Result of FASTA (ccds) for
pF1KB9758
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9758, 711 aa
1>>>pF1KB9758 711 - 711 aa - 711 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.1059+/-0.00117; mu= 3.8791+/- 0.069
mean_var=265.5319+/-53.866, 0's: 0 Z-trim(111.4): 929 B-trim: 569 in 1/51
Lambda= 0.078707
statistics sampled from 11341 (12371) to 11341 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.701), E-opt: 0.2 (0.38), width: 16
Scan time: 4.030
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS13151.1 GZF1 gene_id:64412|Hs108|chr20 ( 711) 4837 563.2 4.8e-160
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CCDS12500.1 ZNF585B gene_id:92285|Hs108|chr19 ( 769) 975 124.7 5.2e-28
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CCDS42532.1 ZNF253 gene_id:56242|Hs108|chr19 ( 499) 969 123.8 6.1e-28
CCDS12503.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 686) 971 124.2 6.5e-28
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CCDS46100.1 ZNF225 gene_id:7768|Hs108|chr19 ( 706) 970 124.1 7.2e-28
CCDS54310.1 ZNF578 gene_id:147660|Hs108|chr19 ( 590) 966 123.6 8.7e-28
CCDS65096.1 ZNF189 gene_id:7743|Hs108|chr9 ( 612) 966 123.6 8.9e-28
CCDS56092.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 580) 965 123.4 9.3e-28
CCDS12632.1 ZNF45 gene_id:7596|Hs108|chr19 ( 682) 966 123.6 9.7e-28
CCDS42558.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 644) 965 123.5 1e-27
CCDS12972.1 ZNF329 gene_id:79673|Hs108|chr19 ( 541) 962 123.1 1.1e-27
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 962 123.1 1.2e-27
CCDS58688.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 503) 960 122.8 1.2e-27
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 962 123.1 1.3e-27
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 962 123.2 1.3e-27
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 962 123.2 1.3e-27
CCDS75846.1 ZNF658 gene_id:26149|Hs108|chr9 (1059) 966 123.8 1.3e-27
CCDS58687.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 555) 960 122.9 1.3e-27
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CCDS12957.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 564) 960 122.9 1.4e-27
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CCDS74468.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 616) 960 122.9 1.4e-27
CCDS58686.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 629) 960 122.9 1.5e-27
CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 ( 682) 956 122.5 2.1e-27
CCDS165.1 ZBTB17 gene_id:7709|Hs108|chr1 ( 803) 957 122.7 2.2e-27
CCDS72712.1 ZBTB17 gene_id:7709|Hs108|chr1 ( 810) 957 122.7 2.2e-27
CCDS35106.1 ZNF483 gene_id:158399|Hs108|chr9 ( 744) 956 122.5 2.3e-27
CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3 ( 754) 954 122.3 2.7e-27
CCDS42639.1 ZNF154 gene_id:7710|Hs108|chr19 ( 437) 949 121.5 2.7e-27
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 ( 738) 953 122.2 2.8e-27
CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19 ( 678) 952 122.0 2.9e-27
CCDS33048.1 ZNF235 gene_id:9310|Hs108|chr19 ( 738) 952 122.1 3.1e-27
CCDS75904.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 364) 943 120.8 3.8e-27
CCDS11179.2 ZNF287 gene_id:57336|Hs108|chr17 ( 761) 949 121.7 4e-27
CCDS69664.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 474) 943 120.9 4.6e-27
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CCDS33122.1 ZNF470 gene_id:388566|Hs108|chr19 ( 717) 946 121.4 4.8e-27
CCDS6755.1 ZNF189 gene_id:7743|Hs108|chr9 ( 584) 944 121.1 4.9e-27
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CCDS6754.1 ZNF189 gene_id:7743|Hs108|chr9 ( 626) 944 121.1 5.1e-27
CCDS43307.1 PRDM9 gene_id:56979|Hs108|chr5 ( 894) 946 121.5 5.7e-27
