Result of FASTA (ccds) for
pF1KB9777
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9777, 788 aa
1>>>pF1KB9777 788 - 788 aa - 788 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.6206+/-0.00105; mu= 5.1845+/- 0.064
mean_var=176.6067+/-36.342, 0's: 0 Z-trim(109.9): 82 B-trim: 83 in 1/50
Lambda= 0.096510
statistics sampled from 11145 (11227) to 11145 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.692), E-opt: 0.2 (0.345), width: 16
Scan time: 2.800
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32301.2 TBC1D2B gene_id:23102|Hs108|chr15 ( 914) 5244 743.1 4.8e-214
CCDS45314.1 TBC1D2B gene_id:23102|Hs108|chr15 ( 963) 5132 727.5 2.5e-209
CCDS75865.1 TBC1D2 gene_id:55357|Hs108|chr9 ( 928) 1600 235.7 2.7e-61
CCDS35080.1 TBC1D2 gene_id:55357|Hs108|chr9 ( 917) 1424 211.2 6.3e-54
CCDS59137.1 TBC1D2 gene_id:55357|Hs108|chr9 ( 468) 1344 199.9 8.1e-51
CCDS14002.1 SGSM3 gene_id:27352|Hs108|chr22 ( 749) 682 107.8 6.7e-23
CCDS14522.1 TBC1D8B gene_id:54885|Hs108|chrX (1120) 516 84.8 8.4e-16
CCDS47136.1 TBC1D9 gene_id:23158|Hs108|chr4 (1266) 516 84.8 9.3e-16
CCDS46375.1 TBC1D8 gene_id:11138|Hs108|chr2 (1140) 508 83.7 1.9e-15
CCDS82486.1 TBC1D8 gene_id:11138|Hs108|chr2 (1155) 508 83.7 1.9e-15
CCDS9534.2 GRTP1 gene_id:79774|Hs108|chr13 ( 336) 490 80.9 3.8e-15
CCDS66591.1 GRTP1 gene_id:79774|Hs108|chr13 ( 344) 490 80.9 3.9e-15
CCDS4450.1 TBC1D9B gene_id:23061|Hs108|chr5 (1233) 476 79.3 4.3e-14
CCDS43408.1 TBC1D9B gene_id:23061|Hs108|chr5 (1250) 476 79.3 4.4e-14
CCDS8162.1 TBC1D10C gene_id:374403|Hs108|chr11 ( 446) 447 75.0 3.1e-13
CCDS10676.2 TBC1D10B gene_id:26000|Hs108|chr16 ( 808) 438 73.9 1.2e-12
CCDS13874.1 TBC1D10A gene_id:83874|Hs108|chr22 ( 508) 411 70.0 1.1e-11
CCDS56227.1 TBC1D10A gene_id:83874|Hs108|chr22 ( 515) 411 70.0 1.1e-11
>>CCDS32301.2 TBC1D2B gene_id:23102|Hs108|chr15 (914 aa)
initn: 5244 init1: 5244 opt: 5244 Z-score: 3956.2 bits: 743.1 E(32554): 4.8e-214
Smith-Waterman score: 5244; 100.0% identity (100.0% similar) in 788 aa overlap (1-788:127-914)
10 20 30
pF1KB9 MTYWLQELQQKRWEYCNSLDMVKWDSRTSP
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 AAEPGTEPPAHFQVHSAGAVTVLKAPNRQLMTYWLQELQQKRWEYCNSLDMVKWDSRTSP
100 110 120 130 140 150
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 TPGDFPKGLVARDNTDLIYPHPNASAEKARNVLAVETVPGELVGEQAANQPAPGHPNSIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TPGDFPKGLVARDNTDLIYPHPNASAEKARNVLAVETVPGELVGEQAANQPAPGHPNSIN
160 170 180 190 200 210
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 FYSLKQWGNELKNSMSSFRPGRGHNDSRRTVFYTNEEWELLDPTPKDLEESIVQEEKKKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 FYSLKQWGNELKNSMSSFRPGRGHNDSRRTVFYTNEEWELLDPTPKDLEESIVQEEKKKL
220 230 240 250 260 270
