Result of FASTA (ccds) for
pF1KB9671
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9671, 516 aa
1>>>pF1KB9671 516 - 516 aa - 516 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.6347+/-0.00248; mu= 7.7273+/- 0.145
mean_var=264.3507+/-53.531, 0's: 0 Z-trim(100.0): 962 B-trim: 0 in 0/47
Lambda= 0.078883
statistics sampled from 4921 (5937) to 4921 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.455), E-opt: 0.2 (0.182), width: 16
Scan time: 2.710
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12854.1 ZNF83 gene_id:55769|Hs108|chr19 ( 516) 3717 438.0 1.2e-122
CCDS82391.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 782) 2301 277.1 5e-74
CCDS12859.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 818) 2301 277.1 5.2e-74
CCDS46172.1 ZNF813 gene_id:126017|Hs108|chr19 ( 617) 2178 263.0 7.1e-70
CCDS46164.1 ZNF880 gene_id:400713|Hs108|chr19 ( 577) 2174 262.5 9.4e-70
CCDS33091.1 ZNF528 gene_id:84436|Hs108|chr19 ( 628) 2168 261.8 1.6e-69
CCDS33097.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 839) 2166 261.8 2.2e-69
CCDS54314.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 840) 2166 261.8 2.2e-69
CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19 ( 678) 2163 261.3 2.5e-69
CCDS33090.1 ZNF616 gene_id:90317|Hs108|chr19 ( 781) 2147 259.6 9.5e-69
CCDS33096.1 ZNF816 gene_id:125893|Hs108|chr19 ( 651) 2135 258.1 2.2e-68
CCDS12856.1 ZNF600 gene_id:162966|Hs108|chr19 ( 722) 2080 251.9 1.8e-66
CCDS46784.1 ZNF860 gene_id:344787|Hs108|chr3 ( 632) 2040 247.3 3.9e-65
CCDS46167.1 ZNF808 gene_id:388558|Hs108|chr19 ( 903) 2039 247.4 5.2e-65
CCDS82388.1 ZNF841 gene_id:284371|Hs108|chr19 ( 808) 2036 247.0 6.1e-65
CCDS46161.1 ZNF841 gene_id:284371|Hs108|chr19 ( 924) 2036 247.0 6.7e-65
CCDS46166.1 ZNF534 gene_id:147658|Hs108|chr19 ( 661) 2011 244.0 3.9e-64
CCDS46165.1 ZNF534 gene_id:147658|Hs108|chr19 ( 674) 2011 244.0 4e-64
CCDS33093.2 ZNF28 gene_id:7576|Hs108|chr19 ( 718) 1997 242.5 1.2e-63
CCDS46162.1 ZNF836 gene_id:162962|Hs108|chr19 ( 936) 1982 240.9 4.8e-63
CCDS7198.1 ZNF33B gene_id:7582|Hs108|chr10 ( 778) 1979 240.5 5.4e-63
CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 1977 240.2 6.2e-63
CCDS73089.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 699) 1963 238.6 1.8e-62
CCDS31182.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 810) 1963 238.7 1.9e-62
CCDS44372.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 811) 1963 238.7 2e-62
CCDS60514.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 817) 1963 238.7 2e-62
CCDS73088.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 829) 1963 238.7 2e-62
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 1953 237.4 3.9e-62
CCDS46170.1 ZNF845 gene_id:91664|Hs108|chr19 ( 970) 1937 235.8 1.7e-61
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 1917 233.3 6.2e-61
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1917 233.3 6.5e-61
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1917 233.3 6.5e-61
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 1917 233.3 6.6e-61
CCDS11180.1 ZNF624 gene_id:57547|Hs108|chr17 ( 865) 1913 233.0 1e-60
CCDS74322.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1159) 1912 233.1 1.4e-60
CCDS42541.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1191) 1912 233.1 1.4e-60
CCDS42537.1 ZNF429 gene_id:353088|Hs108|chr19 ( 674) 1902 231.6 2.1e-60
