FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9774, 671 aa
1>>>pF1KB9774 671 - 671 aa - 671 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.2745+/-0.00122; mu= -2.6721+/- 0.075
mean_var=530.6336+/-104.018, 0's: 0 Z-trim(117.4): 873 B-trim: 97 in 1/54
Lambda= 0.055677
statistics sampled from 17207 (18129) to 17207 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.819), E-opt: 0.2 (0.557), width: 16
Scan time: 3.770
The best scores are: opt bits E(32554)
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>>CCDS5895.1 ZNF282 gene_id:8427|Hs108|chr7 (671 aa)
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Smith-Waterman score: 4787; 99.9% identity (100.0% similar) in 671 aa overlap (1-671:1-671)
10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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70 80 90 100 110 120
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NLEGRTGTAEKKLADCEKTAVEFGNHMESKWAVLGTLLQEYGLLQRRLENLENLLRNRNF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 WVLRLPPGSKGEAPKVPVTFVDIAVYFSEDEWKNLDEWQKELYNNLVKENYKTLMSLDAE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GSVPKPDAPVQAEPREEPCVWEQRHPEEREIPMDPEAGAEPLVPAQDASSQVKREDTLCV
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310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RGQRGLEERAIPTESITDSPISAQDLLSRIKQEEHQCVWDQQDLADRDIPTDPNSESLIS
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pF1KB9 AHDILSWIKQEEQPYPWGPRDSMDGELGLDSGPSDSLLMVKNPPPAPPQPQPQPQPPQPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 AHDILSWIKQEEQPYPWGPRDSMDGELGLDSGPSDSLLMVKNPPPAPPQPQPQPQPPQPQ
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430 440 450 460 470 480
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KB9 TKERPYECAECEKSFNCHSGLIRHQMTHRGERPYKCSECEKTYSRKEHLQNHQRLHTGER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TKERPYECAECEKSFNCHSGLIRHQMTHRGERPYKCSECEKTYSRKEHLQNHQRLHTGER
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610 620 630 640 650 660
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PFQCALCGKSFIRKQNLLKHQRIHTGERPYTCGECGKSFRYKESLKDHLRVHSGGPGPGA
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670
pF1KB9 PRQLPPPPEQD
:::::::::.:
CCDS58 PRQLPPPPERD
670
>>CCDS78284.1 ZNF282 gene_id:8427|Hs108|chr7 (463 aa)
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Smith-Waterman score: 3180; 99.3% identity (99.3% similar) in 457 aa overlap (1-457:1-457)
10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 MDARRPMPFQFPPFPDRAPVFPDRMMREPQLPTAEISLWTVVAAIQAVERKVDAQASQLL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 NLEGRTGTAEKKLADCEKTAVEFGNHMESKWAVLGTLLQEYGLLQRRLENLENLLRNRNF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 WVLRLPPGSKGEAPKVPVTFVDIAVYFSEDEWKNLDEWQKELYNNLVKENYKTLMSLDAE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 GSVPKPDAPVQAEPREEPCVWEQRHPEEREIPMDPEAGAEPLVPAQDASSQVKREDTLCV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 AHDILSWIKQEEQPYPWGPRDSMDGELGLDSGPSDSLLMVKNPPPAPPQPQPQPQPPQPQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::: :
CCDS78 LQSQPQPQSLPPIAVAENPGGPPSRGLLDDGFQPHQGAALRVR
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pF1KB9 GGGGGAEAGTGAGGGCGSCCPGGLRRSLLLHGARSKPYSCPECGKSFGVRKSLIIHHRSH
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20 30 40 50 60 70
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:::. : ..::: . . .:.:. ::
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10 20
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..: .: :: :::::::::.::.::::. .. .::.::::::::::::
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140 150 160 170 180 190
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:.::::..:.::..:.::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::: ::.
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200 210 220 230 240 250
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:::::.: :...::: ::..:.:::::::.:..: ::..:.:.: .. .::. : .
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140 150 160 170 180 190
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:. : . .: ::: ::: :: . :: . ..: : .:.:. . : : .. .
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200 210 220 230 240 250
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pF1KB9 ESITDSPISAQDLLSRIKQEEHQCVWDQQDLADRDIPTDPNSESLISAHDILSWI----K
. . : . ..:. :: : ...: ..:. : : .:.: .: . .
