FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB9828, 330 aa 1>>>pF1KB9828 330 - 330 aa - 330 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2307+/-0.000861; mu= 16.0372+/- 0.051 mean_var=108.4848+/-32.034, 0's: 0 Z-trim(106.4): 261 B-trim: 1053 in 2/48 Lambda= 0.123137 statistics sampled from 8519 (8940) to 8519 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.625), E-opt: 0.2 (0.275), width: 16 Scan time: 2.680 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS12461.1 FFAR2 gene_id:2867|Hs108|chr19 ( 330) 2187 399.7 1.7e-111 CCDS12459.1 FFAR3 gene_id:2865|Hs108|chr19 ( 346) 857 163.5 2.3e-40 CCDS14115.1 P2RY8 gene_id:286530|Hs108|chrX ( 359) 443 89.9 3.3e-18 CCDS14115.1 P2RY8 gene_id:286530|Hs108|chrY ( 359) 443 89.9 3.3e-18 CCDS4032.1 F2R gene_id:2149|Hs108|chr5 ( 425) 427 87.2 2.6e-17 CCDS12458.1 FFAR1 gene_id:2864|Hs108|chr19 ( 300) 424 86.5 3e-17 CCDS318.1 PTAFR gene_id:5724|Hs108|chr1 ( 342) 392 80.8 1.7e-15 CCDS58959.1 F2RL2 gene_id:2151|Hs108|chr5 ( 352) 376 78.0 1.2e-14 CCDS4031.1 F2RL2 gene_id:2151|Hs108|chr5 ( 374) 376 78.1 1.3e-14 CCDS12350.1 F2RL3 gene_id:9002|Hs108|chr19 ( 385) 374 77.7 1.7e-14 CCDS14398.1 P2RY4 gene_id:5030|Hs108|chrX ( 365) 373 77.5 1.8e-14 CCDS4033.1 F2RL1 gene_id:2150|Hs108|chr5 ( 397) 372 77.4 2.2e-14 CCDS14439.1 CYSLTR1 gene_id:10800|Hs108|chrX ( 337) 351 73.6 2.6e-13 CCDS8553.1 LPAR5 gene_id:57121|Hs108|chr12 ( 372) 351 73.6 2.8e-13 CCDS7950.1 APLNR gene_id:187|Hs108|chr11 ( 380) 341 71.8 9.6e-13 CCDS9482.1 OXGR1 gene_id:27199|Hs108|chr13 ( 337) 339 71.4 1.1e-12 CCDS14441.1 LPAR4 gene_id:2846|Hs108|chrX ( 370) 327 69.3 5.3e-12 CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14 ( 391) 326 69.2 6.2e-12 CCDS3169.1 P2RY1 gene_id:5028|Hs108|chr3 ( 373) 322 68.5 9.9e-12 CCDS2148.1 GPR17 gene_id:2840|Hs108|chr2 ( 367) 321 68.3 1.1e-11 CCDS8219.1 P2RY2 gene_id:5029|Hs108|chr11 ( 377) 321 68.3 1.1e-11 CCDS12669.1 GPR4 gene_id:2828|Hs108|chr19 ( 362) 319 67.9 1.4e-11 CCDS9491.1 GPR18 gene_id:2841|Hs108|chr13 ( 331) 318 67.7 1.5e-11 CCDS10429.1 SSTR5 gene_id:6755|Hs108|chr16 ( 364) 310 66.3 4.3e-11 CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20 ( 388) 310 66.3 4.4e-11 CCDS9879.1 GPR65 gene_id:8477|Hs108|chr14 ( 337) 309 66.1 4.6e-11 CCDS5298.1 CCR6 gene_id:1235|Hs108|chr6 ( 374) 304 65.3 9.1e-11 >>CCDS12461.1 FFAR2 gene_id:2867|Hs108|chr19 (330 aa) initn: 2187 init1: 2187 opt: 2187 Z-score: 2115.3 bits: 399.7 E(32554): 1.7e-111 Smith-Waterman score: 2187; 99.7% identity (99.7% similar) in 330 aa overlap (1-330:1-330) 10 20 30 40 50 60 pF1KB9 MLPDWKSSLILMAYIIIFLTGLPANLLALRAFVGRIRQPQPAPVHILLLSLTLADLLLLL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 