Result of FASTA (ccds) for
pF1KB9612
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9612, 691 aa
1>>>pF1KB9612 691 - 691 aa - 691 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.8531+/-0.00164; mu= 2.8989+/- 0.093
mean_var=307.4667+/-68.457, 0's: 0 Z-trim(106.1): 803 B-trim: 434 in 1/49
Lambda= 0.073143
statistics sampled from 7862 (8797) to 7862 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.609), E-opt: 0.2 (0.27), width: 16
Scan time: 3.240
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10042.1 ZNF770 gene_id:54989|Hs108|chr15 ( 691) 4805 522.2 9.8e-148
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CCDS54955.1 ZFP62 gene_id:643836|Hs108|chr5 ( 900) 728 92.1 3.7e-18
CCDS46162.1 ZNF836 gene_id:162962|Hs108|chr19 ( 936) 684 87.5 9.6e-17
CCDS46212.1 ZNF814 gene_id:730051|Hs108|chr19 ( 855) 674 86.4 1.9e-16
CCDS82341.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 527) 663 85.0 3.1e-16
CCDS59367.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 803) 665 85.4 3.5e-16
CCDS12413.2 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 809) 665 85.4 3.5e-16
CCDS74321.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 818) 665 85.4 3.5e-16
CCDS12503.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 686) 663 85.1 3.6e-16
CCDS34773.1 ZNF425 gene_id:155054|Hs108|chr7 ( 752) 657 84.5 6e-16
CCDS54259.1 ZNF607 gene_id:84775|Hs108|chr19 ( 695) 649 83.7 1e-15
CCDS33006.1 ZNF607 gene_id:84775|Hs108|chr19 ( 696) 649 83.7 1e-15
CCDS74322.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1159) 648 83.8 1.5e-15
CCDS42541.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1191) 648 83.8 1.6e-15
CCDS11180.1 ZNF624 gene_id:57547|Hs108|chr17 ( 865) 636 82.4 3.1e-15
CCDS46166.1 ZNF534 gene_id:147658|Hs108|chr19 ( 661) 619 80.5 8.9e-15
CCDS46165.1 ZNF534 gene_id:147658|Hs108|chr19 ( 674) 619 80.5 9e-15
CCDS45012.1 ZNF268 gene_id:10795|Hs108|chr12 ( 947) 611 79.8 2e-14
CCDS42447.1 ZNF236 gene_id:7776|Hs108|chr18 (1845) 614 80.5 2.5e-14
CCDS77201.1 ZNF236 gene_id:7776|Hs108|chr18 (1847) 614 80.5 2.5e-14
CCDS13174.1 ZNF337 gene_id:26152|Hs108|chr20 ( 751) 606 79.2 2.5e-14
CCDS73089.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 699) 590 77.4 7.7e-14
CCDS31182.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 810) 590 77.5 8.5e-14
CCDS44372.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 811) 590 77.5 8.5e-14
CCDS60514.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 817) 590 77.5 8.5e-14
CCDS73088.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 829) 590 77.5 8.6e-14
CCDS77773.1 ZNF717 gene_id:100131827|Hs108|chr3 ( 864) 587 77.2 1.1e-13
CCDS59369.1 ZNF99 gene_id:7652|Hs108|chr19 ( 864) 586 77.1 1.2e-13
CCDS59368.1 ZNF729 gene_id:100287226|Hs108|chr19 (1252) 589 77.6 1.2e-13
CCDS33090.1 ZNF616 gene_id:90317|Hs108|chr19 ( 781) 578 76.2 2e-13
CCDS31938.1 ZNF605 gene_id:100289635|Hs108|chr12 ( 641) 576 75.9 2e-13
CCDS53850.1 ZNF605 gene_id:100289635|Hs108|chr12 ( 672) 576 75.9 2.1e-13
CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19 ( 678) 576 75.9 2.1e-13
