FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9755, 661 aa
1>>>pF1KB9755 661 - 661 aa - 661 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.0175+/-0.00198; mu= 12.6989+/- 0.118
mean_var=285.3028+/-54.416, 0's: 0 Z-trim(104.5): 986 B-trim: 12 in 1/49
Lambda= 0.075931
statistics sampled from 6832 (7914) to 6832 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.573), E-opt: 0.2 (0.243), width: 16
Scan time: 3.470
The best scores are: opt bits E(32554)
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CCDS35237.2 ZNF630 gene_id:57232|Hs108|chrX ( 657) 2054 240.2 6.8e-63
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CCDS12499.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 ( 714) 1886 221.9 2.5e-57
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CCDS12848.1 ZNF432 gene_id:9668|Hs108|chr19 ( 652) 1850 217.9 3.6e-56
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CCDS42537.1 ZNF429 gene_id:353088|Hs108|chr19 ( 674) 1804 212.9 1.2e-54
CCDS31938.1 ZNF605 gene_id:100289635|Hs108|chr12 ( 641) 1794 211.7 2.5e-54
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CCDS12414.2 ZNF681 gene_id:148213|Hs108|chr19 ( 645) 1735 205.3 2.2e-52
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CCDS33097.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 839) 1732 205.1 3.2e-52
CCDS54314.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 840) 1732 205.1 3.2e-52
CCDS10900.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 643) 1730 204.7 3.3e-52
CCDS75846.1 ZNF658 gene_id:26149|Hs108|chr9 (1059) 1731 205.2 3.9e-52
CCDS42541.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1191) 1719 203.9 1e-51
CCDS46165.1 ZNF534 gene_id:147658|Hs108|chr19 ( 674) 1715 203.1 1e-51
CCDS13174.1 ZNF337 gene_id:26152|Hs108|chr20 ( 751) 1709 202.5 1.7e-51
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CCDS82341.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 527) 1696 200.9 3.9e-51
CCDS12503.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 686) 1696 201.0 4.5e-51
CCDS45012.1 ZNF268 gene_id:10795|Hs108|chr12 ( 947) 1697 201.4 4.9e-51
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CCDS74322.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1159) 1694 201.2 6.9e-51
CCDS75971.1 ZNF630 gene_id:57232|Hs108|chrX ( 533) 1687 199.9 7.7e-51
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1682 199.5 1.3e-50
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 1682 199.5 1.3e-50
CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1058) 1683 199.9 1.5e-50
CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1090) 1683 199.9 1.5e-50
>>CCDS43933.1 ZNF81 gene_id:347344|Hs108|chrX (661 aa)
initn: 4616 init1: 4616 opt: 4616 Z-score: 2759.4 bits: 520.9 E(32554): 2.2e-147
Smith-Waterman score: 4616; 99.8% identity (100.0% similar) in 661 aa overlap (1-661:1-661)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MPANEDAPQPGEHGSACEVSVSFEDVTVDFSREEWQQLDSTQRRLYQDVMLENYSHLLSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MPANEDAPQPGEHGSACEVSVSFEDVTVDFSREEWQQLDSTQRRLYQDVMLENYSHLLSV
10 20 30 40 50 60
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pF1KB9 GFEVPKPEVIFKLEQGEGPWTLEGEAPHQSCSDGKFGIKPSQRRISGKSTFHSEMEGEDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GFEVPKPEVIFKLEQGEGPWTLEGEAPHQSCSDGKFGIKPSQRRISGKSTFHSEMEGEDT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 RDDSLYSILEELWQDAEQIKRCQEKHNKLLSRTTFLNKKILNTEWDYEYKDFGKFVHPSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RDDSLYSILEELWQDAEQIKRCQEKHNKLLSRTTFLNKKILNTEWDYEYKDFGKFVHPSP
