Result of FASTA (ccds) for
pF1KB9666
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9666, 481 aa
1>>>pF1KB9666 481 - 481 aa - 481 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.6926+/-0.00103; mu= -8.2804+/- 0.062
mean_var=453.9340+/-92.023, 0's: 0 Z-trim(117.3): 909 B-trim: 0 in 0/54
Lambda= 0.060197
statistics sampled from 17045 (18004) to 17045 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.814), E-opt: 0.2 (0.553), width: 16
Scan time: 4.110
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32890.2 ZNF358 gene_id:140467|Hs108|chr19 ( 568) 3469 315.3 1.1e-85
CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 ( 682) 1132 112.4 1.5e-24
CCDS12977.1 ZNF497 gene_id:162968|Hs108|chr19 ( 498) 1107 110.1 5.6e-24
CCDS58688.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 503) 1098 109.3 9.6e-24
CCDS58687.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 555) 1098 109.4 1e-23
CCDS12957.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 564) 1098 109.4 1e-23
CCDS12956.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 577) 1098 109.4 1.1e-23
CCDS74468.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 616) 1098 109.4 1.1e-23
CCDS58686.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 629) 1098 109.4 1.1e-23
CCDS75904.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 364) 1090 108.5 1.2e-23
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 1096 109.2 1.3e-23
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1096 109.3 1.3e-23
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1096 109.3 1.3e-23
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 1096 109.3 1.3e-23
CCDS69664.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 474) 1090 108.6 1.5e-23
CCDS12497.1 ZNF345 gene_id:25850|Hs108|chr19 ( 488) 1090 108.6 1.5e-23
CCDS6871.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 498) 1090 108.6 1.6e-23
CCDS42639.1 ZNF154 gene_id:7710|Hs108|chr19 ( 437) 1084 108.1 2e-23
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 1079 107.8 3.8e-23
CCDS45463.1 ZNF629 gene_id:23361|Hs108|chr16 ( 869) 1076 107.7 5.3e-23
CCDS12947.1 ZNF71 gene_id:58491|Hs108|chr19 ( 489) 1069 106.8 5.4e-23
CCDS69562.1 ZNF34 gene_id:80778|Hs108|chr8 ( 539) 1069 106.8 5.8e-23
CCDS47945.1 ZNF34 gene_id:80778|Hs108|chr8 ( 560) 1069 106.9 6e-23
CCDS43590.1 ZNF479 gene_id:90827|Hs108|chr7 ( 524) 1068 106.7 6e-23
CCDS47352.1 ZNF879 gene_id:345462|Hs108|chr5 ( 563) 1068 106.8 6.4e-23
CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3 ( 544) 1067 106.7 6.6e-23
CCDS47944.1 ZNF251 gene_id:90987|Hs108|chr8 ( 671) 1069 106.9 6.8e-23
CCDS12959.2 ZNF551 gene_id:90233|Hs108|chr19 ( 670) 1068 106.8 7.2e-23
CCDS12501.1 ZNF383 gene_id:163087|Hs108|chr19 ( 475) 1063 106.3 7.6e-23
CCDS32981.1 ZNF675 gene_id:171392|Hs108|chr19 ( 568) 1063 106.3 8.6e-23
CCDS12491.1 ZNF565 gene_id:147929|Hs108|chr19 ( 499) 1061 106.1 8.9e-23
CCDS35075.1 ZNF782 gene_id:158431|Hs108|chr9 ( 699) 1064 106.5 9.4e-23
CCDS233.1 ZNF436 gene_id:80818|Hs108|chr1 ( 470) 1058 105.8 1e-22
CCDS32973.1 ZNF93 gene_id:81931|Hs108|chr19 ( 620) 1061 106.2 1e-22
CCDS33122.1 ZNF470 gene_id:388566|Hs108|chr19 ( 717) 1062 106.4 1.1e-22
CCDS12854.1 ZNF83 gene_id:55769|Hs108|chr19 ( 516) 1056 105.7 1.2e-22
