Result of FASTA (ccds) for pF1KB9538
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB9538, 352 aa
  1>>>pF1KB9538 352 - 352 aa - 352 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4805+/-0.0019; mu= 6.8094+/- 0.110
 mean_var=248.7842+/-53.023, 0's: 0 Z-trim(103.1): 929  B-trim: 83 in 1/50
 Lambda= 0.081314
 statistics sampled from 6256 (7269) to 6256 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.535), E-opt: 0.2 (0.223), width:  16
 Scan time:  2.510

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS82013.1 ZFP1 gene_id:162239|Hs108|chr16        ( 374) 2428 298.8 4.7e-81
CCDS10914.2 ZFP1 gene_id:162239|Hs108|chr16        ( 407) 2428 298.9   5e-81
CCDS54939.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5        ( 568) 1218 157.1 3.3e-38
CCDS4311.2 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5         ( 604) 1218 157.2 3.4e-38
CCDS54940.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5        ( 620) 1218 157.2 3.4e-38
CCDS14279.1 ZNF41 gene_id:7592|Hs108|chrX          ( 779) 1211 156.5   7e-38
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12         ( 738) 1209 156.2   8e-38
CCDS35075.1 ZNF782 gene_id:158431|Hs108|chr9       ( 699) 1203 155.5 1.3e-37
CCDS35235.1 ZNF182 gene_id:7569|Hs108|chrX         ( 620) 1200 155.1 1.5e-37
CCDS35236.1 ZNF182 gene_id:7569|Hs108|chrX         ( 639) 1200 155.1 1.5e-37
CCDS82341.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19      ( 527) 1192 154.0 2.6e-37
CCDS12503.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19      ( 686) 1192 154.2   3e-37
CCDS33003.1 ZNF260 gene_id:339324|Hs108|chr19      ( 412) 1183 152.8 4.6e-37
CCDS45012.1 ZNF268 gene_id:10795|Hs108|chr12       ( 947) 1189 154.0 4.7e-37
CCDS75846.1 ZNF658 gene_id:26149|Hs108|chr9        (1059) 1189 154.1   5e-37
CCDS56092.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19      ( 580) 1184 153.1 5.3e-37
CCDS42558.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19      ( 644) 1184 153.2 5.6e-37
CCDS62707.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19        ( 665) 1184 153.2 5.7e-37
CCDS62708.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19        ( 667) 1184 153.2 5.7e-37
CCDS12639.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19        ( 692) 1184 153.2 5.8e-37
CCDS12959.2 ZNF551 gene_id:90233|Hs108|chr19       ( 670) 1182 153.0 6.7e-37
CCDS75904.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9          ( 364) 1170 151.2 1.2e-36
CCDS12500.1 ZNF585B gene_id:92285|Hs108|chr19      ( 769) 1174 152.1 1.4e-36
CCDS7198.1 ZNF33B gene_id:7582|Hs108|chr10         ( 778) 1174 152.1 1.4e-36
CCDS82413.1 ZNF544 gene_id:27300|Hs108|chr19       ( 687) 1173 152.0 1.4e-36
CCDS69664.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9          ( 474) 1170 151.4 1.5e-36
CCDS12973.1 ZNF544 gene_id:27300|Hs108|chr19       ( 715) 1173 152.0 1.5e-36
CCDS6871.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9           ( 498) 1170 151.4 1.5e-36
CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3        ( 754) 1173 152.0 1.5e-36
CCDS35067.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9        ( 816) 1173 152.1 1.6e-36
CCDS35066.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9        ( 852) 1173 152.1 1.6e-36
CCDS59136.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9        ( 854) 1173 152.1 1.6e-36
CCDS12499.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19     ( 714) 1171 151.7 1.7e-36
CCDS74353.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19     ( 769) 1171 151.8 1.8e-36
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19      ( 688) 1164 150.9   3e-36
CCDS33122.1 ZNF470 gene_id:388566|Hs108|chr19      ( 717) 1157 150.1 5.4e-36
CCDS75971.1 ZNF630 gene_id:57232|Hs108|chrX        ( 533) 1154 149.6 5.7e-36
CCDS55282.1 ZNF250 gene_id:58500|Hs108|chr8        ( 555) 1153 149.5 6.4e-36
CCDS34972.1 ZNF250 gene_id:58500|Hs108|chr8        ( 560) 1153 149.5 6.4e-36
CCDS35237.2 ZNF630 gene_id:57232|Hs108|chrX        ( 657) 1154 149.7 6.5e-36
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19        ( 616) 1153 149.5 6.8e-36
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19        ( 658) 1153 149.6 7.1e-36
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19        ( 670) 1153 149.6 7.1e-36
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19        ( 682) 1153 149.6 7.2e-36
CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8           ( 682) 1151 149.4 8.5e-36
CCDS73089.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10        ( 699) 1149 149.1   1e-35
CCDS31182.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10        ( 810) 1149 149.2 1.1e-35
CCDS44372.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10        ( 811) 1149 149.2 1.1e-35
CCDS60514.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10        ( 817) 1149 149.2 1.1e-35
CCDS73088.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10        ( 829) 1149 149.2 1.1e-35


>>CCDS82013.1 ZFP1 gene_id:162239|Hs108|chr16             (374 aa)
 initn: 2428 init1: 2428 opt: 2428  Z-score: 1568.6  bits: 298.8 E(32554): 4.7e-81
Smith-Waterman score: 2428; 100.0% identity (100.0% similar) in 352 aa overlap (1-352:23-374)

