FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB9778, 798 aa 1>>>pF1KB9778 798 - 798 aa - 798 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7801+/-0.00137; mu= 14.9600+/- 0.082 mean_var=180.1803+/-35.287, 0's: 0 Z-trim(106.1): 136 B-trim: 37 in 2/47 Lambda= 0.095548 statistics sampled from 8665 (8798) to 8665 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.618), E-opt: 0.2 (0.27), width: 16 Scan time: 3.830 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS7174.1 ITGB1 gene_id:3688|Hs108|chr10 ( 798) 5589 784.1 0 CCDS11511.1 ITGB3 gene_id:3690|Hs108|chr17 ( 788) 2408 345.6 1.9e-94 CCDS3030.1 ITGB5 gene_id:3693|Hs108|chr3 ( 799) 2309 332.0 2.4e-90 CCDS8849.1 ITGB7 gene_id:3695|Hs108|chr12 ( 798) 2226 320.5 6.7e-87 CCDS13716.1 ITGB2 gene_id:3689|Hs108|chr21 ( 769) 2009 290.6 6.6e-78 CCDS74596.1 ITGB6 gene_id:3694|Hs108|chr2 ( 746) 1877 272.4 1.9e-72 CCDS2212.1 ITGB6 gene_id:3694|Hs108|chr2 ( 788) 1877 272.4 2e-72 CCDS74597.1 ITGB6 gene_id:3694|Hs108|chr2 ( 693) 1804 262.3 2e-69 CCDS63040.1 ITGB6 gene_id:3694|Hs108|chr2 ( 681) 1695 247.3 6.5e-65 CCDS58599.1 ITGB4 gene_id:3691|Hs108|chr17 (1752) 1515 222.9 3.5e-57 CCDS32736.1 ITGB4 gene_id:3691|Hs108|chr17 (1805) 1515 222.9 3.6e-57 CCDS11727.1 ITGB4 gene_id:3691|Hs108|chr17 (1822) 1515 223.0 3.6e-57 CCDS5370.1 ITGB8 gene_id:3696|Hs108|chr7 ( 769) 1101 165.4 3.1e-40 CCDS9499.1 ITGBL1 gene_id:9358|Hs108|chr13 ( 494) 481 79.8 1.3e-14 CCDS61361.1 ITGBL1 gene_id:9358|Hs108|chr13 ( 401) 465 77.4 5.1e-14 >>CCDS7174.1 ITGB1 gene_id:3688|Hs108|chr10 (798 aa) initn: 5589 init1: 5589 opt: 5589 Z-score: 4179.0 bits: 784.1 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 5589; 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CCDS11 ALPLGSPRCDLKENLLKDNCAPESIEFPVSEARVLEDRPLSDKGSGDSSQ-----VTQVS 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB9 PQQLVLRLRSGEPQTFTLKFKRAEDYPIDLYYLMDLSYSMKDDLENVKSLGTDLMNEMRR ::...:::: . ..:... ...::::.:.:::::::::::::: ....::: : ..::. CCDS11 PQRIALRLRPDDSKNFSIQVRQVEDYPVDIYYLMDLSYSMKDDLWSIQNLGTKLATQMRK 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB9 ITSDFRIGFGSFVEKTVMPYISTTPAK-LRNPCTSEQN-CTSPFSYKNVLSLTNKGEVFN .::..:::::.::.: : ::. .: . :.::: . .. : :.::.::.::.. :: CCDS11 LTSNLRIGFGAFVDKPVSPYMYISPPEALENPCYDMKTTCLPMFGYKHVLTLTDQVTRFN 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB9 ELVGKQRISGNLDSPEGGFDAIMQVAVCGSLIGWRN-VTRLLVFSTDAGFHFAGDGKLGG : : :: .: : :.::::::::::..:: ::::: ...::::.::: :.: ::.:.: CCDS11 EEVKKQSVSRNRDAPEGGFDAIMQATVCDEKIGWRNDASHLLVFTTDAKTHIALDGRLAG 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB9 IVLPNDGQCHL-ENNMYTMSHYYDYPSIAHLVQKLSENNIQTIFAVTEEFQPVYKELKNL :: :::::::. .: :. : .::::.. ...:::..::. ::::::. .:.. ..: CCDS11 IVQPNDGQCHVGSDNHYSASTTMDYPSLGLMTEKLSQKNINLIFAVTENVVNLYQNYSEL 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KB9 IPKSAVGTLSANSSNVIQLIIDAYNSLSSEVILENGKLSEGVTISYKSYCKNGVNGTGEN :: ..::.:: .::::.:::.:::... :.: :: : : ...:... : : : . . CCDS11 IPGTTVGVLSMDSSNVLQLIVDAYGKIRSKVELEVRDLPEELSLSFNATCLN--NEVIPG 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 pF1KB9 GRKCSNISIGDEVQFEISITSNKCPKKDSDSFKIRPLGFTEEVEVILQYICECECQSEGI ..: ...::: :.: : ::.. :: :.:.:: . . : . . :.: ::... CCDS11 LKSCMGLKIGDTVSFSIEAKVRGCPQEKEKSFTIKPVGFKDSLIVQVTFDCDCACQAQAE 410 420 430 440 450 460 480 490 500 510 520 530 pF1KB9 PESPKCHEGNGTFECGACRCNEGRVGRHCECSTDEVNSEDMDAYCRKENSSEICSNNGEC :.: .:..::::::::.:::. : .: .:::: .. ..: : .... .::. ::: CCDS11 PNSHRCNNGNGTFECGVCRCGPGWLGSQCECSEEDYRPSQQDE-CSPREGQPVCSQRGEC 470 480 490 500 510 520 540 550 560 570 580 590 pF1KB9 VCGQCVCRKRDNTNEIYSGKFCECDNFNCDRSNGLICGGNGVCKCRVCECNPNYTGSACD .::::::.. : ..: .::.::::.:.: : .: .:.:.: :.: : :. ..:: :. CCDS11 LCGQCVCHSSD-FGKI-TGKYCECDDFSCVRYKGEMCSGHGQCSCGDCLCDSDWTGYYCN 530 540 550 560 570 580 600 610 620 630 640 650 pF1KB9 CSLDTSTCEASNGQICNGRGICECGVCKCTDPKFQGQTCEMCQTCLGVCAEHKECVQCRA :. :.:: .::: .:.::: :::: : : .: :.::: : :: .:. .::::.:. CCDS11 CTTRTDTCMSSNGLLCSGRGKCECGSCVCIQPGSYGDTCEKCPTCPDACTFKKECVECKK 