MLPDWKSSLILMAYIIIFLTGLPANLLALRAFVGRIRQPQPAPVHILLLSLTLADLLLLL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB9 LLPFKIIEAASNFRWYLPKVVCALTSFGFYSSIYCSTWLLAGISIERYLGVAFPVQYKLS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 LLPFKIIEAASNFRWYLPKVVCALTSFGFYSSIYCSTWLLAGISIERYLGVAFPVQYKLS 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB9 RRPLYGVIAALVAWVMSFGHCTIVIIVQYLNTTEQVRSGNEITCYENFTDNQLDVVLPVR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 RRPLYGVIAALVAWVMSFGHCTIVIIVQYLNTTEQVRSGNEITCYENFTDNQLDVVLPVR 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB9 LELCLVLFFIPMAVTIFCYWRFVWIMLSQPHVGAQRRRRAVGLAVVTLLNFLVCFGPYNV :::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 LELCLVLFFIPMAVTIFCYWRFVWIMLSQPLVGAQRRRRAVGLAVVTLLNFLVCFGPYNV 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB9 SHLVGYHQRKSPWWRSIAVVFSSLNASLDPLLFYFSSSVVRRAFGRGLQVLRNQGSSLLG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 SHLVGYHQRKSPWWRSIAVVFSSLNASLDPLLFYFSSSVVRRAFGRGLQVLRNQGSSLLG 250 260 270 280 290 300 310 320 330 pF1KB9 RRGKDTAEGTNEDRGVGQGEGMPSSDFTTE :::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 RRGKDTAEGTNEDRGVGQGEGMPSSDFTTE 310 320 330 >>CCDS12459.1 FFAR3 gene_id:2865|Hs108|chr19 (346 aa) initn: 656 init1: 322 opt: 857 Z-score: 838.1 bits: 163.5 E(32554): 2.3e-40 Smith-Waterman score: 857; 42.9% identity (75.5% similar) in 310 aa overlap (9-315:16-314) 10 20 30 40 50 pF1KB9 MLPDWKSSLILMAYIIIFLTGLPANLLALRAFVGRIRQPQPAPVHILLLSLTL ... .:.. ::.::: ::::: .:::.. : .:. : .:::.:: CCDS12 MDTGPDQSYFSGNHWFVFSVYLLTFLVGLPLNLLALVVFVGKL-QRRPVAVDVLLLNLTA 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB9 ADLLLLLLLPFKIIEAASNFRWYLPKVVCALTSFGFYSSIYCSTWLLAGISIERYLGVAF .::::::.:::...:::....: :: ..: :..: :...:: .. .::..::::.:.:: CCDS12 SDLLLLLFLPFRMVEAANGMHWPLPFILCPLSGFIFFTTIYLTALFLAAVSIERFLSVAH 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB9 PVQYKLSRRPLYGV--IAALVAWVMSFGHCTIVIIVQYLNTTEQVRSGNEITCYENFTDN :. :: :: : ..... :... .::..: .... . . .:.. ::: .: . CCDS12 PLWYKT--RPRLGQAGLVSVACWLLASAHCSVVYVIEFSGDISH-SQGTNGTCYLEFRKD 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB9 QLDVVLPVRLELCLVLFFIPMAVTIFCYWRFVWIMLSQPHVGAQRR-RRAVGLAVVTLLN :: ..::::::. .::: .:. .: .:: :.:::. . :..:: ::..:: ..:::: CCDS12 QLAILLPVRLEMAVVLFVVPLIITSYCYSRLVWIL---GRGGSHRRQRRVAGLLAATLLN 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB9 FLVCFGPYNVSHLVGYHQRKSPWWRSIAVVFSSLNASLDPLLFYFSSSVVRRAFGRGLQV ::::::::::::.::: .:: :: ....:.::. .::...::::: . : . :. CCDS12 FLVCFGPYNVSHVVGYICGESPAWRIYVTLLSTLNSCVDPFVYYFSSSGFQADFHELLRR 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 pF1KB9 LRNQGSSLLGRRGKDTAEGTNEDRGVGQGEGMPSSDFTTE : .: :. .... .:..: CCDS12 L----CGLWGQWQQESSMELKEQKGGEEQRADRPAERKTSEHSQGCGTGGQVACAES 