                                     10        20        30        
pF1KB9                       MERDHRNPDEQARQFLILKNQTPIEERGDLFGKALNLN
                             ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 MDVMLENYSNLLSVEVWKADDQMERDHRNPDEQARQFLILKNQTPIEERGDLFGKALNLN
               10        20        30        40        50        60

       40        50        60        70        80        90        
pF1KB9 TDFVSLRQVPYKYDLYEKTLKYNSDLLNSNRSYAGKQTDECNEFGKALLYLKQEKTHSGV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 TDFVSLRQVPYKYDLYEKTLKYNSDLLNSNRSYAGKQTDECNEFGKALLYLKQEKTHSGV
               70        80        90       100       110       120

      100       110       120       130       140       150        
pF1KB9 EYSEYNKSGKALSHKAAIFKHQKIKNLVQPFICTYCDKAFSFKSLLISHKRIHTGEKPYE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 EYSEYNKSGKALSHKAAIFKHQKIKNLVQPFICTYCDKAFSFKSLLISHKRIHTGEKPYE
              130       140       150       160       170       180

      160       170       180       190       200       210        
pF1KB9 CNVCKKTFSHKANLIKHQRIHTGEKPFECPECGKAFTHQSNLIVHQRAHMEKKPYECSEC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 CNVCKKTFSHKANLIKHQRIHTGEKPFECPECGKAFTHQSNLIVHQRAHMEKKPYECSEC
              190       200       210       220       230       240

      220       230       240       250       260       270        
pF1KB9 GKTFAQKFELTTHQRIHTGERPYECNECAKTFFKKSNLIIHQKIHTGEKRYECSECGKSF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 GKTFAQKFELTTHQRIHTGERPYECNECAKTFFKKSNLIIHQKIHTGEKRYECSECGKSF
              250       260       270       280       290       300

      280       290       300       310       320       330        
pF1KB9 IQNSQLIIHMRTHTGEKPYECTECGKTFSQRSTLRLHLRIHTGEKPYECSECGKAFSRKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 IQNSQLIIHMRTHTGEKPYECTECGKTFSQRSTLRLHLRIHTGEKPYECSECGKAFSRKS
              310       320       330       340       350       360

      340       350  
pF1KB9 RLSVHQRVHIGEKP
       ::::::::::::::
CCDS82 RLSVHQRVHIGEKP
              370    

>>CCDS10914.2 ZFP1 gene_id:162239|Hs108|chr16             (407 aa)
 initn: 2428 init1: 2428 opt: 2428  Z-score: 1568.2  bits: 298.9 E(32554): 5e-81
Smith-Waterman score: 2428; 100.0% identity (100.0% similar) in 352 aa overlap (1-352:56-407)

                                             10        20        30
pF1KB9                               MERDHRNPDEQARQFLILKNQTPIEERGDL
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 DPSQRILYMDVMLENYSNLLSVEVWKADDQMERDHRNPDEQARQFLILKNQTPIEERGDL
          30        40        50        60        70        80     

               40        50        60        70        80        90
pF1KB9 FGKALNLNTDFVSLRQVPYKYDLYEKTLKYNSDLLNSNRSYAGKQTDECNEFGKALLYLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 FGKALNLNTDFVSLRQVPYKYDLYEKTLKYNSDLLNSNRSYAGKQTDECNEFGKALLYLK
          90       100       110       120       130       140     

              100       110       120       130       140       150
pF1KB9 QEKTHSGVEYSEYNKSGKALSHKAAIFKHQKIKNLVQPFICTYCDKAFSFKSLLISHKRI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QEKTHSGVEYSEYNKSGKALSHKAAIFKHQKIKNLVQPFICTYCDKAFSFKSLLISHKRI
         150       160       170       180       190       200     

              160       170       180       190       200       210
pF1KB9 HTGEKPYECNVCKKTFSHKANLIKHQRIHTGEKPFECPECGKAFTHQSNLIVHQRAHMEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 HTGEKPYECNVCKKTFSHKANLIKHQRIHTGEKPFECPECGKAFTHQSNLIVHQRAHMEK
         210       220       230       240       250       260     

              220       230       240       250       260       270
pF1KB9 KPYECSECGKTFAQKFELTTHQRIHTGERPYECNECAKTFFKKSNLIIHQKIHTGEKRYE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KPYECSECGKTFAQKFELTTHQRIHTGERPYECNECAKTFFKKSNLIIHQKIHTGEKRYE
         270       280       290       300       310       320     

              280       290       300       310       320       330
pF1KB9 CSECGKSFIQNSQLIIHMRTHTGEKPYECTECGKTFSQRSTLRLHLRIHTGEKPYECSEC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 CSECGKSFIQNSQLIIHMRTHTGEKPYECTECGKTFSQRSTLRLHLRIHTGEKPYECSEC
         330       340       350       360       370       380     

              340       350  
pF1KB9 GKAFSRKSRLSVHQRVHIGEKP
       ::::::::::::::::::::::
CCDS10 GKAFSRKSRLSVHQRVHIGEKP
         390       400       

>>CCDS54939.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5             (568 aa)
 initn: 1173 init1: 1173 opt: 1218  Z-score: 799.5  bits: 157.1 E(32554): 3.3e-38
Smith-Waterman score: 1218; 56.5% identity (81.1% similar) in 301 aa overlap (56-352:240-540)

          30        40        50        60        70        80     
pF1KB9 ERGDLFGKALNLNTDFVSLRQVPYKYDLYEKTLKYNSDLLNSNRSYAGKQTDECNEFGKA
                                     :..  .:.:.  .: ..::.  .:.  :::
CCDS54 CGNVFRNTQSLIQYQNVETKEKSCVCVTCGKAFAKKSQLIVHQRIHTGKKPYDCGACGKA
     210       220       230       240       250       260         

