Result of FASTA (omim) for
pF1KB9734
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9734, 486 aa
1>>>pF1KB9734 486 - 486 aa - 486 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.7533+/-0.000415; mu= -20.9810+/- 0.026
mean_var=618.0523+/-134.792, 0's: 0 Z-trim(124.9): 988 B-trim: 0 in 0/57
Lambda= 0.051590
statistics sampled from 45863 (47599) to 45863 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.825), E-opt: 0.2 (0.558), width: 16
Scan time: 9.180
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001956 (OMIM: 128992) early growth response pro ( 589) 3441 270.9 6.7e-72
NP_001129651 (OMIM: 129010,145900,605253,607678) E ( 426) 596 59.1 2.9e-08
NP_001307966 (OMIM: 129010,145900,605253,607678) E ( 426) 596 59.1 2.9e-08
NP_001955 (OMIM: 128990) early growth response pro ( 543) 598 59.3 3.2e-08
NP_000390 (OMIM: 129010,145900,605253,607678) E3 S ( 476) 596 59.1 3.2e-08
NP_001129649 (OMIM: 129010,145900,605253,607678) E ( 476) 596 59.1 3.2e-08
NP_001129650 (OMIM: 129010,145900,605253,607678) E ( 476) 596 59.1 3.2e-08
XP_011537729 (OMIM: 129010,145900,605253,607678) P ( 489) 596 59.1 3.2e-08
NP_001186810 (OMIM: 602419) early growth response ( 333) 574 57.3 7.7e-08
XP_005273483 (OMIM: 602419) PREDICTED: early growt ( 349) 574 57.3 8e-08
NP_001186809 (OMIM: 602419) early growth response ( 349) 574 57.3 8e-08
XP_005273482 (OMIM: 602419) PREDICTED: early growt ( 442) 577 57.7 8.1e-08
NP_004421 (OMIM: 602419) early growth response pro ( 387) 574 57.4 8.6e-08
XP_011542731 (OMIM: 602419) PREDICTED: early growt ( 406) 574 57.4 8.9e-08
NP_077742 (OMIM: 106210,136680,156240,194070,19407 ( 514) 392 44.0 0.0013
NP_001185480 (OMIM: 106210,136680,156240,194070,19 ( 302) 378 42.7 0.0018
NP_000369 (OMIM: 106210,136680,156240,194070,19407 ( 497) 378 42.9 0.0025
NP_077744 (OMIM: 106210,136680,156240,194070,19407 ( 517) 376 42.8 0.0029
NP_001185481 (OMIM: 106210,136680,156240,194070,19 ( 288) 362 41.5 0.0039
>>NP_001956 (OMIM: 128992) early growth response protein (589 aa)
initn: 3441 init1: 3441 opt: 3441 Z-score: 1411.8 bits: 270.9 E(85289): 6.7e-72
Smith-Waterman score: 3441; 100.0% identity (100.0% similar) in 486 aa overlap (1-486:104-589)
10 20 30
pF1KB9 MLHLSEFSEPDALLVKSTEGCCAEPSAELP
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GEPLPPASPPPARPQAQRARPRAPHSRRRAMLHLSEFSEPDALLVKSTEGCCAEPSAELP
80 90 100 110 120 130
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 RLPARDAPAATGYPGAGDFLSWALNSCGASGDLADSCFLEGPAPTPPPGLSYSGSFFIQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RLPARDAPAATGYPGAGDFLSWALNSCGASGDLADSCFLEGPAPTPPPGLSYSGSFFIQA
140 150 160 170 180 190
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 VPEHPHDPEALFNLMSGILGLAPFPGPEAAASRSPLDAPFPAGSDALLPGPPDLYSPDLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VPEHPHDPEALFNLMSGILGLAPFPGPEAAASRSPLDAPFPAGSDALLPGPPDLYSPDLG