CCDS75077.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 465) 1054 105.5 1.3e-22
CCDS10681.2 ZNF768 gene_id:79724|Hs108|chr16 ( 540) 1055 105.6 1.3e-22
CCDS32330.1 ZNF774 gene_id:342132|Hs108|chr15 ( 483) 1053 105.4 1.4e-22
CCDS42538.1 ZNF100 gene_id:163227|Hs108|chr19 ( 542) 1054 105.5 1.4e-22
CCDS12980.1 ZNF132 gene_id:7691|Hs108|chr19 ( 706) 1057 105.9 1.4e-22
CCDS6399.1 ZNF696 gene_id:79943|Hs108|chr8 ( 374) 1049 104.9 1.5e-22
CCDS74322.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1159) 1062 106.6 1.5e-22
CCDS42541.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1191) 1062 106.6 1.5e-22
CCDS75076.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 616) 1054 105.6 1.6e-22
CCDS56092.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 580) 1053 105.5 1.6e-22
CCDS75075.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 648) 1054 105.6 1.6e-22
CCDS42558.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 644) 1053 105.5 1.7e-22
CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 1053 105.6 1.9e-22
CCDS12414.2 ZNF681 gene_id:148213|Hs108|chr19 ( 645) 1050 105.3 2.1e-22
>>CCDS32890.2 ZNF358 gene_id:140467|Hs108|chr19 (568 aa)
initn: 3469 init1: 3469 opt: 3469 Z-score: 1651.9 bits: 315.3 E(32554): 1.1e-85
Smith-Waterman score: 3469; 100.0% identity (100.0% similar) in 481 aa overlap (1-481:88-568)
10 20 30
pF1KB9 MSSSFDLDPDVIGPVPLILDPNSDTLSPGD
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DPSYEDLEPVSEDLDPDAEAPGSEPQDPDPMSSSFDLDPDVIGPVPLILDPNSDTLSPGD
60 70 80 90 100 110
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 PKVDPISSGLTATPQVLATSPAVLPAPASPPRPFSCPDCGRAFRRSSGLSQHRRTHSGEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PKVDPISSGLTATPQVLATSPAVLPAPASPPRPFSCPDCGRAFRRSSGLSQHRRTHSGEK
120 130 140 150 160 170
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 PYRCPDCGKSFSHGATLAQHRGIHTGARPYQCAACGKAFGWRSTLLKHRSSHSGEKPHHC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PYRCPDCGKSFSHGATLAQHRGIHTGARPYQCAACGKAFGWRSTLLKHRSSHSGEKPHHC
180 190 200 210 220 230
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 PVCGKAFGHGSLLAQHLRTHGGPRPHKCPVCAKGFGQGSALLKHLRTHTGERPYPCPQCG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PVCGKAFGHGSLLAQHLRTHGGPRPHKCPVCAKGFGQGSALLKHLRTHTGERPYPCPQCG
240 250 260 270 280 290
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 KAFGQSSALLQHQRTHTAERPYRCPHCGKAFGQSSNLQHHLRIHTGERPYACPHCSKAFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KAFGQSSALLQHQRTHTAERPYRCPHCGKAFGQSSNLQHHLRIHTGERPYACPHCSKAFG
300 310 320 330 340 350
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 QSSALLQHLHVHSGERPYRCQLCGKAFGQASSLTKHKRVHEGAAAAAAAAAAAAAAAAAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QSSALLQHLHVHSGERPYRCQLCGKAFGQASSLTKHKRVHEGAAAAAAAAAAAAAAAAAG
360 370 380 390 400 410
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 LGLGPGLSPASMMRPGQVSLLGPDAVSVLGSGLGLSPGTSSGRNPDPGSGPGTLPDPSSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LGLGPGLSPASMMRPGQVSLLGPDAVSVLGSGLGLSPGTSSGRNPDPGSGPGTLPDPSSK
420 430 440 450 460 470
400 410 420 430 440 450
pF1KB9 PLPGSRSTPSPTPVESSDPKAGHDAGPDLVPSPDLDPVPSPDPDPVPSPDPNPVSCPDPC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PLPGSRSTPSPTPVESSDPKAGHDAGPDLVPSPDLDPVPSPDPDPVPSPDPNPVSCPDPC
