKKK-ANGIFSTAALPENAE
       ::   .:..  :::.  ::: . :...::.::::::::.: ::. ..:  ::: ::::::
CCDS98 RVPLPDEGKEVATRATNDERCKILEQRLEQGMVFTEYERILKKRLVDGECSTARLPENAE
           870       880       890       900       910       920   

         940       950       960       970       980       990     
pF1KB9 RSRIREVVPYEENRVELIPTKENNTGYINASHIKVVVGGAEWHYIATQGPLPHTCHDFWQ
       :.:...:.::.. ::::.::::::::::::::::: :.: :: :::::::: .::.::::
CCDS98 RNRFQDVLPYDDVRVELVPTKENNTGYINASHIKVSVSGIEWDYIATQGPLQNTCQDFWQ
           930       940       950       960       970       980   

        1000      1010      1020      1030      1040      1050     
pF1KB9 MVWEQGVNVIAMVTAEEEGGRTKSHRYWPKLGSKHSSATYGKFKVTTKFRTDSVCYATTG
       ::::::. .:::::::::::: :: ::::.:::.:...:::.::.::.::::: ::::::
CCDS98 MVWEQGIAIIAMVTAEEEGGREKSFRYWPRLGSRHNTVTYGRFKITTRFRTDSGCYATTG
           990      1000      1010      1020      1030      1040   

        1060      1070      1080      1090      1100      1110     
pF1KB9 LKVKHLLSGQERTVWHLQYTDWPDHGCPEDVQGFLSYLEEIQSVRRHTNSMLEGTKNRHP
       ::.::::.:::::::::::::::.::::::..::::::::::::::::::  .  .. .:
CCDS98 LKMKHLLTGQERTVWHLQYTDWPEHGCPEDLKGFLSYLEEIQSVRRHTNSTSD-PQSPNP
          1050      1060      1070      1080      1090       1100  

        1120      1130      1140      1150      1160      1170     
pF1KB9 PIVVHCSAGVGRTGVLILSELMIYCLEHNEKVEVPMMLRLLREQRMFMIQTIAQYKFVYQ
       :..::::::::::::.::::.:: :::::: ...: .: .::.:::...::. :: :::.
CCDS98 PLLVHCSAGVGRTGVVILSEIMIACLEHNEVLDIPRVLDMLRQQRMMLVQTLCQYTFVYR
           1110      1120      1130      1140      1150      1160  

        1180       
pF1KB9 VLIQFLQNSRLI
       ::::::..::::
CCDS98 VLIQFLKSSRLI
           1170    

>>CCDS10280.1 PTPN9 gene_id:5780|Hs108|chr15              (593 aa)
 initn: 465 init1: 206 opt: 564  Z-score: 451.8  bits: 94.6 E(32554): 7.6e-19
Smith-Waterman score: 564; 33.9% identity (62.6% similar) in 313 aa overlap (887-1187:276-581)

        860       870       880       890             900       910
pF1KB9 GLEAQKRPLMLAALNGLSVARVSGREENRVDATRVP------MDERFRTLKKKLEEGMVF
                                     :...::      ..:    .. . ..: ..
CCDS10 WNFQFLPQVNGHPDPFDEIILFSLPPALDWDSVHVPGPHAMTIQELVDYVNARQKQG-IY
         250       260       270       280       290       300     

              920       930       940       950        960         
pF1KB9 TEYEQIPKKKANGIFSTAALPENAERSRIREVVPYEENRVELIP-TKENNTGYINASHIK
        :::.: ...  : :  .  : : :..:  .:   ...::.:   . ...: ::::: . 
CCDS10 EEYEDIRRENPVGTFHCSMSPGNLEKNRYGDVPCLDQTRVKLTKRSGHTQTDYINASFMD
          310       320       330       340       350       360    

     970        980       990      1000      1010      1020        
pF1KB9 VVVGGAEWH-YIATQGPLPHTCHDFWQMVWEQGVNVIAMVTAEEEGGRTKSHRYWPKLGS
          :  . . ::.::::: .: .::: ::::: : ::.:.:  ::::: :  .:::    
CCDS10 ---GYKQKNAYIGTQGPLENTYRDFWLMVWEQKVLVIVMTTRFEEGGRRKCGQYWPL--E
             370       380       390       400       410           