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260 270 280 290 300
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pF1KB9 QEEQPYPWGPRDSMD-GELGLDSGPSDSLLMVKNPPPAPPQ----PQPQPQPPQPQLQS-
: . :.: : . : : . . .: :::. : . . : .: .
CCDS58 QSTSMTPFG-RPATDLPEASEGQVTFTQLGSYPLPPPVGEQVFSCHHCGKNLSQDMLLTH
310 320 330 340 350 360
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: . . :. :. : .. :.. : ..:.:: . . .
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.. .: : .: : . . : : : .:. : .::.::... ::..:.
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:.:..:::. : .: .:: ::.:::::: : ::::: :..: :.. ::::: ::.::::
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:::::.: ::::::::..:.:::::::::::: :. ::.:::::..:::::: :.::
CCDS58 GERPFSCPHCGKSFIRKHHLMKHQRIHTGERPYPCSYCGRSFRYKQTLKDHLRSGHNGGC
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: . : :: :
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>>CCDS43675.1 ZNF777 gene_id:27153|Hs108|chr7 (831 aa)
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10 20 30
pF1KB9 MQFVSTRPQPQQLGIQG-LGLDSGSWSWAQALPPEEVC--
:. ..:: :. . :. : .::
CCDS43 TSSAPKQETSGRMPHVLQKGPSLLCSAASEQETSLQGPLASQEGTQYPPPAAAEQEVSLL
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pF1KB9 -----HQEPALRGEMAEGMPPMQ----AQEWDMDARRPMPFQFPPFPDRAPV-FPDRMMR
::: ... : :. . : ::: :. .: : .: . . ...
CCDS43 SHSPHHQEAPVHSPEAPEKDPLTLSPTVPETDMD---PL-LQSPVSQKDTPFQISSAVQK
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: ::::::. .: ::.::::::..::: .::.::::::: :::.::::::::::.::.
CCDS43 EQPLPTAEITRLAVWAAVQAVERKLEAQAMRLLTLEGRTGTNEKKIADCEKTAVEFANHL
180 190 200 210 220 230
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::::.::::::::::::::::::.::::.:::::.:::::::.::.::::::: :.::.:
CCDS43 ESKWVVLGTLLQEYGLLQRRLENMENLLKNRNFWILRLPPGSNGEVPKVPVTFDDVAVHF
240 250 260 270 280 290
210 220 230 240 250 260
pF1KB9 SEDEWKNLDEWQKELYNNLVKENYKTLMSLDAEGSVPKPDAPVQAEPREEPCVWEQRHPE
::.:: ::.:::::::.:... ::..:.:.: .. ::: : : :.: . ::. :
CCDS43 SEQEWGNLSEWQKELYKNVMRGNYESLVSMDY--AISKPDLMSQMERGERPTMQEQEDSE
300 310 320 330 340 350
270 280 290 300 310 320
pF1KB9 EREIPMDPEAGAEPLVPAQDASSQVKREDTLC----VRGQRGLEERAIPTESITDSPISA
: : : :: :. . .: ..... . ..: . :: .::... . : : .
CCDS43 EGETPTDPSAAHDGIVIKIEVQTNDEGSESLETPEPLMGQ--VEEHGFQDSELGD-PCGE
360 370 380 390 400
330 340 350 360 370
pF1KB9 QDLLSRIKQE---EHQCVWDQQ--DLADRDIPTDPNSESLISAHDILSWIKQEEQPYPWG
: :. . : :.. ... .: . . .:... . . ..::.
CCDS43 QPDLDMQEPENTLEESTEGSSEFSELKQMLVQQRNCTEGIVIKTEEQDE-EEEEEEEDEL
410 420 430 440 450 460
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pF1KB9 PRDSMDGELGLDSGPSDSLLMVKNPPPAPPQPQPQPQPPQPQLQSQPQPQSLPPIA----
:. .. :: :: .. : ..: :. .:. . .:: :: ..: . : : .
