Result of FASTA (ccds) for pF1KB9611
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB9611, 589 aa
  1>>>pF1KB9611 589 - 589 aa - 589 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6392+/-0.00105; mu= 17.0927+/- 0.063
 mean_var=78.7221+/-15.573, 0's: 0 Z-trim(103.7): 168  B-trim: 0 in 0/50
 Lambda= 0.144553
 statistics sampled from 7342 (7520) to 7342 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.6), E-opt: 0.2 (0.231), width:  16
 Scan time:  3.180

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS10339.1 KLHL25 gene_id:64410|Hs108|chr15       ( 589) 3989 842.2       0
CCDS4021.1 ENC1 gene_id:8507|Hs108|chr5            ( 589) 3090 654.7 9.4e-188
CCDS58958.1 ENC1 gene_id:8507|Hs108|chr5           ( 516) 2742 582.1 5.9e-166
CCDS1310.1 KLHL20 gene_id:27252|Hs108|chr1         ( 609)  985 215.7 1.4e-55
CCDS43766.1 KLHL38 gene_id:340359|Hs108|chr8       ( 581)  965 211.5 2.3e-54
CCDS58970.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5         ( 555)  928 203.8 4.8e-52
CCDS4192.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5          ( 587)  928 203.8   5e-52
CCDS1429.1 KLHL12 gene_id:59349|Hs108|chr1         ( 568)  910 200.1 6.5e-51
CCDS34094.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4         ( 593)  897 197.4 4.4e-50
CCDS54815.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4         ( 597)  897 197.4 4.5e-50
CCDS30550.1 KLHL17 gene_id:339451|Hs108|chr1       ( 642)  881 194.0 4.8e-49
CCDS54335.1 KLHL29 gene_id:114818|Hs108|chr2       ( 875)  858 189.3 1.7e-47
CCDS9680.1 KLHL28 gene_id:54813|Hs108|chr14        ( 571)  838 185.0 2.2e-46
CCDS76675.1 KLHL28 gene_id:54813|Hs108|chr14       ( 585)  838 185.0 2.2e-46
CCDS33749.1 KLHL18 gene_id:23276|Hs108|chr3        ( 574)  826 182.5 1.2e-45
CCDS58969.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5         ( 505)  822 181.7   2e-45
CCDS3245.2 KLHL6 gene_id:89857|Hs108|chr3          ( 621)  808 178.8 1.8e-44
CCDS54756.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4         ( 568)  794 175.9 1.3e-43
CCDS33975.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4         ( 709)  794 175.9 1.5e-43
CCDS33974.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4         ( 755)  794 175.9 1.6e-43
CCDS54816.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4         ( 505)  781 173.1 7.5e-43
CCDS44132.1 IPP gene_id:3652|Hs108|chr1            ( 582)  733 163.1 8.6e-40
CCDS30702.1 IPP gene_id:3652|Hs108|chr1            ( 584)  733 163.1 8.7e-40
CCDS14457.1 KLHL4 gene_id:56062|Hs108|chrX         ( 718)  732 163.0 1.2e-39
CCDS14456.1 KLHL4 gene_id:56062|Hs108|chrX         ( 720)  731 162.8 1.4e-39
CCDS3617.1 KLHL8 gene_id:57563|Hs108|chr4          ( 620)  728 162.1 1.9e-39
CCDS46555.2 KLHL30 gene_id:377007|Hs108|chr2       ( 578)  717 159.8 8.7e-39
CCDS82974.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4         ( 496)  716 159.6 8.8e-39
CCDS3449.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4          ( 694)  711 158.6 2.4e-38
CCDS3246.1 KLHL24 gene_id:54800|Hs108|chr3         ( 600)  702 156.7 7.8e-38
CCDS9445.1 KLHL1 gene_id:57626|Hs108|chr13         ( 748)  666 149.2 1.7e-35
CCDS30575.1 KLHL21 gene_id:9903|Hs108|chr1         ( 597)  657 147.3 5.2e-35
CCDS12384.1 KLHL26 gene_id:55295|Hs108|chr19       ( 615)  609 137.3 5.5e-32
CCDS73582.1 KLHL1 gene_id:57626|Hs108|chr13        ( 687)  607 136.9   8e-32
CCDS82975.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4         ( 427)  589 133.0 7.4e-31
CCDS34609.1 KLHL7 gene_id:55975|Hs108|chr7         ( 586)  589 133.1 9.5e-31
CCDS8334.1 KBTBD3 gene_id:143879|Hs108|chr11       ( 612)  584 132.1   2e-30
CCDS2906.2 KBTBD8 gene_id:84541|Hs108|chr3         ( 601)  565 128.1 3.1e-29
CCDS12239.1 KEAP1 gene_id:9817|Hs108|chr19         ( 624)  563 127.7 4.3e-29
CCDS34614.1 KBTBD2 gene_id:25948|Hs108|chr7        ( 623)  562 127.5   5e-29
CCDS77937.1 KLHL8 gene_id:57563|Hs108|chr4         ( 544)  559 126.8 6.8e-29
CCDS10948.1 KLHL36 gene_id:79786|Hs108|chr16       ( 616)  556 126.2 1.2e-28
CCDS5378.2 KLHL7 gene_id:55975|Hs108|chr7          ( 538)  552 125.4 1.9e-28
CCDS13780.1 KLHL22 gene_id:84861|Hs108|chr22       ( 634)  524 119.6 1.2e-26
CCDS14199.1 KLHL34 gene_id:257240|Hs108|chrX       ( 644)  518 118.3 2.9e-26
CCDS5038.1 KLHL32 gene_id:114792|Hs108|chr6        ( 620)  491 112.7 1.4e-24
CCDS2236.1 KLHL23 gene_id:151230|Hs108|chr2        ( 558)  478 110.0 8.5e-24
CCDS81621.1 KBTBD3 gene_id:143879|Hs108|chr11      ( 533)  466 107.4 4.6e-23
CCDS10935.1 GAN gene_id:8139|Hs108|chr16           ( 597)  465 107.3 5.9e-23
CCDS76909.1 KLHL36 gene_id:79786|Hs108|chr16       ( 553)  457 105.6 1.8e-22


