FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB9728, 444 aa 1>>>pF1KB9728 444 - 444 aa - 444 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.4842+/-0.000848; mu= 1.9676+/- 0.052 mean_var=297.8910+/-60.826, 0's: 0 Z-trim(117.5): 71 B-trim: 10 in 1/52 Lambda= 0.074310 statistics sampled from 18158 (18229) to 18158 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.821), E-opt: 0.2 (0.56), width: 16 Scan time: 3.320 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS4472.1 FOXF2 gene_id:2295|Hs108|chr6 ( 444) 3121 347.4 1.7e-95 CCDS10957.2 FOXF1 gene_id:2294|Hs108|chr16 ( 379) 972 117.0 3.3e-26 CCDS30708.1 FOXD2 gene_id:2306|Hs108|chr1 ( 495) 663 84.0 3.8e-16 CCDS75259.1 FOXD1 gene_id:2297|Hs108|chr5 ( 465) 620 79.3 8.8e-15 CCDS624.1 FOXD3 gene_id:27022|Hs108|chr1 ( 478) 575 74.5 2.5e-13 CCDS35078.1 FOXE1 gene_id:2304|Hs108|chr9 ( 373) 567 73.6 3.9e-13 CCDS4471.1 FOXQ1 gene_id:94234|Hs108|chr6 ( 403) 556 72.4 9.3e-13 CCDS3105.1 FOXL2 gene_id:668|Hs108|chr3 ( 376) 519 68.4 1.4e-11 CCDS7655.2 FOXI2 gene_id:399823|Hs108|chr10 ( 318) 516 68.0 1.5e-11 CCDS4473.1 FOXC1 gene_id:2296|Hs108|chr6 ( 553) 521 68.8 1.6e-11 CCDS13192.1 FOXS1 gene_id:2307|Hs108|chr20 ( 330) 507 67.1 3.1e-11 CCDS77433.1 FOXI3 gene_id:344167|Hs108|chr2 ( 420) 505 67.0 4.2e-11 CCDS12677.1 FOXA3 gene_id:3171|Hs108|chr19 ( 350) 500 66.4 5.4e-11 CCDS2117.1 FOXD4L1 gene_id:200350|Hs108|chr2 ( 408) 500 66.4 6e-11 >>CCDS4472.1 FOXF2 gene_id:2295|Hs108|chr6 (444 aa) initn: 3121 init1: 3121 opt: 3121 Z-score: 1828.2 bits: 347.4 E(32554): 1.7e-95 Smith-Waterman score: 3121; 100.0% identity (100.0% similar) in 444 aa overlap (1-444:1-444) 10 20 30 40 50 60 pF1KB9 MTTEGGPPPAPLRRACSPVPGALQAALMSPPPAAAAAAAAAPETTSSSSSSSSASCASSS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS44 MTTEGGPPPAPLRRACSPVPGALQAALMSPPPAAAAAAAAAPETTSSSSSSSSASCASSS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB9 SSSNSASAPSAACKSAGGGGAGAGSGGAKKASSGLRRPEKPPYSYIALIVMAIQSSPSKR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS44 SSSNSASAPSAACKSAGGGGAGAGSGGAKKASSGLRRPEKPPYSYIALIVMAIQSSPSKR 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB9 LTLSEIYQFLQARFPFFRGAYQGWKNSVRHNLSLNECFIKLPKGLGRPGKGHYWTIDPAS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS44 