CCDS59367.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 803) 1891 230.5 5.7e-60
CCDS12413.2 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 809) 1891 230.5 5.7e-60
CCDS74321.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 818) 1891 230.5 5.7e-60
CCDS82341.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 527) 1883 229.3 8.3e-60
CCDS12503.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 686) 1883 229.5 9.7e-60
CCDS32973.1 ZNF93 gene_id:81931|Hs108|chr19 ( 620) 1882 229.3 9.9e-60
CCDS32977.1 ZNF85 gene_id:7639|Hs108|chr19 ( 595) 1873 228.2 2e-59
CCDS54240.1 ZNF208 gene_id:7757|Hs108|chr19 (1280) 1876 229.0 2.5e-59
CCDS59369.1 ZNF99 gene_id:7652|Hs108|chr19 ( 864) 1867 227.8 3.9e-59
CCDS75076.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 616) 1863 227.1 4.4e-59
CCDS75075.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 648) 1863 227.2 4.5e-59
CCDS59368.1 ZNF729 gene_id:100287226|Hs108|chr19 (1252) 1867 228.0 4.9e-59
CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 ( 682) 1861 227.0 5.5e-59
>>CCDS12854.1 ZNF83 gene_id:55769|Hs108|chr19 (516 aa)
initn: 3717 init1: 3717 opt: 3717 Z-score: 2315.3 bits: 438.0 E(32554): 1.2e-122
Smith-Waterman score: 3717; 100.0% identity (100.0% similar) in 516 aa overlap (1-516:1-516)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MHGRKDDAQKQPVKNQLGLNPQSHLPELQLFQAEGKIYKYDHMEKSVNSSSLVSPPQRIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MHGRKDDAQKQPVKNQLGLNPQSHLPELQLFQAEGKIYKYDHMEKSVNSSSLVSPPQRIS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 STVKTHISHTYECNFVDSLFTQKEKANIGTEHYKCSERGKAFHQGLHFTIHQIIHTKETQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 STVKTHISHTYECNFVDSLFTQKEKANIGTEHYKCSERGKAFHQGLHFTIHQIIHTKETQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 FKCDICGKIFNKKSNLASHQRIHTGEKPYKCNECGKVFHNMSHLAQHRRIHTGEKPYKCN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 FKCDICGKIFNKKSNLASHQRIHTGEKPYKCNECGKVFHNMSHLAQHRRIHTGEKPYKCN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 ECGKVFNQISHLAQHQRIHTGEKPYKCNECGKVFHQISHLAQHRTIHTGEKPYECNKCGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ECGKVFNQISHLAQHQRIHTGEKPYKCNECGKVFHQISHLAQHRTIHTGEKPYECNKCGK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 VFSRNSYLVQHLIIHTGEKPYRCNVCGKVFHHISHLAQHQRIHTGEKPYKCNECGKVFSH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 VFSRNSYLVQHLIIHTGEKPYRCNVCGKVFHHISHLAQHQRIHTGEKPYKCNECGKVFSH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 KSSLVNHWRIHTGEKPYKCNECGKVFSHKSSLVNHWRIHTGEKPYKCNECGKVFSRNSYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KSSLVNHWRIHTGEKPYKCNECGKVFSHKSSLVNHWRIHTGEKPYKCNECGKVFSRNSYL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 AQHLIIHAGEKPYKCDECDKAFSQNSHLVQHHRIHTGEKPYKCDECGKVFSQNSYLAYHW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 AQHLIIHAGEKPYKCDECDKAFSQNSHLVQHHRIHTGEKPYKCDECGKVFSQNSYLAYHW
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 RIHTGEKAYKCNECGKVFGLNSSLAHHRKIHTGEKPFKCNECGKAFSMRSSLTNHHAIHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RIHTGEKAYKCNECGKVFGLNSSLAHHRKIHTGEKPFKCNECGKAFSMRSSLTNHHAIHT
430 440 450 460 470 480
490 500 510
pF1KB9 GEKHFKCNECGKLFRDNSYLVRHQRFHAGKKSNTCN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GEKHFKCNECGKLFRDNSYLVRHQRFHAGKKSNTCN
490 500 510
>>CCDS82391.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 (782 aa)