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 573 75.6 2.5e-13
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 573 75.6 2.6e-13
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 573 75.6 2.6e-13
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 573 75.6 2.6e-13
CCDS62623.1 ZNF254 gene_id:9534|Hs108|chr19 ( 574) 571 75.3 2.7e-13
CCDS74324.1 ZNF254 gene_id:9534|Hs108|chr19 ( 586) 571 75.3 2.8e-13
CCDS74323.1 ZNF254 gene_id:9534|Hs108|chr19 ( 618) 571 75.4 2.8e-13
CCDS32983.1 ZNF254 gene_id:9534|Hs108|chr19 ( 659) 571 75.4 3e-13
CCDS56105.1 ZNF835 gene_id:90485|Hs108|chr19 ( 537) 563 74.5 4.7e-13
CCDS46045.1 ZNF30 gene_id:90075|Hs108|chr19 ( 623) 564 74.6 4.8e-13
CCDS46044.1 ZNF30 gene_id:90075|Hs108|chr19 ( 624) 564 74.6 4.8e-13
CCDS82388.1 ZNF841 gene_id:284371|Hs108|chr19 ( 808) 564 74.8 5.7e-13
CCDS46161.1 ZNF841 gene_id:284371|Hs108|chr19 ( 924) 564 74.8 6.2e-13
CCDS33097.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 839) 563 74.7 6.2e-13
CCDS54314.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 840) 563 74.7 6.2e-13
CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 562 74.5 6.2e-13
>>CCDS10042.1 ZNF770 gene_id:54989|Hs108|chr15 (691 aa)
initn: 4805 init1: 4805 opt: 4805 Z-score: 2765.8 bits: 522.2 E(32554): 9.8e-148
Smith-Waterman score: 4805; 100.0% identity (100.0% similar) in 691 aa overlap (1-691:1-691)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MMAENNLKMLKIQQCVVANKLPRNRPYVCNICFKHFETPSKLARHYLIHTGQKPFECDVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MMAENNLKMLKIQQCVVANKLPRNRPYVCNICFKHFETPSKLARHYLIHTGQKPFECDVC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 HKTFRQLVHLERHQLTHSLPFKCSICQRHFKNLKTFVKHQQLHNETYQNNVKQVRRLLEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 HKTFRQLVHLERHQLTHSLPFKCSICQRHFKNLKTFVKHQQLHNETYQNNVKQVRRLLEA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 KQEKSMYGVYNTFTTEERWALHPCSKSDPMYSMKRRKNIHACTICGKMFPSQSKLDRHVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KQEKSMYGVYNTFTTEERWALHPCSKSDPMYSMKRRKNIHACTICGKMFPSQSKLDRHVL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 IHTGQRPFKCVLCTKSFRQSTHLKIHQLTHSEERPFQCCFCQKGFKIQSKLLKHKQIHTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 IHTGQRPFKCVLCTKSFRQSTHLKIHQLTHSEERPFQCCFCQKGFKIQSKLLKHKQIHTR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 NKAFRALLLKKRRTESRPLPNKLNANQGGFENGEIGESEENNPLDVHSIYIVPFQCPKCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 NKAFRALLLKKRRTESRPLPNKLNANQGGFENGEIGESEENNPLDVHSIYIVPFQCPKCE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 KCFESEQILNEHSCFAARSGKIPSRFKRSYNYKTIVKKILAKLKRARSKKLDNFQSEKKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KCFESEQILNEHSCFAARSGKIPSRFKRSYNYKTIVKKILAKLKRARSKKLDNFQSEKKV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 FKKSFLRNCDLISGEQSSEQTQRTFVGSLGKHGTYKTIGNRKKKTLTLPFSWQNMGKNLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 FKKSFLRNCDLISGEQSSEQTQRTFVGSLGKHGTYKTIGNRKKKTLTLPFSWQNMGKNLK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 GILTTENILSIDNSVNKKDLSICGSSGEEFFNNCEVLQCGFSVPRENIRTRHKICPCDKC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GILTTENILSIDNSVNKKDLSICGSSGEEFFNNCEVLQCGFSVPRENIRTRHKICPCDKC