LTLSEIYQFLQARFPFFRGAYQGWKNSVRHNLSLNECFIKLPKGLGRPGKGHYWTIDPAS 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB9 EFMFEEGSFRRRPRGFRRKCQALKPMYHRVVSGLGFGASLLPQGFDFQAPPSAPLGCHSQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS44 EFMFEEGSFRRRPRGFRRKCQALKPMYHRVVSGLGFGASLLPQGFDFQAPPSAPLGCHSQ 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB9 GGYGGLDMMPAGYDAGAGAPSHAHPHHHHHHHVPHMSPNPGSTYMASCPVPAGPGGVGAA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS44 GGYGGLDMMPAGYDAGAGAPSHAHPHHHHHHHVPHMSPNPGSTYMASCPVPAGPGGVGAA 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KB9 GGGGGGDYGPDSSSSPVPSSPAMASAIECHSPYTSPAAHWSSPGASPYLKQPPALTPSSN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS44 GGGGGGDYGPDSSSSPVPSSPAMASAIECHSPYTSPAAHWSSPGASPYLKQPPALTPSSN 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KB9 PAASAGLHSSMSSYSLEQSYLHQNAREDLSVGLPRYQHHSTPVCDRKDFVLNFNGISSFH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS44 PAASAGLHSSMSSYSLEQSYLHQNAREDLSVGLPRYQHHSTPVCDRKDFVLNFNGISSFH 370 380 390 400 410 420 430 440 pF1KB9 PSASGSYYHHHHQSVCQDIKPCVM :::::::::::::::::::::::: CCDS44 PSASGSYYHHHHQSVCQDIKPCVM 430 440 >>CCDS10957.2 FOXF1 gene_id:2294|Hs108|chr16 (379 aa) initn: 1115 init1: 819 opt: 972 Z-score: 583.9 bits: 117.0 E(32554): 3.3e-26 Smith-Waterman score: 1300; 55.0% identity (72.4% similar) in 413 aa overlap (66-444:2-379) 40 50 60 70 80 pF1KB9 AAAAAAPETTSSSSSSSSASCASSSSSSNSASAPSAACKSAGGGGAGAGSGGA------- .::: ::::.:.:.::: CCDS10 MSSAPEKQQPPHGGGGGGGGGGGAAMDPASS 10 20 30 90 100 110 120 130 140 pF1KB9 -----KKASSGLRRPEKPPYSYIALIVMAIQSSPSKRLTLSEIYQFLQARFPFFRGAYQG ::...:.::::::::::::::::::::::.:::::::::::::.:::::::.::: CCDS10 GPSKAKKTNAGIRRPEKPPYSYIALIVMAIQSSPTKRLTLSEIYQFLQSRFPFFRGSYQG 40 50 60 70 80 90 150 160 170 180 190 200 pF1KB9 WKNSVRHNLSLNECFIKLPKGLGRPGKGHYWTIDPASEFMFEEGSFRRRPRGFRRKCQAL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 WKNSVRHNLSLNECFIKLPKGLGRPGKGHYWTIDPASEFMFEEGSFRRRPRGFRRKCQAL 100 110 120 130 140 150 210 220 230 240 250 pF1KB9 KPMYHRVVSGLGFGASLLPQGFDFQAPPSAPLGC--HSQGGYGGLDMM----PAGYDAGA :::: ...::::. ::. . ::. .. :.: .: . ::: :: :.. : : CCDS10 KPMYS-MMNGLGFNH--LPDTYGFQGSAGG-LSCPPNSLALEGGLGMMNGHLPGNVD-GM 160 170 180 190 200 260 270 280 290 300 310 pF1KB9 GAPSHAHPHHHHHHHVPHMSPNPGSTYMASCPVPAGPGGVGAAGGGGGGDYGPDSSSSPV . :::. :::. : : .::..: ::...:.: : .:: : CCDS10 ALPSHS---------VPHLPSNGGHSYMGGC------------GGAAAGEY-PHHDSS-V 210 220 230 240 320 330 340 350 360 pF1KB9 PSSPAMASA----IECHSPYTSPAAHWSSPGASP-------YLKQPPALTPSSNPAASAG :.:: . .. .: :. :.. :: : :.:: :.:: : :.: ::::. CCDS10 PASPLLPTGAGGVMEPHAVYSGSAAAWP-PSASAALNSGASYIKQQP-LSPC-NPAANP- 250 260 270 280 290 370 380 390 400 410 420 pF1KB9 LHSSMSSYSLEQSYLHQNARE---DLSVGLPRYQHHSTPVCDRKDFVLNFNGI--SSFHP : .:.:..:::: :::::... .:. :.:::. .: .::::.::..::.. ::.: CCDS10 LSGSLSTHSLEQPYLHQNSHNAPAELQ-GIPRYHSQSPSMCDRKEFVFSFNAMASSSMHS 300 310 320 330 340 350 430 440 pF1KB9 SASGSYYHHHHQSVCQDIKPCVM ...:::::. : . :::::::: CCDS10 AGGGSYYHQ--QVTYQDIKPCVM 360 370 >>CCDS30708.1 FOXD2 gene_id:2306|Hs108|chr1 (495 aa) initn: 616 init1: 521 opt: 663 Z-score: 403.4 bits: 84.0 E(32554): 3.8e-16 Smith-Waterman score: 663; 37.7% identity (57.7% similar) in 366 aa overlap (5-355:36-386) 10 20 30 pF1KB9 MTTEGGPPPAPLRRACSPVPGALQAALMSPPPAA :: :: :. .: . :: CCDS30 CCCEIMSSESSPAALSEADADIDVVGGGSGGGELPA---RSGPRAPRDVLPHGHEPPAEE 10 20 30 40 50 60 40 50 60 70 80 90 pF1KB9 AAAAAAAPETTSSSSSSSSASCASSSSSSNSASAP---SAACKSAGGGGAGAGSGGAKKA : : : : :.. :.. .: ... .:..: .:: ..:.: : : :::: CCDS30 AEADLAEDEEESGGCSDGEPRALASRGAAAAAGSPGPGAAAARGAAGPGPGPPSGGA--- 70 80 90 100 110 100 110 120 130 140 150 pF1KB9 SSGLRRPE-KPPYSYIALIVMAIQSSPSKRLTLSEIYQFLQARFPFFRGAYQGWKNSVRH . : : ::::::::::.::: .::.:::::::: .:...:::..: . .:.::.:: CCDS30 --ATRSPLVKPPYSYIALITMAILQSPKKRLTLSEICEFISGRFPYYREKFPAWQNSIRH 120 130 140 150 160 170 160 170 180 190 200 210 pF1KB9 NLSLNECFIKLPKGLGRPGKGHYWTIDPASEFMFEEGSFRRRPRGFRRKCQALKPMYHRV :::::.::.:.:. : ::::.:::.:: : ::..::: :: . :.: : : : . . 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CCDS30 HAFAFAAAAAAAPCQLSVPPGRAAAPPPGPPTASVFAGAGSAPAPAPASGSGPGPGPAGL 300 310 320 330 340 350 330 340 350 360 370 pF1KB9 PAMASA-IECHSPYTSPAAHWSSPGASPYLKQPPALTPSSNPAASAGLHSSMSSYSLEQS ::. .: . : . . :: : :.:. : :: CCDS30 PAFLGAELGCAKAFY--AASLSPPAAGTAAGLPTALLRQGLKTDAGGGAGGGGAGAGQRP 360 370 380 390 400 410 380 390 400 410 420 430 pF1KB9 YLHQNAREDLSVGLPRYQHHSTPVCDRKDFVLNFNGISSFHPSASGSYYHHHHQSVCQDI CCDS30 SFSIDHIMGHGGGGAAPPGAGEGSPGPPFAAAAGPGGQAQVLAMLTAPALAPVAGHIRLS 420 430 440 450 460 470 >>CCDS75259.1 FOXD1 gene_id:2297|Hs108|chr5 (465 aa) initn: 528 init1: 528 opt: 