FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB9608, 284 aa 1>>>pF1KB9608 284 - 284 aa - 284 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6786+/-0.000985; mu= 10.5385+/- 0.058 mean_var=202.8747+/-41.232, 0's: 0 Z-trim(111.9): 929 B-trim: 0 in 0/52 Lambda= 0.090045 statistics sampled from 11733 (12750) to 11733 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.739), E-opt: 0.2 (0.392), width: 16 Scan time: 2.590 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS476.1 ZNF691 gene_id:51058|Hs108|chr1 ( 284) 2058 279.6 1.8e-75 CCDS55595.1 ZNF691 gene_id:51058|Hs108|chr1 ( 315) 2058 279.6 1.9e-75 CCDS10329.2 ZSCAN2 gene_id:54993|Hs108|chr15 ( 614) 898 129.3 6.7e-30 CCDS31418.1 ZNF214 gene_id:7761|Hs108|chr11 ( 606) 882 127.2 2.8e-29 CCDS75904.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 364) 876 126.2 3.5e-29 CCDS69664.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 474) 876 126.3 4.2e-29 CCDS6871.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 498) 876 126.3 4.3e-29 CCDS62707.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 665) 872 126.0 7.3e-29 CCDS62708.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 667) 872 126.0 7.3e-29 CCDS12639.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 692) 872 126.0 7.5e-29 CCDS56092.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 580) 870 125.6 8.1e-29 CCDS42462.1 ZNF554 gene_id:115196|Hs108|chr19 ( 538) 869 125.5 8.4e-29 CCDS42558.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 644) 870 125.7 8.6e-29 CCDS6354.1 ZNF572 gene_id:137209|Hs108|chr8 ( 529) 866 125.1 1.1e-28 CCDS43429.1 ZNF391 gene_id:346157|Hs108|chr6 ( 358) 859 123.9 1.6e-28 CCDS35075.1 ZNF782 gene_id:158431|Hs108|chr9 ( 699) 861 124.6 2e-28 CCDS12959.2 ZNF551 gene_id:90233|Hs108|chr19 ( 670) 860 124.4 2.2e-28 CCDS10494.2 ZNF205 gene_id:7755|Hs108|chr16 ( 554) 858 124.1 2.3e-28 CCDS14279.1 ZNF41 gene_id:7592|Hs108|chrX ( 779) 857 124.1 3.1e-28 CCDS82413.1 ZNF544 gene_id:27300|Hs108|chr19 ( 687) 854 123.7 3.8e-28 CCDS12973.1 ZNF544 gene_id:27300|Hs108|chr19 ( 715) 854 123.7 3.9e-28 CCDS33093.2 ZNF28 gene_id:7576|Hs108|chr19 ( 718) 854 123.7 3.9e-28 CCDS82388.1 ZNF841 gene_id:284371|Hs108|chr19 ( 808) 854 123.8 4.2e-28 CCDS46161.1 ZNF841 gene_id:284371|Hs108|chr19 ( 924) 854 123.8 4.5e-28 CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5 ( 461) 849 122.8 4.7e-28 CCDS233.1 ZNF436 gene_id:80818|Hs108|chr1 ( 470) 847 122.5 5.6e-28 CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 848 122.8 6.1e-28 CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3 ( 754) 849 123.1 6.3e-28 CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 848 122.9 6.3e-28 CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 848 122.9 6.4e-28 CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 848 122.9 6.4e-28 CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 ( 682) 846 122.6 7.7e-28 CCDS45463.1 ZNF629 gene_id:23361|Hs108|chr16 ( 869) 847 122.9 8.2e-28 CCDS54939.