FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9751, 606 aa
1>>>pF1KB9751 606 - 606 aa - 606 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9634+/-0.00224; mu= 13.0022+/- 0.133
mean_var=324.9035+/-58.945, 0's: 0 Z-trim(104.6): 949 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.071154
statistics sampled from 6965 (7995) to 6965 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.566), E-opt: 0.2 (0.246), width: 16
Scan time: 3.010
The best scores are: opt bits E(32554)
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CCDS74349.1 ZNF567 gene_id:163081|Hs108|chr19 ( 647) 1476 167.0 6.9e-41
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CCDS12413.2 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 809) 1477 167.3 7.1e-41
CCDS74321.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 818) 1477 167.3 7.2e-41
>>CCDS31418.1 ZNF214 gene_id:7761|Hs108|chr11 (606 aa)
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pF1KB9 MAVTFEDVTIIFTWEEWKFLDSSQKRLYREVMWENYTNVMSVENWNESYKSQEEKFRYLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MAVTFEDVTIIFTWEEWKFLDSSQKRLYREVMWENYTNVMSVENWNESYKSQEEKFRYLE
10 20 30 40 50 60
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pF1KB9 YENFSYWQGWWNAGAQMYENQNYGETVQGTDSKDLTQQDRSQCQEWLILSTQVPGYGNYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YENFSYWQGWWNAGAQMYENQNYGETVQGTDSKDLTQQDRSQCQEWLILSTQVPGYGNYE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LTFESKSLRNLKYKNFMPWQSLETKTTQDYGREIYMSGSHGFQGGRYRLGISRKNLSMEK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 EQKLIVQHSYIPVEEALPQYVGVICQEDLLRDSMEEKYCGCNKCKGIYYWNSRCVFHKRN
190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 QPGENLCQCSICKACFSQRSDLYRHPRNHIGKKLYGCDEVDGNFHQSSGVHFHQRVHIGE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VPYSCNACGKSFSQISSLHNHQRVHTEEKFYKIECDKDLSRNSLLHIHQRLHIGEKPFKC
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 NQCGKSFNRSSVLHVHQRVHTGEKPYKCDECGKGFSQSSNLRIHQLVHTGEKSYKCEDCG
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430 440 450 460 470 480
pF1KB9 KGFTQRSNLQIHQRVHTGEKPYKCDDCGKDFSHSSDLRIHQRVHTGEKPYTCPECGKGFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 KGFTQRSNLQIHQRVHTGEKPYKCDDCGKDFSHSSDLRIHQRVHTGEKPYTCPECGKGFS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 KSSKLHTHQRVHTGEKPYKCEECGKGFSQRSHLLIHQRVHTGEKPYKCHDCGKGFSHSSN
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pF1KB9 LHIHQRVHTGEKPYQCAKCGKGFSHSSALRIHQRVHAGEKPYKCREYYKGFDHNSHLHNN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LHIHQRVHTGEKPYQCAKCGKGFSHSSALRIHQRVHAGEKPYKCREYYKGFDHNSHLHNN
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pF1KB9 HRRGNL
::::::
CCDS31 HRRGNL
>>CCDS62706.1 ZNF229 gene_id:7772|Hs108|chr19 (819 aa)
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pF1KB9 VQHSYIPVEEALPQYVGVICQEDLLRDSMEEKYCGCNKCKGIYYWNSRCVFHKRNQPGEN
:: :..: . .: :.. .:::.
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pF1KB9 LCQCSICKACFSQRSDLYRHPRNHIGKKLYGCDEVDGNFHQSSGVHFHQRVHIGEVPYSC
.:. : :: : : : ..: :.. : ::. .: ..: .. :::::.:. :.:
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:.:::::: :.: :::.:: :: :: :: :...:.: ::::::.: ::::.::..:::
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.: :.: :: ::::::::.:: :: ::::: ::.: ::: :::::: ::: .:::::.
