Result of FASTA (omim) for
pF1KB9776
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9776, 716 aa
1>>>pF1KB9776 716 - 716 aa - 716 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.5658+/-0.000425; mu= -7.2605+/- 0.027
mean_var=414.9514+/-86.842, 0's: 0 Z-trim(123.1): 18 B-trim: 1137 in 1/57
Lambda= 0.062962
statistics sampled from 42415 (42433) to 42415 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.785), E-opt: 0.2 (0.498), width: 16
Scan time: 14.450
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_004414 (OMIM: 601368,616894) segment polarity p ( 716) 4903 459.9 1.6e-128
XP_005247229 (OMIM: 601368,616894) PREDICTED: segm ( 718) 4858 455.8 2.6e-127
XP_011510815 (OMIM: 601368,616894) PREDICTED: segm ( 548) 3538 335.8 2.7e-91
NP_004413 (OMIM: 602151) segment polarity protein ( 736) 3228 307.8 1e-82
XP_005256559 (OMIM: 602151) PREDICTED: segment pol ( 732) 3212 306.3 2.7e-82
NP_001317240 (OMIM: 180700,601365,616331) segment ( 695) 2869 275.2 6.3e-73
XP_005244789 (OMIM: 180700,601365,616331) PREDICTE ( 574) 2708 260.5 1.4e-68
XP_016879787 (OMIM: 602151) PREDICTED: segment pol ( 476) 2188 213.1 2e-54
XP_005244790 (OMIM: 180700,601365,616331) PREDICTE ( 549) 1868 184.1 1.2e-45
NP_004412 (OMIM: 180700,601365,616331) segment pol ( 670) 1868 184.2 1.4e-45
>>NP_004414 (OMIM: 601368,616894) segment polarity prote (716 aa)
initn: 4903 init1: 4903 opt: 4903 Z-score: 2428.6 bits: 459.9 E(85289): 1.6e-128
Smith-Waterman score: 4903; 100.0% identity (100.0% similar) in 716 aa overlap (1-716:1-716)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MGETKIIYHLDGQETPYLVKLPLPAERVTLADFKGVLQRPSYKFFFKSMDDDFGVVKEEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 MGETKIIYHLDGQETPYLVKLPLPAERVTLADFKGVLQRPSYKFFFKSMDDDFGVVKEEI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 SDDNAKLPCFNGRVVSWLVSAEGSHPDPAPFCADNPSELPPPMERTGGIGDSRPPSFHPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 SDDNAKLPCFNGRVVSWLVSAEGSHPDPAPFCADNPSELPPPMERTGGIGDSRPPSFHPH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 AGGGSQENLDNDTETDSLVSAQRERPRRRDGPEHATRLNGTAKGERRREPGGYDSSSTLM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 AGGGSQENLDNDTETDSLVSAQRERPRRRDGPEHATRLNGTAKGERRREPGGYDSSSTLM
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 SSELETTSFFDSDEDDSTSRFSSSTEQSSASRLMRRHKRRRRKQKVSRIERSSSFSSITD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 SSELETTSFFDSDEDDSTSRFSSSTEQSSASRLMRRHKRRRRKQKVSRIERSSSFSSITD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 STMSLNIITVTLNMEKYNFLGISIVGQSNERGDGGIYIGSIMKGGAVAADGRIEPGDMLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 STMSLNIITVTLNMEKYNFLGISIVGQSNERGDGGIYIGSIMKGGAVAADGRIEPGDMLL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 QVNEINFENMSNDDAVRVLREIVHKPGPITLTVAKCWDPSPRGCFTLPRSEPIRPIDPAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 QVNEINFENMSNDDAVRVLREIVHKPGPITLTVAKCWDPSPRGCFTLPRSEPIRPIDPAA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 WVSHTAAMTGTFPAYGMSPSLSTITSTSSSITSSIPDTERLDDFHLSIHSDMAAIVKAMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 WVSHTAAMTGTFPAYGMSPSLSTITSTSSSITSSIPDTERLDDFHLSIHSDMAAIVKAMA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 SPESGLEVRDRMWLKITIPNAFIGSDVVDWLYHNVEGFTDRREARKYASNLLKAGFIRHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 SPESGLEVRDRMWLKITIPNAFIGSDVVDWLYHNVEGFTDRREARKYASNLLKAGFIRHT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 VNKITFSEQCYYIFGDLCGNMANLSLHDHDGSSGASDQDTLAPLPHPGAAPWPMAFPYQY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 VNKITFSEQCYYIFGDLCGNMANLSLHDHDGSSGASDQDTLAPLPHPGAAPWPMAFPYQY