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 EKVFPSISKLKRHYLIHTGQRPFGCNICGKSFRQSAHLKRHEQTHNEKSPYASLCQVEFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 EKVFPSISKLKRHYLIHTGQRPFGCNICGKSFRQSAHLKRHEQTHNEKSPYASLCQVEFG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB9 NFNNLSNHSGNNVNYNASQQCQAPGVQKYEVSESDQMSGVKAESQDFIPGSTGQPCLPNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 NFNNLSNHSGNNVNYNASQQCQAPGVQKYEVSESDQMSGVKAESQDFIPGSTGQPCLPNV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB9 LLESEQSNPFCSYSEHQEKNDVFLYRCSVCAKSFRSPSKLERHYLIHAGQKPFECSVCGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LLESEQSNPFCSYSEHQEKNDVFLYRCSVCAKSFRSPSKLERHYLIHAGQKPFECSVCGK
610 620 630 640 650 660
670 680 690
pF1KB9 TFRQAPHWKRHQLTHFKERPQGKVVALDSVM
:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 TFRQAPHWKRHQLTHFKERPQGKVVALDSVM
670 680 690
>>CCDS47357.2 ZFP62 gene_id:643836|Hs108|chr5 (867 aa)
initn: 473 init1: 276 opt: 728 Z-score: 439.6 bits: 92.1 E(32554): 3.7e-18
Smith-Waterman score: 738; 27.5% identity (52.1% similar) in 666 aa overlap (25-678:274-832)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MMAENNLKMLKIQQCVVANKLPRNRPYVCNICFKHFETPSKLARHYLIHTGQKP
.:: :. : : : : : : :: :.::
CCDS47 GEKPYECDICGKTFSNSSGLRVHKRIHTGEKPYECDECGKAFITCRTLLNHKSIHFGDKP
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pF1KB9 FECDVCHKTFRQLVHLERHQLTHS--LPFKCSICQRHFKNLKTFVKHQQLHN--ETYQNN
..:: :.:.: : .:.. :. :..:. : . :.: . .. :...:. . :. .
CCDS47 YKCDECEKSFNYSSLLIQHKVIHTGEKPYECDECGKAFRNSSGLIVHKRIHTGEKPYKCD
310 320 330 340 350 360
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 VKQVRRLLEAKQEKSMYGVYNTFTTEERWALHPCSKSDPMYSMKRRKNIHACTICGKMFP
: .: . .: .:... .:: .:. : : ::: :
CCDS47 VCG-----KAFSYSSGLAVHKS--------IHPGKKA------------HECKECGKSFS
370 380 390
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 SQSKLDRHVLIHTGQRPFKCVLCTKSFRQSTHLKIHQLTHSEERPFQCCFCQKGFKIQSK
.: : .: ::::.::. : .: :.::... ::.:. :. :.:..: : :.. .:.
CCDS47 YNSLLLQHRTIHTGERPYVCDVCGKTFRNNAGLKVHRRLHTGEKPYKCDVCGKAYISRSS
400 410 420 430 440 450
240 250 260 270 280
pF1KB9 LLKHKQIHTRNKAFRALLLKKRRTESRPLPN--KLNANQGGFENGEIGESEENNP-LDVH
: .:: :: .: .. .: . : : . .... . : : :.. .:: : ::
CCDS47 LKNHKGIHLGEKPYKCSYCEKSFNYSSALEQHKRIHTREKPFGCDECGKAFRNNSGLKVH
460 470 480 490 500 510
290 300 310 320 330 340
pF1KB9 S-IYI--VPFQCPKCEKCFESEQILNEHSCFAARSGKIPSRFKRSYNYKTIVKKILAKLK
. :. :..: .: : . : . : .:. ... :. : :: . :...
CCDS47 KRIHTGERPYKCEECGKAYISLSSLINHK--SVHPGEKP--FKCDECEKAFITY------
520 530 540 550 560
350 360 370 380 390 400
pF1KB9 RARSKKLDNFQSEKKVFKKSFLRNCDLISGEQSSEQTQRTFVGSLGKHGTYKTIGNRKKK
. : : .::: .::. :.: . : . :..: . . .:.:
CCDS47 ----RTLTN---HKKVHLGEKPYKCDVC--EKSFNYT-----SLLSQH---RRVHTREK-
570 580 590 600 610
410 420 430 440 450 460
pF1KB9 TLTLPFSWQNMGKNLKGILTTENILSIDNSVNKKDLSI-CGSSGEEFFNNCEVLQCGFSV
:. . : .. ... :.. . .. . : :. .... ... .