CCDS43 PQHLQS--LGQLSGRYEAS-MYQTPLPGEMSPEGEESPPPLQL-GNPAVKRLAPSVHGER
470 480 490 500 510 520
440 450 460
pF1KB9 -VAENPGGPPS-----RG-----LLDDG------FQVLPGERGSGEAPPGG---------
..:: :. . :: .. : .... .:. . :
CCDS43 HLSENRGASSQQQRNRRGERPFTCMECGKSFRLKINLIIHQRNHIKEGPYECAECEISFR
530 540 550 560 570 580
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pF1KB9 -----------DRSTGGGGGDGGGGGGGAE-----------AGTGAGGGCGSCCP-----
: :: . : . . .:.:.:: ::
CCDS43 HKQQLTLHQRIHRVRGGCVSPERGPTFNPKHALKPRPKSPSSGSGGGGPKPYKCPECDSS
590 600 610 620 630 640
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pF1KB9 ----GGLRRSLLLHGARSKPYSCPECGKSFGVRKSLIIHHRSHT--KERPYECAECEKSF
..: . . : .. .::.:::: ::: .. ::.::.: :. .: . :. : :::
CCDS43 FSHKSSLTKHQITHTGE-RPYTCPECKKSFRLHISLVIHQRVHAGKHEVSFICSLCGKSF
650 660 670 680 690 700
560 570 580 590 600 610
pF1KB9 NCHSGLIRHQMTHRGERPYKCSECEKTYSRKEHLQNHQRLHTGERPFQCALCGKSFIRKQ
. : :.::: :: ::::.:: ::::..:.: .: :: :.:. ::: : ::::::::.
CCDS43 SRPSHLLRHQRTHTGERPFKCPECEKSFSEKSKLTNHCRVHSRERPHACPECGKSFIRKH
710 720 730 740 750 760
620 630 640 650 660 670
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.::.:.::::::::: :.:::: : :
CCDS43 HLLEHRRIHTGERPYHCAECGKRFTQKHHLLEHQRAHTGERPYPCTHCAKCFRYKQSLKY
770 780 790 800 810 820
>>CCDS56519.1 ZNF783 gene_id:100289678|Hs108|chr7 (546 aa)
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Smith-Waterman score: 1116; 38.3% identity (56.1% similar) in 656 aa overlap (47-661:1-526)
20 30 40 50 60 70
pF1KB9 GLGLDSGSWSWAQALPPEEVCHQEPALRGEMAEGMPPMQAQEWDMDARRPMPFQFPPFPD
:::. : :.. . : . : : :
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10 20
80 90 100 110 120 130
pF1KB9 RAPVFPDRMMREPQLPTAEISLWTVVAAIQAVERKVDAQASQLLNLEGRTGTAEKKLADC
:. .. : ..::.::::::::::.:.:::. ..::.:::::::::::::::
CCDS56 PQPA----AEKNSYLYSTEITLWTVVAAIQALEKKVDSCLTRLLTLEGRTGTAEKKLADC
30 40 50 60 70 80
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:::::::::..:.:::::::::::::::::::::.::::::::::.::::::::::::::
CCDS56 EKTAVEFGNQLEGKWAVLGTLLQEYGLLQRRLENVENLLRNRNFWILRLPPGSKGEAPKV
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pF1KB9 PVTFVDIAVYFSEDEWKNLDEWQKELYNNLVKENYKTLMSLDAEGSVPKPDAPVQAEPRE
:::: :.:::::: :: .:..::::::..... ::.::.::: .. ::: .. : :
CCDS56 PVTFDDVAVYFSELEWGKLEDWQKELYKHVMRGNYETLVSLDY--AISKPDILTRIERGE
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:::. : :.. .: :. :. . : : : :
CCDS56 EPCLDRWGQEKGNEVEVGR-PRMMGTGLPP--------------------------YP-E
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320 330 340 350 360 370
pF1KB9 SITDSPIS-AQDLLSRIKQEEHQCVWDQQDLADRDIPTDPNSESLISAHDILSWIKQEEQ
.: ::.: ::. : .: : .::: : :. :.. . .. :: : :
CCDS56 HLT-SPLSPAQEEL-----KEGQAPKQQQDSEARVAPAGPEAGGGVA-------IKTEAQ
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.: : : ::.. : .. . : :. .: : :. : :..
CCDS56 S-----EDEMTPERLFLGVSRGQTECRI--------PRGPRNRPGGP-----SRHQAQGM
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: . ..: : ::. .:::.: : .
