FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB9487, 1187 aa 1>>>pF1KB9487 1187 - 1187 aa - 1187 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.1819+/-0.00105; mu= 10.3128+/- 0.064 mean_var=162.4089+/-32.780, 0's: 0 Z-trim(109.9): 160 B-trim: 84 in 3/48 Lambda= 0.100640 statistics sampled from 11028 (11189) to 11028 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.67), E-opt: 0.2 (0.344), width: 16 Scan time: 5.370 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS1514.1 PTPN14 gene_id:5784|Hs108|chr1 (1187) 7948 1166.9 0 CCDS9884.1 PTPN21 gene_id:11099|Hs108|chr14 (1174) 2539 381.5 6.4e-105 CCDS10280.1 PTPN9 gene_id:5780|Hs108|chr15 ( 593) 564 94.6 7.6e-19 CCDS48000.1 PTPN3 gene_id:5774|Hs108|chr9 ( 737) 555 93.4 2.3e-18 CCDS48001.1 PTPN3 gene_id:5774|Hs108|chr9 ( 782) 555 93.4 2.4e-18 CCDS13430.1 PTPN1 gene_id:5770|Hs108|chr20 ( 435) 539 90.9 7.3e-18 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:::.:.:.::::::::::::..:..:::::....:::. .: : CCDS98 YLQLKKDILEGSIPCTLEQAIQLAGLAVQADFGDFDQYESQDFLQKFALFPVGWLQDEKV 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KB9 LEELTQKVAQEHKAHSGILPAEAELMYINEVERLDGFGQEIFPVKDNHGNCVHLGIFFMG ::: ::::: :. . :. .::..:..::::.::.:.: .:.::..:. . .: . : CCDS98 LEEATQKVALLHQKYRGLTAPDAEMLYMQEVERMDGYGEESYPAKDSQGSDISIGACLEG 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KB9 IFVRNRIGRQAVIYRWNDMGNITHNKSTILVELINKEETALFHTDDIENAKYISRLFATR :::... ::. :..::.:..:..:::: . .:: ::::: :.:.:.:.:::: :: ..: CCDS98 IFVKHKNGRHPVVFRWHDIANMSHNKSFFALELANKEETIQFQTEDMETAKYIWRLCVAR 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KB9 HKFYKQNKICTEQSNSPP--PIRRQPTWSRSSLPRQQPYILPPV-HVQCGEHYSETH-TS ::::. :. :. :... ::::. . :: :::. :::..:: ... . ::.: . .: CCDS98 HKFYRLNQ-CNLQTQTVTVNPIRRRSS-SRMSLPKPQPYVMPPPPQLHYNGHYTEPYASS 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KB9 QDSIFHGNEEALYCNSHNSLDLNY--LNGTVTNGSVCSVHSVNSLNCSQSFIQASPVSSN ::..: :... ::.:..::: ::: . :::: :.::.:::: : ..: ::.::: CCDS98 QDNLFVPNQNGYYCHSQTSLDRAQIDLNGRIRNGSVYSAHSTNSLNNPQPYLQPSPMSSN 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KB9 LSIPGSDIMRADYIPSHRHSAIIVPSYRPTPDYETVMRQMKRGILHTDSQSQSLRNLNII :: :::.:: ::.:::::::.: :::::::::::::.:..::..:.. ::.::::::: CCDS98 