590 600 610 620 630 640 660 670 680 690 700 710 pF1KB9 FNKGEKKDTCTQECSYFNITKVESRDKLPQPVQPDPVSHCKEKDVDDCWFYFTYSVNGNN :..: .: : :. . ..:: .: . . : :. : :. ::: : : .... CCDS11 FDRGALHDENT--CNRYCRDEIESVKEL-KDTGKDAVN-CTYKNEDDCVVRFQYYEDSSG 650 660 670 680 690 700 720 730 740 750 760 770 pF1KB9 EVMVHVVENPECPTGPDIIPIVAGVVAGIVLIGLALLLIWKLLMIIHDRREFAKFEKEKM . ...:::.:::: ::::. .. .:...:.::::: :::::::. ::::.::::::.:. CCDS11 KSILYVVEEPECPKGPDILVVLLSVMGAILLIGLAALLIWKLLITIHDRKEFAKFEEERA 710 720 730 740 750 760 780 790 pF1KB9 NAKWDTGENPIYKSAVTTVVNPKYEGK :::::..::.:: :..: .: :.: CCDS11 RAKWDTANNPLYKEATSTFTNITYRGT 770 780 >>CCDS3030.1 ITGB5 gene_id:3693|Hs108|chr3 (799 aa) initn: 1489 init1: 468 opt: 2309 Z-score: 1735.5 bits: 332.0 E(32554): 2.4e-90 Smith-Waterman score: 2309; 43.7% identity (71.0% similar) in 775 aa overlap (25-789:26-780) 10 20 30 40 50 pF1KB9 MNLQPIFWIGLISSVCCVFAQTDENRCLKANAKSCGECIQAGPNCGWCTNSTFLQEGMP : : ...: :: ::. :.:.::.. : : : CCDS30 MPRAPAPLYACLLGLCALLPRLAGLNICTSGSATSCEECLLIHPKCAWCSKEDF---GSP 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB9 TS--ARCDDLEALKKKGCPPDDIENPRGSKDIKKNKNVTNRSKGTAEKLKPEDITQIQPQ : .::: : :.:: .::.: .: . .. ......:.: :. :. :: CCDS30 RSITSRCDLRANLVKNGCG-GEIESPASSFHVLRSLPLSSKGSGSA----GWDVIQMTPQ 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB9 QLVLRLRSGEPQTFTLKFKRAEDYPIDLYYLMDLSYSMKDDLENVKSLGTDLMNEMRRIT .... :: :. :: :. ...::::.::::::::: ::::::.:..:::: : .:::..: CCDS30 EIAVNLRPGDKTTFQLQVRQVEDYPVDLYYLMDLSLSMKDDLDNIRSLGTKLAEEMRKLT 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB9 SDFRIGFGSFVEKTVMPYISTTPAKLRNPCTSEQ---NCTSPFSYKNVLSLTNKGEVFNE :.::.::::::.: . :. :.: ::: . . ::. :.....: ::.. . ::: CCDS30 SNFRLGFGSFVDKDISPFSYTAPRYQTNPCIGYKLFPNCVPSFGFRHLLPLTDRVDSFNE 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB9 LVGKQRISGNLDSPEGGFDAIMQVAVCGSLIGWR-NVTRLLVFSTDAGFHFAGDGKLGGI : :::.: : :.:::::::..:.::: :::: .. .::::.:: :.: ::::::. CCDS30 EVRKQRVSRNRDAPEGGFDAVLQAAVCKEKIGWRKDALHLLVFTTDDVPHIALDGKLGGL 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB9 VLPNDGQCHL-ENNMYTMSHYYDYPSIAHLVQKLSENNIQTIFAVTEEFQPVYKELKNLI : :.:::::: : : :: :. .::::.: : .::.::::. :::::.. .::.. :: CCDS30 VQPHDGQCHLNEANEYTASNQMDYPSLALLGEKLAENNINLIFAVTKNHYMLYKNFTALI 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KB9 PKSAVGTLSANSSNVIQLIIDAYNSLSSEVILENGKLSEGVTISYKSYCKNGVNGTGENG : ..: :...:.:.:::::.::::. :.: : : ... . . :..::. :. CCDS30 PGTTVEILDGDSKNIIQLIINAYNSIRSKVELSVWDQPEDLNLFFTATCQDGVSYPGQ-- 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KB9 RKCSNISIGDEVQFEISITSNKCPKKDSDS-FKIRPLGFTEEVEVILQYICECECQSEGI ::: ...::: ..::.:. . .::.. .. : .::.:: . .:: . : : : : : :. CCDS30 RKCEGLKIGDTASFEVSLEARSCPSRHTEHVFALRPVGFRDSLEVGVTYNCTCGC-SVGL 420 430 440 450 460 480 490 500 510 520 530 pF1KB9 -PESPKCHEGNGTFECGACRCNEGRVGRHCECSTDEVNSEDMDAYCRKENSSEICSNNGE :.: .:. :.::. :: :.:. : .: .:::. : :. .. ::. ... .::. :. CCDS30 EPNSARCN-GSGTYVCGLCECSPGYLGTRCECQDGE-NQSVYQNLCREAEGKPLCSGRGD 470 480 490 500 510 520 540 550 560 570 580 590 pF1KB9 CVCGQCVCRKRDNTNEIYSGKFCECDNFNCDRSNGLICGGNGVCKCRVCECNPNYTGSAC : :.:: : . . ..:: : :::::::.: :..:..:.:.: :.: :.:. .: :. : CCDS30 CSCNQCSCFESE-FGKIY-GPFCECDNFSCARNKGVLCSGHGECHCGECKCHAGYIGDNC 530 540 550 560 570 580 600 610 620 630 640 650 pF1KB9 DCSLDTSTCEASNGQICNGRGICECGVCKCTDPKFQGQTCEMCQTCLGVCAEHKECVQCR .:: : :::.. .::::. :: : :: :.::.: :. :: : :: .:. ...::.: CCDS30 NCSTDISTCRGRDGQICSERGHCLCGQCQCTEPGAFGEMCEKCPTCPDACSTKRDCVECL 590 600 610 620 630 640 660 670 680 690 700 pF1KB9 AFNKGEKKD-TCTQECSYFNITKVESRDKLPQPVQPDPVSHCKEKDVDDCWFYFTYSVNG ...:. . :: . : :: :.. : : . : : . :: ..::: CCDS30 LLHSGKPDNQTCHSLCRDEVITWVDTIVKDDQE-----AVLCFYKTAKDCVMMFTYVELP 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 pF1KB9 NNEVMVHVVENPECPTGPDIIPIVAGVVAGIVLIGLALLLIWKLLMIIHDRREFAKFEKE ... . :...::: . :. . :. .::..:.:.::::: :::::. ::::::::::..: CCDS30 SGKSNLTVLREPECGNTPNAMTILLAVVGSILLVGLALLAIWKLLVTIHDRREFAKFQSE 710 720 730 740 750 760 