Result of FASTA (omim) for
pF1KB9749
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9749, 559 aa
1>>>pF1KB9749 559 - 559 aa - 559 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 16.6975+/-0.000436; mu= -34.2717+/- 0.027
mean_var=595.0596+/-121.232, 0's: 0 Z-trim(125.4): 40 B-trim: 0 in 0/62
Lambda= 0.052577
statistics sampled from 48857 (48926) to 48857 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.813), E-opt: 0.2 (0.574), width: 16
Scan time: 14.240
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_005925 (OMIM: 159556) protein ENL [Homo sapiens ( 559) 3736 297.9 5.8e-80
XP_011526324 (OMIM: 159556) PREDICTED: protein ENL ( 561) 3714 296.2 1.8e-79
XP_011526323 (OMIM: 159556) PREDICTED: protein ENL ( 600) 3708 295.7 2.7e-79
XP_016882308 (OMIM: 159556) PREDICTED: protein ENL ( 527) 3508 280.6 8.8e-75
XP_011526325 (OMIM: 159556) PREDICTED: protein ENL ( 558) 2446 200.0 1.6e-50
NP_004520 (OMIM: 159558) protein AF-9 isoform a [H ( 568) 1805 151.4 7.2e-36
NP_001273620 (OMIM: 159558) protein AF-9 isoform b ( 565) 1799 150.9 9.9e-36
XP_016870215 (OMIM: 159558) PREDICTED: protein AF- ( 520) 1423 122.4 3.5e-27
XP_016870216 (OMIM: 159558) PREDICTED: protein AF- ( 517) 1417 121.9 4.8e-27
>>NP_005925 (OMIM: 159556) protein ENL [Homo sapiens] (559 aa)
initn: 3736 init1: 3736 opt: 3736 Z-score: 1556.6 bits: 297.9 E(85289): 5.8e-80
Smith-Waterman score: 3736; 100.0% identity (100.0% similar) in 559 aa overlap (1-559:1-559)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MDNQCTVQVRLELGHRAQLRKKPTTEGFTHDWMVFVRGPEQCDIQHFVEKVVFWLHDSFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MDNQCTVQVRLELGHRAQLRKKPTTEGFTHDWMVFVRGPEQCDIQHFVEKVVFWLHDSFP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 KPRRVCKEPPYKVEESGYAGFIMPIEVHFKNKEEPRKVCFTYDLFLNLEGNPPVNHLRCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 KPRRVCKEPPYKVEESGYAGFIMPIEVHFKNKEEPRKVCFTYDLFLNLEGNPPVNHLRCE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 KLTFNNPTTEFRYKLLRAGGVMVMPEGADTVSRPSPDYPMLPTIPLSAFSDPKKTKPSHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 KLTFNNPTTEFRYKLLRAGGVMVMPEGADTVSRPSPDYPMLPTIPLSAFSDPKKTKPSHG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 SKDANKESSKTSKPHKVTKEHRERPRKDSESKSSSKELEREQAKSSKDTSRKLGEGRLPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 SKDANKESSKTSKPHKVTKEHRERPRKDSESKSSSKELEREQAKSSKDTSRKLGEGRLPK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 EEKAPPPKAAFKEPKMALKETKLESTSPKGGPPPPPPPPPRASSKRPATADSPKPSAKKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 EEKAPPPKAAFKEPKMALKETKLESTSPKGGPPPPPPPPPRASSKRPATADSPKPSAKKQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 KKSSSKGSRSAPGTSPRTSSSSSFSDKKPAKDKSSTRGEKVKAESEPREAKKALEVEESN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 KKSSSKGSRSAPGTSPRTSSSSSFSDKKPAKDKSSTRGEKVKAESEPREAKKALEVEESN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 SEDEASFKSESAQSSPSNSSSSSDSSSDSDFEPSQNHSQGPLRSMVEDLQSEESDEDDSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 