             90        100       110       120       130       140 
pF1KB9 L---LYLK-QEKTHSGVEYSEYNKSGKALSHKAAIFKHQKIKNLVQPFICTYCDKAFSFK
       .   ..:  ...::.: .  . .. :::.:.:.... ::....  .:. :. : :::: :
CCDS54 FSEKFHLVVHQRTHTGEKPYDCSECGKAFSQKSSLIIHQRVHTGEKPYECSECGKAFSQK
     270       280       290       300       310       320         

             150       160       170       180       190       200 
pF1KB9 SLLISHKRIHTGEKPYECNVCKKTFSHKANLIKHQRIHTGEKPFECPECGKAFTHQSNLI
       : :: :.:::::::::::  : :.::.:..:: :.: ::::::.:: :::::: ..:.::
CCDS54 SPLIIHQRIHTGEKPYECRECGKAFSQKSQLIIHHRAHTGEKPYECTECGKAFCEKSHLI
     330       340       350       360       370       380         

             210       220       230       240       250       260 
pF1KB9 VHQRAHMEKKPYECSECGKTFAQKFELTTHQRIHTGERPYECNECAKTFFKKSNLIIHQK
       .:.: :  .:::.:..: ..:..: :: ::: .::::.::::.::.::: .::.:::::.
CCDS54 IHKRIHTGEKPYKCAQCEEAFSRKTELITHQLVHTGEKPYECTECGKTFSRKSQLIIHQR
     390       400       410       420       430       440         

             270       280       290       300       310       320 
pF1KB9 IHTGEKRYECSECGKSFIQNSQLIIHMRTHTGEKPYECTECGKTFSQRSTLRLHLRIHTG
        ::::: :.::::::.: :.:.:: :.: ::::::: ::::::.:::.: :  : :::::
CCDS54 THTGEKPYKCSECGKAFCQKSHLIGHQRIHTGEKPYICTECGKAFSQKSHLPGHQRIHTG
     450       460       470       480       490       500         

             330       340       350                              
pF1KB9 EKPYECSECGKAFSRKSRLSVHQRVHIGEKP                            
       :::: :.:::::::.:: : .:::.: ::.:                            
CCDS54 EKPYICAECGKAFSQKSDLVLHQRIHTGERPYQCAICGKAFIQKSQLTVHQRIHTVVKS
     510       520       530       540       550       560        

>>CCDS4311.2 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5              (604 aa)
 initn: 1173 init1: 1173 opt: 1218  Z-score: 799.2  bits: 157.2 E(32554): 3.4e-38
Smith-Waterman score: 1218; 56.5% identity (81.1% similar) in 301 aa overlap (56-352:276-576)

          30        40        50        60        70        80     
pF1KB9 ERGDLFGKALNLNTDFVSLRQVPYKYDLYEKTLKYNSDLLNSNRSYAGKQTDECNEFGKA
                                     :..  .:.:.  .: ..::.  .:.  :::
CCDS43 CGNVFRNTQSLIQYQNVETKEKSCVCVTCGKAFAKKSQLIVHQRIHTGKKPYDCGACGKA
         250       260       270       280       290       300     

             90        100       110       120       130       140 
pF1KB9 L---LYLK-QEKTHSGVEYSEYNKSGKALSHKAAIFKHQKIKNLVQPFICTYCDKAFSFK
       .   ..:  ...::.: .  . .. :::.:.:.... ::....  .:. :. : :::: :
CCDS43 FSEKFHLVVHQRTHTGEKPYDCSECGKAFSQKSSLIIHQRVHTGEKPYECSECGKAFSQK
         310       320       330       340       350       360     

             150       160       170       180       190       200 
pF1KB9 SLLISHKRIHTGEKPYECNVCKKTFSHKANLIKHQRIHTGEKPFECPECGKAFTHQSNLI
       : :: :.:::::::::::  : :.::.:..:: :.: ::::::.:: :::::: ..:.::
CCDS43 SPLIIHQRIHTGEKPYECRECGKAFSQKSQLIIHHRAHTGEKPYECTECGKAFCEKSHLI
         370       380       390       400       410       420     

             210       220       230       240       250       260 
pF1KB9 VHQRAHMEKKPYECSECGKTFAQKFELTTHQRIHTGERPYECNECAKTFFKKSNLIIHQK
       .:.: :  .:::.:..: ..:..: :: ::: .::::.::::.::.::: .::.:::::.
CCDS43 IHKRIHTGEKPYKCAQCEEAFSRKTELITHQLVHTGEKPYECTECGKTFSRKSQLIIHQR
         430       440       450       460       470       480     

             270       280       290       300       310       320 
pF1KB9 IHTGEKRYECSECGKSFIQNSQLIIHMRTHTGEKPYECTECGKTFSQRSTLRLHLRIHTG
        ::::: :.::::::.: :.:.:: :.: ::::::: ::::::.:::.: :  : :::::
CCDS43 THTGEKPYKCSECGKAFCQKSHLIGHQRIHTGEKPYICTECGKAFSQKSHLPGHQRIHTG
         490       500       510       520       530       540     

             330       340       350                              
pF1KB9 EKPYECSECGKAFSRKSRLSVHQRVHIGEKP                            
       :::: :.:::::::.:: : .:::.: ::.:                            
CCDS43 EKPYICAECGKAFSQKSDLVLHQRIHTGERPYQCAICGKAFIQKSQLTVHQRIHTVVKS
         550       560       570       580       590       600    

