Result of FASTA (ccds) for
pF1KB9665
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9665, 423 aa
1>>>pF1KB9665 423 - 423 aa - 423 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.9898+/-0.00213; mu= 4.2859+/- 0.123
mean_var=268.5143+/-55.797, 0's: 0 Z-trim(102.3): 913 B-trim: 10 in 1/49
Lambda= 0.078269
statistics sampled from 5891 (6884) to 5891 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.521), E-opt: 0.2 (0.211), width: 16
Scan time: 2.770
The best scores are: opt bits E(32554)
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CCDS6871.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 498) 654 88.5 1.5e-17
CCDS233.1 ZNF436 gene_id:80818|Hs108|chr1 ( 470) 630 85.8 9.7e-17
CCDS12504.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19 ( 536) 631 86.0 9.8e-17
CCDS74355.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19 ( 592) 631 86.0 1e-16
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CCDS12975.1 ZSCAN22 gene_id:342945|Hs108|chr19 ( 491) 629 85.7 1.1e-16
CCDS4645.1 ZKSCAN8 gene_id:7745|Hs108|chr6 ( 578) 630 85.9 1.1e-16
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 631 86.1 1.1e-16
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 631 86.1 1.1e-16
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CCDS13812.1 ZNF70 gene_id:7621|Hs108|chr22 ( 446) 627 85.4 1.2e-16
CCDS82393.1 ZNF415 gene_id:55786|Hs108|chr19 ( 325) 620 84.5 1.7e-16
CCDS54939.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 568) 624 85.2 1.8e-16
CCDS4311.2 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 604) 624 85.2 1.8e-16
CCDS7211.1 ZNF22 gene_id:7570|Hs108|chr10 ( 224) 616 83.8 1.8e-16
CCDS54940.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 620) 624 85.3 1.9e-16
CCDS56092.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 580) 623 85.1 1.9e-16
CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5 ( 461) 621 84.8 1.9e-16
CCDS42558.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 644) 623 85.2 2.1e-16
CCDS74207.1 ZSCAN30 gene_id:100101467|Hs108|chr18 ( 307) 617 84.1 2.1e-16
CCDS54313.1 ZNF415 gene_id:55786|Hs108|chr19 ( 555) 620 84.7 2.4e-16
CCDS12860.1 ZNF415 gene_id:55786|Hs108|chr19 ( 555) 620 84.7 2.4e-16
CCDS47352.1 ZNF879 gene_id:345462|Hs108|chr5 ( 563) 620 84.7 2.4e-16
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CCDS82413.1 ZNF544 gene_id:27300|Hs108|chr19 ( 687) 619 84.7 2.9e-16
CCDS82408.1 ZIK1 gene_id:284307|Hs108|chr19 ( 432) 615 84.0 3e-16
CCDS12973.1 ZNF544 gene_id:27300|Hs108|chr19 ( 715) 619 84.8 3e-16
CCDS33122.1 ZNF470 gene_id:388566|Hs108|chr19 ( 717) 619 84.8 3e-16
CCDS31418.1 ZNF214 gene_id:7761|Hs108|chr11 ( 606) 617 84.4 3.2e-16
CCDS82407.1 ZIK1 gene_id:284307|Hs108|chr19 ( 474) 615 84.1 3.2e-16
CCDS33135.1 ZIK1 gene_id:284307|Hs108|chr19 ( 487) 615 84.1 3.2e-16
CCDS47944.1 ZNF251 gene_id:90987|Hs108|chr8 ( 671) 617 84.5 3.4e-16
CCDS4650.1 ZKSCAN3 gene_id:80317|Hs108|chr6 ( 538) 615 84.2 3.4e-16
CCDS2716.1 ZNF660 gene_id:285349|Hs108|chr3 ( 331) 611 83.4 3.5e-16