SEDEASFKSESAQSSPSNSSSSSDSSSDSDFEPSQNHSQGPLRSMVEDLQSEESDEDDSS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 SGEEAAGKTNPGRDSRLSFSDSESDNSADSSLPSREPPPPQKPPPPNSKVSGRRSPESCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 SGEEAAGKTNPGRDSRLSFSDSESDNSADSSLPSREPPPPQKPPPPNSKVSGRRSPESCS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 KPEKILKKGTYDKAYTDELVELHRRLMALRERNVLQQIVNLIEETGHFNVTNTTFDFDLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 KPEKILKKGTYDKAYTDELVELHRRLMALRERNVLQQIVNLIEETGHFNVTNTTFDFDLF
490 500 510 520 530 540
550
pF1KB9 SLDETTVRKLQSCLEAVAT
:::::::::::::::::::
NP_005 SLDETTVRKLQSCLEAVAT
550
>>XP_011526324 (OMIM: 159556) PREDICTED: protein ENL iso (561 aa)
initn: 3714 init1: 3714 opt: 3714 Z-score: 1547.6 bits: 296.2 E(85289): 1.8e-79
Smith-Waterman score: 3714; 100.0% identity (100.0% similar) in 556 aa overlap (4-559:6-561)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MDNQCTVQVRLELGHRAQLRKKPTTEGFTHDWMVFVRGPEQCDIQHFVEKVVFWLHDS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MPKKRQCTVQVRLELGHRAQLRKKPTTEGFTHDWMVFVRGPEQCDIQHFVEKVVFWLHDS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 FPKPRRVCKEPPYKVEESGYAGFIMPIEVHFKNKEEPRKVCFTYDLFLNLEGNPPVNHLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FPKPRRVCKEPPYKVEESGYAGFIMPIEVHFKNKEEPRKVCFTYDLFLNLEGNPPVNHLR
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 CEKLTFNNPTTEFRYKLLRAGGVMVMPEGADTVSRPSPDYPMLPTIPLSAFSDPKKTKPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 CEKLTFNNPTTEFRYKLLRAGGVMVMPEGADTVSRPSPDYPMLPTIPLSAFSDPKKTKPS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 HGSKDANKESSKTSKPHKVTKEHRERPRKDSESKSSSKELEREQAKSSKDTSRKLGEGRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 HGSKDANKESSKTSKPHKVTKEHRERPRKDSESKSSSKELEREQAKSSKDTSRKLGEGRL
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 PKEEKAPPPKAAFKEPKMALKETKLESTSPKGGPPPPPPPPPRASSKRPATADSPKPSAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PKEEKAPPPKAAFKEPKMALKETKLESTSPKGGPPPPPPPPPRASSKRPATADSPKPSAK
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 KQKKSSSKGSRSAPGTSPRTSSSSSFSDKKPAKDKSSTRGEKVKAESEPREAKKALEVEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KQKKSSSKGSRSAPGTSPRTSSSSSFSDKKPAKDKSSTRGEKVKAESEPREAKKALEVEE
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB9 SNSEDEASFKSESAQSSPSNSSSSSDSSSDSDFEPSQNHSQGPLRSMVEDLQSEESDEDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SNSEDEASFKSESAQSSPSNSSSSSDSSSDSDFEPSQNHSQGPLRSMVEDLQSEESDEDD
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KB9 SSSGEEAAGKTNPGRDSRLSFSDSESDNSADSSLPSREPPPPQKPPPPNSKVSGRRSPES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SSSGEEAAGKTNPGRDSRLSFSDSESDNSADSSLPSREPPPPQKPPPPNSKVSGRRSPES
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KB9 CSKPEKILKKGTYDKAYTDELVELHRRLMALRERNVLQQIVNLIEETGHFNVTNTTFDFD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 CSKPEKILKKGTYDKAYTDELVELHRRLMALRERNVLQQIVNLIEETGHFNVTNTTFDFD
490 500 510 520 530 540
540 550
pF1KB9 LFSLDETTVRKLQSCLEAVAT
:::::::::::::::::::::
XP_011 LFSLDETTVRKLQSCLEAVAT
550 560
>>XP_011526323 (OMIM: 159556) PREDICTED: protein ENL iso (600 aa)