initn: 2295 init1: 2295 opt: 2301 Z-score: 1442.5 bits: 277.1 E(32554): 5e-74
Smith-Waterman score: 2322; 61.1% identity (79.4% similar) in 548 aa overlap (3-516:126-672)
10 20
pF1KB9 MHGRKD-----DAQKQPVKNQLGLNPQSHLPE
:..: : ... ..::::.. .:::::
CCDS82 KEPQKNVHDFECQWRDDTGNYKGVLMAQKEGKRDQRDRRDIENKLMNNQLGVSFHSHLPE
100 110 120 130 140 150
30 40 50 60 70 80
pF1KB9 LQLFQAEGKIYKYDHMEKSVNSSSLVSPPQRISSTVKTHISHTY-ECNFVDSLFTQKEKA
:::::.:::.:. ...:::.:..: ::: :.: :.:.:: :. : : : ::.::..::
CCDS82 LQLFQGEGKMYECNQVEKSTNNGSSVSPLQQIPSSVQTHRSKKYHELNHF-SLLTQRRKA
160 170 180 190 200 210
90 100 110 120 130 140
pF1KB9 NIGTEHYKCSERGKAFHQGLHFTIHQIIHTKETQFKCDICGKIFNKKSNLASHQRIHTGE
: . :::.: :::: :. ..: :. ::. : .::. ::: :. .:::. :: :::::
CCDS82 NSCGKPYKCNECGKAFTQNSNLTSHRRIHSGEKPYKCSECGKTFTVRSNLTIHQVIHTGE
220 230 240 250 260 270
150 160 170 180 190 200
pF1KB9 KPYKCNECGKVFHNMSHLAQHRRIHTGEKPYKCNECGKVFNQISHLAQHQRIHTGEKPYK
:::::.::::::.. :.:: ::::::::::::::::::.: :.:. :: :::::::.:
CCDS82 KPYKCHECGKVFRHNSYLATHRRIHTGEKPYKCNECGKAFRGHSNLTTHQLIHTGEKPFK
280 290 300 310 320 330
210 220 230 240 250 260
pF1KB9 CNECGKVFHQISHLAQHRTIHTGEKPYECNKCGKVFSRNSYLVQHLIIHTGEKPYRCNVC
::::::.: : ::: .: ::::::::.::.:::.:: : :. : ::::::::.:: :
CCDS82 CNECGKLFTQNSHLISHWRIHTGEKPYKCNECGKAFSVRSSLAIHQTIHTGEKPYKCNEC
340 350 360 370 380 390
270 280 290 300 310 320
pF1KB9 GKVFHHISHLAQHQRIHTGEKPYKCNECGKVFSHKSSLVNHWRIHTGEKPYKCNECGKVF
::::.. :.:..:.:.::::::::::::::.:: .:.:..: :::: ::.:::::.:::
CCDS82 GKVFRYNSYLGRHRRVHTGEKPYKCNECGKAFSMHSNLATHQVIHTGTKPFKCNECSKVF
400 410 420 430 440 450
330 340 350 360 370 380
pF1KB9 SHKSSLVNHWRIHTGEKPYKCNECGKVFSRNSYLAQHLIIHAGEKPYKCDECDKAFSQNS
...:.:.:: ::::::::::::::::.:: : :. : ::.::::::: :: :.:.:.:
CCDS82 TQNSQLANHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSVRSSLTTHQAIHSGEKPYKCIECGKSFTQKS
460 470 480 490 500 510
390 400 410 420 430
pF1KB9 HLVQHHRIHTGEKPYKCDECGKVFSQNSYLAYHWRIHTGEKAYKCN--------------
:: .:. ::.:::::::.::::::.:.: :: :::.::::: ::::
CCDS82 HLRSHRGIHSGEKPYKCNECGKVFAQTSQLARHWRVHTGEKPYKCNDCGRAFSDRSSLTF
520 530 540 550 560 570
440 450 460 470
pF1KB9 --------------ECGKVFGLNSSLAHHRKIHTGEKPFKCNECGKAFSMRSSLTNHHAI
:::::: :: :: ::.:::::::.:::::::::::.:.::.:..:
CCDS82 HQAIHTGEKPYKCHECGKVFRHNSYLATHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSMHSNLTTHKVI
580 590 600 610 620 630
480 490 500 510
pF1KB9 HTGEKHFKCNECGKLFRDNSYLVRHQRFHAGKKSNTCN
::::: .:::.:::.: .::.:. ::: :.:.: ::
CCDS82 HTGEKPYKCNQCGKVFTQNSHLANHQRTHTGEKPYRCNECGKAFSVRSSLTTHQAIHTGK
640 650 660 670 680 690
CCDS82 KPYKCNECGKVFTQNAHLANHRRIHTGEKPYRCTECGKAFRVRSSLTTHMAIHTGEKRYK
700 710 720 730 740 750
>--
initn: 554 init1: 554 opt: 554 Z-score: 368.0 bits: 78.3 E(32554): 3.6e-14
Smith-Waterman score: 554; 68.8% identity (87.2% similar) in 109 aa overlap (126-234:674-782)
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 SERGKAFHQGLHFTIHQIIHTKETQFKCDICGKIFNKKSNLASHQRIHTGEKPYKCNECG
::: :. .:.:..:: ::::.:::::::::
CCDS82 NQCGKVFTQNSHLANHQRTHTGEKPYRCNECGKAFSVRSSLTTHQAIHTGKKPYKCNECG
650 660 670 680 690 700
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 KVFHNMSHLAQHRRIHTGEKPYKCNECGKVFNQISHLAQHQRIHTGEKPYKCNECGKVFH
::: . .:::.:::::::::::.:.::::.: : :. :. :::::: ::::::::::.
CCDS82 KVFTQNAHLANHRRIHTGEKPYRCTECGKAFRVRSSLTTHMAIHTGEKRYKCNECGKVFR
710 720 730 740 750 760
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 QISHLAQHRTIHTGEKPYECNKCGKVFSRNSYLVQHLIIHTGEKPYRCNVCGKVFHHISH
: :.::.:. .:::::::.