PSITGSDVMRPDYLPSHRHSAVIPPSYRPTPDYETVMKQLNRGLVHAERQSHSLRNLNIG 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KB9 NTHAYNQPEDLVYSQPEMRERHPYTVPYGPQGVYS--NKLVSPSDQRNPKNNVVPSKPGA ...::..: :::::::.::. : . . .: .. ::: : . .: . CCDS98 SSYAYSRPAALVYSQPEIREHAQLPSPAAAHCPFSLSYSFHSPSPYPYPAER----RPVV 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 pF1KB9 SAISHTVSTPELANMQLQGSHNYSTAHMLKNYLFRPPPPYPRPRPATSTPDLASHRHKYV .: ::.:::.: ::: ...: . ..... ..::::::: ::::.:::::. :: :. CCDS98 GA----VSVPELTNAQLQ-AQDYPSPNIMRTQVYRPPPPYPPPRPANSTPDLS--RHLYI 540 550 560 570 580 600 610 620 630 640 650 pF1KB9 SGSSPDLVTRKVQLSVKTFQEDSSPVVHQSLQEVSEPLTATKHHGTVNKRHSLEVMNSMV :.:.:::.::.:. ::.:::::: ::.: :::::::::::..: . ..::.:.:: . . CCDS98 SSSNPDLITRRVHHSVQTFQEDSLPVAH-SLQEVSEPLTAARH-AQLHKRNSIEVAG-LS 590 600 610 620 630 640 660 670 680 690 700 pF1KB9 RGMEAMTLKSLHLP-----MARRNTLREQGPP-----EEGSGSHEVPQLPQYHHKKTFSD .:.:.. :: : .: : . . : . : .:. : .: :::..:: CCDS98 HGLEGLRLKERTLSASAAEVAPRAVSVGSQPSVFTERTQREGPEEAEGL-RYGHKKSLSD 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 pF1KB9 ATMLIHSSESEEEEEEAPESVPQIPMLREKMEYSAQLQAALARIPNKPPPEYPGPRKSVS ::::::::: ::.:. :: . : : . . . .::. : :: . . CCDS98 ATMLIHSSEEEEDEDFEEESGARAPPARAR-----EPRPGLAQDP-------PGCPRVLL 710 720 730 740 750 770 780 790 800 810 pF1KB9 NGALR--QDQASLPPAMARARVLRHGPAKAISMSRTDPPAVNGASLGPSISEPDLT-SVK : :. . .: .: :. :.. .:.. . .... : .: : ::.:: ::: : . CCDS98 AGPLHILEPKAHVPD--AEKRMMDSSPVR--TTAEAQRPWRDGL-LMPSMSESDLTTSGR 760 770 780 790 800 820 830 840 850 860 870 pF1KB9 ERVKKEPVKERPVSEMFSLEDSIIEREMMIRNLEKQKMAGLEAQK-RPLMLAALNGLSVA :.... .:.::::...: . .:.: . ...: .. .:.: :: ::::::::.. CCDS98 YRARRDSLKKRPVSDLLSGKKNIVEGLPPLGGMKKTRV---DAKKIGPLKLAALNGLSLS 810 820 830 840 850 860 880 890 900 910 920 930 pF1KB9 RVSGREENRVDATRVPMDERFRTLKKKLEEGMVFTEYEQIPKKK-ANGIFSTAALPENAE :: .:.. :::. ::: . :...::.::::::::.: ::. ..: ::: :::::: CCDS98 RVPLPDEGKEVATRATNDERCKILEQRLEQGMVFTEYERILKKRLVDGECSTARLPENAE 870 880 890 900 910 920 940 950 960 970 980 990 pF1KB9 RSRIREVVPYEENRVELIPTKENNTGYINASHIKVVVGGAEWHYIATQGPLPHTCHDFWQ :.:...:.::.. ::::.::::::::::::::::: :.: :: :::::::: .::.:::: CCDS98 RNRFQDVLPYDDVRVELVPTKENNTGYINASHIKVSVSGIEWDYIATQGPLQNTCQDFWQ 930 940 950 960 970 980 1000 1010 1020 1030 1040 