FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB9497, 1175 aa 1>>>pF1KB9497 1175 - 1175 aa - 1175 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5853+/-0.000937; mu= 21.1046+/- 0.056 mean_var=80.2544+/-15.938, 0's: 0 Z-trim(105.9): 68 B-trim: 0 in 0/51 Lambda= 0.143166 statistics sampled from 8601 (8668) to 8601 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.622), E-opt: 0.2 (0.266), width: 16 Scan time: 4.760 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS44073.1 ATP13A2 gene_id:23400|Hs108|chr1 (1175) 7795 1620.6 0 CCDS175.1 ATP13A2 gene_id:23400|Hs108|chr1 (1180) 7775 1616.5 0 CCDS44072.1 ATP13A2 gene_id:23400|Hs108|chr1 (1158) 5357 1117.1 0 CCDS33914.1 ATP13A5 gene_id:344905|Hs108|chr3 (1218) 2473 521.4 5.1e-147 CCDS3304.2 ATP13A4 gene_id:84239|Hs108|chr3 (1196) 2446 515.8 2.4e-145 CCDS43187.1 ATP13A3 gene_id:79572|Hs108|chr3 (1226) 1299 278.9 5e-74 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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS44 VQGTVFARMAPEQKTELVCELQKLQYCVGMCGDGANDCGALKAADVGISLSQAEASVVSP 810 820 830 840 850 860 910 920 930 940 950 960 pF1KB9 FTSSMASIECVPMVIREGRCSLDTSFSVFKYMALYSLTQFISVLILYTINTNLGDLQFLA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS44 FTSSMASIECVPMVIREGRCSLDTSFSVFKYMALYSLTQFISVLILYTINTNLGDLQFLA 870 880 890 900 910 920 970 980 990 1000 1010 1020 pF1KB9 IDLVITTTVAVLMSRTGPALVLGRVRPPGALLSVPVLSSLLLQMVLVTGVQLGGYFLTLA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS44 IDLVITTTVAVLMSRTGPALVLGRVRPPGALLSVPVLSSLLLQMVLVTGVQLGGYFLTLA 930 940 950 960 970 980 1030 1040 1050 1060 1070 1080 pF1KB9 QPWFVPLNRTVAAPDNLPNYENTVVFSLSSFQYLILAAAVSKGAPFRRPLYTNVPFLVAL ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS44 QPWFVPLNRTVAAPDNLPNYENTVVFSLSSFQYLILAAAVSKGAPFRRPLYTNERARPVP 990 1000 1010 1020 1030 1040 1090 1100 1110 1120 1130 1140 pF1KB9 ALLSSVLVGLVLVPGLLQGPLALRNITDTGFKLLLLGLVTLNFVGAFMLESVLDQCLPAC CCDS44 PRLPAPPPAQAGLQEALQAAGTRAGRAALAAAARRPPEVVQAHGHPRHWNSLPLSHQLDP 1050 1060 1070 1080 1090 1100 >>CCDS33914.1 ATP13A5 gene_id:344905|Hs108|chr3 (1218 aa) initn: 2529 init1: 697 opt: 2473 Z-score: 2753.0 bits: 521.4 E(32554): 5.1e-147 Smith-Waterman score: 2638; 40.7% identity (67.9% similar) in 1158 aa overlap (56-1169:42-1173) 30 40 50 60 70 80 pF1KB9 DPLSSSVSSVRLSGYCGSPWRVIGYHVVVWMMAGIPLLLFRWKPLWGVRLRLRPCNLAHA . : ::.: :.: : : :: : .: CCDS33 LLNQGEEDELEVFGYRDHNVRKAFCLVASVLTCGGLLLVFYWRPQWRVWANCIPCPLQEA 20 30 