Result of FASTA (ccds) for
pF1KB9825
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9825, 317 aa
1>>>pF1KB9825 317 - 317 aa - 317 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.5171+/-0.000792; mu= 6.4462+/- 0.048
mean_var=122.2961+/-24.262, 0's: 0 Z-trim(112.3): 47 B-trim: 3 in 1/51
Lambda= 0.115976
statistics sampled from 13000 (13046) to 13000 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.748), E-opt: 0.2 (0.401), width: 16
Scan time: 2.730
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14702.1 MAGEA4 gene_id:4103|Hs108|chrX ( 317) 2062 355.5 3.2e-98
CCDS76051.1 MAGEA1 gene_id:4100|Hs108|chrX ( 309) 1507 262.6 2.9e-70
CCDS14692.1 MAGEA8 gene_id:4107|Hs108|chrX ( 318) 1395 243.9 1.3e-64
CCDS76050.1 MAGEA6 gene_id:4105|Hs108|chrX ( 314) 1387 242.5 3.2e-64
CCDS76045.1 MAGEA3 gene_id:4102|Hs108|chrX ( 314) 1376 240.7 1.1e-63
CCDS76046.1 MAGEA2B gene_id:266740|Hs108|chrX ( 314) 1369 239.5 2.6e-63
CCDS76049.1 MAGEA2 gene_id:4101|Hs108|chrX ( 314) 1369 239.5 2.6e-63
CCDS76048.1 MAGEA12 gene_id:4111|Hs108|chrX ( 314) 1368 239.3 2.9e-63
CCDS35423.1 MAGEA9B gene_id:728269|Hs108|chrX ( 315) 1261 221.4 7.1e-58
CCDS14691.1 MAGEA9 gene_id:4108|Hs108|chrX ( 315) 1261 221.4 7.1e-58
CCDS48180.1 MAGEA11 gene_id:4110|Hs108|chrX ( 429) 1248 219.3 4.2e-57
CCDS14705.1 MAGEA10 gene_id:4109|Hs108|chrX ( 369) 1011 179.6 3.2e-45
CCDS43927.1 MAGEB16 gene_id:139604|Hs108|chrX ( 324) 914 163.4 2.2e-40
CCDS14222.1 MAGEB1 gene_id:4112|Hs108|chrX ( 347) 856 153.7 1.9e-37
CCDS14216.1 MAGEB18 gene_id:286514|Hs108|chrX ( 343) 800 144.3 1.3e-34
CCDS59524.1 MAGEB17 gene_id:645864|Hs108|chrX ( 336) 795 143.5 2.2e-34
CCDS14221.1 MAGEB4 gene_id:4115|Hs108|chrX ( 346) 791 142.8 3.6e-34
CCDS14220.1 MAGEB3 gene_id:4114|Hs108|chrX ( 346) 788 142.3 5.2e-34
CCDS14219.1 MAGEB2 gene_id:4113|Hs108|chrX ( 319) 777 140.5 1.7e-33
CCDS35221.1 MAGEB10 gene_id:139422|Hs108|chrX ( 347) 757 137.1 1.9e-32
CCDS14677.1 MAGEC3 gene_id:139081|Hs108|chrX ( 346) 750 136.0 4.2e-32
CCDS14678.1 MAGEC2 gene_id:51438|Hs108|chrX ( 373) 746 135.3 7.2e-32
CCDS14217.1 MAGEB6 gene_id:158809|Hs108|chrX ( 407) 671 122.8 4.7e-28
CCDS35417.1 MAGEC1 gene_id:9947|Hs108|chrX (1142) 676 123.8 6.4e-28
CCDS65233.1 MAGEB5 gene_id:347541|Hs108|chrX ( 275) 644 118.2 7.6e-27
CCDS10023.1 NSMCE3 gene_id:56160|Hs108|chr15 ( 304) 581 107.7 1.2e-23
CCDS14433.1 MAGEE1 gene_id:57692|Hs108|chrX ( 957) 507 95.5 1.8e-19
CCDS14362.1 MAGED2 gene_id:10916|Hs108|chrX ( 606) 500 94.2 2.7e-19
CCDS59527.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX ( 309) 490 92.4 4.8e-19
CCDS14337.1 MAGED1 gene_id:9500|Hs108|chrX ( 778) 496 93.6 5.3e-19
CCDS43958.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX ( 706) 495 93.4 5.5e-19
CCDS35279.1 MAGED1 gene_id:9500|Hs108|chrX ( 834) 496 93.6 5.7e-19
CCDS3269.1 MAGEF1 gene_id:64110|Hs108|chr3 ( 307) 485 91.6 8.5e-19