620 Z-score: 378.9 bits: 79.3 E(32554): 8.8e-15 Smith-Waterman score: 681; 40.4% identity (59.1% similar) in 369 aa overlap (58-383:83-448) 30 40 50 60 70 80 pF1KB9 MSPPPAAAAAAAAAPETTSSSSSSSSASCASSSSSSNSASAPSAACKSAGGGGAGAGSGG ...: . . :: :: .:::::.:.:.:: CCDS75 RRRRRSYAGEDELEDLEEEEDDDDILLAPPAGGSPAPPGPAP-AAGAGAGGGGGGGGAGG 60 70 80 90 100 110 90 100 110 120 130 140 pF1KB9 AKKASSGLRRPE-KPPYSYIALIVMAIQSSPSKRLTLSEIYQFLQARFPFFRGAYQGWKN . .:.:: . : ::::::::::.::: .::.:::::::: .:...:::..: . .:.: CCDS75 GGSAGSGAKNPLVKPPYSYIALITMAILQSPKKRLTLSEICEFISGRFPYYREKFPAWQN 120 130 140 150 160 170 150 160 170 180 190 200 pF1KB9 SVRHNLSLNECFIKLPKGLGRPGKGHYWTIDPASEFMFEEGSFRRRPRGFRRKCQALKPM :.:::::::.::.:.:. : ::::.:::.:: : ::..::: :: . :.:. : : CCDS75 SIRHNLSLNDCFVKIPREPGNPGKGNYWTLDPESADMFDNGSFLRRRKRFKRQ-PLLPPN 180 190 200 210 220 230 210 220 230 240 250 pF1KB9 YHRVVSGLGFGASLLPQGFDFQA-----PPSAPLGCHSQG-G-YG---GLDMMP-----A . : : ::. . : : ::. : :. : : :: ::.. : : CCDS75 AAAAESLLLRGAGAAGGAGDPAAAAALFPPAPPPPPHAYGYGPYGCGYGLQLPPYAPPSA 240 250 260 270 280 290 260 270 280 290 300 pF1KB9 GYDAGAGAPSHA--HPHHHHHHHVPHMSPNP-GSTYMASCPVPAG---PGGVGA----AG . :.:.: . : ::: :: . . : .. : : : :: . : :: CCDS75 LFAAAAAAAAAAAFHPHSPPPPPPPHGAAAELARTAFGYRPHPLGAALPGPLPASAAKAG 300 310 320 330 340 350 310 320 330 340 pF1KB9 GGG---------------GGDYGPDSSSSPVPSSPAMASAIECHSPYTSPAAHWSSPG-- : : ::. :: .... . .. : :.: :: ..: : :: : CCDS75 GPGASALARSPFSIESIIGGSLGPAAAAAAAAQAAAAAQASPSPSPVAAPPAPGSSGGGC 360 370 380 390 400 410 350 360 370 380 390 400 pF1KB9 ASPYLKQPPALTPSSNPAASAGLHSSMSSYSLEQSYLHQNAREDLSVGLPRYQHHSTPVC :. : : : ::.:. ::.:: : . ::: CCDS75 AAQAAVGPAAALTRSLVAAAAAAASSVSS-SAALGTLHQGTALSSVENFTARISNC 420 430 440 450 460 410 420 430 440 pF1KB9 DRKDFVLNFNGISSFHPSASGSYYHHHHQSVCQDIKPCVM >>CCDS624.1 FOXD3 gene_id:27022|Hs108|chr1 (478 aa) initn: 558 init1: 504 opt: 575 Z-score: 352.6 bits: 74.5 E(32554): 2.5e-13 Smith-Waterman score: 603; 33.4% identity (58.7% similar) in 395 aa overlap (3-381:46-417) 10 20 30 pF1KB9 MTTEGGPPPAPLRRACSPVPGALQAALMSPP- . .::: : .: :.: . . .:: CCDS62 TVLTAEDVDIDVVGEGDDGLEEKDSDAGCDSPAGPPELRLDEADEVPPAAPHHGQPQPPH 20 30 40 50 60 70 40 50 60 70 80 pF1KB9 ------PAAAAAAAAAPETTSSSSSSSSASCASSSSSSNSASAPSAACKSAGGGGAGAGS : ::.:.:.: .. .. . .: .. .. .... :.:: :::.:: CCDS62 