CCDS12955.1 ZNF530 gene_id:348327|Hs108|chr19 ( 599) 941 120.7 6.3e-27
CCDS82391.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 782) 943 121.1 6.5e-27
>>CCDS13151.1 GZF1 gene_id:64412|Hs108|chr20 (711 aa)
initn: 4837 init1: 4837 opt: 4837 Z-score: 2986.8 bits: 563.2 E(32554): 4.8e-160
Smith-Waterman score: 4837; 99.9% identity (100.0% similar) in 711 aa overlap (1-711:1-711)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MESGAVLLESKSSPFNLLHEMHELRLLGHLCDVTVSVEYQGVRKDFMAHKAVLAATSKFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MESGAVLLESKSSPFNLLHEMHELRLLGHLCDVTVSVEYQGVRKDFMAHKAVLAATSKFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 KEVFLNEKSVDGTRTNVYLNEVQVADFASFLEFVYTAKVQVEEDRVQRMLEVAEKLKCLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 KEVFLNEKSVDGTRTNVYLNEVQVADFASFLEFVYTAKVQVEEDRVQRMLEVAEKLKCLD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 LSETCFQLKKQMLESVLLELQNFSESQEVEVSSGSQVSAAPAPRASVATDGPHPSGLTDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LSETCFQLKKQMLESVLLELQNFSESQEVEVSSGSQVSAAPAPRASVATDGPHPSGLTDS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LDYPGERASNGMSSDLPPKKSKDKLDKKKEVVKPPYPKIRRASGRLAGRKVFVEIPKKKY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TRRLREQQKTAEGDVGDYRCPQDQSPDRVGTEMEQVSKNEGCQAGAELEELSKKAGPEEE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 EEEEEEDEEGEKKKSNFKCSICEKAFLYEKSFLKHSKHRHGVATEVVYRCDTCGQTFANR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 EEEEEEDEEGEKKKSNFKCSICEKAFLYEKSFLKHSKHRHGVATEVVYRCDTCGQTFANR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 CNLKSHQRHVHSSERHFPCELCGKKFKRKKDVKRHVLQVHEGGGERHRCGQCGKGLSSKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 CNLKSHQRHVHSSERHFPCELCGKKFKRKKDVKRHVLQVHEGGGERHRCGQCGKGLSSKT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 ALRLHERTHTGDRPYGCTECGARFSQPSALKTHMRIHTGEKPFVCDECGARFTQNHMLIY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ALRLHERTHTGDRPYGCTECGARFSQPSALKTHMRIHTGEKPFVCDECGARFTQNHMLIY
430 440 450 460 470 480
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pF1KB9 HKRCHTGERPFMCETCGKSFASKEYLKHHNRIHTGSKPFKCEVCFRTFAQRNSLYQHIKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 HKRCHTGERPFMCETCGKSFASKEYLKHHNRIHTGSKPFKCEVCFRTFAQRNSLYQHIKV
490 500 510 520 530 540
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pF1KB9 HTGERPYCCDQCGKQFTQLNALQRHRRIHTGERPFMCNACGRTFTDKSTLRRHTSIHDKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 HTGERPYCCDQCGKQFTQLNALQRHRRIHTGERPFMCNACGRTFTDKSTLRRHTSIHDKN
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610 620 630 640 650 660
pF1KB9 TPWKSFLVIVDGSPKNDDGHKTEQPDEEYVSSKLSDKLLSFAENGHFHNLAAVQDTVPTM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TPWKSFLVIVDGSPKNDDGHKTEQPDEEYVSSKLSDKLLSFAENGHFHNLAAVQDTVPTM
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710
pF1KB9 QENSSADTACKADDTVVSQDTLLATTISELSELTPQTDSMPTQLHSLSNME
::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QENSSADTACKADDSVVSQDTLLATTISELSELTPQTDSMPTQLHSLSNME
670 680 690 700 710
>>CCDS12499.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 (714 aa)
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Smith-Waterman score: 985; 43.6% identity (73.0% similar) in 296 aa overlap (310-604:407-692)
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 EGCQAGAELEELSKKAGPEEEEEEEEEDEEGEKKKSNFKCSICEKAFLYEKSFLKHSKHR
::: . :. : ::: ..... :.: .
CCDS12 HTGEKPHKCGHCGKLFTSKSQLHVHKRIHTGEKP---YMCNKCGKAFTNRSNLITHQKTH
380 390 400 410 420 430
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 HGVATEVVYRCDTCGQTFANRCNLKSHQRHVHSSERHFPCELCGKKFKRKKDVKRHVLQV
: : : :. ::..:..: .: .::: .:..:. . :. ::: : .:. .. : ..
