Result of FASTA (ccds) for
pF1KB9818
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9818, 309 aa
1>>>pF1KB9818 309 - 309 aa - 309 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3171+/-0.000724; mu= 10.9274+/- 0.044
mean_var=80.0395+/-15.862, 0's: 0 Z-trim(110.1): 49 B-trim: 56 in 1/53
Lambda= 0.143358
statistics sampled from 11348 (11397) to 11348 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.717), E-opt: 0.2 (0.35), width: 16
Scan time: 2.760
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS76051.1 MAGEA1 gene_id:4100|Hs108|chrX ( 309) 2011 425.1 3.4e-119
CCDS14702.1 MAGEA4 gene_id:4103|Hs108|chrX ( 317) 1502 319.8 1.7e-87
CCDS76050.1 MAGEA6 gene_id:4105|Hs108|chrX ( 314) 1334 285.0 4.9e-77
CCDS76045.1 MAGEA3 gene_id:4102|Hs108|chrX ( 314) 1310 280.1 1.5e-75
CCDS76049.1 MAGEA2 gene_id:4101|Hs108|chrX ( 314) 1306 279.3 2.7e-75
CCDS76046.1 MAGEA2B gene_id:266740|Hs108|chrX ( 314) 1306 279.3 2.7e-75
CCDS76048.1 MAGEA12 gene_id:4111|Hs108|chrX ( 314) 1294 276.8 1.5e-74
CCDS14692.1 MAGEA8 gene_id:4107|Hs108|chrX ( 318) 1244 266.4 2e-71
CCDS14691.1 MAGEA9 gene_id:4108|Hs108|chrX ( 315) 1157 248.4 5.2e-66
CCDS35423.1 MAGEA9B gene_id:728269|Hs108|chrX ( 315) 1157 248.4 5.2e-66
CCDS48180.1 MAGEA11 gene_id:4110|Hs108|chrX ( 429) 1011 218.3 8.4e-57
CCDS14705.1 MAGEA10 gene_id:4109|Hs108|chrX ( 369) 1003 216.6 2.3e-56
CCDS43927.1 MAGEB16 gene_id:139604|Hs108|chrX ( 324) 841 183.1 2.5e-46
CCDS14222.1 MAGEB1 gene_id:4112|Hs108|chrX ( 347) 800 174.6 9.5e-44
CCDS14216.1 MAGEB18 gene_id:286514|Hs108|chrX ( 343) 784 171.3 9.4e-43
CCDS14221.1 MAGEB4 gene_id:4115|Hs108|chrX ( 346) 780 170.5 1.7e-42
CCDS14220.1 MAGEB3 gene_id:4114|Hs108|chrX ( 346) 774 169.2 4e-42
CCDS59524.1 MAGEB17 gene_id:645864|Hs108|chrX ( 336) 742 162.6 3.8e-40
CCDS35221.1 MAGEB10 gene_id:139422|Hs108|chrX ( 347) 740 162.2 5.2e-40
CCDS14677.1 MAGEC3 gene_id:139081|Hs108|chrX ( 346) 724 158.9 5.1e-39
CCDS14219.1 MAGEB2 gene_id:4113|Hs108|chrX ( 319) 723 158.7 5.5e-39
CCDS14678.1 MAGEC2 gene_id:51438|Hs108|chrX ( 373) 668 147.3 1.7e-35
CCDS14217.1 MAGEB6 gene_id:158809|Hs108|chrX ( 407) 663 146.3 3.7e-35
CCDS65233.1 MAGEB5 gene_id:347541|Hs108|chrX ( 275) 642 141.9 5.3e-34
CCDS35417.1 MAGEC1 gene_id:9947|Hs108|chrX (1142) 650 143.8 6.1e-34
CCDS10023.1 NSMCE3 gene_id:56160|Hs108|chr15 ( 304) 551 123.1 2.7e-28
CCDS14362.1 MAGED2 gene_id:10916|Hs108|chrX ( 606) 522 117.2 3.2e-26
CCDS14433.1 MAGEE1 gene_id:57692|Hs108|chrX ( 957) 524 117.7 3.6e-26
CCDS14337.1 MAGED1 gene_id:9500|Hs108|chrX ( 778) 507 114.1 3.5e-25
CCDS35279.1 MAGED1 gene_id:9500|Hs108|chrX ( 834) 507 114.1 3.7e-25
CCDS59527.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX ( 309) 495 111.5 8.4e-25
CCDS3269.1 MAGEF1 gene_id:64110|Hs108|chr3 ( 307) 491 110.7 1.5e-24
CCDS43958.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX ( 706) 495 111.6 1.8e-24
