FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB9659, 488 aa 1>>>pF1KB9659 488 - 488 aa - 488 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.3432+/-0.00239; mu= 9.2405+/- 0.141 mean_var=255.3323+/-54.661, 0's: 0 Z-trim(99.7): 973 B-trim: 20 in 1/47 Lambda= 0.080264 statistics sampled from 4822 (5849) to 4822 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.437), E-opt: 0.2 (0.18), width: 16 Scan time: 2.510 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS12497.1 ZNF345 gene_id:25850|Hs108|chr19 ( 488) 3503 420.5 2.1e-117 CCDS74387.1 ZNF283 gene_id:284349|Hs108|chr19 ( 540) 2277 278.6 1.2e-74 CCDS46097.1 ZNF283 gene_id:284349|Hs108|chr19 ( 679) 2277 278.7 1.4e-74 CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1058) 2253 276.2 1.2e-73 CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1090) 2253 276.2 1.2e-73 CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 2217 271.8 1.7e-72 CCDS12505.1 ZNF571 gene_id:51276|Hs108|chr19 ( 609) 2074 255.1 1.5e-67 CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 2050 252.4 1.1e-66 CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 2050 252.4 1.1e-66 CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 2050 252.4 1.1e-66 CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 2050 252.4 1.1e-66 CCDS46045.1 ZNF30 gene_id:90075|Hs108|chr19 ( 623) 2044 251.7 1.7e-66 CCDS46044.1 ZNF30 gene_id:90075|Hs108|chr19 ( 624) 2044 251.7 1.7e-66 CCDS76895.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 585) 2024 249.3 8.2e-66 CCDS10900.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 643) 2024 249.4 8.7e-66 CCDS77297.1 ZNF546 gene_id:339327|Hs108|chr19 ( 810) 2010 247.9 3.1e-65 CCDS12548.1 ZNF546 gene_id:339327|Hs108|chr19 ( 836) 2010 247.9 3.1e-65 CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 2001 246.8 6.1e-65 CCDS42537.1 ZNF429 gene_id:353088|Hs108|chr19 ( 674) 1986 245.0 1.9e-64 CCDS33026.2 ZNF780A gene_id:284323|Hs108|chr19 ( 641) 1976 243.8 4.1e-64 CCDS46079.1 ZNF780A gene_id:284323|Hs108|chr19 ( 642) 1976 243.8 4.1e-64 CCDS33097.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 839) 1977 244.1 4.4e-64 CCDS54314.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 840) 1977 244.1 4.4e-64 CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19 ( 678) 1970 243.2 6.9e-64 CCDS32977.1 ZNF85 gene_id:7639|Hs108|chr19 ( 595) 1969 243.0 6.9e-64 CCDS46077.1 ZNF780B gene_id:163131|Hs108|chr19 ( 833) 1971 243.4 7.1e-64 CCDS59367.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 803) 1970 243.3 7.6e-64 CCDS12413.2 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 809) 1970 243.3 7.6e-64 CCDS74321.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 818) 1970 243.3 7.7e-64 CCDS54240.1 ZNF208 gene_id:7757|Hs108|chr19 (1280) 1972 243.8 8.5e-64 CCDS74322.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1159) 1967 243.1 1.2e-63 CCDS42541.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1191) 1967 243.1 1.2e-63 CCDS12496.1 ZNF790 gene_id:388536|Hs108|chr19 ( 636) 1959 241.8 1.6e-63 CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 ( 682) 1955 241.4 2.3e-63 CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 ( 738) 1955 241.5 2.4e-63 CCDS56092.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 580) 1952 241.0 2.7e-63 CCDS42558.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 644) 1952 241.0 2.8e-63 CCDS7198.1 ZNF33B gene_id:7582|Hs108|chr10 ( 778) 1945 240.3 5.5e-63 CCDS82341.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 527) 1931 238.5 1.4e-62 CCDS73089.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 699) 1933 238.9 1.4e-62 CCDS31182.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 810) 1933 239.0 1.5e-62 CCDS44372.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 811) 1933 239.0 1.5e-62 CCDS60514.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 817) 1933 239.0 1.5e-62 CCDS73088.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 829) 1933 239.0 1.5e-62 CCDS82391.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 782) 1932 238.8 1.6e-62 CCDS12503.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 686) 1931 238.6 1.6e-62 CCDS32973.1 ZNF93 gene_id:81931|Hs108|chr19 ( 620) 1930 238.5 1.6e-62 CCDS12859.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 818) 1932 238.9 1.6e-62 CCDS75846.1 ZNF658 gene_id:26149|Hs108|chr9 (1059) 1933 239.1 1.7e-62 CCDS75077.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 465) 1922 237.4 2.6e-62 >>CCDS12497.1 ZNF345 gene_id:25850|Hs108|chr19 (488 aa) initn: 3503 init1: 3503 opt: 3503 Z-score: 2221.4 bits: 420.5 E(32554): 2.1e-117 Smith-Waterman score: 3503; 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CCDS12 SQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQST 580 590 600 610 620 630 440 450 460 470 480 pF1KB9 SLTQHQRIHTGEKLYECKNCGKAYGRDSEFQQHKKSHNGKKLCELETIN ::::.::::::: : :..::::. ..: . .:...:.: CCDS12 HLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG 640 650 660 670 488 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sat Nov 5 08:26:16 2016 done: Sat Nov 5 08:26:16 2016 Total Scan time: 2.510 Total Display time: 0.120 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]