Result of FASTA (ccds) for
pF1KB9720
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9720, 404 aa
1>>>pF1KB9720 404 - 404 aa - 404 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8087+/-0.000718; mu= 17.2516+/- 0.044
mean_var=106.7027+/-21.256, 0's: 0 Z-trim(113.2): 126 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.124161
statistics sampled from 13771 (13898) to 13771 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.76), E-opt: 0.2 (0.427), width: 16
Scan time: 2.970
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12352.1 NR2F6 gene_id:2063|Hs108|chr19 ( 404) 2748 502.3 3.3e-142
CCDS4068.1 NR2F1 gene_id:7025|Hs108|chr5 ( 423) 1243 232.7 4.9e-61
CCDS10375.1 NR2F2 gene_id:7026|Hs108|chr15 ( 414) 1200 225.0 1e-58
CCDS45359.1 NR2F2 gene_id:7026|Hs108|chr15 ( 261) 1162 218.0 8.1e-57
CCDS45358.1 NR2F2 gene_id:7026|Hs108|chr15 ( 281) 1162 218.0 8.5e-57
CCDS9850.2 ESRRB gene_id:2103|Hs108|chr14 ( 508) 667 129.6 6.4e-30
CCDS41667.1 ESRRA gene_id:2101|Hs108|chr11 ( 423) 653 127.0 3.2e-29
CCDS60830.1 ESRRA gene_id:2101|Hs108|chr11 ( 422) 648 126.1 5.9e-29
CCDS73750.1 NR2E3 gene_id:10002|Hs108|chr15 ( 410) 633 123.4 3.7e-28
CCDS58061.1 ESRRG gene_id:2104|Hs108|chr1 ( 470) 627 122.4 8.7e-28
CCDS1517.1 ESRRG gene_id:2104|Hs108|chr1 ( 435) 624 121.8 1.2e-27
CCDS41468.1 ESRRG gene_id:2104|Hs108|chr1 ( 458) 624 121.9 1.2e-27
CCDS41790.1 RARG gene_id:5916|Hs108|chr12 ( 443) 620 121.1 2e-27
CCDS58236.1 RARG gene_id:5916|Hs108|chr12 ( 382) 615 120.2 3.3e-27
CCDS8850.1 RARG gene_id:5916|Hs108|chr12 ( 454) 615 120.3 3.8e-27
CCDS11366.1 RARA gene_id:5914|Hs108|chr17 ( 462) 613 119.9 4.9e-27
CCDS42317.1 RARA gene_id:5914|Hs108|chr17 ( 457) 601 117.7 2.2e-26
CCDS2642.1 RARB gene_id:5915|Hs108|chr3 ( 448) 583 114.5 2e-25
CCDS2201.1 NR4A2 gene_id:4929|Hs108|chr2 ( 598) 580 114.1 3.5e-25
CCDS5063.1 NR2E1 gene_id:7101|Hs108|chr6 ( 385) 540 106.8 3.7e-23
CCDS69165.1 NR2E1 gene_id:7101|Hs108|chr6 ( 422) 540 106.8 4e-23
CCDS6743.1 NR4A3 gene_id:8013|Hs108|chr9 ( 626) 501 100.0 6.7e-21
CCDS6742.1 NR4A3 gene_id:8013|Hs108|chr9 ( 637) 501 100.0 6.8e-21
CCDS73751.1 NR2E3 gene_id:10002|Hs108|chr15 ( 367) 497 99.0 7.5e-21
CCDS58237.1 RARG gene_id:5916|Hs108|chr12 ( 432) 485 96.9 3.7e-20
CCDS74905.1 NR2C2 gene_id:7182|Hs108|chr3 ( 596) 457 92.1 1.5e-18