CCDS43959.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX (1431) 495 93.5 1e-18
CCDS59528.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX (1034) 490 92.7 1.4e-18
CCDS14676.1 MAGEC3 gene_id:139081|Hs108|chrX ( 643) 485 91.7 1.6e-18
CCDS35281.1 MAGED4B gene_id:81557|Hs108|chrX ( 739) 482 91.3 2.6e-18
CCDS48116.1 MAGED4 gene_id:728239|Hs108|chrX ( 739) 482 91.3 2.6e-18
CCDS14338.1 MAGED4B gene_id:81557|Hs108|chrX ( 741) 482 91.3 2.6e-18
CCDS73700.1 MAGEL2 gene_id:54551|Hs108|chr15 (1249) 463 88.2 3.7e-17
CCDS59529.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX ( 962) 452 86.3 1.1e-16
CCDS10014.1 NDN gene_id:4692|Hs108|chr15 ( 321) 421 80.9 1.5e-15
CCDS14431.1 MAGEE2 gene_id:139599|Hs108|chrX ( 523) 387 75.3 1.2e-13
CCDS14369.1 MAGEH1 gene_id:28986|Hs108|chrX ( 219) 332 65.9 3.2e-11
CCDS56602.1 MAGED4B gene_id:81557|Hs108|chrX ( 757) 337 67.0 5.3e-11
CCDS65261.1 MAGED4 gene_id:728239|Hs108|chrX ( 757) 337 67.0 5.3e-11
>>CCDS14702.1 MAGEA4 gene_id:4103|Hs108|chrX (317 aa)
initn: 2062 init1: 2062 opt: 2062 Z-score: 1876.7 bits: 355.5 E(32554): 3.2e-98
Smith-Waterman score: 2062; 99.7% identity (100.0% similar) in 317 aa overlap (1-317:1-317)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MSSEQKSQHCKPEEGVEAQEEALGLVGAQAPTTEEQEAAVSSSSPLVPGTLEEVPAAESA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MSSEQKSQHCKPEEGVEAQEEALGLVGAQAPTTEEQEAAVSSSSPLVPGTLEEVPAAESA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 GPPQSPQGASALPTTISFTCWRQPNEGSSSQEEEGPSTSPDAESLFREALSNKVDELAHF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GPPQSPQGASALPTTISFTCWRQPNEGSSSQEEEGPSTSPDAESLFREALSNKVDELAHF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 LLRKYRAKELVTKAEMLERVIKNYKRCFPVIFGKASESLKMIFGIDVKEVDPTSNTYTLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::
CCDS14 LLRKYRAKELVTKAEMLERVIKNYKRCFPVIFGKASESLKMIFGIDVKEVDPASNTYTLV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 TCLGLSYDGLLGNNQIFPKTGLLIIVLGTIAMEGDSASEEEIWEELGVMGVYDGREHTVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TCLGLSYDGLLGNNQIFPKTGLLIIVLGTIAMEGDSASEEEIWEELGVMGVYDGREHTVY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 GEPRKLLTQDWVQENYLEYRQVPGSNPARYEFLWGPRALAETSYVKVLEHVVRVNARVRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GEPRKLLTQDWVQENYLEYRQVPGSNPARYEFLWGPRALAETSYVKVLEHVVRVNARVRI
250 260 270 280 290 300
310
pF1KB9 AYPSLREAALLEEEEGV
:::::::::::::::::
CCDS14 AYPSLREAALLEEEEGV
310
>>CCDS76051.1 MAGEA1 gene_id:4100|Hs108|chrX (309 aa)
initn: 1397 init1: 1397 opt: 1507 Z-score: 1375.0 bits: 262.6 E(32554): 2.9e-70
Smith-Waterman score: 1507; 75.4% identity (88.6% similar) in 317 aa overlap (1-317:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MSSEQKSQHCKPEEGVEAQEEALGLVGAQAPTTEEQEAAVSSSSPLVPGTLEEVPAAESA
:: ::.: ::::::..:::.:::::: .:: :.::::::: :::::::.: :.
