Result of FASTA (ccds) for
pF1KB9663
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9663, 224 aa
1>>>pF1KB9663 224 - 224 aa - 224 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.8381+/-0.00126; mu= 8.1779+/- 0.074
mean_var=195.8644+/-40.361, 0's: 0 Z-trim(108.3): 942 B-trim: 139 in 1/50
Lambda= 0.091642
statistics sampled from 9085 (10101) to 9085 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.653), E-opt: 0.2 (0.31), width: 16
Scan time: 2.120
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS7211.1 ZNF22 gene_id:7570|Hs108|chr10 ( 224) 1579 220.9 5.1e-58
CCDS82409.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 ( 591) 764 113.7 2.6e-25
CCDS42642.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 ( 676) 764 113.8 2.8e-25
CCDS82410.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 ( 697) 764 113.8 2.8e-25
CCDS12959.2 ZNF551 gene_id:90233|Hs108|chr19 ( 670) 761 113.4 3.7e-25
CCDS43619.1 ZNF3 gene_id:7551|Hs108|chr7 ( 446) 758 112.7 3.7e-25
CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 745 111.3 1.7e-24
CCDS75904.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 364) 734 109.5 3e-24
CCDS69562.1 ZNF34 gene_id:80778|Hs108|chr8 ( 539) 735 109.8 3.5e-24
CCDS69664.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 474) 734 109.6 3.5e-24
CCDS47945.1 ZNF34 gene_id:80778|Hs108|chr8 ( 560) 735 109.8 3.5e-24
CCDS6871.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 498) 734 109.6 3.6e-24
CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5 ( 461) 732 109.3 4.1e-24
CCDS233.1 ZNF436 gene_id:80818|Hs108|chr1 ( 470) 731 109.2 4.6e-24
CCDS32980.1 ZNF708 gene_id:7562|Hs108|chr19 ( 563) 729 109.0 6.1e-24
CCDS31418.1 ZNF214 gene_id:7761|Hs108|chr11 ( 606) 727 108.8 7.7e-24
CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3 ( 544) 726 108.6 7.9e-24
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 726 108.7 8.6e-24
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 726 108.7 8.9e-24
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 726 108.7 9e-24
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 726 108.7 9.1e-24
CCDS58523.1 ZNF286B gene_id:729288|Hs108|chr17 ( 522) 724 108.3 9.3e-24
CCDS32973.1 ZNF93 gene_id:81931|Hs108|chr19 ( 620) 725 108.6 9.4e-24
CCDS13812.1 ZNF70 gene_id:7621|Hs108|chr22 ( 446) 721 107.9 1.1e-23
CCDS45852.1 ZNF397 gene_id:84307|Hs108|chr18 ( 534) 722 108.1 1.1e-23
CCDS33093.2 ZNF28 gene_id:7576|Hs108|chr19 ( 718) 723 108.4 1.2e-23
CCDS11179.2 ZNF287 gene_id:57336|Hs108|chr17 ( 761) 723 108.4 1.3e-23
CCDS73997.1 ZNF286A gene_id:57335|Hs108|chr17 ( 511) 720 107.8 1.3e-23
CCDS11172.1 ZNF286A gene_id:57335|Hs108|chr17 ( 521) 720 107.8 1.3e-23
CCDS12501.1 ZNF383 gene_id:163087|Hs108|chr19 ( 475) 719 107.6 1.4e-23
CCDS12638.1 ZNF285 gene_id:26974|Hs108|chr19 ( 590) 720 107.9 1.4e-23
CCDS74389.1 ZNF285 gene_id:26974|Hs108|chr19 ( 597) 720 107.9 1.5e-23
CCDS42462.1 ZNF554 gene_id:115196|Hs108|chr19 ( 538) 717 107.4 1.8e-23
CCDS12414.2 ZNF681 gene_id:148213|Hs108|chr19 ( 645) 717 107.5 2e-23
CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3 ( 754) 718 107.7 2e-23
CCDS2011.1 ZNF514 gene_id:84874|Hs108|chr2 ( 400) 713 106.7 2.2e-23
CCDS12945.1 ZNF471 gene_id:57573|Hs108|chr19 ( 626) 716 107.4 2.2e-23