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB9 PPPPHPYNPHPGFPELGYSYGGGSASSQHSEGSRSSGSNRSGSDRRKEKDPKAGDSKSGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 PPPPHPYNPHPGFPELGYSYGGGSASSQHSEGSRSSGSNRSGSDRRKEKDPKAGDSKSGG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB9 SGSESDHTTRSSLRGPRERAPSERSGPAASEHSHRSHHSLASSLRSHHTHPSYGPPGVPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 SGSESDHTTRSSLRGPRERAPSERSGPAASEHSHRSHHSLASSLRSHHTHPSYGPPGVPP
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710
pF1KB9 LYGPPMLMMPPPPAAMGPPGAPPGRDLASVPPELTASRQSFRMAMGNPSEFFVDVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 LYGPPMLMMPPPPAAMGPPGAPPGRDLASVPPELTASRQSFRMAMGNPSEFFVDVM
670 680 690 700 710
>>XP_005247229 (OMIM: 601368,616894) PREDICTED: segment (718 aa)
initn: 5023 init1: 4858 opt: 4858 Z-score: 2406.5 bits: 455.8 E(85289): 2.6e-127
Smith-Waterman score: 4858; 99.6% identity (99.9% similar) in 712 aa overlap (1-712:1-712)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MGETKIIYHLDGQETPYLVKLPLPAERVTLADFKGVLQRPSYKFFFKSMDDDFGVVKEEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MGETKIIYHLDGQETPYLVKLPLPAERVTLADFKGVLQRPSYKFFFKSMDDDFGVVKEEI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 SDDNAKLPCFNGRVVSWLVSAEGSHPDPAPFCADNPSELPPPMERTGGIGDSRPPSFHPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SDDNAKLPCFNGRVVSWLVSAEGSHPDPAPFCADNPSELPPPMERTGGIGDSRPPSFHPH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 AGGGSQENLDNDTETDSLVSAQRERPRRRDGPEHATRLNGTAKGERRREPGGYDSSSTLM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 AGGGSQENLDNDTETDSLVSAQRERPRRRDGPEHATRLNGTAKGERRREPGGYDSSSTLM
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 SSELETTSFFDSDEDDSTSRFSSSTEQSSASRLMRRHKRRRRKQKVSRIERSSSFSSITD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SSELETTSFFDSDEDDSTSRFSSSTEQSSASRLMRRHKRRRRKQKVSRIERSSSFSSITD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 STMSLNIITVTLNMEKYNFLGISIVGQSNERGDGGIYIGSIMKGGAVAADGRIEPGDMLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 STMSLNIITVTLNMEKYNFLGISIVGQSNERGDGGIYIGSIMKGGAVAADGRIEPGDMLL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 QVNEINFENMSNDDAVRVLREIVHKPGPITLTVAKCWDPSPRGCFTLPRSEPIRPIDPAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QVNEINFENMSNDDAVRVLREIVHKPGPITLTVAKCWDPSPRGCFTLPRSEPIRPIDPAA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 WVSHTAAMTGTFPAYGMSPSLSTITSTSSSITSSIPDTERLDDFHLSIHSDMAAIVKAMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 WVSHTAAMTGTFPAYGMSPSLSTITSTSSSITSSIPDTERLDDFHLSIHSDMAAIVKAMA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 SPESGLEVRDRMWLKITIPNAFIGSDVVDWLYHNVEGFTDRREARKYASNLLKAGFIRHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SPESGLEVRDRMWLKITIPNAFIGSDVVDWLYHNVEGFTDRREARKYASNLLKAGFIRHT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 VNKITFSEQCYYIFGDLCGNMANLSLHDHDGSSGASDQDTLAPLPHPGAAPWPMAFPYQY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VNKITFSEQCYYIFGDLCGNMANLSLHDHDGSSGASDQDTLAPLPHPGAAPWPMAFPYQY