CCDS12 TG---EKSYICSKCGKAFTQRSDLITHQR-IHTGEKPYECNTCGKAFTQKSHLNIH-QKI
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400 410 420 430 440 450
pF1KB9 HEGGGER-HRCGQCGKGLSSKTALRLHERTHTGDRPYGCTECGARFSQPSALKTHMRIHT
: : :: ..: .:::....:. : .:.. :::..:: ::::: : . : . ::.::::
CCDS12 HTG--ERQYECHECGKAFNQKSILIVHQKIHTGEKPYVCTECGRAFIRKSNFITHQRIHT
490 500 510 520 530 540
460 470 480 490 500 510
pF1KB9 GEKPFVCDECGARFTQNHMLIYHKRCHTGERPFMCETCGKSFASKEYLKHHNRIHTGSKP
::::. :..:: ::.. .:. :. ::::.:..: :::.:... :..:.. ::: ::
CCDS12 GEKPYECSDCGKSFTSKSQLLVHQPVHTGEKPYVCAECGKAFSGRSNLSKHQKTHTGEKP
550 560 570 580 590 600
520 530 540 550 560 570
pF1KB9 FKCEVCFRTFAQRNSLYQHIKVHTGERPYCCDQCGKQFTQLNALQRHRRIHTGERPFMCN
. : : .:: :.. : : ..::::.:: :..:::.::. . :: :.::::::.:..:
CCDS12 YICSECGKTFRQKSELITHHRIHTGEKPYECSDCGKSFTKKSQLQVHQRIHTGEKPYVCA
610 620 630 640 650 660
580 590 600 610 620 630
pF1KB9 ACGRTFTDKSTLRRHTSIHDKNTPWKSFLVIVDGSPKNDDGHKTEQPDEEYVSSKLSDKL
::..:::.:.: .: . : . :.:
CCDS12 ECGKAFTDRSNLNKHQTTHTGDKPYKCGICGKGFVQKSVFSVHQSSHA
670 680 690 700 710
>--
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Smith-Waterman score: 854; 42.6% identity (67.3% similar) in 303 aa overlap (310-612:71-361)
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 EGCQAGAELEELSKKAGPEEEEEEEEEDEEGEKKKSNFKCSICEKAFLYEKSFLKHSKHR
::: ..:. :: : .:: :: :
CCDS12 CPGEKLWDHNQCRKILSYKQVSSQPQKMYPGEKA---YECAKFEKIFT-QKSQLK--VHL
50 60 70 80 90
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 HGVATEVVYRCDTCGQTFANRCNLKSHQRHVHSSERHFPCELCGKKFKRKKDVKRHVLQV
. .: : .: : ::..:... .. ::. .: :. : :. :::.: . ... :: ..
CCDS12 KVLAGEKLYVCIECGKAFVQKPEFIIHQK-THMREKPFKCNECGKSFFQVSSLFRH-QRI
100 110 120 130 140 150
400 410 420 430 440 450
pF1KB9 HEGGGERHRCGQCGKGLSSKTALRLHERTHTGDRPYGCTECGARFSQPSALKTHMRIHTG
: : . ..:.:::::.: .. : .::. :::.: . ::.:: :.: :.:: :..::::
CCDS12 HTGE-KLYECSQCGKGFSYNSDLSIHEKIHTGERHHECTDCGKAFTQKSTLKMHQKIHTG
160 170 180 190 200 210
460 470 480 490 500 510
pF1KB9 EKPFVCDECGARFTQNHMLIYHKRCHTGERPFMCETCGKSFASKEYLKHHNRIHTGSKPF
:. ..: ::: : :. :: :.: ::::.:. : .::::: :: :. :.:.:: ::.
CCDS12 ERSYICIECGQAFIQKTHLIAHRRIHTGEKPYECSNCGKSFISKSQLQVHQRVHTRVKPY
220 230 240 250 260 270
520 530 540 550 560 570
pF1KB9 KCEVCFRTFAQRNSLYQHIKVHTGERPYCCDQCGKQFTQLNALQRHRRIHTGERPFMCNA
: ..:.. ..: : ::.. :. : .::: :: . : :.::::::.:. :.
CCDS12 ICTEYGKVFSNNSNLVTHKKVQSREKSSICTECGKAFTYRSELIIHQRIHTGEKPYECSD
280 290 300 310 320 330
580 590 600 610 620 630
pF1KB9 CGRTFTDKSTLRRHTSIHDKNTPWKSFLVIVDGSPKNDDGHKTEQPDEEYVSSKLSDKLL
::..::.::.: : :: : ::.. . :
CCDS12 CGKAFTQKSALTVHQRIH---TGEKSYICMKCGLAFIQKAHLIAHQIIHTGEKPHKCGHC
340 350 360 370 380
640 650 660 670 680 690
pF1KB9 SFAENGHFHNLAAVQDTVPTMQENSSADTACKADDTVVSQDTLLATTISELSELTPQTDS
CCDS12 GKLFTSKSQLHVHKRIHTGEKPYMCNKCGKAFTNRSNLITHQKTHTGEKSYICSKCGKAF
390 400 410 420 430 440
>>CCDS74353.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 (769 aa)
initn: 4939 init1: 769 opt: 982 Z-score: 620.7 bits: 125.5 E(32554): 3e-28
Smith-Waterman score: 985; 43.6% identity (73.0% similar) in 296 aa overlap (310-604:462-747)
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 EGCQAGAELEELSKKAGPEEEEEEEEEDEEGEKKKSNFKCSICEKAFLYEKSFLKHSKHR
::: . :. : ::: ..... :.: .