>>CCDS10339.1 KLHL25 gene_id:64410|Hs108|chr15            (589 aa)
 initn: 3989 init1: 3989 opt: 3989  Z-score: 4497.5  bits: 842.2 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 3989; 100.0% identity (100.0% similar) in 589 aa overlap (1-589:1-589)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MSVSVHETRKSRSSTGSMNVTLFHKASHPDCVLAHLNTLRKHCMFTDVTLWAGDRAFPCH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MSVSVHETRKSRSSTGSMNVTLFHKASHPDCVLAHLNTLRKHCMFTDVTLWAGDRAFPCH
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 RAVLAASSRYFEAMFSHGLRESRDDTVNFQDNLHPEVLELLLDFAYSSRIAINEENAESL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RAVLAASSRYFEAMFSHGLRESRDDTVNFQDNLHPEVLELLLDFAYSSRIAINEENAESL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 LEAGDMLQFHDVRDAAAEFLEKNLFPSNCLGMMLLSDAHQCRRLYEFSWRMCLVHFETVR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LEAGDMLQFHDVRDAAAEFLEKNLFPSNCLGMMLLSDAHQCRRLYEFSWRMCLVHFETVR
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 QSEDFNSLSKDTLLDLISSDELETEDERVVFEAILQWVKHDLEPRKVHLPELLRSVRLAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QSEDFNSLSKDTLLDLISSDELETEDERVVFEAILQWVKHDLEPRKVHLPELLRSVRLAL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 LPSDCLQEAVSSEALLMADERTKLIMDEALRCKTRILQNDGVVTSPCARPRKAGHTLLIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LPSDCLQEAVSSEALLMADERTKLIMDEALRCKTRILQNDGVVTSPCARPRKAGHTLLIL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB9 GGQTFMCDKIYQVDHKAKEIIPKADLPSPRKEFSASAIGCKVYVTGGRGSENGVSKDVWV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GGQTFMCDKIYQVDHKAKEIIPKADLPSPRKEFSASAIGCKVYVTGGRGSENGVSKDVWV
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB9 YDTVHEEWSKAAPMLIARFGHGSAELENCLYVVGGHTSLAGVFPASPSVSLKQVEKYDPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 YDTVHEEWSKAAPMLIARFGHGSAELENCLYVVGGHTSLAGVFPASPSVSLKQVEKYDPG
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB9 ANKWMMVAPLRDGVSNAAVVSAKLKLFVFGGTSIHRDMVSKVQCYDPSENRWTIKAECPQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ANKWMMVAPLRDGVSNAAVVSAKLKLFVFGGTSIHRDMVSKVQCYDPSENRWTIKAECPQ
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB9 PWRYTAAAVLGSQIFIMGGDTEFTAASAYRFDCETNQWTRIGDMTAKRMSCHALASGNKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PWRYTAAAVLGSQIFIMGGDTEFTAASAYRFDCETNQWTRIGDMTAKRMSCHALASGNKL
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580         
pF1KB9 YVVGGYFGTQRCKTLDCYDPTSDTWNCITTVPYSLIPTAFVSTWKHLPA
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 YVVGGYFGTQRCKTLDCYDPTSDTWNCITTVPYSLIPTAFVSTWKHLPA
              550       560       570       580         