CCDS56 PRVRAGE-PR-PPG---------------ASGETP----RVLS-----------------
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:: :.. . ::.::.:: .. .: ::.:.:..:
CCDS56 --------------RR-------RQRAFPCPDCGQSFRLKINLTIHQRTHVEEGRQEAPG
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pF1KB9 -RPYECAECEKSFN-----CHSGLIR---HQMTHR----------GERP-----YKCSEC
: :.. . .. . .:: .. : :.:: :.::::
CCDS56 RSPTSCGDSQAMLEPGEVVVPGPVIRWLPEEPEGRRSVAGGRALVGRRPAASKMYHCSEC
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. ..... : :::::::. : : :::.: : ..:..::::::::::: : .::
CCDS56 LRFFQQRKSLLLHQRLHTGNGQGWP-ACPYCGKAFRRPSDLFRHQRIHTGERPYQCPQCG
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..: .. : :...:. : :: :
CCDS56 RTFNRNHHLAVHMQTHARGQVGPHFPAAPARHGSLPLPWPSRKEEG
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: :. :.::.:. : .. . :: .
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.:::::. : ::. ::::::::::.: .: .: .... : .: :..: :
CCDS47 EIPTDPSEEPGISTSDILSWIKQEEEPQVGAPPESKESDV-YKSTYADEELVIKAEGLAR
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: : : .:: .. . ... .: : :. : . .: :: . :
CCDS47 SSLCPEVPVPFSSPPAAAKDAFSDVAFKSQQSTSMTPFGRPATDLPEASEG-QVTFTQLG
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: :: :.. : : . . .. .
CCDS47 SYPLPPPVGEQVFSCHHCGKNLSQDMLLTHQCSHATEHPLPCAQCPKHFTPQADLSSTSQ
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. .. . : : :. : : .:.. .:. ::.:
CCDS47 DHASETPPTCPHCARTFTHPSRLTYHLRVHNSTERPFPCPDCPKRFADQARLTSHRRAHA
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pF1KB9 ----------GKSFGVRKSLIIHHRSHTKERPYECAECEKSFNCHSGLIRHQMTHRGERP
:.::... ::..:.:.:..:::. : .: .:: ::.:::::: : ::::
CCDS47 SERPFRCAQCGRSFSLKISLLLHQRGHAQERPFSCPQCGIDFNGHSALIRHQMIHTGERP
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: :..: :.. ::::: ::.:::::::::.: ::::::::..:.:::::::::::: :.
CCDS47 YPCTDCSKSFMRKEHLLNHRRLHTGERPFSCPHCGKSFIRKHHLMKHQRIHTGERPYPCS
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CCDS47 YCGRSFRYKQTLKDHLRSGHNGGCGGDSDPSGQPPNPPGPLITGLETSGLGVNTEGLETN
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CCDS47 QWYGEGSGGGVL
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CCDS58 QAT------EKSSYFQTTEISLWTVVAAIQAVEKKMESQAARLQSLEGRTGTAEKKLADC
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:: ::::::..:.:::::::::::::::::::::.::::::::::.::::::::::::::
CCDS58 EKMAVEFGNQLEGKWAVLGTLLQEYGLLQRRLENVENLLRNRNFWILRLPPGSKGEAPKV
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.. . .: :.:.::.::..:::::: :... ::.::.:: . : :.: .
CCDS58 SRSLENDGVCFTEQEWENLEDWQKELYRNVMESNYETLVSLKVLG---------QTEGEA
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: . :. :.: : .::.: .. ..:.: :.: :
CCDS58 ELGT-EMLGDLEEEGP----GGAHPA-----GGVMIKQELQYT---QEG------P----
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.: : : .:. ..: ...: ::
CCDS58 ADLP------------GEFSCIAEEQ--------------AFLSP----------EQTEL
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:: . : . :..::.:: : .: . : . . . :. .: . .