>>CCDS54940.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5             (620 aa)
 initn: 1173 init1: 1173 opt: 1218  Z-score: 799.1  bits: 157.2 E(32554): 3.4e-38
Smith-Waterman score: 1218; 56.5% identity (81.1% similar) in 301 aa overlap (56-352:292-592)

          30        40        50        60        70        80     
pF1KB9 ERGDLFGKALNLNTDFVSLRQVPYKYDLYEKTLKYNSDLLNSNRSYAGKQTDECNEFGKA
                                     :..  .:.:.  .: ..::.  .:.  :::
CCDS54 CGNVFRNTQSLIQYQNVETKEKSCVCVTCGKAFAKKSQLIVHQRIHTGKKPYDCGACGKA
             270       280       290       300       310       320 

             90        100       110       120       130       140 
pF1KB9 L---LYLK-QEKTHSGVEYSEYNKSGKALSHKAAIFKHQKIKNLVQPFICTYCDKAFSFK
       .   ..:  ...::.: .  . .. :::.:.:.... ::....  .:. :. : :::: :
CCDS54 FSEKFHLVVHQRTHTGEKPYDCSECGKAFSQKSSLIIHQRVHTGEKPYECSECGKAFSQK
             330       340       350       360       370       380 

             150       160       170       180       190       200 
pF1KB9 SLLISHKRIHTGEKPYECNVCKKTFSHKANLIKHQRIHTGEKPFECPECGKAFTHQSNLI
       : :: :.:::::::::::  : :.::.:..:: :.: ::::::.:: :::::: ..:.::
CCDS54 SPLIIHQRIHTGEKPYECRECGKAFSQKSQLIIHHRAHTGEKPYECTECGKAFCEKSHLI
             390       400       410       420       430       440 

             210       220       230       240       250       260 
pF1KB9 VHQRAHMEKKPYECSECGKTFAQKFELTTHQRIHTGERPYECNECAKTFFKKSNLIIHQK
       .:.: :  .:::.:..: ..:..: :: ::: .::::.::::.::.::: .::.:::::.
CCDS54 IHKRIHTGEKPYKCAQCEEAFSRKTELITHQLVHTGEKPYECTECGKTFSRKSQLIIHQR
             450       460       470       480       490       500 

             270       280       290       300       310       320 
pF1KB9 IHTGEKRYECSECGKSFIQNSQLIIHMRTHTGEKPYECTECGKTFSQRSTLRLHLRIHTG
        ::::: :.::::::.: :.:.:: :.: ::::::: ::::::.:::.: :  : :::::
CCDS54 THTGEKPYKCSECGKAFCQKSHLIGHQRIHTGEKPYICTECGKAFSQKSHLPGHQRIHTG
             510       520       530       540       550       560 

             330       340       350                              
pF1KB9 EKPYECSECGKAFSRKSRLSVHQRVHIGEKP                            
       :::: :.:::::::.:: : .:::.: ::.:                            
CCDS54 EKPYICAECGKAFSQKSDLVLHQRIHTGERPYQCAICGKAFIQKSQLTVHQRIHTVVKS
             570       580       590       600       610       620

>>CCDS14279.1 ZNF41 gene_id:7592|Hs108|chrX               (779 aa)
 initn: 1148 init1: 1148 opt: 1211  Z-score: 793.6  bits: 156.5 E(32554): 7e-38
Smith-Waterman score: 1218; 51.4% identity (77.6% similar) in 331 aa overlap (32-352:333-662)

              10        20        30        40             50      
pF1KB9 ERDHRNPDEQARQFLILKNQTPIEERGDLFGKALNLNTDFVSLRQV-----PYKYDLYEK
                                     ::...:...... ...     ::: .   :
CCDS14 KSNKVFPQKPQVDVHPSVYTGEKPYLCTQCGKVFTLKSNLITHQKIHTGQKPYKCSECGK
            310       320       330       340       350       360  

         60        70        80             90       100       110 
pF1KB9 TLKYNSDLLNSNRSYAGKQTDECNEFGKAL-----LYLKQEKTHSGVEYSEYNKSGKALS
       ..   :::.   : ..:..  ::.: ::..     : ..: :::.: .. : :. :::..
CCDS14 AFFQRSDLFRHLRIHTGEKPYECSECGKGFSQNSDLSIHQ-KTHTGEKHYECNECGKAFT
            370       380       390       400        410       420 

             120       130       140       150       160       170 
pF1KB9 HKAAIFKHQKIKNLVQPFICTYCDKAFSFKSLLISHKRIHTGEKPYECNVCKKTFSHKAN
       .:.:.  ::.:..  .:..:. : :::  :: . .:.:::::::::::. : :.:..:..
CCDS14 RKSALRMHQRIHTGEKPYVCADCGKAFIQKSHFNTHQRIHTGEKPYECSDCGKSFTKKSQ
             430       440       450       460       470       480 

             180       190       200       210       220       230 
pF1KB9 LIKHQRIHTGEKPFECPECGKAFTHQSNLIVHQRAHMEKKPYECSECGKTFAQKFELTTH
       :  ::::::::::. : ::::.:::..:: .::..:  .::: :.::::.:... .:  :
CCDS14 LHVHQRIHTGEKPYICTECGKVFTHRTNLTTHQKTHTGEKPYMCAECGKAFTDQSNLIKH
             490       500       510       520       530       540 

             240       250       260       270       280       290 
pF1KB9 QRIHTGERPYECNECAKTFFKKSNLIIHQKIHTGEKRYECSECGKSFIQNSQLIIHMRTH
       :. ::::.::.:: :.:.:. :: : :::: : ::..:::..:::.:::.: : .:.: :
CCDS14 QKTHTGEKPYKCNGCGKAFIWKSRLKIHQKSHIGERHYECKDCGKAFIQKSTLSVHQRIH
             550       560       570       580       590       600 