480 490 500 510 520 530
460 470 480
pF1KB9 SPTRGTVSPALPTGESPEWVQEQGALLGPDG
:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SPTRGTVSPALPTGESPEWVQEQGALLGPDG
540 550 560
>>CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 (682 aa)
initn: 6144 init1: 1105 opt: 1132 Z-score: 554.0 bits: 112.4 E(32554): 1.5e-24
Smith-Waterman score: 1132; 54.4% identity (79.8% similar) in 263 aa overlap (62-324:403-665)
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 KVDPISSGLTATPQVLATSPAVLPAPASPPRPFSCPDCGRAFRRSSGLSQHRRTHSGEKP
.:. : :::. : : :.: .:.:.:.::::
CCDS64 GEKPFECGECGKAFSQSAHLRKHQRVHTGEKPYECNDCGKPFSRVSNLIKHHRVHTGEKP
380 390 400 410 420 430
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 YRCPDCGKSFSHGATLAQHRGIHTGARPYQCAACGKAFGWRSTLLKHRSSHSGEKPHHCP
:.: ::::.::....: ::: :::: .:. : .:::::.. :.: ::. :.::::..:
CCDS64 YKCSDCGKAFSQSSSLIQHRRIHTGEKPHVCNVCGKAFSYSSVLRKHQIIHTGEKPYRCS
440 450 460 470 480 490
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 VCGKAFGHGSLLAQHLRTHGGPRPHKCPVCAKGFGQGSALLKHLRTHTGERPYPCPQCGK
::::::.:.: : :: .: : .:. : :.: ::..: :. : :.::::.:: : .:::
CCDS64 VCGKAFSHSSALIQHQGVHTGDKPYACHECGKTFGRSSNLILHQRVHTGEKPYECTECGK
500 510 520 530 540 550
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 AFGQSSALLQHQRTHTAERPYRCPHCGKAFGQSSNLQHHLRIHTGERPYACPHCSKAFGQ
.:.:::.:.:::: :.. .:..: .:::::..:::: :: ..::::.::.: .:.:.:.:
CCDS64 TFSQSSTLIQHQRIHNGLKPHECNQCGKAFNRSSNLIHHQKVHTGEKPYTCVECGKGFSQ
560 570 580 590 600 610
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 SSALLQHLHVHSGERPYRCQLCGKAFGQASSLTKHKRVHEGAAAAAAAAAAAAAAAAAGL
:: :.:: .:.:::::.:. :::::.: : : .:.:.: :. :: . :
CCDS64 SSHLIQHQIIHTGERPYKCSECGKAFSQRSVLIQHQRIHTGVKPYDCAACGKAFSQRSKL
620 630 640 650 660 670
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 GLGPGLSPASMMRPGQVSLLGPDAVSVLGSGLGLSPGTSSGRNPDPGSGPGTLPDPSSKP
CCDS64 IKHQLIHTRE
680
>--
initn: 752 init1: 752 opt: 787 Z-score: 392.1 bits: 82.5 E(32554): 1.6e-15
Smith-Waterman score: 787; 40.0% identity (68.0% similar) in 275 aa overlap (44-312:127-401)
20 30 40 50 60
pF1KB9 PVPLILDPNSDTLSPGDPKVDPISSGLTATPQVLAT----SPAVLPAPASP--PRPFSCP
:: :. .::.. .: . ..:
CCDS64 AGDVSQVPELGDLCDDVSERDWGVPEGRRLPQSLSQEGDFTPAAMGLLRGPLGEKDLDCN
100 110 120 130 140 150
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 DCGRAFRRSSGLSQHRRTHSGEKPYRCPDCGKSFSHGATLAQHRGIHTGARPYQCAACGK
: : .: .. . :.:. :.::.:.. :. :.:. :. : : :::
CCDS64 GFDSRFSLSPNLMACQEIPTEERPHPYDMGGQSFQHSVDLTGHEGVPTAESPLICNECGK
160 170 180 190 200 210
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 AFGWRSTLLKHRSSHSGEKPHHCPVCGKAFGHGSLLAQHLRTHGGPRPHKCPVCAKGFGQ
.: :.... :.:: : :::.:...:.: .. :.: . . ..: :.:.:
CCDS64 TFQGNPDLIQRQIVHTGEASFMCDDCGKTFSQNSVLKNRHRSHMSEKAYQCSECGKAFRG
220 230 240 250 260 270
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 GSALLKHLRTHTGERPYPCPQCGKAFGQSSALLQHQRTHTAERPYRCPHCGKAFGQSSNL
: . .: :..:::: : .:::::.:.:.: .::..: .:.::.: .::::: .::::
CCDS64 HSDFSRHQSHHSSERPYMCNECGKAFSQNSSLKKHQKSHMSEKPYECNECGKAFRRSSNL
280 290 300 310 320 330
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 QHHLRIHTGERPYACPHCSKAFGQSSALLQHLHVHSGERPYRCQLCGKAFGQASSLTKHK
.: :::.::.::.: .:.::: .:: :..: ..:.::.:..: :::::.:.. : ::.