CCDS45463.1 ZNF629 gene_id:23361|Hs108|chr16 ( 869) 718 107.8 2.2e-23
CCDS12440.2 ZNF792 gene_id:126375|Hs108|chr19 ( 632) 715 107.3 2.4e-23
CCDS62707.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 665) 714 107.1 2.7e-23
CCDS62708.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 667) 714 107.1 2.7e-23
CCDS4645.1 ZKSCAN8 gene_id:7745|Hs108|chr6 ( 578) 713 106.9 2.7e-23
CCDS41300.1 ZSCAN20 gene_id:7579|Hs108|chr1 (1043) 717 107.8 2.7e-23
CCDS64999.1 ZNF7 gene_id:7553|Hs108|chr8 ( 590) 713 107.0 2.7e-23
CCDS12639.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 692) 714 107.2 2.8e-23
CCDS32797.1 ZNF519 gene_id:162655|Hs108|chr18 ( 540) 712 106.8 2.8e-23
CCDS6435.1 ZNF7 gene_id:7553|Hs108|chr8 ( 686) 713 107.0 3e-23
CCDS64996.1 ZNF7 gene_id:7553|Hs108|chr8 ( 697) 713 107.0 3e-23
CCDS42537.1 ZNF429 gene_id:353088|Hs108|chr19 ( 674) 711 106.8 3.6e-23
CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 ( 682) 711 106.8 3.6e-23
>>CCDS7211.1 ZNF22 gene_id:7570|Hs108|chr10 (224 aa)
initn: 1579 init1: 1579 opt: 1579 Z-score: 1155.1 bits: 220.9 E(32554): 5.1e-58
Smith-Waterman score: 1579; 100.0% identity (100.0% similar) in 224 aa overlap (1-224:1-224)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MRLAKPKAGISRSSSQGKAYENKRKTGRQRQKWGMTIRFDSSFSRLRRSLDDKPYKCTEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 MRLAKPKAGISRSSSQGKAYENKRKTGRQRQKWGMTIRFDSSFSRLRRSLDDKPYKCTEC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 EKSFSQSSTLFQHQKIHTGKKSHKCADCGKSFFQSSNLIQHRRIHTGEKPYKCDECGESF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 EKSFSQSSTLFQHQKIHTGKKSHKCADCGKSFFQSSNLIQHRRIHTGEKPYKCDECGESF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 KQSSNLIQHQRIHTGEKPYQCDECGRCFSQSSHLIQHQRTHTGEKPYQCSECGKCFSQSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 KQSSNLIQHQRIHTGEKPYQCDECGRCFSQSSHLIQHQRTHTGEKPYQCSECGKCFSQSS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220
pF1KB9 HLRQHMKVHKEEKPRKTRGKNIRVKTHLPSWKAGTGRKSVAGLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 HLRQHMKVHKEEKPRKTRGKNIRVKTHLPSWKAGTGRKSVAGLR
190 200 210 220
>>CCDS82409.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 (591 aa)
initn: 3899 init1: 734 opt: 764 Z-score: 568.0 bits: 113.7 E(32554): 2.6e-25
Smith-Waterman score: 764; 46.8% identity (79.2% similar) in 216 aa overlap (10-218:124-339)
10 20 30
pF1KB9 MRLAKPKAGISRSSSQGKAYENKRKTGRQR-QKW--GMT
...::.. ...: .:.. : : .
CCDS82 ATHTGEKSNSKPECESPFQWGDTHYSCGECMKHSSTKHVFVQQQRLPSREECYCWECGKS
100 110 120 130 140 150
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 I-RFDSSFSRLRRSLDDKPYKCTECEKSFSQSSTLFQHQKIHTGKKSHKCADCGKSFFQS
. ..:: .. : .::.: :: ::::....: :::..::::. ..:..::::: ..
CCDS82 FSKYDSVSNHQRVHTGKRPYECGECGKSFSHKGSLVQHQRVHTGKRPYECGECGKSFSHK
160 170 180 190 200 210
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 SNLIQHRRIHTGEKPYKCDECGESFKQSSNLIQHQRIHTGEKPYQCDECGRCFSQSSHLI
..:.::.:.::::.::.: :::.::.:...::.:::.::::.::.:.:::.::.:...::
CCDS82 GSLVQHQRVHTGERPYECGECGKSFSQNGTLIKHQRVHTGERPYECEECGKCFTQKGNLI
220 230 240 250 260 270
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 QHQRTHTGEKPYQCSECGKCFSQSSHLRQHMKVHKEEKPRKTR--GKNIRVKTHLPSWKA
:::: ::.:.::.: ::::::::.. : .: .:: .:.: . ::.. : :: . .