             300       310       320       330       340       350 
pF1KB9 TGEKPYECTECGKTFSQRSTLRLHLRIHTGEKPYECSECGKAFSRKSRLSVHQRVHIGEK
       :::::: : ::::.: :.: .  : ::::::::::::.::: :..::.: :::..: :::
CCDS14 TGEKPYVCPECGKAFIQKSHFIAHHRIHTGEKPYECSDCGKCFTKKSQLRVHQKIHTGEK
             610       620       630       640       650       660 

                                                                   
pF1KB9 P                                                           
       :                                                           
CCDS14 PNICAECGKAFTDRSNLITHQKIHTREKPYECGDCGKTFTWKSRLNIHQKSHTGERHYEC
             670       680       690       700       710       720 

>--
 initn: 486 init1: 486 opt: 500  Z-score: 342.8  bits: 73.1 E(32554): 9e-13
Smith-Waterman score: 502; 56.5% identity (79.1% similar) in 115 aa overlap (159-273:665-779)

      130       140       150       160       170       180        
pF1KB9 FICTYCDKAFSFKSLLISHKRIHTGEKPYECNVCKKTFSHKANLIKHQRIHTGEKPFECP
                                     :  : :.:. ..::: ::.::: :::.:: 
CCDS14 YECSDCGKCFTKKSQLRVHQKIHTGEKPNICAECGKAFTDRSNLITHQKIHTREKPYECG
          640       650       660       670       680       690    

      190       200       210       220       230       240        
pF1KB9 ECGKAFTHQSNLIVHQRAHMEKKPYECSECGKTFAQKFELTTHQRIHTGERPYECNECAK
       .:::.:: .: : .::..:  .. ::::.:::.: ::  :. :: ::::..:: :.:: :
CCDS14 DCGKTFTWKSRLNIHQKSHTGERHYECSKCGKAFIQKATLSMHQIIHTGKKPYACTECQK
          700       710       720       730       740       750    

      250       260       270       280       290       300        
pF1KB9 TFFKKSNLIIHQKIHTGEKRYECSECGKSFIQNSQLIIHMRTHTGEKPYECTECGKTFSQ
       .:  .:::: :::.:.:::::. :.                                   
CCDS14 AFTDRSNLIKHQKMHSGEKRYKASD                                   
          760       770                                            

>>CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12              (738 aa)
 initn: 1172 init1: 1172 opt: 1209  Z-score: 792.6  bits: 156.2 E(32554): 8e-38
Smith-Waterman score: 1212; 51.9% identity (75.9% similar) in 345 aa overlap (17-352:340-682)

                             10        20        30        40      
pF1KB9               MERDHRNPDEQARQFLILKNQTPIEERGDLFGKALNLNTDFVSLRQ
                                     :  .. :.: :    :::.. ....:. ..
CCDS31 WRTHTGEKPYGCNECGRAFSEKSNLINHQRIHTGEKPFECRE--CGKAFSRKSQLVTHHR
     310       320       330       340       350         360       

              50        60        70        80            90       
pF1KB9 V-----PYKYDLYEKTLKYNSDLLNSNRSYAGKQTDECNEFGKALL----YLKQEKTHSG
       .     :.  .  .:..  .:.:.  .  ..:..  ::.:  ::.      .....::.:
CCDS31 THTGTKPFGCSDCRKAFFEKSELIRHQTIHTGEKPYECSECRKAFRERSSLINHQRTHTG
       370       380       390       400       410       420       

       100       110       120       130       140       150       
pF1KB9 VEYSEYNKSGKALSHKAAIFKHQKIKNLVQPFICTYCDKAFSFKSLLISHKRIHTGEKPY
        .     . :::.:.:. ...::  ..  .::::. : :::: :: :. :.: :::::::
CCDS31 EKPHGCIQCGKAFSQKSHLISHQMTHTGEKPFICSKCGKAFSRKSQLVRHQRTHTGEKPY
       430       440       450       460       470       480       

       160       170       180       190       200       210       
pF1KB9 ECNVCKKTFSHKANLIKHQRIHTGEKPFECPECGKAFTHQSNLIVHQRAHMEKKPYECSE
       ::. : :.::.: .: .::::::::::. : :::::: ..:.:: :::.:  .:::::::
CCDS31 ECSECGKAFSEKLSLTNHQRIHTGEKPYVCSECGKAFCQKSHLISHQRTHTGEKPYECSE
       490       500       510       520       530       540       

       220       230       240       250       260       270       
pF1KB9 CGKTFAQKFELTTHQRIHTGERPYECNECAKTFFKKSNLIIHQKIHTGEKRYECSECGKS
       :::.:..:  :.:::: ::::.:::: .: :.: .::.:  ::.:::::: :::: : :.
CCDS31 CGKAFGEKSSLATHQRTHTGEKPYECRDCEKAFSQKSQLNTHQRIHTGEKPYECSLCRKA
       550       560       570       580       590       600       

       280       290       300       310       320       330       
pF1KB9 FIQNSQLIIHMRTHTGEKPYECTECGKTFSQRSTLRLHLRIHTGEKPYECSECGKAFSRK
       :...:.:: :.:::::::::::.:: :.: ..:.:  : ::::::::.::::::::::::
CCDS31 FFEKSELIRHLRTHTGEKPYECNECRKAFREKSSLINHQRIHTGEKPFECSECGKAFSRK
       610       620       630       640       650       660       

