Result of FASTA (ccds) for
pF1KB9536
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9536, 402 aa
1>>>pF1KB9536 402 - 402 aa - 402 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5657+/-0.00159; mu= 12.7150+/- 0.093
mean_var=221.3094+/-44.932, 0's: 0 Z-trim(104.6): 948 B-trim: 67 in 1/50
Lambda= 0.086213
statistics sampled from 6962 (7979) to 6962 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.576), E-opt: 0.2 (0.245), width: 16
Scan time: 2.050
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4617.1 ZNF322 gene_id:79692|Hs108|chr6 ( 402) 2874 371.2 9.8e-103
CCDS82413.1 ZNF544 gene_id:27300|Hs108|chr19 ( 687) 1263 171.1 2.8e-42
CCDS12973.1 ZNF544 gene_id:27300|Hs108|chr19 ( 715) 1263 171.1 2.8e-42
CCDS10329.2 ZSCAN2 gene_id:54993|Hs108|chr15 ( 614) 1255 170.0 5.2e-42
CCDS11179.2 ZNF287 gene_id:57336|Hs108|chr17 ( 761) 1244 168.8 1.5e-41
CCDS74388.1 ZNF227 gene_id:7770|Hs108|chr19 ( 748) 1241 168.4 1.9e-41
CCDS12636.1 ZNF227 gene_id:7770|Hs108|chr19 ( 799) 1241 168.5 2e-41
CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3 ( 754) 1236 167.8 3e-41
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 1234 167.4 3.2e-41
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1234 167.5 3.3e-41
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1234 167.5 3.3e-41
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 1234 167.5 3.4e-41
CCDS11180.1 ZNF624 gene_id:57547|Hs108|chr17 ( 865) 1234 167.6 3.9e-41
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 ( 738) 1229 166.9 5.4e-41
CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 ( 682) 1227 166.6 6.2e-41
CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3 ( 544) 1225 166.2 6.4e-41
CCDS32330.1 ZNF774 gene_id:342132|Hs108|chr15 ( 483) 1223 165.9 7.2e-41
CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5 ( 461) 1220 165.5 9e-41
CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19 ( 678) 1213 164.9 2.1e-40
CCDS82409.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 ( 591) 1212 164.7 2.1e-40
CCDS12959.2 ZNF551 gene_id:90233|Hs108|chr19 ( 670) 1212 164.8 2.2e-40
CCDS82410.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 ( 697) 1212 164.8 2.3e-40
CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 1208 164.3 3.4e-40
CCDS33048.1 ZNF235 gene_id:9310|Hs108|chr19 ( 738) 1207 164.2 3.6e-40
CCDS12500.1 ZNF585B gene_id:92285|Hs108|chr19 ( 769) 1206 164.1 4e-40
CCDS56092.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 580) 1203 163.5 4.5e-40
CCDS6755.1 ZNF189 gene_id:7743|Hs108|chr9 ( 584) 1203 163.5 4.5e-40
CCDS65096.1 ZNF189 gene_id:7743|Hs108|chr9 ( 612) 1203 163.6 4.6e-40
CCDS6754.1 ZNF189 gene_id:7743|Hs108|chr9 ( 626) 1203 163.6 4.7e-40
CCDS42558.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 644) 1203 163.6 4.7e-40
CCDS12947.1 ZNF71 gene_id:58491|Hs108|chr19 ( 489) 1201 163.2 4.8e-40
CCDS12637.1 ZNF112 gene_id:7771|Hs108|chr19 ( 907) 1204 163.9 5.3e-40
CCDS54276.1 ZNF112 gene_id:7771|Hs108|chr19 ( 913) 1204 164.0 5.3e-40
CCDS12499.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 ( 714) 1201 163.4 6e-40
CCDS45463.1 ZNF629 gene_id:23361|Hs108|chr16 ( 869) 1202 163.7 6.1e-40
CCDS74353.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 ( 769) 1201 163.5 6.2e-40