CCDS82 QHQRGHTSERPYECEECGKCFSQKGTLTEHHRVHTRERPYECGECGKSFSRKGHLRNHQR
280 290 300 310 320 330
220
pF1KB9 G-TGRKSVAGLR
: ::..
CCDS82 GHTGERPYECGECGKSFSRKGNLIQHQRSHTGERPYECRECRKLFRGKSHLIEHQRVHTG
340 350 360 370 380 390
>--
initn: 1343 init1: 647 opt: 650 Z-score: 486.5 bits: 98.6 E(32554): 8.8e-21
Smith-Waterman score: 650; 50.3% identity (80.0% similar) in 165 aa overlap (54-218:340-504)
30 40 50 60 70 80
pF1KB9 RKTGRQRQKWGMTIRFDSSFSRLRRSLDDKPYKCTECEKSFSQSSTLFQHQKIHTGKKSH
::.: :: ::::....:.:::. :::.. .
CCDS82 ERPYECGECGKSFSRKGHLRNHQRGHTGERPYECGECGKSFSRKGNLIQHQRSHTGERPY
310 320 330 340 350 360
90 100 110 120 130 140
pF1KB9 KCADCGKSFFQSSNLIQHRRIHTGEKPYKCDECGESFKQSSNLIQHQRIHTGEKPYQCDE
.: .: : : .:.::.:.:.::::.::.:.:::.::..::.. :::.::::::..:.:
CCDS82 ECRECRKLFRGKSHLIEHQRVHTGERPYECNECGKSFQDSSGFRVHQRVHTGEKPFECSE
370 380 390 400 410 420
150 160 170 180 190 200
pF1KB9 CGRCFSQSSHLIQHQRTHTGEKPYQCSECGKCFSQSSHLRQHMKVHKEEKPRKTRGKNIR
::. : :: :..:.:.::::.::.:.:::: : ::: : .:.:.: :.: . : .
CCDS82 CGKSFPQSCSLLRHRRVHTGERPYECGECGKSFHQSSSLLRHQKTHTAERPYECRECGKF
430 440 450 460 470 480
210 220
pF1KB9 VKTHLPSWKAGTGRKSVAGLR
.. : .. ::..
CCDS82 FSSLLEHRRVHTGERPYECRECGKTFTRRSAHFKHQRLHTRGKPYECSECGKSFAETFSL
490 500 510 520 530 540
>>CCDS42642.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 (676 aa)
initn: 3899 init1: 734 opt: 764 Z-score: 567.3 bits: 113.8 E(32554): 2.8e-25
Smith-Waterman score: 764; 46.8% identity (79.2% similar) in 216 aa overlap (10-218:209-424)
10 20 30
pF1KB9 MRLAKPKAGISRSSSQGKAYENKRKTGRQR-QKW--GMT
...::.. ...: .:.. : : .
CCDS42 ATHTGEKSNSKPECESPFQWGDTHYSCGECMKHSSTKHVFVQQQRLPSREECYCWECGKS
180 190 200 210 220 230
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 I-RFDSSFSRLRRSLDDKPYKCTECEKSFSQSSTLFQHQKIHTGKKSHKCADCGKSFFQS
. ..:: .. : .::.: :: ::::....: :::..::::. ..:..::::: ..
CCDS42 FSKYDSVSNHQRVHTGKRPYECGECGKSFSHKGSLVQHQRVHTGKRPYECGECGKSFSHK
240 250 260 270 280 290
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 SNLIQHRRIHTGEKPYKCDECGESFKQSSNLIQHQRIHTGEKPYQCDECGRCFSQSSHLI
..:.::.:.::::.::.: :::.::.:...::.:::.::::.::.:.:::.::.:...::
CCDS42 GSLVQHQRVHTGERPYECGECGKSFSQNGTLIKHQRVHTGERPYECEECGKCFTQKGNLI
300 310 320 330 340 350
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 QHQRTHTGEKPYQCSECGKCFSQSSHLRQHMKVHKEEKPRKTR--GKNIRVKTHLPSWKA
:::: ::.:.::.: ::::::::.. : .: .:: .:.: . ::.. : :: . .
CCDS42 QHQRGHTSERPYECEECGKCFSQKGTLTEHHRVHTRERPYECGECGKSFSRKGHLRNHQR
360 370 380 390 400 410
220
pF1KB9 G-TGRKSVAGLR
: ::..