       340       350                                               
pF1KB9 SRLSVHQRVHIGEKP                                             
       :.:  :::.: ::::                                             
CCDS31 SHLIPHQRTHTGEKPYGCSECRKAFSQKSQLVNHQRIHTGEKPYRCIECGKAFSQKSQLI
       670       680       690       700       710       720       

>--
 initn: 1081 init1: 601 opt: 617  Z-score: 417.2  bits: 86.8 E(32554): 6.4e-17
Smith-Waterman score: 683; 41.6% identity (65.3% similar) in 274 aa overlap (19-289:95-339)

                           10        20           30        40     
pF1KB9             MERDHRNPDEQARQFLILKNQTPIEERG---DLFGKALNLNTDFVSLR
                                     ...  : .::   : ::: .::: .:: ::
CCDS31 EPWVGDGEIPSSDSPEVWKVDGNMMWHQDNQDKLKIIKRGHECDAFGKNFNLNMNFVPLR
           70        80        90       100       110       120    

          50        60        70        80        90       100     
pF1KB9 QVPYKYDLYEKTLKYNSDLLNSNRSYAGKQTDECNEFGKALLYLKQEKTHSGVEYSEYNK
       .   . ::    ::.. :::  . .:.  ..:. : : . .:. : : : . ..: . .:
CCDS31 KSNSEGDLDGLILKHHLDLLIPKGDYGKAESDDFNVFDNFFLHSKPEDTDTWLKYYDCDK
          130       140       150       160       170       180    

         110       120       130       140       150       160     
pF1KB9 SGKALSHKAAIFKHQKIKNLVQPFICTYCDKAFSFKSLLISHKRIHTGEKPYECNVCKKT
         .  :.:                           :: .: ..: . ::: :::. :.: 
CCDS31 YKE--SYK---------------------------KSQIIIYHRNRLGEKLYECSECRKR
            190                                  200       210     

         170       180       190       200       210       220     
pF1KB9 FSHKANLIKHQRIHTGEKPFECPECGKAFTHQSNLIVHQRAHMEKKPYECSECGKTFAQK
       ::.: .:::::  :  .  : : .:::.: ..:..:.:.:.:  .:::.::.:::.:.::
CCDS31 FSKKPSLIKHQSRHIRDIAFGCGNCGKTFPQKSQFITHHRTHTGEKPYNCSQCGKAFSQK
         220       230       240       250       260       270     

         230       240       250       260       270       280     
pF1KB9 FELTTHQRIHTGERPYECNECAKTFFKKSNLIIHQKIHTGEKRYECSECGKSFIQNSQLI
        .::.::: ::::.::::.::.:.: .::.:: : . ::::: : :.:::..: ..:.::
CCDS31 SQLTSHQRTHTGEKPYECGECGKAFSRKSHLISHWRTHTGEKPYGCNECGRAFSEKSNLI
         280       290       300       310       320       330     

         290       300       310       320       330       340     
pF1KB9 IHMRTHTGEKPYECTECGKTFSQRSTLRLHLRIHTGEKPYECSECGKAFSRKSRLSVHQR
        :.:                                                        
CCDS31 NHQRIHTGEKPFECRECGKAFSRKSQLVTHHRTHTGTKPFGCSDCRKAFFEKSELIRHQT
         340       350       360       370       380       390     

>>CCDS35075.1 ZNF782 gene_id:158431|Hs108|chr9            (699 aa)
 initn: 1122 init1: 1122 opt: 1203  Z-score: 789.0  bits: 155.5 E(32554): 1.3e-37
Smith-Waterman score: 1203; 52.4% identity (78.1% similar) in 315 aa overlap (42-352:359-673)

              20        30        40        50        60        70 
pF1KB9 ARQFLILKNQTPIEERGDLFGKALNLNTDFVSLRQVPYKYDLYEKTLKYNSDLLNSNRSY
                                     : .:  ::.:.   :. ..:: :.  ..:.
CCDS35 QRTHATDKYSDYHPCTETFSYQSTFSVHQKVHIRAKPYEYNECGKSCSMNSHLIWPQKSH
      330       340       350       360       370       380        

              80            90       100       110       120       
pF1KB9 AGKQTDECNEFGKALL----YLKQEKTHSGVEYSEYNKSGKALSHKAAIFKHQKIKNLVQ
       .:..  :: : :::.       :...::.: .  . .   ::.: :...  ::. ..  .
CCDS35 TGEKPYECPECGKAFSEKSRLRKHQRTHTGEKPYKCDGCDKAFSAKSGLRIHQRTHTGEK
      390       400       410       420       430       440        

       130       140       150       160       170       180       
pF1KB9 PFICTYCDKAFSFKSLLISHKRIHTGEKPYECNVCKKTFSHKANLIKHQRIHTGEKPFEC
       :: :  : :.:..::.:: :.: ::::::.::: : :.::: ..: .:.: ::::.:..:
CCDS35 PFECHECGKSFNYKSILIVHQRTHTGEKPFECNECGKSFSHMSGLRNHRRTHTGERPYKC
      450       460       470       480       490       500        

       190       200       210       220       230       240       
pF1KB9 PECGKAFTHQSNLIVHQRAHMEKKPYECSECGKTFAQKFELTTHQRIHTGERPYECNECA
        ::::::  .:.:  :.:.:  .:::.:..:::.:.:: .:  :.::::::.::.::.:.
CCDS35 DECGKAFKLKSGLRKHHRTHTGEKPYKCNQCGKAFGQKSQLRGHHRIHTGEKPYKCNHCG
      510       520       530       540       550       560        

