Result of FASTA (ccds) for pF1KB9668
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB9668, 498 aa
  1>>>pF1KB9668 498 - 498 aa - 498 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.0661+/-0.00117; mu= 13.0020+/- 0.070
 mean_var=231.0899+/-46.169, 0's: 0 Z-trim(111.1): 945  B-trim: 0 in 0/52
 Lambda= 0.084369
 statistics sampled from 11108 (12126) to 11108 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.691), E-opt: 0.2 (0.372), width:  16
 Scan time:  3.470

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS12977.1 ZNF497 gene_id:162968|Hs108|chr19      ( 498) 3629 455.0 8.9e-128
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19        ( 616) 1736 224.7 2.3e-58
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19        ( 658) 1736 224.7 2.4e-58
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19        ( 670) 1736 224.7 2.4e-58
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19        ( 682) 1736 224.7 2.5e-58
CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8           ( 682) 1724 223.3 6.8e-58
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19      ( 688) 1704 220.9 3.7e-57
CCDS12497.1 ZNF345 gene_id:25850|Hs108|chr19       ( 488) 1694 219.4   7e-57
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12         ( 738) 1692 219.4 1.1e-56
CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6          ( 751) 1691 219.3 1.2e-56
CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3         ( 544) 1679 217.7 2.6e-56
CCDS42537.1 ZNF429 gene_id:353088|Hs108|chr19      ( 674) 1675 217.3 4.2e-56
CCDS56105.1 ZNF835 gene_id:90485|Hs108|chr19       ( 537) 1669 216.4 6.1e-56
CCDS32977.1 ZNF85 gene_id:7639|Hs108|chr19         ( 595) 1656 214.9 1.9e-55
CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19      (1058) 1658 215.5 2.3e-55
CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19      (1090) 1658 215.5 2.3e-55
CCDS82409.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19      ( 591) 1651 214.3 2.9e-55
CCDS56092.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19      ( 580) 1650 214.2 3.2e-55
CCDS42642.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19      ( 676) 1651 214.4 3.2e-55
CCDS82410.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19      ( 697) 1651 214.4 3.2e-55
CCDS42558.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19      ( 644) 1650 214.2 3.4e-55
CCDS33026.2 ZNF780A gene_id:284323|Hs108|chr19     ( 641) 1647 213.9 4.3e-55
CCDS46079.1 ZNF780A gene_id:284323|Hs108|chr19     ( 642) 1647 213.9 4.3e-55
CCDS75077.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4       ( 465) 1642 213.1 5.4e-55
CCDS75076.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4       ( 616) 1642 213.2 6.4e-55
CCDS75075.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4       ( 648) 1642 213.3 6.6e-55
CCDS35067.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9        ( 816) 1643 213.5   7e-55
CCDS35066.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9        ( 852) 1643 213.6 7.2e-55
CCDS59136.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9        ( 854) 1643 213.6 7.2e-55
CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19       ( 678) 1641 213.2 7.4e-55
CCDS12980.1 ZNF132 gene_id:7691|Hs108|chr19        ( 706) 1641 213.2 7.6e-55
CCDS82391.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19       ( 782) 1641 213.3 8.1e-55
CCDS12859.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19       ( 818) 1641 213.3 8.3e-55
CCDS12500.1 ZNF585B gene_id:92285|Hs108|chr19      ( 769) 1640 213.1 8.7e-55
CCDS12499.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19     ( 714) 1633 212.2 1.5e-54
CCDS74353.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19     ( 769) 1633 212.3 1.6e-54
CCDS45463.1 ZNF629 gene_id:23361|Hs108|chr16       ( 869) 1633 212.3 1.7e-54
CCDS14279.1 ZNF41 gene_id:7592|Hs108|chrX          ( 779) 1632 212.2 1.7e-54
CCDS32973.1 ZNF93 gene_id:81931|Hs108|chr19        ( 620) 1630 211.8 1.8e-54
CCDS76895.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16         ( 585) 1629 211.6 1.9e-54
CCDS42539.1 ZNF676 gene_id:163223|Hs108|chr19      ( 588) 1629 211.6 1.9e-54
CCDS10329.2 ZSCAN2 gene_id:54993|Hs108|chr15       ( 614) 1629 211.7 1.9e-54
CCDS10900.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16         ( 643) 1629 211.7   2e-54
CCDS59367.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19         ( 803) 1625 211.3 3.2e-54
CCDS12413.2 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19         ( 809) 1625 211.3 3.2e-54
CCDS74321.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19         ( 818) 1625 211.3 3.2e-54
CCDS46991.1 ZNF721 gene_id:170960|Hs108|chr4       ( 923) 1623 211.2 4.1e-54
CCDS73089.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10        ( 699) 1621 210.8 4.1e-54
CCDS31182.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10        ( 810) 1621 210.8 4.4e-54
CCDS44372.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10        ( 811) 1621 210.8 4.5e-54