>>CCDS4021.1 ENC1 gene_id:8507|Hs108|chr5                 (589 aa)
 initn: 3249 init1: 3090 opt: 3090  Z-score: 3484.3  bits: 654.7 E(32554): 9.4e-188
Smith-Waterman score: 3090; 74.7% identity (91.2% similar) in 589 aa overlap (1-589:1-589)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MSVSVHETRKSRSSTGSMNVTLFHKASHPDCVLAHLNTLRKHCMFTDVTLWAGDRAFPCH
       :::::::.::::.:.::.:. ::::.:. : ::.::: ::.. .:::: : ::.:.::::
CCDS40 MSVSVHENRKSRASSGSINIYLFHKSSYADSVLTHLNLLRQQRLFTDVLLHAGNRTFPCH
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 RAVLAASSRYFEAMFSHGLRESRDDTVNFQDNLHPEVLELLLDFAYSSRIAINEENAESL
       :::::: ::::::::: ::.::.:. :::....::::::::::.:::::. :::::::::
CCDS40 RAVLAACSRYFEAMFSGGLKESQDSEVNFDNSIHPEVLELLLDYAYSSRVIINEENAESL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 LEAGDMLQFHDVRDAAAEFLEKNLFPSNCLGMMLLSDAHQCRRLYEFSWRMCLVHFETVR
       :::::::.:.:.::: :::::::: :.:::::.:::::::: .:::.:::::: .:.:.:
CCDS40 LEAGDMLEFQDIRDACAEFLEKNLHPTNCLGMLLLSDAHQCTKLYELSWRMCLSNFQTIR
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 QSEDFNSLSKDTLLDLISSDELETEDERVVFEAILQWVKHDLEPRKVHLPELLRSVRLAL
       ..::: .: .: ...:.::.::::::::.:.:. ..:...::. :  .:::::..:::::
CCDS40 KNEDFLQLPQDMVVQLLSSEELETEDERLVYESAINWISYDLKKRYCYLPELLQTVRLAL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 LPSDCLQEAVSSEALLMADERTKLIMDEALRCKTRILQNDGVVTSPCARPRKAGHTLLIL
       ::.  :.: :. : :.  ....: :..::.::: .:::::::::: ::::::.::.:..:
CCDS40 LPAIYLMENVAMEELITKQRKSKEIVEEAIRCKLKILQNDGVVTSLCARPRKTGHALFLL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB9 GGQTFMCDKIYQVDHKAKEIIPKADLPSPRKEFSASAIGCKVYVTGGRGSENGVSKDVWV
       :::::::::.: ::.::::::::::.::::::::: :::::::.::::::::::::::::
CCDS40 GGQTFMCDKLYLVDQKAKEIIPKADIPSPRKEFSACAIGCKVYITGGRGSENGVSKDVWV
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB9 YDTVHEEWSKAAPMLIARFGHGSAELENCLYVVGGHTSLAGVFPASPSVSLKQVEKYDPG
       :::.:::::::::::.::::::::::..:::::::::. .: .::::::::::::.::: 
CCDS40 YDTLHEEWSKAAPMLVARFGHGSAELKHCLYVVGGHTAATGCLPASPSVSLKQVEHYDPT
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB9 ANKWMMVAPLRDGVSNAAVVSAKLKLFVFGGTSIHRDMVSKVQCYDPSENRWTIKAECPQ
        ::: ::::::.:::::::::::::::.:::::. .: . ::::::  :::::. : :::
CCDS40 INKWTMVAPLREGVSNAAVVSAKLKLFAFGGTSVSHDKLPKVQCYDQCENRWTVPATCPQ
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB9 PWRYTAAAVLGSQIFIMGGDTEFTAASAYRFDCETNQWTRIGDMTAKRMSCHALASGNKL
       :::::::::::.:::::::::::.: :::.:. :: :::..::.:::::::::.::::::
CCDS40 PWRYTAAAVLGNQIFIMGGDTEFSACSAYKFNSETYQWTKVGDVTAKRMSCHAVASGNKL
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580         
pF1KB9 YVVGGYFGTQRCKTLDCYDPTSDTWNCITTVPYSLIPTAFVSTWKHLPA
       :::::::: :::::::::::: :.:: :::::::::::::::::::::.
CCDS40 YVVGGYFGIQRCKTLDCYDPTLDVWNSITTVPYSLIPTAFVSTWKHLPS
              550       560       570       580         

>>CCDS58958.1 ENC1 gene_id:8507|Hs108|chr5                (516 aa)
 initn: 2904 init1: 2742 opt: 2742  Z-score: 3092.9  bits: 582.1 E(32554): 5.9e-166
Smith-Waterman score: 2742; 75.2% identity (91.5% similar) in 516 aa overlap (74-589:1-516)

            50        60        70        80        90       100   
pF1KB9 MFTDVTLWAGDRAFPCHRAVLAASSRYFEAMFSHGLRESRDDTVNFQDNLHPEVLELLLD
                                     ::: ::.::.:. :::....::::::::::
CCDS58                               MFSGGLKESQDSEVNFDNSIHPEVLELLLD
                                             10        20        30

           110       120       130       140       150       160   
pF1KB9 FAYSSRIAINEENAESLLEAGDMLQFHDVRDAAAEFLEKNLFPSNCLGMMLLSDAHQCRR
       .:::::. ::::::::::::::::.:.:.::: :::::::: :.:::::.:::::::: .
CCDS58 YAYSSRVIINEENAESLLEAGDMLEFQDIRDACAEFLEKNLHPTNCLGMLLLSDAHQCTK
               40        50        60        70        80        90

           170       180       190       200       210       220   
pF1KB9 LYEFSWRMCLVHFETVRQSEDFNSLSKDTLLDLISSDELETEDERVVFEAILQWVKHDLE
       :::.:::::: .:.:.:..::: .: .: ...:.::.::::::::.:.:. ..:...::.
CCDS58 LYELSWRMCLSNFQTIRKNEDFLQLPQDMVVQLLSSEELETEDERLVYESAINWISYDLK
              100       110       120       130       140       150