CCDS2621.1 NR2C2 gene_id:7182|Hs108|chr3 ( 615) 457 92.1 1.6e-18
CCDS4278.1 NR3C1 gene_id:2908|Hs108|chr5 ( 777) 455 91.8 2.4e-18
CCDS34258.1 NR3C1 gene_id:2908|Hs108|chr5 ( 778) 453 91.5 3e-18
CCDS43965.1 AR gene_id:367|Hs108|chrX ( 388) 444 89.6 5.6e-18
CCDS61470.1 ESR2 gene_id:2100|Hs108|chr14 ( 474) 443 89.5 7.3e-18
CCDS55920.1 ESR2 gene_id:2100|Hs108|chr14 ( 481) 443 89.5 7.4e-18
CCDS32096.1 ESR2 gene_id:2100|Hs108|chr14 ( 495) 443 89.5 7.6e-18
CCDS9762.1 ESR2 gene_id:2100|Hs108|chr14 ( 530) 443 89.5 7.9e-18
CCDS47298.1 NR3C1 gene_id:2908|Hs108|chr5 ( 742) 444 89.8 8.9e-18
CCDS8818.1 NR4A1 gene_id:3164|Hs108|chr12 ( 598) 442 89.4 9.8e-18
CCDS55828.1 NR4A1 gene_id:3164|Hs108|chr12 ( 611) 442 89.4 1e-17
CCDS73471.1 NR4A1 gene_id:3164|Hs108|chr12 ( 652) 442 89.4 1e-17
CCDS14387.1 AR gene_id:367|Hs108|chrX ( 920) 444 89.9 1e-17
CCDS4768.1 RXRB gene_id:6257|Hs108|chr6 ( 533) 432 87.5 3.1e-17
CCDS59007.1 RXRB gene_id:6257|Hs108|chr6 ( 537) 432 87.5 3.1e-17
CCDS1248.1 RXRG gene_id:6258|Hs108|chr1 ( 463) 427 86.6 5.2e-17
CCDS35172.1 RXRA gene_id:6256|Hs108|chr9 ( 462) 422 85.7 9.7e-17
CCDS41821.1 NR2C1 gene_id:7181|Hs108|chr12 ( 467) 422 85.7 9.8e-17
CCDS44953.1 NR2C1 gene_id:7181|Hs108|chr12 ( 483) 422 85.7 1e-16
CCDS1228.1 NR1I3 gene_id:9970|Hs108|chr1 ( 348) 419 85.0 1.2e-16
CCDS9051.1 NR2C1 gene_id:7181|Hs108|chr12 ( 603) 422 85.8 1.2e-16
CCDS8310.1 PGR gene_id:5241|Hs108|chr11 ( 933) 424 86.3 1.3e-16
CCDS72970.1 RXRG gene_id:6258|Hs108|chr1 ( 340) 417 84.7 1.5e-16
CCDS74728.1 HNF4A gene_id:3172|Hs108|chr20 ( 449) 417 84.8 1.8e-16
>>CCDS12352.1 NR2F6 gene_id:2063|Hs108|chr19 (404 aa)
initn: 2748 init1: 2748 opt: 2748 Z-score: 2666.5 bits: 502.3 E(32554): 3.3e-142
Smith-Waterman score: 2748; 100.0% identity (100.0% similar) in 404 aa overlap (1-404:1-404)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MAMVTGGWGGPGGDTNGVDKAGGYPRAAEDDSASPPGAASDAEPGDEERPGLQVDCVVCG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MAMVTGGWGGPGGDTNGVDKAGGYPRAAEDDSASPPGAASDAEPGDEERPGLQVDCVVCG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 DKSSGKHYGVFTCEGCKSFFKRSIRRNLSYTCRSNRDCQIDQHHRNQCQYCRLKKCFRVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 DKSSGKHYGVFTCEGCKSFFKRSIRRNLSYTCRSNRDCQIDQHHRNQCQYCRLKKCFRVG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 