CCDS42 GHTGERPYECGECGKSFSRKGNLIQHQRSHTGERPYECRECRKLFRGKSHLIEHQRVHTG
420 430 440 450 460 470
>--
initn: 1343 init1: 647 opt: 650 Z-score: 485.9 bits: 98.7 E(32554): 9.6e-21
Smith-Waterman score: 650; 50.3% identity (80.0% similar) in 165 aa overlap (54-218:425-589)
30 40 50 60 70 80
pF1KB9 RKTGRQRQKWGMTIRFDSSFSRLRRSLDDKPYKCTECEKSFSQSSTLFQHQKIHTGKKSH
::.: :: ::::....:.:::. :::.. .
CCDS42 ERPYECGECGKSFSRKGHLRNHQRGHTGERPYECGECGKSFSRKGNLIQHQRSHTGERPY
400 410 420 430 440 450
90 100 110 120 130 140
pF1KB9 KCADCGKSFFQSSNLIQHRRIHTGEKPYKCDECGESFKQSSNLIQHQRIHTGEKPYQCDE
.: .: : : .:.::.:.:.::::.::.:.:::.::..::.. :::.::::::..:.:
CCDS42 ECRECRKLFRGKSHLIEHQRVHTGERPYECNECGKSFQDSSGFRVHQRVHTGEKPFECSE
460 470 480 490 500 510
150 160 170 180 190 200
pF1KB9 CGRCFSQSSHLIQHQRTHTGEKPYQCSECGKCFSQSSHLRQHMKVHKEEKPRKTRGKNIR
::. : :: :..:.:.::::.::.:.:::: : ::: : .:.:.: :.: . : .
CCDS42 CGKSFPQSCSLLRHRRVHTGERPYECGECGKSFHQSSSLLRHQKTHTAERPYECRECGKF
520 530 540 550 560 570
210 220
pF1KB9 VKTHLPSWKAGTGRKSVAGLR
.. : .. ::..
CCDS42 FSSLLEHRRVHTGERPYECRECGKTFTRRSAHFKHQRLHTRGKPYECSECGKSFAETFSL
580 590 600 610 620 630
>>CCDS82410.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 (697 aa)
initn: 3899 init1: 734 opt: 764 Z-score: 567.2 bits: 113.8 E(32554): 2.8e-25
Smith-Waterman score: 764; 46.8% identity (79.2% similar) in 216 aa overlap (10-218:230-445)
10 20 30
pF1KB9 MRLAKPKAGISRSSSQGKAYENKRKTGRQR-QKW--GMT
...::.. ...: .:.. : : .
CCDS82 ATHTGEKSNSKPECESPFQWGDTHYSCGECMKHSSTKHVFVQQQRLPSREECYCWECGKS
200 210 220 230 240 250
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 I-RFDSSFSRLRRSLDDKPYKCTECEKSFSQSSTLFQHQKIHTGKKSHKCADCGKSFFQS
. ..:: .. : .::.: :: ::::....: :::..::::. ..:..::::: ..
CCDS82 FSKYDSVSNHQRVHTGKRPYECGECGKSFSHKGSLVQHQRVHTGKRPYECGECGKSFSHK
260 270 280 290 300 310
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 SNLIQHRRIHTGEKPYKCDECGESFKQSSNLIQHQRIHTGEKPYQCDECGRCFSQSSHLI
..:.::.:.::::.::.: :::.::.:...::.:::.::::.::.:.:::.::.:...::
CCDS82 GSLVQHQRVHTGERPYECGECGKSFSQNGTLIKHQRVHTGERPYECEECGKCFTQKGNLI
320 330 340 350 360 370
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 QHQRTHTGEKPYQCSECGKCFSQSSHLRQHMKVHKEEKPRKTR--GKNIRVKTHLPSWKA
:::: ::.:.::.: ::::::::.. : .: .:: .:.: . ::.. : :: . .
CCDS82 QHQRGHTSERPYECEECGKCFSQKGTLTEHHRVHTRERPYECGECGKSFSRKGHLRNHQR
380 390 400 410 420 430
220
pF1KB9 G-TGRKSVAGLR
: ::..
CCDS82 GHTGERPYECGECGKSFSRKGNLIQHQRSHTGERPYECRECRKLFRGKSHLIEHQRVHTG
440 450 460 470 480 490
>--
initn: 1343 init1: 647 opt: 650 Z-score: 485.7 bits: 98.7 E(32554): 9.8e-21
Smith-Waterman score: 650; 50.3% identity (80.0% similar) in 165 aa overlap (54-218:446-610)
30 40 50 60 70 80
pF1KB9 RKTGRQRQKWGMTIRFDSSFSRLRRSLDDKPYKCTECEKSFSQSSTLFQHQKIHTGKKSH
::.: :: ::::....:.:::. :::.. .