200 210 220 230 240 250
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 AAPFPEAFWEASPCAGAPSQCLYEPQLSPPDVKPGLRAPPASPALDAVSAFKGPYAPWEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AAPFPEAFWEASPCAGAPSQCLYEPQLSPPDVKPGLRAPPASPALDAVSAFKGPYAPWEL
260 270 280 290 300 310
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 LSVGAPGNCGSQGDYQAAPEARFPVIGTKIEDLLSISCPAELPAVPANRLYPSGAYDAFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LSVGAPGNCGSQGDYQAAPEARFPVIGTKIEDLLSISCPAELPAVPANRLYPSGAYDAFP
320 330 340 350 360 370
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 LAPGDLGEGAEGLPGLLTPPSGEGGSSGDGGEFLASTQPQLSPLGLRSAAAADFPKPLVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LAPGDLGEGAEGLPGLLTPPSGEGGSSGDGGEFLASTQPQLSPLGLRSAAAADFPKPLVA
380 390 400 410 420 430
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 DIPGSSGVAAPPVPPPPPTPFPQAKARRKGRRGGKCSTRCFCPRPHAKAFACPVESCVRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DIPGSSGVAAPPVPPPPPTPFPQAKARRKGRRGGKCSTRCFCPRPHAKAFACPVESCVRS
440 450 460 470 480 490
400 410 420 430 440 450
pF1KB9 FARSDELNRHLRIHTGHKPFQCRICLRNFSRSDHLTTHVRTHTGEKPFACDVCGRRFARS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FARSDELNRHLRIHTGHKPFQCRICLRNFSRSDHLTTHVRTHTGEKPFACDVCGRRFARS
500 510 520 530 540 550
460 470 480
pF1KB9 DEKKRHSKVHLKQKARAEERLKGLGFYSLGLSFASL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DEKKRHSKVHLKQKARAEERLKGLGFYSLGLSFASL
560 570 580
>>NP_001129651 (OMIM: 129010,145900,605253,607678) E3 SU (426 aa)
initn: 803 init1: 541 opt: 596 Z-score: 269.2 bits: 59.1 E(85289): 2.9e-08
Smith-Waterman score: 649; 38.0% identity (51.2% similar) in 418 aa overlap (73-466:30-376)
50 60 70 80 90
pF1KB9 YPGAGDFLSWALNSCGASGDLADSCFLEGPAPTPPP---GLSYSGSFFIQAVPEHPHD--
::. : ..: :.: :. :..:
NP_001 MNGVAGDGMINIDMTGEKRSLDLPYPSSFAPVSAPRNQTFTYMGKFSID--PQYPGASC
10 20 30 40 50
100 110 120 130 140
pF1KB9 -PEALFNLMS-GILGLAPFPGPEAA------ASRSPLDAPFPAGSDALLPGPPDL---YS
::...:..: ::: . :. .: :: .:: : : : .. ::: ::
NP_001 YPEGIINIVSAGILQGVTSPASTTASSSVTSASPNPL-ATGPLGVCTMSQTQPDLDHLYS
60 70 80 90 100 110
150 160 170 180 190
pF1KB9 PDLGAAPFPEAFWEASPCAGA----PSQCLYEPQLSPPD---VKPGLRAPPASPALDAVS
: : : . : ::: :: : : . : : .:: : .
NP_001 P----PPPPPPY---SGCAGDLYQDPSAFLSAATTSTSSSLAYPPPPSYPSPKPATDP-G
120 130 140 150 160
200 210 220 230 240 250
pF1KB9 AFKGPYAPWELLSVGAPGNCGSQGDYQAAPEARFPVIGTKIEDLLSISCPAELPAVPANR
: :. : :: :: . . :: : . :: . ::
NP_001 LF--PMIP------DYPGFFPSQ--------CQRDLHGTAGPDRKPFPCPLDTLRVPPP-
170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KB9 LYPSGAYDAFPLAPGDLGEGAEGLPGLLTPPSGEGGSSGDGGEFLASTQPQLSPLGLRSA
: : .. : :: . :. : :.. ::: : :.: : : ::
NP_001 LTPLSTIRNFT-----LGGPSAGVTG----PGASGGSEG----------PRL-P-GSSSA
220 230 240 250
320 330 340 350 360 370
pF1KB9 AAADFPKPLVADIPGSSGVAAPPVPPPPPTPF-PQAKARRKGRRGGKCSTRCFCPRPHAK
::: .:: . : :. : . :. : .: . : .