MRKEAVQRGRIPHSLPGAVAASSGSPPGSALAAVASGGDLFPGQPVSELIAQLLRAEPYP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MRKEAVQRGRIPHSLPGAVAASSGSPPGSALAAVASGGDLFPGQPVSELIAQLLRAEPYP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 AAAGRFGAGGGAAGAVLGIDNVCELAARLLFSTVEWARHAPFFPELPVADQVALLRLSWS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 AAAGRFGAGGGAAGAVLGIDNVCELAARLLFSTVEWARHAPFFPELPVADQVALLRLSWS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 ELFVLNAAQAALPLHTAPLLAAAGLHAAPMAAERAVAFMDQVRAFQEQVDKLGRLQVDSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ELFVLNAAQAALPLHTAPLLAAAGLHAAPMAAERAVAFMDQVRAFQEQVDKLGRLQVDSA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 EYGCLKAIALFTPDACGLSDPAHVESLQEKAQVALTEYVRAQYPSQPQRFGRLLLRLPAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 EYGCLKAIALFTPDACGLSDPAHVESLQEKAQVALTEYVRAQYPSQPQRFGRLLLRLPAL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400
pF1KB9 RAVPASLISQLFFMRLVGKTPIETLIRDMLLSGSTFNWPYGSGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RAVPASLISQLFFMRLVGKTPIETLIRDMLLSGSTFNWPYGSGQ
370 380 390 400
>>CCDS4068.1 NR2F1 gene_id:7025|Hs108|chr5 (423 aa)
initn: 1660 init1: 1089 opt: 1243 Z-score: 1209.3 bits: 232.7 E(32554): 4.9e-61
Smith-Waterman score: 1713; 64.3% identity (82.0% similar) in 406 aa overlap (9-404:32-421)
10 20 30
pF1KB9 MAMVTGGWGGPGGDTNGVDKAG-GYPRAAEDDSASPPG
:: :: . ..:: : :.. . . . ::
CCDS40 AMVVSSWRDPQDDVAGGNPGGPNPAAQAARGGGGGAGEQQQQAGSGAPHTPQ--TPGQPG
10 20 30 40 50
40 50 60 70 80
pF1KB9 A-ASDAEPGDEER--PG-----LQVDCVVCGDKSSGKHYGVFTCEGCKSFFKRSIRRNLS
: :. . ::. . :: ...:::::::::::::: :::::::::::::.::::.
CCDS40 APATPGTAGDKGQGPPGSGQSQQHIECVVCGDKSSGKHYGQFTCEGCKSFFKRSVRRNLT
60 70 80 90 100 110
90 100 110 120 130 140
pF1KB9 YTCRSNRDCQIDQHHRNQCQYCRLKKCFRVGMRKEAVQRGRIPHSLPGAVAASSGSPPGS
::::.::.: :::::::::::::::::..::::.:::::::.: . : .:
CCDS40 YTCRANRNCPIDQHHRNQCQYCRLKKCLKVGMRREAVQRGRMPPTQP--------NPGQY
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180 190 200
pF1KB9 ALAAVASGGDLFPGQ-PVSELIAQLLRAEPYPAAAGRFGAGGGAAGAVLGIDNVCELAAR
:: ..:: . :. .: :. ::::::::.. :.:. . ..::.:.::::::
CCDS40 AL----TNGDPLNGHCYLSGYISLLLRAEPYPTS--RYGSQCMQPNNIMGIENICELAAR
180 190 200 210 220
210 220 230 240 250 260
pF1KB9 LLFSTVEWARHAPFFPELPVADQVALLRLSWSELFVLNAAQAALPLHTAPLLAAAGLHAA
::::.:::::. ::::.: ..:::.::::.::::::::::: ..:::.:::::::::::.