     1030      1040      1050      1060      1070      1080        
pF1KB9 KHSSATYGKFKVTTKFRTDSVCYATTGLKVKHLLSGQERTVWHLQYTDWPDHGCPEDVQG
       : :   .: . ::.    .   :  : :....    :.: : :.:. .:::.: : .. .
CCDS10 KDSRIRFGFLTVTNLGVENMNHYKKTTLEIHNTEERQKRQVTHFQFLSWPDYGVPSSAAS
     420       430       440       450       460       470         

     1090      1100      1110          1120      1130      1140    
pF1KB9 FLSYLEEIQSVRRHTNSMLEGTKNR----HPPIVVHCSAGVGRTGVLILSELMIYCLEHN
       ....:. ... .  . : . :....    .::::::::::.::::..   .. .  ::. 
CCDS10 LIDFLRVVRNQQSLAVSNM-GARSKGQCPEPPIVVHCSAGIGRTGTFCSLDICLAQLEEL
     480       490        500       510       520       530        

         1150      1160      1170      1180                   
pF1KB9 EKVEVPMMLRLLREQRMFMIQTIAQYKFVYQVLIQFLQNSRLI            
         ..: . .  .: :: : :::  :: : :.....: ..  ..            
CCDS10 GTLNVFQTVSRMRTQRAFSIQTPEQYYFCYKAILEFAEKEGMVSSGQNLLAVESQ
      540       550       560       570       580       590   

>>CCDS48000.1 PTPN3 gene_id:5774|Hs108|chr9               (737 aa)
 initn: 898 init1: 236 opt: 555  Z-score: 443.3  bits: 93.4 E(32554): 2.3e-18
Smith-Waterman score: 714; 39.8% identity (69.7% similar) in 284 aa overlap (900-1179:461-724)

     870       880       890       900       910       920         
pF1KB9 LNGLSVARVSGREENRVDATRVPMDERFRTLKKKLEEGMVFTEYEQIPKKKANGIFSTAA
                                     ::: :: : :. ..::. .:: .  .. : 
CCDS48 SEDELNQLFPEAIFPMCPEGGDTLEGSMAQLKKGLESGTVLIQFEQLYRKKPGLAITFAK
              440       450       460       470       480       490

     930       940       950       960       970         980       
pF1KB9 LPENAERSRIREVVPYEENRVELIPTKENNTGYINASHIKVVVGGAEW--HYIATQGPLP
       ::.: ...: ..:.::. .:: :    ..:  :::::.... . .:.   .:::::::::
CCDS48 LPQNLDKNRYKDVLPYDTTRVLL----QGNEDYINASYVNMEIPAANLVNKYIATQGPLP
              500       510           520       530       540      

       990      1000      1010      1020      1030      1040       
pF1KB9 HTCHDFWQMVWEQGVNVIAMVTAEEEGGRTKSHRYWPKLGSKHSSATYGKFKVTTKFRTD
       ::: .:::.::.: ...:.:.:.  : :::: :.:::   .  .  ..: :..  . .  
CCDS48 HTCAQFWQVVWDQKLSLIVMLTTLTERGRTKCHQYWP---DPPDVMNHGGFHIQCQSEDC
        550       560       570       580          590       600   

      1050      1060      1070      1080      1090      1100       
pF1KB9 SVCYATTGLKVKHLLSGQERTVWHLQYTDWPDHGCPEDVQGFLSYLEEIQSVRRHTNSML
       .. :..  . : .  .:.:.:: ::::. ::::: :.: . :: ... ..:.:  ..   
CCDS48 TIAYVSREMLVTNTQTGEEHTVTHLQYVAWPDHGVPDDSSDFLEFVNYVRSLRVDSE---
           610       620       630       640       650       660   