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:.: ::::::::::::.:..::: : .:.:. :::::::.::::: .:::::: .:.:
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.::::.::::::: : :::::: : :: :.:::::::::.:: ::::.:.::.:. ::
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:::::::::.: .:::::...: :..:::::.::::: : :::...: :.:..:
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pF1KB9 L
CCDS62 GENPYK
>--
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10 20 30
pF1KB9 MAVTFEDVTIIFTWEEWKFLDSSQKRLYREVM
..:.::...:: :: ..:::.:..::..::
CCDS62 LTSRHEKRALHSQASAISQDREEKIMSQEPLSFKDVAVVFTEEELELLDSTQRQLYQDVM
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40 50 60 70 80 90
pF1KB9 WENYTNVMSV--ENWNESYKSQEEKFRYLEYENFSYWQGWWNAGAQMYENQNYGETVQGT
::. :..:: .: ... :.:..:.. ....: . : ...... .:. ..::
CCDS62 QENFRNLLSVGDKNGKDTEYIQDEELRFFSHKELSSCKIWEEVAGELPGSQDCRVNLQGK
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 DSKDLTQQDRSQCQEWLILSTQVPGYGNYELTFESKSLRNLKYKNFMPWQSLETKTTQDY
: . ..: . : : :: :. .... .: .:. ..: :...
CCDS62 DFQ--FSEDAAPHQGWEGASTPCFPIENFLDSLQGDGLIGLENQQFPAWRAI--------
130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 GREIYMSGSHGFQGGRYRLGISRKNLSMEKEQKLIVQHSYIPVEEALPQYVGVICQEDLL
: : . ::. . ... . .:. ..: .. . . .. . :. :
CCDS62 -RPIPI------QGSWAKAFVNQLGDVQERCKNLDTEDTVYKCNWDDDSFCWISCHVDH-
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220 230 240 250 260 270
pF1KB9 RDSMEEKYCGCNKCKGIYYWNSRCVFHKRNQPGENLCQCSICKACFSQRSDLYRHPRNHI
: .: ::::::. :: :.:. : :::: . . . : . .:: ::: .
CCDS62 RFPEIDKPCGCNKCRKDCIKNS--VLHRIN-PGENGLKSNEYRNGFRDDADLPPHPRVPL
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280 290 300 310 320 330
pF1KB9 GKKLYGCDEVDGNFHQSSGVHFHQRVHIGEVPYSCNACGKSFSQISSLHNHQRVHTEEKF
.:: :: . ....:. .. :::: :: :: ..::
CCDS62 KEKLCQYDEFSEGLRHSAHLNRHQRVPTGE---------KS---VKSL------------
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340 350 360 370 380 390
pF1KB9 YKIECDKDLSRNSLLHIHQRLHIGEKPFKCNQCGKSFNRSSVLHVHQRVHTGEKPYKCDE
: . . .:. .. : : .:. :..:. :::.: .::: .:: ::::..::::.:
CCDS62 ---ERGRGVRQNTHIRNHPRAPVGDMPYRCDVCGKGFRYKSVLLIHQGVHTGRRPYKCEE
320 330 340 350 360 370
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:::.:..:::: .:: :::::: ::: .:::::. : ::.:::.:::
CCDS62 CGKAFGRSSNLLVHQRVHTGEKPYKCSECGKGFSYSSVLQVHQRLHTGEKPYTCSECGKG
380 390 400 410 420 430
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pF1KB9 FSHSSDLRIHQRVHTGEKPYTCPECGKGFSKSSKLHTHQRVHTGEKPYKCEECGKGFSQR
CCDS62 FCAKSALHKHQHIHPGEKPYSCGECGKGFSCSSHLSSHQKTHTGERPYQCDKCGKGFSHN
440 450 460 470 480 490
>>CCDS42574.1 ZNF229 gene_id:7772|Hs108|chr19 (825 aa)
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Smith-Waterman score: 1672; 59.7% identity (78.6% similar) in 387 aa overlap (216-602:430-816)
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 VQHSYIPVEEALPQYVGVICQEDLLRDSMEEKYCGCNKCKGIYYWNSRCVFHKRNQPGEN
:: :..: . .: :.. .:::.
CCDS42 TGEKPYKCSECGKGFSYSSVLQVHQRLHTGEKPYTCSECGKGFCAKSALHKHQHIHPGEK
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250 260 270 280 290 300
pF1KB9 LCQCSICKACFSQRSDLYRHPRNHIGKKLYGCDEVDGNFHQSSGVHFHQRVHIGEVPYSC
.:. : :: : : : ..: :.. : ::. .: ..: .. :::::.:. :.:
CCDS42 PYSCGECGKGFSCSSHLSSHQKTHTGERPYQCDKCGKGFSHNSYLQAHQRVHMGQHLYKC
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pF1KB9 NACGKSFSQISSLHNHQRVHTEEKFYKIECDKDLSRNSLLHIHQRLHIGEKPFKCNQCGK
:.:::::: :.: :::.:: :: :: :: :...:.: ::::::.: ::::.::..:::
CCDS42 NVCGKSFSYSSGLLMHQRLHTGEKPYKCECGKSFGRSSDLHIHQRVHTGEKPYKCSECGK
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pF1KB9 SFNRSSVLHVHQRVHTGEKPYKCDECGKGFSQSSNLRIHQLVHTGEKSYKCEDCGKGFTQ
.: :.: :: ::::::::.:: :: ::::: ::.: ::: :::::: ::: .:::::.