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB9 PPPPHPYNPHPGFPELGYSYGGGSASSQHSEGSRSSGSNRSGSDRRKEKDPKAGDSKSGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PPPPHPYNPHPGFPELGYSYGGGSASSQHSEGSRSSGSNRSGSDRRKEKDPKAGDSKSGG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB9 SGSESDHTTRSSLRGPRERAPSERSGPAASEHSHRSHHSLASSLRSHHTHPSYGPPGVPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SGSESDHTTRSSLRGPRERAPSERSGPAASEHSHRSHHSLASSLRSHHTHPSYGPPGVPP
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710
pF1KB9 LYGPPMLMMPPPPAAMGPPGAPPGRDLASVPPELTASRQSFRMAMGNPSEFFVDVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.. :
XP_005 LYGPPMLMMPPPPAAMGPPGAPPGRDLASVPPELTASRQSFRMAMGNPTKNFGLFDFL
670 680 690 700 710
>>XP_011510815 (OMIM: 601368,616894) PREDICTED: segment (548 aa)
initn: 3536 init1: 3536 opt: 3538 Z-score: 1760.0 bits: 335.8 E(85289): 2.7e-91
Smith-Waterman score: 3538; 99.2% identity (99.4% similar) in 522 aa overlap (195-716:27-548)
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 ERRREPGGYDSSSTLMSSELETTSFFDSDEDDSTSRFSSSTEQSSASRLMRRHKRRRRKQ
: . :::::::::::::::::::::::::
XP_011 MGFVLGTQALQCLPSWGQGWASLVGNDCGPHRFSSSTEQSSASRLMRRHKRRRRKQ
10 20 30 40 50
230 240 250 260 270 280
pF1KB9 KVSRIERSSSFSSITDSTMSLNIITVTLNMEKYNFLGISIVGQSNERGDGGIYIGSIMKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KVSRIERSSSFSSITDSTMSLNIITVTLNMEKYNFLGISIVGQSNERGDGGIYIGSIMKG
60 70 80 90 100 110
290 300 310 320 330 340
pF1KB9 GAVAADGRIEPGDMLLQVNEINFENMSNDDAVRVLREIVHKPGPITLTVAKCWDPSPRGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GAVAADGRIEPGDMLLQVNEINFENMSNDDAVRVLREIVHKPGPITLTVAKCWDPSPRGC
120 130 140 150 160 170
350 360 370 380 390 400
pF1KB9 FTLPRSEPIRPIDPAAWVSHTAAMTGTFPAYGMSPSLSTITSTSSSITSSIPDTERLDDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FTLPRSEPIRPIDPAAWVSHTAAMTGTFPAYGMSPSLSTITSTSSSITSSIPDTERLDDF
180 190 200 210 220 230
410 420 430 440 450 460
pF1KB9 HLSIHSDMAAIVKAMASPESGLEVRDRMWLKITIPNAFIGSDVVDWLYHNVEGFTDRREA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 HLSIHSDMAAIVKAMASPESGLEVRDRMWLKITIPNAFIGSDVVDWLYHNVEGFTDRREA
240 250 260 270 280 290
470 480 490 500 510 520
pF1KB9 RKYASNLLKAGFIRHTVNKITFSEQCYYIFGDLCGNMANLSLHDHDGSSGASDQDTLAPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RKYASNLLKAGFIRHTVNKITFSEQCYYIFGDLCGNMANLSLHDHDGSSGASDQDTLAPL
300 310 320 330 340 350
530 540 550 560 570 580
pF1KB9 PHPGAAPWPMAFPYQYPPPPHPYNPHPGFPELGYSYGGGSASSQHSEGSRSSGSNRSGSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PHPGAAPWPMAFPYQYPPPPHPYNPHPGFPELGYSYGGGSASSQHSEGSRSSGSNRSGSD
360 370 380 390 400 410
590 600 610 620 630 640
pF1KB9 RRKEKDPKAGDSKSGGSGSESDHTTRSSLRGPRERAPSERSGPAASEHSHRSHHSLASSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RRKEKDPKAGDSKSGGSGSESDHTTRSSLRGPRERAPSERSGPAASEHSHRSHHSLASSL
420 430 440 450 460 470
650 660 670 680 690 700
pF1KB9 RSHHTHPSYGPPGVPPLYGPPMLMMPPPPAAMGPPGAPPGRDLASVPPELTASRQSFRMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RSHHTHPSYGPPGVPPLYGPPMLMMPPPPAAMGPPGAPPGRDLASVPPELTASRQSFRMA
480 490 500 510 520 530
710
pF1KB9 MGNPSEFFVDVM
::::::::::::
XP_011 MGNPSEFFVDVM
540
>>NP_004413 (OMIM: 602151) segment polarity protein dish (736 aa)
initn: 1746 init1: 1138 opt: 3228 Z-score: 1606.2 bits: 307.8 E(85289): 1e-82
Smith-Waterman score: 3228; 69.3% identity (84.2% similar) in 745 aa overlap (1-716:11-736)
10 20 30 40
pF1KB9 MGETKIIYHLDGQETPYLVKLPLPAERVTLADFKGVLQRPS-YKFFFKSM
.::::.::::: .:::::::.:.::::.::.:::.:::::. :.:::::
NP_004 MAGSSTGGGGVGETKVIYHLDEEETPYLVKIPVPAERITLGDFKSVLQRPAGAKYFFKSM