CCDS47 ----PYECDRCEK----VFRNNSSLKVHKRIHTGERPYECDVCGKAYISHSSLINHKSTH
620 630 640 650 660
470 480 490 500 510 520
pF1KB9 PRENIRTRHKICPCDKCEKVFPSISKLKRHYLIHTGQRPFGCNICGKSFRQSAHLKRHEQ
: :: : ::.: :.: : : : .: :..:: : ::::: :. :..:..
CCDS47 PG---RTPHT---CDECGKAFFSSRTLISHKRVHLGEKPFKCVECGKSFSYSSLLSQHKR
670 680 690 700 710
530 540 550 560 570 580
pF1KB9 THNEKSPYA-SLCQVEFGNFNNLSNHSGNNVNYNASQQCQAPGVQKYEVSESDQMSGVKA
:. ..::. . : : : ..:. :. .. : . :: .: .
CCDS47 IHTGEKPYVCDRCGKAFRNSSGLTVHKRIHT-----------GEKPYECDECGKA-----
720 730 740 750 760
590 600 610 620 630 640
pF1KB9 ESQDFIPGSTGQPCLPNVLLESEQSNPFCSYSEHQEKNDVFLYRCSVCAKSFRSPSKLER
.: :. :.. . : :: :. : : :.::: : :..
CCDS47 ----YISHSS--------LINHK--------SVHQGKQP---YNCE-CGKSFNYRSVLDQ
770 780 790
650 660 670 680 690
pF1KB9 HYLIHAGQKPFECSVCGKTFRQAPHWKRHQLTHFKERPQGKVVALDSVM
: ::.:.::..:. :::.: . .:. :: :
CCDS47 HKRIHTGKKPYRCNECGKAFNIRSNLTKHKRTHTGEESLNVIYVGSYSGTSQKRTYEGGN
800 810 820 830 840 850
CCDS47 ALDGGRMRMPL
860
>>CCDS54955.1 ZFP62 gene_id:643836|Hs108|chr5 (900 aa)
initn: 473 init1: 276 opt: 728 Z-score: 439.4 bits: 92.1 E(32554): 3.7e-18
Smith-Waterman score: 738; 27.5% identity (52.1% similar) in 666 aa overlap (25-678:307-865)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MMAENNLKMLKIQQCVVANKLPRNRPYVCNICFKHFETPSKLARHYLIHTGQKP
.:: :. : : : : : : :: :.::
CCDS54 GEKPYECDICGKTFSNSSGLRVHKRIHTGEKPYECDECGKAFITCRTLLNHKSIHFGDKP
280 290 300 310 320 330
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 FECDVCHKTFRQLVHLERHQLTHS--LPFKCSICQRHFKNLKTFVKHQQLHN--ETYQNN
..:: :.:.: : .:.. :. :..:. : . :.: . .. :...:. . :. .
CCDS54 YKCDECEKSFNYSSLLIQHKVIHTGEKPYECDECGKAFRNSSGLIVHKRIHTGEKPYKCD
340 350 360 370 380 390
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 VKQVRRLLEAKQEKSMYGVYNTFTTEERWALHPCSKSDPMYSMKRRKNIHACTICGKMFP
: .: . .: .:... .:: .:. : : ::: :
CCDS54 VCG-----KAFSYSSGLAVHKS--------IHPGKKA------------HECKECGKSFS
400 410 420 430
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 SQSKLDRHVLIHTGQRPFKCVLCTKSFRQSTHLKIHQLTHSEERPFQCCFCQKGFKIQSK
.: : .: ::::.::. : .: :.::... ::.:. :. :.:..: : :.. .:.
CCDS54 YNSLLLQHRTIHTGERPYVCDVCGKTFRNNAGLKVHRRLHTGEKPYKCDVCGKAYISRSS
440 450 460 470 480 490
240 250 260 270 280
pF1KB9 LLKHKQIHTRNKAFRALLLKKRRTESRPLPN--KLNANQGGFENGEIGESEENNP-LDVH
: .:: :: .: .. .: . : : . .... . : : :.. .:: : ::
CCDS54 LKNHKGIHLGEKPYKCSYCEKSFNYSSALEQHKRIHTREKPFGCDECGKAFRNNSGLKVH
500 510 520 530 540 550
290 300 310 320 330 340
pF1KB9 S-IYI--VPFQCPKCEKCFESEQILNEHSCFAARSGKIPSRFKRSYNYKTIVKKILAKLK
. :. :..: .: : . : . : .:. ... :. : :: . :...