CCDS59528.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX (1034) 495 111.7 2.5e-24
CCDS35281.1 MAGED4B gene_id:81557|Hs108|chrX ( 739) 491 110.8 3.3e-24
CCDS48116.1 MAGED4 gene_id:728239|Hs108|chrX ( 739) 491 110.8 3.3e-24
CCDS14338.1 MAGED4B gene_id:81557|Hs108|chrX ( 741) 491 110.8 3.3e-24
CCDS43959.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX (1431) 495 111.7 3.4e-24
CCDS14676.1 MAGEC3 gene_id:139081|Hs108|chrX ( 643) 479 108.3 1.6e-23
CCDS73700.1 MAGEL2 gene_id:54551|Hs108|chr15 (1249) 452 102.8 1.4e-21
CCDS59529.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX ( 962) 438 99.9 8.3e-21
CCDS10014.1 NDN gene_id:4692|Hs108|chr15 ( 321) 376 86.9 2.2e-17
CCDS14431.1 MAGEE2 gene_id:139599|Hs108|chrX ( 523) 379 87.6 2.2e-17
CCDS56602.1 MAGED4B gene_id:81557|Hs108|chrX ( 757) 343 80.2 5.5e-15
CCDS65261.1 MAGED4 gene_id:728239|Hs108|chrX ( 757) 343 80.2 5.5e-15
CCDS14369.1 MAGEH1 gene_id:28986|Hs108|chrX ( 219) 295 70.1 1.7e-12
>>CCDS76051.1 MAGEA1 gene_id:4100|Hs108|chrX (309 aa)
initn: 2011 init1: 2011 opt: 2011 Z-score: 2253.3 bits: 425.1 E(32554): 3.4e-119
Smith-Waterman score: 2011; 100.0% identity (100.0% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MSLEQRSLHCKPEEALEAQQEALGLVCVQAATSSSSPLVLGTLEEVPTAGSTDPPQSPQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 MSLEQRSLHCKPEEALEAQQEALGLVCVQAATSSSSPLVLGTLEEVPTAGSTDPPQSPQG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 ASAFPTTINFTRQRQPSEGSSSREEEGPSTSCILESLFRAVITKKVADLVGFLLLKYRAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 ASAFPTTINFTRQRQPSEGSSSREEEGPSTSCILESLFRAVITKKVADLVGFLLLKYRAR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 EPVTKAEMLESVIKNYKHCFPEIFGKASESLQLVFGIDVKEADPTGHSYVLVTCLGLSYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 EPVTKAEMLESVIKNYKHCFPEIFGKASESLQLVFGIDVKEADPTGHSYVLVTCLGLSYD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 GLLGDNQIMPKTGFLIIVLVMIAMEGGHAPEEEIWEELSVMEVYDGREHSAYGEPRKLLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 GLLGDNQIMPKTGFLIIVLVMIAMEGGHAPEEEIWEELSVMEVYDGREHSAYGEPRKLLT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 QDLVQEKYLEYRQVPDSDPARYEFLWGPRALAETSYVKVLEYVIKVSARVRFFFPSLREA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 QDLVQEKYLEYRQVPDSDPARYEFLWGPRALAETSYVKVLEYVIKVSARVRFFFPSLREA
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 ALREEEEGV
:::::::::
CCDS76 ALREEEEGV
>>CCDS14702.1 MAGEA4 gene_id:4103|Hs108|chrX (317 aa)
initn: 1392 init1: 1392 opt: 1502 Z-score: 1684.2 bits: 319.8 E(32554): 1.7e-87
Smith-Waterman score: 1502; 75.1% identity (88.6% similar) in 317 aa overlap (1-309:1-317)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MSLEQRSLHCKPEEALEAQQEALGLVCVQA--------ATSSSSPLVLGTLEEVPTAGST
:: ::.: ::::::..:::.:::::: .:: :.::::::: :::::::.: :.