40 50 60 70 90 100 110 120 130 140 pF1KB9 ETLVIEIRDKEDSSWQLFTVQVQTEAIGEGSLEPSPQSQAEDGRSQAAVGAVPEGAWKDT .:.... :. .: . .. .. . ..:. : :. . : .: . : CCDS33 DTVLLRTTDE----FQRY-MRKKVFCLYLSTLK-FPVSKKWEESLVADRHSVINQA---- 80 90 100 110 120 150 160 170 180 190 200 pF1KB9 AQLHKSEEAKRVLRYYLFQGQRYIWIETQQAFYQVSLLDHGRSCDDVHRSRH-GLSLQDQ : : : : .. : ::.: . .. : .:.::. . ::.:.:.. ::. ..: CCDS33 --LIKPELKLRCMEV---QKIRYVWNDLEKRFQKVGLLEDSNSCSDIHQTFGLGLTSEEQ 130 140 150 160 170 210 220 230 240 250 260 pF1KB9 MVRKAIYGPNVISIPVKSYPQLLVDEALNPYYGFQAFSIALWLADHYYWYALCIFLISSI ::. . :::.: . .. .::: ..:::.: ::::...:::.. : :.. :.... : CCDS33 EVRRLVCGPNAIEVEIQPIWKLLVKQVLNPFYVFQAFTLTLWLSQGYIEYSVAIIILTVI 180 190 200 210 220 230 270 280 290 300 310 320 pF1KB9 SICLSLYKTRKQSQTLRDMVKLSMRVCVC---RPGGEEEWVDSSELVPGDCLVLPQEGGL :: ::.: :.:: :...:. .: : . : :: ..: ::::: :.:: . .: CCDS33 SIVLSVYDLRQQSVKLHNLVEDHNKVQVTIIVKDKGLEE-LESRLLVPGDILILPGKFSL 240 250 260 270 280 290 330 340 350 360 370 pF1KB9 MPCDAALVAGECMVNESSLTGESIPVLKTALP--EGLGPY-CA--ETHRRHTLFCGTLIL ::::.:. : :.:::. :::::::: :: :: :. :. : : .:.:.::::: .. CCDS33 -PCDAVLIDGSCVVNEGMLTGESIPVTKTPLPQMENTMPWKCHSLEDYRKHVLFCGTEVI 300 310 320 330 340 350 380 390 400 410 420 430 pF1KB9 QAR-AYVGPHVLAVVTRTGFCTAKGGLVSSILHPRPINFKFYKHSMKFVAALSVLALLGT :.. . :: : ::: .::. :::: :: :::.:::.:::.:. ..::.. :. :...: CCDS33 QVKPSGQGP-VRAVVLQTGYNTAKGDLVRSILYPRPLNFKLYSDAFKFIVFLACLGVMGF 360 370 380 390 400 410 440 450 460 470 480 490 pF1KB9 IYSIFILYRNRVPLNEIVIRALDLVTVVVPPALPAAMTVCTLYAQSRLRRQGIFCIHPLR .:.. . . . :: .. : :: :.::.:::.::::.:. ..:::.::... :::: : : CCDS33 FYALGVYMYHGVPPKDTVTMALILLTVTVPPVLPAALTIGNVYAQKRLKKKKIFCISPQR 420 430 440 450 460 470 500 510 520 530 540 550 pF1KB9 INLGGKLQLVCFDKTGTLTEDGLDVMGVVPLKGQAFLPL--VPEPRRLPVGPLLRALATC ::. :...::::::::::::::::. :.:: . : . .: .:: :.:.: CCDS33 INMCGQINLVCFDKTGTLTEDGLDLWGTVPTADNCFQEAHSFASGQAVPWSPLCAAMASC 480 490 500 510 520 530 560 570 580 590 600 610 pF1KB9 HALSRLQDTPVGDPMDLKMVESTGWVLEEEPAADSAFGTQVLAVMRPPLWEPQLQAMEEP :.: :. : :::.:::: :.:.: .:. . . :::.: ...: :. : . : CCDS33 HSLILLNGTIQGDPLDLKMFEGTAWKMEDCIVDSCKFGTSVSNIIKPG---PK--ASKSP 540 550 560 570 580 620 630 640 650 660 670 pF1KB9 PVPVSVLHRFPFSSALQRMSVVVAWPGATQPEAYVKGSPELVAGLCNPETVPTDFAQMLQ . .: .:::::.::::::.. : .. ..:.::.::.:: .: :::: .: : :. CCDS33 VEAIITLCQFPFSSSLQRMSVIAQLAGENHFHVYMKGAPEMVARFCRSETVPKNFPQELR 590 600 610 620 630 640 680 690 700 710 720 730 pF1KB9 