Result of FASTA (omim) for
pF1KB9521
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9521, 588 aa
1>>>pF1KB9521 588 - 588 aa - 588 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6310+/-0.000308; mu= 15.0267+/- 0.019
mean_var=141.9410+/-29.320, 0's: 0 Z-trim(120.4): 53 B-trim: 0 in 0/57
Lambda= 0.107652
statistics sampled from 35457 (35518) to 35457 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.743), E-opt: 0.2 (0.416), width: 16
Scan time: 12.470
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_016856740 (OMIM: 614269) PREDICTED: probable G- ( 454) 969 162.0 3.9e-39
XP_011539736 (OMIM: 614269) PREDICTED: probable G- ( 609) 969 162.1 4.9e-39
XP_016856739 (OMIM: 614269) PREDICTED: probable G- ( 609) 969 162.1 4.9e-39
NP_997253 (OMIM: 614269) probable G-protein couple ( 609) 969 162.1 4.9e-39
>>XP_016856740 (OMIM: 614269) PREDICTED: probable G-prot (454 aa)
initn: 852 init1: 692 opt: 969 Z-score: 823.5 bits: 162.0 E(85289): 3.9e-39
Smith-Waterman score: 1459; 55.7% identity (79.5% similar) in 409 aa overlap (8-406:2-389)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MARGGAGAEEASLRSNALSWLACGLLALLANAWIILSISAKQQKHKPLELLLCFLAGTHI
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XP_016 MSDERRLPGSAVGWLVCGGLSLLANAWGILSVGAKQKKWKPLEFLLCTLAATHM
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 LMAAVPLTTFAVVQLRRQASSDYDWNESICKVFVSTYYTLALATCFTVASLSYHRMWMVR
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XP_016 LNVAVPIATYSVVQLRRQ-RPDFEWNEGLCKVFVSTFYTLTLATCFSVTSLSYHRMWMVC
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 WPVNYRLSNAKKQALHAVMGIWMVSFILSTLPSIGWHNNGERYYARGCQFIVSKIGLGFG
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XP_016 WPVNYRLSNAKKQAVHTVMGIWMVSFILSALPAVGWHDTSERFYTHGCRFIVAEIGLGFG
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 VCFSLLLLGGIVMGLVCVAITFYQTLWARPRRARQARRVGGGGGTKAGGPGALGTRPAFE
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XP_016 VCFLLLVGGSVAMGVICTAIALFQTLAVQ--VGRQA------------------DRRAFT
180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 VPAIVVEDARGKRRSSLDGSESAKTSLQVTNLVSAIVFLYDSLTGVPILVVSFFSLKSDS
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XP_016 VPTIVVEDAQGKRRSSIDGSEPAKTSLQTTGLVTTIVFIYDCLMGFPVLVVSFSSLRADA
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350
pF1KB9 APPWMVLAVLWCSMAQTLLLPSFIWSCERYRADVRTVWEQCVAIMS-EEDGDDD----GG
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XP_016 SAPWMALCVLWCSVAQALLLPVFLWACDRYRADLKAVREKCMALMANDEESDDETSLEGG
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KB9 CD-DYAEGRVCKVRFDANGATGPGSRDPAQVKLLPGRHMLFP--PLE--RVHYLQVPLSR
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XP_016 ISPDLVLERSLDYGYGGDFVALDRMAKYEISALEGGLPQLYPLRPLQEDKMQYLQVSAGL
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KB9 RLSHDETNIFSTPREPGSFLHKWSSSDDIRVLPAQSRALGGPPEYLGQGHRLEDEEDEEE
XP_016 GERPHLRVTGCPELPEASPLGAHLTPSAVAGVAVTIRGRAVQRSHSLCGWAPTATPMVPV
400 410 420 430 440 450
>>XP_011539736 (OMIM: 614269) PREDICTED: probable G-prot (609 aa)
initn: 945 init1: 692 opt: 969 Z-score: 821.9 bits: 162.1 E(85289): 4.9e-39
Smith-Waterman score: 1611; 47.0% identity (71.2% similar) in 593 aa overlap (8-579:2-564)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MARGGAGAEEASLRSNALSWLACGLLALLANAWIILSISAKQQKHKPLELLLCFLAGTHI
..: : ..:..::.:: :.:::::: :::..:::.: ::::.::: ::.::.