>>CCDS12977.1 ZNF497 gene_id:162968|Hs108|chr19           (498 aa)
 initn: 3629 init1: 3629 opt: 3629  Z-score: 2407.5  bits: 455.0 E(32554): 8.9e-128
Smith-Waterman score: 3629; 100.0% identity (100.0% similar) in 498 aa overlap (1-498:1-498)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MESPRGWTLQVAPEEGQVLCNVKTATRGLSEGAVSGGWGAWENSTEVPREAGDGQRQQAT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MESPRGWTLQVAPEEGQVLCNVKTATRGLSEGAVSGGWGAWENSTEVPREAGDGQRQQAT
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 LGAADEQGGPGRELGPADGGRDGAGPRSEPADRALRPSPLPEEPGCRCGECGKAFSQGSY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LGAADEQGGPGRELGPADGGRDGAGPRSEPADRALRPSPLPEEPGCRCGECGKAFSQGSY
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 LLQHRRVHTGEKPYTCPECGKAFAWSSNLSQHQRIHSGEKPYACRECGKAFRAHSQLIHH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LLQHRRVHTGEKPYTCPECGKAFAWSSNLSQHQRIHSGEKPYACRECGKAFRAHSQLIHH
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 QETHSGLKPFRCPDCGKSFGRSTTLVQHRRTHTGEKPYECPECGKAFSWNSNFLEHRRVH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 QETHSGLKPFRCPDCGKSFGRSTTLVQHRRTHTGEKPYECPECGKAFSWNSNFLEHRRVH
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 TGARPHACRDCGKAFSQSSNLAEHLKIHAGARPHACPDCGKAFVRVAGLRQHRRTHSSEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TGARPHACRDCGKAFSQSSNLAEHLKIHAGARPHACPDCGKAFVRVAGLRQHRRTHSSEK
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB9 PFPCAECGKAFRESSQLLQHQRTHTGERPFECAECGQAFVMGSYLAEHRRVHTGEKPHAC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PFPCAECGKAFRESSQLLQHQRTHTGERPFECAECGQAFVMGSYLAEHRRVHTGEKPHAC
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB9 AQCGKAFSQRSNLLSHRRTHSGAKPFACADCGKAFRGSSGLAHHRLSHTGERPFACAECG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 AQCGKAFSQRSNLLSHRRTHSGAKPFACADCGKAFRGSSGLAHHRLSHTGERPFACAECG
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB9 KAFRGSSELRQHQRLHSGERPFVCAHCSKAFVRKSELLSHRRTHTGERPYACGECGKPFS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KAFRGSSELRQHQRLHSGERPFVCAHCSKAFVRKSELLSHRRTHTGERPYACGECGKPFS
              430       440       450       460       470       480

              490        
pF1KB9 HRCNLNEHQKRHGGRAAP
       ::::::::::::::::::
CCDS12 HRCNLNEHQKRHGGRAAP
              490        

>>CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19             (616 aa)
 initn: 6618 init1: 1718 opt: 1736  Z-score: 1161.3  bits: 224.7 E(32554): 2.3e-58
Smith-Waterman score: 1736; 52.0% identity (77.9% similar) in 425 aa overlap (70-494:140-560)

      40        50        60        70        80        90         
pF1KB9 AWENSTEVPREAGDGQRQQATLGAADEQGGPGRELGPADGGRDGAGPRSEPADRALRPSP
                                     : :.   . : :   : : .:   .:. . 
CCDS74 VKTPVLEQWQRNGFGENISLNPDLPHQPMTPERQSPHTWGTR---GKREKPDLNVLQKTC
     110       120       130       140       150          160      