NP_001 AAA---------------AAAAAAYNPHHLPLRPILRPRKYPNRPSKTPV-------HER
260 270 280
380 390 400 410 420 430
pF1KB9 AFACPVESCVRSFARSDELNRHLRIHTGHKPFQCRICLRNFSRSDHLTTHVRTHTGEKPF
. ::.:.: : :.:::::.::.::::::::::::::.::::::::::::.:::::::::
NP_001 PYPCPAEGCDRRFSRSDELTRHIRIHTGHKPFQCRICMRNFSRSDHLTTHIRTHTGEKPF
290 300 310 320 330 340
440 450 460 470 480
pF1KB9 ACDVCGRRFARSDEKKRHSKVHLKQKARAEERLKGLGFYSLGLSFASL
::: :::.::::::.:::.:.::.:: :
NP_001 ACDYCGRKFARSDERKRHTKIHLRQKERKSSAPSASVPAPSTASCSGGVQPGGTLCSSNS
350 360 370 380 390 400
>>NP_001307966 (OMIM: 129010,145900,605253,607678) E3 SU (426 aa)
initn: 803 init1: 541 opt: 596 Z-score: 269.2 bits: 59.1 E(85289): 2.9e-08
Smith-Waterman score: 649; 38.0% identity (51.2% similar) in 418 aa overlap (73-466:30-376)
50 60 70 80 90
pF1KB9 YPGAGDFLSWALNSCGASGDLADSCFLEGPAPTPPP---GLSYSGSFFIQAVPEHPHD--
::. : ..: :.: :. :..:
NP_001 MNGVAGDGMINIDMTGEKRSLDLPYPSSFAPVSAPRNQTFTYMGKFSID--PQYPGASC
10 20 30 40 50
100 110 120 130 140
pF1KB9 -PEALFNLMS-GILGLAPFPGPEAA------ASRSPLDAPFPAGSDALLPGPPDL---YS
::...:..: ::: . :. .: :: .:: : : : .. ::: ::
NP_001 YPEGIINIVSAGILQGVTSPASTTASSSVTSASPNPL-ATGPLGVCTMSQTQPDLDHLYS
60 70 80 90 100 110
150 160 170 180 190
pF1KB9 PDLGAAPFPEAFWEASPCAGA----PSQCLYEPQLSPPD---VKPGLRAPPASPALDAVS
: : : . : ::: :: : : . : : .:: : .
NP_001 P----PPPPPPY---SGCAGDLYQDPSAFLSAATTSTSSSLAYPPPPSYPSPKPATDP-G
120 130 140 150 160
200 210 220 230 240 250
pF1KB9 AFKGPYAPWELLSVGAPGNCGSQGDYQAAPEARFPVIGTKIEDLLSISCPAELPAVPANR
: :. : :: :: . . :: : . :: . ::
NP_001 LF--PMIP------DYPGFFPSQ--------CQRDLHGTAGPDRKPFPCPLDTLRVPPP-
170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KB9 LYPSGAYDAFPLAPGDLGEGAEGLPGLLTPPSGEGGSSGDGGEFLASTQPQLSPLGLRSA
: : .. : :: . :. : :.. ::: : :.: : : ::
NP_001 LTPLSTIRNFT-----LGGPSAGVTG----PGASGGSEG----------PRL-P-GSSSA
220 230 240 250
320 330 340 350 360 370
pF1KB9 AAADFPKPLVADIPGSSGVAAPPVPPPPPTPF-PQAKARRKGRRGGKCSTRCFCPRPHAK
::: .:: . : :. : . :. : .: . : .