300 310 320 330 340 >>CCDS14115.1 P2RY8 gene_id:286530|Hs108|chrX (359 aa) initn: 395 init1: 226 opt: 443 Z-score: 440.5 bits: 89.9 E(32554): 3.3e-18 Smith-Waterman score: 443; 30.5% identity (65.5% similar) in 275 aa overlap (12-277:28-297) 10 20 30 40 pF1KB9 MLPDWKSSLILMAYIIIFLTGLPANLLALRAFVGRIRQPQPAPV ..: .. ...:.::..: .. :. :. .: CCDS14 MQVPNSTGPDNATLQMLRNPAIAVALPVVYSLVAAVSIPGNLFSLWVLCRRM-GPR-SPS 10 20 30 40 50 50 60 70 80 90 100 pF1KB9 HILLLSLTLADLLLLLLLPFKIIEAASNFRWYLPKVVCALTSFGFYSSIYCSTWLLAGIS :....:...::.: .:::.: . .: . ..: ... .::...: : .. :: CCDS14 VIFMINLSVTDLMLASVLPFQIYYHCNRHHWVFGVLLCNVVTVAFYANMYSSILTMTCIS 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KB9 IERYLGVAFPVQYKLSRRPLYGVIAALVAWVMSFGHCTIVIIVQYLNTTEQVRSGNEITC .::.::: .:.. : :: :.: : .:.. . : . . . : :.. . ::: CCDS14 VERFLGVLYPLSSKRWRRRRYAVAACAGTWLLLL---TALSPLARTDLTYPVHALGIITC 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KB9 YENFTDNQLDVVL--PVRL-ELCLVLFFIPMAVTIFCYWRFVWIMLSQPHV-GAQRRRRA .. . ..: : : : . ..::.::...:. :: . .: .. : ..:::: CCDS14 FDVLKWTMLPSVAMWAVFLFTIFILLFLIPFVITVACYTATILKLLRTEEAHGREQRRRA 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 pF1KB9 VGLAVVTLLNFLVCFGPYN---VSHLVG--YHQRKSPWWRSIAVVFSSLNASLDPLLFYF ::::.:.:: :..::.: : ..:.:. .. .. .... .: :: :::...:: CCDS14 VGLAAVVLLAFVTCFAPNNFVLLAHIVSRLFYGKSYYHVYKLTLCLSCLNNCLDPFVYYF 240 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 330 pF1KB9 SSSVVRRAFGRGLQVLRNQGSSLLGRRGKDTAEGTNEDRGVGQGEGMPSSDFTTE .: CCDS14 ASREFQLRLREYLGCRRVPRDTLDTRRESLFSARTTSVRSEAGAHPEGMEGATRPGLQRQ 300 310 320 330 340 350 >>CCDS14115.1 P2RY8 gene_id:286530|Hs108|chrY (359 aa) initn: 395 init1: 226 opt: 443 Z-score: 440.5 bits: 89.9 E(32554): 3.3e-18 Smith-Waterman score: 443; 30.5% identity (65.5% similar) in 275 aa overlap (12-277:28-297) 10 20 30 40 pF1KB9 MLPDWKSSLILMAYIIIFLTGLPANLLALRAFVGRIRQPQPAPV ..: .. ...:.::..: .. :. :. .: CCDS14 MQVPNSTGPDNATLQMLRNPAIAVALPVVYSLVAAVSIPGNLFSLWVLCRRM-GPR-SPS 10 20 30 40 50 50 60 70 80 90 100 pF1KB9 HILLLSLTLADLLLLLLLPFKIIEAASNFRWYLPKVVCALTSFGFYSSIYCSTWLLAGIS :....:...::.: .:::.: . .: . ..: ... .::...: : .. :: CCDS14 VIFMINLSVTDLMLASVLPFQIYYHCNRHHWVFGVLLCNVVTVAFYANMYSSILTMTCIS 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KB9 IERYLGVAFPVQYKLSRRPLYGVIAALVAWVMSFGHCTIVIIVQYLNTTEQVRSGNEITC .::.::: .:.. : :: :.: : .:.. . : . . . : :.. . ::: CCDS14 VERFLGVLYPLSSKRWRRRRYAVAACAGTWLLLL---TALSPLARTDLTYPVHALGIITC 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KB9 YENFTDNQLDVVL--PVRL-ELCLVLFFIPMAVTIFCYWRFVWIMLSQPHV-GAQRRRRA .. . ..: : : : . ..::.::...:. :: . .: .. : ..:::: CCDS14 FDVLKWTMLPSVAMWAVFLFTIFILLFLIPFVITVACYTATILKLLRTEEAHGREQRRRA 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 