770 780 790 pF1KB9 KMNAKWDTGENPIYKSAVTTVVNPKYEGK . :... . ::.:.. ..: CCDS30 RSRARYEMASNPLYRKPISTHTVDFTFNKFNKSYNGTVD 770 780 790 >>CCDS8849.1 ITGB7 gene_id:3695|Hs108|chr12 (798 aa) initn: 2029 init1: 506 opt: 2226 Z-score: 1673.6 bits: 320.5 E(32554): 6.7e-87 Smith-Waterman score: 2477; 45.0% identity (72.9% similar) in 771 aa overlap (32-796:48-791) 10 20 30 40 50 60 pF1KB9 NLQPIFWIGLISSVCCVFAQTDENRCLKANAKSCGECIQAGPNCGWCTNSTFLQEGMPTS : :: .:: . :.:.:: . .: : . CCDS88 ESELDAKIPSTGDATEWRNPHLSMLGSCQPAPSCQKCILSHPSCAWCKQLNFTASGEAEA 20 30 40 50 60 70 70 80 90 100 110 120 pF1KB9 ARCDDLEALKKKGCPPDDIENPRGSKDIKKNKNVTNRSKGTAEKLKPEDITQIQPQQLVL :: : : .::: ...:.:::.... ... ... ..: : ::. ::.. . CCDS88 RRCARREELLARGCPLEELEEPRGQQEVLQDQPLSQGARG-------EGATQLAPQRVRV 80 90 100 110 120 130 130 140 150 160 170 180 pF1KB9 RLRSGEPQTFTLKFKRAEDYPIDLYYLMDLSYSMKDDLENVKSLGTDLMNEMRRITSDFR :: :::: . ..: ::: ::.::::::::::::::::: :..:: :. .....: . : CCDS88 TLRPGEPQQLQVRFLRAEGYPVDLYYLMDLSYSMKDDLERVRQLGHALLVRLQEVTHSVR 140 150 160 170 180 190 190 200 210 220 230 240 pF1KB9 IGFGSFVEKTVMPYISTTPAKLRNPCTSE-QNCTSPFSYKNVLSLTNKGEVFNELVGKQR :::::::.:::.:..::.:.:::.:: .. . : ::::...:::::. ...:.. ::.: CCDS88 IGFGSFVDKTVLPFVSTVPSKLRHPCPTRLERCQSPFSFHHVLSLTGDAQAFEREVGRQS 200 210 220 230 240 250 250 260 270 280 290 300 pF1KB9 ISGNLDSPEGGFDAIMQVAVCGSLIGWRNVTRLLVFSTDAGFHFAGDGKLGGIVLPNDGQ .::::::::::::::.:.:.: ::::::.:::::..: :: ::::::::: .:.::. CCDS88 VSGNLDSPEGGFDAILQAALCQEQIGWRNVSRLLVFTSDDTFHTAGDGKLGGIFMPSDGH 260 270 280 290 300 310 310 320 330 340 350 pF1KB9 CHLENN-MYTMSHYYDYPSIAHLVQKLSENNIQTIFAVTEEFQPVYKELKNLIPKSAVGT :::..: .:. : .::::.....: :: ::: ::::: :::.::..:::::::: CCDS88 CHLDSNGLYSRSTEFDYPSVGQVAQALSAANIQPIFAVTSAALPVYQELSKLIPKSAVGE 320 330 340 350 360 370 360 370 380 390 400 410 pF1KB9 LSANSSNVIQLIIDAYNSLSSEVILENGKLSEGVTISYKSYCKNGVN--GTGENGRKCSN :: .::::.:::.:::::::: : ::...: :: :::.: :.. . : .:. .:.. CCDS88 LSEDSSNVVQLIMDAYNSLSSTVTLEHSSLPPGVHISYESQCEGPEKREGKAEDRGQCNH 380 390 400 410 420 430 420 430 440 450 460 470 pF1KB9 ISIGDEVQFEISITSNKC-PKKDSDSFKIRPLGFTEEVEVILQYICECECQSEGIPESPK . :.. : : .:. ...: : . ...: :::.::. : :. .:.:.: :. :..:. CCDS88 VRINQTVTFWVSLQATHCLP--EPHLLRLRALGFSEELIVELHTLCDCNC-SDTQPQAPH 440 450 460 470 480 480 490 500 510 520 530 pF1KB9 CHEGNGTFECGACRCNEGRVGRHCECSTDEVNSEDMDAYCRKENSS-EICSNNGECVCGQ : .:.: ..::.: : ::.:: ::::. :..: :... :: :.. .::..:.: ::. CCDS88 CSDGQGHLQCGVCSCAPGRLGRLCECSVAELSSPDLESGCRAPNGTGPLCSGKGHCQCGR 490 500 510 520 530 540 540 550 560 570 580 590 pF1KB9 CVCRKRDNTNEIYSGKFCECDNFNCDRSNGLICGGNGVCKCRVCECNPNYTGSACDCSLD : : .. ::..::::. .:.: .:..::: : :.: ::.:. : :: ::.:: : CCDS88 CSCSGQS------SGHLCECDDASCERHEGILCGGFGRCQCGVCHCHANRTGRACECSGD 550 560 570 580 590 600 600 610 620 630 640 650 pF1KB9 TSTCEASNGQICNGRGICECGVCKCTDPKFQGQTCEMCQTCLGVCAEHKECVQCRAFNKG ..: . .: .:.:.: :.:. :.: : . : :..: : : .:..:..: :: : CCDS88 MDSCISPEGGLCSGHGRCKCNRCQCLDG-YYGALCDQCPGCKTPCERHRDCAECGAFRTG 610 620 630 640 650 660 660 670 680 690 700 710 pF1KB9 EKKDTCTQECSYFNITKVESRDKLPQPVQPDPVSHCKEKDVDDCWFYFTYSVNGNNEVMV .:. :.. :.: . . :. : . :::. .:. :.: .. . :.. CCDS88 PLATNCSTACAHTNVTLALA------PILDD--GWCKERTLDNQLFFFLVEDDARGTVVL 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 pF1KB9 HVVENPECPTGPDIIPIVAGVVAGIVLIGLALLLIWKLLMIIHDRREFAKFEKEKMNAKW .: :. . :: : :.::: .::.:.: ..: . :.::::...::::... .: CCDS88 RV--RPQEKGADHTQAIVLGCVGGIVAVGLGLVLAYRLSVEIYDRREYSRFEKEQQQLNW 720 730 740 750 760 770 780 790 pF1KB9 DTGENPIYKSAVTTVVNPKYEGK ::.::::.::..::... CCDS88 KQDSNPLYKSAITTTINPRFQEADSPTL 780 790 >>CCDS13716.1 ITGB2 gene_id:3689|Hs108|chr21 (769 aa) initn: 2051 init1: 885 opt: 2009 Z-score: 1512.2 bits: 290.6 E(32554): 6.6e-78 Smith-Waterman score: 2541; 45.6% identity (73.2% similar) in 801 aa overlap (1-795:2-766) 10 20 30 40 50 pF1KB9 MNLQP--IFWIGLISSVCCVFAQTDENRCLKANAKSCGECIQAGPNCGWCTNSTFLQEG ..:.: . .::.: . ::..: .: : ...:: :::..::.: :: . .: : CCDS13 MLGLRPPLLALVGLLS-LGCVLSQ----ECTKFKVSSCRECIESGPGCTWCQKLNFTGPG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB9 