Result of FASTA (omim) for
pF1KB9614
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9614, 502 aa
1>>>pF1KB9614 502 - 502 aa - 502 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.8795+/-0.000661; mu= 12.5501+/- 0.041
mean_var=276.8334+/-59.565, 0's: 0 Z-trim(112.0): 2078 B-trim: 393 in 2/52
Lambda= 0.077084
statistics sampled from 18375 (20711) to 18375 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.56), E-opt: 0.2 (0.243), width: 16
Scan time: 9.140
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_694563 (OMIM: 194480) zinc finger protein 3 hom ( 502) 3557 410.2 6.9e-114
NP_001291423 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 ( 585) 1791 213.9 9.9e-55
NP_001291422 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 ( 585) 1791 213.9 9.9e-55
NP_001291421 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 ( 643) 1791 214.0 1e-54
NP_666016 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 is ( 643) 1791 214.0 1e-54
NP_001276331 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 616) 1782 213.0 2e-54
XP_016882731 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 621) 1782 213.0 2e-54
XP_005272399 (OMIM: 601262) PREDICTED: zinc finger ( 542) 1781 212.8 2.1e-54
XP_016882730 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 628) 1782 213.0 2.1e-54
XP_016882729 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 658) 1782 213.0 2.1e-54
NP_001276330 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 658) 1782 213.0 2.1e-54
NP_003427 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 670) 1782 213.0 2.1e-54
XP_006723426 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1782 213.0 2.1e-54
XP_006723425 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1782 213.0 2.1e-54
XP_005259268 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1782 213.0 2.1e-54
NP_009065 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 682) 1782 213.0 2.1e-54
XP_011515600 (OMIM: 601262) PREDICTED: zinc finger ( 682) 1781 212.9 2.3e-54
XP_005272398 (OMIM: 601262) PREDICTED: zinc finger ( 682) 1781 212.9 2.3e-54
NP_001025147 (OMIM: 601262) zinc finger protein 16 ( 682) 1781 212.9 2.3e-54
NP_008889 (OMIM: 601262) zinc finger protein 16 [H ( 682) 1781 212.9 2.3e-54
NP_001305822 (OMIM: 602277) zinc finger protein 18 ( 675) 1731 207.4 1.1e-52
XP_011513163 (OMIM: 602277) PREDICTED: zinc finger ( 675) 1731 207.4 1.1e-52
NP_009080 (OMIM: 602277) zinc finger protein 184 i ( 751) 1731 207.4 1.2e-52
NP_001305820 (OMIM: 602277) zinc finger protein 18 ( 751) 1731 207.4 1.2e-52
NP_001305821 (OMIM: 602277) zinc finger protein 18 ( 751) 1731 207.4 1.2e-52
NP_003424 (OMIM: 604074) zinc finger protein 132 [ ( 706) 1720 206.2 2.6e-52
NP_001309068 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 1715 205.7 4e-52
NP_001309067 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 1715 205.7 4e-52
NP_001309066 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 1715 205.7 4e-52
NP_001309060 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1715 205.7 4.1e-52
NP_001309065 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1715 205.7 4.1e-52
NP_001309059 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1715 205.7 4.1e-52
NP_001309063 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1715 205.7 4.1e-52
NP_001096073 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1715 205.7 4.1e-52
NP_001309058 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1715 205.7 4.1e-52
NP_001309062 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1715 205.7 4.1e-52
XP_016882935 (OMIM: 600398) PREDICTED: zinc finger ( 818) 1715 205.7 4.1e-52
NP_001309061 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1715 205.7 4.1e-52
NP_150630 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 i ( 818) 1715 205.7 4.1e-52
NP_001309064 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1715 205.7 4.1e-52