           230       240       250       260       270       280   
pF1KB9 PRKVHLPELLRSVRLALLPSDCLQEAVSSEALLMADERTKLIMDEALRCKTRILQNDGVV
        :  .:::::..:::::::.  :.: :. : :.  ....: :..::.::: .::::::::
CCDS58 KRYCYLPELLQTVRLALLPAIYLMENVAMEELITKQRKSKEIVEEAIRCKLKILQNDGVV
              160       170       180       190       200       210

           290       300       310       320       330       340   
pF1KB9 TSPCARPRKAGHTLLILGGQTFMCDKIYQVDHKAKEIIPKADLPSPRKEFSASAIGCKVY
       :: ::::::.::.:..::::::::::.: ::.::::::::::.::::::::: :::::::
CCDS58 TSLCARPRKTGHALFLLGGQTFMCDKLYLVDQKAKEIIPKADIPSPRKEFSACAIGCKVY
              220       230       240       250       260       270

           350       360       370       380       390       400   
pF1KB9 VTGGRGSENGVSKDVWVYDTVHEEWSKAAPMLIARFGHGSAELENCLYVVGGHTSLAGVF
       .:::::::::::::::::::.:::::::::::.::::::::::..:::::::::. .: .
CCDS58 ITGGRGSENGVSKDVWVYDTLHEEWSKAAPMLVARFGHGSAELKHCLYVVGGHTAATGCL
              280       290       300       310       320       330

           410       420       430       440       450       460   
pF1KB9 PASPSVSLKQVEKYDPGANKWMMVAPLRDGVSNAAVVSAKLKLFVFGGTSIHRDMVSKVQ
       ::::::::::::.:::  ::: ::::::.:::::::::::::::.:::::. .: . :::
CCDS58 PASPSVSLKQVEHYDPTINKWTMVAPLREGVSNAAVVSAKLKLFAFGGTSVSHDKLPKVQ
              340       350       360       370       380       390

           470       480       490       500       510       520   
pF1KB9 CYDPSENRWTIKAECPQPWRYTAAAVLGSQIFIMGGDTEFTAASAYRFDCETNQWTRIGD
       :::  :::::. : ::::::::::::::.:::::::::::.: :::.:. :: :::..::
CCDS58 CYDQCENRWTVPATCPQPWRYTAAAVLGNQIFIMGGDTEFSACSAYKFNSETYQWTKVGD
              400       410       420       430       440       450

           530       540       550       560       570       580   
pF1KB9 MTAKRMSCHALASGNKLYVVGGYFGTQRCKTLDCYDPTSDTWNCITTVPYSLIPTAFVST
       .:::::::::.:::::::::::::: :::::::::::: :.:: ::::::::::::::::
CCDS58 VTAKRMSCHAVASGNKLYVVGGYFGIQRCKTLDCYDPTLDVWNSITTVPYSLIPTAFVST
              460       470       480       490       500       510

             
pF1KB9 WKHLPA
       :::::.
CCDS58 WKHLPS
             

>>CCDS1310.1 KLHL20 gene_id:27252|Hs108|chr1              (609 aa)
 initn: 891 init1: 470 opt: 985  Z-score: 1111.6  bits: 215.7 E(32554): 1.4e-55
Smith-Waterman score: 985; 34.7% identity (65.5% similar) in 550 aa overlap (28-565:50-581)

                  10        20        30        40        50       
pF1KB9    MSVSVHETRKSRSSTGSMNVTLFHKASHPDCVLAHLNTLRKHCMFTDVTLWAGDRAF
                                     ::  .:  .: ::::  . ::.: .: . .
CCDS13 DVTSRCTLGDPNKLPEGVPQPARMPYISDKHPRQTLEVINLLRKHRELCDVVLVVGAKKI
      20        30        40        50        60        70         

        60        70        80        90       100       110       
pF1KB9 PCHRAVLAASSRYFEAMFSHGLRESRDDTVNFQDNLHPEVLELLLDFAYSSRIAINEENA
         ::..:.: : ::.:::.  : :::.  : ..: .  ...:::.::::.:.:...: :.
CCDS13 YAHRVILSACSPYFRAMFTGELAESRQTEVVIRD-IDERAMELLIDFAYTSQITVEEGNV
      80        90       100       110        120       130        

       120       130       140       150       160       170       
pF1KB9 ESLLEAGDMLQFHDVRDAAAEFLEKNLFPSNCLGMMLLSDAHQCRRLYEFSWRMCLVHFE
       ..:: :. .::. ....:  :::...: ::::::.  ..:.:.::.: ... ..   .:.
CCDS13 QTLLPAACLLQLAEIQEACCEFLKRQLDPSNCLGIRAFADTHSCRELLRIADKFTQHNFQ
      140       150       160       170       180       190        

       180       190       200       210       220       230       
pF1KB9 TVRQSEDFNSLSKDTLLDLISSDELETEDERVVFEAILQWVKHDLEPRKVHLPELLRSVR
        : .::.:  :  . :.:.::::::....:. ::.:.. :::.... :. .::..:. ::
CCDS13 EVMESEEFMLLPANQLIDIISSDELNVRSEEQVFNAVMAWVKYSIQERRPQLPQVLQHVR
      200       210       220       230       240       250        