      1110      1120      1130      1140       1150       1160     
pF1KB9 EGTKNRHPPIVVHCSAGVGRTGVLILSELMIYCL-EHNEKVEVPM-MLRLLREQRMFMIQ
               :..::::::.::::::.  :  . :: :.:  .  :. ..: .:.:: .:.:
CCDS48 --------PVLVHCSAGIGRTGVLVTMETAM-CLTERNLPI-YPLDIVRKMRDQRAMMVQ
                      670       680        690        700       710

        1170      1180            
pF1KB9 TIAQYKFVYQVLIQFLQNSRLI     
       : .::::: .....             
CCDS48 TSSQYKFVCEAILRVYEEGLVQMLDPS
              720       730       

>>CCDS48001.1 PTPN3 gene_id:5774|Hs108|chr9               (782 aa)
 initn: 898 init1: 236 opt: 555  Z-score: 443.0  bits: 93.4 E(32554): 2.4e-18
Smith-Waterman score: 714; 39.8% identity (69.7% similar) in 284 aa overlap (900-1179:506-769)

     870       880       890       900       910       920         
pF1KB9 LNGLSVARVSGREENRVDATRVPMDERFRTLKKKLEEGMVFTEYEQIPKKKANGIFSTAA
                                     ::: :: : :. ..::. .:: .  .. : 
CCDS48 SEDELNQLFPEAIFPMCPEGGDTLEGSMAQLKKGLESGTVLIQFEQLYRKKPGLAITFAK
         480       490       500       510       520       530     

     930       940       950       960       970         980       
pF1KB9 LPENAERSRIREVVPYEENRVELIPTKENNTGYINASHIKVVVGGAEW--HYIATQGPLP
       ::.: ...: ..:.::. .:: :    ..:  :::::.... . .:.   .:::::::::
CCDS48 LPQNLDKNRYKDVLPYDTTRVLL----QGNEDYINASYVNMEIPAANLVNKYIATQGPLP
         540       550           560       570       580       590 

       990      1000      1010      1020      1030      1040       
pF1KB9 HTCHDFWQMVWEQGVNVIAMVTAEEEGGRTKSHRYWPKLGSKHSSATYGKFKVTTKFRTD
       ::: .:::.::.: ...:.:.:.  : :::: :.:::   .  .  ..: :..  . .  
CCDS48 HTCAQFWQVVWDQKLSLIVMLTTLTERGRTKCHQYWP---DPPDVMNHGGFHIQCQSEDC
             600       610       620          630       640        

      1050      1060      1070      1080      1090      1100       
pF1KB9 SVCYATTGLKVKHLLSGQERTVWHLQYTDWPDHGCPEDVQGFLSYLEEIQSVRRHTNSML
       .. :..  . : .  .:.:.:: ::::. ::::: :.: . :: ... ..:.:  ..   
CCDS48 TIAYVSREMLVTNTQTGEEHTVTHLQYVAWPDHGVPDDSSDFLEFVNYVRSLRVDSE---
      650       660       670       680       690       700        

      1110      1120      1130      1140       1150       1160     
pF1KB9 EGTKNRHPPIVVHCSAGVGRTGVLILSELMIYCL-EHNEKVEVPM-MLRLLREQRMFMIQ
               :..::::::.::::::.  :  . :: :.:  .  :. ..: .:.:: .:.:
CCDS48 --------PVLVHCSAGIGRTGVLVTMETAM-CLTERNLPI-YPLDIVRKMRDQRAMMVQ
                 710       720        730        740       750     

        1170      1180            
pF1KB9 TIAQYKFVYQVLIQFLQNSRLI     
       : .::::: .....             
CCDS48 TSSQYKFVCEAILRVYEEGLVQMLDPS
         760       770       780  

>>CCDS13430.1 PTPN1 gene_id:5770|Hs108|chr20              (435 aa)
 initn: 368 init1: 294 opt: 539  Z-score: 434.2  bits: 90.9 E(32554): 7.3e-18
Smith-Waterman score: 539; 33.4% identity (63.8% similar) in 290 aa overlap (893-1179:3-276)