1050 pF1KB9 MVWEQGVNVIAMVTAEEEGGRTKSHRYWPKLGSKHSSATYGKFKVTTKFRTDSVCYATTG ::::::. .:::::::::::: :: ::::.:::.:...:::.::.::.::::: :::::: CCDS98 MVWEQGIAIIAMVTAEEEGGREKSFRYWPRLGSRHNTVTYGRFKITTRFRTDSGCYATTG 990 1000 1010 1020 1030 1040 1060 1070 1080 1090 1100 1110 pF1KB9 LKVKHLLSGQERTVWHLQYTDWPDHGCPEDVQGFLSYLEEIQSVRRHTNSMLEGTKNRHP ::.::::.:::::::::::::::.::::::..:::::::::::::::::: . .. .: CCDS98 LKMKHLLTGQERTVWHLQYTDWPEHGCPEDLKGFLSYLEEIQSVRRHTNSTSD-PQSPNP 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1120 1130 1140 1150 1160 1170 pF1KB9 PIVVHCSAGVGRTGVLILSELMIYCLEHNEKVEVPMMLRLLREQRMFMIQTIAQYKFVYQ :..::::::::::::.::::.:: :::::: ...: .: .::.:::...::. :: :::. CCDS98 PLLVHCSAGVGRTGVVILSEIMIACLEHNEVLDIPRVLDMLRQQRMMLVQTLCQYTFVYR 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1180 pF1KB9 VLIQFLQNSRLI ::::::..:::: CCDS98 VLIQFLKSSRLI 1170 >>CCDS10280.1 PTPN9 gene_id:5780|Hs108|chr15 (593 aa) initn: 465 init1: 206 opt: 564 Z-score: 451.8 bits: 94.6 E(32554): 7.6e-19 Smith-Waterman score: 564; 33.9% identity (62.6% similar) in 313 aa overlap (887-1187:276-581) 860 870 880 890 900 910 pF1KB9 GLEAQKRPLMLAALNGLSVARVSGREENRVDATRVP------MDERFRTLKKKLEEGMVF :...:: ..: .. . ..: .. CCDS10 WNFQFLPQVNGHPDPFDEIILFSLPPALDWDSVHVPGPHAMTIQELVDYVNARQKQG-IY 250 260 270 280 290 300 920 930 940 950 960 pF1KB9 TEYEQIPKKKANGIFSTAALPENAERSRIREVVPYEENRVELIP-TKENNTGYINASHIK :::.: ... : : . : : :..: .: ...::.: . ...: ::::: . CCDS10 EEYEDIRRENPVGTFHCSMSPGNLEKNRYGDVPCLDQTRVKLTKRSGHTQTDYINASFMD 310 320 330 340 350 360 970 980 990 1000 1010 1020 pF1KB9 VVVGGAEWH-YIATQGPLPHTCHDFWQMVWEQGVNVIAMVTAEEEGGRTKSHRYWPKLGS : . . ::.::::: .: .::: ::::: : ::.:.: ::::: : .::: CCDS10 ---GYKQKNAYIGTQGPLENTYRDFWLMVWEQKVLVIVMTTRFEEGGRRKCGQYWPL--E 370 380 390 400 410 1030 1040 1050 1060 1070 1080 pF1KB9 KHSSATYGKFKVTTKFRTDSVCYATTGLKVKHLLSGQERTVWHLQYTDWPDHGCPEDVQG : : .: . ::. . : : :.... :.: : :.:. .:::.: : .. . CCDS10 KDSRIRFGFLTVTNLGVENMNHYKKTTLEIHNTEERQKRQVTHFQFLSWPDYGVPSSAAS 420 430 440 450 460 470 1090 1100 1110 1120 1130 1140 pF1KB9 FLSYLEEIQSVRRHTNSMLEGTKNR----HPPIVVHCSAGVGRTGVLILSELMIYCLEHN ....:. ... . . : . :.... .::::::::::.::::.. .. . ::. CCDS10 LIDFLRVVRNQQSLAVSNM-GARSKGQCPEPPIVVHCSAGIGRTGTFCSLDICLAQLEEL 480 490 500 510 520 