CCDS54 KRIHTGERPYKCEECGKAYISLSSLINHK--SVHPGEKP--FKCDECEKAFITY------
560 570 580 590 600
350 360 370 380 390 400
pF1KB9 RARSKKLDNFQSEKKVFKKSFLRNCDLISGEQSSEQTQRTFVGSLGKHGTYKTIGNRKKK
. : : .::: .::. :.: . : . :..: . . .:.:
CCDS54 ----RTLTN---HKKVHLGEKPYKCDVC--EKSFNYT-----SLLSQH---RRVHTREK-
610 620 630 640
410 420 430 440 450 460
pF1KB9 TLTLPFSWQNMGKNLKGILTTENILSIDNSVNKKDLSI-CGSSGEEFFNNCEVLQCGFSV
:. . : .. ... :.. . .. . : :. .... ... .
CCDS54 ----PYECDRCEK----VFRNNSSLKVHKRIHTGERPYECDVCGKAYISHSSLINHKSTH
650 660 670 680 690
470 480 490 500 510 520
pF1KB9 PRENIRTRHKICPCDKCEKVFPSISKLKRHYLIHTGQRPFGCNICGKSFRQSAHLKRHEQ
: :: : ::.: :.: : : : .: :..:: : ::::: :. :..:..
CCDS54 PG---RTPHT---CDECGKAFFSSRTLISHKRVHLGEKPFKCVECGKSFSYSSLLSQHKR
700 710 720 730 740
530 540 550 560 570 580
pF1KB9 THNEKSPYA-SLCQVEFGNFNNLSNHSGNNVNYNASQQCQAPGVQKYEVSESDQMSGVKA
:. ..::. . : : : ..:. :. .. : . :: .: .
CCDS54 IHTGEKPYVCDRCGKAFRNSSGLTVHKRIHT-----------GEKPYECDECGKA-----
750 760 770 780 790
590 600 610 620 630 640
pF1KB9 ESQDFIPGSTGQPCLPNVLLESEQSNPFCSYSEHQEKNDVFLYRCSVCAKSFRSPSKLER
.: :. :.. . : :: :. : : :.::: : :..
CCDS54 ----YISHSS--------LINHK--------SVHQGKQP---YNCE-CGKSFNYRSVLDQ
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650 660 670 680 690
pF1KB9 HYLIHAGQKPFECSVCGKTFRQAPHWKRHQLTHFKERPQGKVVALDSVM
: ::.:.::..:. :::.: . .:. :: :
CCDS54 HKRIHTGKKPYRCNECGKAFNIRSNLTKHKRTHTGEESLNVIYVGSYSGTSQKRTYEGGN
830 840 850 860 870 880
CCDS54 ALDGGRMRMPL
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:..::.:. : : :.. :.: : ..:: .
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::..:. : :.:.. : ::..:. :..:..: . :.. . .:.:.. :. .
CCDS46 KPYKCNECGKAFHRGSLLTIHQIVHTRGKPYQCGVCGKIFRQNSDLVNHRRSHTGEKPYK
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.. . . . . ... : :. . . :.:. . : . .. ::. :
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::::.: ..:.: : ::::..:.:: .: ::: ::..: :: .:: ..:..: : :
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:: .:.: :. ::: .: . . : .. : . .. : .. .: :. :.
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.. . . :. :..: :: : :.. ..:..: :
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: .. :: . . . ::.. . .:. . .::: . . ..: : :. . .
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: : . .: ::. .. : ... : : .. . ..:: . ::.
CCDS46 KRIHTGEK-----PFQCNECGTVFRNYSCLARHLRIHTGQKPYKCNVCG----KVFNDSG
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:. .. :.: .: :..: ::: : : :: ::::..:. :: :::.. :
CCDS46 NLS-----NHKRIHTGEKPFQCNECGKVFSYYSCLARHRKIHTGEKPYKCNDCGKAYTQR
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pF1KB9 AHLKRHEQTHNEKSPYASLCQVEFGNFNNLSNHSGNNVNYNASQQCQAPGVQKYEVSESD
. : .: :. ..:: :. :::. .:.. . :. . . : .. .