NP_001 AAA---------------AAAAAAYNPHHLPLRPILRPRKYPNRPSKTPV-------HER
260 270 280
380 390 400 410 420 430
pF1KB9 AFACPVESCVRSFARSDELNRHLRIHTGHKPFQCRICLRNFSRSDHLTTHVRTHTGEKPF
. ::.:.: : :.:::::.::.::::::::::::::.::::::::::::.:::::::::
NP_001 PYPCPAEGCDRRFSRSDELTRHIRIHTGHKPFQCRICMRNFSRSDHLTTHIRTHTGEKPF
290 300 310 320 330 340
440 450 460 470 480
pF1KB9 ACDVCGRRFARSDEKKRHSKVHLKQKARAEERLKGLGFYSLGLSFASL
::: :::.::::::.:::.:.::.:: :
NP_001 ACDYCGRKFARSDERKRHTKIHLRQKERKSSAPSASVPAPSTASCSGGVQPGGTLCSSNS
350 360 370 380 390 400
>>NP_001955 (OMIM: 128990) early growth response protein (543 aa)
initn: 686 init1: 575 opt: 598 Z-score: 268.7 bits: 59.3 E(85289): 3.2e-08
Smith-Waterman score: 668; 34.8% identity (55.7% similar) in 465 aa overlap (23-470:17-428)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MLHLSEFSEPDALLVKSTEGCCAEPSAELPRLPARDA-PAATGY----PGAGDFLSWALN
..: . .:. :. : : . :: .::. :
NP_001 MAAAKAEMQLMSPLQISDPFGSFPHSPTMDNYPKLEEMMLLSNGAPQFLGAAGA
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 SCGASGDLADSCFLEGPAPTPPPGLSYSGSFFI-QA-VPEHPHDPEALFNLMSGILGLAP
:.... ..: : . . : :.: : :: . :.:.. :
NP_001 PEGSGSNSSSSSSGGGGGGGGGSNSSSSSSTFNPQADTGEQPYEH----------LTAES
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 FPGPEAAASRSPLDAPFPAGSDALLPGPPDLYSPDLGAAPFPEA---FWEASPCAGAPSQ
:: . ... .:. . : :: :. .. : :.. .: : . :
NP_001 FPDISLNNEKVLVETSYPSQTTRL---PPITYTGRFSLEPAPNSGNTLWPE-PLFSLVSG
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 CLYEPQLSPPDVKPGLRAPPASPALDAVSAFKGPYAPWELLSVGAPGNCGSQGDYQAAPE
. . .:: . . :: ::: ...:: ..: : :: ..:.: :. :.:::
NP_001 LV--SMTNPPASSSS--AP--SPAASSASASQSP--P---LSCAVPSN-DSSPIYSAAPT
170 180 190 200
240 250 260 270 280
pF1KB9 ARFPVIGTKIEDLLSISCPAELPAVPANRL-YPSGAYDAFPLAPGDLGEGAEGLPGLLTP
::. .: :.. .:. .. : :: :: : : : : . .: : :
NP_001 --FPTPNT---DIFPEPQSQAFPGSAGTALQYPPPAY---PAAKG--GFQVPMIPDYLFP
210 220 230 240 250
290 300 310 320 330 340
pF1KB9 PS-GEGG-SSGDGGEFLA----STQPQLSPLGLRSAAAADFPKPLVADIPGSSGVAAPPV
. :. : .. : : . . ::.:.::. .: :.. ::. . : .