CCDS76 MSLEQRSLHCKPEEALEAQQEALGLVCVQA--------ATSSSSPLVLGTLEEVPTAGST
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 GPPQSPQGASALPTTISFTCWRQPNEGSSSQEEEGPSTSPDAESLFREALSNKVDELAHF
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CCDS76 DPPQSPQGASAFPTTINFTRQRQPSEGSSSREEEGPSTSCILESLFRAVITKKVADLVGF
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 LLRKYRAKELVTKAEMLERVIKNYKRCFPVIFGKASESLKMIFGIDVKEVDPTSNTYTLV
:: ::::.: :::::::: ::::::.::: :::::::::...:::::::.:::...:.::
CCDS76 LLLKYRAREPVTKAEMLESVIKNYKHCFPEIFGKASESLQLVFGIDVKEADPTGHSYVLV
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 TCLGLSYDGLLGNNQIFPKTGLLIIVLGTIAMEGDSASEEEIWEELGVMGVYDGREHTVY
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CCDS76 TCLGLSYDGLLGDNQIMPKTGFLIIVLVMIAMEGGHAPEEEIWEELSVMEVYDGREHSAY
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 GEPRKLLTQDWVQENYLEYRQVPGSNPARYEFLWGPRALAETSYVKVLEHVVRVNARVRI
:::::::::: :::.:::::::: :.:::::::::::::::::::::::.:..:.::::.
CCDS76 GEPRKLLTQDLVQEKYLEYRQVPDSDPARYEFLWGPRALAETSYVKVLEYVIKVSARVRF
240 250 260 270 280 290
310
pF1KB9 AYPSLREAALLEEEEGV
.:::::::: ::::::
CCDS76 FFPSLREAALREEEEGV
300
>>CCDS14692.1 MAGEA8 gene_id:4107|Hs108|chrX (318 aa)
initn: 1298 init1: 1053 opt: 1395 Z-score: 1273.6 bits: 243.9 E(32554): 1.3e-64
Smith-Waterman score: 1395; 71.8% identity (85.4% similar) in 316 aa overlap (5-317:5-318)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MSSEQKSQHCKPEEGVEAQEEALGLVGAQAPTTEEQEAAVSSSSPLVPGTLEEVPAAESA
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CCDS14 MLLGQKSQRYKAEEGLQAQGEAPGLMDVQIPTAEEQKAA-SSSSTLIMGTLEEVTDSGSP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB9 GPPQSPQGASALPTTISFTCWRQPNEGSSSQEEEGPSTSPDA---ESLFREALSNKVDEL
.:::::.:::. :. . : : : .:::::.:::::::::: ::::::::..:: ::
CCDS14 SPPQSPEGASSSLTVTDSTLWSQSDEGSSSNEEEGPSTSPDPAHLESLFREALDEKVAEL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 AHFLLRKYRAKELVTKAEMLERVIKNYKRCFPVIFGKASESLKMIFGIDVKEVDPTSNTY
..::::::. :: :::::::: :::::: :: ::.:::: ...:::::::::::....:
CCDS14 VRFLLRKYQIKEPVTKAEMLESVIKNYKNHFPDIFSKASECMQVIFGIDVKEVDPAGHSY
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 TLVTCLGLSYDGLLGNNQIFPKTGLLIIVLGTIAMEGDSASEEEIWEELGVMGVYDGREH
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CCDS14 ILVTCLGLSYDGLLGDDQSTPKTGLLIIVLGMILMEGSRAPEEAIWEALSVMGLYDGREH
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 TVYGEPRKLLTQDWVQENYLEYRQVPGSNPARYEFLWGPRALAETSYVKVLEHVVRVNAR
.:: . ::::::.:::::::::::.:::.:.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SVYWKLRKLLTQEWVQENYLEYRQAPGSDPVRYEFLWGPRALAETSYVKVLEHVVRVNAR
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KB9 VRIAYPSLREAALLEEEEGV
:::.::::.: :: ::.::
CCDS14 VRISYPSLHEEAL-GEEKGV
300 310
>>CCDS76050.1 MAGEA6 gene_id:4105|Hs108|chrX (314 aa)
initn: 1204 init1: 1204 opt: 1387 Z-score: 1266.4 bits: 242.5 E(32554): 3.2e-64
Smith-Waterman score: 1387; 68.3% identity (85.1% similar) in 315 aa overlap (1-315:1-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MSSEQKSQHCKPEEGVEAQEEALGLVGAQAPTTEEQEAAVSSSSPLVPGTLEEVPAAESA
: ::.:::::::::.::. :::::::::::.::::::: :::: :: :: :::::::
CCDS76 MPLEQRSQHCKPEEGLEARGEALGLVGAQAPATEEQEAA-SSSSTLVEVTLGEVPAAESP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 GPPQSPQGASALPTTISFTCWRQPNEGSSSQEEEGPSTSPDAESLFREALSNKVDELAHF
:::::::::.::::... : : : ::.:::::::: :: :: :. ::: :: .:.::
CCDS76 DPPQSPQGASSLPTTMNYPLWSQSYEDSSNQEEEGPSTFPDLESEFQAALSRKVAKLVHF
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 LLRKYRAKELVTKAEMLERVIKNYKRCFPVIFGKASESLKMIFGIDVKEVDPTSNTYTLV
:: ::::.: ::::::: :. :.. :::::.:::.::...:::.. :::: ...: ..