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190 200 210 220 230 240
pF1KB9 NLILSQKRPHKRDSFGKSFKHNLDLHIHNKSNAAKNLDKTIGHGQVFTQNSSYSHHENTH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NLILSQKRPHKRDSFGKSFKHNLDLHIHNKSNAAKNLDKTIGHGQVFTQNSSYSHHENTH
190 200 210 220 230 240
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pF1KB9 TGVKFCERNQCGKVLSLKHSLSQNVKFPIGEKANTCTEFGKIFTQRSHFFTPQKIHTVEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::
CCDS43 TGVKFCERNQCGKVLSLKHSLSQNVKFPIGEKANTCTEFGKIFTQRSHFFAPQKIHTVEK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 PHELSKCVNVFTQKPLLSIYLRVHRDEKLYICTKCGKAFIQNSELIMHEKTHTREKPYKC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PHELSKCVNVFTQKPLLSIYLRVHRDEKLYICTKCGKAFIQNSELIMHEKTHTREKPYKC
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pF1KB9 NECGKSFFQVSSLLRHQTTHTGEKLFECSECGKGFSLNSALNIHQKIHTGERHHKCSECG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NECGKSFFQVSSLLRHQTTHTGEKLFECSECGKGFSLNSALNIHQKIHTGERHHKCSECG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 KAFTQKSTLRMHQRIHTGERSYICTQCGQAFIQKAHLIAHQRIHTGEKPYECSDCGKSFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KAFTQKSTLRMHQRIHTGERSYICTQCGQAFIQKAHLIAHQRIHTGEKPYECSDCGKSFP
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pF1KB9 SKSQLQMHKRIHTGEKPYICTECGKAFTNRSNLNTHQKSHTGEKSYICAECGKAFTDRSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SKSQLQMHKRIHTGEKPYICTECGKAFTNRSNLNTHQKSHTGEKSYICAECGKAFTDRSN
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pF1KB9 FNKHQTIHTGEKPYVCADCGRAFIQKSELITHQRIHTTEKPYKCPDCEKSFSKKPHLKVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 FNKHQTIHTGEKPYVCADCGRAFIQKSELITHQRIHTTEKPYKCPDCEKSFSKKPHLKVH
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pF1KB9 QRIHTGEKPYICAECGKAFTDRSNFNKHQTIHTGDKPYKCSDCGKGFTQKSVLSMHRNIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QRIHTGEKPYICAECGKAFTDRSNFNKHQTIHTGDKPYKCSDCGKGFTQKSVLSMHRNIH
610 620 630 640 650 660
pF1KB9 T
:
CCDS43 T
>>CCDS12837.1 ZNF175 gene_id:7728|Hs108|chr19 (711 aa)
initn: 3197 init1: 1773 opt: 2611 Z-score: 1572.0 bits: 301.3 E(32554): 3e-81
Smith-Waterman score: 2611; 55.3% identity (80.2% similar) in 667 aa overlap (1-661:1-666)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MPANED---APQ---PGEHGSACEVSVSFEDVTVDFSREEWQQLDSTQRRLYQDVMLENY
:::. . :: : .. ..::.:::::::::::::::::::: .:: ::.::::: :
CCDS12 MPADVNLSQKPQVLGPEKQDGSCEASVSFEDVTVDFSREEWQQLDPAQRCLYRDVMLELY
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pF1KB9 SHLLSVGFEVPKPEVIFKLEQGEGPWTLEGEAPHQSCSDGKFGIKPSQRRISGKSTFHSE
:::..::...:.:::::.. . . : . :.:. :: :.. .::.. :..:: :..:...
CCDS12 SHLFAVGYHIPNPEVIFRMLKEKEPRVEEAEVSHQRCQEREFGLEIPQKEISKKASFQKD
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pF1KB9 MEGEDTRDDSLYSILEELWQDAEQIKRCQEKHNKLLSRTTFLNKKILNTEWDYEYKDFGK
: :: ::: : :::::: ::.. :. .... . .:...:.::: :::: . :::: ::
CCDS12 MVGEFTRDGSWCSILEELRLDADRTKKDEQNQIQPMSHSAFFNKKTLNTESNCEYKDPGK
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pF1KB9 FVHPSPNLILSQKRPHKRDSFGKSFKHNLDLHIHNKSNAAKNLDKTIGHGQVFTQNSSYS
... :.: :::.:.: : .:.: ::... .:.:: ...:: ..: ::.:...:: .
CCDS12 MIRTRPHLASSQKQPQKCCLFTESLKLNLEVNGQNESNDTEQLDDVVGSGQLFSHSSSDA
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pF1KB9 HHENTHTGVKFCERNQCGKVLSLKHSLSQNVKFPIGEKANTCTEFGKIFTQRSHFFTPQK
.: ::: ::. ::: :: . :.::.:. .. .: . :.: : :::.::.:. :.