NP_001 QQQGDLGLGTPDQKPFQGLESRTQQPSLTPLSTIKAFATQ---------SGSQDLKALNT
260 270 280 290 300
350 360 370 380 390 400
pF1KB9 PPPPPTPFPQAKARRKGRRGGKCSTRCFCPRPHAKAFACPVESCVRSFARSDELNRHLRI
: .. :. : .: : :: . .::::::: : :.:::::.::.::
NP_001 SYQSQLIKP-SRMRKYPNRPSKT------P-PHERPYACPVESCDRRFSRSDELTRHIRI
310 320 330 340 350 360
410 420 430 440 450 460
pF1KB9 HTGHKPFQCRICLRNFSRSDHLTTHVRTHTGEKPFACDVCGRRFARSDEKKRHSKVHLKQ
:::.::::::::.::::::::::::.::::::::::::.:::.::::::.:::.:.::.:
NP_001 HTGQKPFQCRICMRNFSRSDHLTTHIRTHTGEKPFACDICGRKFARSDERKRHTKIHLRQ
370 380 390 400 410 420
470 480
pF1KB9 KARAEERLKGLGFYSLGLSFASL
: . ..
NP_001 KDKKADKSVVASSATSSLSSYPSPVATSYPSPVTTSYPSPATTSYPSPVPTSFSSPGSST
430 440 450 460 470 480
>>NP_000390 (OMIM: 129010,145900,605253,607678) E3 SUMO- (476 aa)
initn: 803 init1: 541 opt: 596 Z-score: 268.6 bits: 59.1 E(85289): 3.2e-08
Smith-Waterman score: 649; 38.0% identity (51.2% similar) in 418 aa overlap (73-466:80-426)
50 60 70 80 90
pF1KB9 YPGAGDFLSWALNSCGASGDLADSCFLEGPAPTPPP---GLSYSGSFFIQAVPEHPHD--
::. : ..: :.: :. :..:
NP_000 QMNGVAGDGMINIDMTGEKRSLDLPYPSSFAPVSAPRNQTFTYMGKFSID--PQYPGASC
50 60 70 80 90 100
100 110 120 130 140
pF1KB9 -PEALFNLMS-GILGLAPFPGPEAA------ASRSPLDAPFPAGSDALLPGPPDL---YS
::...:..: ::: . :. .: :: .:: : : : .. ::: ::
NP_000 YPEGIINIVSAGILQGVTSPASTTASSSVTSASPNPL-ATGPLGVCTMSQTQPDLDHLYS
110 120 130 140 150 160
150 160 170 180 190
pF1KB9 PDLGAAPFPEAFWEASPCAGA----PSQCLYEPQLSPPD---VKPGLRAPPASPALDAVS
: : : . : ::: :: : : . : : .:: : .
NP_000 P----PPPPPPY---SGCAGDLYQDPSAFLSAATTSTSSSLAYPPPPSYPSPKPATDP-G
170 180 190 200 210
200 210 220 230 240 250
pF1KB9 AFKGPYAPWELLSVGAPGNCGSQGDYQAAPEARFPVIGTKIEDLLSISCPAELPAVPANR
: :. : :: :: . . :: : . :: . ::
NP_000 LF--PMIP------DYPGFFPSQ--------CQRDLHGTAGPDRKPFPCPLDTLRVPPP-
220 230 240 250 260
260 270 280 290 300 310
pF1KB9 LYPSGAYDAFPLAPGDLGEGAEGLPGLLTPPSGEGGSSGDGGEFLASTQPQLSPLGLRSA
: : .. : :: . :. : :.. ::: : :.: : : ::
NP_000 LTPLSTIRNFT-----LGGPSAGVTG----PGASGGSEG----------PRL-P-GSSSA
270 280 290 300
320 330 340 350 360 370
pF1KB9 AAADFPKPLVADIPGSSGVAAPPVPPPPPTPF-PQAKARRKGRRGGKCSTRCFCPRPHAK
::: .:: . : :. : . :. : .: . : .