NP_001309057 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1715 205.7 4.1e-52
NP_942596 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 i ( 818) 1715 205.7 4.1e-52
XP_016882934 (OMIM: 600398) PREDICTED: zinc finger ( 837) 1715 205.7 4.2e-52
XP_016881871 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 527) 1710 204.9 4.8e-52
NP_001317411 (OMIM: 613904) zinc finger protein 56 ( 527) 1710 204.9 4.8e-52
XP_016881869 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 527) 1710 204.9 4.8e-52
XP_016881868 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 527) 1710 204.9 4.8e-52
XP_016881867 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 650) 1710 205.0 5.4e-52
XP_016881865 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 686) 1710 205.0 5.5e-52
NP_689697 (OMIM: 613904) zinc finger protein 569 i ( 686) 1710 205.0 5.5e-52
>>NP_694563 (OMIM: 194480) zinc finger protein 3 homolog (502 aa)
initn: 3557 init1: 3557 opt: 3557 Z-score: 2165.6 bits: 410.2 E(85289): 6.9e-114
Smith-Waterman score: 3557; 100.0% identity (100.0% similar) in 502 aa overlap (1-502:1-502)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MGTENKEVIPKEEISEESEPHGSLLEKFPKVVYQGHEFGAGCEEDMLEGHSRESMEEVIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_694 MGTENKEVIPKEEISEESEPHGSLLEKFPKVVYQGHEFGAGCEEDMLEGHSRESMEEVIE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 QMSPQERDFPSGLMIFKKSPSSEKDRENNESERGCSPSPNLVTHQGDTTEGVSAFATSGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_694 QMSPQERDFPSGLMIFKKSPSSEKDRENNESERGCSPSPNLVTHQGDTTEGVSAFATSGQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 NFLEILESNKTQRSSVGEKPHTCKECGKAFNQNSHLIQHMRVHSGEKPFECKECGKTFGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_694 NFLEILESNKTQRSSVGEKPHTCKECGKAFNQNSHLIQHMRVHSGEKPFECKECGKTFGT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 NSSLRRHLRIHAGEKPFACNECGKAFIQSSHLIHHHRIHTGERPYKCEECGKAFSQNSAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_694 NSSLRRHLRIHAGEKPFACNECGKAFIQSSHLIHHHRIHTGERPYKCEECGKAFSQNSAL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 ILHQRIHTGEKPYECNECGKTFRVSSQLIQHQRIHTEERYHECNECGKAFKHSSGLIRHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_694 ILHQRIHTGEKPYECNECGKTFRVSSQLIQHQRIHTEERYHECNECGKAFKHSSGLIRHQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 KIHTGEKPYLCNECGKGFGQSSELIRHQRIHTGDKPYECNECGKTFGQNSEIIRHIRIHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_694 KIHTGEKPYLCNECGKGFGQSSELIRHQRIHTGDKPYECNECGKTFGQNSEIIRHIRIHT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 GEKPYVCKECGKAFRGNSELLRHERIHTGEKPYECFECGKAFRRTSHLIVHQRIHTGEKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_694 GEKPYVCKECGKAFRGNSELLRHERIHTGEKPYECFECGKAFRRTSHLIVHQRIHTGEKP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 HQCNECARTFWDNSELLLHQKIHIGEKPYECSECEKTFSQHSQLIIHQRIHTGEKPYECQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_694 HQCNECARTFWDNSELLLHQKIHIGEKPYECSECEKTFSQHSQLIIHQRIHTGEKPYECQ
430 440 450 460 470 480
490 500
pF1KB9 ECQKTFSRSSHLLRHQSVHCME
::::::::::::::::::::::
NP_694 ECQKTFSRSSHLLRHQSVHCME
490 500
>>NP_001291423 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 iso (585 aa)
initn: 3512 init1: 1783 opt: 1791 Z-score: 1103.6 bits: 213.9 E(85289): 9.9e-55
Smith-Waterman score: 1795; 51.1% identity (71.4% similar) in 528 aa overlap (2-502:4-527)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MGTENKEVIPKEEISEESE-PHGSLLEKFPKVVYQGHEFGAGCEE--DMLEGHSRESM
: :: ....:.:.. ..::::: .: : : .: . ..: ..
NP_001 MYEGKENVSFELQRDFSQETDFSEASLLEKQQEV----HSAGNIKKEKSNTIDGTVKDET
10 20 30 40 50
60 70 80 90
pF1KB9 EEVIEQMSPQERDF----------PSGLMIFKKSPSSE----KDRENNESERG--CS---
: : . : . ::: . :: : . : . : :: :
NP_001 SPVEECFFSQSSNSYQCHTITGEQPSGCTGLGKSISFDTKLVKHEIINSEERPFKCEELV
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 -P---SPNLVTHQ-GDTTEGVSAFATSGQNFLEILESNKTQRSSVGEKPHTCKECGKAFN
: . .:. :: ..: : . :. : . :: :::: : ::::.:.