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.. : .:: : : . : .. . . . .:
CCDS58 QECG----QGLKLKKDTSRPYECSECEITFRYKQQLA--------------THLRSHSGW
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::: : ..:: . : :: ..: : .::. . ::. :.: : .: :
CCDS58 GSCTPEEPEESLRPR-PRLKPQTKKAKLHQCDVCLRSFSCKVSLVTHQRCHLQEGPSAGQ
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pF1KB9 ECEKSFNCHS--GLIRHQMTHRGERPYKCSECEKTYSRKEHLQNHQRLHTGERPFQCALC
. .. :. .: .: : .... :. : :..:. : :::.::::::..:. :
CCDS58 HVQERFSPNSLVALPGHIPWRKSRSSLICGYCGKSFSHPSDLVRHQRIHTGERPYSCTEC
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pF1KB9 GKSFIRKQNLLKHQRIHTGERPYTCGECGKSFRYKESLKDHLRVHSGGPGPGAPRQLPPP
:::..::.::.::.:: :: : :.
CCDS58 EKSFVQKQHLLQHQKIHQRERGGLALEPGRPNGLL
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:::: :::::::::::::::::..:.:::::::::::::::::::::.::::::::::.:
CCDS58 GRTGMAEKKLADCEKTAVEFGNQLEGKWAVLGTLLQEYGLLQRRLENVENLLRNRNFWIL
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:::::::::.:: :: .:..::::::..... ::.::.::: ..
CCDS58 RLPPGSKGESPK---------------EWGKLEDWQKELYKHVMRGNYETLVSLDY--AI
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::.. : : .::: :.. :. ..:.:: :. : ::: : :.:.: : .. :
CCDS58 SKPEVLSQIEQGKEPCNWRRPGPKIPDVPVDPSPGSGPPVPAPDLLMQIKQEGELQLQEQ
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pF1KB9 R--GLEERAIPTESITDSPIS-------AQDLLSRIKQEEHQCV--------WDQQDLAD
. :.: : .: . : . : :. . . :. : : ::
CCDS58 QALGVEAWAAGQPDIGEEPWGLSQLDSGAGDISTDATSGVHSNFSTTIPPTSW-QTDLPP
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. :.. :.. . :..:. :: :::. : : : .... : ::..
CCDS58 HH-PSSACSDGTLKLNTAASTEDVKIVIKTEVQEEEVVATPVHPTD-LEAH-GTLFGPGQ
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. . .: : . : : : :. .:. : .: :.: : :
CCDS58 ATRFFPSPAQEGAWESQGSSFPSQDPVLGLREPARPERDMGELSPAVAQEETPPGDWLFG
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pF1KB9 LLDDG--FQVLPGERGSGEAPPGGDRSTGGGGGDGGGGG-GGAEAGTGAGGGC---GSCC
. : :. : : : : .. .. :.: . ..: . : :
CCDS58 GVRWGWNFRCKPP---VGLNPRTGPEGLPYSSPDNGEAILDPSQAPRPFNEPCKYPGRTK
380 390 400 410 420 430
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: . .: : : ..:..: ::::: .. :: :.:: . . . : .
CCDS58 GFGHKPGLKKHPAAPPGGRPFTCATCGKSFQLQVSLSAHQRSCGAPDGSGPGTGGGGSGS
440 450 460 470 480 490
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pF1KB9 CHSGLIRHQMTHRGERPYKCSECEKTYSRKEHLQNHQRLHTGERPFQCALCGKSFIRKQN
.: . : .:.:: . ..: :: :. :::::::: :. : : : ....
CCDS58 GGGGGGSGGGSARDGSALRCGECGRCFTRPAHLIRHRMLHTGERPFPCTECEKRFTERSK
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pF1KB9 LLKHQRIHTGERPYTCGECGKSFRYKESLKDHLRVHSGG---PGPGAPRQLPP-PPEQD
:. : : ::: ::.:: ::::: :. :. : : :..: :. : : :: ::.