initn: 3708 init1: 3708 opt: 3708 Z-score: 1544.7 bits: 295.7 E(85289): 2.7e-79
Smith-Waterman score: 3708; 99.8% identity (100.0% similar) in 556 aa overlap (4-559:45-600)
10 20 30
pF1KB9 MDNQCTVQVRLELGHRAQLRKKPTTEGFTHDWM
.:::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IPGQRHQLRSSFCVCVCTCAPVCRLDSDFKRCTVQVRLELGHRAQLRKKPTTEGFTHDWM
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 VFVRGPEQCDIQHFVEKVVFWLHDSFPKPRRVCKEPPYKVEESGYAGFIMPIEVHFKNKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VFVRGPEQCDIQHFVEKVVFWLHDSFPKPRRVCKEPPYKVEESGYAGFIMPIEVHFKNKE
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 EPRKVCFTYDLFLNLEGNPPVNHLRCEKLTFNNPTTEFRYKLLRAGGVMVMPEGADTVSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EPRKVCFTYDLFLNLEGNPPVNHLRCEKLTFNNPTTEFRYKLLRAGGVMVMPEGADTVSR
140 150 160 170 180 190
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 PSPDYPMLPTIPLSAFSDPKKTKPSHGSKDANKESSKTSKPHKVTKEHRERPRKDSESKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PSPDYPMLPTIPLSAFSDPKKTKPSHGSKDANKESSKTSKPHKVTKEHRERPRKDSESKS
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 SSKELEREQAKSSKDTSRKLGEGRLPKEEKAPPPKAAFKEPKMALKETKLESTSPKGGPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SSKELEREQAKSSKDTSRKLGEGRLPKEEKAPPPKAAFKEPKMALKETKLESTSPKGGPP
260 270 280 290 300 310
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 PPPPPPPRASSKRPATADSPKPSAKKQKKSSSKGSRSAPGTSPRTSSSSSFSDKKPAKDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PPPPPPPRASSKRPATADSPKPSAKKQKKSSSKGSRSAPGTSPRTSSSSSFSDKKPAKDK
320 330 340 350 360 370
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 SSTRGEKVKAESEPREAKKALEVEESNSEDEASFKSESAQSSPSNSSSSSDSSSDSDFEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SSTRGEKVKAESEPREAKKALEVEESNSEDEASFKSESAQSSPSNSSSSSDSSSDSDFEP
380 390 400 410 420 430
400 410 420 430 440 450
pF1KB9 SQNHSQGPLRSMVEDLQSEESDEDDSSSGEEAAGKTNPGRDSRLSFSDSESDNSADSSLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SQNHSQGPLRSMVEDLQSEESDEDDSSSGEEAAGKTNPGRDSRLSFSDSESDNSADSSLP
440 450 460 470 480 490
460 470 480 490 500 510
pF1KB9 SREPPPPQKPPPPNSKVSGRRSPESCSKPEKILKKGTYDKAYTDELVELHRRLMALRERN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SREPPPPQKPPPPNSKVSGRRSPESCSKPEKILKKGTYDKAYTDELVELHRRLMALRERN
500 510 520 530 540 550
520 530 540 550
pF1KB9 VLQQIVNLIEETGHFNVTNTTFDFDLFSLDETTVRKLQSCLEAVAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VLQQIVNLIEETGHFNVTNTTFDFDLFSLDETTVRKLQSCLEAVAT
560 570 580 590 600
>>XP_016882308 (OMIM: 159556) PREDICTED: protein ENL iso (527 aa)
initn: 3508 init1: 3508 opt: 3508 Z-score: 1463.6 bits: 280.6 E(85289): 8.8e-75
Smith-Waterman score: 3508; 100.0% identity (100.0% similar) in 527 aa overlap (33-559:1-527)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 NQCTVQVRLELGHRAQLRKKPTTEGFTHDWMVFVRGPEQCDIQHFVEKVVFWLHDSFPKP
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MVFVRGPEQCDIQHFVEKVVFWLHDSFPKP
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 RRVCKEPPYKVEESGYAGFIMPIEVHFKNKEEPRKVCFTYDLFLNLEGNPPVNHLRCEKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RRVCKEPPYKVEESGYAGFIMPIEVHFKNKEEPRKVCFTYDLFLNLEGNPPVNHLRCEKL