NP_001 EPFRCDSQLIQHQENNTEEKPYQCSECGKAFSINEKLIWHQRLHSGEKPFKCVECGKSFS
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 QNSHLIQHMRVHSGEKPFECKECGKTFGTNSSLRRHLRIHAGEKPFACNECGKAFIQSSH
.:: : :. .::::::..:: :::.:..:.:: :: :::.::::. :.:::..: ::
NP_001 YSSHYITHQTIHSGEKPYQCKMCGKAFSVNGSLSRHQRIHTGEKPYQCKECGNGFSCSSA
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 LIHHHRIHTGERPYKCEECGKAFSQNSALILHQRIHTGEKPYECNECGKTFRVSSQLIQH
: :.:.::::.::.:..:::::. :. :: :::::::::::::::::: :: :::: ::
NP_001 YITHQRVHTGEKPYECNDCGKAFNVNAKLIQHQRIHTGEKPYECNECGKGFRCSSQLRQH
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 QRIHTEERYHECNECGKAFKHSSGLIRHQKIHTGEKPYLCNECGKGFGQSSELIRHQRIH
: ::: :. ..:.::::.:.... ::.::.:::::::: :.::::.:. ...::.:::::
NP_001 QSIHTGEKPYQCKECGKGFNNNTKLIQHQRIHTGEKPYECTECGKAFSVKGKLIQHQRIH
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 TGDKPYECNECGKTFGQNSEIIRHIRIHTGEKPYVCKECGKAFRGNSELLRHERIHTGEK
::.::::::::::.: ::.. .:.::::::::: :.:::::: :..:.::.:::::::
NP_001 TGEKPYECNECGKAFRCNSQFRQHLRIHTGEKPYECNECGKAFSVNGKLMRHQRIHTGEK
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KB9 PYECFECGKAFRRTSHLIVHQRIHTGEKPHQCNECARTFWDNSELLLHQKIHIGEKPYEC
:.:: :::. : .:. :.::::::::.::.::...: :..: ::.:: ::::..:
NP_001 PFECNECGRCFTSKRNLLDHHRIHTGEKPYQCKECGKAFSINAKLTRHQRIHTGEKPFKC
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500
pF1KB9 SECEKTFSQHSQLIIHQRIHTGEKPYECQECQKTFSRSSHLLRHQSVHCME
::::.:: :. :.::::::::::..:.:: :.: ..::.::: : :
NP_001 MECEKAFSCSSNYIVHQRIHTGEKPFQCKECGKAFHVNAHLIRHQRSHTGEKPFRCVECG
480 490 500 510 520 530
NP_001 KGFSFSSDYIIHQTVHTWKKPYMCSVCGKAFRFSFQLSQHQSVHSEGKS
540 550 560 570 580
>>NP_001291422 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 iso (585 aa)
initn: 3512 init1: 1783 opt: 1791 Z-score: 1103.6 bits: 213.9 E(85289): 9.9e-55
Smith-Waterman score: 1795; 51.1% identity (71.4% similar) in 528 aa overlap (2-502:4-527)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MGTENKEVIPKEEISEESE-PHGSLLEKFPKVVYQGHEFGAGCEE--DMLEGHSRESM
: :: ....:.:.. ..::::: .: : : .: . ..: ..
NP_001 MYEGKENVSFELQRDFSQETDFSEASLLEKQQEV----HSAGNIKKEKSNTIDGTVKDET
10 20 30 40 50
60 70 80 90
pF1KB9 EEVIEQMSPQERDF----------PSGLMIFKKSPSSE----KDRENNESERG--CS---
: : . : . ::: . :: : . : . : :: :
NP_001 SPVEECFFSQSSNSYQCHTITGEQPSGCTGLGKSISFDTKLVKHEIINSEERPFKCEELV
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 -P---SPNLVTHQ-GDTTEGVSAFATSGQNFLEILESNKTQRSSVGEKPHTCKECGKAFN
: . .:. :: ..: : . :. : . :: :::: : ::::.:.