QQPLTLPKEAAGAGAGP--GGDVGAPEADGCKGGVGGEEGGA-------SGGGPGAGSGS 80 90 100 110 120 90 100 110 120 130 140 pF1KB9 GGAKKASSGLRRPEKPPYSYIALIVMAIQSSPSKRLTLSEIYQFLQARFPFFRGAYQGWK .:. :. ::::::::::.::: .::.:.:::: : .:.. :::..: . .:. CCDS62 AGGLAPSKPKNSLVKPPYSYIALITMAILQSPQKKLTLSGICEFISNRFPYYREKFPAWQ 130 140 150 160 170 180 150 160 170 180 190 200 pF1KB9 NSVRHNLSLNECFIKLPKGLGRPGKGHYWTIDPASEFMFEEGSFRRRPRGFRRKCQA-LK ::.:::::::.::.:.:. : ::::.:::.:: :: ::..::: :: . :.:. : :. CCDS62 NSIRHNLSLNDCFVKIPREPGNPGKGNYWTLDPQSEDMFDNGSFLRRRKRFKRHQQEHLR 190 200 210 220 230 240 210 220 230 240 250 260 pF1KB9 PMYHRVVSGLGFGASLLPQGFDFQAPPSAPLGCHSQGGYGGLDMMPAGYDAGAGAPSHAH . ... .::: : . .: . : : : .. :. . ::. :.:.: . . CCDS62 EQTALMMQ--SFGAYSLAAAAGAAGPYGRPYGLHPAAAAGAYSH-PAAAAAAAAAAALQY 250 260 270 280 290 300 270 280 290 300 310 320 pF1KB9 PHHHHHHHVPHMSPNPGSTYMASCPVPAGPGG-VGAAGGGGGGDYGPDSSSSPVPSSPAM :. .: ..: . :: :.: .: ... :.. :: . . . : CCDS62 PYA-----LPPVAP------VLPPAVPLLPSGELGRKAAAFGSQLGPGLQLQLNSLGAAA 310 320 330 340 350 330 340 350 360 370 pF1KB9 ASAIECHSPYTSPAAHWSSPGASPYLK-------QPPALTPSSNPAASAGLHSSMSSYSL :.: . :. . : :.: : .. : : :. :. :: .. .. : CCDS62 AAAGTAGAAGTTASLIKSEPSARPSFSIENIIGGGPAAPGGSAVGAGVAGGTGGSGGGST 360 370 380 390 400 410 380 390 400 410 420 430 pF1KB9 EQSYLHQNAREDLSVGLPRYQHHSTPVCDRKDFVLNFNGISSFHPSASGSYYHHHHQSVC ::.: CCDS62 AQSFLRPPGTVQSAALMATHQPLSLSRTTATIAPILSVPLSGQFLQPAASAAAAAAAAAQ 420 430 440 450 460 470 >>CCDS35078.1 FOXE1 gene_id:2304|Hs108|chr9 (373 aa) initn: 579 init1: 473 opt: 567 Z-score: 349.4 bits: 73.6 E(32554): 3.9e-13 Smith-Waterman score: 570; 35.2% identity (61.0% similar) in 318 aa overlap (70-374:25-325) 40 50 60 70 80 90 pF1KB9 AAPETTSSSSSSSSASCASSSSSSNSASAPSAACKSAGGGGAGAGSGGAKKASSGLRRPE .:: .. : ..: :.:: .. . :.: CCDS35 MTAESGPPPPQPEVLATVKEERGETAAGAGVPGEATGRGAGG-RRRKRPLQRG- 10 20 30 40 50 100 110 120 130 140 150 pF1KB9 KPPYSYIALIVMAIQSSPSKRLTLSEIYQFLQARFPFFRGAYQGWKNSVRHNLSLNECFI ::::::::::.::: .: .::::. ::.:. ::::.: . :.::.::::.::.::. CCDS35 KPPYSYIALIAMAIAHAPERRLTLGGIYKFITERFPFYRDNPKKWQNSIRHNLTLNDCFL 60 70 80 90 100 110 160 170 180 190 200 210 pF1KB9 KLPKGLGRPGKGHYWTIDPASEFMFEEGSFRRRPRGFRRKCQALKPMY-HRVVSGLGFGA :.:. ::::::.::..:: .: ::: ::: :: . :.:. . : : : .... . .: CCDS35 KIPREAGRPGKGNYWALDPNAEDMFESGSFLRRRKRFKRSDLSTYPAYMHDAAAAAAAAA 