CCDS74 HTGEKPHKCGHCGKLFTSKSQLHVHKRIHTGEKP---YMCNKCGKAFTNRSNLITHQKTH
440 450 460 470 480
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 HGVATEVVYRCDTCGQTFANRCNLKSHQRHVHSSERHFPCELCGKKFKRKKDVKRHVLQV
: : : :. ::..:..: .: .::: .:..:. . :. ::: : .:. .. : ..
CCDS74 TG---EKSYICSKCGKAFTQRSDLITHQR-IHTGEKPYECNTCGKAFTQKSHLNIH-QKI
490 500 510 520 530 540
400 410 420 430 440 450
pF1KB9 HEGGGER-HRCGQCGKGLSSKTALRLHERTHTGDRPYGCTECGARFSQPSALKTHMRIHT
: : :: ..: .:::....:. : .:.. :::..:: ::::: : . : . ::.::::
CCDS74 HTG--ERQYECHECGKAFNQKSILIVHQKIHTGEKPYVCTECGRAFIRKSNFITHQRIHT
550 560 570 580 590 600
460 470 480 490 500 510
pF1KB9 GEKPFVCDECGARFTQNHMLIYHKRCHTGERPFMCETCGKSFASKEYLKHHNRIHTGSKP
::::. :..:: ::.. .:. :. ::::.:..: :::.:... :..:.. ::: ::
CCDS74 GEKPYECSDCGKSFTSKSQLLVHQPVHTGEKPYVCAECGKAFSGRSNLSKHQKTHTGEKP
610 620 630 640 650 660
520 530 540 550 560 570
pF1KB9 FKCEVCFRTFAQRNSLYQHIKVHTGERPYCCDQCGKQFTQLNALQRHRRIHTGERPFMCN
. : : .:: :.. : : ..::::.:: :..:::.::. . :: :.::::::.:..:
CCDS74 YICSECGKTFRQKSELITHHRIHTGEKPYECSDCGKSFTKKSQLQVHQRIHTGEKPYVCA
670 680 690 700 710 720
580 590 600 610 620 630
pF1KB9 ACGRTFTDKSTLRRHTSIHDKNTPWKSFLVIVDGSPKNDDGHKTEQPDEEYVSSKLSDKL
::..:::.:.: .: . : . :.:
CCDS74 ECGKAFTDRSNLNKHQTTHTGDKPYKCGICGKGFVQKSVFSVHQSSHA
730 740 750 760
>--
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CCDS82 H--SREQSYKCNECGKAFIKMSNLIRHQR-IHTGEKPYACKECEKSFSQKSNLIDHE-KI
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CCDS12 ALIQHWRVHTGERPYECSECGRAFNNNSNLAQHQKVHTGERPFECSECGRDFSQSSHLLR
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CCDS12 HTGEKPYECSECGKAFAHSSTLIEHWRVHTKERPYECNECGKFFSQNSILIKHQKVHTGE
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:.:
CCDS12 KPYKCSECGKFFSRKSSLICHWRVHTGERPYECSECGRAFSSNSHLVRHQRVHTQERPYE
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CCDS42 EIFQCDKYGKVFHKFSNSNTYKTRHTGINLFKCIICGKAFKRSSTLTTHKKIHTG---EK
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CCDS42 PYRCEECGKAFNQSANLTTHKR-IHTGEKPYRCEECGKAFKQSSNLTTHK-KIHT--GEK
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pF1KB9 -HRCGQCGKGLSSKTALRLHERTHTGDRPYGCTECGARFSQPSALKTHMRIHTGEKPFVC
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CCDS42 PYKCEECGKAFNRSTDLTTHKIVHTGEKPYKCEECGKAFKHPSHVTTHKKIHTRGKPYNC
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CCDS42 EECGKSFKHCSNLTIHKRIHTGEKPYKCEECGKAFHLSSHLTTHKILHTGEKPYRCRECG
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CCDS42 ASSTLTTHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNWSSDLNKHKKIHIERKPYIVKNVTDLLNVPPL
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CCDS46 NIRELSEGGSSTR
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]