Result of FASTA (ccds) for
pF1KB9590
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9590, 405 aa
1>>>pF1KB9590 405 - 405 aa - 405 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7479+/-0.000849; mu= 11.3026+/- 0.052
mean_var=99.7563+/-19.982, 0's: 0 Z-trim(109.3): 20 B-trim: 495 in 1/52
Lambda= 0.128412
statistics sampled from 10764 (10778) to 10764 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.682), E-opt: 0.2 (0.331), width: 16
Scan time: 3.060
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14636.2 TFDP3 gene_id:51270|Hs108|chrX ( 405) 2641 499.4 2.4e-141
CCDS9538.1 TFDP1 gene_id:7027|Hs108|chr13 ( 410) 1894 361.0 1.1e-99
CCDS54650.1 TFDP2 gene_id:7029|Hs108|chr3 ( 446) 1029 200.8 2.1e-51
CCDS43159.1 TFDP2 gene_id:7029|Hs108|chr3 ( 386) 1017 198.6 8.6e-51
CCDS54648.1 TFDP2 gene_id:7029|Hs108|chr3 ( 418) 1011 197.5 2e-50
CCDS54649.1 TFDP2 gene_id:7029|Hs108|chr3 ( 349) 1008 196.9 2.5e-50
CCDS54647.1 TFDP2 gene_id:7029|Hs108|chr3 ( 310) 952 186.5 3e-47
>>CCDS14636.2 TFDP3 gene_id:51270|Hs108|chrX (405 aa)
initn: 2641 init1: 2641 opt: 2641 Z-score: 2651.0 bits: 499.4 E(32554): 2.4e-141
Smith-Waterman score: 2641; 100.0% identity (100.0% similar) in 405 aa overlap (1-405:1-405)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MAKYVSLTEANEELKVLMDENQTSRPVAVHTSTVNPLGKQLLPKTFGQSSVNIDQQVVIG
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CCDS14 MAKYVSLTEANEELKVLMDENQTSRPVAVHTSTVNPLGKQLLPKTFGQSSVNIDQQVVIG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 MPQRPAASNIPVVGSPNPPSTHFASQNQHSYSSPPWAGQHNRKGEKNGMGLCRLSMKVWE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MPQRPAASNIPVVGSPNPPSTHFASQNQHSYSSPPWAGQHNRKGEKNGMGLCRLSMKVWE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 TVQRKGTTSCQEVVGELVAKFRAASNHASPNESAYDVKNIKRRTYDALNVLMAMNIISRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TVQRKGTTSCQEVVGELVAKFRAASNHASPNESAYDVKNIKRRTYDALNVLMAMNIISRE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 KKKIKWIGLTTNSAQNCQNLRVERQKRLERIKQKQSELQQLILQQIAFKNLVLRNQYVEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 KKKIKWIGLTTNSAQNCQNLRVERQKRLERIKQKQSELQQLILQQIAFKNLVLRNQYVEE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 QVSQRPLPNSVIHVPFIIISSSKKTVINCSISDDKSEYLFKFNSSFEIHDDTEVLMWMGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 QVSQRPLPNSVIHVPFIIISSSKKTVINCSISDDKSEYLFKFNSSFEIHDDTEVLMWMGM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 TFGLESGSCSAEDLKMARNLVPKALEPYVTEMAQGTFGGVFTTAGSRSNGTWLSASDLTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TFGLESGSCSAEDLKMARNLVPKALEPYVTEMAQGTFGGVFTTAGSRSNGTWLSASDLTN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400
pF1KB9 IAIGMLATSSGGSQYSGSRVETPAVEEEEEEDNNDDDLSENDEDD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 IAIGMLATSSGGSQYSGSRVETPAVEEEEEEDNNDDDLSENDEDD
370 380 390 400
>>CCDS9538.1 TFDP1 gene_id:7027|Hs108|chr13 (410 aa)