            870       880       890       900       910       920  
pF1KB9 RPLMLAALNGLSVARVSGREENRVDATRVPMDERFRTLKKKLEEGMVFTEYEQIPKKKAN
                                     :...:. . :.   :   . :..: .. ..
CCDS13                             MEMEKEFEQIDKS---GSWAAIYQDIRHEASD
                                           10           20         

            930       940       950       960       970       980  
pF1KB9 GIFSTAALPENAERSRIREVVPYEENRVELIPTKENNTGYINASHIKVVVGGAEWHYIAT
           .: ::.: .:.: :.: :....:..:   .:.:  ::::: ::.    :.  :: :
CCDS13 FPCRVAKLPKNKNRNRYRDVSPFDHSRIKL--HQEDND-YINASLIKMEE--AQRSYILT
      30        40        50          60         70          80    

            990      1000      1010      1020      1030      1040  
pF1KB9 QGPLPHTCHDFWQMVWEQGVNVIAMVTAEEEGGRTKSHRYWPKLGSKHSSATYGKFKVTT
       :::::.::  ::.:::::    ..:..   : :  :  .:::.   :.      ..:.: 
CCDS13 QGPLPNTCGHFWEMVWEQKSRGVVMLNRVMEKGSLKCAQYWPQKEEKEMIFEDTNLKLTL
           90       100       110       120       130       140    

           1050      1060      1070      1080      1090      1100  
pF1KB9 KFRTDSVCYATTGLKVKHLLSGQERTVWHLQYTDWPDHGCPEDVQGFLSYLEEIQSVRRH
         .  .  :..  :....: . . : . :..:: ::: : ::.  .::..: ..    :.
CCDS13 ISEDIKSYYTVRQLELENLTTQETREILHFHYTTWPDFGVPESPASFLNFLFKV----RE
          150       160       170       180       190           200

           1110      1120      1130      1140         1150         
pF1KB9 TNSMLEGTKNRHPPIVVHCSAGVGRTGVLILSELMIYCLEHNE---KVEVPMMLRLLREQ
       ..:.    . .: :.:::::::.::.:.. :..  .  ... .   .:..  .:  .:. 
CCDS13 SGSL----SPEHGPVVVHCSAGIGRSGTFCLADTCLLLMDKRKDPSSVDIKKVLLEMRKF
                  210       220       230       240       250      

    1160      1170      1180                                       
pF1KB9 RMFMIQTIAQYKFVYQVLIQFLQNSRLI                                
       :: .:::  : .: : ..:.                                        
CCDS13 RMGLIQTADQLRFSYLAVIEGAKFIMGDSSVQDQWKELSHEDLEPPPEHIPPPPRPPKRI
        260       270       280       290       300       310      

>>CCDS81741.1 PTPN11 gene_id:5781|Hs108|chr12             (597 aa)
 initn: 467 init1: 167 opt: 523  Z-score: 419.6  bits: 88.7 E(32554): 4.7e-17
Smith-Waterman score: 541; 32.3% identity (64.6% similar) in 322 aa overlap (885-1182:220-527)

          860       870       880       890       900              
pF1KB9 MAGLEAQKRPLMLAALNGLSVARVSGREENRVDATRVPMDERFRTLKK------KLEEGM
                                     :..:...  . : : :.:      :...:.
CCDS81 LTDLVEHYKKNPMVETLGTVLQLKQPLNTTRINAAEI--ESRVRELSKLAETTDKVKQGF
     190       200       210       220         230       240       

      910       920         930       940       950         960    
pF1KB9 VFTEYEQIPKKKANGIFST--AALPENAERSRIREVVPYEENRVELIPTKENN--TGYIN
        . :.: . ... . ..:   .   :: ...: ....:....:: :     :.  . :::
CCDS81 -WEEFETLQQQECKLLYSRKEGQRQENKNKNRYKNILPFDHTRVVLHDGDPNEPVSDYIN
        250       260       270       280       290       300      