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 568) 842 122.0 9.9e-28 CCDS46162.1 ZNF836 gene_id:162962|Hs108|chr19 ( 936) 845 122.7 1e-27 CCDS4311.2 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 604) 842 122.0 1e-27 CCDS59372.1 ZNF726 gene_id:730087|Hs108|chr19 ( 616) 842 122.0 1e-27 CCDS54940.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 620) 842 122.0 1e-27 CCDS43619.1 ZNF3 gene_id:7551|Hs108|chr7 ( 446) 839 121.5 1.1e-27 CCDS11179.2 ZNF287 gene_id:57336|Hs108|chr17 ( 761) 841 122.0 1.3e-27 CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3 ( 544) 838 121.5 1.4e-27 CCDS32330.1 ZNF774 gene_id:342132|Hs108|chr15 ( 483) 837 121.3 1.4e-27 CCDS7205.2 ZNF485 gene_id:220992|Hs108|chr10 ( 441) 836 121.1 1.5e-27 CCDS46172.1 ZNF813 gene_id:126017|Hs108|chr19 ( 617) 835 121.1 2e-27 CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 ( 738) 836 121.4 2e-27 CCDS77773.1 ZNF717 gene_id:100131827|Hs108|chr3 ( 864) 837 121.6 2e-27 CCDS74388.1 ZNF227 gene_id:7770|Hs108|chr19 ( 748) 836 121.4 2e-27 CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19 ( 678) 835 121.2 2.1e-27 CCDS58688.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 503) 833 120.8 2.1e-27 CCDS12636.1 ZNF227 gene_id:7770|Hs108|chr19 ( 799) 836 121.4 2.1e-27 >>CCDS476.1 ZNF691 gene_id:51058|Hs108|chr1 (284 aa) initn: 2058 init1: 2058 opt: 2058 Z-score: 1468.3 bits: 279.6 E(32554): 1.8e-75 Smith-Waterman score: 2058; 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CCDS10 KCGVCGKSFSQSSSLIAHQGMHTGEKPYECLTCGESFSWSSNLLKHQRIHTGEKPYKCSE 450 460 470 480 490 500 260 270 280 pF1KB9 CGKHFSRSSNLIRHQKTHLGEQAGKDSS ::: ::. :.:. ::.:: ::. : CCDS10 CGKCFSQRSQLVVHQRTHTGEKPYKCLMCGKSFSRGSILVMHQRAHLGDKPYRCPECGKG 510 520 530 540 550 560 >>CCDS31418.1 ZNF214 gene_id:7761|Hs108|chr11 (606 aa) initn: 3811 init1: 870 opt: 882 Z-score: 639.1 bits: 127.2 E(32554): 2.8e-29 Smith-Waterman score: 882; 50.2% identity (72.4% similar) in 243 aa overlap (38-278:310-552) 10 20 30 40 50 60 pF1KB9 SPEPHLPEEGEGGKPWRVDDSEGSWIPPGEKEHGQESLSDELQETHPKKPWQKVTVRARE : .: : . :..: .. . :. CCDS31 VDGNFHQSSGVHFHQRVHIGEVPYSCNACGKSFSQISSLHNHQRVHTEEKFYKIECDKDL 280 290 300 310 320 330 70 80 90 100 110 120 pF1KB9 LGDPI--AHPRHEADEKPFICAQCGKTFNNTSNLRTHQRIHTGEKPYKCSECGKSFSRSS . . : : . :::: : ::::.:: .: :..:::.:::::::::.::::.::.:: CCDS31 SRNSLLHIHQRLHIGEKPFKCNQCGKSFNRSSVLHVHQRVHTGEKPYKCDECGKGFSQSS 340 350 360 370 380 390 130 140 150 160 170 180 pF1KB9 NRIRHERIHLEEKHYKCPKCQESFRRRSDLTTHQQDHLGKRPYRCDICGKSFSQSATLAV : :. .: :: ::: : ..: .::.: ::. : :..::.:: :::.::.:. : . CCDS31 NLRIHQLVHTGEKSYKCEDCGKGFTQRSNLQIHQRVHTGEKPYKCDDCGKDFSHSSDLRI 400 410 420 430 440 450 190 200 210 220 230 240 pF1KB9 HHRTHLEPAPYICCECGKSFSNSSSFGVHHRTHTGERPYECTECGRTFSDISNFGAHQRT :.:.: :: : ::::.::.::.. .:.:.::::.::.: :::. ::. :.. :::. CCDS31 HQRVHTGEKPYTCPECGKGFSKSSKLHTHQRVHTGEKPYKCEECGKGFSQRSHLLIHQRV 460 470 480 490 500 510 250 260 270 280 pF1KB9 HRGEKPYRCTVCGKHFSRSSNLIRHQKTHLGEQAGKDSS : :::::.: ::: ::.:::: ::..: ::. CCDS31 HTGEKPYKCHDCGKGFSHSSNLHIHQRVHTGEKPYQCAKCGKGFSHSSALRIHQRVHAGE 520 530 540 550 560 570 CCDS31 KPYKCREYYKGFDHNSHLHNNHRRGNL 580 590 600 >>CCDS75904.