CCDS12 CSKNIHTGETFCKGNQCRKVCGHKQSLKQH-QIHTQKKPDGCSECGGSFTQKSHLFAQQR
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::.: . :: .:: ..: . ::.:: : . :: .:::.::: :::. :.:::::
CCDS12 IHSVGNLHECGKCGKAFMPQLKLSVYLTDHTGDIPCICKECGKVFIQRSELLTHQKTHTR
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pF1KB9 EKPYKCNECGKSFFQVSSLLRHQTTHTGEKLFECSECGKGFSLNSALNIHQKIHTGERHH
.:::::..:::.:::. ::.::: ::. :::.:::::::::: ::.: ::::::::::..
CCDS12 KKPYKCHDCGKAFFQMLSLFRHQRTHSREKLYECSECGKGFSQNSTLIIHQKIHTGERQY
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pF1KB9 KCSECGKAFTQKSTLRMHQRIHTGERSYICTQCGQAFIQKAHLIAHQRIHTGEKPYECSD
:::::::::::::: .:::::.:..::.: .::::::::::::.::: :::::::.: .
CCDS12 ACSECGKAFTQKSTLSLHQRIHSGQKSYVCIECGQAFIQKAHLIVHQRSHTGEKPYQCHN
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pF1KB9 CGKSFPSKSQLQMHKRIHTGEKPYICTECGKAFTNRSNLNTHQKSHTGEKSYICAECGKA
::::: :::::..:.::::::::: :..:::.::..:.:: ::: ::::. ..:.:::::
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pF1KB9 FTDRSNFNKHQTIHTGEKPYVCADCGRAFIQKSELITHQRIHTTEKPYKCPDCEKSFSKK
:...: .. :: :::::::: :..::.:: .::.. :::::: :::: : .: :.:. .
CCDS12 FNQKSILSMHQRIHTGEKPYKCSECGKAFTSKSQFKEHQRIHTGEKPYVCTECGKAFNGR
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pF1KB9 PHLKVHQRIHTGEKPYICAECGKAFTDRSNFNKHQTIHTGDKPYKCSDCGKGFTQKSVLS
... :: :: :.:..: .:::::...:.. :: : :.:::.: ::::.:..: :.
CCDS12 SNFHKHQITHTRERPFVCYKCGKAFVQKSELITHQRTHMGEKPYECLDCGKSFSKKPQLK
600 610 620 630 640 650
660
pF1KB9 MHRNIHT
.:. :::
CCDS12 VHQRIHTGERPYVCSECGKAFNNRSNFNKHQTTHTRDKSYKCSYSVKGFTKQ
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>>CCDS14279.1 ZNF41 gene_id:7592|Hs108|chrX (779 aa)
initn: 2048 init1: 2048 opt: 2255 Z-score: 1360.9 bits: 262.4 E(32554): 1.8e-69
Smith-Waterman score: 2704; 59.1% identity (79.8% similar) in 667 aa overlap (1-661:1-658)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MPANEDAP--QPGE----HGSACEVSVSFEDVTVDFSREEWQQLDSTQRRLYQDVMLENY
: :: :.: .:. .::.::.::::::::::::.::::.:: .::::: :: ::::
CCDS14 MAANGDSPPWSPALAAEGRGSSCEASVSFEDVTVDFSKEEWQHLDPAQRRLYWDVTLENY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 SHLLSVGFEVPKPEVIFKLEQGEGPWTLEGEAPHQSCSDGKFGIKPSQRRISGKSTFHSE
:::::::...:: :. :::::::::: ::::::::::: .: : .:. : : :: :
CCDS14 SHLLSVGYQIPKSEAAFKLEQGEGPWMLEGEAPHQSCSGEAIG-KMQQQGIPGGIFFHCE
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 MEGEDTRDDSLYSILEELWQDAEQIKRCQEKHNKLLSRTTFLNKKILNTEWDYEYKDFGK
. .::: ::::::::: .:... ::..:.:::.. :.: : ::.:.. :
CCDS14 RFDQPIGEDSLCSILEELWQDNDQLEQRQENQNNLLSHV-----KVLIKERGYEHKNIEK
120 130 140 150 160 170
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pF1KB9 FVHPSPNLILSQKRPHKRDSFGKSFKHNLDLHIHNKSNAAKNLDKTIGHGQVFTQNSSYS
..: . .:. : :: :. :.. .::.:. : ::...:.::: : .:.:. : .. : .