CCDS40 LLFSAVEWARNIPFFPDLQITDQVSLLRLTWSELFVLNAAQCSMPLHVAPLLAAAGLHAS
230 240 250 260 270 280
270 280 290 300 310 320
pF1KB9 PMAAERAVAFMDQVRAFQEQVDKLGRLQVDSAEYGCLKAIALFTPDACGLSDPAHVESLQ
::.:.:.:::::..: :::::.:: :.::::::.:::::.::: ::::::: ::.::::
CCDS40 PMSADRVVAFMDHIRIFQEQVEKLKALHVDSAEYSCLKAIVLFTSDACGLSDAAHIESLQ
290 300 310 320 330 340
330 340 350 360 370 380
pF1KB9 EKAQVALTEYVRAQYPSQPQRFGRLLLRLPALRAVPASLISQLFFMRLVGKTPIETLIRD
::.: :: ::::.:::.::.:::.::::::.::.: .:.: ::::.::::::::::::::
CCDS40 EKSQCALEEYVRSQYPNQPSRFGKLLLRLPSLRTVSSSVIEQLFFVRLVGKTPIETLIRD
350 360 370 380 390 400
390 400
pF1KB9 MLLSGSTFNWPYGSGQ
::::::.::::: : :
CCDS40 MLLSGSSFNWPYMSIQCS
410 420
>>CCDS10375.1 NR2F2 gene_id:7026|Hs108|chr15 (414 aa)
initn: 1725 init1: 1111 opt: 1200 Z-score: 1167.7 bits: 225.0 E(32554): 1e-58
Smith-Waterman score: 1701; 64.2% identity (81.5% similar) in 400 aa overlap (9-404:31-414)
10 20 30
pF1KB9 MAMVTGGWGGPGGDTNGVDKAG-GYPRAAEDDSASPPG
: : : . . : : : .. ..:. :
CCDS10 MAMVVSTWRDPQDEVPGSQGSQASQAPPVPGPPPGAPHTPQTPGQGGPASTPAQTAAG-G
10 20 30 40 50
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 AASDAEPG-DEERPGLQVDCVVCGDKSSGKHYGVFTCEGCKSFFKRSIRRNLSYTCRSNR
.. . :: :... ...:::::::::::::: :::::::::::::.:::::::::.::
CCDS10 QGGPGGPGSDKQQQQQHIECVVCGDKSSGKHYGQFTCEGCKSFFKRSVRRNLSYTCRANR
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 DCQIDQHHRNQCQYCRLKKCFRVGMRKEAVQRGRIPHSLP--GAVAASSGSPPGSALAAV
.: :::::::::::::::::..::::.:::::::.: . : : : ..:.:
CCDS10 NCPIDQHHRNQCQYCRLKKCLKVGMRREAVQRGRMPPTQPTHGQFALTNGDP--------
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 ASGGDLFPGQPVSELIAQLLRAEPYPAAAGRFGAGGGAAGAVLGIDNVCELAARLLFSTV
: . .: :. ::::::::.. :::. . ..::.:.::::::.:::.:
CCDS10 -----LNCHSYLSGYISLLLRAEPYPTS--RFGSQCMQPNNIMGIENICELAARMLFSAV
180 190 200 210 220
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 EWARHAPFFPELPVADQVALLRLSWSELFVLNAAQAALPLHTAPLLAAAGLHAAPMAAER
::::. ::::.: ..::::::::.::::::::::: ..:::.:::::::::::.::.:.:
CCDS10 EWARNIPFFPDLQITDQVALLRLTWSELFVLNAAQCSMPLHVAPLLAAAGLHASPMSADR
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 AVAFMDQVRAFQEQVDKLGRLQVDSAEYGCLKAIALFTPDACGLSDPAHVESLQEKAQVA
.:::::..: :::::.:: :.::::::.:::::.::: ::::::: :::::::::.: :
CCDS10 VVAFMDHIRIFQEQVEKLKALHVDSAEYSCLKAIVLFTSDACGLSDVAHVESLQEKSQCA
290 300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 LTEYVRAQYPSQPQRFGRLLLRLPALRAVPASLISQLFFMRLVGKTPIETLIRDMLLSGS
: ::::.:::.:: :::.::::::.::.: .:.: ::::.::::::::::::::::::::
CCDS10 LEEYVRSQYPNQPTRFGKLLLRLPSLRTVSSSVIEQLFFVRLVGKTPIETLIRDMLLSGS
350 360 370 380 390 400
400
pF1KB9 TFNWPYGSGQ
.::::: . :
CCDS10 SFNWPYMAIQ
410
>>CCDS45359.1 NR2F2 gene_id:7026|Hs108|chr15 (261 aa)
initn: 1111 init1: 1111 opt: 1162 Z-score: 1133.6 bits: 218.0 E(32554): 8.1e-57
Smith-Waterman score: 1162; 67.7% identity (85.8% similar) in 260 aa overlap (145-404:4-261)