XP_011 MSDERRLPGSAVGWLVCGGLSLLANAWGILSVGAKQKKWKPLEFLLCTLAATHM
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 LMAAVPLTTFAVVQLRRQASSDYDWNESICKVFVSTYYTLALATCFTVASLSYHRMWMVR
: .:::..:..::::::: :..:::..:::::::.:::.:::::.:.::::::::::
XP_011 LNVAVPIATYSVVQLRRQ-RPDFEWNEGLCKVFVSTFYTLTLATCFSVTSLSYHRMWMVC
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 WPVNYRLSNAKKQALHAVMGIWMVSFILSTLPSIGWHNNGERYYARGCQFIVSKIGLGFG
::::::::::::::.:.::::::::::::.::..:::...::.:..::.:::..::::::
XP_011 WPVNYRLSNAKKQAVHTVMGIWMVSFILSALPAVGWHDTSERFYTHGCRFIVAEIGLGFG
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 VCFSLLLLGGIVMGLVCVAITFYQTLWARPRRARQARRVGGGGGTKAGGPGALGTRPAFE
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XP_011 VCFLLLVGGSVAMGVICTAIALFQTLAVQ--VGRQA------------------DRRAFT
180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 VPAIVVEDARGKRRSSLDGSESAKTSLQVTNLVSAIVFLYDSLTGVPILVVSFFSLKSDS
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XP_011 VPTIVVEDAQGKRRSSIDGSEPAKTSLQTTGLVTTIVFIYDCLMGFPVLVVSFSSLRADA
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350
pF1KB9 APPWMVLAVLWCSMAQTLLLPSFIWSCERYRADVRTVWEQCVAIMS-EEDGDDD----GG
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XP_011 SAPWMALCVLWCSVAQALLLPVFLWACDRYRADLKAVREKCMALMANDEESDDETSLEGG
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KB9 CD-DYAEGRVCKVRFDANGATGPGSRDPAQVKLLPGRHMLFP--PLE--RVHYLQVPLSR
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XP_011 ISPDLVLERSLDYGYGGDFVALDRMAKYEISALEGGLPQLYPLRPLQEDKMQYLQVPPTR
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KB9 RLSHDETNIFSTPREPGSFLHKWSSSDDIRVLPAQSRALGGPPEYLGQGHRLEDEEDEEE
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XP_011 RFSHDDADVWAAVPLP-AFLPRWGSGEDLAAL-AHLVLPAGPERRRASLLAFAEDAPPSR
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520
pF1KB9 AE---GGGLASLR-QFLESGVLG---SGGGPPR---GPGFFREEITTFIDETPLPSPTAS
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XP_011 ARRRSAESLLSLRPSALDSGPRGARDSPPGSPRRRPGPGPRSASASLLPDAFALTAFECE
460 470 480 490 500 510
530 540 550 560 570
pF1KB9 PGHSPRRPRPLGLSPRRLSLGSPESRAVG-LPLGLSAGRRCSLTGGEESARAWGGSWGPG
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XP_011 PQALRRPPGPFPAAP-----AAPDGADPGEAPTPPSSAQRSP--GPRPSAHSHAGSLRPG
520 530 540 550 560
580
pF1KB9 NPIFPQLTL
XP_011 LSASWGEPGGLRAAGGGGSTSSFLSSPSESSGYATLHSDSLGSAS
570 580 590 600
>>XP_016856739 (OMIM: 614269) PREDICTED: probable G-prot (609 aa)
initn: 945 init1: 692 opt: 969 Z-score: 821.9 bits: 162.1 E(85289): 4.9e-39
Smith-Waterman score: 1611; 47.0% identity (71.2% similar) in 593 aa overlap (8-579:2-564)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MARGGAGAEEASLRSNALSWLACGLLALLANAWIILSISAKQQKHKPLELLLCFLAGTHI
..: : ..:..::.:: :.:::::: :::..:::.: ::::.::: ::.::.