       240       250       260       270         280       290     
pF1KB9 LALLPSDCLQEAVSSEALLMADERTKLIMDEALRCKTRIL--QNDGVVTSPCARPRKA--
       : ::    :  .:.:. :. .::. . ..:::   :. .:  :.  .. .: .::::   
CCDS13 LPLLSPKFLVGTVGSDPLIKSDEECRDLVDEA---KNYLLLPQERPLMQGPRTRPRKPIR
      260       270       280       290          300       310     

            300         310          320       330       340       
pF1KB9 -GHTLLILGGQTFMC--DKIYQV---DHKAKEIIPKADLPSPRKEFSASAIGCKVYVTGG
        :..:. .::    :  : : .:   : ...:    :.. . :   ..:..   .:..::
CCDS13 CGEVLFAVGGW---CSGDAISSVERYDPQTNEWRMVASMSKRRCGVGVSVLDDLLYAVGG
         320          330       340       350       360       370  

       350       360       370        380       390       400      
pF1KB9 RGSENGVSKDVWVYDTVHEEWSK-AAPMLIARFGHGSAELENCLYVVGGHTSLAGVFPAS
       . . . ... :  ::   ..::. .::    : . : : : . ::.:::. ...      
CCDS13 HDGSSYLNS-VERYDPKTNQWSSDVAPTSTCRTSVGVAVLGGFLYAVGGQDGVS------
            380        390       400       410       420           

        410       420       430       440       450       460      
pF1KB9 PSVSLKQVEKYDPGANKWMMVAPLRDGVSNAAVVSAKLKLFVFGGTSIHRDMVSKVQCYD
           :. ::.:::  :::  :: .     ..::.     :.. ::..   . .. :. :.
CCDS13 ---CLNIVERYDPKENKWTRVASMSTRRLGVAVAVLGGFLYAVGGSD-GTSPLNTVERYN
            430       440       450       460        470       480 

        470       480       490       500        510       520     
pF1KB9 PSENRWTIKAECPQPWRYTAAAVLGSQIFIMGGDTEFTA-ASAYRFDCETNQWTRIGDMT
       :.::::   :      .. . ::  ..:. .::  . :  .:: :.. .::::. .  ::
CCDS13 PQENRWHTIAPMGTRRKHLGCAVYQDMIYAVGGRDDTTELSSAERYNPRTNQWSPVVAMT
             490       500       510       520       530       540 

         530       540       550       560       570       580     
pF1KB9 AKRMSCHALASGNKLYVVGGYFGTQRCKTLDCYDPTSDTWNCITTVPYSLIPTAFVSTWK
       ..: .    . ...:..:::. ::   ::.. .:: ..::                    
CCDS13 SRRSGVGLAVVNGQLMAVGGFDGTTYLKTIEVFDPDANTWRLYGGMNYRRLGGGVGVIKM
             550       560       570       580       590       600 

               
pF1KB9 HLPA    
               
CCDS13 THCESHIW
               

>>CCDS43766.1 KLHL38 gene_id:340359|Hs108|chr8            (581 aa)
 initn: 757 init1: 186 opt: 965  Z-score: 1089.3  bits: 211.5 E(32554): 2.3e-54
Smith-Waterman score: 965; 32.4% identity (62.0% similar) in 584 aa overlap (17-582:5-570)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MSVSVHETRKSRSSTGSMNVTLFHKASHPDCVLAHLNTLRKHCMFTDVTLWAGDRAFPCH
                       :..  ::.  .  . .: .::.::.  ..:::.. :: : .:::
CCDS43             MDEESLDGLLFKDHDFSSDLLRQLNSLRQSRILTDVSICAGAREIPCH
                           10        20        30        40        

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 RAVLAASSRYFEAMFSHGLRESRDDTVNFQDNLHPEVLELLLDFAYSSRIAINEENAESL
       : :::.:: ::.:::  ..::. .  :... .. : .:. .....:...  :  .:.  .
CCDS43 RNVLASSSPYFRAMFCSSFREKSEAKVQLK-GIDPPTLDQIVSYVYTGEAHIATDNVLPV
       50        60        70         80        90       100       

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 LEAGDMLQFHDVRDAAAEFLEKNLFPSNCLGMMLLSDAHQCRRLYEFSWRMCLVHFETVR
       .::..::::  . .: . .:...: :::::::. ::.  .:. : . . .. :. :  : 
CCDS43 MEAASMLQFPKLFEACSSYLQSQLAPSNCLGMIRLSEILSCETLKKKAREVALTSFPEVA
       110       120       130       140       150       160       

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 QSEDFNSLSKDTLLDLISSDELETEDERVVFEAILQWVKHDLEPRKVHLPELLRSVRLAL
        : :.. :    : : ...: :  :.:.: :::.. :.::::. :: .. ::...:::  
CCDS43 ASADLKELCALELRDYLGDDGLCGEEEKV-FEALMVWIKHDLQARKRYMQELFKQVRLQY
       170       180       190        200       210       220      

              250       260       270            280       290     
pF1KB9 LPSDCLQEAVSSEALLMADERTKLIMDEALR-----CKTRILQNDGVVTSPCARPRKAGH
       .    ... ....:::...   ..:.. : :     : : . .   ..  :   ::.. .
CCDS43 IHPAFFHHFIANDALLQSSPACQIILETAKRQMFSLCGTTVPDCKLLLHVP---PRNSYQ
        230       240       250       260       270          280   