     100       110       120       130       140       150         
pF1KB9 LPEEPGCRCGECGKAFSQGSYLLQHRRVHTGEKPYTCPECGKAFAWSSNLSQHQRIHSGE
       . :.:  .: :::::::..: :..:.:.::::.:: : :: :.:  :: :..:::::.::
CCDS74 VKEKPY-KCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGE
        170        180       190       200       210       220     

     160       170       180       190       200       210         
pF1KB9 KPYACRECGKAFRAHSQLIHHQETHSGLKPFRCPDCGKSFGRSTTLVQHRRTHTGEKPYE
       ::: : .::..:   . ::.::.::.: ::..: .:::::.  ... ::.::::::::::
CCDS74 KPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYE
         230       240       250       260       270       280     

     220       230       240       250       260       270         
pF1KB9 CPECGKAFSWNSNFLEHRRVHTGARPHACRDCGKAFSQSSNLAEHLKIHAGARPHACPDC
       : ::::::  . .. .: :.::: .:. : .::::::.::.:..: .::.: .:. : .:
CCDS74 CSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHEC
         290       300       310       320       330       340     

     280       290       300       310       320       330         
pF1KB9 GKAFVRVAGLRQHRRTHSSEKPFPCAECGKAFRESSQLLQHQRTHTGERPFECAECGQAF
       ::::.... : ::.:::..:::. :.:::::: .:. : .:.: ::::.:. : :::..:
CCDS74 GKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTF
         350       360       370       380       390       400     

     340       350       360       370       380       390         
pF1KB9 VMGSYLAEHRRVHTGEKPHACAQCGKAFSQRSNLLSHRRTHSGAKPFACADCGKAFRGSS
         .: :..:.:.::::::. :.:::::: : ..: .:.: :.: ::. : ::::::  ::
CCDS74 SHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSS
         410       420       430       440       450       460     

     400       410       420       430       440       450         
pF1KB9 GLAHHRLSHTGERPFACAECGKAFRGSSELRQHQRLHSGERPFVCAHCSKAFVRKSELLS
       .:..:.  ::::.:. : .::.::   . : ::::.:.::.:. : .:..:: ..: :. 
CCDS74 SLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIE
         470       480       490       500       510       520     

     460       470       480       490                             
pF1KB9 HRRTHTGERPYACGECGKPFSHRCNLNEHQKRHGGRAAP                     
       :.: :: :.::.:.:::: :::  .:..:.. : :                         
CCDS74 HQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRI
         530       540       550       560       570       580     

CCDS74 HTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
         590       600       610      

>>CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19             (658 aa)
 initn: 6618 init1: 1718 opt: 1736  Z-score: 1161.0  bits: 224.7 E(32554): 2.4e-58
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CCDS74 VKEKPY-KCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGE
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CCDS74 HQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRI
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CCDS74 HTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
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>>CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19             (670 aa)
 initn: 6618 init1: 1718 opt: 1736  Z-score: 1160.9  bits: 224.7 E(32554): 2.4e-58
Smith-Waterman score: 1736; 52.0% identity (77.9% similar) in 425 aa overlap (70-494:194-614)

      40        50        60        70        80        90         
pF1KB9 AWENSTEVPREAGDGQRQQATLGAADEQGGPGRELGPADGGRDGAGPRSEPADRALRPSP
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CCDS12 VKTPVLEQWQRNGFGENISLNPDLPHQPMTPERQSPHTWGTR---GKREKPDLNVLQKTC
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CCDS12 VKEKPY-KCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGE
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       ::: : .::..:   . ::.::.::.: ::..: .:::::.  ... ::.::::::::::
CCDS12 KPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYE
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CCDS12 CSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHEC
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CCDS12 GKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTF
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CCDS12 HQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRI
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CCDS12 HTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
     640       650       660       670

>>CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19             (682 aa)
 initn: 6618 init1: 1718 opt: 1736  Z-score: 1160.8  bits: 224.7 E(32554): 2.5e-58
Smith-Waterman score: 1736; 52.0% identity (77.9% similar) in 425 aa overlap (70-494:206-626)