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 TFNNPTTEFRYKLLRAGGVMVMPEGADTVSRPSPDYPMLPTIPLSAFSDPKKTKPSHGSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TFNNPTTEFRYKLLRAGGVMVMPEGADTVSRPSPDYPMLPTIPLSAFSDPKKTKPSHGSK
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 DANKESSKTSKPHKVTKEHRERPRKDSESKSSSKELEREQAKSSKDTSRKLGEGRLPKEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DANKESSKTSKPHKVTKEHRERPRKDSESKSSSKELEREQAKSSKDTSRKLGEGRLPKEE
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 KAPPPKAAFKEPKMALKETKLESTSPKGGPPPPPPPPPRASSKRPATADSPKPSAKKQKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KAPPPKAAFKEPKMALKETKLESTSPKGGPPPPPPPPPRASSKRPATADSPKPSAKKQKK
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 SSSKGSRSAPGTSPRTSSSSSFSDKKPAKDKSSTRGEKVKAESEPREAKKALEVEESNSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SSSKGSRSAPGTSPRTSSSSSFSDKKPAKDKSSTRGEKVKAESEPREAKKALEVEESNSE
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 DEASFKSESAQSSPSNSSSSSDSSSDSDFEPSQNHSQGPLRSMVEDLQSEESDEDDSSSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DEASFKSESAQSSPSNSSSSSDSSSDSDFEPSQNHSQGPLRSMVEDLQSEESDEDDSSSG
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 EEAAGKTNPGRDSRLSFSDSESDNSADSSLPSREPPPPQKPPPPNSKVSGRRSPESCSKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EEAAGKTNPGRDSRLSFSDSESDNSADSSLPSREPPPPQKPPPPNSKVSGRRSPESCSKP
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 EKILKKGTYDKAYTDELVELHRRLMALRERNVLQQIVNLIEETGHFNVTNTTFDFDLFSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EKILKKGTYDKAYTDELVELHRRLMALRERNVLQQIVNLIEETGHFNVTNTTFDFDLFSL
460 470 480 490 500 510
550
pF1KB9 DETTVRKLQSCLEAVAT
:::::::::::::::::
XP_016 DETTVRKLQSCLEAVAT
520
>>XP_011526325 (OMIM: 159556) PREDICTED: protein ENL iso (558 aa)
initn: 3405 init1: 2444 opt: 2446 Z-score: 1027.8 bits: 200.0 E(85289): 1.6e-50
Smith-Waterman score: 3325; 92.3% identity (92.4% similar) in 556 aa overlap (4-559:45-558)
10 20 30
pF1KB9 MDNQCTVQVRLELGHRAQLRKKPTTEGFTHDWM
.:::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IPGQRHQLRSSFCVCVCTCAPVCRLDSDFKRCTVQVRLELGHRAQLRKKPTTEGFTHDWM
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 VFVRGPEQCDIQHFVEKVVFWLHDSFPKPRRVCKEPPYKVEESGYAGFIMPIEVHFKNKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VFVRGPEQCDIQHFVEKVVFWLHDSFPKPRRVCKEPPYKVEESGYAGFIMPIEVHFKNKE
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 EPRKVCFTYDLFLNLEGNPPVNHLRCEKLTFNNPTTEFRYKLLRAGGVMVMPEGADTVSR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EPRKVCFTYDLFLNLEGNPPVNHLRCEKLTFNNPTTEFRYKLLRAGG-------------
140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 PSPDYPMLPTIPLSAFSDPKKTKPSHGSKDANKESSKTSKPHKVTKEHRERPRKDSESKS
:::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 -----------------------------DANKESSKTSKPHKVTKEHRERPRKDSESKS
190 200 210
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 SSKELEREQAKSSKDTSRKLGEGRLPKEEKAPPPKAAFKEPKMALKETKLESTSPKGGPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SSKELEREQAKSSKDTSRKLGEGRLPKEEKAPPPKAAFKEPKMALKETKLESTSPKGGPP