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 (364 aa) initn: 2509 init1: 859 opt: 876 Z-score: 637.3 bits: 126.2 E(32554): 3.5e-29 Smith-Waterman score: 892; 47.9% identity (71.3% similar) in 261 aa overlap (33-283:1-258) 10 20 30 40 50 60 pF1KB9 SEKEQSPEPHLPEEGEGGKPWRVDDSEGSWIPPGEKEHGQESLSDELQETHPKKPWQKVT .:::...:: .: .. .: :.: CCDS75 MPPGDSDHGTSDLEKSFNLRPVLSPQQRVP 10 20 30 70 80 90 100 110 pF1KB9 VRAREL----------GDPIAHPRHEADEKPFICAQCGKTFNNTSNLRTHQRIHTGEKPY :.:: .. : .: :.: ::. : .:::.:. :.: ::. ::::::: CCDS75 VEARPRKCETHTESFKNSEILKP-HRA--KPYACNECGKAFSYCSSLSQHQKSHTGEKPY 40 50 60 70 80 120 130 140 150 160 170 pF1KB9 KCSECGKSFSRSSNRIRHERIHLEEKHYKCPKCQESFRRRSDLTTHQQDHLGKRPYRCDI .::::::.::.::. :.:.::: :: ::: .: ..: . ..:: ::. : :..::::. CCDS75 ECSECGKAFSQSSSLIQHQRIHTGEKPYKCSECGRAFSQNANLTKHQRTHTGEKPYRCSE 90 100 110 120 130 140 180 190 200 210 220 230 pF1KB9 CGKSFSQSATLAVHHRTHLEPAPYICCECGKSFSNSSSFGVHHRTHTGERPYECTECGRT : :.::. ..:. :.: : :: : .:::.: .:... :.::::::.::.:.:::.. 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CCDS62 CGKAFINSYKLIRHQATHTEEKLYECN 650 660 >>CCDS12639.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 (692 aa) initn: 6281 init1: 864 opt: 872 Z-score: 631.5 bits: 126.0 E(32554): 7.5e-29 Smith-Waterman score: 872; 44.9% identity (71.7% similar) in 272 aa overlap (15-278:305-575) 10 20 30 40 pF1KB9 MGSEKEQSPEPHLPEEGEGGKPWRVDDSEGSWIPPGEKEHG--- : :. .: ... .: . :: :... CCDS12 FSDRIQSFCHGTPLHIHEKIHGGGKTFDFKECGQVLNP-KISHNEQQRIPFEESQYKCSE 280 290 300 310 320 330 50 60 70 80 90 pF1KB9 ---QESLSDELQETHPKKPWQ--KVTVRARELGDPIAHPRHEADEKPFICAQCGKTFNNT . ::....... .::.. . . .:: : .. :::. :..:::.:. . 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CCDS12 EKPYECNQCGKSFSQSYVLVVHQRTHTGEKPYECSQCGKSFRQSSCLTQHQRTHTGEKPF 580 590 600 610 620 630 >-- initn: 480 init1: 480 opt: 480 Z-score: 356.2 bits: 75.1 E(32554): 1.6e-13 Smith-Waterman score: 480; 58.0% identity (75.9% similar) in 112 aa overlap (167-278:576-687) 140 150 160 170 180 190 pF1KB9 EKHYKCPKCQESFRRRSDLTTHQQDHLGKRPYRCDICGKSFSQSATLAVHHRTHLEPAPY ::.:. :::::::: .:.::.::: :: CCDS12 EKPYECSECGKSFNRSSHLVMHQRIHTGEKPYECNQCGKSFSQSYVLVVHQRTHTGEKPY 550 560 570 580 590 600 200 210 220 230 240 250 pF1KB9 ICCECGKSFSNSSSFGVHHRTHTGERPYECTECGRTFSDISNFGAHQRTHRGEKPYRCTV : .::::: .:: . :.::::::.:.::..::.::: . . .::::: ::::. : CCDS12 ECSQCGKSFRQSSCLTQHQRTHTGEKPFECNQCGKTFSLSARLIVHQRTHTGEKPFTCIQ 610 620 630 640 650 660 260 270 280 pF1KB9 CGKHFSRSSNLIRHQKTHLGEQAGKDSS ::: : : .::::: :: :. 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