CCDS31183.1 ZNF37A gene_id:7587|Hs108|chr10 ( 561) 615 84.2 3.5e-16
CCDS11179.2 ZNF287 gene_id:57336|Hs108|chr17 ( 761) 617 84.6 3.6e-16
CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3 ( 544) 614 84.1 3.7e-16
CCDS2011.1 ZNF514 gene_id:84874|Hs108|chr2 ( 400) 610 83.4 4.2e-16
CCDS62707.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 665) 614 84.2 4.2e-16
CCDS62708.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 667) 614 84.2 4.2e-16
CCDS12500.1 ZNF585B gene_id:92285|Hs108|chr19 ( 769) 615 84.4 4.3e-16
CCDS12639.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 692) 614 84.2 4.3e-16
CCDS69562.1 ZNF34 gene_id:80778|Hs108|chr8 ( 539) 612 83.8 4.3e-16
CCDS12499.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 ( 714) 614 84.2 4.4e-16
CCDS47945.1 ZNF34 gene_id:80778|Hs108|chr8 ( 560) 612 83.8 4.5e-16
CCDS32981.1 ZNF675 gene_id:171392|Hs108|chr19 ( 568) 612 83.8 4.5e-16
>>CCDS75904.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 (364 aa)
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220 230 240 250 260 270
pF1KB9 NIREYTLVKSLIIAIVVRKPSVRVLTLFFIREFTLEKNYYLCTQCSKSFSQISDLIKHQR
: : :: : :..:...::: ..: ::::
CCDS75 HQKSHTGEKPYECSECGKAFSQSSSLIQHQRIHTGEKPYK-CSECGRAFSQNANLTKHQR
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280 290 300 310 320 330
pF1KB9 IHTGEKPYKCSECRKAFSQCSALTLHQRIHTGKKPNPCDECGKSFSRRSDLINHQKIHTG
:::::::.::::.::::.::::. :::::::.:: :..:::.: . ..: :::. :::
CCDS75 THTGEKPYRCSECEKAFSDCSALVQHQRIHTGEKPYECSDCGKAFRHSANLTNHQRTHTG
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340 350 360 370 380 390
pF1KB9 EKPYKCDACGKAFSTCTDLIEHQKTHAEEKPYQCVQCSRSCSQLSELTIHEEVHCGEDSQ
::::::. :::::: :. .:.::. :. ::::.:. :... :: ..:: :...: ::
CCDS75 EKPYKCSECGKAFSYCAAFIQHQRIHTGEKPYRCAACGKAFSQSANLTNHQRTHTGEKPY
200 210 220 230 240 250
400 410 420
pF1KB9 NVMNVRKPLVCTPTLFSTRDTVPEKNLMNAVDY
CCDS75 KCSECGKAFSQSTNLIIHQKTHTGEKPYKCNECGKFFSESSALIRHHIIHTGEKPYECNE
260 270 280 290 300 310
>>CCDS69664.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 (474 aa)
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Smith-Waterman score: 654; 58.5% identity (82.3% similar) in 147 aa overlap (241-387:217-362)
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 NIREYTLVKSLIIAIVVRKPSVRVLTLFFIREFTLEKNYYLCTQCSKSFSQISDLIKHQR
: : :: : :..:...::: ..: ::::
CCDS69 HQKSHTGEKPYECSECGKAFSQSSSLIQHQRIHTGEKPYK-CSECGRAFSQNANLTKHQR
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pF1KB9 IHTGEKPYKCSECRKAFSQCSALTLHQRIHTGKKPNPCDECGKSFSRRSDLINHQKIHTG
:::::::.::::.::::.::::. :::::::.:: :..:::.: . ..: :::. :::
CCDS69 THTGEKPYRCSECEKAFSDCSALVQHQRIHTGEKPYECSDCGKAFRHSANLTNHQRTHTG
250 260 270 280 290 300
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 EKPYKCDACGKAFSTCTDLIEHQKTHAEEKPYQCVQCSRSCSQLSELTIHEEVHCGEDSQ
::::::. :::::: :. .:.::. :. ::::.:. :... :: ..:: :...: ::
CCDS69 EKPYKCSECGKAFSYCAAFIQHQRIHTGEKPYRCAACGKAFSQSANLTNHQRTHTGEKPY
310 320 330 340 350 360
400 410 420
pF1KB9 NVMNVRKPLVCTPTLFSTRDTVPEKNLMNAVDY