CCDS42 GFRRNSDLHSHQRVHTGERPYVCDVCGKGFIYSSDLLIHQRVHTGEKPYKCAECGKGFSY
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CCDS42 RVHTGEKPYKCEECGKGFGRNSCLHVHQRVHTGEKPYTCGVCGKGFSYTSGLRNHQRVHL
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pF1KB9 L
CCDS42 GENPYK
820
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CCDS54 NSHLKSY--QRVHTEEKPCKCGEYGENFNHCSPLNTYELIHTGEMSYRHNIYEKAFSHSL
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CCDS46 GEKPYKCNECGKVFNKKANLARHHRLHSGEKPYKCTECVKTFSRNSALVIHKAIHIGEKR
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CCDS46 YKCNECGKTFSRISALVIHTAIHTGEKPYKCNECGKGFNRKTHLACHHRLHTGEKPYKCN
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CCDS46 VFNQKANLARHHRLHTGEKPYKFNECGKAFN
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CCDS12 MNVEVVKVMPQDLVTFKDVAIDFSQEEWQWMNPAQKRLYRSMMLENYQSLVSLGLCISKP
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CCDS12 YVISLLEQGREPWEMTSEMTRSPFSDWESIYVTQELPLKQFMYDDACMEGITSYGLECST
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CCDS12 FEENWKWEDLFEK--QMGSHEM-FSKKEI--ITHKETITKET-EFKYTK-FGKCIHLENI
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CCDS12 EESIYNHTSDKKSFSKNSMVI-KHKKVYVGKKLFKCNECDKTFTHSSSLTVHFRIHTGEK
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CCDS12 PYACEECGKAFKQRQHLAQHHRTHTGEKLFECKECRKAFKQSEHLIQHQRIHTGEKPYKC
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340 350 360 370 380 390
pF1KB9 KDLSRNSLLHIHQR-LHIGEKPFKCNQCGKSFNRSSVLHVHQRVHTGEKPYKCDECGKGF
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CCDS12 KAFRYNTSFIRHWRSYHTGEKPFNCIDCGKAFSVHIGLILHRRIHTGEKPYKCGVCGKTF
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pF1KB9 SQSSNLRIHQLVHTGEKSYKCEDCGKGFTQRSNLQIHQRVHTGEKPYKCDDCGKDFSHSS
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CCDS12 SSGSSRTVHQRIHTGEKPYECDICGKDFSHHASLTQHQRVHSGEKPYECKECGKAFRQNV
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460 470 480 490 500 510
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CCDS12 HLVSHLRIHTGEKPYECKECGKAFRISSQLATHQRIHTGEKPYECIECGNAFKQRSHLAQ
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CCDS12 HQKTHTGEKPYECNECGKAFSQTSNLTQHQRIHTGEKPYKCTECGKAFSDSSSCAQHQRL
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580 590 600
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CCDS12 HTGQRPYQCFECGKAFRRKLSLICHQRSHTGEEP
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CCDS46 PNNRGKHYKCDECGKVFSQNSR---LTSHKRIHTGEK-PYQCNKCGKAFTVRSNLTIHQV
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pF1KB9 ----EKYCGCNKCKGIYYWNSRCVFHKRNQPGENLCQCSICKACFSQRSDLYRHPRNHIG
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pF1KB9 KI-ECDKDLSRNSLLHIHQRLHIGEKPFKCNQCGKSFNRSSVLHVHQRVHTGEKPYKCDE
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CCDS46 KCNECGKVFRHNSYLAKHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSMHSNLTKHQIIHTGEKPFKCNE
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CCDS46 CVKVFTQYSHLANHRRIHTGEKPYRCDECGKAFSVRSSLTTHQAIHTGEKPYKCNDCGKV
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pF1KB9 SHLLIHQRVHTGEKPYKCHDCGKGFSHSSNLHIHQRVHTGEKPYQCAKCGKGFSHSSALR
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CCDS46 HQRVHSGEKPFKCEECGKSFSRSAHLQAHQKVHTGEKPYKCGECGKGFKWSLNLDMHQRV