220 230 240 250 260 270
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 PPPPPPPRASSKRPATADSPKPSAKKQKKSSSKGSRSAPGTSPRTSSSSSFSDKKPAKDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PPPPPPPRASSKRPATADSPKPSAKKQKKSSSKGSRSAPGTSPRTSSSSSFSDKKPAKDK
280 290 300 310 320 330
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 SSTRGEKVKAESEPREAKKALEVEESNSEDEASFKSESAQSSPSNSSSSSDSSSDSDFEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SSTRGEKVKAESEPREAKKALEVEESNSEDEASFKSESAQSSPSNSSSSSDSSSDSDFEP
340 350 360 370 380 390
400 410 420 430 440 450
pF1KB9 SQNHSQGPLRSMVEDLQSEESDEDDSSSGEEAAGKTNPGRDSRLSFSDSESDNSADSSLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SQNHSQGPLRSMVEDLQSEESDEDDSSSGEEAAGKTNPGRDSRLSFSDSESDNSADSSLP
400 410 420 430 440 450
460 470 480 490 500 510
pF1KB9 SREPPPPQKPPPPNSKVSGRRSPESCSKPEKILKKGTYDKAYTDELVELHRRLMALRERN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SREPPPPQKPPPPNSKVSGRRSPESCSKPEKILKKGTYDKAYTDELVELHRRLMALRERN
460 470 480 490 500 510
520 530 540 550
pF1KB9 VLQQIVNLIEETGHFNVTNTTFDFDLFSLDETTVRKLQSCLEAVAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VLQQIVNLIEETGHFNVTNTTFDFDLFSLDETTVRKLQSCLEAVAT
520 530 540 550
>>NP_004520 (OMIM: 159558) protein AF-9 isoform a [Homo (568 aa)
initn: 1407 init1: 844 opt: 1805 Z-score: 764.9 bits: 151.4 E(85289): 7.2e-36
Smith-Waterman score: 1806; 54.5% identity (74.5% similar) in 580 aa overlap (1-559:1-567)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MDNQCTVQVRLELGHRAQLRKKPTTEGFTHDWMVFVRGPEQCDIQHFVEKVVFWLHDSFP
: ..:.:::.::::::::.:::::.:::::::::::::::. .:::::::::: ::.:::
NP_004 MASSCAVQVKLELGHRAQVRKKPTVEGFTHDWMVFVRGPEHSNIQHFVEKVVFHLHESFP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 KPRRVCKEPPYKVEESGYAGFIMPIEVHFKNKEEPRKVCFTYDLFLNLEGNPPVNHLRCE
.:.::::.::::::::::::::.::::.:::::::::: : :::::.:::.:::::::::
NP_004 RPKRVCKDPPYKVEESGYAGFILPIEVYFKNKEEPRKVRFDYDLFLHLEGHPPVNHLRCE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KB9 KLTFNNPTTEFRYKLLRAGG--VMVMPEGADTVSRPSPDYPMLPTIPLSAFSDPKKTKPS
:::::::: .:: :::.::: . .... : : . . :. :. .... :
NP_004 KLTFNNPTEDFRRKLLKAGGDPNRSIHTSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 HGSKDANKESSKTSKPHKVTKEHRERPRKDS-ESKSSSKELEREQAKSSKDTSRKLGEGR
.:..... :.. :::::. :::.:.: ::: : ::. :: :.. ::::..:.: :..
NP_004 SSSSSSSSSSTSFSKPHKLMKEHKEKPSKDSREHKSAFKEPSRDHNKSSKESSKKPKENK
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 LPKEEKAPPPKAAFKEPKMALKETKLEST--SPKGGPPPPPPPPPRASSKRPATADSPKP
:::: : : :::::: :: : .:. . .: : :::: .:: .
NP_004 PLKEEKIVP-KMAFKEPKPMSKEPKPDSNLLTITSGQDKKAP------SKRPPISDSEEL
250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 SAKKQKKSSSKGSRSAPGTSPRTSSSSSFSDKKPAKDKSSTRGEKVKAESEPREAKKA--
::::.:::::.. .. ...: . : .::: :::: .. ::: ::: : ::.
NP_004 SAKKRKKSSSEALFKSFSSAPPLILTCS-ADKKQIKDKSHVKMGKVKIESETSEKKKSTL
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400
pF1KB9 ------LEVEESNSEDEASFKSESAQSSPSNSSSSSDSSSDSDFEPSQNHSQGPLRSMVE
.. ..:. :.. : ::.: : ::..:::::.:: : :::...::::::...