CCDS14 IIHVTTKLVPSIKRLHNCDTI---LKHTLNSHNHNRNSATKNLGKIFGNGNNFPHSPSST
180 190 200 210 220 230
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pF1KB9 HHENTHTGVKFCERNQCGKVLSLKHSLSQNVKFPIGEKANTCTEFGKIFTQRSHFFTPQK
..::..::.. ::... : :: :.. ... :. :: .::: :::.::.: :.
CCDS14 KNENAKTGANSCEHDHYEKHLSHKQAPTHHQKIHPEEKLYVCTECVMGFTQKSHLFEHQR
240 250 260 270 280 290
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pF1KB9 IHTVEKPHELSKCVNVFTQKPLLSIYLRVHRDEKLYICTKCGKAFIQNSELIMHEKTHTR
::. :: .: .: .:: ::: .... :. :: :.::.:::.: .:.:: :.: ::
CCDS14 IHAGEKSRECDKSNKVFPQKPQVDVHPSVYTGEKPYLCTQCGKVFTLKSNLITHQKIHTG
300 310 320 330 340 350
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pF1KB9 EKPYKCNECGKSFFQVSSLLRHQTTHTGEKLFECSECGKGFSLNSALNIHQKIHTGERHH
.:::::.::::.::: :.:.:: ::::: .:::::::::: :: :.:::: ::::.:.
CCDS14 QKPYKCSECGKAFFQRSDLFRHLRIHTGEKPYECSECGKGFSQNSDLSIHQKTHTGEKHY
360 370 380 390 400 410
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pF1KB9 KCSECGKAFTQKSTLRMHQRIHTGERSYICTQCGQAFIQKAHLIAHQRIHTGEKPYECSD
.:.:::::::.::.:::::::::::. :.:..::.:::::.:. .:::::::::::::::
CCDS14 ECNECGKAFTRKSALRMHQRIHTGEKPYVCADCGKAFIQKSHFNTHQRIHTGEKPYECSD
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB9 CGKSFPSKSQLQMHKRIHTGEKPYICTECGKAFTNRSNLNTHQKSHTGEKSYICAECGKA
::::: .::::..:.::::::::::::::::.::.:.::.::::.::::: :.:::::::
CCDS14 CGKSFTKKSQLHVHQRIHTGEKPYICTECGKVFTHRTNLTTHQKTHTGEKPYMCAECGKA
480 490 500 510 520 530
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pF1KB9 FTDRSNFNKHQTIHTGEKPYVCADCGRAFIQKSELITHQRIHTTEKPYKCPDCEKSFSKK
:::.::. ::: ::::::: : ::.::: ::.: ::. : :. :.: :: :.: .:
CCDS14 FTDQSNLIKHQKTHTGEKPYKCNGCGKAFIWKSRLKIHQKSHIGERHYECKDCGKAFIQK
540 550 560 570 580 590
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pF1KB9 PHLKVHQRIHTGEKPYICAECGKAFTDRSNFNKHQTIHTGDKPYKCSDCGKGFTQKSVLS
:.::::::::::::.: :::::: ..:.: :. ::::.:::.:::::: ::.:: :
CCDS14 STLSVHQRIHTGEKPYVCPECGKAFIQKSHFIAHHRIHTGEKPYECSDCGKCFTKKSQLR
600 610 620 630 640 650
660
pF1KB9 MHRNIHT
.:..:::
CCDS14 VHQKIHTGEKPNICAECGKAFTDRSNLITHQKIHTREKPYECGDCGKTFTWKSRLNIHQK
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>--
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::: ::::::::::::::. :: ::: :
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::: :.:::..: ::.: ::. :: :. :.: : :.: .: :..:: ::::.:::
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.::. . . .: .: :: :.: :..: :.:: :::. :. :...: :. .:.
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:: .::: :. :::.: . :. :: :::::: ..::::::.:: .:.: :::..::::
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. ..::::::::.::: : .::::::::. : : .::.:: ::..:: :.: ::::::::
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:..:::.: ::.: .::::::::::: :..: .::. ...: ::: ::::: : :.::
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::.:. .:.. :: ::::::: :..::.:: :::.:: :::::: :::: : .: :.:
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:.: :: ::::::::::::::::::::...:.. :: ::::..::.:. :::.: :::
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660
pF1KB9 VLSMHRNIHT
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600
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:. .::. . . .: .: :: :.: :..: :.:: :::. :. :...: :. .