CCDS69 KCSECGKAFSQSTNLIIHQKTHTGEKPYKCNECGKFFSESSALIRHHIIHTGEKPYECNE
370 380 390 400 410 420
>>CCDS6871.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 (498 aa)
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Smith-Waterman score: 654; 58.5% identity (82.3% similar) in 147 aa overlap (241-387:241-386)
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 NIREYTLVKSLIIAIVVRKPSVRVLTLFFIREFTLEKNYYLCTQCSKSFSQISDLIKHQR
: : :: : :..:...::: ..: ::::
CCDS68 HQKSHTGEKPYECSECGKAFSQSSSLIQHQRIHTGEKPYK-CSECGRAFSQNANLTKHQR
220 230 240 250 260
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 IHTGEKPYKCSECRKAFSQCSALTLHQRIHTGKKPNPCDECGKSFSRRSDLINHQKIHTG
:::::::.::::.::::.::::. :::::::.:: :..:::.: . ..: :::. :::
CCDS68 THTGEKPYRCSECEKAFSDCSALVQHQRIHTGEKPYECSDCGKAFRHSANLTNHQRTHTG
270 280 290 300 310 320
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 EKPYKCDACGKAFSTCTDLIEHQKTHAEEKPYQCVQCSRSCSQLSELTIHEEVHCGEDSQ
::::::. :::::: :. .:.::. :. ::::.:. :... :: ..:: :...: ::
CCDS68 EKPYKCSECGKAFSYCAAFIQHQRIHTGEKPYRCAACGKAFSQSANLTNHQRTHTGEKPY
330 340 350 360 370 380
400 410 420
pF1KB9 NVMNVRKPLVCTPTLFSTRDTVPEKNLMNAVDY
CCDS68 KCSECGKAFSQSTNLIIHQKTHTGEKPYKCNECGKFFSESSALIRHHIIHTGEKPYECNE
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>>CCDS233.1 ZNF436 gene_id:80818|Hs108|chr1 (470 aa)
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pF1KB9 SLIIAIVVRKPSVRVLTLFFIREFTLEKNYYLCTQCSKSFSQISDLIKHQRIHTGEKPYK
: : .:.:.::: :::..:.: :::::::.
CCDS23 KPYECNECGRGFSERSDLIKHYRVHTGERPYKCDECGKNFSQNSDLVRHRRAHTGEKPYH
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280 290 300 310 320 330
pF1KB9 CSECRKAFSQCSALTLHQRIHTGKKPNPCDECGKSFSRRSDLINHQKIHTGEKPYKCDAC
:.:: . ::. : :. ::: :::.:: :. ::::::: : ::.:::::::::::.:. :
CCDS23 CNECGENFSRISHLVQHQRTHTGEKPYECNACGKSFSRSSHLITHQKIHTGEKPYECNEC
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340 350 360 370 380 390
pF1KB9 GKAFSTCTDLIEHQKTHAEEKPYQCVQCSRSCSQLSELTIHEEVHCGEDSQNVMNVRKPL
..:. .:::.::.::. ::::.::::... .: :.: :..:: :: ::
CCDS23 WRSFGERSDLIKHQRTHTGEKPYECVQCGKGFTQSSNLITHQRVHTGE---------KPY
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400 410 420
pF1KB9 VCTPTLFSTRDTVPEKNLMNAVDY
::
CCDS23 ECTECEKSFSRSSALIKHKRVHTD
450 460 470
>--
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Smith-Waterman score: 630; 52.8% identity (75.2% similar) in 161 aa overlap (227-387:115-275)
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pF1KB9 ISVIKVLVKAQTSLNIREYTLVKSLIIAIVVRKPSVRVLTLFFIREFTLEKNYYLCTQCS
: : : :. .: :..:..:.
CCDS23 NAEENPESEEGFESGDRSERQWGDLTAEEWVSYPLQPVTDLLVHKEVHTGIRYHICSHCG
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pF1KB9 KSFSQISDLIKHQRIHTGEKPYKCSECRKAFSQCSALTLHQRIHTGKKPNPCDECGKSFS
:.::::::: .::. :::..:::: :: :.::. : : ::: :::..: :.::::::.
CCDS23 KAFSQISDLNRHQKTHTGDRPYKCYECGKGFSRSSHLIQHQRTHTGERPYDCNECGKSFG
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pF1KB9 RRSDLINHQKIHTGEKPYKCDACGKAFSTCTDLIEHQKTHAEEKPYQCVQCSRSCSQLSE
: : ::.:: :::::::.::. :::.: . ::.::.::. ::::.: .:..: :. :.