CCDS14 MSSEQKSQHCKPEEGVEAQEEALGLVGAQAPTTEEQEAAVSSSSPLVPGTLEEVPAAESA
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 DPPQSPQGASAFPTTINFTRQRQPSEGSSSREEEGPSTSCILESLFRAVITKKVADLVGF
::::::::::.::::.:: :::.:::::.:::::::: ::::: ....:: .:. :
CCDS14 GPPQSPQGASALPTTISFTCWRQPNEGSSSQEEEGPSTSPDAESLFREALSNKVDELAHF
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 LLLKYRAREPVTKAEMLESVIKNYKHCFPEIFGKASESLQLVFGIDVKEADPTGHSYVLV
:: ::::.: :::::::: ::::::.::: :::::::::...:::::::.::....:.::
CCDS14 LLRKYRAKELVTKAEMLERVIKNYKRCFPVIFGKASESLKMIFGIDVKEVDPASNTYTLV
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 TCLGLSYDGLLGDNQIMPKTGFLIIVLVMIAMEGGHAPEEEIWEELSVMEVYDGREHSAY
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CCDS14 TCLGLSYDGLLGNNQIFPKTGLLIIVLGTIAMEGDSASEEEIWEELGVMGVYDGREHTVY
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 GEPRKLLTQDLVQEKYLEYRQVPDSDPARYEFLWGPRALAETSYVKVLEYVIKVSARVRF
:::::::::: :::.:::::::: :.:::::::::::::::::::::::.:..:.::::.
CCDS14 GEPRKLLTQDWVQENYLEYRQVPGSNPARYEFLWGPRALAETSYVKVLEHVVRVNARVRI
250 260 270 280 290 300
300
pF1KB9 FFPSLREAALREEEEGV
.:::::::: ::::::
CCDS14 AYPSLREAALLEEEEGV
310
>>CCDS76050.1 MAGEA6 gene_id:4105|Hs108|chrX (314 aa)
initn: 1221 init1: 1221 opt: 1334 Z-score: 1496.5 bits: 285.0 E(32554): 4.9e-77
Smith-Waterman score: 1334; 67.8% identity (83.4% similar) in 314 aa overlap (1-307:1-314)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MSLEQRSLHCKPEEALEAQQEALGLVCVQA-------ATSSSSPLVLGTLEEVPTAGSTD
: ::::: ::::::.:::. :::::: .:: :.:::: :: :: :::.: : :
CCDS76 MPLEQRSQHCKPEEGLEARGEALGLVGAQAPATEEQEAASSSSTLVEVTLGEVPAAESPD
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 PPQSPQGASAFPTTINFTRQRQPSEGSSSREEEGPSTSCILESLFRAVITKKVADLVGFL
:::::::::..:::.:. : : ::..::::::: ::: :.:....::: :: ::
CCDS76 PPQSPQGASSLPTTMNYPLWSQSYEDSSNQEEEGPSTFPDLESEFQAALSRKVAKLVHFL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 LLKYRAREPVTKAEMLESVIKNYKHCFPEIFGKASESLQLVFGIDVKEADPTGHSYVLVT
:::::::::::::::: ::. :... :: ::.:::.::::::::.. :.:: :: :...:
CCDS76 LLKYRAREPVTKAEMLGSVVGNWQYFFPVIFSKASDSLQLVFGIELMEVDPIGHVYIFAT
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 CLGLSYDGLLGDNQIMPKTGFLIIVLVMIAMEGGHAPEEEIWEELSVMEVYDGREHSAYG
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CCDS76 CLGLSYDGLLGDNQIMPKTGFLIIILAIIAKEGDCAPEEKIWEELSVLEVFEGREDSIFG
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 EPRKLLTQDLVQEKYLEYRQVPDSDPARYEFLWGPRALAETSYVKVLEYVIKVSARVRFF
.:.::::: .:::.:::::::: :::: :::::::::: ::::::::....:.:. :.