CCDS82 QSSNLASHHRMHTGEKPYK
770 780
>>CCDS12859.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 (818 aa)
initn: 2295 init1: 2295 opt: 2301 Z-score: 1442.2 bits: 277.1 E(32554): 5.2e-74
Smith-Waterman score: 2322; 61.1% identity (79.4% similar) in 548 aa overlap (3-516:162-708)
10 20
pF1KB9 MHGRKD-----DAQKQPVKNQLGLNPQSHLPE
:..: : ... ..::::.. .:::::
CCDS12 KEPQKNVHDFECQWRDDTGNYKGVLMAQKEGKRDQRDRRDIENKLMNNQLGVSFHSHLPE
140 150 160 170 180 190
30 40 50 60 70 80
pF1KB9 LQLFQAEGKIYKYDHMEKSVNSSSLVSPPQRISSTVKTHISHTY-ECNFVDSLFTQKEKA
:::::.:::.:. ...:::.:..: ::: :.: :.:.:: :. : : : ::.::..::
CCDS12 LQLFQGEGKMYECNQVEKSTNNGSSVSPLQQIPSSVQTHRSKKYHELNHF-SLLTQRRKA
200 210 220 230 240 250
90 100 110 120 130 140
pF1KB9 NIGTEHYKCSERGKAFHQGLHFTIHQIIHTKETQFKCDICGKIFNKKSNLASHQRIHTGE
: . :::.: :::: :. ..: :. ::. : .::. ::: :. .:::. :: :::::
CCDS12 NSCGKPYKCNECGKAFTQNSNLTSHRRIHSGEKPYKCSECGKTFTVRSNLTIHQVIHTGE
260 270 280 290 300 310
150 160 170 180 190 200
pF1KB9 KPYKCNECGKVFHNMSHLAQHRRIHTGEKPYKCNECGKVFNQISHLAQHQRIHTGEKPYK
:::::.::::::.. :.:: ::::::::::::::::::.: :.:. :: :::::::.:
CCDS12 KPYKCHECGKVFRHNSYLATHRRIHTGEKPYKCNECGKAFRGHSNLTTHQLIHTGEKPFK
320 330 340 350 360 370
210 220 230 240 250 260
pF1KB9 CNECGKVFHQISHLAQHRTIHTGEKPYECNKCGKVFSRNSYLVQHLIIHTGEKPYRCNVC
::::::.: : ::: .: ::::::::.::.:::.:: : :. : ::::::::.:: :
CCDS12 CNECGKLFTQNSHLISHWRIHTGEKPYKCNECGKAFSVRSSLAIHQTIHTGEKPYKCNEC
380 390 400 410 420 430
270 280 290 300 310 320
pF1KB9 GKVFHHISHLAQHQRIHTGEKPYKCNECGKVFSHKSSLVNHWRIHTGEKPYKCNECGKVF
::::.. :.:..:.:.::::::::::::::.:: .:.:..: :::: ::.:::::.:::
CCDS12 GKVFRYNSYLGRHRRVHTGEKPYKCNECGKAFSMHSNLATHQVIHTGTKPFKCNECSKVF
440 450 460 470 480 490
330 340 350 360 370 380
pF1KB9 SHKSSLVNHWRIHTGEKPYKCNECGKVFSRNSYLAQHLIIHAGEKPYKCDECDKAFSQNS
...:.:.:: ::::::::::::::::.:: : :. : ::.::::::: :: :.:.:.:
CCDS12 TQNSQLANHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSVRSSLTTHQAIHSGEKPYKCIECGKSFTQKS
500 510 520 530 540 550
390 400 410 420 430
pF1KB9 HLVQHHRIHTGEKPYKCDECGKVFSQNSYLAYHWRIHTGEKAYKCN--------------
:: .:. ::.:::::::.::::::.:.: :: :::.::::: ::::
CCDS12 HLRSHRGIHSGEKPYKCNECGKVFAQTSQLARHWRVHTGEKPYKCNDCGRAFSDRSSLTF
560 570 580 590 600 610
440 450 460 470
pF1KB9 --------------ECGKVFGLNSSLAHHRKIHTGEKPFKCNECGKAFSMRSSLTNHHAI
:::::: :: :: ::.:::::::.:::::::::::.:.::.:..:
CCDS12 HQAIHTGEKPYKCHECGKVFRHNSYLATHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSMHSNLTTHKVI
620 630 640 650 660 670
480 490 500 510
pF1KB9 HTGEKHFKCNECGKLFRDNSYLVRHQRFHAGKKSNTCN
::::: .:::.:::.: .::.:. ::: :.:.: ::
CCDS12 HTGEKPYKCNQCGKVFTQNSHLANHQRTHTGEKPYRCNECGKAFSVRSSLTTHQAIHTGK
680 690 700 710 720 730
CCDS12 KPYKCNECGKVFTQNAHLANHRRIHTGEKPYRCTECGKAFRVRSSLTTHMAIHTGEKRYK
740 750 760 770 780 790
>--
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100 110 120 130 140 150
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::: :. .:.:..:: ::::.:::::::::
CCDS12 NQCGKVFTQNSHLANHQRTHTGEKPYRCNECGKAFSVRSSLTTHQAIHTGKKPYKCNECG
680 690 700 710 720 730
160 170 180 190 200 210
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::: . .:::.:::::::::::.:.::::.: : :. :. :::::: ::::::::::.