CCDS82 ERPYECGECGKSFSRKGHLRNHQRGHTGERPYECGECGKSFSRKGNLIQHQRSHTGERPY
420 430 440 450 460 470
90 100 110 120 130 140
pF1KB9 KCADCGKSFFQSSNLIQHRRIHTGEKPYKCDECGESFKQSSNLIQHQRIHTGEKPYQCDE
.: .: : : .:.::.:.:.::::.::.:.:::.::..::.. :::.::::::..:.:
CCDS82 ECRECRKLFRGKSHLIEHQRVHTGERPYECNECGKSFQDSSGFRVHQRVHTGEKPFECSE
480 490 500 510 520 530
150 160 170 180 190 200
pF1KB9 CGRCFSQSSHLIQHQRTHTGEKPYQCSECGKCFSQSSHLRQHMKVHKEEKPRKTRGKNIR
::. : :: :..:.:.::::.::.:.:::: : ::: : .:.:.: :.: . : .
CCDS82 CGKSFPQSCSLLRHRRVHTGERPYECGECGKSFHQSSSLLRHQKTHTAERPYECRECGKF
540 550 560 570 580 590
210 220
pF1KB9 VKTHLPSWKAGTGRKSVAGLR
.. : .. ::..
CCDS82 FSSLLEHRRVHTGERPYECRECGKTFTRRSAHFKHQRLHTRGKPYECSECGKSFAETFSL
600 610 620 630 640 650
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10 20 30 40
pF1KB9 MRLAKPKAGISRSSSQGKAYENKRKTGRQRQKWGMTIRFDS
: : . :: :. :.. .... :: :
CCDS12 HRRVHTGEMPYQCSDCGKSFSCKSELIQHQRIHSGERPYEC-RECGKSFRQFSNLIRHRS
410 420 430 440 450 460
50 60 70 80 90 100
pF1KB9 SFSRLRRSLDDKPYKCTECEKSFSQSSTLFQHQKIHTGKKSHKCADCGKSFFQSSNLIQH
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CCDS12 IHT------GDRPYECSECEKSFSRKFILIQHQRVHTGERPYECSECGKSFTRKSDLIQH
470 480 490 500 510 520
110 120 130 140 150 160
pF1KB9 RRIHTGEKPYKCDECGESFKQSSNLIQHQRIHTGEKPYQCDECGRCFSQSSHLIQHQRTH
:::::: .::.:.:::.::.: :.::::.:.::::.::.:.:::. ::::. ::::::.:
CCDS12 RRIHTGTRPYECSECGKSFRQRSGLIQHRRLHTGERPYECSECGKSFSQSASLIQHQRVH
530 540 550 560 570 580
170 180 190 200 210
pF1KB9 TGEKPYQCSECGKCFSQSSHLRQHMKVHKEEKPRKTR--GKNIRVKTHL-PSWKAGTGRK
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CCDS12 TGERPYECSECGKSFSQSSSLIQHQRGHTGERPYECSQCGKPFTHKSDLIQHQRVHTGER
590 600 610 620 630 640
220
pF1KB9 SVAGLR
CCDS12 PYECSECGKSFSRKSNLIRHRRVHTEERP
650 660 670
>--
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30 40 50 60 70 80
pF1KB9 NKRKTGRQRQKWGMTIRFDSSFSRLRRSLDDKPYKCTECEKSFSQSSTLFQHQKIHTGKK
..::.:.. ::.: ..: ...::. :::
CCDS12 TGQKMFECSECEESFSKKCHLILHKIIHTGERPYECSDREKAFIHKSEFIHHQRRHTGGV
280 290 300 310 320 330
90 100 110 120 130 140
pF1KB9 SHKCADCGKSFFQSSNLIQHRRIHTGEKPYKCDECGESFKQSSNLIQHQRIHTGEKPYQC
:.:..: :.: .::::.:.:.::::.::.: :::.::.:::.:..:::.:.::.::::
CCDS12 RHECGECRKTFSYKSNLIEHQRVHTGERPYECGECGKSFRQSSSLFRHQRVHSGERPYQC
340 350 360 370 380 390
150 160 170 180 190 200
pF1KB9 DECGRCFSQSSHLIQHQRTHTGEKPYQCSECGKCFSQSSHLRQHMKVHKEEKPRKTRGKN
:::. : : .::.:.:.:::: :::::.::: :: .:.: ::
CCDS12 CECGKSFRQIFNLIRHRRVHTGEMPYQCSDCGKSFSCKSELIQHQRIHSGERPYECRECG
400 410 420 430 440 450
210 220