initn: 1702 init1: 1640 opt: 1894 Z-score: 1903.0 bits: 361.0 E(32554): 1.1e-99
Smith-Waterman score: 1894; 75.2% identity (87.3% similar) in 411 aa overlap (1-405:1-410)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MAKYVSLTEANEELKVLMDENQTSRP-----VAVHTSTVNPLGKQLLPKTFGQSSVNIDQ
::: ..: ::: ::::..:.: . :::: ::::::::::::::::::.::: :
CCDS95 MAKDAGLIEANGELKVFIDQNLSPGKGVVSLVAVHPSTVNPLGKQLLPKTFGQSNVNIAQ
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 QVVIGMPQRPAASNIPVVGSPNPPSTHFASQNQHSYSSPPWAGQHNRKGEKNGMGLCRLS
::::: :::::::: :::::. :::::::::: : ::: ::..:::::::: :: ..:
CCDS95 QVVIGTPQRPAASNTLVVGSPHTPSTHFASQNQPSDSSPWSAGKRNRKGEKNGKGLRHFS
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 MKVWETVQRKGTTSCQEVVGELVAKFRAASNHASPNESAYDVKNIKRRTYDALNVLMAMN
::: : :::::::: .::. ::::.: ::.:: ::::::: :::.::.:::::::::::
CCDS95 MKVCEKVQRKGTTSYNEVADELVAEFSAADNHILPNESAYDQKNIRRRVYDALNVLMAMN
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 IISREKKKIKWIGLTTNSAQNCQNLRVERQKRLERIKQKQSELQQLILQQIAFKNLVLRN
:::.:::.:::::: :::::.::::.::::.::::::::::.::.:::::::::::: ::
CCDS95 IISKEKKEIKWIGLPTNSAQECQNLEVERQRRLERIKQKQSQLQELILQQIAFKNLVQRN
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 QYVEEQVSQRPLPNSVIHVPFIIISSSKKTVINCSISDDKSEYLFKFNSSFEIHDDTEVL
...:.:.:. : ::::::.::::...::::::.::::.:: ::::.:...:::::: :::
CCDS95 RHAEQQASRPPPPNSVIHLPFIIVNTSKKTVIDCSISNDKFEYLFNFDNTFEIHDDIEVL
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 MWMGMTFGLESGSCSAEDLKMARNLVPKALEPYVTEMAQGTFGGVF-TTAGSRSNGTWLS
:::. ::::::::::::::::.::::::::::::::::: :::: ::::: :::: .:
CCDS95 KRMGMACGLESGSCSAEDLKMARSLVPKALEPYVTEMAQGTVGGVFITTAGSTSNGTRFS
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400
pF1KB9 ASDLTNIAIGMLATSSGGSQYSGSRVETPAVEEEEEEDNNDDDLSENDEDD
:::::: : :::::::.:::::::::::: : :.:..:::..::::::
CCDS95 ASDLTNGADGMLATSSNGSQYSGSRVETP-VSYVGEDDEEDDDFNENDEDD
370 380 390 400 410
>>CCDS54650.1 TFDP2 gene_id:7029|Hs108|chr3 (446 aa)
initn: 1071 init1: 856 opt: 1029 Z-score: 1036.3 bits: 200.8 E(32554): 2.1e-51
Smith-Waterman score: 1167; 48.3% identity (72.8% similar) in 445 aa overlap (2-399:3-444)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MAKYVSLTEANEELKVLMDENQTSRP-----VAVHTSTVNPLGKQLLPKTFGQSSVNID
:: :.:: .: :.. ..:.: . :: .:..: : .::::.: .::.
CCDS54 MTAKNVGLTSTNAEVRGFIDQNLSPTKGNISFVAFPVSNTNSPTK-ILPKTLGPINVNVG
10 20 30 40 50
60 70 80 90
pF1KB9 QQVVIGMPQRPAASNIPVVGSPNPPSTHFASQNQHSYSSPPWA-----------------
:..:. ::: ..:. ..::: :. ...:. : . :.
CCDS54 PQMIISTPQRLTSSGSVLIGSPYTPAPAMVTQT-HIAEATGWVPGDRKRARKFIDSDFSE
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 GQHNRKGEKNGMGLCRLSMKVWETVQRKGTTSCQEVVGELVAKFRAASNHASPNESAYDV
.....::.::: :: ..:::: : :::::::: .::. :::..: ..:: . . ::::
CCDS54 SKRSKKGDKNGKGLRHFSMKVCEKVQRKGTTSYNEVADELVSEFTNSNNHLAAD-SAYDQ
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 KNIKRRTYDALNVLMAMNIISREKKKIKWIGLTTNSAQNCQNLRVERQKRLERIKQKQSE
:::.::.::::::::::::::.:::.:::::: :::::.::::..:.:.:.::::::...