CCDS76 LLLKYRAREPVTKAEMLGSVVGNWQYFFPVIFSKASDSLQLVFGIELMEVDPIGHVYIFA
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 TCLGLSYDGLLGNNQIFPKTGLLIIVLGTIAMEGDSASEEEIWEELGVMGVYDGREHTVY
::::::::::::.:::.::::.:::.:. :: ::: : ::.:::::.:. :..::: ...
CCDS76 TCLGLSYDGLLGDNQIMPKTGFLIIILAIIAKEGDCAPEEKIWEELSVLEVFEGREDSIF
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 GEPRKLLTQDWVQENYLEYRQVPGSNPARYEFLWGPRALAETSYVKVLEHVVRVNARVRI
:.:.::::: .::::::::::::::.:: :::::::::: ::::::::.:.:.... ::
CCDS76 GDPKKLLTQYFVQENYLEYRQVPGSDPACYEFLWGPRALIETSYVKVLHHMVKISGGPRI
240 250 260 270 280 290
310
pF1KB9 AYPSLREAALLEEEEGV
.:: :.: :: : ::
CCDS76 SYPLLHEWALREGEE
300 310
>>CCDS76045.1 MAGEA3 gene_id:4102|Hs108|chrX (314 aa)
initn: 1193 init1: 1193 opt: 1376 Z-score: 1256.5 bits: 240.7 E(32554): 1.1e-63
Smith-Waterman score: 1376; 68.3% identity (84.4% similar) in 315 aa overlap (1-315:1-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MSSEQKSQHCKPEEGVEAQEEALGLVGAQAPTTEEQEAAVSSSSPLVPGTLEEVPAAESA
: ::.:::::::::.::. :::::::::::.::::::: :::: :: :: :::::::
CCDS76 MPLEQRSQHCKPEEGLEARGEALGLVGAQAPATEEQEAA-SSSSTLVEVTLGEVPAAESP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 GPPQSPQGASALPTTISFTCWRQPNEGSSSQEEEGPSTSPDAESLFREALSNKVDELAHF
:::::::::.::::... : : : ::.:::::::: :: :: :. ::: :: ::.::
CCDS76 DPPQSPQGASSLPTTMNYPLWSQSYEDSSNQEEEGPSTFPDLESEFQAALSRKVAELVHF
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 LLRKYRAKELVTKAEMLERVIKNYKRCFPVIFGKASESLKMIFGIDVKEVDPTSNTYTLV
:: ::::.: ::::::: :. :.. :::::.::: ::...:::.. :::: .. : ..
CCDS76 LLLKYRAREPVTKAEMLGSVVGNWQYFFPVIFSKASSSLQLVFGIELMEVDPIGHLYIFA
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 TCLGLSYDGLLGNNQIFPKTGLLIIVLGTIAMEGDSASEEEIWEELGVMGVYDGREHTVY
::::::::::::.:::.::.:::::::. :: ::: : ::.:::::.:. :..::: ..