CCDS64 IQHQRIHSGEKPYVCSECGKAFRRSSNLIKHHRTHTGEKPFECGECGKAFSQSAHLRKHQ
340 350 360 370 380 390
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 RVHEGAAAAAAAAAAAAAAAAAGLGLGPGLSPASMMRPGQVSLLGPDAVSVLGSGLGLSP
::: :
CCDS64 RVHTGEKPYECNDCGKPFSRVSNLIKHHRVHTGEKPYKCSDCGKAFSQSSSLIQHRRIHT
400 410 420 430 440 450
>>CCDS12977.1 ZNF497 gene_id:162968|Hs108|chr19 (498 aa)
initn: 1072 init1: 1072 opt: 1107 Z-score: 544.0 bits: 110.1 E(32554): 5.6e-24
Smith-Waterman score: 1107; 53.8% identity (78.2% similar) in 266 aa overlap (59-324:157-422)
30 40 50 60 70 80
pF1KB9 GDPKVDPISSGLTATPQVLATSPAVLPAPASPPRPFSCPDCGRAFRRSSGLSQHRRTHSG
: .:..: .::.::: : : .:..::::
CCDS12 VHTGEKPYTCPECGKAFAWSSNLSQHQRIHSGEKPYACRECGKAFRAHSQLIHHQETHSG
130 140 150 160 170 180
90 100 110 120 130 140
pF1KB9 EKPYRCPDCGKSFSHGATLAQHRGIHTGARPYQCAACGKAFGWRSTLLKHRSSHSGEKPH
::.:::::::::....::.::: ::: .::.: :::::.: :..:.:: :.: .::
CCDS12 LKPFRCPDCGKSFGRSTTLVQHRRTHTGEKPYECPECGKAFSWNSNFLEHRRVHTGARPH
190 200 210 220 230 240
150 160 170 180 190 200
pF1KB9 HCPVCGKAFGHGSLLAQHLRTHGGPRPHKCPVCAKGFGQGSALLKHLRTHTGERPYPCPQ
: :::::...: ::.::. :.: ::: :: :.:.: . ..: .: :::..:.:.:: .
CCDS12 ACRDCGKAFSQSSNLAEHLKIHAGARPHACPDCGKAFVRVAGLRQHRRTHSSEKPFPCAE
250 260 270 280 290 300
210 220 230 240 250 260
pF1KB9 CGKAFGQSSALLQHQRTHTAERPYRCPHCGKAFGQSSNLQHHLRIHTGERPYACPHCSKA
::::: .:: :::::::::.:::..: .::.:: ..: : .: :.::::.:.:: .:.::
CCDS12 CGKAFRESSQLLQHQRTHTGERPFECAECGQAFVMGSYLAEHRRVHTGEKPHACAQCGKA
310 320 330 340 350 360
270 280 290 300 310 320
pF1KB9 FGQSSALLQHLHVHSGERPYRCQLCGKAFGQASSLTKHKRVHEGAAAAAAAAAAAAAAAA
:.: : ::.: ..::: .:. : ::::: .:.:..:. : : : : . :
CCDS12 FSQRSNLLSHRRTHSGAKPFACADCGKAFRGSSGLAHHRLSHTGERPFACAECGKAFRGS
370 380 390 400 410 420
330 340 350 360 370 380
pF1KB9 AGLGLGPGLSPASMMRPGQVSLLGPDAVSVLGSGLGLSPGTSSGRNPDPGSGPGTLPDPS
CCDS12 SELRQHQRLHSGERPFVCAHCSKAFVRKSELLSHRRTHTGERPYACGECGKPFSHRCNLN
430 440 450 460 470 480
>>CCDS58688.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 (503 aa)
initn: 2158 init1: 1095 opt: 1098 Z-score: 539.7 bits: 109.3 E(32554): 9.6e-24
Smith-Waterman score: 1098; 53.5% identity (81.1% similar) in 254 aa overlap (59-312:219-472)
30 40 50 60 70 80
pF1KB9 GDPKVDPISSGLTATPQVLATSPAVLPAPASPPRPFSCPDCGRAFRRSSGLSQHRRTHSG
: ::. : .::. : :.. :.:.:.:
CCDS58 ILTREGLFECSKCGKACTRRCNLIQHQKVHSEERPYECNECGKFFTYYSSFIIHQRVHTG
190 200 210 220 230 240
90 100 110 120 130 140
pF1KB9 EKPYRCPDCGKSFSHGATLAQHRGIHTGARPYQCAACGKAFGWRSTLLKHRSSHSGEKPH
:.:: ::.::::::. .: .:: .::: :::.:. :::.:. ::.:..:: :.::.:.
