FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB9495, 836 aa 1>>>pF1KB9495 836 - 836 aa - 836 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.7760+/-0.000906; mu= 6.2746+/- 0.054 mean_var=210.9061+/-42.131, 0's: 0 Z-trim(113.5): 19 B-trim: 7 in 1/50 Lambda= 0.088314 statistics sampled from 14081 (14095) to 14081 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.754), E-opt: 0.2 (0.433), width: 16 Scan time: 5.080 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS9736.1 DACT1 gene_id:51339|Hs108|chr14 ( 836) 5565 722.2 9.2e-208 CCDS41961.1 DACT1 gene_id:51339|Hs108|chr14 ( 799) 3951 516.5 7.1e-146 CCDS12688.2 DACT3 gene_id:147906|Hs108|chr19 ( 629) 486 75.0 4.7e-13 CCDS74402.1 DACT3 gene_id:147906|Hs108|chr19 ( 404) 445 69.6 1.2e-11 >>CCDS9736.1 DACT1 gene_id:51339|Hs108|chr14 (836 aa) initn: 5565 init1: 5565 opt: 5565 Z-score: 3843.5 bits: 722.2 E(32554): 9.2e-208 Smith-Waterman score: 5565; 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CCDS74 LRRRRRRGAGQPRTSPGGADGGPRRQNSVRQRPPDASPSPGSARPAREPSLERV------ 40 50 60 70 80 520 530 540 550 560 pF1KB9 NSLQGVPPATPPLLSTAFP------VEERPALDFKSEGSSQSLEEAHLVKAQFIPGQQPS : :..: :: :. . .:: . . .: :..:::::.::: : . CCDS74 ----GGHPTSPAALSRAWASSWESEAAPEPAAPPAAPSPPDSPAEGRLVKAQYIPGAQAA 90 100 110 120 130 140 570 580 590 600 610 620 pF1KB9 VRLHRGHRNMGVVKNSSLKHRGPALQG--LENGLPTVREKTRAGSKKCRFPDDLDT--NK .: :. .. .. : .: .:.. : ::. ::.... :. . . 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CCDS74 GRLGPLGRRGPAGGVGGGYGESESSASEGESPAFSSASSDSDGSGGLVWPQQLVAATAAS 310 320 330 340 350 360 800 810 820 830 pF1KB9 TVTA-PDLHNHPAKTFVKIKASHNLKKKILRFRSGSLKLMTTV : :::.:::::::: ::::::::::::::.:::: CCDS74 GGGAGAGAPAGPAKVFVKIKASHALKKKILRFRSGSLKVMTTV 370 380 390 400 836 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Thu Nov 3 23:58:25 2016 done: Thu Nov 3 23:58:26 2016 Total Scan time: 5.080 Total Display time: 0.080 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]