CCDS12 KVFTQNAHLANHRRIHTGEKPYRCTECGKAFRVRSSLTTHMAIHTGEKRYKCNECGKVFR
740 750 760 770 780 790
220 230 240 250 260 270
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CCDS12 QSSNLASHHRMHTGEKPYK
800 810
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10 20 30
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: ..:.:.::: . .::::::..::..:::
CCDS46 WQEDERNSHEAPMTEIKKLTGSADRYDQRHAGNKPIKDQLGSSFHSHLPELHMFQTQGKI
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...:::.:..: .: :::: :::::..: :: .: :.:::..... . ..:.
CCDS46 G--NQVEKSINDASSISTSQRISCRPKTHISNNYGNNFRNSSLLTQKQEVHMREKSFQCN
170 180 190 200 210
100 110 120 130 140 150
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: ::::. . . ::::: : :.:::.:::.::.: ::. :.: :::::::.::::::
CCDS46 ESGKAFNYSSLLRKHQIIHLGEKQYKCDVCGKVFNRKRNLVCHRRCHTGEKPYRCNECGK
220 230 240 250 260 270
160 170 180 190 200 210
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.: . :. :::.:::::::::.:: :.:. :.: .:.:::.::::::::::::.: :
CCDS46 TFSQTYSLTCHRRLHTGEKPYKCEECDKAFSFKSNLKRHRRIHAGEKPYKCNECGKTFSQ
280 290 300 310 320 330
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 ISHLAQHRTIHTGEKPYECNKCGKVFSRNSYLVQHLIIHTGEKPYRCNVCGKVFHHISHL
: :. :: .::::::..::.:::.:::.: :. : .:::::::.:: :::.: . :
CCDS46 TSSLTCHRRLHTGEKPFKCNECGKTFSRKSSLTCHHRLHTGEKPYKCNECGKTFSQELTL
340 350 360 370 380 390
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 AQHQRIHTGEKPYKCNECGKVFSHKSSLVNHWRIHTGEKPYKCNECGKVFSHKSSLVNHW
:.:.::::::::::::::::..:..:. : :.:.:::::::.:: :.::..:.:: :
CCDS46 KCHRRLHTGEKPYKCNECGKVFNKKANLARHHRLHSGEKPYKCTECVKTFSRNSALVIHK
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340 350 360 370 380 390
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:: ::: ::::::::.::: : :. : ::.:::::::.:: :.:....::. :::.::
CCDS46 AIHIGEKRYKCNECGKTFSRISALVIHTAIHTGEKPYKCNECGKGFNRKTHLACHHRLHT
460 470 480 490 500 510
400 410 420 430 440 450
pF1KB9 GEKPYKCDECGKVFSQNSYLAYHWRIHTGEKAYKCNECGKVFGLNSSLAHHRKIHTGEKP
:::::::.::::::.....::.: :.:::.: ::::::::::. .. ::.:...::::::
CCDS46 GEKPYKCNECGKVFNRKTHLAHHHRLHTGDKPYKCNECGKVFNQKAHLARHHRLHTGEKP
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460 470 480 490 500 510
pF1KB9 FKCNECGKAFSMRSSLTNHHAIHTGEKHFKCNECGKLFRDNSYLVRHQRFHAGKKSNTCN
.:::::::.:.....:. :: .::::: .: ::::: :
CCDS46 YKCNECGKVFNQKANLARHHRLHTGEKPYKFNECGKAFN
580 590 600 610
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10 20 30
pF1KB9 MHGRKDDAQKQPVKNQLGLNPQSHLPELQLFQAEGK
.: .. .::::::. : :: :::::::: .