NP_000 AAA---------------AAAAAAYNPHHLPLRPILRPRKYPNRPSKTPV-------HER
310 320 330
380 390 400 410 420 430
pF1KB9 AFACPVESCVRSFARSDELNRHLRIHTGHKPFQCRICLRNFSRSDHLTTHVRTHTGEKPF
. ::.:.: : :.:::::.::.::::::::::::::.::::::::::::.:::::::::
NP_000 PYPCPAEGCDRRFSRSDELTRHIRIHTGHKPFQCRICMRNFSRSDHLTTHIRTHTGEKPF
340 350 360 370 380 390
440 450 460 470 480
pF1KB9 ACDVCGRRFARSDEKKRHSKVHLKQKARAEERLKGLGFYSLGLSFASL
::: :::.::::::.:::.:.::.:: :
NP_000 ACDYCGRKFARSDERKRHTKIHLRQKERKSSAPSASVPAPSTASCSGGVQPGGTLCSSNS
400 410 420 430 440 450
>>NP_001129649 (OMIM: 129010,145900,605253,607678) E3 SU (476 aa)
initn: 803 init1: 541 opt: 596 Z-score: 268.6 bits: 59.1 E(85289): 3.2e-08
Smith-Waterman score: 649; 38.0% identity (51.2% similar) in 418 aa overlap (73-466:80-426)
50 60 70 80 90
pF1KB9 YPGAGDFLSWALNSCGASGDLADSCFLEGPAPTPPP---GLSYSGSFFIQAVPEHPHD--
::. : ..: :.: :. :..:
NP_001 QMNGVAGDGMINIDMTGEKRSLDLPYPSSFAPVSAPRNQTFTYMGKFSID--PQYPGASC
50 60 70 80 90 100
100 110 120 130 140
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::...:..: ::: . :. .: :: .:: : : : .. ::: ::
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110 120 130 140 150 160
150 160 170 180 190
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: : : . : ::: :: : : . : : .:: : .
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200 210 220 230 240 250
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: :. : :: :: . . :: : . :: . ::
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: : .. : :: . :. : :.. ::: : :.: : : ::
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::: .:: . : :. : . :. : .: . : .
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. ::.:.: : :.:::::.::.::::::::::::::.::::::::::::.:::::::::
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::: :::.::::::.:::.:.::.:: :
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>>NP_001129650 (OMIM: 129010,145900,605253,607678) E3 SU (476 aa)
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pF1KB9 -PEALFNLMS-GILGLAPFPGPEAA------ASRSPLDAPFPAGSDALLPGPPDL---YS
::...:..: ::: . :. .: :: .:: : : : .. ::: ::
NP_001 YPEGIINIVSAGILQGVTSPASTTASSSVTSASPNPL-ATGPLGVCTMSQTQPDLDHLYS
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150 160 170 180 190
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: : : . : ::: :: : : . : : .:: : .
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: :. : :: :: . . :: : . :: . ::
NP_001 LF--PMIP------DYPGFFPSQ--------CQRDLHGTAGPDRKPFPCPLDTLRVPPP-
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: : .. : :: . :. : :.. ::: : :.: : : ::
NP_001 LTPLSTIRNFT-----LGGPSAGVTG----PGASGGSEG----------PRL-P-GSSSA
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pF1KB9 AAADFPKPLVADIPGSSGVAAPPVPPPPPTPF-PQAKARRKGRRGGKCSTRCFCPRPHAK
::: .:: . : :. : . :. : .: . : .