CCDS82341.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 527) 1198 162.9 6.5e-40
CCDS12503.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 686) 1198 163.0 7.5e-40
CCDS76895.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 585) 1196 162.7 8.2e-40
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 1197 162.9 8.2e-40
CCDS10900.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 643) 1196 162.7 8.6e-40
CCDS14279.1 ZNF41 gene_id:7592|Hs108|chrX ( 779) 1195 162.7 1e-39
CCDS32440.1 ZNF267 gene_id:10308|Hs108|chr16 ( 743) 1194 162.6 1.1e-39
CCDS75846.1 ZNF658 gene_id:26149|Hs108|chr9 (1059) 1192 162.6 1.6e-39
CCDS12632.1 ZNF45 gene_id:7596|Hs108|chr19 ( 682) 1187 161.7 1.9e-39
CCDS32977.1 ZNF85 gene_id:7639|Hs108|chr19 ( 595) 1185 161.3 2.1e-39
CCDS31938.1 ZNF605 gene_id:100289635|Hs108|chr12 ( 641) 1185 161.4 2.2e-39
CCDS47352.1 ZNF879 gene_id:345462|Hs108|chr5 ( 563) 1184 161.2 2.3e-39
CCDS53850.1 ZNF605 gene_id:100289635|Hs108|chr12 ( 672) 1185 161.4 2.3e-39
CCDS46162.1 ZNF836 gene_id:162962|Hs108|chr19 ( 936) 1187 161.9 2.3e-39
>>CCDS4617.1 ZNF322 gene_id:79692|Hs108|chr6 (402 aa)
initn: 2874 init1: 2874 opt: 2874 Z-score: 1957.9 bits: 371.2 E(32554): 9.8e-103
Smith-Waterman score: 2874; 100.0% identity (100.0% similar) in 402 aa overlap (1-402:1-402)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MYTSEEKCNQRTQKRKIYNVCPRKGKKIFIHMHEIIQIDGHIYQCLECKQNFCENLALIM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MYTSEEKCNQRTQKRKIYNVCPRKGKKIFIHMHEIIQIDGHIYQCLECKQNFCENLALIM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 CERTHTGEKPYKCDMCEKTFVQSSDLTSHQRIHNYEKPYKCSKCEKSFWHHLALSGHQRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 CERTHTGEKPYKCDMCEKTFVQSSDLTSHQRIHNYEKPYKCSKCEKSFWHHLALSGHQRT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 HAGKKFYTCDICGKNFGQSSDLLVHQRSHTGEKPYLCSECDKCFSRSTNLIRHRRTHTGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 HAGKKFYTCDICGKNFGQSSDLLVHQRSHTGEKPYLCSECDKCFSRSTNLIRHRRTHTGE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 KPFKCLECEKAFSGKSDLISHQRTHTGERPYKCNKCEKSYRHRSAFIVHKRVHTGEKPYK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KPFKCLECEKAFSGKSDLISHQRTHTGERPYKCNKCEKSYRHRSAFIVHKRVHTGEKPYK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 CGACEKCFGQKSDLIVHQRVHTGEKPYKCLECMRSFTRSANLIRHQATHTHTFKCLEYEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 CGACEKCFGQKSDLIVHQRVHTGEKPYKCLECMRSFTRSANLIRHQATHTHTFKCLEYEK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 SFNCSSDLIVHQRIHMEEKPHQWSACESGFLLGMDFVAQQKMRTQTEELHYKYTVCDKSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SFNCSSDLIVHQRIHMEEKPHQWSACESGFLLGMDFVAQQKMRTQTEELHYKYTVCDKSF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400
pF1KB9 HQSSALLQHQTVHIGEKPFVCNVSEKGLELSPPHASEASQMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 HQSSALLQHQTVHIGEKPFVCNVSEKGLELSPPHASEASQMS
370 380 390 400
>>CCDS82413.1 ZNF544 gene_id:27300|Hs108|chr19 (687 aa)
initn: 3013 init1: 1099 opt: 1263 Z-score: 872.6 bits: 171.1 E(32554): 2.8e-42
Smith-Waterman score: 1263; 46.3% identity (72.5% similar) in 382 aa overlap (1-378:309-687)
10 20
pF1KB9 MYTSEEKCN--QRTQKRKIYNVCPRKGKKI
: .: :: : :.: .. : : :. .