CCDS76 DPKKLLTQYFVQENYLEYRQVPGSDPACYEFLWGPRALIETSYVKVLHHMVKISGGPRIS
250 260 270 280 290 300
300
pF1KB9 FPSLREAALREEEEGV
.: :.: :::: ::
CCDS76 YPLLHEWALREGEE
310
>>CCDS76045.1 MAGEA3 gene_id:4102|Hs108|chrX (314 aa)
initn: 1197 init1: 1197 opt: 1310 Z-score: 1469.6 bits: 280.1 E(32554): 1.5e-75
Smith-Waterman score: 1310; 66.9% identity (83.4% similar) in 314 aa overlap (1-307:1-314)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MSLEQRSLHCKPEEALEAQQEALGLVCVQA-------ATSSSSPLVLGTLEEVPTAGSTD
: ::::: ::::::.:::. :::::: .:: :.:::: :: :: :::.: : :
CCDS76 MPLEQRSQHCKPEEGLEARGEALGLVGAQAPATEEQEAASSSSTLVEVTLGEVPAAESPD
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 PPQSPQGASAFPTTINFTRQRQPSEGSSSREEEGPSTSCILESLFRAVITKKVADLVGFL
:::::::::..:::.:. : : ::..::::::: ::: :.:....:::.:: ::
CCDS76 PPQSPQGASSLPTTMNYPLWSQSYEDSSNQEEEGPSTFPDLESEFQAALSRKVAELVHFL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 LLKYRAREPVTKAEMLESVIKNYKHCFPEIFGKASESLQLVFGIDVKEADPTGHSYVLVT
:::::::::::::::: ::. :... :: ::.::: ::::::::.. :.:: :: :...:
CCDS76 LLKYRAREPVTKAEMLGSVVGNWQYFFPVIFSKASSSLQLVFGIELMEVDPIGHLYIFAT
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 CLGLSYDGLLGDNQIMPKTGFLIIVLVMIAMEGGHAPEEEIWEELSVMEVYDGREHSAYG
::::::::::::::::::.:.:::::..:: :: ::::.:::::::.::..::: : :
CCDS76 CLGLSYDGLLGDNQIMPKAGLLIIVLAIIAREGDCAPEEKIWEELSVLEVFEGREDSILG
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 EPRKLLTQDLVQEKYLEYRQVPDSDPARYEFLWGPRALAETSYVKVLEYVIKVSARVRFF
.:.::::: .:::.:::::::: :::: ::::::::::.::::::::....:.:. ..
CCDS76 DPKKLLTQHFVQENYLEYRQVPGSDPACYEFLWGPRALVETSYVKVLHHMVKISGGPHIS
250 260 270 280 290 300
300
pF1KB9 FPSLREAALREEEEGV
.: :.: .::: ::
CCDS76 YPPLHEWVLREGEE
310
>>CCDS76049.1 MAGEA2 gene_id:4101|Hs108|chrX (314 aa)
initn: 1193 init1: 1193 opt: 1306 Z-score: 1465.2 bits: 279.3 E(32554): 2.7e-75
Smith-Waterman score: 1306; 67.5% identity (84.4% similar) in 314 aa overlap (1-307:1-314)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MSLEQRSLHCKPEEALEAQQEALGLVCVQA-AT------SSSSPLVLGTLEEVPTAGSTD
: ::::: ::::::.:::. :::::: .:: :: :::: :: :: :::.: : .
CCDS76 MPLEQRSQHCKPEEGLEARGEALGLVGAQAPATEEQQTASSSSTLVEVTLGEVPAADSPS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 PPQSPQGASAFPTTINFTRQRQPSEGSSSREEEGPSTSCILESLFRAVITKKVADLVGFL
::.::::::.: ::::.: :: .::::..::::: ::: :.:.:..:...:: ::
CCDS76 PPHSPQGASSFSTTINYTLWRQSDEGSSNQEEEGPRMFPDLESEFQAAISRKMVELVHFL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 LLKYRAREPVTKAEMLESVIKNYKHCFPEIFGKASESLQLVFGIDVKEADPTGHSYVLVT
:::::::::::::::::::..: . :: ::.:::: :::::::.: :. : .: :.:::
CCDS76 LLKYRAREPVTKAEMLESVLRNCQDFFPVIFSKASEYLQLVFGIEVVEVVPISHLYILVT
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 CLGLSYDGLLGDNQIMPKTGFLIIVLVMIAMEGGHAPEEEIWEELSVMEVYDGREHSAYG
::::::::::::::.:::::.:::::..::.:: ::::.::::::..::..::: :...
CCDS76 CLGLSYDGLLGDNQVMPKTGLLIIVLAIIAIEGDCAPEEKIWEELSMLEVFEGREDSVFA
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 EPRKLLTQDLVQEKYLEYRQVPDSDPARYEFLWGPRALAETSYVKVLEYVIKVSARVRFF
.::::: ::::::.:::::::: :::: :::::::::: ::::::::....:.... ..