                970       980       990      1000      1010        
pF1KB9 ASHI------KVVVGGAEWHYIATQGPLPHTCHDFWQMVWEQGVNVIAMVTAEEEGGRTK
       :. :      :   .  .  :::::: : .: .:::.::....  ::.:.: : : :..:
CCDS81 ANIIMPEFETKCNNSKPKKSYIATQGCLQNTVNDFWRMVFQENSRVIVMTTKEVERGKSK
        310       320       330       340       350       360      

     1020      1030      1040      1050      1060           1070   
pF1KB9 SHRYWPKLGSKHSSATYGKFKVTTKFRTDSVCYATTGLKVKH----LLSGQ-ERTVWHLQ
         .:::   ....   :: ..: .  .. .  :.   ::...    ::.:. :::::. .
CCDS81 CVKYWP---DEYALKEYGVMRVRNVKESAAHDYTLRELKLSKVGQALLQGNTERTVWQYH
        370          380       390       400       410       420   

          1080      1090      1100      1110      1120      1130   
pF1KB9 YTDWPDHGCPEDVQGFLSYLEEIQSVRRHTNSMLEGTKNRHPPIVVHCSAGVGRTGVLIL
       .  ::::: : :  : :..:::..  ... . :  :      :.:::::::.::::..:.
CCDS81 FRTWPDHGVPSDPGGVLDFLEEVH--HKQESIMDAG------PVVVHCSAGIGRTGTFIV
           430       440         450             460       470     

          1140         1150      1160      1170      1180          
pF1KB9 SELMIYCLEH---NEKVEVPMMLRLLREQRMFMIQTIAQYKFVYQVLIQFLQNSRLI   
        ...:  ...   .  ..::  ....: ::  :.:: :::.:.:... ....        
CCDS81 IDILIDIIREKGVDCDIDVPKTIQMVRSQRSGMVQTEAQYRFIYMAVQHYIETLQRRIEE
         480       490       500       510       520       530     

CCDS81 EQKSKRKGHEYTNIKYSLADQTSGDQSPLPPCTPTPPCAEMREDSARVYENVGLMQQQKS
         540       550       560       570       580       590     

>>CCDS56505.1 PTPRZ1 gene_id:5803|Hs108|chr7              (1448 aa)
 initn: 455 init1: 204 opt: 518  Z-score: 410.0  bits: 88.2 E(32554): 1.6e-16
Smith-Waterman score: 518; 33.1% identity (62.3% similar) in 308 aa overlap (887-1179:835-1124)

        860       870       880       890       900       910      
pF1KB9 GLEAQKRPLMLAALNGLSVARVSGREENRVDATRVPMDERFRTLKKKLEEGMVFTE-YEQ
                                     :.  .:. ..:      :. .  ::: .:.
CCDS56 CFQTAHFYLEDSTSPRVISTPPTPIFPISDDVGAIPI-KHFPKHVADLHASSGFTEEFEE
          810       820       830       840        850       860   

         920         930       940       950          960       970
pF1KB9 IPKKKAN-GIFS-TAALPENAERSRIREVVPYEENRVELIPTKENN---TGYINASHIKV
       . .  .. :: . ..  :.: ...:  ..: :...::.:    :..   : ::::...  
CCDS56 VQSCTVDLGITADSSNHPDNKHKNRYINIVAYDHSRVKLAQLAEKDGKLTDYINANYVDG
           870       880       890       900       910       920   

              980       990      1000      1010      1020      1030
pF1KB9 VVGGAEWHYIATQGPLPHTCHDFWQMVWEQGVNVIAMVTAEEEGGRTKSHRYWPKLGSKH
          .    :::.::::  : .:::.:.::..:.::.:.:   : :: :  .:::  ::..
CCDS56 Y--NRPKAYIAAQGPLKSTAEDFWRMIWEHNVEVIVMITNLVEKGRRKCDQYWPADGSEE
             930       940       950       960       970       980 

             1040      1050         1060            1070      1080 
pF1KB9 SSATYGKFKVTTKFRTDSVCYATT---GLKVKHLLSGQE------RTVWHLQYTDWPDHG
           ::.: :: :  .. . : :.    :.  .. .:..      :.: . .::.::: :
CCDS56 ----YGNFLVTQK-SVQVLAYYTVRNFTLRNTKIKKGSQKGRPSGRVVTQYHYTQWPDMG
                 990       1000      1010      1020      1030      