pF1KB9 IRVKTHLPSWKAGTGRKSVAGLR
CCDS12 KSFRQFSNLIRHRSIHTGDRPYECSECEKSFSRKFILIQHQRVHTGERPYECSECGKSFT
460 470 480 490 500 510
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30 40 50 60 70 80
pF1KB9 NKRKTGRQRQKWGMTIRFDSSFSRLRRSLDDKPYKCTECEKSFSQSSTLFQHQKIHTGKK
.:::.:.:: :.::::: :.:::.::::.:
CCDS43 VGDRPHKCDECSKSFNRTSDLIQHQRIHTGEKPYECNECGKAFSQSSHLIQHQRIHTGEK
200 210 220 230 240 250
90 100 110 120 130 140
pF1KB9 SHKCADCGKSFFQSSNLIQHRRIHTGEKPYKCDECGESFKQSSNLIQHQRIHTGEKPYQC
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CCDS43 PYECSDCGKTFSCSSALILHRRIHTGEKPYECNECGKTFSWSSTLTHHQRIHTGEKPYAC
260 270 280 290 300 310
150 160 170 180 190 200
pF1KB9 DECGRCFSQSSHLIQHQRTHTGEKPYQCSECGKCFSQSSHLRQHMKVHKEEKPRKTRGKN
.:::. ::.:: ::.::: :::::::.:.:::: ::::::: ::...: :::
CCDS43 NECGKAFSRSSTLIHHQRIHTGEKPYECNECGKAFSQSSHLYQHQRIHTGEKPYECMECG
320 330 340 350 360 370
210 220
pF1KB9 IRVKTHLPSWKAGTGRKSVAGLR
CCDS43 GKFTYSSGLIQHQRIHTGENPYECSECGKAFRYSSALVRHQRIHTGEKPLNGIGMSKSSL
380 390 400 410 420 430
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10 20 30 40
pF1KB9 MRLAKPKAGISRSSSQGKAYENKRKTGRQRQKWGMTIRFDS
:: .:.. .:.:. . . : .. . :
CCDS46 GPVNNEFGKSVNVSSNLVTQEPSPEETSTKRSIKQNSNPVKKEKSCKCNEC-GKAFSYCS
180 190 200 210 220 230
50 60 70 80 90 100
pF1KB9 SFSRLRRS-LDDKPYKCTECEKSFSQSSTLFQHQKIHTGKKSHKCADCGKSFFQSSNLIQ
.. : .:. .:::::.::::.::.: .:..::.:::: : .:: .:::.:... .: :
CCDS46 ALIRHQRTHTGEKPYKCNECEKAFSRSENLINHQRIHTGDKPYKCDQCGKGFIEGPSLTQ
240 250 260 270 280 290
110 120 130 140 150 160
pF1KB9 HRRIHTGEKPYKCDECGESFKQSSNLIQHQRIHTGEKPYQCDECGRCFSQSSHLIQHQRT
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CCDS46 HQRIHTGEKPYKCDECGKAFSQRTHLVQHQRIHTGEKPYTCNECGKAFSQRGHFMEHQKI
300 310 320 330 340 350
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 HTGEKPYQCSECGKCFSQSSHLRQHMKVHKEEKPRKTRGKNIRVKTHLPSWKAGTGRKSV
::::::..:.:: : :..:.:: ::.:.: :: :
CCDS46 HTGEKPFKCDECDKTFTRSTHLTQHQKIHTGEKTYKCNECGKAFNGPSTFIRHHMIHTGE
360 370 380 390 400 410
pF1KB9 AGLR
CCDS46 KPYECNECGKAFSQHSNLTQHQKTHTGEKPYDCAECGKSFSYWSSLAQHLKIHTGEKPYK
420 430 440 450 460 470
>--
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10 20 30 40 50 60
pF1KB9 AKPKAGISRSSSQGKAYENKRKTGRQRQKWGMTIRFDSSFSRLRR-SLDDKPYKCTECEK
: .. . ::... :: .::..:.:: :
CCDS46 ECGKSFSYWSSLAQHLKIHTGEKPYKCNECGKAFSYCSSLTQHRRIHTREKPFECSECGK
450 460 470 480 490 500
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 SFSQSSTLFQHQKIHTGKKSHKCADCGKSFFQSSNLIQHRRIHTGEKPYKCDECGESFKQ
.:: :.: :::: :: .:...: .:::.:..::.: .:.:::::::::.: :::..:.