120 130 140 150 160 170 220 230 240 250 260 270 pF1KB9 SLLPQGFDFQAPPSAPLGCHSQGGYGGLDMMPAGYDAGAGAPSHAHPHHHHHHHVPHMSP . . : : ..: .. : :.. :: . :: : : .. : :: CCDS35 AAAAAAAIF--PGAVPA---ARPPY------PGAVYAGYAPPSLAAPPPVYY---PAASP 180 190 200 210 280 290 300 310 320 330 pF1KB9 NPGSTYMASCPVPAGPGGVGAAGGGGGGDYGPDSSSSPVPSS---PAMASAIECHSPYTS .: .. : .: .: : .: ::. . :...:. .. :: .. . .: . CCDS35 GPCRVFGLVPERPLSPE-LGPAPSGPGGSCAFASAGAPATTTGYQPAGCTGARPANPSAY 220 230 240 250 260 270 340 350 360 370 380 pF1KB9 PAAHWSSPGASPYLKQPPALT-------PSSNPA--ASAGLHSSMSSYSLEQSYLHQNAR ::. . :: : .. :.: :: .:.:...... : CCDS35 AAAYAGPDGAYPQGAGSAIFAAAGRLAGPASPPAGGSSGGVETTVDFYGRTSPGQFGALG 280 290 300 310 320 330 390 400 410 420 430 440 pF1KB9 EDLSVGLPRYQHHSTPVCDRKDFVLNFNGISSFHPSASGSYYHHHHQSVCQDIKPCVM CCDS35 ACYNPGGQLGGASAGAYHARHAAAYPGGIDRFVSAM 340 350 360 370 >>CCDS4471.1 FOXQ1 gene_id:94234|Hs108|chr6 (403 aa) initn: 497 init1: 379 opt: 556 Z-score: 342.6 bits: 72.4 E(32554): 9.3e-13 Smith-Waterman score: 565; 33.8% identity (56.5% similar) in 379 aa overlap (5-364:25-386) 10 20 30 40 pF1KB9 MTTEGGPPPAPLRRACSPVPGALQAALMSPPPAAAAAAAA :. :.:: : . :. . : :...: . CCDS44 MKLEVFVPRAAHGDKQGSDLEGAGGSDAPSPLSAAGDDSLGSDGDCAANSPAAGGGARDT 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KB9 APETTSSSSSSSSASCASSSSSSNSASAPSAACKSAGGGGAGAGSGGAKKASSGLRRPEK . .:.... .: : .... .. : .: .:: :..::::: . ... ::: : CCDS44 QGDGEQSAGGGPGAEEAIPAAAAAAVVAEGAEAGAAGPGAGGAGSGEGARSKPYTRRP-K 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KB9 PPYSYIALIVMAIQSSPSKRLTLSEIYQFLQARFPFFRGAYQGWKNSVRHNLSLNECFIK :::::::::.:::..: . ::::.:: ..:...::::::.: ::.::::::::::.::.: CCDS44 PPYSYIALIAMAIRDSAGGRLTLAEINEYLMGKFPFFRGSYTGWRNSVRHNLSLNDCFVK 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 pF1KB9 LPKGLGRP-GKGHYWTIDPASEFMFEEGSFRRRPRGFRRKCQALKPMYHRV-VSGLGFGA . . .:: :: .:: ..: ::. : .: :::: :.. . ::. : . :. CCDS44 VLRDPSRPWGKDNYWMLNPNSEYTFADGVFRRR----RKR------LSHRAPVPAPGLRP 180 190 200 210 220 220 230 240 250 260 270 pF1KB9 SLLPQGFDFQAPPSAPLGCHSQGGYGGLDMMPAGYDAGAGAPSHAHPH--HHHHHHVPHM : :. ::: :: . : . . . :: . : : .. . CCDS44 EEAP-GLP-AAPPPAPAAPASPRMRSPARQEERASPAGKFSSSFAIDSILRKPFRSRRLR 230 240 250 260 270 280 280 290 300 310 320 pF1KB9 SPNPGSTYM---ASCP-VPAGPGGVGAA-----------GGGGGGDYGPDSSSSPVPSSP . ::.: . : :: .:: :. . :: :.: . : . : :..: CCDS44 DTAPGTTLQWGAAPCPPLPAFPALLPAAPCRALLPLCAYGAGEPARLGAREAEVP-PTAP 290 300 310 320 330 340 330 340 350 360 370 380 pF1KB9 AMASAIECHSPYTSPAAHWSSPGASPYLKQPPALTPSSNPAASAGLHSSMSSYSLEQSYL . : : ..:: .:.:. : :.. ::: CCDS44 PLLLA---PLPAAAPAKPLRGPAAGGAHLYCPLRLPAALQAASVRRPGPHLPYPVETLLA 350 360 370 380 390 400 390 400 410 420 430 440 pF1KB9 HQNAREDLSVGLPRYQHHSTPVCDRKDFVLNFNGISSFHPSASGSYYHHHHQSVCQDIKP >>CCDS3105.1 FOXL2 gene_id:668|Hs108|chr3 (376 aa) initn: 474 init1: 449 opt: 519 Z-score: 321.5 bits: 68.4 E(32554): 1.4e-11 Smith-Waterman score: 571; 34.3% identity (53.4% similar) in 399 aa overlap (30-389:6-376) 10 20 30 40 50 60 pF1KB9 MTTEGGPPPAPLRRACSPVPGALQAALMSPPPAAAAAAAAAPETTSSSSSSSSASCASSS : : ::.: :::: CCDS31 MMASYPEPEDAAGALLAPET---------------- 10 20 70 80 90 100 110 120 pF1KB9 SSSNSASAPSAACKSAGGGGAGAGSGGAKKASSGLRRPEKPPYSYIALIVMAIQSSPSKR . ... : . : : ::.:.:. . .: . . .::::::.:::.:::. : :: CCDS31 --GRTVKEPEGPPPSPGKGGGGGGGTAPEKPDPA----QKPPYSYVALIAMAIRESAEKR 30 40 50 60 70 130 140 150 160 170 180 pF1KB9 LTLSEIYQFLQARFPFFRGAYQGWKNSVRHNLSLNECFIKLPKGLGRPGKGHYWTIDPAS :::: :::.. :.:::.. .::.::.::::::::::::.:. : ::.:::.::: CCDS31 LTLSGIYQYIIAKFPFYEKNKKGWQNSIRHNLSLNECFIKVPREGGGERKGNYWTLDPAC 80 90 100 110 120 130 190 200 210 220 230 pF1KB9 EFMFEEGSFRRR---PRGFRRKCQALKP---MYHRVVSGLGFG-ASLLPQGFDFQAPP-- : :::.:..::: : :: ..: .. .. : : :. .:. . ::: CCDS31 EDMFEKGNYRRRRRMKRPFRPPPAHFQPGKGLFGAGGAAGGCGVAGAGADGYGYLAPPKY 140 150 160 170 180 190 240 250 260 270 280 pF1KB9 --------SAPLGCH-SQGGYGGLDMMPAGYDAGAGAPSHAHPHHHHHHHVPHMSPNPGS : :: : :.. .: :. :.:.: . : : : . .:.. 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CCDS76 YASGPGPAPPYAAPSYGAPGPLLGAPGGLAGADLAWLSLSGQQELLRLVRPPYSYSALIA 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB9 MAIQSSPSKRLTLSEIYQFLQARFPFFRGAYQGWKNSVRHNLSLNECFIKLPKGLGRPGK :::::.: ..::::.:::.. . :::.. . ::.::.:::::::.:: :.:. ::: CCDS76 MAIQSAPLRKLTLSQIYQYVAGNFPFYKRSKAGWQNSIRHNLSLNDCFKKVPRDEDDPGK 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KB9 GHYWTIDPASEFMFEEGSFRRRPRGFRRKCQALKPMYHRVVSGLGFGASLLPQG--FDFQ :.:::.:: : ::..:.:::. : : . .: : :.: : :.. .:.: CCDS76 GNYWTLDPNCEKMFDNGNFRRK-RKRRAEASAAVRSGARSVGGAEAPALEPPSAACLDLQ 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 