CCDS46 LQSEVKIANNPGGRECIKGVNAESSSKLGSNAGNKSLKNQLGLTFQLHLSELQLFQAERN
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pF1KB9 IYKYDHMEKSVNSSSLVSPPQRISSTVKTHISHTYECNFVDSLFT-QKEKANIGTEHYKC
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CCDS46 ISGCKHVEKPINNS-LVSPLQKIYSSVKSHILNKYRNDFDDSPFLPQEQKAQIREKPCEC
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100 110 120 130 140 150
pF1KB9 SERGKAFHQGLHFTIHQIIHTKETQFKCDICGKIFNKKSNLASHQRIHTGEKPYKCNECG
.:.::::. . ... .:.::: .. .::. : :.:...:::..:::::::::::::.:::
CCDS46 NEHGKAFRVSSRLANNQVIHTADNPYKCNECDKVFSNSSNLVQHQRIHTGEKPYKCHECG
190 200 210 220 230 240
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 KVFHNMSHLAQHRRIHTGEKPYKCNECGKVFNQISHLAQHQRIHTGEKPYKCNECGKVFH
:.:. .: ::.:.:::::::::::.::::::.: ::::.:.::::::::::::::::::.
CCDS46 KLFNRISLLARHQRIHTGEKPYKCHECGKVFTQNSHLANHHRIHTGEKPYKCNECGKVFN
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220 230 240 250 260 270
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. .:::.:. ::.:::::.:..:::.:: .: :. ::.:::::: :.:: :::::.. .:
CCDS46 RNAHLARHQKIHSGEKPYKCKECGKAFSGGSGLTAHLVIHTGEKLYKCNKCGKVFNRNAH
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pF1KB9 LAQHQRIHTGEKPYKCNECGKVFSHKSSLVNHWRIHTGEKPYKCNECGKVFSHKSSLVNH
:..:::::::::::.:.:::::: :: :.:: :.::::.:::::::::.: :.:. :
CCDS46 LTRHQRIHTGEKPYECKECGKVFRHKFCLTNHHRMHTGEQPYKCNECGKAFRDCSGLTAH
370 380 390 400 410 420
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 WRIHTGEKPYKCNECGKVFSRNSYLAQHLIIHAGEKPYKCDECDKAFSQNSHLVQHHRIH
::::::::::.::.::: . :..: .:.:::::.:::: : :..::.:..:::::
CCDS46 LLIHTGEKPYKCKECAKVFRHRLSLSNHQRFHTGEKPYRCDECGKDFTRNSNLANHHRIH
430 440 450 460 470 480
400 410 420 430 440 450
pF1KB9 TGEKPYKCDECGKVFSQNSYLAYHWRIHTGEKAYKCNECGKVFGLNSSLAHHRKIHTGEK
::::::::.:: ::::.::.:: : .::::::.::::::::::. . : .:..::::::
CCDS46 TGEKPYKCSECHKVFSHNSHLARHRQIHTGEKSYKCNECGKVFSHKLYLKKHERIHTGEK
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pF1KB9 PFKCNECGKAFSMRSSLTNHHAIHTGEKHFKCNECGKLFRDNSYLVRHQRFHAGKKSNTC
:..:.:::: :. :.:.::: :::::: ..
CCDS46 PYRCHECGKDFTRNSNLANHHRIHTGEKPYR
550 560 570
pF1KB9 N
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10 20 30
pF1KB9 MHGRKDDAQKQPVKNQLGLNPQSHLPELQLFQAEGK
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CCDS33 LQSEEKIANDPDGRECIKGVNTERSSKLGSNAGNKPCKNQLGFTFQLHLSDLQLFQAERK
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pF1KB9 IYKYDHMEKSVNSSSLVSPPQRISSTVKTHISHTYECNFVDS-LFTQKEKANIGTEHYKC
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CCDS33 ISGCKHFEKPVSDNSSVSPLEKISSSVKSHLLNKYRNNFDHAPLLPQEQKAHIREKAYKC
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pF1KB9 SERGKAFHQGLHFTIHQIIHTKETQFKCDICGKIFNKKSNLASHQRIHTGEKPYKCNECG
.:.:..:. . .: .:.::. .. .::. :::.:. .:.:. :.:.:::::::::.:::
CCDS33 NEHGQVFRASASLT-NQVIHNADNPYKCSECGKVFSCSSKLVIHRRMHTGEKPYKCHECG
190 200 210 220 230 240
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pF1KB9 KVFHNMSHLAQHRRIHTGEKPYKCNECGKVFNQISHLAQHQRIHTGEKPYKCNECGKVFH
:.: . :.:.::.:::::::::::.:: ::: . :.::::::::::::::::.:: :::.