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB9 DDDFGVVKEEISDDNAKLPCFNGRVVSWLVSAEGSHPDPAPFCADNPSELPPPM------
:.::::::::::::::.::::::::::::::... .:. :: . .:: ::
NP_004 DQDFGVVKEEISDDNARLPCFNGRVVSWLVSSDNPQPEMAPPVHEPRAELAPPAPPLPPL
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150
pF1KB9 --ERTGGIGDSRPPSFHPHAGGGSQENLDNDTETDSLVSAQRERPRRRDGPEHAT---RL
:::.::::::::::::.... :.:::. .:::.:.:: .::::::::. ::.. :
NP_004 PPERTSGIGDSRPPSFHPNVSS-SHENLEPETETESVVSLRRERPRRRDSSEHGAGGHRT
130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 NGTAKGERRREPGGYDSSSTLMSSELETTSFFDSDEDDSTSRFSSSTEQSSASRLMRRHK
.: .. ::. .::.::::::.::::.::. ::::.:. :::::::::::::::..::
NP_004 GGPSRLERHL--AGYESSSTLMTSELESTSLGDSDEEDTMSRFSSSTEQSSASRLLKRH-
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 RRRRKQKVSRIERSSSFSSITDSTMSLNIITVTLNMEKYNFLGISIVGQSNERGDGGIYI
::::::. :.::.:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 RRRRKQRPPRLERTSSFSSVTDSTMSLNIITVTLNMEKYNFLGISIVGQSNERGDGGIYI
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 GSIMKGGAVAADGRIEPGDMLLQVNEINFENMSNDDAVRVLREIVHKPGPITLTVAKCWD
:::::::::::::::::::::::::..:::::::::::::::.::::::::.::::::::
NP_004 GSIMKGGAVAADGRIEPGDMLLQVNDMNFENMSNDDAVRVLRDIVHKPGPIVLTVAKCWD
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 PSPRGCFTLPRSEPIRPIDPAAWVSHTAAMTGTFPAYGMSPSLSTITSTSSSITSSIPDT
:::.. :::::.:::.::::::::::.::.::::::: : :.::::: ::.::
NP_004 PSPQAYFTLPRNEPIQPIDPAAWVSHSAALTGTFPAYPGSSSMSTITS-----GSSLPDG
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KB9 ERLDDFHLSIHSDMAAIVKAMASPESGLEVRDRMWLKITIPNAFIGSDVVDWLYHNVEGF
. ::.:.:::...::::.:::::::::::::::::::::.::::::::::.::::
NP_004 --CEGRGLSVHTDMASVTKAMAAPESGLEVRDRMWLKITIPNAFLGSDVVDWLYHHVEGF
420 430 440 450 460
460 470 480 490 500 510
pF1KB9 TDRREARKYASNLLKAGFIRHTVNKITFSEQCYYIFGDLCGN----MANLSLHDHDGSSG
.:::::::::.:::::.::::::::::::::::.:::: :. ..::::.:.:::::
NP_004 PERREARKYASGLLKAGLIRHTVNKITFSEQCYYVFGDLSGGCESYLVNLSLNDNDGSSG
470 480 490 500 510 520
520 530 540 550 560 570
pF1KB9 ASDQDTLAPLPHPGAAPWPM--AFPYQYPPPPHPYNPHPG-FPELG-YSYGGGSASSQHS
::::::::::: ::.:::. .: :::: : :::.:.: . ::. :.:::::::::::
NP_004 ASDQDTLAPLP--GATPWPLLPTFSYQYPAP-HPYSPQPPPYHELSSYTYGGGSASSQHS
530 540 550 560 570 580
580 590 600 610 620
pF1KB9 EGSRSSGSNRS--GSDRRKEKDPKAGDSKSGGSGSESDHTTRS-SLRGPRERAPSERSGP
::::::::.:: :. : . . .: .:::: :::::. ..:. ::: : . . .::
NP_004 EGSRSSGSTRSDGGAGRTGRPEERAPESKSG-SGSESEPSSRGGSLRRGGEASGTSDGGP
590 600 610 620 630 640
630 640 650 660 670 680
pF1KB9 AASEHSHRSHHSLASSLRSHH-THPSYGPPGVPPLYGPPML-MMPPPPA----AMGPPGA
: :. . : .::.: :: :::. :.: :. :::::: :. ::::
NP_004 PPS----RGSTGGAPNLRAHPGLHPYGPPPGMALPYNPMMVVMMPPPPPPVPPAVQPPGA
650 660 670 680 690 700
690 700 710
pF1KB9 PPGRDLASVPPELTASRQSFRMAMGNPSEFFVDVM
:: :::.:::::::::::::.::::::::::::::
NP_004 PPVRDLGSVPPELTASRQSFHMAMGNPSEFFVDVM
710 720 730
>>XP_005256559 (OMIM: 602151) PREDICTED: segment polarit (732 aa)
initn: 1943 init1: 1014 opt: 3212 Z-score: 1598.4 bits: 306.3 E(85289): 2.7e-82
Smith-Waterman score: 3212; 69.3% identity (84.1% similar) in 742 aa overlap (1-716:11-732)
10 20 30 40
pF1KB9 MGETKIIYHLDGQETPYLVKLPLPAERVTLADFKGVLQRPS-YKFFFKSM
.::::.::::: .:::::::.:.::::.::.:::.:::::. :.:::::
XP_005 MAGSSTGGGGVGETKVIYHLDEEETPYLVKIPVPAERITLGDFKSVLQRPAGAKYFFKSM
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB9 DDDFGVVKEEISDDNAKLPCFNGRVVSWLVSAEGSHPDPAPFCADNPSELPPPM------