MPTSARCDDLEALKKKGCPPDDIENPRGSKDIKKNKNVTNRSKGTAEKLKPEDITQIQPQ : : ::: : .:: ::: .: . . ....: .. :..:: CCDS13 DPDSIRCDTRPQLLMRGCAADDIMDPTSLAETQEDHNGGQK--------------QLSPQ 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KB9 QLVLRLRSGEPQTFTLKFKRAEDYPIDLYYLMDLSYSMKDDLENVKSLGTDLMNEMRRIT ...: :: :. .:.. :.::. ::::::::::::::: :::.:::.:: ::. . .:: CCDS13 KVTLYLRPGQAAAFNVTFRRAKGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLRNVKKLGGDLLRALNEIT 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KB9 SDFRIGFGSFVEKTVMPYISTTPAKLRNPCTS-EQNCTSPFSYKNVLSLTNKGEVFNELV . ::::::::.:::.:...: : :::::: . :..: ::....::.:::... :. : CCDS13 ESGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPDKLRNPCPNKEKECQPPFAFRHVLKLTNNSNQFQTEV 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KB9 GKQRISGNLDSPEGGFDAIMQVAVCGSLIGWRNVTRLLVFSTDAGFHFAGDGKLGGIVLP ::: ::::::.::::.::.::::.: ::::::::::::.:: :::::::::::.:. : CCDS13 GKQLISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEEIGWRNVTRLLVFATDDGFHFAGDGKLGAILTP 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KB9 NDGQCHLENNMYTMSHYYDYPSIAHLVQKLSENNIQTIFAVTEEFQPVYKELKNLIPKSA :::.::::.:.: :. .::::...:..::.::::: ::::: .. .:..: ..::::: CCDS13 NDGRCHLEDNLYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAENNIQPIFAVTSRMVKTYEKLTEIIPKSA 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KB9 VGTLSANSSNVIQLIIDAYNSLSSEVILENGKLSEGVTISYKSYCKNGVNGTGENGRKCS :: :: .::::..:: .:::.:::.:.:... : . . ..: :.:.:::. .. :. CCDS13 VGELSEDSSNVVHLIKNAYNKLSSRVFLDHNALPDTLKVTYDSFCSNGVTHRNQPRGDCD 350 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 pF1KB9 NISIGDEVQFEISITSNKCPKKDSDSFKIRPLGFTEEVEVILQYICECECQSEGIPESPK ...:. . :....:...: ...: : :: ::::. : : . :::.:.... .: CCDS13 GVQINVPITFQVKVTATECIQEQS--FVIRALGFTDIVTVQVLPQCECRCRDQSRDRS-L 410 420 430 440 450 480 490 500 510 520 530 pF1KB9 CHEGNGTFECGACRCNEGRVGRHCECSTDEVNSEDMDAYCRKENSSEICSNNGECVCGQC :: :.: .::: :::. : .:..:::.:. .:..... :::.:.: :::. :.:::::: CCDS13 CH-GKGFLECGICRCDTGYIGKNCECQTQGRSSQELEGSCRKDNNSIICSGLGDCVCGQC 460 470 480 490 500 510 540 550 560 570 580 590 pF1KB9 VCRKRDNTNEIYSGKFCECDNFNCDRSNGLICGG--NGVCKCRVCECNPNYTGSACDCSL .:. : ... :..::::..::.: :: .::: :.: : :.:.:.. ::::.: CCDS13 LCHTSDVPGKLIYGQYCECDTINCERYNGQVCGGPGRGLCFCGKCRCHPGFEGSACQCER 520 530 540 550 560 570 600 610 620 630 640 650 pF1KB9 DTSTCEASNGQICNGRGICECGVCKCTDPKFQGQTCEMCQTCLGVCAEHKECVQCRAFNK : : :.::: :.:.::.: . .: :. : : . :... :..: :.: CCDS13 TTEGCLNPRRVECSGRGRCRCNVCECHSG-YQLPLCQECPGCPSPCGKYISCAECLKFEK 580 590 600 610 620 630 660 670 680 690 700 710 pF1KB9 GEKKDTCTQECSYFNITKVESRDKLPQPVQPDPVSHCKEKDVDDCWFYFTY-SVNGNNEV : .:. : ..... .::. :::.: . :: .: . .: .. CCDS13 GPFGKNCSAACPGLQLSN--------NPVKG---RTCKERDSEGCWVAYTLEQQDGMDRY 640 650 660 670 680 720 730 740 750 760 770 pF1KB9 MVHVVENPECPTGPDIIPIVAGVVAGIVLIGLALLLIWKLLMIIHDRREFAKFEKEKMNA ...: :. :: .::.: ::.:.::::::::. ::.::: :. . : ::. .:::::... CCDS13 LIYVDESRECVAGPNIAAIVGGTVAGIVLIGILLLVIWKALIHLSDLREYRRFEKEKLKS 690 700 710 720 730 740 780 790 pF1KB9 KWDTGENPIYKSAVTTVVNPKYEGK .:.. .::..:::.:::.:::. CCDS13 QWNN-DNPLFKSATTTVMNPKFAES 750 760 >>CCDS74596.1 ITGB6 gene_id:3694|Hs108|chr2 (746 aa) initn: 1429 init1: 473 opt: 1877 Z-score: 1414.0 bits: 272.4 E(32554): 1.9e-72 Smith-Waterman score: 2250; 43.2% identity (71.9% similar) in 740 aa overlap (63-798:16-735) 40 50 60 70 80 90 pF1KB9 KSCGECIQAGPNCGWCTNSTFLQEGMPTSARCDDLEALKKKGCPPDDIENPRGSKDIKKN ::: : ::: . :::: .. .: :: CCDS74 MITYKNFTHPSGVGERCDTPANLLAKGCQLNFIENPVSQVEILKN 10 20 30 40 100 110 120 130 140 150 pF1KB9 KNVT-NRSKGTAEKLKPEDITQIQPQQLVLRLRSGEPQTFTLKFKRAEDYPIDLYYLMDL : .. .:.:... ::.:: ::.:.:.:: : ::. .. ...::::.:::::::: CCDS74 KPLSVGRQKNSS------DIVQIAPQSLILKLRPGGAQTLQVHVRQTEDYPVDLYYLMDL 50 60 70 80 90 160 170 180 190 200 210 pF1KB9 SYSMKDDLENVKSLGTDLMNEMRRITSDFRIGFGSFVEKTVMPYISTTPAKLRNPCTS-E : :: :::...: ::. : .:: ..::.::.:::::::: : :...::: .. :::.: CCDS74 