         300        310       320        330       340         350 
pF1KB9 TLLIL-GGQTFMCDKIYQVDHKAKEIIPKADLPS-PRKEFSASAIGCK--VYVTGGRGSE
        .::: ::.    .   .:   .:.     .: . : . ..::::  .  .:: :: .  
CCDS43 DFLILLGGRKDSQQTTRDVLLYSKQTGQWQSLAKLPTRLYKASAITLHRSIYVLGGMAVS
           290       300       310       320       330       340   

                360       370       380       390       400        
pF1KB9 NG---VSKDVWVYDTVHEEWSKAAPMLIARFGHGSAELENCLYVVGGHTSLAGVFPASPS
       .:   ::..:....   ..:  . :::.::..: :.  .: .. .::         .  .
CCDS43 SGRSLVSHNVYIFSLKLNQWRLGEPMLVARYSHRSTAHKNFIFSIGG--------IGEGQ
           350       360       370       380       390             

      410       420       430       440       450       460        
pF1KB9 VSLKQVEKYDPGANKWMMVAPLRDGVSNAAVVSAKLKLFVFGGTSIHRDMVSKVQCYDPS
         . ..:.::   : :  .: .  :: . ::.    .:..::: .: .. :  .: :  :
CCDS43 ELMGSMERYDSICNVWESMASMPVGVLHPAVAVKDQRLYLFGGEDIMQNPVRLIQVYHIS
         400       410       420       430       440       450     

      470       480        490       500       510       520       
pF1KB9 ENRWTIKAECPQPWRYTA-AAVLGSQIFIMGGDTEFTAASAYRFDCETNQWTRIGDMTAK
       .: : .: :  .     : :.::: .: :.:: :.   :    .: ..:.... .::  .
CCDS43 RNSW-FKMETRMIKNVCAPAVVLGERIVIVGGYTRRILA----YDPQSNKFVKCADMKDR
          460       470       480       490           500       510

       530       540       550            560       570       580  
pF1KB9 RMSCHALASGNKLYVVGGYFGTQRCK-----TLDCYDPTSDTWNCITTVPYSLIPTAFVS
       ::   : . ::::::.::   :  :.     ..::::: .:::.    .:..:.  : ..
CCDS43 RMHHGATVMGNKLYVTGGRRLTTDCNIEDSASFDCYDPETDTWTSQGQLPHKLFDHACLT
              520       530       540       550       560       570

                  
pF1KB9 TWKHLPA    
                  
CCDS43 LQCIPRTSGLP
              580 

>>CCDS58970.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5              (555 aa)
 initn: 815 init1: 446 opt: 928  Z-score: 1047.9  bits: 203.8 E(32554): 4.8e-52
Smith-Waterman score: 928; 32.5% identity (63.0% similar) in 541 aa overlap (36-570:8-537)

          10        20        30        40        50        60     
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                                     .: ::.. .. :: . : :  .  ::.:::
CCDS58                        MGKAFKVMNELRSKQLLCDVMIVAEDVEIEAHRVVLA
                                      10        20        30       

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pF1KB9 ASSRYFEAMFSHGLRESRDDTVNFQDNLHPEVLELLLDFAYSSRIAINEENAESLLEAGD
       : : :: :::.  . ::.   ....: .  ..:  :.:. :...: ..:::.. :: :..
CCDS58 ACSPYFCAMFTGDMSESKAKKIEIKD-VDGQTLSKLIDYIYTAEIEVTEENVQVLLPAAS
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pF1KB9 MLQFHDVRDAAAEFLEKNLFPSNCLGMMLLSDAHQCRRLYEFSWRMCLVHFETVRQSEDF
       .::. :::.   .::...: :.::::.  ..:.: :  : . .  .   ::  :  .:.:
CCDS58 LLQLMDVRQNCCDFLQSQLHPTNCLGIRAFADVHTCTDLLQQANAYAEQHFPEVMLGEEF
        100       110       120       130       140       150      

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pF1KB9 NSLSKDTLLDLISSDELETEDERVVFEAILQWVKHDLEPRKVHLPELLRSVRLALLPSDC
        ::: : . .:::::.: . .:. ::::...:.... : :  :. .:.. ::: ::: : 
CCDS58 LSLSLDQVCSLISSDKLTVSSEEKVFEAVISWINYEKETRLEHMAKLMEHVRLPLLPRDY
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pF1KB9 LQEAVSSEALLMADERTKLIMDEALRCKTRILQNDGVVTSPCARPRKA---GHTLLILGG
       : ..:  :::.  ..  : .. ::.. .   :..  .. .: ..::      ......::
CCDS58 LVQTVEEEALIKNNNTCKDFLIEAMKYHLLPLDQRLLIKNPRTKPRTPVSLPKVMIVVGG
        220       230       240       250       260       270      

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pF1KB9 QTFMCDK-IYQVDHKAKEIIPKADLPSPRKEFSASAIGCKVYVTGGRGSENGVSKDVWVY
       :.    . .   : .  .    :.::: : . ..  .. .::..:: ..   : . : ::
CCDS58 QAPKAIRSVECYDFEEDRWDQIAELPSRRCRAGVVFMAGHVYAVGGFNGSLRV-RTVDVY
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       : :...:.. : :   :   :.: :.. ::.:::  . .:         : .:: :.  .
CCDS58 DGVKDQWTSIASMQERRSTLGAAVLNDLLYAVGGFDGSTG---------LASVEAYSYKT
         340       350       360       370                380      