CCDS46 AFSYLSNLNQHQKTHTQEKAYECKECGKAFIRSSSLAKHERIHTGEKPYQCHECGKTFSY
510 520 530 540 550 560
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 SSNLIQHQRIHTGEKPYQCDECGRCFSQSSHLIQHQRTHTGEKPYQCSECGKCFSQSSHL
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CCDS46 GSSLIQHRKIHTGERPYKCNECGRAFNQNIHLTQHKRIHTGAKPYECAECGKAFRHCSSL
570 580 590 600 610 620
190 200 210 220
pF1KB9 RQHMKVHKEEKPRKTRG--KNIRVKTHLPS-WKAGTGRKSVAGLR
::.:.: :::: . :.. ..:: . . ::.:
CCDS46 AQHQKTHTEEKPYQCNKCEKTFSQSSHLTQHQRIHTGEKPYKCNECDKAFSRSTHLTEHQ
630 640 650 660 670 680
CCDS46 NTHTGEKPYNCNECRKTFSQSTYLIQHQRIHSGEKPFGCNDCGKSFRYRSALNKHQRLHP
690 700 710 720 730 740
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10 20 30
pF1KB9 MRLAKPKAGISRSSSQGKAYENKRKTGRQRQKW---GM
: . :.:.. ... .::.. : :
CCDS75 ECGKAFSYCSSLSQHQKSHTGEKPYECSECGKAFSQSSSLIQHQRIHTGEKPYKCSECGR
70 80 90 100 110 120
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 TIRFDSSFSRLRRS-LDDKPYKCTECEKSFSQSSTLFQHQKIHTGKKSHKCADCGKSFFQ
.. ...... .:. .:::.:.::::.::. :.: :::.::::.: ..:.::::.: .
CCDS75 AFSQNANLTKHQRTHTGEKPYRCSECEKAFSDCSALVQHQRIHTGEKPYECSDCGKAFRH
130 140 150 160 170 180
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 SSNLIQHRRIHTGEKPYKCDECGESFKQSSNLIQHQRIHTGEKPYQCDECGRCFSQSSHL
:.:: .:.: :::::::::.:::..:. . .:::::::::::::.: ::. ::::..:
CCDS75 SANLTNHQRTHTGEKPYKCSECGKAFSYCAAFIQHQRIHTGEKPYRCAACGKAFSQSANL
190 200 210 220 230 240
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 IQHQRTHTGEKPYQCSECGKCFSQSSHLRQHMKVHKEEKPRKTRGKNIRVKTHLPSWKAG
.:::::::::::.:::::: ::::..: :.:.: ::: :
CCDS75 TNHQRTHTGEKPYKCSECGKAFSQSTNLIIHQKTHTGEKPYKCNECGKFFSESSALIRHH
250 260 270 280 290 300
220
pF1KB9 TGRKSVAGLR
CCDS75 IIHTGEKPYECNECGKAFNQSSSLSQHQRIHTGVKPYECSECGKAFRCSSAFVRHQRLHA
310 320 330 340 350 360
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30 40 50 60 70 80
pF1KB9 NKRKTGRQRQKWGMTIRFDSSFSRLRRSLDDKPYKCTECEKSFSQSSTLFQHQKIHTGKK
.::::: :: : :: :.:. ::.::::.:
CCDS69 SGEIPYRCDECGKTFTRRPNLMKHQRIHTGEKPYKCGECGKHFSAYSSLIYHQRIHTGEK
290 300 310 320 330 340
90 100 110 120 130 140
pF1KB9 SHKCADCGKSFFQSSNLIQHRRIHTGEKPYKCDECGESFKQSSNLIQHQRIHTGEKPYQC
.:: ::::.: ..: ::.::: ::::::..: :::..: ::::::::::::::::::.:
CCDS69 PYKCNDCGKAFSDGSILIRHRRTHTGEKPFECKECGKGFTQSSNLIQHQRIHTGEKPYKC
350 360 370 380 390 400
150 160 170 180 190
pF1KB9 DECGRCFSQSSHLIQHQRTHTGEKPYQCSECGKCFSQSSHLRQHMKVHKEEKPRKTR--G
.:: . : :...:..:::.:::::::.:..::: ::::.:: ::...: ::: : :
CCDS69 NECEKAFIQKTKLVEHQRSHTGEKPYECNDCGKVFSQSTHLIQHQRIHTGEKPYKCSECG