SYTAAGYRVVALASKPLPTVPSLEAAQQLTRDTVEGDLSLLGLLVMRNLLKPQTTPVIQA :::. :.::.::: : : . .: ...:.:. ::..:..::::.:.: :: .: :.. CCDS33 SYTVQGFRVIALAHKTLK-MGNLSEVEHLAREKVESELTFLGLLIMENRLKKETKLVLKE 650 660 670 680 690 700 740 750 760 770 780 790 pF1KB9 LRRTRIRAVMVTGDNLQTAVTVARGCGMVAPQEHLIIVHATHPERGQPASLEFLPMESPT : ..:::.::.::::::::.:::.. :. : ..:::.: .::. :::. . .:. CCDS33 LSEARIRTVMITGDNLQTAITVAKNSEMIPPGSQVIIVEADEPEEFVPASVTWQLVENQE 710 720 730 740 750 760 800 810 820 830 840 850 pF1KB9 AVNGVKDPDQAASYTVEPDPRS---RHLALSGPTFGIIVKHFPKLLPKVLVQGTVFARMA . : :. . .. . : .. :.:.:: .. .: .:: .::::.::.:::::::. CCDS33 TGPGKKEIYMHTGNSSTPRGEGGSCYHFAMSGKSYQVIFQHFNSLLPKILVNGTVFARMS 770 780 790 800 810 820 860 870 880 890 900 910 pF1KB9 PEQKTELVCELQKLQYCVGMCGDGANDCGALKAADVGISLSQAEASVVSPFTSSMASIEC : ::. :. :.:::.: ::::::::::::::::: .:::::. ::::.:::::. ..:.: CCDS33 PGQKSSLIEEFQKLNYYVGMCGDGANDCGALKAAHAGISLSEQEASVASPFTSKTTNIQC 830 840 850 860 870 880 920 930 940 950 960 970 pF1KB9 VPMVIREGRCSLDTSFSVFKYMALYSLTQFISVLILYTINTNLGDLQFLAIDLVITTTVA :: .::::: .: .::.::::...:.. ::::.:.:: .:. :.: :..:: : CCDS33 VPHLIREGRAALVSSFGVFKYLTMYGIIQFISALLLYWQLQLFGNYQYLMQDVAITLMVC 890 900 910 920 930 940 980 990 1000 1010 1020 pF1KB9 VLMSRTGPALVLGRVRPPGALLSVPVLSSLLLQMVLVTGVQLGGYFLTLAQPWF------ . :: : :. :: : ::: :.: :..:. . ::..... . :::. CCDS33 LTMSSTHAYPKLAPYRPAGQLLSPPLLLSIFLNSCFSCIVQISAFLYVKQQPWYCEVYQY 950 960 970 980 990 1000 1030 1040 1050 1060 pF1KB9 --------------VPLNRTVAA-----PDNLPNYENTVVFSLSSFQYLILAAAVSKGAP : :.:. .. : .. ..:.:... .....:. .: ::: : CCDS33 SECFLANQSNFSTNVSLERNWTGNATLIPGSILSFETTTLWPITTINYITVAFIFSKGKP 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 pF1KB9 FRRPLYTNV--PFLVALALLSSVLVGLVLVPGLLQGPLALRNITDTGFKLLLLGLVTLNF ::.:.::: ::. :: .... . . .: . .:: ....:.: .. .: CCDS33 FRKPIYTNYIFSFLLLAALGLTIFILFSDFQVIYRGMELIPTIT--SWRVLILVVALTQF 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1170 pF1KB9 VGAFMLE-SVLDQCLPACLRRLRPKRASKKRFKQLERELAEQP-WPPLPAGPLR ::..: :.:.. : . . ::.... ...:::. :::. CCDS33 CVAFFVEDSILQNHELWLLIKREFGFYSKSQYRTWQKKLAEDSTWPPINRTDYSGDGKNG 1130 1140 1150 1160 1170 1180 CCDS33 FYINGGYESHEQIPKRKLKLGGQPTEQHFWARL 1190 1200 1210 >>CCDS3304.2 ATP13A4 gene_id:84239|Hs108|chr3 (1196 aa) initn: 2221 init1: 801 opt: 2446 Z-score: 2722.9 bits: 515.8 E(32554): 2.4e-145 Smith-Waterman score: 2639; 41.3% identity (67.5% similar) in 1156 aa overlap (59-1169:44-1167) 30 40 50 60 70 80 pF1KB9 SSSVSSVRLSGYCGSPWRVIGYHVVVWMMAGIPLLLFRWKPLWGVRLRLRPCNLAHAETL :: :.: :.: : : . ::.: .:.:. CCDS33 EGEENEMEIFGYRTQGCRKSLCLAGSIFSFGILPLVFYWRPAWHVWAHCVPCSLQEADTV 20 30 40 50 60 70 90 100 110 120 130 140 pF1KB9 VIEIRDK-EDSSWQLFTVQVQTEAIGEG-SLEPS-PQSQAEDGRSQAAVGAVPEGAWKDT ... :. . ::. .. . :.. . .: :. : :. . :. CCDS33 LLRTTDEFQIYSWKK-VIWIYLSALNSAFGLTPDHPLMTDEEYIINRAI----------- 80 90 100 110 120 150 160 170 180 190 200 pF1KB9 AQLHKSEEAKRVLRYYLFQGQRYIWIETQQAFYQVSLLDHGRSCDDVHRSR-HGLSLQDQ .: . : .. : ::.: . : ... :. : .:.. ::. ..: CCDS33 ---RKPDLKVRCIKV---QKIRYVWNYLEGQFQKIGSLEDWLSSAKIHQKFGSGLTREEQ 130 140 150 160 170 210 220 230 240 250 260 pF1KB9 MVRKAIYGPNVISIPVKSYPQLLVDEALNPYYGFQAFSIALWLADHYYWYALCIFLISSI .:. : :::.:.. : .::. :.:::.: :: ::. ::... : ::. :...: : CCDS33 EIRRLICGPNTIDVEVTPIWKLLIKEVLNPFYIFQLFSVCLWFSEDYKEYAFAIIIMSII 180 190 200 210 220 230 270 280 290 300 310 320 pF1KB9 SICLSLYKTRKQSQTLRDMVKL--SMRVCVC-RPGGEEEWVDSSELVPGDCLVLPQEGGL :: :..: :.:: :. .:. :. : :: : .: .: ..: ::::: :.: . : CCDS33 SISLTVYDLREQSVKLHHLVESHNSITVSVCGRKAGVQE-LESRVLVPGDLLILTGNKVL 240 250 260 270 280 290 330 340 350 360 370 pF1KB9 MPCDAALVAGECMVNESSLTGESIPVLKTALP--EGLGPYCAET---HRRHTLFCGTLIL :::::.:. : :.:.:. :::::::: :: :: .. :. ... ..::.::::: .. CCDS33 MPCDAVLIEGSCVVDEGMLTGESIPVTKTPLPKMDSSVPWKTQSEADYKRHVLFCGTEVI 300 310 320 330 340 350 380 390 400 410 420 430 pF1KB9 QARAYVGPHVLAVVTRTGFCTAKGGLVSSILHPRPINFKFYKHSMKFVAALSVLALLGTI ::.: . : ::: .::: :::: :: :::.:.:.::..:. ...:. : : .: : CCDS33 QAKAACSGTVRAVVLQTGFNTAKGDLVRSILYPKPVNFQLYRDAIRFLLCLVGTATIGMI 360 370 380 390 400 410 440 450 460 470 480 490 pF1KB9 YSIFILYRNRVPLNEIVIRALDLVTVVVPPALPAAMTVCTLYAQSRLRRQGIFCIHPLRI :.. . . : .:.: .:::..:..::::::::.:. .::: ::...::::: : :: CCDS33 YTLCVYVLSGEPPEEVVRKALDVITIAVPPALPAALTTGIIYAQRRLKKRGIFCISPQRI 420 430 440 450 460 470 500 510 520 530 540 550 pF1KB9 NLGGKLQLVCFDKTGTLTEDGLDVMGVVPLKGQAFLPL--VPEPRRLPVGPLLRALATCH :. :.:.:::::::::::.::::. ::: ..: . . :: ::: :.:.:: CCDS33 NVCGQLNLVCFDKTGTLTRDGLDLWGVVSCDRNGFQEVHSFASGQALPWGPLCAAMASCH 480 490 500 510 520 530 560 570 580 590 600 610 pF1KB9 ALSRLQDTPVGDPMDLKMVESTGWVLEEEPAADSAFGTQVLAVMRPPLWEPQLQAMEEPP .: :. : :::.:::: :.: : : ..:. : : . . .: : . : CCDS33 SLILLDGTIQGDPLDLKMFEATTW--EMAFSGDDFHIKGVPA--HAMVVKPCRTASQVPV 540 550 560 570 580 590 620 630 640 650 660 670 pF1KB9 VPVSVLHRFPFSSALQRMSVVVAWPGATQPEAYVKGSPELVAGLCNPETVPTDFAQMLQS ...::.::::::::::.:.: :. . :..::.:: ::..:.::::::.:.. :: CCDS33 