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CCDS46 HTGEKPYTCGECGKHFSQASSLQLHQSVHTGEKPYKCDVCGKVFSRSSQLQY-HRRVHTG
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CCDS46 EKPYKCEICGKRFSWRSNLVSHHKIHAAGTFYENDENSKNIRELSEGGSSTR
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pF1KB9 VQHSYIPVEEALPQYVGVICQEDLLRDSMEEKYCGCNKCKGIYYWNSRCVFHKRNQPGEN
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pF1KB9 LCQCSICKACFSQRSDLYRHPRNHIGKKLYGCDEVDGNFHQSSGVHFHQRVHIGEVPYSC
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CCDS82 PYKCNECGKAFSVRSSLAIHQTIHTGEKPYKCNECGKVFRYNSYLGRHRRVHTGEKPYKC
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pF1KB9 NACGKSFSQISSLHNHQRVHTEEKFYKI-ECDKDLSRNSLLHIHQRLHIGEKPFKCNQCG
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CCDS82 NECGKAFSMHSNLATHQVIHTGTKPFKCNECSKVFTQNSQLANHRRIHTGEKPYKCNECG
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pF1KB9 KSFNRSSVLHVHQRVHTGEKPYKCDECGKGFSQSSNLRIHQLVHTGEKSYKCEDCGKGFT
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CCDS82 KAFSVRSSLTTHQAIHSGEKPYKCIECGKSFTQKSHLRSHRGIHSGEKPYKCNECGKVFA
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pF1KB9 QRSNLQIHQRVHTGEKPYKCDDCGKDFSHSSDLRIHQRVHTGEKPYTCPECGKGFSKSSK
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CCDS82 QTSQLARHWRVHTGEKPYKCNDCGRAFSDRSSLTFHQAIHTGEKPYKCHECGKVFRHNSY
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CCDS82 LATHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSMHSNLTTHKVIHTGEKPYKCNQCGKVFTQNSHLANH
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pF1KB9 QRVHTGEKPYQCAKCGKGFSHSSALRIHQRVHAGEKPYKCREYYKGFDHNSHLHNNHRRG
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CCDS82 QRTHTGEKPYRCNECGKAFSVRSSLTTHQAIHTGKKPYKCNECGKVFTQNAHL-ANHRRI
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pF1KB9 NL
CCDS82 HTGEKPYRCTECGKAFRVRSSLTTHMAIHTGEKRYKCNECGKVFRQSSNLASHHRMHTGE
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>--
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pF1KB9 NHIGKKLYGCDEVDGNFHQSSGVHFHQRVHIGEVPYSCNACGKSFSQISSLHNHQRVHTE
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CCDS82 MLEEGKEPWTVKSCVKIARKPRTPECVKGVVTDIPPKCT--------IKDLLPKEKSSTE
30 40 50 60 70
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pF1KB9 EKFYKIECDK----DLSRNSLLHIHQRLHIGEKPFKCNQCGKSFNRSSVLHVHQRVHTGE
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CCDS82 AVFHTVVLERHESPDIEDFSFKEPQKNVH----DFECQWRDDTGNYKGVLMAQKEGKRDQ
80 90 100 110 120 130
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. . : .: : : :.: :: . : :.:.. :. .. :... :.. .
CCDS82 RDRR-DIENKLMNNQLGVSFHSHLPELQLFQGEGKMYECNQVEKSTNNGSSVSPLQQIPS
140 150 160 170 180
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. . .. ....: : : ...... ::: : ::::.:...:.: .:.:.:.::::
CCDS82 SVQTHRSKKY-HELNHFSLLTQRRKANSCGKPYKCNECGKAFTQNSNLTSHRRIHSGEKP
190 200 210 220 230 240
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pF1KB9 YKCEECGKGFSQRSHLLIHQRVHTGEKPYKCHDCGKGFSHSSNLHIHQRVHTGEKPYQCA
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CCDS82 YKCSECGKTFTVRSNLTIHQVIHTGEKPYKCHECGKVFRHNSYLATHRRIHTGEKPYKCN
250 260 270 280 290 300
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CCDS82 ECGKAFRGHSNLTTHQLIHTGEKPFKCNECGKLFTQNSHLISHWRIHTGEKPYKCNECGK
310 320 330 340 350 360
606 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]