410 420 430 440 450 460
200 210 220
pF1KB9 KNIRVKTHLPSWKAGTGRKSVAGLR
: .. ...:
CCDS69 KAFHNSSRLIHHQRLHHGEKPYRCSDCKKAFSQSTYLIQHRRIHTGEKPYKCSECGKAFR
470 480 490 500 510 520
>--
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30 40 50 60 70 80
pF1KB9 ENKRKTGRQRQKWGMTIRFDSSFSRLRRSLDDKPYKCTECEKSFSQSSTLFQHQKIHTGK
:..:.:: ::.:: : : : .:...: .:
CCDS69 QRGPRAVTLTNGESSRESGGNLRLLSRPVPDQRPHKCDICEQSFEQRSYLNNHKRVHRSK
140 150 160 170 180 190
90 100 110 120 130
pF1KB9 KSHKCADCGKSFFQSSNLI--QHRRIHTGEKPYKCDECGESFKQSSNLIQHQRIHTGEKP
:.. . :. : :.::. . ..: ::.: . :. ::..:. :.::..:::.:: :::
CCDS69 KTNTVRNSGEIF--SANLVVKEDQKIPTGKKLHYCSYCGKTFRYSANLVKHQRLHTEEKP
200 210 220 230 240 250
140 150 160 170 180 190
pF1KB9 YQCDECGRCFSQSSHLIQHQRTHTGEKPYQCSECGKCFSQSSHLRQHMKVHKEEKPRKTR
:.:::::. :::: ..:.:.: :.:: ::.:.:::: :.. .: .:...:
CCDS69 YKCDECGKAFSQSCEFINHRRMHSGEIPYRCDECGKTFTRRPNLMKHQRIHTGEKPYKCG
260 270 280 290 300 310
200 210 220
pF1KB9 GKNIRVKTHLPSWKAGTGRKSVAGLR
CCDS69 ECGKHFSAYSSLIYHQRIHTGEKPYKCNDCGKAFSDGSILIRHRRTHTGEKPFECKECGK
320 330 340 350 360 370
>>CCDS69664.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 (474 aa)
initn: 3324 init1: 725 opt: 734 Z-score: 547.6 bits: 109.6 E(32554): 3.5e-24
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10 20 30
pF1KB9 MRLAKPKAGISRSSSQGKAYENKRKTGRQRQKW---GM
: . :.:.. ... .::.. : :
CCDS69 ECGKAFSYCSSLSQHQKSHTGEKPYECSECGKAFSQSSSLIQHQRIHTGEKPYKCSECGR
180 190 200 210 220 230
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pF1KB9 TIRFDSSFSRLRRS-LDDKPYKCTECEKSFSQSSTLFQHQKIHTGKKSHKCADCGKSFFQ
.. ...... .:. .:::.:.::::.::. :.: :::.::::.: ..:.::::.: .
CCDS69 AFSQNANLTKHQRTHTGEKPYRCSECEKAFSDCSALVQHQRIHTGEKPYECSDCGKAFRH
240 250 260 270 280 290
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 SSNLIQHRRIHTGEKPYKCDECGESFKQSSNLIQHQRIHTGEKPYQCDECGRCFSQSSHL
:.:: .:.: :::::::::.:::..:. . .:::::::::::::.: ::. ::::..:
CCDS69 SANLTNHQRTHTGEKPYKCSECGKAFSYCAAFIQHQRIHTGEKPYRCAACGKAFSQSANL
300 310 320 330 340 350
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 IQHQRTHTGEKPYQCSECGKCFSQSSHLRQHMKVHKEEKPRKTRGKNIRVKTHLPSWKAG
.:::::::::::.:::::: ::::..: :.:.: ::: :
CCDS69 TNHQRTHTGEKPYKCSECGKAFSQSTNLIIHQKTHTGEKPYKCNECGKFFSESSALIRHH
360 370 380 390 400 410
220
pF1KB9 TGRKSVAGLR
CCDS69 IIHTGEKPYECNECGKAFNQSSSLSQHQRIHTGVKPYECSECGKAFRCSSAFVRHQRLHA
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224 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]