CCDS54 KNIRRRVYDALNVLMAMNIISKEKKEIKWIGLPTNSAQECQNLEIEKQRRIERIKQKRAQ
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 LQQLILQQIAFKNLVLRNQYVEEQVSQRPLPNSVIHVPFIIISSSKKTVINCSISDDKSE
::.:.:::::::::: ::. :.: . : ::.:..:::::..:.::::.::::.:: :
CCDS54 LQELLLQQIAFKNLVQRNRQNEQQNQGPPALNSTIQLPFIIINTSRKTVIDCSISSDKFE
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 YLFKFNSSFEIHDDTEVLMWMGMTFGLESGSCSAEDLKMARNLVPKALEPYVTEMAQGTF
:::.:...:::::: ::: :::.::::::.:: ::::.:..::::::: :.:... :
CCDS54 YLFNFDNTFEIHDDIEVLKRMGMSFGLESGKCSLEDLKLAKSLVPKALEGYITDISTGPS
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370
pF1KB9 ----GGVFTTAGSRSN-----GTWLSASDLTN---------IAIGM-LA-----TSSGGS
: ..... : :: :. : :.... .: :. :: .::..:
CCDS54 WLNQGLLLNSTQSVSNLDLTTGATLPQSSVNQGLCLDAEVALATGQFLAPNSHQSSSAAS
360 370 380 390 400 410
380 390 400
pF1KB9 QYSGSRVETP-AVEEEEEEDNNDDDLSENDEDD
. : :: ::: . ..:.:::...:. :
CCDS54 HCSESRGETPCSFNDEDEEDDEEDSSSPE
420 430 440
>>CCDS43159.1 TFDP2 gene_id:7029|Hs108|chr3 (386 aa)
initn: 1126 init1: 1008 opt: 1017 Z-score: 1025.3 bits: 198.6 E(32554): 8.6e-51
Smith-Waterman score: 1080; 49.4% identity (74.3% similar) in 385 aa overlap (57-399:1-384)
30 40 50 60 70 80
pF1KB9 VAVHTSTVNPLGKQLLPKTFGQSSVNIDQQVVIGMPQRPAASNIPVVGSPNPPSTHFASQ
..:. ::: ..:. ..::: :. ...:
CCDS43 MIISTPQRLTSSGSVLIGSPYTPAPAMVTQ
10 20 30
90 100 110 120
pF1KB9 NQHSYSSPPWA-----------------GQHNRKGEKNGMGLCRLSMKVWETVQRKGTTS
. : . :. .....::.::: :: ..:::: : ::::::::
CCDS43 T-HIAEATGWVPGDRKRARKFIDSDFSESKRSKKGDKNGKGLRHFSMKVCEKVQRKGTTS
40 50 60 70 80
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 CQEVVGELVAKFRAASNHASPNESAYDVKNIKRRTYDALNVLMAMNIISREKKKIKWIGL
.::. :::..: ..:: . . .::: :::.::.::::::::::::::.:::.::::::
CCDS43 YNEVADELVSEFTNSNNHLAADSQAYDQKNIRRRVYDALNVLMAMNIISKEKKEIKWIGL
90 100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 TTNSAQNCQNLRVERQKRLERIKQKQSELQQLILQQIAFKNLVLRNQYVEEQVSQRPLPN
:::::.::::..:.:.:.::::::...::.:.:::::::::: ::. :.: . : :
CCDS43 PTNSAQECQNLEIEKQRRIERIKQKRAQLQELLLQQIAFKNLVQRNRQNEQQNQGPPALN
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 SVIHVPFIIISSSKKTVINCSISDDKSEYLFKFNSSFEIHDDTEVLMWMGMTFGLESGSC
:.:..:::::..:.::::.::::.:: ::::.:...:::::: ::: :::.::::::.:
CCDS43 STIQLPFIIINTSRKTVIDCSISSDKFEYLFNFDNTFEIHDDIEVLKRMGMSFGLESGKC
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 SAEDLKMARNLVPKALEPYVTEMAQGTF----GGVFTTAGSRSN-----GTWLSASDLTN
: ::::.:..::::::: :.:... : : ..... : :: :. : :....