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:. :. :. :.:: . ::::.:. .:: :
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.. :: .::: :. :::.: . :. :: :::::: ..::::::.:: .:.: :::..:
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:::. ..::::::::.::: : .::::::::. : : .::.:: ::..:: :.: :::::
CCDS54 TGEKPYECSECGKAFSQKSPLIIHQRIHTGEKPYECRECGKAFSQKSQLIIHHRAHTGEK
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CCDS54 PYECTECGKAFCEKSHLIIHKRIHTGEKPYKCAQCEEAFSRKTELITHQLVHTGEKPYEC
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pF1KB9 AECGKAFTDRSNFNKHQTIHTGEKPYVCADCGRAFIQKSELITHQRIHTTEKPYKCPDCE
.::::.:. .:.. :: ::::::: :..::.:: :::.:: :::::: :::: : .:
CCDS54 TECGKTFSRKSQLIIHQRTHTGEKPYKCSECGKAFCQKSHLIGHQRIHTGEKPYICTECG
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:.::.: :: ::::::::::::::::::::...:.. :: ::::..::.:. :::.:
CCDS54 KAFSQKSHLPGHQRIHTGEKPYICAECGKAFSQKSDLVLHQRIHTGERPYQCAICGKAFI
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pF1KB9 QKSVLSMHRNIHT
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CCDS54 QKSQLTVHQRIHTVVKS
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.:.::::.:. .:. .:. : : .....: ..: .... :. : .:. :::. .
CCDS35 KDNSLYSVLK-IWHIDNQMDRYQGNQDRVLRQVTVISRETLTDEMGSKYSAFGKMFNRCT
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CCDS35 GFIHTGMEPYGDSQCEKVLSHKQAHVQYKKFQAREKPNVCSMCGKAFIKKSQLIIHQRIH
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: :::. . : ..:..: : .. :.: :: : ::: :.:: ..: . .:...:: ::
CCDS35 TGEKPYVCGDCRKAFSEKSHLIVHQRIHTGEKPYECTKYGRAFSRKSPFTVHQRVHTGEK
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::.: :: :.: : : :. :: .:: :: :::::: :.: : : ::: :::.. ..:
CCDS35 PYECFECPKAFSQKSHLIIHQRVHTREKPFECSECRKAFCEMSHLFIHQITHTGKKPYEC
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pF1KB9 SECGKAFTQKSTLRMHQRIHTGERSYICTQCGQAFIQKAHLIAHQRIHTGEKPYECSDCG
.::::.: .:. : .::: ::::. : : .::..: :..:::.::::::::::: :.:::
CCDS35 TECGKTFPRKTQLIIHQRTHTGEKPYKCGECGKTFCQQSHLIGHQRIHTGEKPYVCTDCG
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pF1KB9 KSFPSKSQLQMHKRIHTGEKPYICTECGKAFTNRSNLNTHQKSHTGEKSYICAECGKAFT
:.: .::.: :.:.:::::::.::::::.:...: : ::. ::::: : :.::::.:.
CCDS35 KAFSQKSHLTGHQRLHTGEKPYMCTECGKSFSQKSPLIIHQRIHTGEKPYQCGECGKTFS
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CCDS35 QKSLLIIHLRVHTGEKPYECTECGRAFSLKSHLILHQRGHTGEKPYECSECGKAFCGKSP
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CCDS35 LIIHQKTHPREKTPECAESGMTFFWKSQMITYQRRHTGEKPSRCSDCGKAFCQHVYFTGH
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pF1KB9 RNIHT
.:
CCDS35 QNPYRKDTLYIC
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pF1KB9 RRLYQDVMLENYSHLLSVGFEVPKPEVIFKLEQGEGPWTLEGEAPHQSCSDGKF------
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CCDS12 QRNLYRDVMLETYSHLLSVGYQVPKPEVVMLEQGKEPWALQGERPRHSCPGEKLWDHNQH
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pF1KB9 ----GIKPS----QRRISGKSTFHSEMEGEDTRDDSLYSIL------EELW---------
: ::. :. ::..... :.. : ... :.:.
CCDS12 RKIIGYKPASSQDQKIYSGEKSYECAEFGKSFTWKSQFKVHLKVPTGEKLYVCIECGRAF
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pF1KB9 -QDAEQIK-----------RCQEKHNKLLSRTT-FLNKKILNTEWDYEYKDFGKFVHPSP
: : : .:.: ..... .. : ...: . : :: .. :: .