NP_001 AAA---------------AAAAAAYNPHHLPLRPILRPRKYPNRPSKTPV-------HER
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. ::.:.: : :.:::::.::.::::::::::::::.::::::::::::.:::::::::
NP_001 PYPCPAEGCDRRFSRSDELTRHIRIHTGHKPFQCRICMRNFSRSDHLTTHIRTHTGEKPF
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::: :::.::::::.:::.:.::.:: :
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>>XP_011537729 (OMIM: 129010,145900,605253,607678) PREDI (489 aa)
initn: 803 init1: 541 opt: 596 Z-score: 268.5 bits: 59.1 E(85289): 3.2e-08
Smith-Waterman score: 649; 38.0% identity (51.2% similar) in 418 aa overlap (73-466:93-439)
50 60 70 80 90
pF1KB9 YPGAGDFLSWALNSCGASGDLADSCFLEGPAPTPPP---GLSYSGSFFIQAVPEHPHD--
::. : ..: :.: :. :..:
XP_011 QMNGVAGDGMINIDMTGEKRSLDLPYPSSFAPVSAPRNQTFTYMGKFSID--PQYPGASC
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XP_011 YPEGIINIVSAGILQGVTSPASTTASSSVTSASPNPL-ATGPLGVCTMSQTQPDLDHLYS
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pF1KB9 PDLGAAPFPEAFWEASPCAGA----PSQCLYEPQLSPPD---VKPGLRAPPASPALDAVS
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XP_011 P----PPPPPPY---SGCAGDLYQDPSAFLSAATTSTSSSLAYPPPPSYPSPKPATDP-G
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: :. : :: :: . . :: : . :: . ::
XP_011 LF--PMIP------DYPGFFPSQ--------CQRDLHGTAGPDRKPFPCPLDTLRVPPP-
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pF1KB9 LYPSGAYDAFPLAPGDLGEGAEGLPGLLTPPSGEGGSSGDGGEFLASTQPQLSPLGLRSA
: : .. : :: . :. : :.. ::: : :.: : : ::
XP_011 LTPLSTIRNFT-----LGGPSAGVTG----PGASGGSEG----------PRL-P-GSSSA
280 290 300 310
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pF1KB9 AAADFPKPLVADIPGSSGVAAPPVPPPPPTPF-PQAKARRKGRRGGKCSTRCFCPRPHAK
::: .:: . : :. : . :. : .: . : .
XP_011 AAA---------------AAAAAAYNPHHLPLRPILRPRKYPNRPSKTPV-------HER
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. ::.:.: : :.:::::.::.::::::::::::::.::::::::::::.:::::::::
XP_011 PYPCPAEGCDRRFSRSDELTRHIRIHTGHKPFQCRICMRNFSRSDHLTTHIRTHTGEKPF
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pF1KB9 ACDVCGRRFARSDEKKRHSKVHLKQKARAEERLKGLGFYSLGLSFASL
::: :::.::::::.:::.:.::.:: :
XP_011 ACDYCGRKFARSDERKRHTKIHLRQKERKSSAPSASVPAPSTASCSGGVQPGGTLCSSNS
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>>NP_001186810 (OMIM: 602419) early growth response prot (333 aa)
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pF1KB9 SFFIQAVPEHPHDPEALFNLMSGILGLAPFPGPEAAASRSPLDAPFPAGSDALLPGPPDL
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NP_001 MDIGLTNEKPNPELSYSGSF--QPAPGNKTVTYLGKFAF
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150 160 170 180 190
pF1KB9 YSP-----DLGAAPFPEAFWEASPCAGAPS-QCLYEPQLSPP--DVKPGLRA-PPASPAL
:: : . . .. . : .:: : : ...:: ::. : :: :
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pF1KB9 DAVSAFKGPYAPWELLSVGAPGNCGSQGDYQAAPEARFPVIGTKIEDLLSISCPAELPAV
: : . . : : :: : :::.: :.. ... .: .