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 KCFRVGMRKEAVQRGRIPHSLPGAVAASSGSPPGSALAAVASGGDLFPGQPVSELIAQLL
. : . :...: : . .: :. ::
CCDS45 MPPTQPTHGQFALTNGDPLNCHSYLSGYISLLL
10 20 30
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 RAEPYPAAAGRFGAGGGAAGAVLGIDNVCELAARLLFSTVEWARHAPFFPELPVADQVAL
::::::.. :::. . ..::.:.::::::.:::.:::::. ::::.: ..:::::
CCDS45 RAEPYPTS--RFGSQCMQPNNIMGIENICELAARMLFSAVEWARNIPFFPDLQITDQVAL
40 50 60 70 80 90
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 LRLSWSELFVLNAAQAALPLHTAPLLAAAGLHAAPMAAERAVAFMDQVRAFQEQVDKLGR
:::.::::::::::: ..:::.:::::::::::.::.:.:.:::::..: :::::.::
CCDS45 LRLTWSELFVLNAAQCSMPLHVAPLLAAAGLHASPMSADRVVAFMDHIRIFQEQVEKLKA
100 110 120 130 140 150
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 LQVDSAEYGCLKAIALFTPDACGLSDPAHVESLQEKAQVALTEYVRAQYPSQPQRFGRLL
:.::::::.:::::.::: ::::::: :::::::::.: :: ::::.:::.:: :::.::
CCDS45 LHVDSAEYSCLKAIVLFTSDACGLSDVAHVESLQEKSQCALEEYVRSQYPNQPTRFGKLL
160 170 180 190 200 210
360 370 380 390 400
pF1KB9 LRLPALRAVPASLISQLFFMRLVGKTPIETLIRDMLLSGSTFNWPYGSGQ
::::.::.: .:.: ::::.::::::::::::::::::::.::::: . :
CCDS45 LRLPSLRTVSSSVIEQLFFVRLVGKTPIETLIRDMLLSGSSFNWPYMAIQ
220 230 240 250 260
>>CCDS45358.1 NR2F2 gene_id:7026|Hs108|chr15 (281 aa)
initn: 1156 init1: 1111 opt: 1162 Z-score: 1133.1 bits: 218.0 E(32554): 8.5e-57
Smith-Waterman score: 1185; 65.6% identity (82.3% similar) in 282 aa overlap (125-404:15-281)
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 NRDCQIDQHHRNQCQYCRLKKCFRVGMRKEAVQRGRIPHSLP--GAVAASSGSPPGSALA
::::::.: . : : : ..:.:
CCDS45 MQAVWDLEQGKYGFAVQRGRMPPTQPTHGQFALTNGDP------
10 20 30
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 AVASGGDLFPGQPVSELIAQLLRAEPYPAAAGRFGAGGGAAGAVLGIDNVCELAARLLFS
: . .: :. ::::::::.. :::. . ..::.:.::::::.:::
CCDS45 -------LNCHSYLSGYISLLLRAEPYPTS--RFGSQCMQPNNIMGIENICELAARMLFS
40 50 60 70 80
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 TVEWARHAPFFPELPVADQVALLRLSWSELFVLNAAQAALPLHTAPLLAAAGLHAAPMAA
.:::::. ::::.: ..::::::::.::::::::::: ..:::.:::::::::::.::.:
CCDS45 AVEWARNIPFFPDLQITDQVALLRLTWSELFVLNAAQCSMPLHVAPLLAAAGLHASPMSA
90 100 110 120 130 140
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 ERAVAFMDQVRAFQEQVDKLGRLQVDSAEYGCLKAIALFTPDACGLSDPAHVESLQEKAQ
.:.:::::..: :::::.:: :.::::::.:::::.::: ::::::: :::::::::.:
CCDS45 DRVVAFMDHIRIFQEQVEKLKALHVDSAEYSCLKAIVLFTSDACGLSDVAHVESLQEKSQ
150 160 170 180 190 200
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 VALTEYVRAQYPSQPQRFGRLLLRLPALRAVPASLISQLFFMRLVGKTPIETLIRDMLLS
:: ::::.:::.:: :::.::::::.::.: .:.: ::::.::::::::::::::::::
CCDS45 CALEEYVRSQYPNQPTRFGKLLLRLPSLRTVSSSVIEQLFFVRLVGKTPIETLIRDMLLS
210 220 230 240 250 260
400
pF1KB9 GSTFNWPYGSGQ
::.::::: . :
CCDS45 GSSFNWPYMAIQ
270 280
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30 40 50 60 70 80
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.:.:: : : . ::.: : : : ..::..::. .: :...:. . .:: :.