:.::::::::::::::.::::::::::::::... .:. :: . .:: ::
XP_005 DQDFGVVKEEISDDNARLPCFNGRVVSWLVSSDNPQPEMAPPVHEPRAELAPPAPPLPPL
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB9 --ERTGGIGDSRPPSFHPHAGGGSQENLDNDTETDSLVSAQRERPRRRDGPEHATRLNGT
:::.::::::::::::.... :.:::. .:::.:.:: .::::::::. . : .:
XP_005 PPERTSGIGDSRPPSFHPNVSS-SHENLEPETETESVVSLRRERPRRRDST-GGHRTGGP
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 AKGERRREPGGYDSSSTLMSSELETTSFFDSDEDDSTSRFSSSTEQSSASRLMRRHKRRR
.. ::. .::.::::::.::::.::. ::::.:. :::::::::::::::..:: :::
XP_005 SRLERHL--AGYESSSTLMTSELESTSLGDSDEEDTMSRFSSSTEQSSASRLLKRH-RRR
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB9 RKQKVSRIERSSSFSSITDSTMSLNIITVTLNMEKYNFLGISIVGQSNERGDGGIYIGSI
:::. :.::.:::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RKQRPPRLERTSSFSSVTDSTMSLNIITVTLNMEKYNFLGISIVGQSNERGDGGIYIGSI
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB9 MKGGAVAADGRIEPGDMLLQVNEINFENMSNDDAVRVLREIVHKPGPITLTVAKCWDPSP
::::::::::::::::::::::..:::::::::::::::.::::::::.:::::::::::
XP_005 MKGGAVAADGRIEPGDMLLQVNDMNFENMSNDDAVRVLRDIVHKPGPIVLTVAKCWDPSP
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB9 RGCFTLPRSEPIRPIDPAAWVSHTAAMTGTFPAYGMSPSLSTITSTSSSITSSIPDTERL
.. :::::.:::.::::::::::.::.::::::: : :.::::: ::.::
XP_005 QAYFTLPRNEPIQPIDPAAWVSHSAALTGTFPAYPGSSSMSTITS-----GSSLPDG--C
360 370 380 390 400
410 420 430 440 450 460
pF1KB9 DDFHLSIHSDMAAIVKAMASPESGLEVRDRMWLKITIPNAFIGSDVVDWLYHNVEGFTDR
. ::.:.:::...::::.:::::::::::::::::::::.::::::::::.:::: .:
XP_005 EGRGLSVHTDMASVTKAMAAPESGLEVRDRMWLKITIPNAFLGSDVVDWLYHHVEGFPER
410 420 430 440 450 460
470 480 490 500 510
pF1KB9 REARKYASNLLKAGFIRHTVNKITFSEQCYYIFGDLCGN----MANLSLHDHDGSSGASD
::::::::.:::::.::::::::::::::::.:::: :. ..::::.:.::::::::
XP_005 REARKYASGLLKAGLIRHTVNKITFSEQCYYVFGDLSGGCESYLVNLSLNDNDGSSGASD
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pF1KB9 QDTLAPLPHPGAAPWPM--AFPYQYPPPPHPYNPHPG-FPELG-YSYGGGSASSQHSEGS
:::::::: ::.:::. .: :::: : :::.:.: . ::. :.::::::::::::::
XP_005 QDTLAPLP--GATPWPLLPTFSYQYPAP-HPYSPQPPPYHELSSYTYGGGSASSQHSEGS
530 540 550 560 570 580
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pF1KB9 RSSGSNRS--GSDRRKEKDPKAGDSKSGGSGSESDHTTRS-SLRGPRERAPSERSGPAAS
:::::.:: :. : . . .: .:::: :::::. ..:. ::: : . . .:: :
XP_005 RSSGSTRSDGGAGRTGRPEERAPESKSG-SGSESEPSSRGGSLRRGGEASGTSDGGPPPS
590 600 610 620 630 640
640 650 660 670 680
pF1KB9 EHSHRSHHSLASSLRSHH-THPSYGPPGVPPLYGPPML-MMPPPPA----AMGPPGAPPG
:. . : .::.: :: :::. :.: :. :::::: :. ::::::
XP_005 ----RGSTGGAPNLRAHPGLHPYGPPPGMALPYNPMMVVMMPPPPPPVPPAVQPPGAPPV
650 660 670 680 690 700
690 700 710
pF1KB9 RDLASVPPELTASRQSFRMAMGNPSEFFVDVM
:::.:::::::::::::.::::::::::::::
XP_005 RDLGSVPPELTASRQSFHMAMGNPSEFFVDVM
710 720 730
>>NP_001317240 (OMIM: 180700,601365,616331) segment pola (695 aa)
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10 20 30 40 50
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:.:::::::.: .:::::::::. :::::::::.::. :: .:::::::::.::::::
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pF1KB9 EEISDDNAKLPCFNGRVVSWLVSAEGSHPDPAPFCADNPSELPPPMERTGGIGDSRPPSF
::: :::::::::::::::::: :::.: : . .:. ..::::.::::::::::::::
NP_001 EEIFDDNAKLPCFNGRVVSWLVLAEGAHSDAGSQGTDSHTDLPPPLERTGGIGDSRPPSF
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pF1KB9 HPHAGGGSQENLDNDTETDSLVSAQRERPRRRDGPEHATRLNGTAKGERRREPG-GYDSS
::.... :....::.: :.:.:: .::: :::. :.:.: :: .:.:::. : ::.