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 TPEGNKGVTGSGFPFDFGRNPYKGKRPLKDIIGSYKNRHSSGDPSSEGTSGSGSVSIRKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TPEGNKGVTGSGFPFDFGRNPYKGKRPLKDIIGSYKNRHSSGDPSSEGTSGSGSVSIRKP
280 290 300 310 320 330
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 ASEMQLQVQSQQEELEQLKKDLSSQKELVRLLQQTVRSSQYDKYFTSSRLCEGVPKDTLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ASEMQLQVQSQQEELEQLKKDLSSQKELVRLLQQTVRSSQYDKYFTSSRLCEGVPKDTLE
340 350 360 370 380 390
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 LLHQKDDQILGLTSQLERFSLEKESLQQEVRTLKSKVGELNEQLGMLMETIQAKDEVIIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LLHQKDDQILGLTSQLERFSLEKESLQQEVRTLKSKVGELNEQLGMLMETIQAKDEVIIK
400 410 420 430 440 450
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 LSEGEGNGPPPTVAPSSPSVVPVARDQLELDRLKDNLQGYKTQNKFLNKEILELSALRRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LSEGEGNGPPPTVAPSSPSVVPVARDQLELDRLKDNLQGYKTQNKFLNKEILELSALRRN
460 470 480 490 500 510
400 410 420 430 440 450
pF1KB9 AERRERDLMAKYSSLEAKLCQIESKYLILLQEMKTPVCSEDQGPTREVIAQLLEDALQVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 AERRERDLMAKYSSLEAKLCQIESKYLILLQEMKTPVCSEDQGPTREVIAQLLEDALQVE
520 530 540 550 560 570
460 470 480 490 500 510
pF1KB9 SQEQPEQAFVKPHLVSEYDIYGFRTVPEDDEEEKLVAKVRALDLKTLYLTENQEVSTGVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SQEQPEQAFVKPHLVSEYDIYGFRTVPEDDEEEKLVAKVRALDLKTLYLTENQEVSTGVK
580 590 600 610 620 630
520 530 540 550 560 570
pF1KB9 WENYFASTVNREMMCSPELKNLIRAGIPHEHRSKVWKWCVDRHTRKFKDNTEPGHFQTLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 WENYFASTVNREMMCSPELKNLIRAGIPHEHRSKVWKWCVDRHTRKFKDNTEPGHFQTLL
640 650 660 670 680 690
580 590 600 610 620 630
pF1KB9 QKALEKQNPASKQIELDLLRTLPNNKHYSCPTSEGIQKLRNVLLAFSWRNPDIGYCQGLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QKALEKQNPASKQIELDLLRTLPNNKHYSCPTSEGIQKLRNVLLAFSWRNPDIGYCQGLN
700 710 720 730 740 750
640 650 660 670 680 690
pF1KB9 RLVAVALLYLEQEDAFWCLVTIVEVFMPRDYYTKTLLGSQVDQRVFRDLMSEKLPRLHGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RLVAVALLYLEQEDAFWCLVTIVEVFMPRDYYTKTLLGSQVDQRVFRDLMSEKLPRLHGH
760 770 780 790 800 810
700 710 720 730 740 750
pF1KB9 FEQYKVDYTLITFNWFLVVFVDSVVSDILFKIWDSFLYEGPKVIFRFALALFKYKEEEIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 FEQYKVDYTLITFNWFLVVFVDSVVSDILFKIWDSFLYEGPKVIFRFALALFKYKEEEIL
820 830 840 850 860 870
760 770 780
pF1KB9 KLQDSMSIFKYLRYFTRTILDARSGTDAPTTWRKSGWS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KLQDSMSIFKYLRYFTRTILDARSGTDAPTTWRKSGWS
880 890 900 910
>>CCDS45314.1 TBC1D2B gene_id:23102|Hs108|chr15 (963 aa)
initn: 5132 init1: 5132 opt: 5132 Z-score: 3871.6 bits: 727.5 E(32554): 2.5e-209
Smith-Waterman score: 5132; 100.0% identity (100.0% similar) in 773 aa overlap (1-773:127-899)
10 20 30
pF1KB9 MTYWLQELQQKRWEYCNSLDMVKWDSRTSP