SASMDDDLNTIKELGSRLSKEMSKLTSNFRLGFGSFVEKPVSPFVKTTPEEIANPCSSIP 100 110 120 130 140 150 220 230 240 250 260 270 pF1KB9 QNCTSPFSYKNVLSLTNKGEVFNELVGKQRISGNLDSPEGGFDAIMQVAVCGSLIGWRNV : :..:..: ::: .: :::.: .:.::.:.:.::::::::::.::: ::::: CCDS74 YFCLPTFGFKHILPLTNDAERFNEIVKNQKISANIDTPEGGFDAIMQAAVCKEKIGWRND 160 170 180 190 200 210 280 290 300 310 320 pF1KB9 T-RLLVFSTDAGFHFAGDGKLGGIVLPNDGQCHLEN-NMYTMSHYYDYPSIAHLVQKLSE . .:::: .:: ::. :.::.:::.:::: :::.. : :.:: .::.:..:..:: . CCDS74 SLHLLVFVSDADSHFGMDSKLAGIVIPNDGLCHLDSKNEYSMSTVLEYPTIGQLIDKLVQ 220 230 240 250 260 270 330 340 350 360 370 380 pF1KB9 NNIQTIFAVTEEFQPVYKELKNLIPKSAVGTLSANSSNVIQLIIDAYNSLSSEVILENGK ::. :::::.: .:.. .::: ..:: :. .:.:..::::.::. : ::: :: CCDS74 NNVLLIFAVTQEQVHLYENYAKLIPGATVGLLQKDSGNILQLIISAYEELRSEVELEVLG 280 290 300 310 320 330 390 400 410 420 430 440 pF1KB9 LSEGVTISYKSYCKNGVNGTGENGRKCSNISIGDEVQFEISITSNKCPKKDSDSFKIRPL .::...:. . :.::. .. .:::....:: ..: .... .: .. : . :.:. CCDS74 DTEGLNLSFTAICNNGT--LFQHQKKCSHMKVGDTASFSVTVNIPHCERR-SRHIIIKPV 340 350 360 370 380 390 450 460 470 480 490 500 pF1KB9 GFTEEVEVILQYICECECQSEGIPESPKCHEGNGTFECGACRCNEGRVGRHCECSTDEVN :. . .:.... :.:.::.: .: :::.:::.:.::.: :. :..: .:::. : .. CCDS74 GLGDALELLVSPECNCDCQKEVEVNSSKCHHGNGSFQCGVCACHPGHMGPRCECGEDMLS 400 410 420 430 440 450 510 520 530 540 550 560 pF1KB9 SEDMDAYCRKENSSEICSNNGECVCGQCVCRKRDNTNEIYSGKFCECDNFNCDRSNGLIC ... :.. . ::. :.: ::::.:. : :: : .:.::::.: : .::.: CCDS74 TDS----CKEAPDHPSCSGRGDCYCGQCICHLSPYGN-IY-GPYCQCDNFSCVRHKGLLC 460 470 480 490 500 510 570 580 590 600 610 620 pF1KB9 GGNGVCKCRVCECNPNYTGSACDCSLDTSTCEASNGQICNGRGICECGVCKCTDPKFQGQ :::: : : : : ..:: :.:. .:..: . .: .:.::: : :: : ::.: .: CCDS74 GGNGDCDCGECVCRSGWTGEYCNCTTSTDSCVSEDGVLCSGRGDCVCGKCVCTNPGASGP 520 530 540 550 560 570 630 640 650 660 670 680 pF1KB9 TCEMCQTCLGVCAEHKECVQCRAFNKGEKKDTCTQECSYFNITKVESRDKLPQPVQPDPV ::: : :: : .. :..:. :. .. :...:. . : : .: . : CCDS74 TCERCPTCGDPCNSKRSCIECHLSAAGQAREECVDKCKLAGATISEEED-----FSKDGS 580 590 600 610 620 690 700 710 720 730 740 pF1KB9 SHCKEKDVDDCWFYFTYSVNGNNEVMVHVVENPECPTGPDIIPIVAGVVAGIVLIGLALL :. . ..: . : ..........: ... .:: :.: :. :: .:.:::..:: CCDS74 VSCSLQGENECLITFLITTDNEGKTIIHSINEKDCPKPPNIPMIMLGVSLAILLIGVVLL 630 640 650 660 670 680 750 760 770 780 790 pF1KB9 LIWKLLMIIHDRREFAKFEKEKMNAKWDTGENPIYKSAVTTVVNPKYEGK :::::. .:::.: :::: :. .:::.:: ::.:.....: : :. . CCDS74 CIWKLLVSFHDRKEVAKFEAERSKAKWQTGTNPLYRGSTSTFKNVTYKHREKQKVDLSTD 690 700 710 720 730 740 CCDS74 C >>CCDS2212.1 ITGB6 gene_id:3694|Hs108|chr2 (788 aa) initn: 1429 init1: 473 opt: 1877 Z-score: 1413.7 bits: 272.4 E(32554): 2e-72 Smith-Waterman score: 2340; 42.5% identity (71.8% similar) in 776 aa overlap (27-798:23-777) 10 20 30 40 50 60 pF1KB9 MNLQPIFWIGLISSVCCVFAQTDENRCLKANAKSCGECIQAGPNCGWCTNSTFLQEGMPT : ..:..: .:. ::.:.::.. .: . . . CCDS22 MGIELLCLFFLFLGRNDHVQGGCALGGAETCEDCLLIGPQCAWCAQENFTHPS-GV 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 pF1KB9 SARCDDLEALKKKGCPPDDIENPRGSKDIKKNKNVT-NRSKGTAEKLKPEDITQIQPQQL . ::: : ::: . :::: .. .: ::: .. .:.:... ::.:: ::.: CCDS22 GERCDTPANLLAKGCQLNFIENPVSQVEILKNKPLSVGRQKNSS------DIVQIAPQSL 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KB9 VLRLRSGEPQTFTLKFKRAEDYPIDLYYLMDLSYSMKDDLENVKSLGTDLMNEMRRITSD .:.:: : ::. .. ...::::.::::::::: :: :::...: ::. : .:: ..::. CCDS22 ILKLRPGGAQTLQVHVRQTEDYPVDLYYLMDLSASMDDDLNTIKELGSRLSKEMSKLTSN 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KB9 FRIGFGSFVEKTVMPYISTTPAKLRNPCTS-EQNCTSPFSYKNVLSLTNKGEVFNELVGK ::.:::::::: : :...::: .. :::.: : :..:..: ::: .: :::.: . CCDS22 FRLGFGSFVEKPVSPFVKTTPEEIANPCSSIPYFCLPTFGFKHILPLTNDAERFNEIVKN 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KB9 QRISGNLDSPEGGFDAIMQVAVCGSLIGWRNVT-RLLVFSTDAGFHFAGDGKLGGIVLPN :.::.:.:.::::::::::.::: ::::: . .:::: .:: ::. :.::.:::.:: CCDS22 QKISANIDTPEGGFDAIMQAAVCKEKIGWRNDSLHLLVFVSDADSHFGMDSKLAGIVIPN 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KB9 DGQCHLEN-NMYTMSHYYDYPSIAHLVQKLSENNIQTIFAVTEEFQPVYKELKNLIPKSA :: :::.. : :.:: .::.:..:..:: .::. :::::.: .:.. .::: .. CCDS22 DGLCHLDSKNEYSMSTVLEYPTIGQLIDKLVQNNVLLIFAVTQEQVHLYENYAKLIPGAT 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KB9 VGTLSANSSNVIQLIIDAYNSLSSEVILENGKLSEGVTISYKSYCKNGVNGTGENGRKCS :: :. .:.:..::::.::. : ::: :: .::...:. . :.::. .. .::: CCDS22 VGLLQKDSGNILQLIISAYEELRSEVELEVLGDTEGLNLSFTAICNNGT--LFQHQKKCS 350 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 pF1KB9 NISIGDEVQFEISITSNKCPKKDSDSFKIRPLGFTEEVEVILQYICECECQSEGIPESPK ....:: ..: .... .: .. : . :.:.:. . .:.... :.:.::.: .: : CCDS22 HMKVGDTASFSVTVNIPHCERR-SRHIIIKPVGLGDALELLVSPECNCDCQKEVEVNSSK 410 420 430 440 450 460 480 490 500 510 520 530 pF1KB9 CHEGNGTFECGACRCNEGRVGRHCECSTDEVNSEDMDAYCRKENSSEICSNNGECVCGQC ::.:::.:.::.: :. :..: .:::. : ..... :.. . ::. :.: :::: CCDS22 CHHGNGSFQCGVCACHPGHMGPRCECGEDMLSTDS----CKEAPDHPSCSGRGDCYCGQC 470 480 490 500 510 520 540 550 560 570 580 590 pF1KB9 VCRKRDNTNEIYSGKFCECDNFNCDRSNGLICGGNGVCKCRVCECNPNYTGSACDCSLDT .:. : :: : .:.::::.: : .::.::::: : : : : ..:: :.:. .: CCDS22 ICHLSPYGN-IY-GPYCQCDNFSCVRHKGLLCGGNGDCDCGECVCRSGWTGEYCNCTTST 530 540 550 560 570 580 600 610 620 630 640 650 pF1KB9 STCEASNGQICNGRGICECGVCKCTDPKFQGQTCEMCQTCLGVCAEHKECVQCRAFNKGE ..: . .: .:.::: : :: : ::.: .: ::: : :: : .. :..:. :. CCDS22 DSCVSEDGVLCSGRGDCVCGKCVCTNPGASGPTCERCPTCGDPCNSKRSCIECHLSAAGQ 590 600 610 620 630 640 660 670 680 690 700 710 pF1KB9 KKDTCTQECSYFNITKVESRDKLPQPVQPDPVSHCKEKDVDDCWFYFTYSVNGNNEVMVH .. :...:. . : : .: . : :. . ..: . : ..........: CCDS22 AREECVDKCKLAGATISEEED-----FSKDGSVSCSLQGENECLITFLITTDNEGKTIIH 650 660 670 680 690 720 730 740 750 760 770 pF1KB9 VVENPECPTGPDIIPIVAGVVAGIVLIGLALLLIWKLLMIIHDRREFAKFEKEKMNAKWD ... .:: :.: :. :: .:.:::..:: :::::. .:::.: :::: :. .:::. CCDS22 SINEKDCPKPPNIPMIMLGVSLAILLIGVVLLCIWKLLVSFHDRKEVAKFEAERSKAKWQ 700 710 720 730 740 750 780 790 pF1KB9 TGENPIYKSAVTTVVNPKYEGK :: ::.:.....: : :. . CCDS22 TGTNPLYRGSTSTFKNVTYKHREKQKVDLSTDC 760 770 780 >>CCDS74597.1 ITGB6 gene_id:3694|Hs108|chr2 (693 aa) initn: 719 init1: 473 opt: 1804 Z-score: 1360.0 bits: 262.3 E(32554): 2e-69 Smith-Waterman score: 2112; 43.3% identity (72.5% similar) in 676 aa overlap (126-798:21-682) 100 110 120 130 140 150 pF1KB9 TNRSKGTAEKLKPEDITQIQPQQLVLRLRSGEPQTFTLKFKRAEDYPIDLYYLMDLSYSM : ::. .. ...::::.::::::::: :: CCDS74 MGIELLCLFFLFLGRNDHVQGGAQTLQVHVRQTEDYPVDLYYLMDLSASM 10 20 30 40 50 160 170 180 190 200 210 pF1KB9 KDDLENVKSLGTDLMNEMRRITSDFRIGFGSFVEKTVMPYISTTPAKLRNPCTS-EQNCT :::...: ::. : .:: ..::.::.:::::::: : :...::: .. :::.: : CCDS74 DDDLNTIKELGSRLSKEMSKLTSNFRLGFGSFVEKPVSPFVKTTPEEIANPCSSIPYFCL 60 70 80 90 100 110 220 230 240 250 260 270 pF1KB9 SPFSYKNVLSLTNKGEVFNELVGKQRISGNLDSPEGGFDAIMQVAVCGSLIGWRNVT-RL :..:..: ::: .: :::.: .:.::.:.:.::::::::::.::: ::::: . .: CCDS74 PTFGFKHILPLTNDAERFNEIVKNQKISANIDTPEGGFDAIMQAAVCKEKIGWRNDSLHL 120 130 140 150 160 170 280 290 300 310 320 330 pF1KB9 LVFSTDAGFHFAGDGKLGGIVLPNDGQCHLEN-NMYTMSHYYDYPSIAHLVQKLSENNIQ ::: .:: ::. :.::.:::.:::: :::.. : :.:: .::.:..:..:: .::. CCDS74 LVFVSDADSHFGMDSKLAGIVIPNDGLCHLDSKNEYSMSTVLEYPTIGQLIDKLVQNNVL 180 190 200 210 220 230 340 350 360 370 380 390 pF1KB9 TIFAVTEEFQPVYKELKNLIPKSAVGTLSANSSNVIQLIIDAYNSLSSEVILENGKLSEG :::::.: .:.. .::: ..:: :. .:.:..::::.::. : ::: :: .:: CCDS74 LIFAVTQEQVHLYENYAKLIPGATVGLLQKDSGNILQLIISAYEELRSEVELEVLGDTEG 240 250 260 270 280 290 400 410 420 430 440 450 pF1KB9 VTISYKSYCKNGVNGTGENGRKCSNISIGDEVQFEISITSNKCPKKDSDSFKIRPLGFTE ...:. . :.::. .. .:::....:: ..: .... .: .. : . :.:.:. . CCDS74 LNLSFTAICNNGT--LFQHQKKCSHMKVGDTASFSVTVNIPHCERR-SRHIIIKPVGLGD 300 310 320 330 340 460 470 480 490 500 510 pF1KB9 EVEVILQYICECECQSEGIPESPKCHEGNGTFECGACRCNEGRVGRHCECSTDEVNSEDM .:.... :.:.::.: .: :::.:::.:.::.: :. :..: .:::. : ..... CCDS74 ALELLVSPECNCDCQKEVEVNSSKCHHGNGSFQCGVCACHPGHMGPRCECGEDMLSTDS- 350 360 370 380 390 400 520 530 540 550 560 570 pF1KB9 DAYCRKENSSEICSNNGECVCGQCVCRKRDNTNEIYSGKFCECDNFNCDRSNGLICGGNG :.. . ::. :.: ::::.:. : :: : .:.::::.: : .::.::::: CCDS74 ---CKEAPDHPSCSGRGDCYCGQCICHLSPYGN-IY-GPYCQCDNFSCVRHKGLLCGGNG 