CCDS33 KLFSSNSNLSQHQRIHTGEKPYKCHECDKVFRSSSKLAQHQRIHTGEKPYKCHECDKVFN
250 260 270 280 290 300
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pF1KB9 QISHLAQHRTIHTGEKPYECNKCGKVFSRNSYLVQHLIIHTGEKPYRCNVCGKVFHHISH
::.::..:. :::::::: ::::::::::.:::..: .:::::::.:. :::.: :
CCDS33 QIAHLVRHQKIHTGEKPYSCNKCGKVFSRHSYLAEHQTVHTGEKPYKCEECGKAFSVRSS
310 320 330 340 350 360
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pF1KB9 LAQHQRIHTGEKPYKCNECGKVFSHKSSLVNHWRIHTGEKPYKCNECGKVFSHKSSLVNH
: :: ::::.:::::.:: :::..: :..: :::: :.:: :..:::.::.::.:. :
CCDS33 LITHQLIHTGRKPYKCKECDKVFGRKCFLTSHQRIHTRERPYGCSQCGKIFSQKSDLIRH
370 380 390 400 410 420
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 WRIHTGEKPYKCNECGKVFSRNSYLAQHLIIHAGEKPYKCDECDKAFSQNSHLVQHHRIH
. :: :::::::.:: .: . : :. :..::.:::::.: :: :.: .: :..:::::
CCDS33 RKTHTDEKPYKCNKCGTAFREFSDLTAHFLIHSGEKPYECKECGKVFRYKSSLTSHHRIH
430 440 450 460 470 480
400 410 420 430 440 450
pF1KB9 TGEKPYKCDECGKVFSQNSYLAYHWRIHTGEKAYKCNECGKVFGLNSSLAHHRKIHTGEK
::::::::..::::::..: :. : .:::::: ::::.:::::. : :..:. :::::.
CCDS33 TGEKPYKCNRCGKVFSRSSNLVCHQKIHTGEKPYKCNQCGKVFNQASYLTRHQIIHTGER
490 500 510 520 530 540
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pF1KB9 PFKCNECGKAFSMRSSLTNHHAIHTGEKHFKCNECGKLFRDNSYLVRHQRFHAGKKSNTC
:..:..::::: :.:: : :::: .: .:.::::.: ..: :. :.:.: :.: :
CCDS33 PYRCSKCGKAFRGCSGLTAHLAIHTEKKSHECKECGKIFTQKSSLTNHHRIHIGEKPYKC
550 560 570 580 590 600
pF1KB9 N
CCDS33 TLCSKVFSHNSDLAQHQRVHS
610 620
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10 20
pF1KB9 MHGRKDDAQKQPVK-NQLGLN-PQ-SHLPEL
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CCDS33 VSPPQQMPYNVKTHISKKYLKDFISSLLLTQGQKANNWGSPYKSNGCGMVFPQNSHLASH
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30 40 50 60 70 80
pF1KB9 QLFQAEGKIYKYDHMEKSVNSSSLVSPPQRISSTVKTHISHTYECNFV---DSLFTQKEK
: ... : :: . :. . : .. : : . : . . ::. : .: ..:..:
CCDS33 QRSHTKEKPYKCYECGKAFRTRSNLTTHQVIHTGEKRYKCN--ECGKVFSRNSQLSQHQK
280 290 300 310 320 330
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pF1KB9 ANIGTEHYKCSERGKAFHQGLHFTIHQIIHTKETQFKCDICGKIFNKKSNLASHQRIHTG
. : . :::.: ::.: :. :.. :. ::: : .::. ::: : .:.:: :: :.:
CCDS33 IHTGEKPYKCNECGKVFTQNSHLVRHRGIHTGEKPYKCNECGKAFRARSSLAIHQATHSG
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pF1KB9 EKPYKCNECGKVFHNMSHLAQHRRIHTGEKPYKCNECGKVFNQISHLAQHQRIHTGEKPY
::::::::::::: . :::..: ::::::::::::::::.:. : :: : ::::::::
CCDS33 EKPYKCNECGKVFTQNSHLTNHWRIHTGEKPYKCNECGKAFGVRSSLAIHLVIHTGEKPY
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pF1KB9 KCNECGKVFHQISHLAQHRTIHTGEKPYECNKCGKVFSRNSYLVQHLIIHTGEKPYRCNV
::.::::::.. ::::.:. ::::::::.::.:::.: .: :. : .::::::::.::
CCDS33 KCHECGKVFRRNSHLARHQLIHTGEKPYKCNECGKAFRAHSNLTTHQVIHTGEKPYKCNE
460 470 480 490 500 510
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pF1KB9 CGKVFHHISHLAQHQRIHTGEKPYKCNECGKVFSHKSSLVNHWRIHTGEKPYKCNECGKV
::::: . ::::.::::::: ::: ::::::.:: :::..: ::::::::::::::::
CCDS33 CGKVFTQNSHLANHQRIHTGVKPYMCNECGKAFSVYSSLTTHQVIHTGEKPYKCNECGKV
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pF1KB9 FSHKSSLVNHWRIHTGEKPYKCNECGKVFSRNSYLAQHLIIHAGEKPYKCDECDKAFSQN
:...: :. : ::::::::::::::::: .::::..: ::.:::::: .: ::::..