      40        50        60        70        80        90         
pF1KB9 AWENSTEVPREAGDGQRQQATLGAADEQGGPGRELGPADGGRDGAGPRSEPADRALRPSP
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CCDS54 VKTPVLEQWQRNGFGENISLNPDLPHQPMTPERQSPHTWGTR---GKREKPDLNVLQKTC
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CCDS54 VKEKPY-KCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGE
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       ::: : .::..:   . ::.::.::.: ::..: .:::::.  ... ::.::::::::::
CCDS54 KPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYE
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       : ::::::  . .. .: :.::: .:. : .::::::.::.:..: .::.: .:. : .:
CCDS54 CSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHEC
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pF1KB9 GKAFVRVAGLRQHRRTHSSEKPFPCAECGKAFRESSQLLQHQRTHTGERPFECAECGQAF
       ::::.... : ::.:::..:::. :.:::::: .:. : .:.: ::::.:. : :::..:
CCDS54 GKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTF
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pF1KB9 GLAHHRLSHTGERPFACAECGKAFRGSSELRQHQRLHSGERPFVCAHCSKAFVRKSELLS
       .:..:.  ::::.:. : .::.::   . : ::::.:.::.:. : .:..:: ..: :. 
CCDS54 SLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIE
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pF1KB9 HRRTHTGERPYACGECGKPFSHRCNLNEHQKRHGGRAAP                     
       :.: :: :.::.:.:::: :::  .:..:.. : :                         
CCDS54 HQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRI
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CCDS54 HTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
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>>CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8                (682 aa)
 initn: 3224 init1: 1721 opt: 1724  Z-score: 1152.9  bits: 223.3 E(32554): 6.8e-58
Smith-Waterman score: 1724; 58.7% identity (80.8% similar) in 385 aa overlap (108-492:295-679)

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CCDS64 YQCSECGKAFRGHSDFSRHQSHHSSERPYMCNECGKAFSQNSSLKKHQKSHMSEKPYECN
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pF1KB9 ECGKAFAWSSNLSQHQRIHSGEKPYACRECGKAFRAHSQLIHHQETHSGLKPFRCPDCGK
       ::::::  :::: ::::::::::::.: :::::::  :.::.:..::.: :::.: .:::
CCDS64 ECGKAFRRSSNLIQHQRIHSGEKPYVCSECGKAFRRSSNLIKHHRTHTGEKPFECGECGK
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pF1KB9 SFGRSTTLVQHRRTHTGEKPYECPECGKAFSWNSNFLEHRRVHTGARPHACRDCGKAFSQ
       .:..:. : .:.:.::::::::: .::: ::  ::...:.::::: .:. : ::::::::
CCDS64 AFSQSAHLRKHQRVHTGEKPYECNDCGKPFSRVSNLIKHHRVHTGEKPYKCSDCGKAFSQ
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       ::.: .: .::.: .::.:  :::::   . ::.:.  :..:::. :. ::::: .:: :
CCDS64 SSSLIQHRRIHTGEKPHVCNVCGKAFSYSSVLRKHQIIHTGEKPYRCSVCGKAFSHSSAL
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pF1KB9 LQHQRTHTGERPFECAECGQAFVMGSYLAEHRRVHTGEKPHACAQCGKAFSQRSNLLSHR
       .::: .:::..:. : :::..:  .: :  :.::::::::. :..:::.::: :.:..:.
CCDS64 IQHQGVHTGDKPYACHECGKTFGRSSNLILHQRVHTGEKPYECTECGKTFSQSSTLIQHQ
          510       520       530       540       550       560    

       380       390       400       410       420       430       
pF1KB9 RTHSGAKPFACADCGKAFRGSSGLAHHRLSHTGERPFACAECGKAFRGSSELRQHQRLHS
       : :.: ::  : .:::::  ::.: ::.  ::::.:..:.::::.:  ::.: ::: .:.
CCDS64 RIHNGLKPHECNQCGKAFNRSSNLIHHQKVHTGEKPYTCVECGKGFSQSSHLIQHQIIHT
          570       580       590       600       610       620    

       440       450       460       470       480       490       
pF1KB9 GERPFVCAHCSKAFVRKSELLSHRRTHTGERPYACGECGKPFSHRCNLNEHQKRHGGRAA
       ::::. :..:.::: ..: :..:.: ::: .:: :. ::: ::.: .: .::  :     
CCDS64 GERPYKCSECGKAFSQRSVLIQHQRIHTGVKPYDCAACGKAFSQRSKLIKHQLIHTRE  
          630       640       650       660       670       680    

        
pF1KB9 P

>>CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19           (688 aa)
 initn: 9887 init1: 1688 opt: 1704  Z-score: 1139.7  bits: 220.9 E(32554): 3.7e-57
Smith-Waterman score: 1704; 53.9% identity (79.6% similar) in 393 aa overlap (102-494:136-527)