410 420 430 440 450 460 580 590 600 610 620 630 pF1KB9 VCKCRVCECNPNYTGSACDCSLDTSTCEASNGQICNGRGICECGVCKCTDPKFQGQTCEM : : : : ..:: :.:. .:..: . .: .:.::: : :: : ::.: .: ::: CCDS74 DCDCGECVCRSGWTGEYCNCTTSTDSCVSEDGVLCSGRGDCVCGKCVCTNPGASGPTCER 470 480 490 500 510 520 640 650 660 670 680 690 pF1KB9 CQTCLGVCAEHKECVQCRAFNKGEKKDTCTQECSYFNITKVESRDKLPQPVQPDPVSHCK : :: : .. :..:. :. .. :...:. . : : .: . : :. CCDS74 CPTCGDPCNSKRSCIECHLSAAGQAREECVDKCKLAGATISEEED-----FSKDGSVSCS 530 540 550 560 570 700 710 720 730 740 750 pF1KB9 EKDVDDCWFYFTYSVNGNNEVMVHVVENPECPTGPDIIPIVAGVVAGIVLIGLALLLIWK . ..: . : ..........: ... .:: :.: :. :: .:.:::..:: ::: CCDS74 LQGENECLITFLITTDNEGKTIIHSINEKDCPKPPNIPMIMLGVSLAILLIGVVLLCIWK 580 590 600 610 620 630 760 770 780 790 pF1KB9 LLMIIHDRREFAKFEKEKMNAKWDTGENPIYKSAVTTVVNPKYEGK ::. .:::.: :::: :. .:::.:: ::.:.....: : :. . CCDS74 LLVSFHDRKEVAKFEAERSKAKWQTGTNPLYRGSTSTFKNVTYKHREKQKVDLSTDC 640 650 660 670 680 690 >>CCDS63040.1 ITGB6 gene_id:3694|Hs108|chr2 (681 aa) initn: 1070 init1: 426 opt: 1695 Z-score: 1278.9 bits: 247.3 E(32554): 6.5e-65 Smith-Waterman score: 1784; 37.9% identity (63.8% similar) in 776 aa overlap (27-798:23-670) 10 20 30 40 50 60 pF1KB9 MNLQPIFWIGLISSVCCVFAQTDENRCLKANAKSCGECIQAGPNCGWCTNSTFLQEGMPT : ..:..: .:. ::.:.::.. .: . . . CCDS63 MGIELLCLFFLFLGRNDHVQGGCALGGAETCEDCLLIGPQCAWCAQENFTHPS-GV 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 pF1KB9 SARCDDLEALKKKGCPPDDIENPRGSKDIKKNKNVT-NRSKGTAEKLKPEDITQIQPQQL . ::: : ::: . :::: .. .: ::: .. .:.:... ::.:: ::.: CCDS63 GERCDTPANLLAKGCQLNFIENPVSQVEILKNKPLSVGRQKNSS------DIVQIAPQSL 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KB9 VLRLRSGEPQTFTLKFKRAEDYPIDLYYLMDLSYSMKDDLENVKSLGTDLMNEMRRITSD .:.:: : ::. .. ...::::.::::::::: :: :::...: ::. : .:: ..::. CCDS63 ILKLRPGGAQTLQVHVRQTEDYPVDLYYLMDLSASMDDDLNTIKELGSRLSKEMSKLTSN 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KB9 FRIGFGSFVEKTVMPYISTTPAKLRNPCTS-EQNCTSPFSYKNVLSLTNKGEVFNELVGK ::.:::::::: : :...::: .. :::.: : :..:..: ::: .: :::.: . CCDS63 FRLGFGSFVEKPVSPFVKTTPEEIANPCSSIPYFCLPTFGFKHILPLTNDAERFNEIVKN 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KB9 QRISGNLDSPEGGFDAIMQVAVCGSLIGWRNVT-RLLVFSTDAGFHFAGDGKLGGIVLPN :.::.:.:.::::::::::.::: ::::: . .:::: .:: ::. :.::.:::.:: CCDS63 QKISANIDTPEGGFDAIMQAAVCKEKIGWRNDSLHLLVFVSDADSHFGMDSKLAGIVIPN 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KB9 DGQCHLEN-NMYTMSHYYDYPSIAHLVQKLSENNIQTIFAVTEEFQPVYKELKNLIPKSA :: :::.. : :.:: .::.:..:..:: .::. :::::.: .:.. .::: .. CCDS63 DGLCHLDSKNEYSMSTVLEYPTIGQLIDKLVQNNVLLIFAVTQEQVHLYENYAKLIPGAT 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KB9 VGTLSANSSNVIQLIIDAYNSLSSEVILENGKLSEGVTISYKSYCKNGVNGTGENGRKCS :: :. .:.:..::::.::. : ::: :: .::...:. . :.::. .. .::: CCDS63 VGLLQKDSGNILQLIISAYEELRSEVELEVLGDTEGLNLSFTAICNNGT--LFQHQKKCS 350 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 pF1KB9 NISIGDEVQFEISITSNKCPKKDSDSFKIRPLGFTEEVEVILQYICECECQSEGIPESPK ....:: ..: .... .: .. : . :.:.:. . .:.... :.:.::.: .: : CCDS63 HMKVGDTASFSVTVNIPHCERR-SRHIIIKPVGLGDALELLVSPECNCDCQKEVEVNSSK 410 420 430 440 450 460 480 490 500 510 520 530 pF1KB9 CHEGNGTFECGACRCNEGRVGRHCECSTDEVNSEDMDAYCRKENSSEICSNNGECVCGQC ::.:::.:.::.: :. :..: .:::. : ..... :.. . ::. :.: :::: CCDS63 CHHGNGSFQCGVCACHPGHMGPRCECGEDMLSTDS----CKEAPDHPSCSGRGDCYCGQC 470 480 490 500 510 520 540 550 560 570 580 590 pF1KB9 VCRKRDNTNEIYSGKFCECDNFNCDRSNGLICGGNGVCKCRVCECNPNYTGSACDCSLDT .:. : :: : .:.::::.: : .::.:: : : : CCDS63 ICHLSPYGN-IY-GPYCQCDNFSCVRHKGLLCG---------------------DFSKD- 530 540 550 600 610 620 630 640 650 pF1KB9 STCEASNGQICNGRGICECGVCKCTDPKFQGQTCEMCQTCLGVCAEHKECVQCRAFNKGE : .:. .::. CCDS63 -------------------GSVSCS---LQGE---------------------------- 560 660 670 680 690 700 710 pF1KB9 KKDTCTQECSYFNITKVESRDKLPQPVQPDPVSHCKEKDVDDCWFYFTYSVNGNNEVMVH ..: . : ..........: CCDS63 ----------------------------------------NECLITFLITTDNEGKTIIH 570 580 720 730 740 750 760 770 pF1KB9 