EGIAILHQFPFSSALQRMTVIVQEMGGDR-LAFMKGAPERVASFCQPETVPTSFVSELQI 600 610 620 630 640 680 690 700 710 720 730 pF1KB9 YTAAGYRVVALASKPLPTVPSLEAAQQLTRDTVEGDLSLLGLLVMRNLLKPQTTPVIQAL ::. :.::.::: : : . . : :::.:::.:: .::::...: :: .: ::.. : CCDS33 YTTQGFRVIALAYKKLE---NDHHATTLTRETVESDLIFLGLLILENRLKEETKPVLEEL 650 660 670 680 690 700 740 750 760 770 780 790 pF1KB9 RRTRIRAVMVTGDNLQTAVTVARGCGMVAPQEHLIIVHATHPERGQPASLEF-LPMESPT .:::.::.::::::::.:::: :::. ....:...:.. .. ::. . : :. CCDS33 ISARIRTVMITGDNLQTAITVARKSGMVSESQKVILIEANETTGSSSASISWTLVEEKKH 710 720 730 740 750 760 800 810 820 830 840 850 pF1KB9 AVNGVKDPDQAASYTVEPDPR--SRHLALSGPTFGIIVKHFPKLLPKVLVQGTVFARMAP . : .: : : : :.::.: .: .: .:: .::::.:..::.::::.: CCDS33 IMYGNQDNYINIRDEVSDKGREGSYHFALTGKSFHVISQHFSSLLPKILINGTIFARMSP 770 780 790 800 810 820 860 870 880 890 900 910 pF1KB9 EQKTELVCELQKLQYCVGMCGDGANDCGALKAADVGISLSQAEASVVSPFTSSMASIECV ::. :: :.:::.: ::::::::::::::: : ::::::. ::::.:::::. .:::: CCDS33 GQKSSLVEEFQKLDYFVGMCGDGANDCGALKMAHVGISLSEQEASVASPFTSKTPNIECV 830 840 850 860 870 880 920 930 940 950 960 970 pF1KB9 PMVIREGRCSLDTSFSVFKYMALYSLTQFISVLILYTINTNLGDLQFLAIDLVITTTVAV : .:.::: .: ::: .::::::::. :...::.:: ...:.. ::: ::.::: ..: CCDS33 PHLIKEGRAALVTSFCMFKYMALYSMIQYVGVLLLYWETNSLSNYQFLFQDLAITTLIGV 890 900 910 920 930 940 980 990 1000 1010 1020 pF1KB9 LMSRTG--PALVLGRVRPPGALLSVPVLSSLLLQMVLVTGVQLGGYFLTLAQPWF-VPL- :. .: : :: :: : :.: :.: :......: .....:..:. :::. : . 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CCDS33 PTYTNYIFVLVLIIQLGVCLFILFADIPELYRRLDLL--CTPVLWRASIVIMLSLNFIVS 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1170 pF1KB9 FMLESVL--DQCLPACLRRLRPKRASKKRFKQLERELAEQP-WPPLPAGPLR .. : .. .. : ..: . ::.... .:.::..: :::: CCDS33 LVAEEAVIENRALWMMIKRCFGYQ-SKSQYRIWQRDLANDPSWPPLNQTSHSDMPECGRG 1130 1140 1150 1160 1170 1180 CCDS33 VSYSNPVFESNEEQL 1190 >>CCDS43187.1 ATP13A3 gene_id:79572|Hs108|chr3 (1226 aa) initn: 2449 init1: 701 opt: 1299 Z-score: 1442.4 bits: 278.9 E(32554): 5e-74 Smith-Waterman score: 2906; 42.2% identity (68.1% similar) in 1200 aa overlap (35-1170:17-1204) 10 20 30 40 50 60 pF1KB9 SSPLVGSTPTGYGTLTIGTSIDPLSSSVSSVRLSGYCGSPWRVIGYHVVVWMMAGIPLLL ... :: : :.. . : .:. ::: CCDS43 MDREERKTINQGQEDEMEIYGYNLSRWKLAIVSLGVICSGGFLLLL 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KB9 FRWKPLWGVRLRLRPCNLAHAETLVIEIRDKEDSSWQLFTVQVQTEAIGEGSLEPSPQSQ . : : : :. . :..... : : . : : ..... .. : ::.:. 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