CCDS82 CSESLCLVQTERSGPGETPFRCEERCAAFPMASSFSDCNIIQTTEKPSVCNQCG-KSFSC
280 290 300 310 320 330
30 40 50 60 70 80
pF1KB9 FIHMHEIIQIDGHIYQCLECKQNFCENLALIMCERTHTGEKPYKCDMCEKTFVQSSDLTS
.:. . . ..: .: ..: .. :.. .:::::::::.::.: :.:.: : : .
CCDS82 CKLIHQRTHTGEKPFECTQCGKSFSQSYDLVIHQRTHTGEKPYECDLCGKSFTQRSKLIT
340 350 360 370 380 390
90 100 110 120 130 140
pF1KB9 HQRIHNYEKPYKCSKCEKSFWHHLALSGHQRTHAGKKFYTCDICGKNFGQSSDLLVHQRS
:::::. ::::.: .:.::: . : ::: :.:.: : : :::.:.:: .:..:.:.
CCDS82 HQRIHTGEKPYQCIECRKSFRWNSNLIVHQRIHTGEKPYECTHCGKSFSQSYELVTHKRT
400 410 420 430 440 450
150 160 170 180 190 200
pF1KB9 HTGEKPYLCSECDKCFSRSTNLIRHRRTHTGEKPFKCLECEKAFSGKSDLISHQRTHTGE
::::::. :..: : ::.. .:. :.::::::::..: : :.:: .: ::.::: ::::
CCDS82 HTGEKPFKCTQCGKSFSQKYDLVVHQRTHTGEKPYECNLCGKSFSQSSKLITHQRIHTGE
460 470 480 490 500 510
210 220 230 240 250 260
pF1KB9 RPYKCNKCEKSYRHRSAFIVHKRVHTGEKPYKCGACEKCFGQKSDLIVHQRVHTGEKPYK
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CCDS82 KPYQCIECGKSFRWNSNLVIHQRIHTGEKPYDCTHCGKSFSQSYQLVAHKRTHTGEKPYE
520 530 540 550 560 570
270 280 290 300 310 320
pF1KB9 CLECMRSFTRSANLIRHQATHT--HTFKCLEYEKSFNCSSDLIVHQRIHMEEKPHQWSAC
: :: ..:.::..:::: :: . .:: . .:.: :: :..::: : ::: . : :
CCDS82 CNECGKAFNRSTQLIRHLQIHTGEKPYKCNQCNKAFARSSYLVMHQRTHTGEKPFECSQC
580 590 600 610 620 630
330 340 350 360 370 380
pF1KB9 ESGFLLGMDFVAQQKMRTQTEELHYKYTVCDKSFHQSSALLQHQTVHIGEKPFVCNVSEK
..: . ...... : .. : :. . : :::.:.: :. :. .: ::::
CCDS82 GKAFSGSSNLLSHH--RIHSGEKPYECSDCGKSFRQQSQLVVHRRTHTGEKP
640 650 660 670 680
390 400
pF1KB9 GLELSPPHASEASQMS
>>CCDS12973.1 ZNF544 gene_id:27300|Hs108|chr19 (715 aa)
initn: 3013 init1: 1099 opt: 1263 Z-score: 872.4 bits: 171.1 E(32554): 2.8e-42
Smith-Waterman score: 1263; 46.3% identity (72.5% similar) in 382 aa overlap (1-378:337-715)
10 20
pF1KB9 MYTSEEKCN--QRTQKRKIYNVCPRKGKKI
: .: :: : :.: .. : : :. .