              80        90       100       110       120       130 
pF1KB9 RELGPADGGRDGAGPRSEPADRALRPSPLPEEPGCRCGECGKAFSQGSYLLQHRRVHTGE
                                     :.:  .: :::::: ..:.: ::. .::::
CCDS12 YFRQGMIIYDKMSIFNQHTYLSQHSRCHSTEKPY-KCKECGKAFRRASHLTQHQSIHTGE
         110       120       130        140       150       160    

             140       150       160       170       180       190 
pF1KB9 KPYTCPECGKAFAWSSNLSQHQRIHSGEKPYACRECGKAFRAHSQLIHHQETHSGLKPFR
       ::: : .:::::. .:.:: :::.:.:::::::.::::::   :::: :.. :.: ::..
CCDS12 KPYECKQCGKAFSRDSQLSLHQRLHTGEKPYACKECGKAFTQSSQLILHHRIHTGEKPYK
          170       180       190       200       210       220    

             200       210       220       230       240       250 
pF1KB9 CPDCGKSFGRSTTLVQHRRTHTGEKPYECPECGKAFSWNSNFLEHRRVHTGARPHACRDC
       : .:::.: ::. :..:...::::::::: ::::::. ::..  :.:.::: . . :..:
CCDS12 CEECGKAFIRSSQLTRHQKVHTGEKPYECKECGKAFTQNSQLTLHQRLHTGEKLYECKEC
          230       240       250       260       270       280    

             260       270       280       290       300       310 
pF1KB9 GKAFSQSSNLAEHLKIHAGARPHACPDCGKAFVRVAGLRQHRRTHSSEKPFPCAECGKAF
        :.:.: :.:  : .::.: .:. : .:::::.  . : ::.. :..:::. : :::.::
CCDS12 RKVFTQLSQLILHKRIHTGEKPYECKECGKAFICGSQLSQHQKIHNGEKPYECKECGRAF
          290       300       310       320       330       340    

             320       330       340       350       360       370 
pF1KB9 RESSQLLQHQRTHTGERPFECAECGQAFVMGSYLAEHRRVHTGEKPHACAQCGKAFSQRS
        ..: :.:::: ::::.:..: :::.::. :: :..:.:.::.:::. : .::: ::. :
CCDS12 IRGSLLMQHQRIHTGEKPYKCEECGKAFIRGSQLTQHQRIHTNEKPYECKECGKMFSHGS
          350       360       370       380       390       400    

             380       390       400       410       420       430 
pF1KB9 NLLSHRRTHSGAKPFACADCGKAFRGSSGLAHHRLSHTGERPFACAECGKAFRGSSELRQ
       .: .:.: :.: ::. : .:::::  .: :..:.  ::::.:. : ::::.:  .::: :
CCDS12 QLTQHQRIHTGEKPYQCKECGKAFNRGSLLTRHQRIHTGEKPYECKECGKTFSRGSELTQ
          410       420       430       440       450       460    

             440       450       460       470       480       490 
pF1KB9 HQRLHSGERPFVCAHCSKAFVRKSELLSHRRTHTGERPYACGECGKPFSHRCNLNEHQKR
       :.:.:.::.:. : .:.:.:.: :.: .:.: ::::.:: : ::   :..  .:..::. 
CCDS12 HERIHTGEKPYECKECGKSFIRGSQLTQHQRIHTGEKPYECKECRMAFTQSSHLSQHQRL
          470       480       490       500       510       520    

                                                                   
pF1KB9 HGGRAAP                                                     
       : :                                                         
CCDS12 HTGEKPYVCNECGKAFARGLLLIQHQRIHTGEKPYQCKECGKAFIRGSQLTQHQRIHTGE
          530       540       550       560       570       580    

>--
 initn: 1930 init1: 680 opt: 680  Z-score: 466.1  bits: 96.2 E(32554): 1.2e-19
Smith-Waterman score: 680; 56.0% identity (78.0% similar) in 159 aa overlap (159-317:528-686)