CCDS43 SLEDLKLAKSLVPKALEGYITDISTGPSWLNQGLLLNSTQSVSNLDLTTGATLPQSSVNQ
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400
pF1KB9 ---------IAIGML------ATSSGGSQYSGSRVETP-AVEEEEEEDNNDDDLSENDED
.: :.. .::..:. : :: ::: . ..:.:::...:. :
CCDS43 GLCLDAEVALATGQFLAPNSHQSSSAASHCSESRGETPCSFNDEDEEDDEEDSSSPE
330 340 350 360 370 380
pF1KB9 D
>>CCDS54648.1 TFDP2 gene_id:7029|Hs108|chr3 (418 aa)
initn: 1071 init1: 856 opt: 1011 Z-score: 1018.8 bits: 197.5 E(32554): 2e-50
Smith-Waterman score: 1074; 49.5% identity (74.4% similar) in 386 aa overlap (56-399:33-416)
30 40 50 60 70 80
pF1KB9 PVAVHTSTVNPLGKQLLPKTFGQSSVNIDQQVVIGMPQRPAASNIPVVGSPNPPSTHFAS
...:. ::: ..:. ..::: :. ...
CCDS54 PEGIIFEAENKPSPGTESAGTFILDLSATSRTIISTPQRLTSSGSVLIGSPYTPAPAMVT
10 20 30 40 50 60
90 100 110 120
pF1KB9 QNQHSYSSPPWA-----------------GQHNRKGEKNGMGLCRLSMKVWETVQRKGTT
:. : . :. .....::.::: :: ..:::: : :::::::
CCDS54 QT-HIAEATGWVPGDRKRARKFIDSDFSESKRSKKGDKNGKGLRHFSMKVCEKVQRKGTT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 SCQEVVGELVAKFRAASNHASPNESAYDVKNIKRRTYDALNVLMAMNIISREKKKIKWIG
: .::. :::..: ..:: . . :::: :::.::.::::::::::::::.:::.:::::
CCDS54 SYNEVADELVSEFTNSNNHLAAD-SAYDQKNIRRRVYDALNVLMAMNIISKEKKEIKWIG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 LTTNSAQNCQNLRVERQKRLERIKQKQSELQQLILQQIAFKNLVLRNQYVEEQVSQRPLP
: :::::.::::..:.:.:.::::::...::.:.:::::::::: ::. :.: . :
CCDS54 LPTNSAQECQNLEIEKQRRIERIKQKRAQLQELLLQQIAFKNLVQRNRQNEQQNQGPPAL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 NSVIHVPFIIISSSKKTVINCSISDDKSEYLFKFNSSFEIHDDTEVLMWMGMTFGLESGS
::.:..:::::..:.::::.::::.:: ::::.:...:::::: ::: :::.::::::.
CCDS54 NSTIQLPFIIINTSRKTVIDCSISSDKFEYLFNFDNTFEIHDDIEVLKRMGMSFGLESGK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KB9 CSAEDLKMARNLVPKALEPYVTEMAQGTF----GGVFTTAGSRSN-----GTWLSASDLT
:: ::::.:..::::::: :.:... : : ..... : :: :. : :...
CCDS54 CSLEDLKLAKSLVPKALEGYITDISTGPSWLNQGLLLNSTQSVSNLDLTTGATLPQSSVN
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400
pF1KB9 N---------IAIGML------ATSSGGSQYSGSRVETP-AVEEEEEEDNNDDDLSENDE
. .: :.. .::..:. : :: ::: . ..:.:::...:. :
CCDS54 QGLCLDAEVALATGQFLAPNSHQSSSAASHCSESRGETPCSFNDEDEEDDEEDSSSPE
370 380 390 400 410
pF1KB9 DD
>>CCDS54649.1 TFDP2 gene_id:7029|Hs108|chr3 (349 aa)
initn: 1071 init1: 856 opt: 1008 Z-score: 1017.0 bits: 196.9 E(32554): 2.5e-50
Smith-Waterman score: 1042; 55.5% identity (79.4% similar) in 326 aa overlap (99-399:23-347)
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 NIPVVGSPNPPSTHFASQNQHSYSSPPWAGQHNRKGEKNGMGLCRLSMKVWETVQRKGTT
....::.::: :: ..:::: : :::::::
CCDS54 MLDPKCDRKRARKFIDSDFSESKRSKKGDKNGKGLRHFSMKVCEKVQRKGTT
10 20 30 40 50
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 SCQEVVGELVAKFRAASNHASPNESAYDVKNIKRRTYDALNVLMAMNIISREKKKIKWIG
: .::. :::..: ..:: . . :::: :::.::.::::::::::::::.:::.:::::
CCDS54 SYNEVADELVSEFTNSNNHLAAD-SAYDQKNIRRRVYDALNVLMAMNIISKEKKEIKWIG
60 70 80 90 100 110
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 LTTNSAQNCQNLRVERQKRLERIKQKQSELQQLILQQIAFKNLVLRNQYVEEQVSQRPLP
: :::::.::::..:.:.:.::::::...::.:.:::::::::: ::. :.: . :
CCDS54 LPTNSAQECQNLEIEKQRRIERIKQKRAQLQELLLQQIAFKNLVQRNRQNEQQNQGPPAL
120 130 140 150 160 170
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 NSVIHVPFIIISSSKKTVINCSISDDKSEYLFKFNSSFEIHDDTEVLMWMGMTFGLESGS
::.:..:::::..:.::::.::::.:: ::::.:...:::::: ::: :::.::::::.