NP_001 EPFRCDSQLIQHQENNTEEKPYQCSECGKAFSINEKLIWHQRLHSGEKPFKCVECGKSFS
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 QNSHLIQHMRVHSGEKPFECKECGKTFGTNSSLRRHLRIHAGEKPFACNECGKAFIQSSH
.:: : :. .::::::..:: :::.:..:.:: :: :::.::::. :.:::..: ::
NP_001 YSSHYITHQTIHSGEKPYQCKMCGKAFSVNGSLSRHQRIHTGEKPYQCKECGNGFSCSSA
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 LIHHHRIHTGERPYKCEECGKAFSQNSALILHQRIHTGEKPYECNECGKTFRVSSQLIQH
: :.:.::::.::.:..:::::. :. :: :::::::::::::::::: :: :::: ::
NP_001 YITHQRVHTGEKPYECNDCGKAFNVNAKLIQHQRIHTGEKPYECNECGKGFRCSSQLRQH
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 QRIHTEERYHECNECGKAFKHSSGLIRHQKIHTGEKPYLCNECGKGFGQSSELIRHQRIH
: ::: :. ..:.::::.:.... ::.::.:::::::: :.::::.:. ...::.:::::
NP_001 QSIHTGEKPYQCKECGKGFNNNTKLIQHQRIHTGEKPYECTECGKAFSVKGKLIQHQRIH
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 TGDKPYECNECGKTFGQNSEIIRHIRIHTGEKPYVCKECGKAFRGNSELLRHERIHTGEK
::.::::::::::.: ::.. .:.::::::::: :.:::::: :..:.::.:::::::
NP_001 TGEKPYECNECGKAFRCNSQFRQHLRIHTGEKPYECNECGKAFSVNGKLMRHQRIHTGEK
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KB9 PYECFECGKAFRRTSHLIVHQRIHTGEKPHQCNECARTFWDNSELLLHQKIHIGEKPYEC
:.:: :::. : .:. :.::::::::.::.::...: :..: ::.:: ::::..:
NP_001 PFECNECGRCFTSKRNLLDHHRIHTGEKPYQCKECGKAFSINAKLTRHQRIHTGEKPFKC
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500
pF1KB9 SECEKTFSQHSQLIIHQRIHTGEKPYECQECQKTFSRSSHLLRHQSVHCME
::::.:: :. :.::::::::::..:.:: :.: ..::.::: : :
NP_001 MECEKAFSCSSNYIVHQRIHTGEKPFQCKECGKAFHVNAHLIRHQRSHTGEKPFRCVECG
480 490 500 510 520 530
NP_001 KGFSFSSDYIIHQTVHTWKKPYMCSVCGKAFRFSFQLSQHQSVHSEGKS
540 550 560 570 580
>>NP_001291421 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 iso (643 aa)
initn: 3512 init1: 1783 opt: 1791 Z-score: 1103.2 bits: 214.0 E(85289): 1e-54
Smith-Waterman score: 1795; 51.1% identity (71.4% similar) in 528 aa overlap (2-502:62-585)
10 20 30
pF1KB9 MGTENKEVIPKEEISEESE-PHGSLLEKFPK
: :: ....:.:.. ..::::: .
NP_001 GSSPLAAGTGLQGLQTDIQTDNDLTKEMYEGKENVSFELQRDFSQETDFSEASLLEKQQE
40 50 60 70 80 90
40 50 60 70
pF1KB9 VVYQGHEFGAGCEE--DMLEGHSRESMEEVIEQMSPQERDF----------PSGLMIFKK
: : : .: . ..: .. : : . : . ::: . :
NP_001 V----HSAGNIKKEKSNTIDGTVKDETSPVEECFFSQSSNSYQCHTITGEQPSGCTGLGK
100 110 120 130 140
80 90 100 110 120
pF1KB9 SPSSE----KDRENNESERG--CS----P---SPNLVTHQ-GDTTEGVSAFATSGQNFLE
: : . : . : :: : : . .:. :: ..: : . :. :
NP_001 SISFDTKLVKHEIINSEERPFKCEELVEPFRCDSQLIQHQENNTEEKPYQCSECGKAFSI
150 160 170 180 190 200
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 ILESNKTQRSSVGEKPHTCKECGKAFNQNSHLIQHMRVHSGEKPFECKECGKTFGTNSSL
. :: :::: : ::::.:. .:: : :. .::::::..:: :::.:..:.::
NP_001 NEKLIWHQRLHSGEKPFKCVECGKSFSYSSHYITHQTIHSGEKPYQCKMCGKAFSVNGSL
210 220 230 240 250 260
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 RRHLRIHAGEKPFACNECGKAFIQSSHLIHHHRIHTGERPYKCEECGKAFSQNSALILHQ
:: :::.::::. :.:::..: :: : :.:.::::.::.:..:::::. :. :: ::
NP_001 SRHQRIHTGEKPYQCKECGNGFSCSSAYITHQRVHTGEKPYECNDCGKAFNVNAKLIQHQ
270 280 290 300 310 320
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 RIHTGEKPYECNECGKTFRVSSQLIQHQRIHTEERYHECNECGKAFKHSSGLIRHQKIHT
:::::::::::::::: :: :::: ::: ::: :. ..:.::::.:.... ::.::.:::
NP_001 RIHTGEKPYECNECGKGFRCSSQLRQHQSIHTGEKPYQCKECGKGFNNNTKLIQHQRIHT
330 340 350 360 370 380
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 GEKPYLCNECGKGFGQSSELIRHQRIHTGDKPYECNECGKTFGQNSEIIRHIRIHTGEKP
::::: :.::::.:. ...::.:::::::.::::::::::.: ::.. .:.::::::::
NP_001 GEKPYECTECGKAFSVKGKLIQHQRIHTGEKPYECNECGKAFRCNSQFRQHLRIHTGEKP
390 400 410 420 430 440
370 380 390 400 410 420
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: :.:::::: :..:.::.::::::::.:: :::. : .:. :.::::::::.::.