CCDS23 RSSHLIQHQTIHTGEKPHKCNECGKSFCRLSHLIQHQRTHSGEKPYECEECGKSFSRSSH
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:. :...: ::
CCDS23 LAQHQRTHTGEKPYECNECGRGFSERSDLIKHYRVHTGERPYKCDECGKNFSQNSDLVRH
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>>CCDS12504.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19 (536 aa)
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pF1KB9 KVLVKAQTSLNIREYTLVKSLIIAIVVRKPSVRVLTLFFIREFTLEKNYYLCTQCSKSFS
:.:. : : :. : : .:.:.::
CCDS12 AFSNRSSIAQHQRVHTGEKPYECNVCGKAFSLRAYLTVHQRIHTGERPYE-CKECGKAFS
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270 280 290 300 310 320
pF1KB9 QISDLIKHQRIHTGEKPYKCSECRKAFSQCSALTLHQRIHTGKKPNPCDECGKSFSRRSD
: : : .:::::::::::::.:::::::: . :. :::.:::.:: : ::::.:: :.
CCDS12 QNSHLAQHQRIHTGEKPYKCQECRKAFSQIAYLAQHQRVHTGEKPYECIECGKAFSNDSS
400 410 420 430 440 450
330 340 350 360 370 380
pF1KB9 LINHQKIHTGEKPYKCDACGKAFSTCTDLIEHQKTHAEEKPYQCVQCSRSCSQLSELTIH
: .::..:::::::.: .:::::: : .: .::. :. :.::.: .:... : ..:. :
CCDS12 LTQHQRVHTGEKPYECTVCGKAFSYCGSLAQHQRIHTGERPYECKECKKTFRQHAHLAHH
460 470 480 490 500 510
390 400 410 420
pF1KB9 EEVHCGEDSQNVMNVRKPLVCTPTLFSTRDTVPEKNLMNAVDY
...: ::
CCDS12 QRIHIGESLSPPNPVNHQVL
520 530
>--
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Smith-Waterman score: 583; 55.6% identity (77.5% similar) in 142 aa overlap (246-387:214-355)
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 TLVKSLIIAIVVRKPSVRVLTLFFIREFTLEKNYYLCTQCSKSFSQISDLIKHQRIHTGE
::. :..: : ::: :.: ::::::::
CCDS12 PKEEKVHKHDTQKRSFKKNLMAIKPKSVCAEKKLLKCNDCEKVFSQSSSLTLHQRIHTGE
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pF1KB9 KPYKCSECRKAFSQCSALTLHQRIHTGKKPNPCDECGKSFSRRSDLINHQKIHTGEKPYK
::::: :: ::::: : :. :::::::.:: : :: :.::. . :..: ..:::::::.
CCDS12 KPYKCIECGKAFSQRSNLVQHQRIHTGEKPYECKECRKAFSQNAHLVQHLRVHTGEKPYE
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pF1KB9 CDACGKAFSTCTDLIEHQKTHAEEKPYQCVQCSRSCSQLSELTIHEEVHCGEDSQNVMNV
: .: :::: . : .::..:. ::::.:..:... :. : .. :..:: ::
CCDS12 CKVCRKAFSQFAYLAQHQRVHTGEKPYECIECGKAFSNRSSIAQHQRVHTGEKPYECNVC
310 320 330 340 350 360
400 410 420
pF1KB9 RKPLVCTPTLFSTRDTVPEKNLMNAVDY
CCDS12 GKAFSLRAYLTVHQRIHTGERPYECKECGKAFSQNSHLAQHQRIHTGEKPYKCQECRKAF
370 380 390 400 410 420
>>CCDS74355.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19 (592 aa)
initn: 627 init1: 627 opt: 631 Z-score: 413.4 bits: 86.0 E(32554): 1e-16
Smith-Waterman score: 631; 54.1% identity (76.4% similar) in 157 aa overlap (231-387:424-579)
210 220 230 240 250 260
pF1KB9 KVLVKAQTSLNIREYTLVKSLIIAIVVRKPSVRVLTLFFIREFTLEKNYYLCTQCSKSFS
:.:. : : :. : : .:.:.::
CCDS74 AFSNRSSIAQHQRVHTGEKPYECNVCGKAFSLRAYLTVHQRIHTGERPYE-CKECGKAFS
400 410 420 430 440 450
270 280 290 300 310 320
pF1KB9 QISDLIKHQRIHTGEKPYKCSECRKAFSQCSALTLHQRIHTGKKPNPCDECGKSFSRRSD
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CCDS74 QNSHLAQHQRIHTGEKPYKCQECRKAFSQIAYLAQHQRVHTGEKPYECIECGKAFSNDSS
460 470 480 490 500 510
330 340 350 360 370 380
pF1KB9 LINHQKIHTGEKPYKCDACGKAFSTCTDLIEHQKTHAEEKPYQCVQCSRSCSQLSELTIH
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CCDS74 LTQHQRVHTGEKPYECTVCGKAFSYCGSLAQHQRIHTGERPYECKECKKTFRQHAHLAHH
520 530 540 550 560 570
390 400 410 420
pF1KB9 EEVHCGEDSQNVMNVRKPLVCTPTLFSTRDTVPEKNLMNAVDY
...: ::
CCDS74 QRIHIGESLSPPNPVNHQVL
580 590
>--
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220 230 240 250 260 270
pF1KB9 TLVKSLIIAIVVRKPSVRVLTLFFIREFTLEKNYYLCTQCSKSFSQISDLIKHQRIHTGE