            1090      1100      1110      1120      1130      1140 
pF1KB9 CPEDVQGFLSYLEEIQSVRRHTNSMLEGTKNRHPPIVVHCSAGVGRTGVLILSELMIYCL
        ::     :.....   ..::. .          :.::::::::::::. :. . :.  .
CCDS56 VPEYSLPVLTFVRKAAYAKRHAVG----------PVVVHCSAGVGRTGTYIVLDSMLQQI
       1040      1050      1060                1070      1080      

            1150      1160      1170      1180                     
pF1KB9 EHNEKVEVPMMLRLLREQRMFMIQTIAQYKFVYQVLIQFLQNSRLI              
       .:.  :..  .:. .: :: ...::  :: :....:..                      
CCDS56 QHEGTVNIFGFLKHIRSQRNYLVQTEEQYVFIHDTLVEAILSKETEVLDSHIHAYVNALL
       1090      1100      1110      1120      1130      1140      

CCDS56 IPGPAGKTKLEKQFQLLSQSNIQQSDYSAALKQCNREKNRTSSIIPVERSRVGISSLSGE
       1150      1160      1170      1180      1190      1200      

>>CCDS2895.1 PTPRG gene_id:5793|Hs108|chr3                (1445 aa)
 initn: 432 init1: 201 opt: 512  Z-score: 405.3  bits: 87.3 E(32554): 3e-16
Smith-Waterman score: 515; 24.5% identity (49.3% similar) in 877 aa overlap (415-1179:296-1118)

          390       400       410       420       430         440  
pF1KB9 NGSVCSVHSVNSLNCSQSFIQASPVSSNLSIPGSDIMRADYIPSHR-HSAIIVPS-YRPT
                                     . . . .: .. :..: :. ..  :  : .
CCDS28 EWIVFRRPVPISYHQLEAFYSIFTTEQQDHVKSVEYLRNNFRPQQRLHDRVVSKSAVRDS
         270       280       290       300       310       320     

            450       460       470       480        490       500 
pF1KB9 PDYETVMRQMKRGILHTDSQSQSLRNLNIINTHAYNQPEDLV-YSQPEMRERHPYTVPYG
        ...  : .. .. : :....        ....  ::    : .::::    ::  . : 
CCDS28 WNHD--MTDFLENPLGTEASKVCSSPPIHMKVQPLNQTALQVSWSQPETI-YHPPIMNY-
           330       340       350       360       370        380  

             510       520       530       540        550       560
pF1KB9 PQGVYSNKLVSPSDQRNPKNNVVPSKPGASAISHTVSTPELANMQLQG-SHNYSTAHMLK
          . : . ..  :...   .   .:   ..::: ::   :  ...:.  .:   . . .
CCDS28 ---MISYSWTKNEDEKEKTFTKDSDKDLKATISH-VSPDSLYLFRVQAVCRNDMRSDFSQ
                390       400       410        420       430       

              570                   580       590       600        
pF1KB9 NYLFRPPPPY------------PRPRPATSTPDLASHRHKYVSGSSPDLVTRKVQLSVKT
       ..::.                 :   ::.:. :.:      .:..:   ..  . .:  .
CCDS28 TMLFQANTTRIFQGTRIVKTGVPTASPASSA-DMAP-----ISSGSSTWTSSGIPFSFVS
       440       450       460        470            480       490 

      610       620       630       640       650       660        
pF1KB9 FQEDSSPVVHQSLQEVSEPLTATKHHGTVNKRHSLEVMNSMVRGMEAMTLKSLHLPMARR
       .    .:    :   :.  .:.:   :      ..  . : :   .  :  :     :: 
CCDS28 MATGMGPSSSGSQATVASVVTSTLLAGLGFGGGGISSFPSTVWPTRLPTAASASKQAARP
             500       510       520       530       540       550 