CCDS76 TCLGLSYDGLLGDNQIMPKAGLLIIVLAIIAREGDCAPEEKIWEELSVLEVFEGREDSIL
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 GEPRKLLTQDWVQENYLEYRQVPGSNPARYEFLWGPRALAETSYVKVLEHVVRVNARVRI
:.:.::::: .::::::::::::::.:: ::::::::::.::::::::.:.:.... .:
CCDS76 GDPKKLLTQHFVQENYLEYRQVPGSDPACYEFLWGPRALVETSYVKVLHHMVKISGGPHI
240 250 260 270 280 290
310
pF1KB9 AYPSLREAALLEEEEGV
.:: :.: .: : ::
CCDS76 SYPPLHEWVLREGEE
300 310
>>CCDS76046.1 MAGEA2B gene_id:266740|Hs108|chrX (314 aa)
initn: 1190 init1: 1190 opt: 1369 Z-score: 1250.2 bits: 239.5 E(32554): 2.6e-63
Smith-Waterman score: 1369; 67.6% identity (85.4% similar) in 315 aa overlap (1-315:1-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MSSEQKSQHCKPEEGVEAQEEALGLVGAQAPTTEEQEAAVSSSSPLVPGTLEEVPAAESA
: ::.:::::::::.::. :::::::::::.::::..: :::: :: :: :::::.:
CCDS76 MPLEQRSQHCKPEEGLEARGEALGLVGAQAPATEEQQTA-SSSSTLVEVTLGEVPAADSP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 GPPQSPQGASALPTTISFTCWRQPNEGSSSQEEEGPSTSPDAESLFREALSNKVDELAHF
.::.::::::.. :::..: ::: .::::.:::::: :: :: :. :.: :. ::.::
CCDS76 SPPHSPQGASSFSTTINYTLWRQSDEGSSNQEEEGPRMFPDLESEFQAAISRKMVELVHF
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 LLRKYRAKELVTKAEMLERVIKNYKRCFPVIFGKASESLKMIFGIDVKEVDPTSNTYTLV
:: ::::.: :::::::: :..: . :::::.:::: :...:::.: :: : :. : ::
CCDS76 LLLKYRAREPVTKAEMLESVLRNCQDFFPVIFSKASEYLQLVFGIEVVEVVPISHLYILV
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 TCLGLSYDGLLGNNQIFPKTGLLIIVLGTIAMEGDSASEEEIWEELGVMGVYDGREHTVY
::::::::::::.::..::::::::::. ::.::: : ::.:::::... :..::: .:.
CCDS76 TCLGLSYDGLLGDNQVMPKTGLLIIVLAIIAIEGDCAPEEKIWEELSMLEVFEGREDSVF
180 190 200 210 220 230
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CCDS76 SYPPLHERALREGEE
300 310
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CCDS76 TCLGLSYDGLLGDNQIVPKTGLLIIVLAIIAKEGDCAPEEKIWEELSVLEASDGREDSVF
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pF1KB9 GEPRKLLTQDWVQENYLEYRQVPGSNPARYEFLWGPRALAETSYVKVLEHVVRVNARVRI
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CCDS76 AHPRKLLTQDLVQENYLEYRQVPGSDPACYEFLWGPRALVETSYVKVLHHLLKISGGPHI
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pF1KB9 AYPSLREAALLEEEEGV
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CCDS76 SYPPLHEWAFREGEE
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pF1KB9 TLVTCLGLSYDGLLGNNQIFPKTGLLIIVLGTIAMEGDSASEEEIWEELGVMGVYDGREH
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CCDS35 MFYGEPRKLLTQDWVQENYLEYRQVPGSDPAHYEFLWGSKAHAETSYEKVINYLVMLNAR
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CCDS35 EPICYPSLYEEVLGEEQEGV
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CCDS14 MSLEQRSPHCKPDEDLEAQGEDLGLMGAQEPTGEEEETTSSSDS-----KEEEVSAAGSS
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pF1KB9 GPPQSPQGASALPTTISFTCWRQPNEGSSSQEEEGPSTSPDA---ESLFREALSNKVDEL
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CCDS14 SPPQSPQGGASSSISVYYTLWSQFDEGSSSQEEEEPSSSVDPAQLEFMFQEALKLKVAEL
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pF1KB9 AHFLLRKYRAKELVTKAEMLERVIKNYKRCFPVIFGKASESLKMIFGIDVKEVDPTSNTY
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CCDS14 VHFLLHKYRVKEPVTKAEMLESVIKNYKRYFPVIFGKASEFMQVIFGTDVKEVDPAGHSY
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CCDS14 ILVTALGLSCDSMLGDGHSMPKAALLIIVLGVILTKDNCAPEEVIWEALSVMGVYVGKEH
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CCDS14 MFYGEPRKLLTQDWVQENYLEYRQVPGSDPAHYEFLWGSKAHAETSYEKVINYLVMLNAR
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CCDS14 EPICYPSLYEEVLGEEQEGV
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]