pF1KB9 A-P-PSAPLGCHSQGGY--------GGLDMMPAGYDAGAGAPSHAHPHHHHHHHVPH-MS : : :::: . .:. ::: .:.: :: : .. :.:. .. CCDS76 ASPSPSAPEAATCFSGFASAMSALAGGLGTFPGGL---AGDFSFGRRPPTVATHAPQTLN 240 250 260 270 280 280 290 300 310 320 330 pF1KB9 PNPGSTYMASCPVPAGPGGVGAAGGGGGGDYGPDSSSSPVPSSPAMASAIECHSPYTSPA :.:: CCDS76 PSPGFAPGHQTAAAGFRLSHLLYSREGTEV 290 300 310 >>CCDS4473.1 FOXC1 gene_id:2296|Hs108|chr6 (553 aa) initn: 621 init1: 481 opt: 521 Z-score: 320.5 bits: 68.8 E(32554): 1.6e-11 Smith-Waterman score: 557; 37.4% identity (56.5% similar) in 329 aa overlap (67-393:48-332) 40 50 60 70 80 90 pF1KB9 AAAAAPETTSSSSSSSSASCASSSSSSNSASAPSAACKSAGGGGAGAGSGGAKKASSGLR : :. : . :: . . : . . . CCDS44 YLGGEQSYYRAAAAAAGGGYTAMPAPMSVYSHPAHAEQYPGGMARAYGPYTPQPQPKDMV 20 30 40 50 60 70 100 110 120 130 140 150 pF1KB9 RPEKPPYSYIALIVMAIQSSPSKRLTLSEIYQFLQARFPFFRGAYQGWKNSVRHNLSLNE ::::::::::.::::..:.:..::. ::::.. ::::.: :::.::.:::::::: CCDS44 ---KPPYSYIALITMAIQNAPDKKITLNGIYQFIMDRFPFYRDNKQGWQNSIRHNLSLNE 80 90 100 110 120 130 160 170 180 190 200 210 pF1KB9 CFIKLPKGLGRPGKGHYWTIDPASEFMFEEGSFRRRPRGFRRKCQALKPMYHRVVSGLGF ::.:.:. .:::: :::.:: : :::.::: :: : :..: .:.: .. : CCDS44 CFVKVPRDDKKPGKGSYWTLDPDSYNMFENGSFLRRRRRFKKK-DAVKDKEEKDRLHLKE 140 150 160 170 180 190 220 230 240 250 260 270 pF1KB9 GASLLPQGFDFQAPPSAPLGCHSQGGYGGLDMMPAGYDAGAGAPSHAHPHHHHHHHVPHM : : . :: :: : :..: .: .: : . CCDS44 PP---PPG---RQPPPAP---------------PEQADGNAPGP---QP--------PPV 200 210 220 280 290 300 310 320 330 pF1KB9 SPNPGSTYMASCPVPAGPGGVGAAGGGGGGDYGPDSSSSPVPSSPAMASAIECHSPYTSP . .: ..:: : : . .:: :.:.. : . :: :: ...:. : . : CCDS44 RIQDIKTENGTCPSPPQPLSPAAALGSGSAAAVP-KIESPDSSSSSLSSG--SSPPGSLP 230 240 250 260 270 340 350 360 370 380 390 pF1KB9 AAH-WSSPGASPYLKQPPALTPSSNPAA-SAGLHSSMSSYSLEQSYLHQNAREDLSVGLP .:. : ::. . :: .::. : : :. . ::. : :.: .:: :: CCDS44 SARPLSLDGAD---SAPPPPAPSAPPPHHSQGFSVDNIMTSLRGS--PQSAAAELSSGLL 280 290 300 310 320 330 400 410 420 430 440 pF1KB9 RYQHHSTPVCDRKDFVLNFNGISSFHPSASGSYYHHHHQSVCQDIKPCVM CCDS44 ASAAASSRAGIAPPLALGAYSPGQSSLYSSPCSQTSSAGSSGGGGGGAGAAGGAGGAGTY 340 350 360 370 380 390 444 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sat Nov 5 01:09:41 2016 done: Sat Nov 5 01:09:41 2016 Total Scan time: 3.320 Total Display time: 0.050 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]