      670       680       690       700       710       720        
pF1KB9 NTLREQGPPEEGSGSHEVPQLPQYHHKKTFSDATMLIHSSESEEEEEEAPESVPQIPMLR
            ..    :  .   :       ..  .:     ..::::. :.:  :.  .     
CCDS28 VLATTEALASPGPDGDSSPTKDGEGTEEGEKD-----EKSESEDGEREHEEDGEKD---S
             560       570       580            590       600      

      730       740       750       760            770       780   
pF1KB9 EKMEYSAQLQAALARIPNKPPPEYPGPRKSVSNG-----ALRQDQASLPPAMARARVLRH
       :: : :.  .::  :  ..: :   .: ... .:     . .::....:  .. .:    
CCDS28 EKKEKSGVTHAAEERNQTEPSPTPSSPNRTAEGGHQTIPGHEQDHTAVPTDQTGGRR-DA
           610       620       630       640       650       660   

           790       800       810       820       830         840 
pF1KB9 GPAKAISMSRTDPPAVNGASLGPSISEPDLTSVKERVKKEPVKERPVS--EMFSLEDSII
       ::.        ::  :..... :. .: . ..   .  . : : .:.:  . :: :::  
CCDS28 GPG-------LDPDMVTSTQVPPTATEEQYAGSDPKRPEMPSK-KPMSRGDRFS-EDS--
                   670       680       690        700        710   

             850         860                  870       880        
pF1KB9 EREMMIRNLEKQK--MAGLEAQKR-----PLMLAA------LNGLSVARVSGREENRVDA
        : . .   ::.   : .  :  :     ::....      :  : .. :  :  :.. .
CCDS28 -RFITVNPAEKNTSGMISRPAPGRMEWIIPLIVVSALTFVCLILLIAVLVYWRGCNKIKS
              720       730       740       750       760       770

      890       900                                       910      
pF1KB9 TRVPMDERFRTLKKKLEEGM--------------------------------VFTEYEQI
          :  .::: . .. :.:                                 .  ..: :
CCDS28 KGFP--RRFREVPSSGERGEKGSRKCFQTAHFYVEDSSSPRVVPNESIPIIPIPDDMEAI
                780       790       800       810       820        

           920                        930                940       
pF1KB9 PKK---KANG-IFS----------------TAAL---------PENAERSRIREVVPYEE
       : :   :  : ..:                :: .         ::: ...:  ... :..
CCDS28 PVKQFVKHIGELYSNNQHGFSEDFEEVQRCTADMNITAEHSNHPENKHKNRYINILAYDH
      830       840       850       860       870       880        

       950          960       970        980       990      1000   
pF1KB9 NRVEL--IPTKEN-NTGYINASHIKVVVGGAEWH-YIATQGPLPHTCHDFWQMVWEQGVN
       .::.:  .: :.. .. ::::...    :  . . ::::::::  : .:::.:.:::...
CCDS28 SRVKLRPLPGKDSKHSDYINANYVD---GYNKAKAYIATQGPLKSTFEDFWRMIWEQNTG
      890       900       910          920       930       940     

          1010      1020      1030      1040      1050      1060   
pF1KB9 VIAMVTAEEEGGRTKSHRYWPKLGSKHSSATYGKFKVTTKFRTDSVCYATTGLKVKH--L
       .:.:.:   : :: :  .:::     ..:  ::.. :: :     .::..  .....  .
CCDS28 IIVMITNLVEKGRRKCDQYWPT----ENSEEYGNIIVTLKSTKIHACYTVRRFSIRNTKV
         950       960           970       980       990      1000 

                     1070      1080      1090      1100      1110  
pF1KB9 LSGQ---------ERTVWHLQYTDWPDHGCPEDVQGFLSYLEEIQSVRRHTNSMLEGTKN
        .::         ::.: . .::.::: : :: .   :..      ::: . . .  :  
CCDS28 KKGQKGNPKGRQNERVVIQYHYTQWPDMGVPEYALPVLTF------VRRSSAARMPETG-
            1010      1020      1030      1040            1050     