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:: .:::::..:: ::::: ::::.:::::::..:::.:.::::::::.. . .:.::::
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180 190 200 210 220 230
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:::::::::::.:::::::...:::::::::::.::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SITDSTMSLNIVTVTLNMERHHFLGISIVGQSNDRGDGGIYIGSIMKGGAVAADGRIEPG
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:::::::..:::::::::::::::::: . :::.:::::::::.::. ::.::..:.:::
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pF1KB9 DPAAWVSHTAAMTGTFPAYGMSPSLSTITSTSSS-ITSSIPDTERLDDFHLSIHSDMAAI
:::::.:::::.::..: :: :: :..: :::: .:::.: . .:.. :...:::.:.
NP_001 DPAAWLSHTAALTGALPRYGTSPCSSAVTRTSSSSLTSSVPGAPQLEEAPLTVKSDMSAV
360 370 380 390 400 410
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pF1KB9 VKAMASPESGLEVRDRMWLKITIPNAFIGSDVVDWLYHNVEGFTDRREARKYASNLLKAG
:..: :.::::.:::::::::: :: ::.::::::: .:::: .:::::::::.::: :
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pF1KB9 FIRHTVNKITFSEQCYYIFGDLCGNMANLSLHDHDGSSGASDQDTLAPLPHPGAAPWPMA
:.:::::::::::::::.:::::.:.:.:.:.. ::::.:::::::::::: :::::..
NP_001 FLRHTVNKITFSEQCYYVFGDLCSNLATLNLNS--GSSGTSDQDTLAPLPHP-AAPWPLG
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pF1KB9 --FPYQYPPPPHPYNPHPGFPELGYSYGGGSASSQHSEGSRSSGSNRSGSDRR---KEKD
.::::: :: : : :.. . :.:::.::..::.::::.::::.:: .:: .::.
NP_001 QGYPYQYPGPP-PCFP-PAYQDPGFSYGSGSTGSQQSEGSKSSGSTRS--SRRAPGREKE
540 550 560 570 580 590
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pF1KB9 PKAGDSKSGGSGSESDHTTRSSLRGPRERAPSERSGPAASEHSHRSHHSLASSLRSHHTH
.:. .:::::::::: .: . : : ::. . : .:: ::.
NP_001 RRAAG--AGGSGSESDHT------APSGVGSSWRERPAG-------QLSRGSSPRSQ---
600 610 620 630
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pF1KB9 PSYGPPGVPPLYGPPMLMMPPPPAAMGPPGAPPGRDLASVPPELTASRQSFRMAMGNPSE
: ::.:: : .. ::::.:: :.::.::::::.:::::. ::::: :
NP_001 ASATAPGLPP----PHPTTKAYTVVGGPPGGPPVRELAAVPPELTGSRQSFQKAMGNPCE
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pF1KB9 FFVDVM
::::.:
NP_001 FFVDIM
690
>>XP_005244789 (OMIM: 180700,601365,616331) PREDICTED: s (574 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KB9 MGETKIIYHLDGQETPYLVKLPLPAERVTLADFKGVLQ-RP--SYKFFFKSMDDDFGVVK
:.:::::::.: .:::::::::. :::::::::.::. :: .:::::::::.::::::
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::: :::::::::::::::::: :::.: : . .:. ..::::.::::::::::::::
XP_005 EEIFDDNAKLPCFNGRVVSWLVLAEGAHSDAGSQGTDSHTDLPPPLERTGGIGDSRPPSF
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pF1KB9 HPHAGGGSQENLDNDTETDSLVSAQRERPRRRDGPEHATRLNGTAKGERRREPG-GYDSS
::.... :....::.: :.:.:: .::: :::. :.:.: :: .:.:::. : ::.
XP_005 HPNVAS-SRDGMDNETGTESMVSHRRERARRRNR-EEAARTNGHPRGDRRRDVGLPPDSA
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pF1KB9 STLMSSELETTSFFDSDEDDSTSRFSSSTEQSSASRLMRRHKRRRRKQKVSRIERSSSFS
:: .:::::..:: ::::: ::::.:::::::..:::.:.::::::::.. . .:.::::
XP_005 STALSSELESSSFVDSDEDGSTSRLSSSTEQSTSSRLIRKHKRRRRKQRLRQADRASSFS
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:::::::::::.:::::::...:::::::::::.::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SITDSTMSLNIVTVTLNMERHHFLGISIVGQSNDRGDGGIYIGSIMKGGAVAADGRIEPG
240 250 260 270 280 290
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pF1KB9 DMLLQVNEINFENMSNDDAVRVLREIVHKPGPITLTVAKCWDPSPRGCFTLPRSEPIRPI
:::::::..:::::::::::::::::: . :::.:::::::::.::. ::.::..:.:::
XP_005 DMLLQVNDVNFENMSNDDAVRVLREIVSQTGPISLTVAKCWDPTPRSYFTVPRADPVRPI
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pF1KB9 DPAAWVSHTAAMTGTFPAYGMSPSLSTITSTSSS-ITSSIPDTERLDDFHLSIHSDMAAI
:::::.:::::.::..: :: :: :..: :::: .:::.: . .:.. :...:::.:.