CCDS12 CSESLCLVQTERSGPGETPFRCEERCAAFPMASSFSDCNIIQTTEKPSVCNQCG-KSFSC
310 320 330 340 350 360
30 40 50 60 70 80
pF1KB9 FIHMHEIIQIDGHIYQCLECKQNFCENLALIMCERTHTGEKPYKCDMCEKTFVQSSDLTS
.:. . . ..: .: ..: .. :.. .:::::::::.::.: :.:.: : : .
CCDS12 CKLIHQRTHTGEKPFECTQCGKSFSQSYDLVIHQRTHTGEKPYECDLCGKSFTQRSKLIT
370 380 390 400 410 420
90 100 110 120 130 140
pF1KB9 HQRIHNYEKPYKCSKCEKSFWHHLALSGHQRTHAGKKFYTCDICGKNFGQSSDLLVHQRS
:::::. ::::.: .:.::: . : ::: :.:.: : : :::.:.:: .:..:.:.
CCDS12 HQRIHTGEKPYQCIECRKSFRWNSNLIVHQRIHTGEKPYECTHCGKSFSQSYELVTHKRT
430 440 450 460 470 480
150 160 170 180 190 200
pF1KB9 HTGEKPYLCSECDKCFSRSTNLIRHRRTHTGEKPFKCLECEKAFSGKSDLISHQRTHTGE
::::::. :..: : ::.. .:. :.::::::::..: : :.:: .: ::.::: ::::
CCDS12 HTGEKPFKCTQCGKSFSQKYDLVVHQRTHTGEKPYECNLCGKSFSQSSKLITHQRIHTGE
490 500 510 520 530 540
210 220 230 240 250 260
pF1KB9 RPYKCNKCEKSYRHRSAFIVHKRVHTGEKPYKCGACEKCFGQKSDLIVHQRVHTGEKPYK
.::.: .: ::.: : ...:.:.::::::: : : : :.:. .:..:.:.:::::::.
CCDS12 KPYQCIECGKSFRWNSNLVIHQRIHTGEKPYDCTHCGKSFSQSYQLVAHKRTHTGEKPYE
550 560 570 580 590 600
270 280 290 300 310 320
pF1KB9 CLECMRSFTRSANLIRHQATHT--HTFKCLEYEKSFNCSSDLIVHQRIHMEEKPHQWSAC
: :: ..:.::..:::: :: . .:: . .:.: :: :..::: : ::: . : :
CCDS12 CNECGKAFNRSTQLIRHLQIHTGEKPYKCNQCNKAFARSSYLVMHQRTHTGEKPFECSQC
610 620 630 640 650 660
330 340 350 360 370 380
pF1KB9 ESGFLLGMDFVAQQKMRTQTEELHYKYTVCDKSFHQSSALLQHQTVHIGEKPFVCNVSEK
..: . ...... : .. : :. . : :::.:.: :. :. .: ::::
CCDS12 GKAFSGSSNLLSHH--RIHSGEKPYECSDCGKSFRQQSQLVVHRRTHTGEKP
670 680 690 700 710
390 400
pF1KB9 GLELSPPHASEASQMS
>>CCDS10329.2 ZSCAN2 gene_id:54993|Hs108|chr15 (614 aa)
initn: 3136 init1: 1095 opt: 1255 Z-score: 867.7 bits: 170.0 E(32554): 5.2e-42
Smith-Waterman score: 1255; 48.1% identity (70.9% similar) in 374 aa overlap (21-388:224-595)
10 20 30 40
pF1KB9 MYTSEEKCNQRTQKRKIYNVCPRKGK----KIFIHMHEIIQIDGHIYQCL
::. :: : . :: . . :.:
CCDS10 EDHGEVVSQDREVGQLIGLQGTYLGEKPYECPQCGKTFSRKSHLITHERTHTGEKYYKCD
200 210 220 230 240 250
50 60 70 80 90 100
pF1KB9 ECKQNFCENLALIMCERTHTGEKPYKCDMCEKTFVQSSDLTSHQRIHNYEKPYKCSKCEK
:: ..: .. . . :::::::::: : :.: .:..: .:::::. :::..:..: :
CCDS10 ECGKSFSDGSNFSRHQTTHTGEKPYKCRDCGKSFSRSANLITHQRIHTGEKPFQCAECGK
260 270 280 290 300 310
110 120 130 140 150 160
pF1KB9 SFWHHLALSGHQRTHAGKKFYTCDICGKNFGQSSDLLVHQRSHTGEKPYLCSECDKCFSR
:: . : .:::::.:.: :.: :::.::. :.: .:: ::::::: :.:: . ::
CCDS10 SFSRSPNLIAHQRTHTGEKPYSCPECGKSFGNRSSLNTHQGIHTGEKPYECKECGESFSY
320 330 340 350 360 370
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 STNLIRHRRTHTGEKPFKCLECEKAFSGKSDLISHQRTHTGERPYKCNKCEKSYRHRSAF
..:::::.: ::::::.:: .: . :: .: ::.:.::::::.::.:..: ::. . : .