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270 280 290 300 310 320
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: . : ..... ::. . : . .:.:.. :. :::.:: . :. . :
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330 340 350 360 370 380
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:..::. . :: .: .: .: : :.::: :: :: . :. ..... ..: ::.:
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390 400
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.. :. .::
CCDS98 MHKLFLEMLEAKVGQEQLRGSPKDERMSSHDGKCPFQSAAFTSRDQSNSPGIPNPRPSSP
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230 240 250 260 270 280
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: ..::...:. : :..::..:: .:::. :: : . . ::... . :.
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CCDS41 LQLVRRLQALRLEREEYVLLKALALANSDSVHIEDAEAVEQLREALHEALLEYEAGRAGP
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.. .: ::::: :: :: . ........ ..: ::.:.. :. .::
CCDS41 GGGAERRRAGRLLLTLPLLRQTAGKVLAHFYGVKLEGKVPMHKLFLEMLEAMMD
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pF1KB9 SGQ
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10 20 30 40 50
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. :: .. :: . .. : .
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CCDS60 RRAGRLLLTLPLLRQTAGKVLAHFYGVKLEGKVPMHKLFLEMLEAMMD
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CCDS73 DSSSGKHYGIYACNGCSGFFKRSVRRRLIYRCQVGAGMCPVDKAHRNQCQACRLKKCLQA
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:: ..::: : :.: .. ... : : : .: : .: : :.:
CCDS73 GMNQDAVQNERQPRSTAQVHLDSMESNTESRPESLVAPPAPAGRSPRGPTPMSAARALGH
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CCDS73 HFMASLITAETCAKLEPEDADENIDVTSNDPEFPSSPYSSSSPCGLDSIHETSARLLFMA
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CCDS73 VKWAKNLPVFSSLPFRDQVILLEEAWSELFLLGAIQWSLPLDSCPLLAPPEASAAGGAQG
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pF1KB9 RAVAFMDQVRAFQEQVDKLGRLQVDSAEYGCLKAIALFTPDACGLSDPAHVESLQEKAQV
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CCDS73 RLTLASMETRVLQETISRFRALAVDPTEFACMKALVLFKPETRGLKDPEHVEALQDQSQV
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CCDS73 MLSQHSKAHHPSQPVRFGKLLLLLPSLRFITAERIELLFFRKTIGNTPMEKLLCDMFKN
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CCDS58 SSPASLTDSVNHHSPGGSSDASGSYSSTMNGHQNGLDSPPLYPSAPILGGSGPVRKLYDD
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CCDS58 CSSTIVEDPQTKCEYMLNSMPKRLCLVCGDIASGYHYGVASCEACKAFFKRTIQGNIEYS
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CCDS58 CPATNECEITKRRRKSCQACRFMKCLKVGMLKEGVRLDRVRGGRQKYKRRIDAENSPYLN
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CCDS58 PQLVQPAKKPLLWSDPADNKIVSHLLVAEPEKIYA--MPDPTVPDSDIKALTTLCDLADR
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CCDS58 DEDQSKLAGLLDLNNAILQLVKKYKSMKLEKEEFVTLKAIALANSDSMHIEDVEAVQKLQ
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. . :: .: .:. .:.: :..:. :: :: . .. ..... ..: ::.:.. :. .
CCDS58 DVLHEALQDYEAGQHMEDPRRAGKMLMTLPLLRQTSTKAVQHFYNIKLEGKVPMHKLFLE
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pF1KB9 MLLSGSTFNWPYGSGQ
::
CCDS58 MLEAKV
470
404 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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start: Fri Nov 4 18:31:31 2016 done: Fri Nov 4 18:31:32 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]