CCDS46 SSLTKHLIIHTGEKPYN--CN-EFGG---AFIQSSKLARYHRNPTGEKPHKCSHCGRTFS
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...:. ... ::. .: .: : : . ..:.. .. :.:. :.:
CCDS46 HITGLTYHQRRH----TGE--MPYKCIECGQVFNSTSNLARHRRIHTGEKPYKCNECGKV
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:: : : :: ::.:.::. :. :::.:: :: : ..:
CCDS46 FRHQSTLARHRSIHTGEKPYVCNECGKAFRVRSILVNHQKMHTGDKPYKCNECGKAFIER
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CCDS46 SKLVYHQRNHTGEKPYKCIECGKAFGRFSCLNKHQMIHSGEKPYKCNECGKSFISRSGLT
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: :.: . : . :: .:. .:. : . :.. .: .::..:. .:
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: .:::.::..: : ::: . . .. :: .:.... ..: : :.:. .:.:..:...
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:: .: . : . : . ...:.. :. :: .: .. :: .
CCDS46 HTGEKPYGCEECGKSFSSEGHLRSHQRVHAGERPFKCGECVKSFSHKRSLVHHQRVHSGE
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:.:: .: : : .. : :. ...: : .. . :.. .: ..:. .. .
CCDS46 RPYQCGECGKSFSQKGNLVLHQ--RVHTGARP--YECGECGKSFSSK--GHLRNHQQIHT
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. : ::: .. :: .: . .:.. : :: ....::. .. .:
CCDS46 GDRLYECGECGKSFSHKGTLIL-HQRVHPRERSYGCGECGK--SFSSIGHLRSHQRVHTG
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:. . ::.. : :. .. . . : ::. :. : .. :
CCDS46 ERPYECGECGKSFSHKRSLVHHQRMHTGERPYK-----CGDCGKSFNEK------GHLRN
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CCDS46 HQRVHTTERPFKCGECGKCFSHKGNLILHQHGHTGERPYVCRECGKLFKKKSHLLVHQRI
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pF1KB9 HNEKSPYAS-LCQVEFGNFNNLSNHSGNNVNYNASQQCQAPGVQKYEVSESDQMSGVKAE
:: ..::: :: : : .: :. ... . .:. : .: :..
CCDS46 HNGEKPYACEACQKFFRNKYQLIAHQRVHTG-ERPYECNDCG-------KSFTHSSTFCV
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pF1KB9 SQDFIPGSTGQPCLPNVLLESEQSNPFCSYSEHQE-KNDVFLYRCSVCAKSFRSPSKLER
. . : : .:.: :...:.. .. :.:: :.::: :.: .
CCDS46 HKRIHTGEKPYECSECGKSFAESS----SFTKHKRVHTGEKPYECSECGKSFAESSSLTK
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pF1KB9 HYLIHAGQKPFECSVCGKTFRQAPHWKRHQLTHFKERPQGKVVALDSVM
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CCDS46 HKRVHTGEKPYKCEKCGKLFNKKSHLLVHQSSHWRKAI
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CCDS82 VITPFKCNHCGKGFNQTLDLIRHLRIHTGEKPYECSNCRKAFSHKEKLIKHYKIHSREQS
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60 70 80 90 100 110
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..:. : :.: .. .: ::: :. :. :. :.. :.. .... :...:. . .
CCDS82 YKCNECGKAFIKMSNLIRHQRIHTGEKPYACKECEKSFSQKSNLIDHEKIHTGEKPYECN
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pF1KB9 QVRRLLEAKQEKSMYGVYNTFTTEERWALHPCSKSDP-MYSMKRRKNIHA------CTIC
. . . :: :. . .. : :. .: . :.:. : . :. . :. : :
CCDS82 ECGKAFSQKQ--SLIAHQKVHTGEKPYACNECGKAFPRIASLALHMRSHTGEKPYKCDKC
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:: : . : : :: ::::..:..: : :.: ::. : .:. .:. :.:..: :.:.:
CCDS82 GKAFSQFSMLIIHVRIHTGEKPYECNECGKAFSQSSALTVHMRSHTGEKPYECKECRKAF
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pF1KB9 KIQSKLLKHKQIHTRNKAFRALLLKKRRTESRPL--PNKLNANQGGFENGEIGE--SEEN
. ..... :..::::.: .. : . : ....... . : :. :...