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CCDS74 PKEEKVHKHDTQKRSFKKNLMAIKPKSVCAEKKLLKCNDCEKVFSQSSSLTLHQRIHTGE
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 KPYKCSECRKAFSQCSALTLHQRIHTGKKPNPCDECGKSFSRRSDLINHQKIHTGEKPYK
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CCDS74 KPYKCIECGKAFSQRSNLVQHQRIHTGEKPYECKECRKAFSQNAHLVQHLRVHTGEKPYE
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 CDACGKAFSTCTDLIEHQKTHAEEKPYQCVQCSRSCSQLSELTIHEEVHCGEDSQNVMNV
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CCDS74 CKVCRKAFSQFAYLAQHQRVHTGEKPYECIECGKAFSNRSSIAQHQRVHTGEKPYECNVC
360 370 380 390 400 410
400 410 420
pF1KB9 RKPLVCTPTLFSTRDTVPEKNLMNAVDY
CCDS74 GKAFSLRAYLTVHQRIHTGERPYECKECGKAFSQNSHLAQHQRIHTGEKPYKCQECRKAF
420 430 440 450 460 470
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220 230 240 250 260 270
pF1KB9 NIREYTLVKSLIIAIVVRKPSVRVLTLFFIREFTLEKNYYLCTQCSKSFSQISDLIKHQR
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CCDS74 HRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYE-CSQCGKAFRQSTHLTQHQR
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pF1KB9 IHTGEKPYKCSECRKAFSQCSALTLHQRIHTGKKPNPCDECGKSFSRRSDLINHQKIHTG
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CCDS74 IHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTG
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pF1KB9 EKPYKCDACGKAFSTCTDLIEHQKTHAEEKPYQCVQCSRSCSQLSELTIHEEVHCGEDSQ
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CCDS74 EKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPY
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400 410 420
pF1KB9 NVMNVRKPLVCTPTLFSTRDTVPEKNLMNAVDY
CCDS74 ECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
570 580 590 600 610
>--
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220 230 240 250 260 270
pF1KB9 NIREYTLVKSLIIAIVVRKPSVRVLTLFFIREFTLEKNYYLCTQCSKSFSQISDLIKHQR
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CCDS74 HQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYE-CSECGKSFSFRSSFSQHER
220 230 240 250 260 270
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 IHTGEKPYKCSECRKAFSQCSALTLHQRIHTGKKPNPCDECGKSFSRRSDLINHQKIHTG
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CCDS74 THTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTG
280 290 300 310 320 330
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 EKPYKCDACGKAFSTCTDLIEHQKTHAEEKPYQCVQCSRSCSQLSELTIHEEVHCGEDSQ
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CCDS74 EKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPY
340 350 360 370 380 390
400 410 420
pF1KB9 NVMNVRKPLVCTPTLFSTRDTVPEKNLMNAVDY
CCDS74 GCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECND
400 410 420 430 440 450
>>CCDS12975.1 ZSCAN22 gene_id:342945|Hs108|chr19 (491 aa)
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230 240 250 260 270 280
pF1KB9 IIAIVVRKPSVRVLTLFFIREFTLEKNYYLCTQCSKSFSQISDLIKHQRIHTGEKPYKCS
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CCDS12 YACSECGKAFSRSTHLAQHQVVHTGAKPHECKECGKAFSRVTHLTQHQRIHTGEKPYKCG
300 310 320 330 340 350
290 300 310 320 330 340
pF1KB9 ECRKAFSQCSALTLHQRIHTGKKPNPCDECGKSFSRRSDLINHQKIHTGEKPYKCDACGK
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CCDS12 ECGKTFSRSTHLTQHQRVHTGERPYECDACGKAFSQSTHLTQHQRIHTGEKPYKCDACGR
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350 360 370 380 390 400
pF1KB9 AFSTCTDLIEHQKTHAEEKPYQCVQCSRSCSQLSELTIHEEVHCGEDSQNVMNVRKPLVC