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 AAEPGTEPPAHFQVHSAGAVTVLKAPNRQLMTYWLQELQQKRWEYCNSLDMVKWDSRTSP
100 110 120 130 140 150
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 TPGDFPKGLVARDNTDLIYPHPNASAEKARNVLAVETVPGELVGEQAANQPAPGHPNSIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TPGDFPKGLVARDNTDLIYPHPNASAEKARNVLAVETVPGELVGEQAANQPAPGHPNSIN
160 170 180 190 200 210
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 FYSLKQWGNELKNSMSSFRPGRGHNDSRRTVFYTNEEWELLDPTPKDLEESIVQEEKKKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 FYSLKQWGNELKNSMSSFRPGRGHNDSRRTVFYTNEEWELLDPTPKDLEESIVQEEKKKL
220 230 240 250 260 270
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 TPEGNKGVTGSGFPFDFGRNPYKGKRPLKDIIGSYKNRHSSGDPSSEGTSGSGSVSIRKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TPEGNKGVTGSGFPFDFGRNPYKGKRPLKDIIGSYKNRHSSGDPSSEGTSGSGSVSIRKP
280 290 300 310 320 330
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 ASEMQLQVQSQQEELEQLKKDLSSQKELVRLLQQTVRSSQYDKYFTSSRLCEGVPKDTLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ASEMQLQVQSQQEELEQLKKDLSSQKELVRLLQQTVRSSQYDKYFTSSRLCEGVPKDTLE
340 350 360 370 380 390
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 LLHQKDDQILGLTSQLERFSLEKESLQQEVRTLKSKVGELNEQLGMLMETIQAKDEVIIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LLHQKDDQILGLTSQLERFSLEKESLQQEVRTLKSKVGELNEQLGMLMETIQAKDEVIIK
400 410 420 430 440 450
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 LSEGEGNGPPPTVAPSSPSVVPVARDQLELDRLKDNLQGYKTQNKFLNKEILELSALRRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LSEGEGNGPPPTVAPSSPSVVPVARDQLELDRLKDNLQGYKTQNKFLNKEILELSALRRN
460 470 480 490 500 510
400 410 420 430 440 450
pF1KB9 AERRERDLMAKYSSLEAKLCQIESKYLILLQEMKTPVCSEDQGPTREVIAQLLEDALQVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 AERRERDLMAKYSSLEAKLCQIESKYLILLQEMKTPVCSEDQGPTREVIAQLLEDALQVE
520 530 540 550 560 570
460 470 480 490 500 510
pF1KB9 SQEQPEQAFVKPHLVSEYDIYGFRTVPEDDEEEKLVAKVRALDLKTLYLTENQEVSTGVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SQEQPEQAFVKPHLVSEYDIYGFRTVPEDDEEEKLVAKVRALDLKTLYLTENQEVSTGVK
580 590 600 610 620 630
520 530 540 550 560 570
pF1KB9 WENYFASTVNREMMCSPELKNLIRAGIPHEHRSKVWKWCVDRHTRKFKDNTEPGHFQTLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 WENYFASTVNREMMCSPELKNLIRAGIPHEHRSKVWKWCVDRHTRKFKDNTEPGHFQTLL
640 650 660 670 680 690
580 590 600 610 620 630
pF1KB9 QKALEKQNPASKQIELDLLRTLPNNKHYSCPTSEGIQKLRNVLLAFSWRNPDIGYCQGLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QKALEKQNPASKQIELDLLRTLPNNKHYSCPTSEGIQKLRNVLLAFSWRNPDIGYCQGLN
700 710 720 730 740 750
640 650 660 670 680 690
pF1KB9 RLVAVALLYLEQEDAFWCLVTIVEVFMPRDYYTKTLLGSQVDQRVFRDLMSEKLPRLHGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 RLVAVALLYLEQEDAFWCLVTIVEVFMPRDYYTKTLLGSQVDQRVFRDLMSEKLPRLHGH
760 770 780 790 800 810
700 710 720 730 740 750