       250       260       270       280       290       300       
pF1KB9 KTFFKKSNLIIHQKIHTGEKRYECSECGKSFIQNSQLIIHMRTHTGEKPYECTECGKTFS
       ..: .:::: .:.. ::::: :.: ::::.: :.:.:  :.:::::::::::.::::.::
CCDS35 EAFSQKSNLRVHHRTHTGEKPYQCEECGKTFRQKSNLRGHQRTHTGEKPYECNECGKAFS
      570       580       590       600       610       620        

       310       320       330       340       350                 
pF1KB9 QRSTLRLHLRIHTGEKPYECSECGKAFSRKSRLSVHQRVHIGEKP               
       ..:.:: : : :::::::.:..::.:::.:: : ::::.: ::::               
CCDS35 EKSVLRKHQRTHTGEKPYNCNQCGEAFSQKSNLRVHQRTHTGEKPYKCDKCGRTFSQKSS
      630       640       650       660       670       680        

CCDS35 LREHQKAHPGD
      690         

>>CCDS35235.1 ZNF182 gene_id:7569|Hs108|chrX              (620 aa)
 initn: 1144 init1: 1144 opt: 1200  Z-score: 787.7  bits: 155.1 E(32554): 1.5e-37
Smith-Waterman score: 1200; 54.2% identity (78.9% similar) in 308 aa overlap (48-351:298-605)

        20        30        40        50        60        70       
pF1KB9 LKNQTPIEERGDLFGKALNLNTDFVSLRQVPYKYDLYEKTLKYNSDLLNSNRSYAGKQTD
                                     ::. .   :..  .:.:.  .....:..: 
CCDS35 ERPFECPECGKAFREKSTVIIHYRTHTGEKPYECNECGKAFTQKSNLIVHQKTHTGEKTY
       270       280       290       300       310       320       

        80            90       100       110       120       130   
pF1KB9 ECNEFGKALLY----LKQEKTHSGVEYSEYNKSGKALSHKAAIFKHQKIKNLVQPFICTY
       ::.. :....     . ...::.: .  : :.  :..: :.... ::. ..  .:  :: 
CCDS35 ECTKCGESFIQKLDLIIHHSTHTGKKPHECNECKKTFSDKSTLIIHQRTHTGEKPHKCTE
       330       340       350       360       370       380       

           140       150       160       170       180       190   
pF1KB9 CDKAFSFKSLLISHKRIHTGEKPYECNVCKKTFSHKANLIKHQRIHTGEKPFECPECGKA
       : :.:. :: :: :.: :::::::::.:: :::..:.::  ::: :.::::::: :: ::
CCDS35 CGKSFNEKSTLIVHQRTHTGEKPYECDVCGKTFTQKSNLGVHQRTHSGEKPFECNECEKA
       390       400       410       420       430       440       

           200       210       220       230       240       250   
pF1KB9 FTHQSNLIVHQRAHMEKKPYECSECGKTFAQKFELTTHQRIHTGERPYECNECAKTFFKK
       :...: :..:::.:  .:::::.:: :.:.::  :  ::: :: :.::.::::.:.: .:
CCDS35 FSQKSYLMLHQRGHTGEKPYECNECEKAFSQKSYLIIHQRTHTEEKPYKCNECGKAFREK
       450       460       470       480       490       500       

           260       270       280       290       300       310   
pF1KB9 SNLIIHQKIHTGEKRYECSECGKSFIQNSQLIIHMRTHTGEKPYECTECGKTFSQRSTLR
       :.:::::.:::::: :::  : :.: :.::::::.::::::::: ::::::.: ..::. 
CCDS35 SKLIIHQRIHTGEKPYECPVCWKAFSQKSQLIIHQRTHTGEKPYACTECGKAFREKSTFT
       510       520       530       540       550       560       

           320       330       340       350                
pF1KB9 LHLRIHTGEKPYECSECGKAFSRKSRLSVHQRVHIGEKP              
       .: : :::::::.:.::::::..:: : ::::.: :.:               
CCDS35 VHQRTHTGEKPYKCTECGKAFTQKSNLIVHQRTHAGKKAHGRGHTRKSKFMAH
       570       580       590       600       610       620

>--
 initn: 516 init1: 516 opt: 529  Z-score: 362.3  bits: 76.3 E(32554): 7.4e-14
Smith-Waterman score: 529; 54.5% identity (76.9% similar) in 134 aa overlap (190-323:168-297)

     160       170       180       190       200       210         
pF1KB9 NVCKKTFSHKANLIKHQRIHTGEKPFECPECGKAFTHQSNLIVHQRAHMEKKPYECSECG
                                     :.: : :      .....   :::  .:::
CCDS35 PDKHESFGNNMVDNLDLFSRSSAENKYDNGCAKLFFHTE----YEKTNPGMKPYGYKECG
       140       150       160       170           180       190   

     220       230       240       250       260       270         
pF1KB9 KTFAQKFELTTHQRIHTGERPYECNECAKTFFKKSNLIIHQKIHTGEKRYECSECGKSFI
       : . .:  :. ::::..::.:.::. : ::: :::.::.: . ::::: . :.::::.: 
CCDS35 KGLRRKKGLSLHQRIKNGEKPFECTACRKTFSKKSHLIVHWRTHTGEKPFGCTECGKAFS
           200       210       220       230       240       250   

     280       290       300       310       320       330         
pF1KB9 QNSQLIIHMRTHTGEKPYECTECGKTFSQRSTLRLHLRIHTGEKPYECSECGKAFSRKSR
       :.::::::.::::::.:.:: ::::.: ..::. .: : :::::                
CCDS35 QKSQLIIHLRTHTGERPFECPECGKAFREKSTVIIHYRTHTGEKPYECNECGKAFTQKSN
           260       270       280       290       300       310   