CCDS12 VQKPEFITHQKTHMREKPYKCNECGKSFFQVSSLFRHHRIHTGEKLYECSECGKGFPYNS
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190 200 210 220 230
pF1KB9 NLILSQK-----RPHKRDSFGKSFKHNLDLHIHNKSNAAKNLDKTIGHGQVFTQNSSYSH
.: . .: : :. . ::.: .. :.::.: .... : ::.: :...
CCDS12 DLSIHEKIHTGERHHECTDCGKAFTQKSTLKIHQKIHTGERSYICIECGQAFIQKTQLIA
230 240 250 260 270 280
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pF1KB9 HENTHTGVKFCERNQCGK----------------------------VLSLKHSLSQNVKF
:. :.: : : :.::: :.: . .: . :.
CCDS12 HRRIHSGEKPYECNNCGKSFISKSQLQVHQRVHTRVKPYICTEYGKVFSNNSNLITHEKI
290 300 310 320 330 340
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pF1KB9 PIGEKANTCTEFGKIFTQRSHFFTPQKIHTVEKPHELSKCVNVFTQKPLLSIYLRVHRDE
::.. ::: :: :: ::... :.::: :::.: : : .:::: :... :.: :
CCDS12 QSREKSSICTECGKAFTYRSELIIHQRIHTGEKPYECSDCGRAFTQKSALTVHQRIHTGE
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pF1KB9 KLYICTKCGKAFIQNSELIMHEKTHTREKPYKC---------------------------
: ::: ::: :::....:: :. :: ::::::
CCDS12 KSYICMKCGLAFIRKAHLITHQIIHTGEKPYKCGHCGKLFTSKSQLHVHKRIHTGEKPYV
410 420 430 440 450 460
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pF1KB9 -NECGKSFFQVSSLLRHQTTHTGEKLFECSECGKGFSLNSALNIHQKIHTGERHHKCSEC
:.:::.: . :.:. :: :::::: . ::.:::.:. : : ::.:::::. ..:. :
CCDS12 CNKCGKAFTNRSNLITHQKTHTGEKSYICSKCGKAFTQRSDLITHQRIHTGEKPYECNTC
470 480 490 500 510 520
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pF1KB9 GKAFTQKSTLRMHQRIHTGERSYICTQCGQAFIQKAHLIAHQRIHTGEKPYECSDCGKSF
::::::::.: .::.::::::.: : .::.:: ::. ::.::.:::::::: :..::..:
CCDS12 GKAFTQKSNLNIHQKIHTGERQYECHECGKAFNQKSILIVHQKIHTGEKPYVCTECGRAF
530 540 550 560 570 580
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pF1KB9 PSKSQLQMHKRIHTGEKPYICTECGKAFTNRSNLNTHQKSHTGEKSYICAECGKAFTDRS
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CCDS12 IRKSNFITHQRIHTGEKPYECSDCGKSFTSKSQLLVHQPVHTGEKPYVCAECGKAFSGRS
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CCDS12 NLSKHQKTHTGEKPYICSECGKTFRQKSELITHHRIHTGEKPYECSDCGKSFTKKSQLQV
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pF1KB9 HQRIHTGEKPYICAECGKAFTDRSNFNKHQTIHTGDKPYKCSDCGKGFTQKSVLSMHRNI
:::::::::::.::::::::..:::.::::: :::::::::. :::::.::::.:.:..
CCDS12 HQRIHTGEKPYVCAECGKAFSNRSNLNKHQTTHTGDKPYKCGICGKGFVQKSVFSVHQSS
710 720 730 740 750 760
660
pF1KB9 HT
:
CCDS12 HA
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::::::::.:.:. : ::.:: :::::: :
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: ..:. : . .:: : ... :: : : .:: .. ::: :: :::.
CCDS54 WIIKGDISNWIYPDEYQADGRQDRKSNLHNSQSCILGTVSFHHKILKGVTRDGSLCSILK
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:. :..: :...::. ..::.:.: .. ..:. .::. . . .: .: :
CCDS54 VCQGDG-QLQRFLENQDKLFRQVTFVNSKTVTEASGHKYNPLGKIFQECIETDISIQRFH
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::.:. .:: : :...: :: .::
CCDS54 CGNVFRNTQSLIQY----------------------------QNVETKEK-----SCV--
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:. ::::: ..:.::.:.. :: .::: :. :::.: .