530 1150 1160 1170 1180 pF1KB9 EKVEVPMMLRLLREQRMFMIQTIAQYKFVYQVLIQFLQNSRLI ..: . . .: :: : ::: :: : :.....: .. .. CCDS10 GTLNVFQTVSRMRTQRAFSIQTPEQYYFCYKAILEFAEKEGMVSSGQNLLAVESQ 540 550 560 570 580 590 >>CCDS48000.1 PTPN3 gene_id:5774|Hs108|chr9 (737 aa) initn: 898 init1: 236 opt: 555 Z-score: 443.3 bits: 93.4 E(32554): 2.3e-18 Smith-Waterman score: 714; 39.8% identity (69.7% similar) in 284 aa overlap (900-1179:461-724) 870 880 890 900 910 920 pF1KB9 LNGLSVARVSGREENRVDATRVPMDERFRTLKKKLEEGMVFTEYEQIPKKKANGIFSTAA ::: :: : :. ..::. .:: . .. : CCDS48 SEDELNQLFPEAIFPMCPEGGDTLEGSMAQLKKGLESGTVLIQFEQLYRKKPGLAITFAK 440 450 460 470 480 490 930 940 950 960 970 980 pF1KB9 LPENAERSRIREVVPYEENRVELIPTKENNTGYINASHIKVVVGGAEW--HYIATQGPLP ::.: ...: ..:.::. .:: : ..: :::::.... . .:. .::::::::: CCDS48 LPQNLDKNRYKDVLPYDTTRVLL----QGNEDYINASYVNMEIPAANLVNKYIATQGPLP 500 510 520 530 540 990 1000 1010 1020 1030 1040 pF1KB9 HTCHDFWQMVWEQGVNVIAMVTAEEEGGRTKSHRYWPKLGSKHSSATYGKFKVTTKFRTD ::: .:::.::.: ...:.:.:. : :::: :.::: . . ..: :.. . . CCDS48 HTCAQFWQVVWDQKLSLIVMLTTLTERGRTKCHQYWP---DPPDVMNHGGFHIQCQSEDC 550 560 570 580 590 600 1050 1060 1070 1080 1090 1100 pF1KB9 SVCYATTGLKVKHLLSGQERTVWHLQYTDWPDHGCPEDVQGFLSYLEEIQSVRRHTNSML .. :.. . : . .:.:.:: ::::. ::::: :.: . :: ... ..:.: .. CCDS48 TIAYVSREMLVTNTQTGEEHTVTHLQYVAWPDHGVPDDSSDFLEFVNYVRSLRVDSE--- 610 620 630 640 650 660 1110 1120 1130 1140 1150 1160 pF1KB9 EGTKNRHPPIVVHCSAGVGRTGVLILSELMIYCL-EHNEKVEVPM-MLRLLREQRMFMIQ :..::::::.::::::. : . :: :.: . :. ..: .:.:: .:.: CCDS48 --------PVLVHCSAGIGRTGVLVTMETAM-CLTERNLPI-YPLDIVRKMRDQRAMMVQ 670 680 690 700 710 1170 1180 pF1KB9 TIAQYKFVYQVLIQFLQNSRLI : .::::: ..... CCDS48 TSSQYKFVCEAILRVYEEGLVQMLDPS 720 730 >>CCDS48001.1 PTPN3 gene_id:5774|Hs108|chr9 (782 aa) initn: 898 init1: 236 opt: 555 Z-score: 443.0 bits: 93.4 E(32554): 2.4e-18 Smith-Waterman score: 714; 39.8% identity (69.7% similar) in 284 aa overlap (900-1179:506-769) 870 880 890 900 910 920 pF1KB9 LNGLSVARVSGREENRVDATRVPMDERFRTLKKKLEEGMVFTEYEQIPKKKANGIFSTAA ::: :: : :. ..::. .:: . .. : CCDS48 SEDELNQLFPEAIFPMCPEGGDTLEGSMAQLKKGLESGTVLIQFEQLYRKKPGLAITFAK 480 490 500 510 520 530 930 940 950 960 970 980 pF1KB9 LPENAERSRIREVVPYEENRVELIPTKENNTGYINASHIKVVVGGAEW--HYIATQGPLP ::.: ...: ..:.::. .:: : ..: :::::.... . .:. .::::::::: CCDS48 LPQNLDKNRYKDVLPYDTTRVLL----QGNEDYINASYVNMEIPAANLVNKYIATQGPLP 540 550 560 570 580 590 990 1000 1010 1020 1030 1040 pF1KB9 HTCHDFWQMVWEQGVNVIAMVTAEEEGGRTKSHRYWPKLGSKHSSATYGKFKVTTKFRTD ::: .:::.::.: ...:.:.:. : :::: :.::: . . ..: :.. . . CCDS48 HTCAQFWQVVWDQKLSLIVMLTTLTERGRTKCHQYWP---DPPDVMNHGGFHIQCQSEDC 600 610 620 630 640 1050 1060 1070 1080 1090 1100 pF1KB9 SVCYATTGLKVKHLLSGQERTVWHLQYTDWPDHGCPEDVQGFLSYLEEIQSVRRHTNSML .. :.. . : . .:.:.:: ::::. ::::: :.: . :: ... ..:.: .. CCDS48 TIAYVSREMLVTNTQTGEEHTVTHLQYVAWPDHGVPDDSSDFLEFVNYVRSLRVDSE--- 650 660 670 680 690 700 1110 1120 1130 1140 1150 1160 pF1KB9 EGTKNRHPPIVVHCSAGVGRTGVLILSELMIYCL-EHNEKVEVPM-MLRLLREQRMFMIQ :..::::::.::::::. : . :: :.: . :. ..: .:.:: .:.: CCDS48 --------PVLVHCSAGIGRTGVLVTMETAM-CLTERNLPI-YPLDIVRKMRDQRAMMVQ 710 720 730 740 750 1170 1180 pF1KB9 TIAQYKFVYQVLIQFLQNSRLI : .::::: ..... CCDS48 TSSQYKFVCEAILRVYEEGLVQMLDPS 760 770 780 >>CCDS13430.1 PTPN1 gene_id:5770|Hs108|chr20 (435 aa) initn: 368 init1: 294 opt: 539 Z-score: 434.2 bits: 90.9 E(32554): 7.3e-18 Smith-Waterman score: 539; 33.4% identity (63.8% similar) in 290 aa overlap (893-1179:3-276) 870 880 890 900 910 920 pF1KB9 RPLMLAALNGLSVARVSGREENRVDATRVPMDERFRTLKKKLEEGMVFTEYEQIPKKKAN :...:. . :. : . :..: .. .. CCDS13 MEMEKEFEQIDKS---GSWAAIYQDIRHEASD 10 20 930 940 950 960 970 980 pF1KB9 GIFSTAALPENAERSRIREVVPYEENRVELIPTKENNTGYINASHIKVVVGGAEWHYIAT .: ::.: .:.: :.: :....:..: .:.: ::::: ::. :. :: : CCDS13 FPCRVAKLPKNKNRNRYRDVSPFDHSRIKL--HQEDND-YINASLIKMEE--AQRSYILT 30 40 50 60 70 80 990 1000 1010 1020 1030 1040 pF1KB9 QGPLPHTCHDFWQMVWEQGVNVIAMVTAEEEGGRTKSHRYWPKLGSKHSSATYGKFKVTT :::::.:: ::.::::: ..:.. : : : .:::. :. ..:.: CCDS13 QGPLPNTCGHFWEMVWEQKSRGVVMLNRVMEKGSLKCAQYWPQKEEKEMIFEDTNLKLTL 90 100 110 120 130 140 1050 1060 1070 1080 1090 1100 pF1KB9 KFRTDSVCYATTGLKVKHLLSGQERTVWHLQYTDWPDHGCPEDVQGFLSYLEEIQSVRRH . . :.. :....: . . : . :..:: ::: : ::. .::..: .. :. CCDS13 ISEDIKSYYTVRQLELENLTTQETREILHFHYTTWPDFGVPESPASFLNFLFKV----RE 150 160 170 180 190 200 1110 1120 1130 1140 1150 pF1KB9 TNSMLEGTKNRHPPIVVHCSAGVGRTGVLILSELMIYCLEHNE---KVEVPMMLRLLREQ ..:. . .: :.:::::::.::.:.. :.. . ... . .:.. .: .:. CCDS13 