NP_001 YECNECGKAFSVNGKLMRHQRIHTGEKPFECNECGRCFTSKRNLLDHHRIHTGEKPYQCK
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::...: :..: ::.:: ::::..: ::::.:: :. :.::::::::::..:.:: :
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pF1KB9 TFSRSSHLLRHQSVHCME
.: ..::.::: : :
NP_001 AFHVNAHLIRHQRSHTGEKPFRCVECGKGFSFSSDYIIHQTVHTWKKPYMCSVCGKAFRF
570 580 590 600 610 620
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10 20 30
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: :: ....:.:.. ..::::: .
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40 50 60 70
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: : : .: . ..: .. : : . : . ::: . :
NP_666 V----HSAGNIKKEKSNTIDGTVKDETSPVEECFFSQSSNSYQCHTITGEQPSGCTGLGK
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80 90 100 110 120
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: : . : . : :: : : . .:. :: ..: : . :. :
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. :: :::: : ::::.:. .:: : :. .::::::..:: :::.:..:.::
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:: :::.::::. :.:::..: :: : :.:.::::.::.:..:::::. :. :: ::
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:::::::::::::::: :: :::: ::: ::: :. ..:.::::.:.... ::.::.:::
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::::: :.::::.:. ...::.:::::::.::::::::::.: ::.. .:.::::::::
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: :.:::::: :..:.::.::::::::.:: :::. : .:. :.::::::::.::.
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pF1KB9 ECARTFWDNSELLLHQKIHIGEKPYECSECEKTFSQHSQLIIHQRIHTGEKPYECQECQK
::...: :..: ::.:: ::::..: ::::.:: :. :.::::::::::..:.:: :
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pF1KB9 TFSRSSHLLRHQSVHCME
.: ..::.::: : :
NP_666 AFHVNAHLIRHQRSHTGEKPFRCVECGKGFSFSSDYIIHQTVHTWKKPYMCSVCGKAFRF
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10 20 30
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: . :. :::: :.:.: ...:
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40 50 60 70 80 90
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. :. . ::: . : : .:... : .. : .: :. ..:. .: .
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pF1KB9 SPSPNLVTHQGDTTEGVSAFATSGQNFLEILESNKTQRSSVGEKPHTCKECGKAFNQNSH
: .:.: :: : : : . . .. : . : :.. : :::. :.::::::...:
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160 170 180 190 200 210
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::.: :.:.::.:.::.:: : : ..:.: .: :::.::::. :..::..: : . ::.:
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.: ::::.::.: ::::.:: :.. :.: :::::::::.::::.:: : .: :: :::
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280 290 300 310 320 330
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: :. ..:.::::::.:::.: .::.:::::::: :.::::.: : . ::.::: :::.:
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340 350 360 370 380 390
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::::.::::.:.:.. . .: ::::::::: :.::::.: .: : .::: :::::::::
NP_001 PYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYEC
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.::::::...:: ::::::::::..::.:...: .: : ::.:: :::::::..:
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460 470 480 490 500
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..::: . :: :::::::::::::..: ..::.:: :..:: .: :
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>--
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pF1KB9 EERYHECNECGKAFKHSSGLIRHQKIHTGEKPYLCNECGKGFGQSSELIRHQRIHTGDKP
::: ::::::.:..:: : .:.: :::.::
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:::..:::.: :.... .: :::::::::.:..::::: .: : .:.: :::
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pF1KB9 ECGKAFRRTSHLIVHQRIHTGEKPHQCNECARTFWDNSELLLHQKIHIGEKPYECSECEK
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pF1KB9 EEISEESEPHGSLLEKFPKVVYQGHEFGAGCEEDMLEGHSRESMEEVIEQMSPQERDFPS
:. . ::: . : : .:... :
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:.. : :::. :.::::::...: ::.: :.:.::.:.::.:: : : ..:.: .: :::
XP_016 QKTCVKEKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIH
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pF1KB9 AGEKPFACNECGKAFIQSSHLIHHHRIHTGERPYKCEECGKAFSQNSALILHQRIHTGEK
.::::. :..::..: : . ::.:.: ::::.::.: ::::.:: :.. :.: :::::
XP_016 TGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEK
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260 270 280 290 300 310
pF1KB9 PYECNECGKTFRVSSQLIQHQRIHTEERYHECNECGKAFKHSSGLIRHQKIHTGEKPYLC
::::.::::.:: : .: :: :::: :. ..:.::::::.:::.: .::.:::::::: :
XP_016 PYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYEC
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pF1KB9 NECGKGFGQSSELIRHQRIHTGDKPYECNECGKTFGQNSEIIRHIRIHTGEKPYVCKECG
.::::.: : . ::.::: :::.:::::.::::.:.:.. . .: ::::::::: :.:::
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pF1KB9 KAFRGNSELLRHERIHTGEKPYECFECGKAFRRTSHLIVHQRIHTGEKPHQCNECARTFW
:.: .: : .::: ::::::::: .::::::...:: ::::::::::..::.:...:
XP_016 KTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFS
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.: : ::.:: :::::::..: ..::: . :: :::::::::::::..: ..::.::
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pF1KB9 LLRHQSVHCME
:..:: .: :
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Smith-Waterman score: 408; 61.4% identity (85.5% similar) in 83 aa overlap (307-389:539-621)
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 EERYHECNECGKAFKHSSGLIRHQKIHTGEKPYLCNECGKGFGQSSELIRHQRIHTGDKP
::: ::::::.:..:: : .:.: :::.::
XP_016 GEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKP
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pF1KB9 YECNECGKTFGQNSEIIRHIRIHTGEKPYVCKECGKAFRGNSELLRHERIHTGEKPYECF
:::..:::.: :.... .: :::::::::.:..::::: .: : .:.: :::
XP_016 YECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
570 580 590 600 610 620
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pF1KB9 ECGKAFRRTSHLIVHQRIHTGEKPHQCNECARTFWDNSELLLHQKIHIGEKPYECSECEK
>>XP_005272399 (OMIM: 601262) PREDICTED: zinc finger pro (542 aa)
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pF1KB9 EGHSRESMEEVIEQMSPQERDFPSGLMIFKKSPSSEKDRENNESERGCSPSPNLVTHQGD
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XP_005 RQIVHTGEASFMCDDCGKTFSQNSVLKNRHRSHMSEKAYQCSECGKAFRGHSDFSRHQSH
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pF1KB9 -TTEGVSAFATSGQNFLEILESNKTQRSSVGEKPHTCKECGKAFNQNSHLIQHMRVHSGE
..: :. : . .: :.: ..:::. :.:::::: ..:.::::.:.::::
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pF1KB9 KPFECKECGKTFGTNSSLRRHLRIHAGEKPFACNECGKAFIQSSHLIHHHRIHTGERPYK
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XP_005 KPYVCSECGKAFRRSSNLIKHHRTHTGEKPFECGECGKAFSQSAHLRKHQRVHTGEKPYE
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::::..:: : .:: :::::::: :. :::.:..:: ::.:: .::::::: :.::::::
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:..:..: : :.::::::: : ::::.: .: :..:.:::.: ::.:: .::::: :.:
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.:: ::..::::::. : ::.. : ..:.:. :: :: ::.::.:::: :.:::.: ::
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470 480 490 500
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::::::: :::.: : :.::. :.:..:: .: :
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>--
initn: 732 init1: 326 opt: 327 Z-score: 224.0 bits: 51.1 E(85289): 9.7e-06
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::: .:: . : .: .:. :.: :::
XP_005 MGLLRGPLGEKDLDCNGFDSRFSLSPNLMACQEIPTEE
10 20 30
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: : . :..:.:: : :. . :.:.: .:::::: : . .::..: .:::. .
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40 50 60 70 80 90
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:..:::::.::: . ::
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pF1KB9 YECNECGKTFGQNSEIIRHIRIHTGEKPYVCKECGKAFRGNSELLRHERIHTGEKPYECF
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60827320 residues in 85289 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]