NP_004 PPFDDIVDPNDSDVEENISSKSDSEQPSPASSSSSSSSS----FTPSQTRQQGPLRSIMK
360 370 380 390 400
410 420 430 440 450
pF1KB9 DLQS----EESDE-DDSSSGEEAAGKTNPG--RDSRLSFSD-SESDNSADSSLPSREPPP
::.: ::::: .:... : .: : :. :.:.:: :.:..:. :: .::::
NP_004 DLHSDDNEEESDEVEDNDNDSEMERPVNRGGSRSRRVSLSDGSDSESSSASSPLHHEPPP
410 420 430 440 450 460
460 470 480 490 500 510
pF1KB9 PQKPPPPNSKVSGRRSPESCSKPEKILKKGTYDKAYTDELVELHRRLMALRERNVLQQIV
: :... .:: . :: .: .:.: :::: :::::::::::.::::..:::::
NP_004 PLLKTN-NNQILEVKSPIKQSKSDKQIKNGECDKAYLDELVELHRRLMTLRERHILQQIV
470 480 490 500 510 520
520 530 540 550
pF1KB9 NLIEETGHFNVTNTTFDFDLFSLDETTVRKLQSCLEAVAT
:::::::::..::::::::: :::.:::::::: ::. .:
NP_004 NLIEETGHFHITNTTFDFDLCSLDKTTVRKLQSYLETSGTS
530 540 550 560
>>NP_001273620 (OMIM: 159558) protein AF-9 isoform b [Ho (565 aa)
initn: 1401 init1: 838 opt: 1799 Z-score: 762.5 bits: 150.9 E(85289): 9.9e-36
Smith-Waterman score: 1800; 54.7% identity (74.5% similar) in 576 aa overlap (5-559:2-564)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MDNQCTVQVRLELGHRAQLRKKPTTEGFTHDWMVFVRGPEQCDIQHFVEKVVFWLHDSFP
:.:::.::::::::.:::::.:::::::::::::::. .:::::::::: ::.:::
NP_001 MCAVQVKLELGHRAQVRKKPTVEGFTHDWMVFVRGPEHSNIQHFVEKVVFHLHESFP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 KPRRVCKEPPYKVEESGYAGFIMPIEVHFKNKEEPRKVCFTYDLFLNLEGNPPVNHLRCE
.:.::::.::::::::::::::.::::.:::::::::: : :::::.:::.:::::::::
NP_001 RPKRVCKDPPYKVEESGYAGFILPIEVYFKNKEEPRKVRFDYDLFLHLEGHPPVNHLRCE
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB9 KLTFNNPTTEFRYKLLRAGG--VMVMPEGADTVSRPSPDYPMLPTIPLSAFSDPKKTKPS
:::::::: .:: :::.::: . .... : : . . :. :. .... :
NP_001 KLTFNNPTEDFRRKLLKAGGDPNRSIHTSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 HGSKDANKESSKTSKPHKVTKEHRERPRKDS-ESKSSSKELEREQAKSSKDTSRKLGEGR
.:..... :.. :::::. :::.:.: ::: : ::. :: :.. ::::..:.: :..
NP_001 SSSSSSSSSSTSFSKPHKLMKEHKEKPSKDSREHKSAFKEPSRDHNKSSKESSKKPKENK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 LPKEEKAPPPKAAFKEPKMALKETKLEST--SPKGGPPPPPPPPPRASSKRPATADSPKP
:::: : : :::::: :: : .:. . .: : :::: .:: .
NP_001 PLKEEKIVP-KMAFKEPKPMSKEPKPDSNLLTITSGQDKKAP------SKRPPISDSEEL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 SAKKQKKSSSKGSRSAPGTSPRTSSSSSFSDKKPAKDKSSTRGEKVKAESEPREAKKA--
::::.:::::.. .. ...: . : .::: :::: .. ::: ::: : ::.
NP_001 SAKKRKKSSSEALFKSFSSAPPLILTCS-ADKKQIKDKSHVKMGKVKIESETSEKKKSTL
300 310 320 330 340
360 370 380 390 400
pF1KB9 ------LEVEESNSEDEASFKSESAQSSPSNSSSSSDSSSDSDFEPSQNHSQGPLRSMVE
.. ..:. :.. : ::.: : ::..:::::.:: : :::...::::::...