CCDS54 NSTIQLPFIIINTSRKTVIDCSISSDKFEYLFNFDNTFEIHDDIEVLKRMGMSFGLESGK
180 190 200 210 220 230
310 320 330 340 350
pF1KB9 CSAEDLKMARNLVPKALEPYVTEMAQGTF----GGVFTTAGSRSN-----GTWLSASDLT
:: ::::.:..::::::: :.:... : : ..... : :: :. : :...
CCDS54 CSLEDLKLAKSLVPKALEGYITDISTGPSWLNQGLLLNSTQSVSNLDLTTGATLPQSSVN
240 250 260 270 280 290
360 370 380 390 400
pF1KB9 N---------IAIGM-LA-----TSSGGSQYSGSRVETP-AVEEEEEEDNNDDDLSENDE
. .: :. :: .::..:. : :: ::: . ..:.:::...:. :
CCDS54 QGLCLDAEVALATGQFLAPNSHQSSSAASHCSESRGETPCSFNDEDEEDDEEDSSSPE
300 310 320 330 340
pF1KB9 DD
>>CCDS54647.1 TFDP2 gene_id:7029|Hs108|chr3 (310 aa)
initn: 1015 init1: 856 opt: 952 Z-score: 961.7 bits: 186.5 E(32554): 3e-47
Smith-Waterman score: 986; 56.0% identity (79.0% similar) in 309 aa overlap (116-399:1-308)
90 100 110 120 130 140
pF1KB9 QNQHSYSSPPWAGQHNRKGEKNGMGLCRLSMKVWETVQRKGTTSCQEVVGELVAKFRAAS
::: : :::::::: .::. :::..: ..
CCDS54 MKVCEKVQRKGTTSYNEVADELVSEFTNSN
10 20 30
150 160 170 180 190 200
pF1KB9 NHASPNESAYDVKNIKRRTYDALNVLMAMNIISREKKKIKWIGLTTNSAQNCQNLRVERQ
:: . . :::: :::.::.::::::::::::::.:::.:::::: :::::.::::..:.:
CCDS54 NHLAAD-SAYDQKNIRRRVYDALNVLMAMNIISKEKKEIKWIGLPTNSAQECQNLEIEKQ
40 50 60 70 80
210 220 230 240 250 260
pF1KB9 KRLERIKQKQSELQQLILQQIAFKNLVLRNQYVEEQVSQRPLPNSVIHVPFIIISSSKKT
.:.::::::...::.:.:::::::::: ::. :.: . : ::.:..:::::..:.::
CCDS54 RRIERIKQKRAQLQELLLQQIAFKNLVQRNRQNEQQNQGPPALNSTIQLPFIIINTSRKT
90 100 110 120 130 140
270 280 290 300 310 320
pF1KB9 VINCSISDDKSEYLFKFNSSFEIHDDTEVLMWMGMTFGLESGSCSAEDLKMARNLVPKAL
::.::::.:: ::::.:...:::::: ::: :::.::::::.:: ::::.:..::::::
CCDS54 VIDCSISSDKFEYLFNFDNTFEIHDDIEVLKRMGMSFGLESGKCSLEDLKLAKSLVPKAL
150 160 170 180 190 200
330 340 350 360
pF1KB9 EPYVTEMAQGTF----GGVFTTAGSRSN-----GTWLSASDLTN---------IAIGM-L
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