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pF1KB9 NKWMMVAPLRDGVSNAAVVSAKLKLFVFGG-TSIHRDMVSKVQCYDPSENRWTIKAECPQ
       :.:..:::.    :...:  .. ::.. ::  .  :. .: :. :.:. :.:   :.   
CCDS58 NEWFFVAPMNTRRSSVGVGVVEGKLYAVGGYDGASRQCLSTVEQYNPATNEWIYVADMST
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pF1KB9 PWRYTAAAVLGSQIFIMGG-DTEFTAASAYRFDCETNQWTRIGDMTAKRMSCHALASGNK
           ....::..:..  :: :  ..  :.  .:  :: : ...::.  : .  . : .. 
CCDS58 RRSGAGVGVLSGQLYATGGHDGPLVRKSVEVYDPGTNTWKQVADMNMCRRNAGVCAVNGL
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       ::::::  :.    ... :.:..: :. . :                   
CCDS58 LYVVGGDDGSCNLASVEYYNPVTDKWTLLPTNMSTGRSYAGVAVIHKSL 
        510       520       530       540       550      

>>CCDS4192.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5               (587 aa)
 initn: 815 init1: 446 opt: 928  Z-score: 1047.6  bits: 203.8 E(32554): 5e-52
Smith-Waterman score: 928; 32.5% identity (63.0% similar) in 541 aa overlap (36-570:40-569)

          10        20        30        40        50        60     
pF1KB9 HETRKSRSSTGSMNVTLFHKASHPDCVLAHLNTLRKHCMFTDVTLWAGDRAFPCHRAVLA
                                     .: ::.. .. :: . : :  .  ::.:::
CCDS41 SQTLIQAGDDEKNQRTITVNPAHMGKAFKVMNELRSKQLLCDVMIVAEDVEIEAHRVVLA
      10        20        30        40        50        60         

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pF1KB9 ASSRYFEAMFSHGLRESRDDTVNFQDNLHPEVLELLLDFAYSSRIAINEENAESLLEAGD
       : : :: :::.  . ::.   ....: .  ..:  :.:. :...: ..:::.. :: :..
CCDS41 ACSPYFCAMFTGDMSESKAKKIEIKD-VDGQTLSKLIDYIYTAEIEVTEENVQVLLPAAS
      70        80        90        100       110       120        

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pF1KB9 MLQFHDVRDAAAEFLEKNLFPSNCLGMMLLSDAHQCRRLYEFSWRMCLVHFETVRQSEDF
       .::. :::.   .::...: :.::::.  ..:.: :  : . .  .   ::  :  .:.:
CCDS41 LLQLMDVRQNCCDFLQSQLHPTNCLGIRAFADVHTCTDLLQQANAYAEQHFPEVMLGEEF
      130       140       150       160       170       180        

         190       200       210       220       230       240     
pF1KB9 NSLSKDTLLDLISSDELETEDERVVFEAILQWVKHDLEPRKVHLPELLRSVRLALLPSDC
        ::: : . .:::::.: . .:. ::::...:.... : :  :. .:.. ::: ::: : 
CCDS41 LSLSLDQVCSLISSDKLTVSSEEKVFEAVISWINYEKETRLEHMAKLMEHVRLPLLPRDY
      190       200       210       220       230       240        

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pF1KB9 LQEAVSSEALLMADERTKLIMDEALRCKTRILQNDGVVTSPCARPRKA---GHTLLILGG
       : ..:  :::.  ..  : .. ::.. .   :..  .. .: ..::      ......::
CCDS41 LVQTVEEEALIKNNNTCKDFLIEAMKYHLLPLDQRLLIKNPRTKPRTPVSLPKVMIVVGG
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pF1KB9 QTFMCDK-IYQVDHKAKEIIPKADLPSPRKEFSASAIGCKVYVTGGRGSENGVSKDVWVY
       :.    . .   : .  .    :.::: : . ..  .. .::..:: ..   : . : ::
CCDS41 QAPKAIRSVECYDFEEDRWDQIAELPSRRCRAGVVFMAGHVYAVGGFNGSLRV-RTVDVY
      310       320       330       340       350       360        

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pF1KB9 DTVHEEWSKAAPMLIARFGHGSAELENCLYVVGGHTSLAGVFPASPSVSLKQVEKYDPGA
       : :...:.. : :   :   :.: :.. ::.:::  . .:         : .:: :.  .
CCDS41 DGVKDQWTSIASMQERRSTLGAAVLNDLLYAVGGFDGSTG---------LASVEAYSYKT
       370       380       390       400                410        

             430       440       450        460       470       480
pF1KB9 NKWMMVAPLRDGVSNAAVVSAKLKLFVFGG-TSIHRDMVSKVQCYDPSENRWTIKAECPQ
       :.:..:::.    :...:  .. ::.. ::  .  :. .: :. :.:. :.:   :.   
CCDS41 NEWFFVAPMNTRRSSVGVGVVEGKLYAVGGYDGASRQCLSTVEQYNPATNEWIYVADMST
      420       430       440       450       460       470        