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CCDS12 AFSDCSALIRHLRIHSGEKPYQCKVCPKAFAQSSSLIEHQRIHTGEKPYKCSDCGKAFSR
420 430 440 450 460 470
410 420
pF1KB9 TPTLFSTRDTVPEKNLMNAVDY
CCDS12 SSALMVHLRIHITVLQ
480 490
>>CCDS4645.1 ZKSCAN8 gene_id:7745|Hs108|chr6 (578 aa)
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pF1KB9 SLIIAIVVRKPSVRVLTLFFIREFTLEKNYYLCTQCSKSFSQISDLIKHQRIHTGEKPYK
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CCDS46 KPYQCNVCGKAFSYRSALLSHQDIHNKVKRYHCKECGKAFSQNTGLILHQRIHTGEKPYQ
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280 290 300 310 320 330
pF1KB9 CSECRKAFSQCSALTLHQRIHTGKKPNPCDECGKSFSRRSDLINHQKIHTGEKPYKCDAC
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CCDS46 CNQCGKAFSQSAGLILHQRIHSGERPYECNECGKAFSHSSHLIGHQRIHTGEKPYECDEC
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340 350 360 370 380 390
pF1KB9 GKAFSTCTDLIEHQKTHAEEKPYQCVQCSRSCSQLSELTIHEEVHCGEDSQNVMNVRKPL
::.: . :: ::..:. ::::.: .:.:. :: : : :...: ::
CCDS46 GKTFRRSSHLIGHQRSHTGEKPYKCNECGRAFSQKSGLIEHQRIHTGERPYKCKECGKAF
470 480 490 500 510 520
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pF1KB9 VCTPTLFSTRDTVPEKNLMNAVDY
CCDS46 NGNTGLIQHLRIHTGEKPYQCNECGKAFIQRSSLIRHQRIHSGEKSESISV
530 540 550 560 570
>>CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 (658 aa)
initn: 626 init1: 626 opt: 631 Z-score: 412.9 bits: 86.1 E(32554): 1.1e-16
Smith-Waterman score: 631; 57.8% identity (80.3% similar) in 147 aa overlap (241-387:458-603)
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 NIREYTLVKSLIIAIVVRKPSVRVLTLFFIREFTLEKNYYLCTQCSKSFSQISDLIKHQR
: : :: : :.::.:.: : . : .:::
CCDS74 HRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYE-CSQCGKAFRQSTHLTQHQR
430 440 450 460 470 480
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 IHTGEKPYKCSECRKAFSQCSALTLHQRIHTGKKPNPCDECGKSFSRRSDLINHQKIHTG
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CCDS74 IHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTG
490 500 510 520 530 540
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 EKPYKCDACGKAFSTCTDLIEHQKTHAEEKPYQCVQCSRSCSQLSELTIHEEVHCGEDSQ
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CCDS74 EKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPY
550 560 570 580 590 600
400 410 420
pF1KB9 NVMNVRKPLVCTPTLFSTRDTVPEKNLMNAVDY
CCDS74 ECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
610 620 630 640 650
>--
initn: 720 init1: 599 opt: 604 Z-score: 396.5 bits: 83.0 E(32554): 9.2e-16
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pF1KB9 NIREYTLVKSLIIAIVVRKPSVRVLTLFFIREFTLEKNYYLCTQCSKSFSQISDLIKHQR
: : :: : :..:.:::: :.. .:.:
CCDS74 HQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYE-CSECGKSFSFRSSFSQHER
260 270 280 290 300 310
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 IHTGEKPYKCSECRKAFSQCSALTLHQRIHTGKKPNPCDECGKSFSRRSDLINHQKIHTG
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CCDS74 THTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTG
320 330 340 350 360 370
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 EKPYKCDACGKAFSTCTDLIEHQKTHAEEKPYQCVQCSRSCSQLSELTIHEEVHCGEDSQ
::::.: :::::. : ::.::.::. ::::.: .:... :: . :: :...: ::
CCDS74 EKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPY
380 390 400 410 420 430
400 410 420
pF1KB9 NVMNVRKPLVCTPTLFSTRDTVPEKNLMNAVDY
CCDS74 GCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECND
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423 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]