XP_016 MSDERRLPGSAVGWLVCGGLSLLANAWGILSVGAKQKKWKPLEFLLCTLAATHM
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 LMAAVPLTTFAVVQLRRQASSDYDWNESICKVFVSTYYTLALATCFTVASLSYHRMWMVR
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XP_016 LNVAVPIATYSVVQLRRQ-RPDFEWNEGLCKVFVSTFYTLTLATCFSVTSLSYHRMWMVC
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 WPVNYRLSNAKKQALHAVMGIWMVSFILSTLPSIGWHNNGERYYARGCQFIVSKIGLGFG
::::::::::::::.:.::::::::::::.::..:::...::.:..::.:::..::::::
XP_016 WPVNYRLSNAKKQAVHTVMGIWMVSFILSALPAVGWHDTSERFYTHGCRFIVAEIGLGFG
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 VCFSLLLLGGIVMGLVCVAITFYQTLWARPRRARQARRVGGGGGTKAGGPGALGTRPAFE
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XP_016 VCFLLLVGGSVAMGVICTAIALFQTLAVQ--VGRQA------------------DRRAFT
180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 VPAIVVEDARGKRRSSLDGSESAKTSLQVTNLVSAIVFLYDSLTGVPILVVSFFSLKSDS
::.::::::.::::::.:::: ::::::.:.::..:::.:: : : :.::::: ::..:.
XP_016 VPTIVVEDAQGKRRSSIDGSEPAKTSLQTTGLVTTIVFIYDCLMGFPVLVVSFSSLRADA
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350
pF1KB9 APPWMVLAVLWCSMAQTLLLPSFIWSCERYRADVRTVWEQCVAIMS-EEDGDDD----GG
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XP_016 SAPWMALCVLWCSVAQALLLPVFLWACDRYRADLKAVREKCMALMANDEESDDETSLEGG
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KB9 CD-DYAEGRVCKVRFDANGATGPGSRDPAQVKLLPGRHMLFP--PLE--RVHYLQVPLSR
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XP_016 ISPDLVLERSLDYGYGGDFVALDRMAKYEISALEGGLPQLYPLRPLQEDKMQYLQVPPTR
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KB9 RLSHDETNIFSTPREPGSFLHKWSSSDDIRVLPAQSRALGGPPEYLGQGHRLEDEEDEEE
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XP_016 RFSHDDADVWAAVPLP-AFLPRWGSGEDLAAL-AHLVLPAGPERRRASLLAFAEDAPPSR
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520
pF1KB9 AE---GGGLASLR-QFLESGVLG---SGGGPPR---GPGFFREEITTFIDETPLPSPTAS
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XP_016 ARRRSAESLLSLRPSALDSGPRGARDSPPGSPRRRPGPGPRSASASLLPDAFALTAFECE
460 470 480 490 500 510
530 540 550 560 570
pF1KB9 PGHSPRRPRPLGLSPRRLSLGSPESRAVG-LPLGLSAGRRCSLTGGEESARAWGGSWGPG
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XP_016 PQALRRPPGPFPAAP-----AAPDGADPGEAPTPPSSAQRSP--GPRPSAHSHAGSLRPG
520 530 540 550 560
580
pF1KB9 NPIFPQLTL
XP_016 LSASWGEPGGLRAAGGGGSTSSFLSSPSESSGYATLHSDSLGSAS
570 580 590 600
>>NP_997253 (OMIM: 614269) probable G-protein coupled re (609 aa)
initn: 945 init1: 692 opt: 969 Z-score: 821.9 bits: 162.1 E(85289): 4.9e-39
Smith-Waterman score: 1611; 47.0% identity (71.2% similar) in 593 aa overlap (8-579:2-564)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MARGGAGAEEASLRSNALSWLACGLLALLANAWIILSISAKQQKHKPLELLLCFLAGTHI
..: : ..:..::.:: :.:::::: :::..:::.: ::::.::: ::.::.