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pF1KB9 PWRYTAAAVLGSQIFIMGG-DTEFTAASAYRFDCETNQWTRIGDMTAKRMSCHALASGNK
           ....::..:..  :: :  ..  :.  .:  :: : ...::.  : .  . : .. 
CCDS41 RRSGAGVGVLSGQLYATGGHDGPLVRKSVEVYDPGTNTWKQVADMNMCRRNAGVCAVNGL
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     540       550       560       570       580         
pF1KB9 LYVVGGYFGTQRCKTLDCYDPTSDTWNCITTVPYSLIPTAFVSTWKHLPA
       ::::::  :.    ... :.:..: :. . :                   
CCDS41 LYVVGGDDGSCNLASVEYYNPVTDKWTLLPTNMSTGRSYAGVAVIHKSL 
      540       550       560       570       580        

>>CCDS1429.1 KLHL12 gene_id:59349|Hs108|chr1              (568 aa)
 initn: 961 init1: 401 opt: 910  Z-score: 1027.5  bits: 200.1 E(32554): 6.5e-51
Smith-Waterman score: 910; 31.2% identity (63.2% similar) in 555 aa overlap (27-571:14-553)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MSVSVHETRKSRSSTGSMNVTLFHKASHPDCVLAHLNTLRKHCMFTDVTLWAGDRAFPCH
                                 .:   .:  .:.:::   . :::: . .. :: :
CCDS14              MGGIMAPKDIMTNTHAKSILNSMNSLRKSNTLCDVTLRVEQKDFPAH
                            10        20        30        40       

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 RAVLAASSRYFEAMFSHGLRESRDDTVNFQDNLHPEVLELLLDFAYSSRIAINEENAESL
       : :::: : :: :::.  : :.    :..: .:   ..:.::::.:.  . .. ::.. :
CCDS14 RIVLAACSDYFCAMFTSELSEKGKPYVDIQ-GLTASTMEILLDFVYTETVHVTVENVQEL
        50        60        70         80        90       100      

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 LEAGDMLQFHDVRDAAAEFLEKNLFPSNCLGMMLLSDAHQCRRLYEFSWRMCLVHFETVR
       : :. .::.. :..:  ::::..: ::::::.  ....:.:  :.. .  .   ::  : 
CCDS14 LPAACLLQLKGVKQACCEFLESQLDPSNCLGIRDFAETHNCVDLMQAAEVFSQKHFPEVV
        110       120       130       140       150       160      

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 QSEDFNSLSKDTLLDLISSDELETEDERVVFEAILQWVKHDLEPRKVHLPELLRSVRLAL
       : :.:  ::.  .  ::. ::.....:. ::::...::::  . :.  ::.::. ::. :
CCDS14 QHEEFILLSQGEVEKLIKCDEIQVDSEEPVFEAVINWVKHAKKEREESLPNLLQYVRMPL
        170       180       190       200       210       220      

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pF1KB9 LPSDCLQEAVSSEALLMADERTKLIMDEALRCKTRILQNDGVVTSPCARPR-KAGHTLLI
       :    . .....: ..  . . . ..::: . . :  .  . . .: .: :  :...::.
CCDS14 LTPRYITDVIDAEPFIRCSLQCRDLVDEAKKFHLRP-ELRSQMQGPRTRARLGANEVLLV
        230       240       250       260        270       280     

     300          310       320       330       340       350      
pF1KB9 LGG---QTFMCDKIYQVDHKAKEIIPKADLPSPRKEFSASAIGCKVYVTGGRGSENGVSK
       .::   :    : . . : :..:     ..   :.  .. ..  ..:: ::  ... .:.
CCDS14 VGGFGSQQSPIDVVEKYDPKTQEWSFLPSITRKRRYVASVSLHDRIYVIGGYDGRSRLSS
         290       300       310       320       330       340     

        360          370       380       390       400       410   
pF1KB9 DVWVYDTVHEE---WSKAAPMLIARFGHGSAELENCLYVVGGHTSLAGVFPASPSVSLKQ
        :   : . .:   : ..::: . :   :.. : . .:: ::       : .:   .  .
CCDS14 -VECLDYTADEDGVWYSVAPMNVRRGLAGATTLGDMIYVSGG-------FDGSRRHT--S
          350       360       370       380              390       

           420       430       440       450       460       470   
pF1KB9 VEKYDPGANKWMMVAPLRDGVSNAAVVSAKLKLFVFGGTSIHRDMVSKVQCYDPSENRWT
       .:.:::. ..: :.. .. .  .:..: :.  .. .:: .   .....:. :::  ..::
CCDS14 MERYDPNIDQWSMLGDMQTAREGAGLVVASGVIYCLGGYD-GLNILNSVEKYDPHTGHWT
         400       410       420       430        440       450    

           480         490        500       510       520       530
pF1KB9 IKAECPQPWRYTAA--AVLGSQIFIMGG-DTEFTAASAYRFDCETNQWTRIGDMTAKRMS
            :.  . ..:  :.:...:...:: :     .:.  .. .:..:: . .::. :  
CCDS14 --NVTPMATKRSGAGVALLNDHIYVVGGFDGTAHLSSVEAYNIRTDSWTTVTSMTTPRCY
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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