CCDS82 SHKKNFITHQKIHTREKPYECNECGKAFIQMSNLVRHQRIHTGEKPYICKECGKAFSQKS
270 280 290 300 310 320
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pF1KB9 NPLDVHSIYI--VPFQCPKCEKCFESEQILNEHSCFAARSGKIPSRFKRSYNYKTIVKKI
: . ..:. :..: .: : : ..: . :. ...:. : .. . . . ..
CCDS82 NLIAHEKIHSGEKPYECNECGKAFSQKQNFITHQ--KVHTGEKPYDCNECGKAFSQIASL
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340 350 360 370 380 390
pF1KB9 LAKLKRARSKKLDNFQSEKKVFKKSFLRNCDLISGEQSSEQTQRTFV-GSLGKHGTYKT-
.:. ..: . .. :.:.. :.:.. .. :. .. .: . :: . .:
CCDS82 TLHLRSHTGEKPYECDKCGKAFSQ-----CSLLNLHMRSHTGEKPYVCNECGKAFSQRTS
380 390 400 410 420 430
400 410 420 430 440 450
pF1KB9 -IGNRKKKTLTLPFSWQNMGKNLKGILTTENILSIDNSVNKKDLSICGSSGEEFFNNCEV
: . . .: :. .. :: . : ..:.. . : : .::. :.
CCDS82 LIVHMRGHTGEKPYECNKCGKAF----------SQSSSLT---IHIRGHTGEKPFD----
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460 470 480 490 500 510
pF1KB9 LQCGFSVPRENIRTRHKICPCDKCEKVFPSISKLKRHYLIHTGQRPFGCNICGKSFRQSA
:.:: :.: .::.: :. :::..:. : :::.: :..
CCDS82 --------------------CSKCGKAFSQISSLTLHMRKHTGEKPYHCIECGKAFSQKS
480 490 500 510
520 530 540 550 560 570
pF1KB9 HLKRHEQTHNEKSPYASLCQVEFGNFNNLSNHSGNNVNYNASQQCQAPGVQKYEVSESDQ
:: ::.. :
CCDS82 HLVRHQRIHTH
520
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CCDS59 NTGEKPYTCEECGKVFNWSSRLTTHKKNYTRYKLYKCEECGKAFNKSSILTTHKIIRTGE
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pF1KB9 KPFECDVCHKTFRQLVHLERHQLTHS--LPFKCSICQRHFKNLKTFVKHQQLHNETYQNN
: ..: : :.: : .: .:. : :.:: : . :. .:..::...:. .
CCDS59 KFYKCKECAKAFNQSSNLTEHKKIHPGEKPYKCEECGKAFNWPSTLTKHKRIHTGEKPYT
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pF1KB9 VKQVRRLLEAKQEKSMYGVYNTFTTEERWALHPCSKSDPMYS----MKRRKNIHA-----
.. . : .. : ... . : :. .. :.. .: . ..:.::.
CCDS59 CEECGK---AFNQFSNLTTHKRIHTAEK--FYKCTECGEAFSRSSNLTKHKKIHTEKKPY
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pF1KB9 -CTICGKMFPSQSKLDRHVLIHTGQRPFKCVLCTKSFRQSTHLKIHQLTHSEERPFQCCF
: ::: : .::: .: : :::..:.:: : :.: . : :. :. :.:..:
CCDS59 KCEECGKAFKWSSKLTEHKLTHTGEKPYKCEECGKAFNWPSTLTKHNRIHTGEKPYKCEV
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pF1KB9 CQKGFKIQSKLLKHKQIHTRNKAFRALLLKKRRTESRPLPN--KLNANQGGFENGEIGES
: :.:. :.: ::.::: .: .. : ..: : . :.. .. .. : :..