      130       140       150       160       170       180        
pF1KB9 TGEKPYTCPECGKAFAWSSNLSQHQRIHSGEKPYACRECGKAFRAHSQLIHHQETHSGLK
                                     ::::.: ::::::     ::.::. :.: :
CCDS12 TGEKPYECKECRMAFTQSSHLSQHQRLHTGEKPYVCNECGKAFARGLLLIQHQRIHTGEK
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pF1KB9 PFRCPDCGKSFGRSTTLVQHRRTHTGEKPYECPECGKAFSWNSNFLEHRRVHTGARPHAC
       :..: .:::.: :.. :.::.: ::::::::: ::::::: .:..  :.:.::: .:. :
CCDS12 PYQCKECGKAFIRGSQLTQHQRIHTGEKPYECKECGKAFSHGSQLTLHQRIHTGEKPYEC
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pF1KB9 RDCGKAFSQSSNLAEHLKIHAGARPHACPDCGKAFVRVAGLRQHRRTHSSEKPFPCAECG
       :.: :::.:::.:..: .::.: .:. : .:::::.: . : ::.: : ::: :   :::
CCDS12 RECRKAFTQSSHLSRHQRIHTGEKPYQCKECGKAFTRGSQLTQHQRIHISEKSFEYKECG
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pF1KB9 KAFRESSQLLQHQRTHTGERPFECAECGQAFVMGSYLAEHRRVHTGEKPHACAQCGKAFS
         : ..::.                                                   
CCDS12 IDFSHGSQVYM                                                 
       680                                                         

>>CCDS12497.1 ZNF345 gene_id:25850|Hs108|chr19            (488 aa)
 initn: 6317 init1: 1681 opt: 1694  Z-score: 1134.7  bits: 219.4 E(32554): 7e-57
Smith-Waterman score: 1694; 54.8% identity (79.2% similar) in 394 aa overlap (102-495:87-479)

              80        90       100       110       120       130 
pF1KB9 RELGPADGGRDGAGPRSEPADRALRPSPLPEEPGCRCGECGKAFSQGSYLLQHRRVHTGE
                                     :.:  .: ::::::..:. :  :.:.::::
CCDS12 TDEKLLECKECGKDFSFVSVLVRHQRIHTGEKPY-ECKECGKAFGSGANLAYHQRIHTGE
         60        70        80        90        100       110     

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pF1KB9 KPYTCPECGKAFAWSSNLSQHQRIHSGEKPYACRECGKAFRAHSQLIHHQETHSGLKPFR
       ::. : ::::::. .:::..:::::.::::: :.::::::   : ::.::  ::: ::..
CCDS12 KPFECKECGKAFGSGSNLTHHQRIHTGEKPYECKECGKAFSFGSGLIRHQIIHSGEKPYE
         120       130       140       150       160       170     

             200       210       220       230       240       250 
pF1KB9 CPDCGKSFGRSTTLVQHRRTHTGEKPYECPECGKAFSWNSNFLEHRRVHTGARPHACRDC
       : .:::::.  ..:..:.: ::::::::: .:::::. .::. .:::.::: .:. :. :
CCDS12 CKECGKSFSFESALIRHHRIHTGEKPYECIDCGKAFGSGSNLTQHRRIHTGEKPYECKAC
         180       190       200       210       220       230     

             260       270       280       290       300       310 
pF1KB9 GKAFSQSSNLAEHLKIHAGARPHACPDCGKAFVRVAGLRQHRRTHSSEKPFPCAECGKAF
       : :::..: :..: .::.: .:. : .:::::   ..: .:.: :..:::. : ::::::
CCDS12 GMAFSSGSALTRHQRIHTGEKPYICNECGKAFSFGSALTRHQRIHTGEKPYVCKECGKAF
         240       250       260       270       280       290     

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pF1KB9 RESSQLLQHQRTHTGERPFECAECGQAFVMGSYLAEHRRVHTGEKPHACAQCGKAFSQRS
         .:.: :::: ::::.:.:: :: .::  :: : .:.:.::::::. : .:::.::. :
CCDS12 NSGSDLTQHQRIHTGEKPYECKECEKAFRSGSKLIQHQRMHTGEKPYECKECGKTFSSGS
         300       310       320       330       340       350     

             380       390       400       410       420       430 
pF1KB9 NLLSHRRTHSGAKPFACADCGKAFRGSSGLAHHRLSHTGERPFACAECGKAFRGSSELRQ
       .: .:.: :.: ::. : .::::: ..: : .:.: ::::::. : ::::.: ..: : .
CCDS12 DLTQHHRIHTGEKPYECKECGKAFGSGSKLIQHQLIHTGERPYECKECGKSFSSGSALNR
         360       370       380       390       400       410     