NP_001 DLYSEPVSFHDPQ-----GNPGLAYSPQDYQSAK----PALDSNL-----------FPMI
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pF1KB9 PANRLYPSGAYDAFPLAPGDLGEGAEGLPGLLTPPSGEGGSSGDGGEFLASTQPQLSPLG
: :: :.:.: : : .: . . . : ..::
NP_001 PDYNLYHH---------PNDMGSIPEHKPF-------------QGMDPIRVNPPPITPLE
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pF1KB9 LRSAAAADFPKPLVADIPGSSGVAAPPVPPPPPTPFPQAKARRKGRRGGKCSTRCFCPRP
.: : . :: ... ::. : : :. : .: . ::
NP_001 TIKA----FKDKQIH--PGFGSLPQPPLTLKPIRP------RKYPNRPSKTPLH---ERP
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pF1KB9 HAKAFACPVESCVRSFARSDELNRHLRIHTGHKPFQCRICLRNFSRSDHLTTHVRTHTGE
:: ::.:.: : :.:::::.:::::::::::::::::.:.::::::::::.::::::
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:::::. :::.::::::.:::.:.::::: . :.
NP_001 KPFACEFCGRKFARSDERKRHAKIHLKQKEKKAEKGGAPSASSAPPVSLAPVVTTCA
280 290 300 310 320 330
>>XP_005273483 (OMIM: 602419) PREDICTED: early growth re (349 aa)
initn: 834 init1: 554 opt: 574 Z-score: 261.5 bits: 57.3 E(85289): 8e-08
Smith-Waterman score: 599; 36.4% identity (54.0% similar) in 363 aa overlap (117-470:3-327)
90 100 110 120 130 140
pF1KB9 FIQAVPEHPHDPEALFNLMSGILGLAPFPGPEAAAS-RSPLDAPFPAGSDALLPGPPDLY
: :: : :. . . : :.: :
XP_005 MEPCAAWSPRGGRENVMDIGLTNEKPNPELSY
10 20 30
150 160 170 180 190
pF1KB9 SPDLGAAPFPEAFWEASPCA-GAPSQCLYEPQLSPPDVKPG-LRAPPASPALDA----VS
: .. :: .. . : .::. . .: .. : : .:::: ::.. .:
XP_005 SGSFQPAPGNKTVTYLGKFAFDSPSNWCQDNIISL--MSAGILGVPPASGALSTQTSTAS
40 50 60 70 80 90
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pF1KB9 AFKGPYAPWELLSVGAP--GNCGSQGDYQAAPEARFPVIGTKIEDLLSISCPAELPAVPA
. : . : . . : .::: : . : . :. . . ::. .
XP_005 MVQPPQGDVEAMYPALPPYSNCG---DLYSEPVSFHDPQGNPGLAYSPQDYQSAKPALDS
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pF1KB9 NRLYPSGAYDAFPLAPGDLGEGAEGLPGLLTPPSGEGGSSGDGGEFLASTQPQLSPLGLR
: :.: . :.:.: : : .: . . . : ..::
XP_005 N-LFPMIPDYNLYHHPNDMGSIPEHKPF-------------QGMDPIRVNPPPITPLETI
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pF1KB9 SAAAADFPKPLVADIPGSSGVAAPPVPPPPPTPFPQAKARRKGRRGGKCSTRCFCPRPHA
.: : . :: ... ::. : : :. : .: . ::::
XP_005 KA----FKDKQIH--PGFGSLPQPPLTLKPIRP------RKYPNRPSKTPLH---ERPHA
200 210 220 230
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pF1KB9 KAFACPVESCVRSFARSDELNRHLRIHTGHKPFQCRICLRNFSRSDHLTTHVRTHTGEKP
::.:.: : :.:::::.:::::::::::::::::.:.::::::::::.::::::::
XP_005 ----CPAEGCDRRFSRSDELTRHLRIHTGHKPFQCRICMRSFSRSDHLTTHIRTHTGEKP
240 250 260 270 280 290
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pF1KB9 FACDVCGRRFARSDEKKRHSKVHLKQKARAEERLKGLGFYSLGLSFASL
:::. :::.::::::.:::.:.::::: . :.
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60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 18:35:42 2016 done: Fri Nov 4 18:35:43 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]