CCDS33 FTQNSHLARHRGIHTGEKPYKCNECGKVFRHNSYLSRHQRIHTGEKPYKYNEYGKAFSEH
580 590 600 610 620 630
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pF1KB9 SHLVQHHRIHTGEKPYKCDECGKVFSQNSYLAYHWRIHTGEKAYKCNECGKVFGLNSSLA
:.:. :. ::::::::::.::::::.:::.:: : :.::: : :.::::::.:. .:.::
CCDS33 SNLTTHQVIHTGEKPYKCNECGKVFTQNSHLARHRRVHTGGKPYQCNECGKAFSQTSKLA
640 650 660 670 680 690
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pF1KB9 HHRKIHTGEKPFKCNECGKAFSMRSSLTNHHAIHTGEKHFKCNECGKLFRDNSYLVRHQR
.:...::::::..::.::::::.:::::.:.:::::.: .:::::::.: .::.:.::.
CCDS33 RHQRVHTGEKPYECNQCGKAFSVRSSLTTHQAIHTGKKPYKCNECGKVFTQNSHLARHRG
700 710 720 730 740 750
510
pF1KB9 FHAGKKSNTCN
.:.:.: ::
CCDS33 IHTGEKPYKCNECGKAFSQTSKLARHQRIHTGEKPYECGKPFSICSSLTTHQTIHTGGKP
760 770 780 790 800 810
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10 20
pF1KB9 MHGRKDDAQKQPVK-NQLGLN-PQ-SHLPEL
.:.: . .: : : :. :: :::
CCDS54 VSPPQQMPYNVKTHISKKYLKDFISSLLLTQGQKANNWGSPYKSNGCGMVFPQNSHLASH
230 240 250 260 270 280
30 40 50 60 70 80
pF1KB9 QLFQAEGKIYKYDHMEKSVNSSSLVSPPQRISSTVKTHISHTYECNFV---DSLFTQKEK
: ... : :: . :. . : .. : : . : . . ::. : .: ..:..:
CCDS54 QRSHTKEKPYKCYECGKAFRTRSNLTTHQVIHTGEKRYKCN--ECGKVFSRNSQLSQHQK
290 300 310 320 330
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pF1KB9 ANIGTEHYKCSERGKAFHQGLHFTIHQIIHTKETQFKCDICGKIFNKKSNLASHQRIHTG
. : . :::.: ::.: :. :.. :. ::: : .::. ::: : .:.:: :: :.:
CCDS54 IHTGEKPYKCNECGKVFTQNSHLVRHRGIHTGEKPYKCNECGKAFRARSSLAIHQATHSG
340 350 360 370 380 390
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pF1KB9 EKPYKCNECGKVFHNMSHLAQHRRIHTGEKPYKCNECGKVFNQISHLAQHQRIHTGEKPY
::::::::::::: . :::..: ::::::::::::::::.:. : :: : ::::::::
CCDS54 EKPYKCNECGKVFTQNSHLTNHWRIHTGEKPYKCNECGKAFGVRSSLAIHLVIHTGEKPY
400 410 420 430 440 450
210 220 230 240 250 260
pF1KB9 KCNECGKVFHQISHLAQHRTIHTGEKPYECNKCGKVFSRNSYLVQHLIIHTGEKPYRCNV
::.::::::.. ::::.:. ::::::::.::.:::.: .: :. : .::::::::.::
CCDS54 KCHECGKVFRRNSHLARHQLIHTGEKPYKCNECGKAFRAHSNLTTHQVIHTGEKPYKCNE
460 470 480 490 500 510
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pF1KB9 CGKVFHHISHLAQHQRIHTGEKPYKCNECGKVFSHKSSLVNHWRIHTGEKPYKCNECGKV
::::: . ::::.::::::: ::: ::::::.:: :::..: ::::::::::::::::
CCDS54 CGKVFTQNSHLANHQRIHTGVKPYMCNECGKAFSVYSSLTTHQVIHTGEKPYKCNECGKV
520 530 540 550 560 570
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pF1KB9 FSHKSSLVNHWRIHTGEKPYKCNECGKVFSRNSYLAQHLIIHAGEKPYKCDECDKAFSQN
:...: :. : ::::::::::::::::: .::::..: ::.:::::: .: ::::..
CCDS54 FTQNSHLARHRGIHTGEKPYKCNECGKVFRHNSYLSRHQRIHTGEKPYKYNEYGKAFSEH
580 590 600 610 620 630
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CCDS54 SNLTTHQVIHTGEKPYKCNECGKVFTQNSHLARHRRVHTGGKPYQCNECGKAFSQTSKLA
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::
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]