pF1KB9 FEQYKVDYTLITFNWFLVVFVDSVVSDILFKIWDSFLYEGPKVIFRFALALFKYKEEEIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 FEQYKVDYTLITFNWFLVVFVDSVVSDILFKIWDSFLYEGPKVIFRFALALFKYKEEEIL
820 830 840 850 860 870
760 770 780
pF1KB9 KLQDSMSIFKYLRYFTRTILDARSGTDAPTTWRKSGWS
:::::::::::::::::::::::
CCDS45 KLQDSMSIFKYLRYFTRTILDARKLISISFGDLNPFPLRQIRNRRAYHLEKVRLELTELE
880 890 900 910 920 930
>>CCDS75865.1 TBC1D2 gene_id:55357|Hs108|chr9 (928 aa)
initn: 1645 init1: 609 opt: 1600 Z-score: 1214.0 bits: 235.7 E(32554): 2.7e-61
Smith-Waterman score: 1754; 40.9% identity (69.4% similar) in 784 aa overlap (1-773:130-860)
10 20 30
pF1KB9 MTYWLQELQQKRWEYCNSLDMVKWDSRTSP
: ::::.::.::::. :: :
CCDS75 FDCKADAEEGIFEIKTPSRVITLKAATKQAMLYWLQQLQMKRWEFHNS----------PP
100 110 120 130 140
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 TPGDFPKGLVARDNTDLIYPHPNASAEKARNVLAVETVPGELVGEQAANQPAPGHPNSIN
.: : . .: .. : . :: . . :.: :: ::: :: :: :. :
CCDS75 APPATPDAALAGNGPVLHLELGQEEAELEEFLCPVKTPPG-LVGVAAALQPFPALQN---
150 160 170 180 190 200
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 FYSLKQWGNELKNSMSSFRPGRGHNDSRRTVFYTNEEWELLDPTPKDLEESIVQEEKKKL
:::. :.:..:.: .. ::..... : .: .: .: : ...
CCDS75 -ISLKHLGTEIQNTMHNI---RGNKQAQGTGH---------EPPGEDSPQS--GEPQREE
210 220 230 240 250
160 170 180 190 200
pF1KB9 TPEGNKGVTGSGFPFDFGRNPYKGKRPLKDIIGSYK-NRHSSGDPS-SEGTSGSGSVSIR
: .. . : . : : .: . .: : . : .:... : ::: ..
CCDS75 QPLASDASTPGREPED---SPKPAPKPSLTISFAQKAKRQNNTFPFFSEG------ITRN
260 270 280 290 300
210 220 230 240 250 260
pF1KB9 KPASEMQLQVQSQQEELEQLKKDLSSQKELVRLLQQTVRSSQYDKYFTSSRLCEGVPKDT
. :.: .: . .... .: :.:.::::::..:.......: .: .:. : . ::
CCDS75 RTAQE---KVAALEQQVLMLTKELKSQKELVKILHKALEAAQQEKRASSAYLAAAEDKDR
310 320 330 340 350
270 280 290 300 310 320
pF1KB9 LELLHQKDDQILGLTSQLERFSLEKESLQQEVRTLKSKVGELNEQLGMLMETIQAKDEVI
:::...: :: : ..: . :.::: . . ...: ::.... .::. .::..::
CCDS75 LELVRHKVRQIAELGRRVEALEQERESLAHTASLREQQVQELQQHVQLLMDKNHAKQQVI
360 370 380 390 400 410
330 340 350 360 370 380
pF1KB9 IKLSEG--EGNGPPPTVAPSSPSVVPVARD----QLELDRLKDNLQGYKTQNKFLNKEIL
:::: . :: .: :.. . :: : ....:::....:.::: :::.::
CCDS75 CKLSEKVTQDFTHPPDQSPLRPDA--ANRDFLSQQGKIEHLKDDMEAYRTQNCFLNSEIH
420 430 440 450 460 470
390 400 410 420 430 440
pF1KB9 ELSALRRNAERRERDLMAKYSSLEAKLCQIESKYLILLQEMKTPVCSEDQGPTREVIAQL
... . :.. ..:. :..: . :.:. ::.::::: :.... . ... . :.. ::
CCDS75 QVTKIWRKVAEKEKALLTKCAYLQARNCQVESKYLAGLRRLQEAL-GDEASECSELLRQL
480 490 500 510 520 530
450 460 470 480 490 500
pF1KB9 LEDALQVESQEQPEQAF-VKPHLVSEYDIYGFRTVPEDDEEE-KLVAKVRALDLKTLYLT
...::: :. : ... ..: .:.:: ::: :::. . :. ::.::..::. .. .:
CCDS75 VQEALQWEAGEASSDSIELSP--ISKYDEYGFLTVPDYEVEDLKLLAKIQALESRSHHLL
540 550 560 570 580 590
510 520 530 540 550 560
pF1KB9 ENQEVSTGVKWENYFASTVNREMMCSPELKNLIRAGIPHEHRSKVWKWCVDRHTRKFKDN
. :. .. : . : ... : :::.:.:::.:.::: .::.: : : : . .