NP_001 PPFDDIVDPNDSDVEENISSKSDSEQPSPASSSSSSSSS----FTPSQTRQQGPLRSIMK
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450
pF1KB9 DLQS----EESDE-DDSSSGEEAAGKTNPG--RDSRLSFSD-SESDNSADSSLPSREPPP
::.: ::::: .:... : .: : :. :.:.:: :.:..:. :: .::::
NP_001 DLHSDDNEEESDEVEDNDNDSEMERPVNRGGSRSRRVSLSDGSDSESSSASSPLHHEPPP
410 420 430 440 450 460
460 470 480 490 500 510
pF1KB9 PQKPPPPNSKVSGRRSPESCSKPEKILKKGTYDKAYTDELVELHRRLMALRERNVLQQIV
: :... .:: . :: .: .:.: :::: :::::::::::.::::..:::::
NP_001 PLLKTN-NNQILEVKSPIKQSKSDKQIKNGECDKAYLDELVELHRRLMTLRERHILQQIV
470 480 490 500 510 520
520 530 540 550
pF1KB9 NLIEETGHFNVTNTTFDFDLFSLDETTVRKLQSCLEAVAT
:::::::::..::::::::: :::.:::::::: ::. .:
NP_001 NLIEETGHFHITNTTFDFDLCSLDKTTVRKLQSYLETSGTS
530 540 550 560
>>XP_016870215 (OMIM: 159558) PREDICTED: protein AF-9 is (520 aa)
initn: 1180 init1: 844 opt: 1423 Z-score: 608.9 bits: 122.4 E(85289): 3.5e-27
Smith-Waterman score: 1539; 49.8% identity (68.6% similar) in 580 aa overlap (1-559:1-519)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MDNQCTVQVRLELGHRAQLRKKPTTEGFTHDWMVFVRGPEQCDIQHFVEKVVFWLHDSFP
: ..:.:::.::::::::.:::::.:::::::::::::::. .:::::::::: ::.:::
XP_016 MASSCAVQVKLELGHRAQVRKKPTVEGFTHDWMVFVRGPEHSNIQHFVEKVVFHLHESFP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 KPRRVCKEPPYKVEESGYAGFIMPIEVHFKNKEEPRKVCFTYDLFLNLEGNPPVNHLRCE
.:.::::.::::::::::::::.::::.:::::::::: : :::::.:::.:::::::::
XP_016 RPKRVCKDPPYKVEESGYAGFILPIEVYFKNKEEPRKVRFDYDLFLHLEGHPPVNHLRCE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KB9 KLTFNNPTTEFRYKLLRAGG--VMVMPEGADTVSRPSPDYPMLPTIPLSAFSDPKKTKPS
:::::::: .:: :::.::: . .... : : . . :. :. .... :
XP_016 KLTFNNPTEDFRRKLLKAGGDPNRSIHTSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 HGSKDANKESSKTSKPHKVTKEHRERPRKDS-ESKSSSKELEREQAKSSKDTSRKLGEGR
.:..... :.. :::::. :::.:.: ::: : ::. :: :.. ::::..:.: :..
XP_016 SSSSSSSSSSTSFSKPHKLMKEHKEKPSKDSREHKSAFKEPSRDHNKSSKESSKKPKENK
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 LPKEEKAPPPKAAFKEPKMALKETKLEST--SPKGGPPPPPPPPPRASSKRPATADSPKP
:::: : : :::::: :: : .:. . .: : :::: .:: .
XP_016 PLKEEKIVP-KMAFKEPKPMSKEPKPDSNLLTITSGQDKKAP------SKRPPISDSEEL
250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 SAKKQKKSSSKGSRSAPGTSPRTSSSSSFSDKKPAKDKSSTRGEKVKAESEPREAKKA--
::::.:::::.. .. ...: . : .::: :::: .. ::: ::: : ::.
XP_016 SAKKRKKSSSEALFKSFSSAPPLILTCS-ADKKQIKDKSHVKMGKVKIESETSEKKKSTL
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400
pF1KB9 ------LEVEESNSEDEASFKSESAQSSPSNSSSSSDSSSDSDFEPSQNHSQGPLRSMVE
.. ..:. :.. : ::.: : ::..:::::.:: : :::...::::::...