           1120      1130      1140      1150      1160      1170  
pF1KB9 RHPPIVVHCSAGVGRTGVLILSELMIYCLEHNEKVEVPMMLRLLREQRMFMIQTIAQYKF
          :..:::::::::::. :. . :.  .. .  :.:  .:. .: :: ...::  :: :
CCDS28 ---PVLVHCSAGVGRTGTYIVIDSMLQQIKDKSTVNVLGFLKHIRTQRNYLVQTEEQYIF
            1060      1070      1080      1090      1100      1110 

           1180                                                    
pF1KB9 VYQVLIQFLQNSRLI                                             
       ....:..                                                     
CCDS28 IHDALLEAILGKETEVSSNQLHSYVNSILIPGVGGKTRLEKQFKLVTQCNAKYVECFSAQ
            1120      1130      1140      1150      1160      1170 

>>CCDS44820.1 PTPN6 gene_id:5777|Hs108|chr12              (595 aa)
 initn: 525 init1: 188 opt: 501  Z-score: 402.3  bits: 85.5 E(32554): 4.3e-16
Smith-Waterman score: 609; 34.4% identity (64.7% similar) in 317 aa overlap (885-1185:217-520)

          860       870       880       890       900              
pF1KB9 MAGLEAQKRPLMLAALNGLSVARVSGREENRVDATRVPMDERFRTLKKKLE-----EGMV
                                     ::.:. .  ..:   :.:: :     ..  
CCDS44 LTDLVEHFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADI--ENRVLELNKKQESEDTAKAGF
        190       200       210       220         230       240    

     910       920         930       940       950       960       
pF1KB9 FTEYEQIPKKKANGIFST--AALPENAERSRIREVVPYEENRVELIPTKENNTG--YINA
       . :.:.. :...... .   .  :::  ..: ....:....:: :     :  :  ::::
CCDS44 WEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKGKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNIPGSDYINA
          250       260       270       280       290       300    

         970          980       990      1000      1010      1020  
pF1KB9 SHIKVVVGGAEWH---YIATQGPLPHTCHDFWQMVWEQGVNVIAMVTAEEEGGRTKSHRY
       ..::  . : . .   :::.:: :  : .:::::.:...  ::.:.: : : ::.:   :
CCDS44 NYIKNQLLGPDENAKTYIASQGCLEATVNDFWQMAWQENSRVIVMTTREVEKGRNKCVPY
          310       320       330       340       350       360    

           1030      1040      1050      1060       1070      1080 
pF1KB9 WPKLGSKHSSATYGKFKVTTKFRTDSVCYATTGLKVKHLLSGQE-RTVWHLQYTDWPDHG
       ::..: ...   :: ..::.  . :.. :    :.:. : .:.  : .:: :: .:::::
CCDS44 WPEVGMQRA---YGPYSVTNCGEHDTTEYKLRTLQVSPLDNGDLIREIWHYQYLSWPDHG
          370          380       390       400       410       420 

            1090      1100      1110      1120      1130      1140 
pF1KB9 CPEDVQGFLSYLEEIQSVRRHTNSMLEGTKNRHPPIVVHCSAGVGRTGVLILSELMIYCL
        : .  : ::.:..:.  .:. .    :      ::.::::::.::::..:. ....  .
CCDS44 VPSEPGGVLSFLDQIN--QRQESLPHAG------PIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMENI
             430         440             450       460       470   

               1150      1160      1170      1180                  
pF1KB9 EH---NEKVEVPMMLRLLREQRMFMIQTIAQYKFVYQVLIQFLQNSRLI           
            .  ...   ....: ::  :.:: :::::.: .. ::.....             
CCDS44 STKGLDCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVLQSQKGQE
           480       490       500       510       520       530   

CCDS44 SEYGNITYPPAMKNAHAKASRTSSKHKEDVYENLHTKNKREEKVKKQRSADKEKSKGSLK
           540       550       560       570       580       590   




1187 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Thu Nov  3 23:52:50 2016 done: Thu Nov  3 23:52:51 2016
 Total Scan time:  5.370 Total Display time:  0.280

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com