             440       450       460       470       480       490 
pF1KB9 HQRLHSGERPFVCAHCSKAFVRKSELLSHRRTHTGERPYACGECGKPFSHRCNLNEHQKR
       :::.:.::.:. : .:.:::   : : .:.: ::::. : : .::: ...  ....:.: 
CCDS12 HQRIHTGEKPYECKECGKAFYSGSSLTQHQRIHTGEKLYECKNCGKAYGRDSEFQQHKKS
         420       430       440       450       460       470     

                    
pF1KB9 HGGRAAP      
       :.:.         
CCDS12 HNGKKLCELETIN
         480        

>>CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12              (738 aa)
 initn: 11281 init1: 1690 opt: 1692  Z-score: 1131.5  bits: 219.4 E(32554): 1.1e-56
Smith-Waterman score: 1692; 55.7% identity (78.4% similar) in 393 aa overlap (102-494:288-679)

              80        90       100       110       120       130 
pF1KB9 RELGPADGGRDGAGPRSEPADRALRPSPLPEEPGCRCGECGKAFSQGSYLLQHRRVHTGE
                                     :.:  .:::::::::. :.:..: :.::::
CCDS31 TGEKPYNCSQCGKAFSQKSQLTSHQRTHTGEKPY-ECGECGKAFSRKSHLISHWRTHTGE
       260       270       280       290        300       310      

             140       150       160       170       180       190 
pF1KB9 KPYTCPECGKAFAWSSNLSQHQRIHSGEKPYACRECGKAFRAHSQLIHHQETHSGLKPFR
       ::: : :::.::. .::: .:::::.::::. ::::::::  .:::. :..::.: ::: 
CCDS31 KPYGCNECGRAFSEKSNLINHQRIHTGEKPFECRECGKAFSRKSQLVTHHRTHTGTKPFG
        320       330       340       350       360       370      

             200       210       220       230       240       250 
pF1KB9 CPDCGKSFGRSTTLVQHRRTHTGEKPYECPECGKAFSWNSNFLEHRRVHTGARPHACRDC
       : :: :.: ... :..:.  ::::::::: :: :::   :....:.:.::: .::.: .:
CCDS31 CSDCRKAFFEKSELIRHQTIHTGEKPYECSECRKAFRERSSLINHQRTHTGEKPHGCIQC
        380       390       400       410       420       430      

             260       270       280       290       300       310 
pF1KB9 GKAFSQSSNLAEHLKIHAGARPHACPDCGKAFVRVAGLRQHRRTHSSEKPFPCAECGKAF
       ::::::.:.:  :   :.: .:  :  ::::: : . : .:.:::..:::. :.::::::
CCDS31 GKAFSQKSHLISHQMTHTGEKPFICSKCGKAFSRKSQLVRHQRTHTGEKPYECSECGKAF
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             320       330       340       350       360       370 
pF1KB9 RESSQLLQHQRTHTGERPFECAECGQAFVMGSYLAEHRRVHTGEKPHACAQCGKAFSQRS
        :. .: .::: ::::.:. :.:::.:: . :.:  :.:.::::::. :..:::::...:
CCDS31 SEKLSLTNHQRIHTGEKPYVCSECGKAFCQKSHLISHQRTHTGEKPYECSECGKAFGEKS
        500       510       520       530       540       550      

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pF1KB9 NLLSHRRTHSGAKPFACADCGKAFRGSSGLAHHRLSHTGERPFACAECGKAFRGSSELRQ
       .: .:.:::.: ::. : :: :::  .: :  :.  ::::.:. :. : :::  .::: .
CCDS31 SLATHQRTHTGEKPYECRDCEKAFSQKSQLNTHQRIHTGEKPYECSLCRKAFFEKSELIR
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pF1KB9 HQRLHSGERPFVCAHCSKAFVRKSELLSHRRTHTGERPYACGECGKPFSHRCNLNEHQKR
       : : :.::.:. : .: ::: .:: :..:.: ::::.:. :.:::: ::.. .:  ::. 
CCDS31 HLRTHTGEKPYECNECRKAFREKSSLINHQRIHTGEKPFECSECGKAFSRKSHLIPHQRT
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