SGSL----SPEHGPVVVHCSAGIGRSGTFCLADTCLLLMDKRKDPSSVDIKKVLLEMRKF 210 220 230 240 250 1160 1170 1180 pF1KB9 RMFMIQTIAQYKFVYQVLIQFLQNSRLI :: .::: : .: : ..:. CCDS13 RMGLIQTADQLRFSYLAVIEGAKFIMGDSSVQDQWKELSHEDLEPPPEHIPPPPRPPKRI 260 270 280 290 300 310 >>CCDS81741.1 PTPN11 gene_id:5781|Hs108|chr12 (597 aa) initn: 467 init1: 167 opt: 523 Z-score: 419.6 bits: 88.7 E(32554): 4.7e-17 Smith-Waterman score: 541; 32.3% identity (64.6% similar) in 322 aa overlap (885-1182:220-527) 860 870 880 890 900 pF1KB9 MAGLEAQKRPLMLAALNGLSVARVSGREENRVDATRVPMDERFRTLKK------KLEEGM :..:... . : : :.: :...:. CCDS81 LTDLVEHYKKNPMVETLGTVLQLKQPLNTTRINAAEI--ESRVRELSKLAETTDKVKQGF 190 200 210 220 230 240 910 920 930 940 950 960 pF1KB9 VFTEYEQIPKKKANGIFST--AALPENAERSRIREVVPYEENRVELIPTKENN--TGYIN . :.: . ... . ..: . :: ...: ....:....:: : :. . ::: CCDS81 -WEEFETLQQQECKLLYSRKEGQRQENKNKNRYKNILPFDHTRVVLHDGDPNEPVSDYIN 250 260 270 280 290 300 970 980 990 1000 1010 pF1KB9 ASHI------KVVVGGAEWHYIATQGPLPHTCHDFWQMVWEQGVNVIAMVTAEEEGGRTK :. : : . . :::::: : .: .:::.::.... ::.:.: : : :..: CCDS81 ANIIMPEFETKCNNSKPKKSYIATQGCLQNTVNDFWRMVFQENSRVIVMTTKEVERGKSK 310 320 330 340 350 360 1020 1030 1040 1050 1060 1070 pF1KB9 SHRYWPKLGSKHSSATYGKFKVTTKFRTDSVCYATTGLKVKH----LLSGQ-ERTVWHLQ .::: .... :: ..: . .. . :. ::... ::.:. :::::. . CCDS81 CVKYWP---DEYALKEYGVMRVRNVKESAAHDYTLRELKLSKVGQALLQGNTERTVWQYH 370 380 390 400 410 420 1080 1090 1100 1110 1120 1130 pF1KB9 YTDWPDHGCPEDVQGFLSYLEEIQSVRRHTNSMLEGTKNRHPPIVVHCSAGVGRTGVLIL . ::::: : : : :..:::.. ... . : : :.:::::::.::::..:. CCDS81 FRTWPDHGVPSDPGGVLDFLEEVH--HKQESIMDAG------PVVVHCSAGIGRTGTFIV 430 440 450 460 470 1140 1150 1160 1170 1180 pF1KB9 SELMIYCLEH---NEKVEVPMMLRLLREQRMFMIQTIAQYKFVYQVLIQFLQNSRLI ...: ... . ..:: ....: :: :.:: :::.:.:... .... CCDS81 IDILIDIIREKGVDCDIDVPKTIQMVRSQRSGMVQTEAQYRFIYMAVQHYIETLQRRIEE 480 490 500 510 520 530 CCDS81 EQKSKRKGHEYTNIKYSLADQTSGDQSPLPPCTPTPPCAEMREDSARVYENVGLMQQQKS 540 550 560 570 580 590 >>CCDS56505.1 PTPRZ1 gene_id:5803|Hs108|chr7 (1448 aa) initn: 455 init1: 204 opt: 518 Z-score: 410.0 bits: 88.2 E(32554): 1.6e-16 Smith-Waterman score: 518; 33.1% identity (62.3% similar) in 308 aa overlap (887-1179:835-1124) 860 870 880 890 900 910 pF1KB9 GLEAQKRPLMLAALNGLSVARVSGREENRVDATRVPMDERFRTLKKKLEEGMVFTE-YEQ :. .:. ..: :. . ::: .:. CCDS56 CFQTAHFYLEDSTSPRVISTPPTPIFPISDDVGAIPI-KHFPKHVADLHASSGFTEEFEE 810 820 830 840 850 860 920 930 940 950 960 970 pF1KB9 IPKKKAN-GIFS-TAALPENAERSRIREVVPYEENRVELIPTKENN---TGYINASHIKV . . .. :: . .. :.: ...: ..: :...::.: :.. : ::::... CCDS56 VQSCTVDLGITADSSNHPDNKHKNRYINIVAYDHSRVKLAQLAEKDGKLTDYINANYVDG 870 880 890 900 910 920 980 990 1000 1010 1020 1030 pF1KB9 VVGGAEWHYIATQGPLPHTCHDFWQMVWEQGVNVIAMVTAEEEGGRTKSHRYWPKLGSKH . :::.:::: : .:::.:.::..:.::.:.: : :: : .::: ::.. CCDS56 Y--NRPKAYIAAQGPLKSTAEDFWRMIWEHNVEVIVMITNLVEKGRRKCDQYWPADGSEE 930 940 950 960 970 980 1040 1050 1060 1070 1080 pF1KB9 SSATYGKFKVTTKFRTDSVCYATT---GLKVKHLLSGQE------RTVWHLQYTDWPDHG ::.: :: : .. . : :. :. .. .:.. :.: . .::.::: : CCDS56 ----YGNFLVTQK-SVQVLAYYTVRNFTLRNTKIKKGSQKGRPSGRVVTQYHYTQWPDMG 990 1000 1010 1020 1030 1090 1100 1110 1120 1130 1140 pF1KB9 CPEDVQGFLSYLEEIQSVRRHTNSMLEGTKNRHPPIVVHCSAGVGRTGVLILSELMIYCL :: :..... ..::. . :.::::::::::::. :. . :. . CCDS56 VPEYSLPVLTFVRKAAYAKRHAVG----------PVVVHCSAGVGRTGTYIVLDSMLQQI 1040 1050 1060 1070 1080 1150 1160 1170 1180 pF1KB9 EHNEKVEVPMMLRLLREQRMFMIQTIAQYKFVYQVLIQFLQNSRLI .:. :.. .:. .: :: ...:: :: :....:.. CCDS56 QHEGTVNIFGFLKHIRSQRNYLVQTEEQYVFIHDTLVEAILSKETEVLDSHIHAYVNALL 1090 1100 1110 1120 1130 1140 CCDS56 IPGPAGKTKLEKQFQLLSQSNIQQSDYSAALKQCNREKNRTSSIIPVERSRVGISSLSGE 1150 1160 1170 1180 1190 1200 >>CCDS2895.1 PTPRG gene_id:5793|Hs108|chr3 (1445 aa) initn: 432 init1: 201 opt: 512 Z-score: 405.3 bits: 87.3 E(32554): 3e-16 Smith-Waterman score: 515; 24.5% identity (49.3% similar) in 877 aa overlap (415-1179:296-1118) 390 400 410 420 430 440 pF1KB9 NGSVCSVHSVNSLNCSQSFIQASPVSSNLSIPGSDIMRADYIPSHR-HSAIIVPS-YRPT . . . .: .. :..: :. .. : : . CCDS28 EWIVFRRPVPISYHQLEAFYSIFTTEQQDHVKSVEYLRNNFRPQQRLHDRVVSKSAVRDS 270 280 290 300 310 320 450 460 470 480 490 500 pF1KB9 PDYETVMRQMKRGILHTDSQSQSLRNLNIINTHAYNQPEDLV-YSQPEMRERHPYTVPYG ... : .. .. : :.... .... :: : .:::: :: . : CCDS28 WNHD--MTDFLENPLGTEASKVCSSPPIHMKVQPLNQTALQVSWSQPETI-YHPPIMNY- 330 340 350 360 370 380 510 520 530 540 550 560 pF1KB9 PQGVYSNKLVSPSDQRNPKNNVVPSKPGASAISHTVSTPELANMQLQG-SHNYSTAHMLK . : . .. :... . .: ..::: :: : ...:. .: . . . 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