NP_997 MSDERRLPGSAVGWLVCGGLSLLANAWGILSVGAKQKKWKPLEFLLCTLAATHM
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pF1KB9 LMAAVPLTTFAVVQLRRQASSDYDWNESICKVFVSTYYTLALATCFTVASLSYHRMWMVR
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NP_997 LNVAVPIATYSVVQLRRQ-RPDFEWNEGLCKVFVSTFYTLTLATCFSVTSLSYHRMWMVC
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 WPVNYRLSNAKKQALHAVMGIWMVSFILSTLPSIGWHNNGERYYARGCQFIVSKIGLGFG
::::::::::::::.:.::::::::::::.::..:::...::.:..::.:::..::::::
NP_997 WPVNYRLSNAKKQAVHTVMGIWMVSFILSALPAVGWHDTSERFYTHGCRFIVAEIGLGFG
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 VCFSLLLLGGIVMGLVCVAITFYQTLWARPRRARQARRVGGGGGTKAGGPGALGTRPAFE
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NP_997 VCFLLLVGGSVAMGVICTAIALFQTLAVQ--VGRQA------------------DRRAFT
180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 VPAIVVEDARGKRRSSLDGSESAKTSLQVTNLVSAIVFLYDSLTGVPILVVSFFSLKSDS
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NP_997 VPTIVVEDAQGKRRSSIDGSEPAKTSLQTTGLVTTIVFIYDCLMGFPVLVVSFSSLRADA
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350
pF1KB9 APPWMVLAVLWCSMAQTLLLPSFIWSCERYRADVRTVWEQCVAIMS-EEDGDDD----GG
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NP_997 SAPWMALCVLWCSVAQALLLPVFLWACDRYRADLKAVREKCMALMANDEESDDETSLEGG
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KB9 CD-DYAEGRVCKVRFDANGATGPGSRDPAQVKLLPGRHMLFP--PLE--RVHYLQVPLSR
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NP_997 ISPDLVLERSLDYGYGGDFVALDRMAKYEISALEGGLPQLYPLRPLQEDKMQYLQVPPTR
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pF1KB9 RLSHDETNIFSTPREPGSFLHKWSSSDDIRVLPAQSRALGGPPEYLGQGHRLEDEEDEEE
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NP_997 RFSHDDADVWAAVPLP-AFLPRWGSGEDLAAL-AHLVLPAGPERRRASLLAFAEDAPPSR
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520
pF1KB9 AE---GGGLASLR-QFLESGVLG---SGGGPPR---GPGFFREEITTFIDETPLPSPTAS
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NP_997 ARRRSAESLLSLRPSALDSGPRGARDSPPGSPRRRPGPGPRSASASLLPDAFALTAFECE
460 470 480 490 500 510
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pF1KB9 PGHSPRRPRPLGLSPRRLSLGSPESRAVG-LPLGLSAGRRCSLTGGEESARAWGGSWGPG
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NP_997 PQALRRPPGPFPAAP-----AAPDGADPGEAPTPPSSAQRSP--GPRPSAHSHAGSLRPG
520 530 540 550 560
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pF1KB9 NPIFPQLTL
NP_997 LSASWGEPGGLRAAGGGGSTSSFLSSPSESSGYATLHSDSLGSAS
570 580 590 600
588 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 17:06:50 2016 done: Fri Nov 4 17:06:52 2016
Total Scan time: 12.470 Total Display time: 0.050
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]