XP_016 PPFDDIVDPNDSDVEENISSKSDSEQPSPASSSSSSSSS----FTPSQTRQQGPLRSIMK
360 370 380 390 400
410 420 430 440 450
pF1KB9 DLQS----EESDE-DDSSSGEEAAGKTNPG--RDSRLSFSD-SESDNSADSSLPSREPPP
::.: ::::: .:... : .: : :. :.:.:: :.:..:. :: .::::
XP_016 DLHSDDNEEESDEVEDNDNDSEMERPVNRGGSRSRRVSLSDGSDSESSSASSPLHHEPPP
410 420 430 440 450 460
460 470 480 490 500 510
pF1KB9 PQKPPPPNSKVSGRRSPESCSKPEKILKKGTYDKAYTDELVELHRRLMALRERNVLQQIV
: .:: .. .:::
XP_016 P------------------------LLKTNN-------------------------NQIV
470
520 530 540 550
pF1KB9 NLIEETGHFNVTNTTFDFDLFSLDETTVRKLQSCLEAVAT
:::::::::..::::::::: :::.:::::::: ::. .:
XP_016 NLIEETGHFHITNTTFDFDLCSLDKTTVRKLQSYLETSGTS
480 490 500 510 520
>>XP_016870216 (OMIM: 159558) PREDICTED: protein AF-9 is (517 aa)
initn: 1174 init1: 838 opt: 1417 Z-score: 606.5 bits: 121.9 E(85289): 4.8e-27
Smith-Waterman score: 1533; 50.0% identity (68.6% similar) in 576 aa overlap (5-559:2-516)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MDNQCTVQVRLELGHRAQLRKKPTTEGFTHDWMVFVRGPEQCDIQHFVEKVVFWLHDSFP
:.:::.::::::::.:::::.:::::::::::::::. .:::::::::: ::.:::
XP_016 MCAVQVKLELGHRAQVRKKPTVEGFTHDWMVFVRGPEHSNIQHFVEKVVFHLHESFP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 KPRRVCKEPPYKVEESGYAGFIMPIEVHFKNKEEPRKVCFTYDLFLNLEGNPPVNHLRCE
.:.::::.::::::::::::::.::::.:::::::::: : :::::.:::.:::::::::
XP_016 RPKRVCKDPPYKVEESGYAGFILPIEVYFKNKEEPRKVRFDYDLFLHLEGHPPVNHLRCE
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB9 KLTFNNPTTEFRYKLLRAGG--VMVMPEGADTVSRPSPDYPMLPTIPLSAFSDPKKTKPS
:::::::: .:: :::.::: . .... : : . . :. :. .... :
XP_016 KLTFNNPTEDFRRKLLKAGGDPNRSIHTSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 HGSKDANKESSKTSKPHKVTKEHRERPRKDS-ESKSSSKELEREQAKSSKDTSRKLGEGR
.:..... :.. :::::. :::.:.: ::: : ::. :: :.. ::::..:.: :..
XP_016 SSSSSSSSSSTSFSKPHKLMKEHKEKPSKDSREHKSAFKEPSRDHNKSSKESSKKPKENK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 LPKEEKAPPPKAAFKEPKMALKETKLEST--SPKGGPPPPPPPPPRASSKRPATADSPKP
:::: : : :::::: :: : .:. . .: : :::: .:: .
XP_016 PLKEEKIVP-KMAFKEPKPMSKEPKPDSNLLTITSGQDKKAP------SKRPPISDSEEL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 SAKKQKKSSSKGSRSAPGTSPRTSSSSSFSDKKPAKDKSSTRGEKVKAESEPREAKKA--
::::.:::::.. .. ...: . : .::: :::: .. ::: ::: : ::.
XP_016 SAKKRKKSSSEALFKSFSSAPPLILTCS-ADKKQIKDKSHVKMGKVKIESETSEKKKSTL
300 310 320 330 340
360 370 380 390 400
pF1KB9 ------LEVEESNSEDEASFKSESAQSSPSNSSSSSDSSSDSDFEPSQNHSQGPLRSMVE
.. ..:. :.. : ::.: : ::..:::::.:: : :::...::::::...
XP_016 PPFDDIVDPNDSDVEENISSKSDSEQPSPASSSSSSSSS----FTPSQTRQQGPLRSIMK
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450
pF1KB9 DLQS----EESDE-DDSSSGEEAAGKTNPG--RDSRLSFSD-SESDNSADSSLPSREPPP
::.: ::::: .:... : .: : :. :.:.:: :.:..:. :: .::::
XP_016 DLHSDDNEEESDEVEDNDNDSEMERPVNRGGSRSRRVSLSDGSDSESSSASSPLHHEPPP
410 420 430 440 450 460
460 470 480 490 500 510
pF1KB9 PQKPPPPNSKVSGRRSPESCSKPEKILKKGTYDKAYTDELVELHRRLMALRERNVLQQIV
: .:: .. .:::
XP_016 P------------------------LLKTNN-------------------------NQIV
470
520 530 540 550
pF1KB9 NLIEETGHFNVTNTTFDFDLFSLDETTVRKLQSCLEAVAT
:::::::::..::::::::: :::.:::::::: ::. .:
XP_016 NLIEETGHFHITNTTFDFDLCSLDKTTVRKLQSYLETSGTS
480 490 500 510
559 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 18:41:00 2016 done: Fri Nov 4 18:41:02 2016
Total Scan time: 14.240 Total Display time: 0.090
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]