CCDS58 ERPYACPECGKSFSQIYSLNSHRKVHTGERPYECGECGKSFSQRSNLMQHRRVHTGERPY
250 260 270 280 290 300
150 160 170 180 190 200
pF1KB9 HCPVCGKAFGHGSLLAQHLRTHGGPRPHKCPVCAKGFGQGSALLKHLRTHTGERPYPCPQ
.: :::.:... : : :.: : :::.: :.:.:...:.:..: : ::::::: : .
CCDS58 ECSECGKSFSQNFSLIYHQRVHTGERPHECNECGKSFSRSSSLIHHRRLHTGERPYECSK
310 320 330 340 350 360
210 220 230 240 250 260
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CCDS58 SVLIQHQRVHIGEKP
550
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CCDS12 SVLIQHQRVHIGEKP
550 560
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CCDS12 SVLIQHQRVHIGEKP
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CCDS74 CGKSFKQSSSFSSHRKVHTGERPYVCGECGKSFSHSSNLKNHQRVHTGERPVECSECSKS
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CCDS74 FSCKSNLIKHLRVHTGERPYECSECGKSFSQSSSLIQHRRVHTGKRPYQCSQCGKSFGCK
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CCDS74 SVLIQHQRVHIGEKP
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CCDS58 ECSECGKSFSQNFSLIYHQRVHTGERPHECNECGKSFSRSSSLIHHRRLHTGERPYECSK
440 450 460 470 480 490
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CCDS58 CGKSFKQSSSFSSHRKVHTGERPYVCGECGKSFSHSSNLKNHQRVHTGERPVECSECSKS
500 510 520 530 540 550
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CCDS58 FSCKSNLIKHLRVHTGERPYECSECGKSFSQSSSLIQHRRVHTGKRPYQCSQCGKSFGCK
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CCDS58 SVLIQHQRVHIGEKP
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10 20 30
pF1KB9 MSSSFDLDPDVIGP---VPLILDP-----------NSDTLSPGDPKVD
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CCDS75 MPPGDSDHGTSDLEKSFNLRP-VLSPQQRVPVEARPRKCETHTESFKNSEILKPHRAK--
10 20 30 40 50
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 PISSGLTATPQVLATSPAVLPAPASPPRPFSCPDCGRAFRRSSGLSQHRRTHSGEKPYRC
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CCDS75 PYACNECGKAFSYCSSLSQHQKSHTGEKPYECSECGKAFSQSSSLIQHQRIHTGEKPYKC
60 70 80 90 100 110
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pF1KB9 PDCGKSFSHGATLAQHRGIHTGARPYQCAACGKAFGWRSTLLKHRSSHSGEKPHHCPVCG
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CCDS75 SECGRAFSQNANLTKHQRTHTGEKPYRCSECEKAFSDCSALVQHQRIHTGEKPYECSDCG
120 130 140 150 160 170
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pF1KB9 KAFGHGSLLAQHLRTHGGPRPHKCPVCAKGFGQGSALLKHLRTHTGERPYPCPQCGKAFG
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CCDS75 KAFRHSANLTNHQRTHTGEKPYKCSECGKAFSYCAAFIQHQRIHTGEKPYRCAACGKAFS
180 190 200 210 220 230
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CCDS75 LIRHHIIHTGEKPYECNECGKAFNQSSSLSQHQRIHTGVKPYECSECGKAFRCSSAFVRH
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CCDS75 QRLHAGE
360
481 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 18:04:28 2016 done: Fri Nov 4 18:04:29 2016
Total Scan time: 4.110 Total Display time: 0.070
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]