VVENPECPTGPDIIPIVAGVVAGIVLIGLALLLIWKLLMIIHDRREFAKFEKEKMNAKWD ... .:: :.: :. :: .:.:::..:: :::::. .:::.: :::: :. .:::. CCDS63 SINEKDCPKPPNIPMIMLGVSLAILLIGVVLLCIWKLLVSFHDRKEVAKFEAERSKAKWQ 590 600 610 620 630 640 780 790 pF1KB9 TGENPIYKSAVTTVVNPKYEGK :: ::.:.....: : :. . CCDS63 TGTNPLYRGSTSTFKNVTYKHREKQKVDLSTDC 650 660 670 680 >>CCDS58599.1 ITGB4 gene_id:3691|Hs108|chr17 (1752 aa) initn: 1353 init1: 342 opt: 1515 Z-score: 1140.0 bits: 222.9 E(32554): 3.5e-57 Smith-Waterman score: 1622; 36.7% identity (63.6% similar) in 774 aa overlap (4-752:5-734) 10 20 30 40 50 pF1KB9 MNLQPIFWIGLISS--VCCVFAQTDENRCLKANAKSCGECIQAGPNCGWCTNSTFLQEG .: : :. . . .. : ::: :: .::: ::... .:..::. : CCDS58 MAGPRPSPWARLLLAALISVSLSGTLANRCKKAPVKSCTECVRVDKDCAYCTDEMF---- 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB9 MPTSARCDDLEALKKKGCPPDDIENPRGSKDIKKNKNVTNRSKGTAEKLKPEDITQIQPQ . ::. : :: ..: ..: .: .. .. . . . :..:: CCDS58 --RDRRCNTQAELLAAGCQRESIVVMESSFQITEETQIDTTLRRS----------QMSPQ 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KB9 QLVLRLRSGEPQTFTLKFKRAEDYPIDLYYLMDLSYSMKDDLENVKSLGTDLMNEMRRIT : .::: :: . : :. . . :.::: :::.: ::.:::.:.:..: .: . ..: CCDS58 GLRVRLRPGEERHFELEVFEPLESPVDLYILMDFSNSMSDDLDNLKKMGQNLARVLSQLT 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KB9 SDFRIGFGSFVEKTVMPYISTTPAKLRNPCTSEQNCTSPFSYKNVLSLTNKGEVF-NELV ::. ::::.::.:. .: . : ::..: : :::.:::.:::. . : :.: CCDS58 SDYTIGFGKFVDKVSVPQTDMRPEKLKEP---WPNSDPPFSFKNVISLTEDVDEFRNKLQ 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KB9 GKQRISGNLDSPEGGFDAIMQVAVCGSLIGWR-NVTRLLVFSTDAGFHFAGDGK--LGGI : .:::::::.::::::::.:.::: :::: . :.::::::...::. .:: :.:: CCDS58 G-ERISGNLDAPEGGFDAILQTAVCTRDIGWRPDSTHLLVFSTESAFHYEADGANVLAGI 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KB9 VLPNDGQCHLENN-MYTMSHYYDYPSIAHLVQKLSENNIQTIFAVTEEFQPVYKELKNLI . :: .:::... ::. . ::::. ::. :...:: :::::. :..:.. . CCDS58 MSRNDERCHLDTTGTYTQYRTQDYPSVPTLVRLLAKHNIIPIFAVTNYSYSYYEKLHTYF 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KB9 PKSAVGTLSANSSNVIQLIIDAYNSLSSEVILENGKLSEGVT--ISYKSYCKNGVNGTGE : :..:.:. .:::...:. .:.: . :.. .. .:. .. : . : . :: CCDS58 PVSSLGVLQEDSSNIVELLEEAFNRIRSNLDIRALDSPRGLRTEVTSKMFQK---TRTGS 350 360 370 380 390 420 430 440 450 460 pF1KB9 NGRKCSNISIGDEVQF---EISITSNKC--PKKDSDSFKIRPLGFTEEVEVILQYICE-C . ....: .::. : .. : :. .. .....: .:.. ... ::. : CCDS58 FHIRRGEVGIY-QVQLRALEHVDGTHVCQLPEDQKGNIHLKP-SFSDGLKMDAGIICDVC 400 410 420 430 440 450 470 480 490 500 510 520 pF1KB9 ECQSEGIPESPKCHEGNGTFECGACRCNEGRVGRHCECSTDEVNSEDMDAYCRKENSSEI :. . .: .: :: : :: : :.:: :. :.::: .. :.. : .:. .. CCDS58 TCELQKEVRSARCSF-NGDFVCGQCVCSEGWSGQTCNCSTGSLS--DIQP-CLREGEDKP 460 470 480 490 500 510 530 540 550 560 570 580 pF1KB9 CSNNGECVCGQCVCRKRDNTNEIYSGKFCECDNFNCDRSNGLICGGNGVCKCRVCECNPN ::. ::: ::.::: . : :.::: :::.: :..:..:. : :. : :.:. CCDS58 CSGRGECQCGHCVCYGEGR----YEGQFCEYDNFQCPRTSGFLCNDRGRCSMGQCVCEPG 520 530 540 550 560 590 600 610 620 630 640 pF1KB9 YTGSACDCSLDTSTCEASNGQICNGRGICECGVCKCTDPKFQGQT-CEMCQTCL--GVCA .:: .::: :...:: ::: :::::: :::: :.: . .. .: ::. . . :.: CCDS58 WTGPSCDCPLSNATCIDSNGGICNGRGHCECGRCHCHQQSLYTDTICEINYSAIHPGLCE 570 580 590 600 610 620 650 660 670 680 690 700 pF1KB9 EHKECVQCRAFNKGEKKDTCTQECSYFNITKVESRDKLPQPVQPDPVSHCKEKDVDD-CW . . ::::.:.. :::: .::.. ::. :.: . . : .:. .: :: : CCDS58 DLRSCVQCQAWGTGEKKGRTCEECNF----KVKMVDELKRA--EEVVVRCSFRDEDDDCT 630 640 650 660 670 680 710 720 730 740 750 pF1KB9 FYFTYSVNG----NNEVMVHVVENPECPTGPD--IIPIVAGVVAGIVLIGLALLLIWKLL . .:. .: :. :.:: .. .:: : .::.. .. :..: ::: :: CCDS58 YSYTMEGDGAPGPNSTVLVH--KKKDCPPGSFWWLIPLLLLLLP---LLALLLLLCWKYC 690 700 710 720 730 760 770 780 790 pF1KB9 MIIHDRREFAKFEKEKMNAKWDTGENPIYKSAVTTVVNPKYEGK CCDS58 ACCKACLALLPCCNRGHMVGFKEDHYMLRENLMASDHLDTPMLRSGNLKGRDVVRWKVTN 740 750 760 770 780 790 798 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Fri Nov 4 18:50:55 2016 done: Fri Nov 4 18:50:56 2016 Total Scan time: 3.830 Total Display time: 0.270 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]