CCDS10 NSNLIRHQRIHTGEKPYKCTDCGQRFSQSSALITHRRTHTGEKPYQCSECGKSFSRSSNL
380 390 400 410 420 430
230 240 250 260 270 280
pF1KB9 IVHKRVHTGEKPYKCGACEKCFGQKSDLIVHQRVHTGEKPYKCLECMRSFTRSANLIRHQ
.:.:.: :::::::.: : :.:.:.::.:: .:::::::.:: : .::. :.::..::
CCDS10 ATHRRTHMVEKPYKCGVCGKSFSQSSSLIAHQGMHTGEKPYECLTCGESFSWSSNLLKHQ
440 450 460 470 480 490
290 300 310 320 330 340
pF1KB9 ATHT--HTFKCLEYEKSFNCSSDLIVHQRIHMEEKPHQWSACESGFLLGMDFVAQQKMRT
:: . .:: : : :. :.:.:::: : :::.. : ..: : .: .: :.
CCDS10 RIHTGEKPYKCSECGKCFSQRSQLVVHQRTHTGEKPYKCLMCGKSFSRGSILVMHQ--RA
500 510 520 530 540 550
350 360 370 380 390 400
pF1KB9 QTEELHYKYTVCDKSFHQSSALLQHQTVHIGEKPFVCNVSEKGLELSPPHASEASQMS
. . :. : :.: .:.:. :: .: ::::. : ::.
CCDS10 HLGDKPYRCPECGKGFSWNSVLIIHQRIHTGEKPYKCPECGKGFSNSSNFITHQRTHMKE
560 570 580 590 600 610
CCDS10 KLY
>>CCDS11179.2 ZNF287 gene_id:57336|Hs108|chr17 (761 aa)
initn: 3093 init1: 1092 opt: 1244 Z-score: 859.4 bits: 168.8 E(32554): 1.5e-41
Smith-Waterman score: 1244; 47.3% identity (72.3% similar) in 376 aa overlap (19-391:371-744)
10 20 30 40
pF1KB9 MYTSEEKCNQRTQKRKIYNVCPRKGKKI-FIHMHEIIQIDGHIYQCLE
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CCDS11 VYNEGRATFNHVSYGIVHRKILPGEKPYKCNVCGKKFRKYPSLLKHQSTHAKEKSYECEE
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: ..: . .:: .: :::::::.: .: :.: : . :: :::::. ::::::. : :.
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: .. :. :::::.:.: : : :::.:..::.:. ::: :::::::.:.:: : ::.:
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CCDS11 HRN
760
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10 20 30
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10 20 30
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CCDS12 RSRLTYHQKVHTGKKL
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CCDS27 GEKPYKCNECAKAFTQSSRLTDHQRTHTGEKPYECNECGEAFIRSKSLARHQVLHTGKKP
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CCDS27 YKCNECGRAFCSNRNLIDHQRIHTGEKPYECSECGKAFSRSKCLIRHQSLHTGEKPYKCS
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CCDS74 LTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQH
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CCDS74 QRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIH
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CCDS74 KSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFS
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