CCDS75 GLEAVDRPLR-ERWAALG---DLVPSAELKQLLRAGVPREHRPRVWRWLV--HLRVQHLH
600 610 620 630 640
570 580 590 600 610 620
pF1KB9 TEPGHFQTLLQKALEKQNPASKQIELDLLRTLPNNKHYSCPTSEGIQKLRNVLLAFSWRN
: :: .: ::... ...::..:::::: ::.:::::..:::: .::: :::::::.:
CCDS75 T-PGCYQELLSRGQAREHPAARQIELDLNRTFPNNKHFTCPTSSFPDKLRRVLLAFSWQN
650 660 670 680 690 700
630 640 650 660 670
pF1KB9 PDIGYCQGLNRLVAVALLYLEQED-AFWCLVTIVEVFMPRDYYTKTLLGSQVDQRVFRDL
: ::::::::::.:.::: ::.:. ::::::.:::..:: ::: .:: .:::::::..::
CCDS75 PTIGYCQGLNRLAAIALLVLEEEESAFWCLVAIVETIMPADYYCNTLTASQVDQRVLQDL
710 720 730 740 750 760
680 690 700 710 720 730
pF1KB9 MSEKLPRLHGHFEQYKVDYTLITFNWFLVVFVDSVVSDILFKIWDSFLYEGPKVIFRFAL
.::::::: .:. :..:: .:.:::::::::.::..:.::...::.::::: ::.::.::
CCDS75 LSEKLPRLMAHLGQHHVDLSLVTFNWFLVVFADSLISNILLRVWDAFLYEGTKVVFRYAL
770 780 790 800 810 820
740 750 760 770 780
pF1KB9 ALFKYKEEEILKLQDSMSIFKYLRYFTRTILDARSGTDAPTTWRKSGWS
:.:::.:.:::.::... :..:::.::.:: ..:
CCDS75 AIFKYNEKEILRLQNGLEIYQYLRFFTKTISNSRKLMNIAFNDMNPFRMKQLRQLRMVHR
830 840 850 860 870 880
CCDS75 ERLEAELRELEQLKAEYLERRASRRRAVSEGCASEDEVEGEA
890 900 910 920
>>CCDS35080.1 TBC1D2 gene_id:55357|Hs108|chr9 (917 aa)
initn: 1578 init1: 432 opt: 1424 Z-score: 1081.7 bits: 211.2 E(32554): 6.3e-54
Smith-Waterman score: 1663; 39.9% identity (68.0% similar) in 784 aa overlap (1-773:130-849)
10 20 30
pF1KB9 MTYWLQELQQKRWEYCNSLDMVKWDSRTSP
: ::::.::.::::. :: :
CCDS35 FDCKADAEEGIFEIKTPSRVITLKAATKQAMLYWLQQLQMKRWEFHNS----------PP
100 110 120 130 140
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 TPGDFPKGLVARDNTDLIYPHPNASAEKARNVLAVETVPGELVGEQAANQPAPGHPNSIN
.: : . .: .. : . :: . . :.: :: ::: :: :: :. :
CCDS35 APPATPDAALAGNGPVLHLELGQEEAELEEFLCPVKTPPG-LVGVAAALQPFPALQN---
150 160 170 180 190 200
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 FYSLKQWGNELKNSMSSFRPGRGHNDSRRTVFYTNEEWELLDPTPKDLEESIVQEEKKKL
:::. :.:..:.: .. ::..... : .: .: .: : ...
CCDS35 -ISLKHLGTEIQNTMHNI---RGNKQAQGTGH---------EPPGEDSPQS--GEPQREE
210 220 230 240 250
160 170 180 190 200
pF1KB9 TPEGNKGVTGSGFPFDFGRNPYKGKRPLKDIIGSYK-NRHSSGDPS-SEGTSGSGSVSIR
: .. . : . : : .: . .: : . : .:... : ::: ..