XP_005 DPAAWLSHTAALTGALPRYGTSPCSSAVTRTSSSSLTSSVPGAPQLEEAPLTVKSDMSAV
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pF1KB9 VKAMASPESGLEVRDRMWLKITIPNAFIGSDVVDWLYHNVEGFTDRREARKYASNLLKAG
:..: :.::::.:::::::::: :: ::.::::::: .:::: .:::::::::.::: :
XP_005 VRVMQLPDSGLEIRDRMWLKITIANAVIGADVVDWLYTHVEGFKERREARKYASSLLKHG
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pF1KB9 FIRHTVNKITFSEQCYYIFGDLCGNMANLSLHDHDGSSGASDQDTLAPLPHPGAAPWPMA
:.:::::::::::::::.:::::.:.:.:.:.. ::::.:::::::::::: :::::..
XP_005 FLRHTVNKITFSEQCYYVFGDLCSNLATLNLNS--GSSGTSDQDTLAPLPHP-AAPWPLG
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pF1KB9 --FPYQYPPPPHPYNPHPGFPELGYSYGGGSASSQHSEGSRSSGSNRSGSDRRKEKDPKA
.::::: :: : : :.. . :.:::.::..::.::
XP_005 QGYPYQYPGPP-PCFP-PAYQDPGFSYGSGSTGSQQSEALD
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pF1KB9 GDSKSGGSGSESDHTTRSSLRGPRERAPSERSGPAASEHSHRSHHSLASSLRSHHTHPSY
>>XP_016879787 (OMIM: 602151) PREDICTED: segment polarit (476 aa)
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pF1KB9 LMRRHKRRRRKQKVSRIERSSSFSSITDSTMSLNIITVTLNMEKYNFLGISIVGQSNERG
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MSLNIITVTLNMEKYNFLGISIVGQSNERG
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pF1KB9 DGGIYIGSIMKGGAVAADGRIEPGDMLLQVNEINFENMSNDDAVRVLREIVHKPGPITLT
:::::::::::::::::::::::::::::::..:::::::::::::::.::::::::.::
XP_016 DGGIYIGSIMKGGAVAADGRIEPGDMLLQVNDMNFENMSNDDAVRVLRDIVHKPGPIVLT
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pF1KB9 VAKCWDPSPRGCFTLPRSEPIRPIDPAAWVSHTAAMTGTFPAYGMSPSLSTITSTSSSIT
:::::::::.. :::::.:::.::::::::::.::.::::::: : :.::::: ::
XP_016 VAKCWDPSPQAYFTLPRNEPIQPIDPAAWVSHSAALTGTFPAYPGSSSMSTITSGSS---
100 110 120 130 140
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pF1KB9 SSIPDTERLDDFHLSIHSDMAAIVKAMASPESGLEVRDRMWLKITIPNAFIGSDVVDWLY
.:: . ::.:.:::...::::.:::::::::::::::::::::.:::::::::
XP_016 --LPDG--CEGRGLSVHTDMASVTKAMAAPESGLEVRDRMWLKITIPNAFLGSDVVDWLY
150 160 170 180 190 200
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pF1KB9 HNVEGFTDRREARKYASNLLKAGFIRHTVNKITFSEQCYYIFGDLCGN----MANLSLHD
:.:::: .:::::::::.:::::.::::::::::::::::.:::: :. ..::::.:
XP_016 HHVEGFPERREARKYASGLLKAGLIRHTVNKITFSEQCYYVFGDLSGGCESYLVNLSLND
210 220 230 240 250 260
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pF1KB9 HDGSSGASDQDTLAPLPHPGAAPWPM--AFPYQYPPPPHPYNPHPG-FPELG-YSYGGGS
.::::::::::::::: :::.:::. .: :::: : :::.:.: . ::. :.:::::
XP_016 NDGSSGASDQDTLAPL--PGATPWPLLPTFSYQYPAP-HPYSPQPPPYHELSSYTYGGGS
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pF1KB9 ASSQHSEGSRSSGSNRS--GSDRRKEKDPKAGDSKSGGSGSESDHTTRS-SLRGPRERAP
::::::::::::::.:: :. : . . .: .:::: :::::. ..:. ::: : .