CCDS54 ---------------------CVTCGKAFAKKSQLIVHQRIHTGKKPYDCGACGKAFSEK
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:. :: :::::: ..::::::.:: .:.: :::..::::. ..::::::::.::: :
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CCDS54 IHQRIHTGEKPYECRECGKAFSQKSQLIIHHRAHTGEKPYECTECGKAFCEKSHLIIHKR
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:::: :..::.:: :::.:: :::::: :::: : .: :.::.: :: :::::::::::
CCDS54 EKPYKCSECGKAFCQKSHLIGHQRIHTGEKPYICTECGKAFSQKSHLPGHQRIHTGEKPY
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:::::::::...:.. :: ::::..::.:. :::.: ::: :..:. :::
CCDS54 ICAECGKAFSQKSDLVLHQRIHTGERPYQCAICGKAFIQKSQLTVHQRIHTVVKS
520 530 540 550 560
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:. ... ..:. .:: :. ..: . :: :: .: ::::: :. ::.
CCDS35 RESLYLFSDYVNVFSPKSHAFAHESICAEEKQHECHECEAVFTQKSQLDGSQRVYAG---
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CCDS35 AFIRKSHFITHERIHTGEKPYECSDCGKSFIKKSQLHVHQRIHTGENPFICSECGKVFTH
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..:: ::: ::::. :::. ::::::::::. ::: :::::::: :.:::..: ::.:
CCDS35 KTNLIIHQKIHTGERPYICTVCGKAFTDRSNLIKHQKIHTGEKPYKCSDCGKSFTWKSRL
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CCDS35 RIHQKCHTGERHYECSECGKAFIQKSTLSMHQRIHRGEKPYVCTECGKAFFHKSHFITHE
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CCDS35 RIHTGEKPYECSICGKSFTKKSQLHVHQQIHTGEKPYRCAECGKAFTDRSNLFTHQKIHT
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>--
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CCDS35 PYKCSDCGKAFTRKSGLHIHQQSHTGERHYECSECGKAFARKSTLIMHQRIHTGEKPYIC
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CCDS35 KAFTIRSNLIKHQKIHTKQKPYKCSDLGKALNWKPQLSMPQKSDNGEVECSMPQLWCGDS
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CCDS35 EGDQGQLSSI
810
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pF1KB9 SCSDGKFGIKPSQRRISGKSTFHSEMEGEDTRDDSLYSILEELWQDAEQIKRCQEKHNKL
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CCDS35 RPDGDIGFGPLQQRMSEEVSFQSEININLFTRDDP-YSILEELWKDDEHTRKCGENQNKP
80 90 100 110 120 130
150 160 170 180 190 200
pF1KB9 LSRTTFLNKKILNTEWDYEYKDFGKFVHPSPNLILSQKRPHKRDSFGKSFKHNLDLHIHN
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CCDS35 LSRVVFINKKTLANDSIFEYKDIGEIVHVNTHLVSSRKRPHNCNSCGKNLEPIITL--YN
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CCDS35 RNNATENSDKTIGDGDIFT-------HLNSHTEVTACECNQCGKPLHHKQALIQQQKIHT
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pF1KB9 GEKANTCTEFGKIFTQRSHFFTPQKIHTVEKPHELSKCVNVFTQKPLLSIYLRVHRDEKL
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CCDS35 -ICTEYEKDFSLKSN---RQKTPYEGNYYKCSDYGRAFIQKSDLFRCQRIHSGEKPYEYS
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pF1KB9 ECGKGFSLNSALNIHQKIHTGERHHKCSECGKAFTQKSTLRMHQRIHTGERSYICTQCGQ
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pF1KB9 LFECSECGKGFSLNSALNIHQKIHTGERHHKCSECGKAFTQKSTLRMHQRIHTGERSYIC
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CCDS35 PYKCSDCGKAFTRKSGLHIHQQSHTGERHYECSECGKAFARKSTLIMHQRIHTGEKPYIC
670 680 690 700 710 720
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pF1KB9 KAFTNRSNLNTHQKSHTGEKSYICAECGKAFTDRSNFNKHQTIHTGEKPYVCADCGRAFI
:::: :::: ::: :: .: : :.. :::.. . ... : .::
CCDS35 KAFTIRSNLIKHQKIHTKQKPYKCSDLGKALNWKPQLSMPQKSDNGEVECSMPQLWCGDS
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CCDS35 EGDQGQLSSI
850
661 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 18:42:17 2016 done: Fri Nov 4 18:42:18 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]