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:::: . :: .: :.. . :: : ....:::....:.::: :::.::
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CCDS59 NGLEIYQYLRFFTKTISNSRKLMNIAFNDMNPFRMKQLRQLRMVHRERLEAELRELEQLK
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CCDS14 LS-YREIVKNSSNDETIAAKQIEKDLLRTMPSNACFASMGSIGVPRLRRVLRALAWLYPE
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CCDS14 HLKEEELIQSENSASIFNTLSDIPSQMEDAELLLGVAMRLAGSLTDVAVETQRRKHLAYL
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780
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.. :.:
CCDS14 NVTNKDSPLPSNVQQGSNVSDEKTSHTRVDITDLIRESNEKYGNIRYEDIHSMRCRNRLY
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CCDS47 DYYNTRVVGALVDQGVFEELARDYVPQLYDCMQDLGV-ISTISLSWFLTLFLSVMPFESA
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CCDS47 VVVVDCFFYEGIKVIFQLALAVLDANVDKLLNCKDDGEAMTVLGRYLDSVTNKDSTLPPI
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pF1KB9 TTWRKSGWS
CCDS47 PHLHSLLSDDVEPYPEVDIFRLIRTSYEKFGTIRADLIEQMRFKQRLKVIQTLEDTTKRN
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CCDS46 SLRGRLWLLFSDAVTDL---ASHPGYYGNLVEESLGKCCLVTEEIERDLHRSLP--EHPA
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CCDS46 FQNETGIAALRRVLTAYAHRNPKIGYCQSMNILTSVLLLYTKEEEAFWLLVAVCERMLP-
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pF1KB9 DYYTKTLLGSQVDQRVFRDLMSEKLPRLHGHFEQYKVDYTLITFNWFLVVFVDSVVSDIL
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CCDS46 DYFNHRVIGAQVDQSVFEELIKGHLPELAEHMNDLSA-LASVSLSWFLTLFLSIMPLESA
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pF1KB9 FKIWDSFLYEGPKVIFRFALALFKYKEEEILKLQDSMSIFKYLRYFTRTILDARSGTDAP
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CCDS46 VNVVDCFFYDGIKAIFQLGLAVLEANAEDLCSSKDDGQALMILSRF----LDHIKNEDSP
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pF1KB9 TTWRKSGWS
CCDS46 GPPVGSHHAFFSDDQEPYPVTDISDLIRDSYEKFGDQSVEQIEHLRYKHRIRVLQGHEDT
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pF1KB9 EEEKLVAKVRALDLKTLYLTENQEVSTGVKWENYFASTVNREMMCSPE-LKNLIRAGIPH
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CCDS82 HPDALVTAFQQSGSQSPDSRMSREQIKISLWNDHFVEYGRTVCMFRTEKIRKLVAMGIPE
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pF1KB9 EHRSKVWKWCVDRHTRKFKDNTEPGHFQTLLQKALEKQNPASKQIELDLLRTLPNNKHYS
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CCDS82 SLRGRLWLLFSDAVTDL---ASHPGYYGNLVEESLGKCCLVTEEIERDLHRSLP--EHPA
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pF1KB9 CPTSEGIQKLRNVLLAFSWRNPDIGYCQGLNRLVAVALLYLEQEDAFWCLVTIVEVFMPR
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CCDS82 FQNETGIAALRRVLTAYAHRNPKIGYCQSMNILTSVLLLYTKEEEAFWLLVAVCERMLP-
580 590 600 610 620 630
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pF1KB9 DYYTKTLLGSQVDQRVFRDLMSEKLPRLHGHFEQYKVDYTLITFNWFLVVFVDSVVSDIL
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CCDS82 DYFNHRVIGAQVDQSVFEELIKGHLPELAEHMNDLSA-LASVSLSWFLTLFLSIMPLESA
640 650 660 670 680 690
720 730 740 750 760 770
pF1KB9 FKIWDSFLYEGPKVIFRFALALFKYKEEEILKLQDSMSIFKYLRYFTRTILDARSGTDAP
.. : :.:.: :.::...::... . :.. . .:. . . : : :: .. :.:
CCDS82 VNVVDCFFYDGIKAIFQLGLAVLEANAEDLCSSKDDGQALMILSRF----LDHIKNEDSP
700 710 720 730 740 750
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pF1KB9 TTWRKSGWS
CCDS82 GPPVGSHHAFFSDDQEPYPVTDISDLIRDSYEKFGDQSVEQIEHLRYKHRIRVLQGHEDT
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788 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]