CCDS59 CGKAFNQFSNLTTHKRIHTAEKPYKCEECGKAFSRSSNLTKHKKIHIEKKPYKCEECGKA
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pF1KB9 EE-NNPLDVHSIYIV---PFQCPKCEKCFESEQILNEHSCFAARSGKIPSRFKRSYNYKT
. .. : :.: . :..: .: : :. .::..:. ..:. : . .. . :
CCDS59 FKWSSKLTEHKITHTGEKPYKCEECGKAFNHFSILTKHK--RIHTGEKPYKCEECGKAFT
520 530 540 550 560 570
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pF1KB9 IVKKILAKLKRARSKKLDNFQSEKKVFKKS--FLRNCDLISGEQ--SSEQTQRTF--VGS
... .. : ..:. . . :.: .: . . . .: . . :. ..: ..
CCDS59 QSSNLTTHKKIHTGEKFYKCEECGKAFTQSSNLTTHKKIHTGGKPYKCEECGKAFNQFST
580 590 600 610 620 630
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pF1KB9 LGKHGTYKTIGNRKKKTLTLPFSWQNMGKNLK--GILTTENILSIDNSVNKKDLSICGSS
: :: : : ...: :.. .. :: .: . :: ..:. .. : :
CCDS59 LTKH---KIIHTEEK-----PYKCEECGKAFKWSSTLTKHKIIHTGEKPYK-----CEEC
640 650 660 670
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pF1KB9 GEEFFNNCEVLQCGFSVPRENIRTRHKICPCDKCEKVFPSISKLKRHYLIHTGQRPFGCN
:. : :. .:. .. :.: .: :.:: :.: :.: .: ::::..:. :.
CCDS59 GKAF-----KLSSTLST-HKIIHTGEKPYKCEKCGKAFNRSSNLIEHKKIHTGEQPYKCE
680 690 700 710 720 730
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pF1KB9 ICGKSFRQSAHLKRHEQTHNEKSPYA-SLCQVEFGNFNNLSNHSGNNVNYNASQQCQAPG
:::.: :.::. :.. :....:: . : :....::..:.
CCDS59 ECGKAFNYSSHLNTHKRIHTKEQPYKCKECGKAFNQYSNLTTHNKIHTGEKLYKPEDVTV
740 750 760 770 780 790
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pF1KB9 VQKYEVSESDQMSGVKAESQDFIPGSTGQPCLPNVLLESEQSNPFCSYSEHQEKNDVFLY
CCDS59 ILTTPQTFSNIK
800
>>CCDS12413.2 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 (809 aa)
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pF1KB9 MMAENNLKMLKIQQCVVANKLPRNRPYVCNICFKHFETPSKLARHYLIHTGQ
: . : :. : : :. : :. : .:.::.
CCDS12 NTGEKPYTCEECGKVFNWSSRLTTHKKNYTRYKLYKCEECGKAFNKSSILTTHKIIRTGE
230 240 250 260 270 280
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pF1KB9 KPFECDVCHKTFRQLVHLERHQLTHS--LPFKCSICQRHFKNLKTFVKHQQLHNETYQNN
: ..: : :.: : .: .:. : :.:: : . :. .:..::...:. .
CCDS12 KFYKCKECAKAFNQSSNLTEHKKIHPGEKPYKCEECGKAFNWPSTLTKHKRIHTGEKPYT
290 300 310 320 330 340
120 130 140 150 160
pF1KB9 VKQVRRLLEAKQEKSMYGVYNTFTTEERWALHPCSKSDPMYS----MKRRKNIHA-----
.. . : .. : ... . : :. .. :.. .: . ..:.::.
CCDS12 CEECGK---AFNQFSNLTTHKRIHTAEK--FYKCTECGEAFSRSSNLTKHKKIHTEKKPY
350 360 370 380 390
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 -CTICGKMFPSQSKLDRHVLIHTGQRPFKCVLCTKSFRQSTHLKIHQLTHSEERPFQCCF
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CCDS12 KCEECGKAFKWSSKLTEHKLTHTGEKPYKCEECGKAFNWPSTLTKHNRIHTGEKPYKCEV
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]