     340       350                                                 
pF1KB9 LSVHQRVHIGEKP                                               
                                                                   
CCDS35 LIVHQKTHTGEKTYECTKCGESFIQKLDLIIHHSTHTGKKPHECNECKKTFSDKSTLIIH
           320       330       340       350       360       370   

>>CCDS35236.1 ZNF182 gene_id:7569|Hs108|chrX              (639 aa)
 initn: 1144 init1: 1144 opt: 1200  Z-score: 787.5  bits: 155.1 E(32554): 1.5e-37
Smith-Waterman score: 1200; 54.2% identity (78.9% similar) in 308 aa overlap (48-351:317-624)

        20        30        40        50        60        70       
pF1KB9 LKNQTPIEERGDLFGKALNLNTDFVSLRQVPYKYDLYEKTLKYNSDLLNSNRSYAGKQTD
                                     ::. .   :..  .:.:.  .....:..: 
CCDS35 ERPFECPECGKAFREKSTVIIHYRTHTGEKPYECNECGKAFTQKSNLIVHQKTHTGEKTY
        290       300       310       320       330       340      

        80            90       100       110       120       130   
pF1KB9 ECNEFGKALLY----LKQEKTHSGVEYSEYNKSGKALSHKAAIFKHQKIKNLVQPFICTY
       ::.. :....     . ...::.: .  : :.  :..: :.... ::. ..  .:  :: 
CCDS35 ECTKCGESFIQKLDLIIHHSTHTGKKPHECNECKKTFSDKSTLIIHQRTHTGEKPHKCTE
        350       360       370       380       390       400      

           140       150       160       170       180       190   
pF1KB9 CDKAFSFKSLLISHKRIHTGEKPYECNVCKKTFSHKANLIKHQRIHTGEKPFECPECGKA
       : :.:. :: :: :.: :::::::::.:: :::..:.::  ::: :.::::::: :: ::
CCDS35 CGKSFNEKSTLIVHQRTHTGEKPYECDVCGKTFTQKSNLGVHQRTHSGEKPFECNECEKA
        410       420       430       440       450       460      

           200       210       220       230       240       250   
pF1KB9 FTHQSNLIVHQRAHMEKKPYECSECGKTFAQKFELTTHQRIHTGERPYECNECAKTFFKK
       :...: :..:::.:  .:::::.:: :.:.::  :  ::: :: :.::.::::.:.: .:
CCDS35 FSQKSYLMLHQRGHTGEKPYECNECEKAFSQKSYLIIHQRTHTEEKPYKCNECGKAFREK
        470       480       490       500       510       520      

           260       270       280       290       300       310   
pF1KB9 SNLIIHQKIHTGEKRYECSECGKSFIQNSQLIIHMRTHTGEKPYECTECGKTFSQRSTLR
       :.:::::.:::::: :::  : :.: :.::::::.::::::::: ::::::.: ..::. 
CCDS35 SKLIIHQRIHTGEKPYECPVCWKAFSQKSQLIIHQRTHTGEKPYACTECGKAFREKSTFT
        530       540       550       560       570       580      

           320       330       340       350                
pF1KB9 LHLRIHTGEKPYECSECGKAFSRKSRLSVHQRVHIGEKP              
       .: : :::::::.:.::::::..:: : ::::.: :.:               
CCDS35 VHQRTHTGEKPYKCTECGKAFTQKSNLIVHQRTHAGKKAHGRGHTRKSKFMAH
        590       600       610       620       630         

>--
 initn: 516 init1: 516 opt: 529  Z-score: 362.1  bits: 76.4 E(32554): 7.5e-14
Smith-Waterman score: 529; 54.5% identity (76.9% similar) in 134 aa overlap (190-323:187-316)

     160       170       180       190       200       210         
pF1KB9 NVCKKTFSHKANLIKHQRIHTGEKPFECPECGKAFTHQSNLIVHQRAHMEKKPYECSECG
                                     :.: : :      .....   :::  .:::
CCDS35 PDKHESFGNNMVDNLDLFSRSSAENKYDNGCAKLFFHTE----YEKTNPGMKPYGYKECG
        160       170       180       190           200       210  

     220       230       240       250       260       270         
pF1KB9 KTFAQKFELTTHQRIHTGERPYECNECAKTFFKKSNLIIHQKIHTGEKRYECSECGKSFI
       : . .:  :. ::::..::.:.::. : ::: :::.::.: . ::::: . :.::::.: 
CCDS35 KGLRRKKGLSLHQRIKNGEKPFECTACRKTFSKKSHLIVHWRTHTGEKPFGCTECGKAFS
            220       230       240       250       260       270  

     280       290       300       310       320       330         
pF1KB9 QNSQLIIHMRTHTGEKPYECTECGKTFSQRSTLRLHLRIHTGEKPYECSECGKAFSRKSR
       :.::::::.::::::.:.:: ::::.: ..::. .: : :::::                
CCDS35 QKSQLIIHLRTHTGERPFECPECGKAFREKSTVIIHYRTHTGEKPYECNECGKAFTQKSN
            280       290       300       310       320       330  

     340       350                                                 
pF1KB9 LSVHQRVHIGEKP                                               
                                                                   
CCDS35 LIVHQKTHTGEKTYECTKCGESFIQKLDLIIHHSTHTGKKPHECNECKKTFSDKSTLIIH
            340       350       360       370       380       390  




352 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Fri Nov  4 00:14:55 2016 done: Fri Nov  4 00:14:55 2016
 Total Scan time:  2.510 Total Display time:  0.050

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com