XP_016 ASSQHSEGSRSSGSTRSDGGAGRTGRPEERAPESKSG-SGSESEPSSRGGSLRRGGEASG
330 340 350 360 370
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pF1KB9 SERSGPAASEHSHRSHHSLASSLRSHH-THPSYGPPGVPPLYGPPML-MMPPPPA----A
. .:: : :. . : .::.: :: :::. :.: :. :::::: :
XP_016 TSDGGPPPS----RGSTGGAPNLRAHPGLHPYGPPPGMALPYNPMMVVMMPPPPPPVPPA
380 390 400 410 420 430
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pF1KB9 MGPPGAPPGRDLASVPPELTASRQSFRMAMGNPSEFFVDVM
. :::::: :::.:::::::::::::.::::::::::::::
XP_016 VQPPGAPPVRDLGSVPPELTASRQSFHMAMGNPSEFFVDVM
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>>XP_005244790 (OMIM: 180700,601365,616331) PREDICTED: s (549 aa)
initn: 2498 init1: 1186 opt: 1868 Z-score: 940.2 bits: 184.1 E(85289): 1.2e-45
Smith-Waterman score: 2581; 68.3% identity (86.0% similar) in 577 aa overlap (1-571:1-546)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MGETKIIYHLDGQETPYLVKLPLPAERVTLADFKGVLQ-RP--SYKFFFKSMDDDFGVVK
:.:::::::.: .:::::::::. :::::::::.::. :: .:::::::::.::::::
XP_005 MAETKIIYHMDEEETPYLVKLPVAPERVTLADFKNVLSNRPVHAYKFFFKSMDQDFGVVK
10 20 30 40 50 60
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pF1KB9 EEISDDNAKLPCFNGRVVSWLVSAEGSHPDPAPFCADNPSELPPPMERTGGIGDSRPPSF
::: :::::::::::::::::: :::.: : . .:. ..::::.::::::::::::::
XP_005 EEIFDDNAKLPCFNGRVVSWLVLAEGAHSDAGSQGTDSHTDLPPPLERTGGIGDSRPPSF
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 HPHAGGGSQENLDNDTETDSLVSAQRERPRRRDGPEHATRLNGTAKGERRREPG-GYDSS
::.... :....::.: :.:.:: .::: :::. :.:.: :: .:.:::. : ::.
XP_005 HPNVAS-SRDGMDNETGTESMVSHRRERARRRNR-EEAARTNGHPRGDRRRDVGLPPDSA
130 140 150 160 170
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pF1KB9 STLMSSELETTSFFDSDEDDSTSRFSSSTEQSSASRLMRRHKRRRRKQKVSRIERSSSFS
:: .:::::..:: ::::: ::::.:::::::..:::.:.::::::::.. . .:.::::
XP_005 STALSSELESSSFVDSDEDGSTSRLSSSTEQSTSSRLIRKHKRRRRKQRLRQADRASSFS
180 190 200 210 220 230
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pF1KB9 SITDSTMSLNIITVTLNMEKYNFLGISIVGQSNERGDGGIYIGSIMKGGAVAADGRIEPG
:::::::::::.:::::::...:::::::::::.::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SITDSTMSLNIVTVTLNMERHHFLGISIVGQSNDRGDGGIYIGSIMKGGAVAADGRIEPG
240 250 260 270 280 290
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pF1KB9 DMLLQVNEINFENMSNDDAVRVLREIVHKPGPITLTVAKCWDPSPRGCFTLPRSEPIRPI
:::::::..:::::::::::::::::: . :::.:::::::::.::. ::.::..:.:::
XP_005 DMLLQVNDVNFENMSNDDAVRVLREIVSQTGPISLTVAKCWDPTPRSYFTVPRADPVRPI
300 310 320 330 340 350
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pF1KB9 DPAAWVSHTAAMTGTFPAYGMSPSLSTITSTSSSITSSIPDTERLDDFHLSIHSDMAAIV
:::::.:::::.::..: : .:.. :...:::.:.:
XP_005 DPAAWLSHTAALTGALPRY------------------------ELEEAPLTVKSDMSAVV
360 370 380 390
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pF1KB9 KAMASPESGLEVRDRMWLKITIPNAFIGSDVVDWLYHNVEGFTDRREARKYASNLLKAGF
..: :.::::.:::::::::: :: ::.::::::: .:::: .:::::::::.::: ::
XP_005 RVMQLPDSGLEIRDRMWLKITIANAVIGADVVDWLYTHVEGFKERREARKYASSLLKHGF
400 410 420 430 440 450
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pF1KB9 IRHTVNKITFSEQCYYIFGDLCGNMANLSLHDHDGSSGASDQDTLAPLPHPGAAPWPMA-
.:::::::::::::::.:::::.:.:.:.:.. ::::.:::::::::::: :::::..
XP_005 LRHTVNKITFSEQCYYVFGDLCSNLATLNLNS--GSSGTSDQDTLAPLPHP-AAPWPLGQ
460 470 480 490 500 510
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pF1KB9 -FPYQYPPPPHPYNPHPGFPELGYSYGGGSASSQHSEGSRSSGSNRSGSDRRKEKDPKAG
.::::: :: : : :.. . :.:::.::..::.::
XP_005 GYPYQYPGPP-PCFP-PAYQDPGFSYGSGSTGSQQSEALD
520 530 540
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