CCDS76 HPRKLLMQDLVQENYLEYRQVPGSDPACYEFLWGPRALIETSYVKVLHHTLKIGGEPHIS
250 260 270 280 290 300
300
pF1KB9 FPSLREAALREEEEGV
.: :.: :::: ::
CCDS76 YPPLHERALREGEE
310
>>CCDS76046.1 MAGEA2B gene_id:266740|Hs108|chrX (314 aa)
initn: 1193 init1: 1193 opt: 1306 Z-score: 1465.2 bits: 279.3 E(32554): 2.7e-75
Smith-Waterman score: 1306; 67.5% identity (84.4% similar) in 314 aa overlap (1-307:1-314)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MSLEQRSLHCKPEEALEAQQEALGLVCVQA-AT------SSSSPLVLGTLEEVPTAGSTD
: ::::: ::::::.:::. :::::: .:: :: :::: :: :: :::.: : .
CCDS76 MPLEQRSQHCKPEEGLEARGEALGLVGAQAPATEEQQTASSSSTLVEVTLGEVPAADSPS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 PPQSPQGASAFPTTINFTRQRQPSEGSSSREEEGPSTSCILESLFRAVITKKVADLVGFL
::.::::::.: ::::.: :: .::::..::::: ::: :.:.:..:...:: ::
CCDS76 PPHSPQGASSFSTTINYTLWRQSDEGSSNQEEEGPRMFPDLESEFQAAISRKMVELVHFL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 LLKYRAREPVTKAEMLESVIKNYKHCFPEIFGKASESLQLVFGIDVKEADPTGHSYVLVT
:::::::::::::::::::..: . :: ::.:::: :::::::.: :. : .: :.:::
CCDS76 LLKYRAREPVTKAEMLESVLRNCQDFFPVIFSKASEYLQLVFGIEVVEVVPISHLYILVT
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 CLGLSYDGLLGDNQIMPKTGFLIIVLVMIAMEGGHAPEEEIWEELSVMEVYDGREHSAYG
::::::::::::::.:::::.:::::..::.:: ::::.::::::..::..::: :...
CCDS76 CLGLSYDGLLGDNQVMPKTGLLIIVLAIIAIEGDCAPEEKIWEELSMLEVFEGREDSVFA
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 EPRKLLTQDLVQEKYLEYRQVPDSDPARYEFLWGPRALAETSYVKVLEYVIKVSARVRFF
.::::: ::::::.:::::::: :::: :::::::::: ::::::::....:.... ..
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300
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310
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CCDS76 HPRKLLTQDLVQENYLEYRQVPGSDPACYEFLWGPRALVETSYVKVLHHLLKISGGPHIS
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300
pF1KB9 FPSLREAALREEEEGV
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CCDS76 YPPLHEWAFREGEE
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CCDS14 RFLLRKYQIKEPVTKAEMLESVIKNYKNHFPDIFSKASECMQVIFGIDVKEVDPAGHSYI
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CCDS14 VYWKLRKLLTQEWVQENYLEYRQAPGSDPVRYEFLWGPRALAETSYVKVLEHVVRVNARV
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pF1KB9 RFFFPSLREAALREEEEGV
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CCDS14 RISYPSLHEEALGEEK-GV
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CCDS14 PQGGASSSISVYYTLWSQFDEGSSSQEEEEPSSSVDPAQLEFMFQEALKLKVAELVHFLL
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CCDS14 HKYRVKEPVTKAEMLESVIKNYKRYFPVIFGKASEFMQVIFGTDVKEVDPAGHSYILVTA
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CCDS14 LGLSCDSMLGDGHSMPKAALLIIVLGVILTKDNCAPEEVIWEALSVMGVYVGKEHMFYGE
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CCDS14 PRKLLTQDWVQENYLEYRQVPGSDPAHYEFLWGSKAHAETSYEKVINYLVMLNAREPICY
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pF1KB9 PSLREAALREEEEGV
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CCDS14 PSLYEEVLGEEQEGV
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CCDS35 MSLEQRSPHCKPDEDLEAQGEDLGLMGAQEPTGEEEETTSSSDSKEEEVSAAGSSSPPQS
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CCDS35 PQGGASSSISVYYTLWSQFDEGSSSQEEEEPSSSVDPAQLEFMFQEALKLKVAELVHFLL
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CCDS35 HKYRVKEPVTKAEMLESVIKNYKRYFPVIFGKASEFMQVIFGTDVKEVDPAGHSYILVTA
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CCDS35 LGLSCDSMLGDGHSMPKAALLIIVLGVILTKDNCAPEEVIWEALSVMGVYVGKEHMFYGE
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240 250 260 270 280 290
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CCDS35 PRKLLTQDWVQENYLEYRQVPGSDPAHYEFLWGSKAHAETSYEKVINYLVMLNAREPICY
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CCDS35 PSLYEEVLGEEQEGV
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]