CCDS58 LIDHYRTHTGVRPFTCTVCGKSFIRKDHLRKHQRNHAAGAKTPARGQPLPTPPAPPDPFK
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CCDS58 SPASKGPLASTDLVTDWTCGLSVLGPTDGGDM
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CCDS55 MAEAVAAPISPWTMAATIQAMERKIESQAARLLSLE
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pF1KB9 GRTGTAEKKLADCEKTAVEFGNHMESKWAVLGTLLQEYGLLQRRLENLENLLRNRNFWVL
:::: :::::::::::::::::..:.:::::::::::::::::::::.::::::::::.:
CCDS55 GRTGMAEKKLADCEKTAVEFGNQLEGKWAVLGTLLQEYGLLQRRLENVENLLRNRNFWIL
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CCDS55 RLPPGSKGESPK---------------EWGKLEDWQKELYKHVMRGNYETLVSLDY--AI
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pF1KB9 PKPDAPVQAEPREEPCVWEQRHPEEREIPMDPEAGAEPLVPAQDASSQVKREDTLCVRGQ
::.. : : .::: :.. :. ..:.:: :. : ::: : :.:.: : .. :
CCDS55 SKPEVLSQIEQGKEPCNWRRPGPKIPDVPVDPSPGSGPPVPAPDLLMQIKQEGELQLQEQ
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pF1KB9 R--GLEERAIPTESITDSPIS-------AQDLLSRIKQEEHQCV--------WDQQDLAD
. :.: : .: . : . : :. . . :. : : ::
CCDS55 QALGVEAWAAGQPDIGEEPWGLSQLDSGAGDISTDATSGVHSNFSTTIPPTSW-QTDLPP
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. :.. :.. .. . :. :: :::. : : : .... : ::.
CCDS55 HH-PSSACSDGTLKLNTAASTEADVKIVIKTEVQEEEVVATPVHPTD-LEAH-GTLFGPG
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.. . .: : . : : : :. .:. : .: :.: :
CCDS55 QATRFFPSPAQEGAWESQGSSFPSQDPVLGLREPARPERDMGELSPAVAQEETPPGDWLF
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pF1KB9 GLLDDG--FQVLPGERGSGEAPPGGDRSTGGGGGDGGGGG-GGAEAGTGAGGGC---GSC
: . : :. : : : : .. .. :.: . ..: . : :
CCDS55 GGVRWGWNFRCKPP---VGLNPRTGPEGLPYSSPDNGEAILDPSQAPRPFNEPCKYPGRT
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: . .: : : ..:..: ::::: .. :: :.:: . . . :
CCDS55 KGFGHKPGLKKHPAAPPGGRPFTCATCGKSFQLQVSLSAHQRSCGAPDGSGPGTGGGGSG
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pF1KB9 NCHSGLIRHQMTHRGERPYKCSECEKTYSRKEHLQNHQRLHTGERPFQCALCGKSFIRKQ
. .: . : .:.:: . ..: :: :. :::::::: :. : : : ...
CCDS55 SGGGGGGSGGGSARDGSALRCGECGRCFTRPAHLIRHRMLHTGERPFPCTECEKRFTERS
500 510 520 530 540 550
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CCDS55 KLIDHYRTHTGVRPFTCTVCGKSFIRKDHLRKHQRNHAAGAKTPARGQPLPTPPAPPDPF
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CCDS55 KSPASKGPLASTDLVTDWTCGLSVLGPTDGGDM
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pF1KB9 LGTLLQEYGLLQRRLENLENLLRNRNFWVLRLPPGSKGEAPKVPVTFVDIAVYFSEDEWK
:: : : :.. .:: :.:: .:.:::
CCDS55 MAAARLLPVPAG--PQAKLTFEDVAVLLSQDEWD
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pF1KB9 NLDEWQKELYNNLVKENYKTLMSLDAEGSVPKPDAPVQAEPREEPCVWEQRHPEEREIPM
: :. :: :.. :.: ...:: :: ::: : : :.: : ... .. .
CCDS55 RLCPAQRGLYRNVMMETYGNVVSLGLPGS--KPDIISQLERGEDPWVLDRKGAKKSQGLW
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pF1KB9 DPEAGAEPLVPAQDASSQVKREDTL-----CVRGQRGLEERAIPTESITDSP-ISAQDLL
. . : .. ..:.: : .. . : :... : .. :
CCDS55 SDYSDNLK----YDHTTACTQQDSLSCPWECETKGESQNTDLSPKPLISEQTVILGKTPL
100 110 120 130 140
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pF1KB9 SRIKQEEHQCVWDQQDLADRDIPTDPNSESLISAHDILSWIKQEEQPYPWGPRDSMDGEL
.:: ::... .:.. .: ...: :. .: : : : : :
CCDS55 GRIDQENNET---KQSFCLSPNSVDHREVQVLSQSMPLT----PHQAVPSGERPYMCVEC
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