pF1KB9 VGLAVVTLLNFLVCFGPYN---VSHLVG--YHQRKSPWWRSIAVVFSSLNASLDPLLFYF ::::.:.:: :..::.: : ..:.:. .. .. .... .: :: :::...:: CCDS14 VGLAAVVLLAFVTCFAPNNFVLLAHIVSRLFYGKSYYHVYKLTLCLSCLNNCLDPFVYYF 240 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 330 pF1KB9 SSSVVRRAFGRGLQVLRNQGSSLLGRRGKDTAEGTNEDRGVGQGEGMPSSDFTTE .: CCDS14 ASREFQLRLREYLGCRRVPRDTLDTRRESLFSARTTSVRSEAGAHPEGMEGATRPGLQRQ 300 310 320 330 340 350 >>CCDS4032.1 F2R gene_id:2149|Hs108|chr5 (425 aa) initn: 332 init1: 156 opt: 427 Z-score: 424.2 bits: 87.2 E(32554): 2.6e-17 Smith-Waterman score: 427; 27.5% identity (62.5% similar) in 291 aa overlap (1-282:96-380) 10 20 30 pF1KB9 MLPDWKSSLILMAYIIIFLTGLPANLLALR . .: . .. .: .:...:: :..:. CCDS40 LTEYRLVSINKSSPLQKQLPAFISEDASGYLTSSWLTLFVPSVYTGVFVVSLPLNIMAIV 70 80 90 100 110 120 40 50 60 70 80 90 pF1KB9 AFVGRIRQPQPAPVHILLLSLTLADLLLLLLLPFKIIEAASNFRWYLPKVVCALTSFGFY .:. ... .:: :. .: :. ::.:.. .::::: :. : . . .: ... .:: CCDS40 VFILKMKVKKPAVVY--MLHLATADVLFVSVLPFKISYYFSGSDWQFGSELCRFVTAAFY 130 140 150 160 170 180 100 110 120 130 140 pF1KB9 SSIYCSTWLLAGISIERYLGVAFPVQYKLSRRPL-YGVIAALVAWVMSFGHCTIVIIVQY ..: : :.. :::.:.:.:..:.: .:: : : . .. :. :..... :. . CCDS40 CNMYASILLMTVISIDRFLAVVYPMQ-SLSWRTLGRASFTCLAIWALAIAG---VVPLLL 190 200 210 220 230 150 160 170 180 190 200 pF1KB9 LNTTEQVRSGNEITCYENFTDNQLDVVLPVRLE-LCLVLFFIPMAVTIFCYWRFVWIMLS . : :: . : ::.. .... :. . . :.::.:. .. :: .. . : CCDS40 KEQTIQVPGLNITTCHDVLNETLLEGYYAYYFSAFSAVFFFVPLIISTVCYVSIIRCLSS 240 250 260 270 280 290 210 220 230 240 250 260 pF1KB9 QPHVGAQRRRRAVGLAVVTLLNFLVCFGPYNVSHLVGY----HQRKSP---WWRSIAVVF . .. ... ::. :..... :..:::: :: .. : : . . . : CCDS40 SAVANRSKKSRALFLSAAVFCIFIICFGPTNVLLIAHYSFLSHTSTTEAAYFAYLLCVCV 300 310 320 330 340 350 270 280 290 300 310 320 pF1KB9 SSLNASLDPLLFYFSSSVVRRAFGRGLQVLRNQGSSLLGRRGKDTAEGTNEDRGVGQGEG ::.. .:::..:..:: .: CCDS40 SSISCCIDPLIYYYASSECQRYVYSILCCKESSDPSSYNSSGQLMASKMDTCSSNLNNSI 360 370 380 390 400 410 >>CCDS12458.1 FFAR1 gene_id:2864|Hs108|chr19 (300 aa) initn: 370 init1: 213 opt: 424 Z-score: 423.1 bits: 86.5 E(32554): 3e-17 Smith-Waterman score: 438; 30.5% identity (60.7% similar) in 308 aa overlap (4-295:2-295) 10 20 30 40 50 60 pF1KB9 MLPDWKSSLILMAYIIIFLTGLPANLLALRAFVGRIRQPQPAPVHILLLSLTLADLLLLL : .: . :. : :.: :.::.:. ... : . .: . :.: .:::: . CCDS12 MDLPPQLSFGLYVAAFALGFPLNVLAIRGATAHARL-RLTPSLVYALNLGCSDLLLTV 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KB9 LLPFKIIEAASNFRWYLPKVVCALTSFGFYSSIYCSTWLLAGISIERYLGVAFPVQYKLS ::.: .:: .. : :: .: . . . . .: . .::..: ::::.:::. :. CCDS12 SLPLKAVEALASGAWPLPASLCPVFAVAHFFPLYAGGGFLAALSAGRYLGAAFPLGYQAF 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 pF1KB9 RRPLY--GVIAALVAWVMSFGHCTIVIIVQ-------YLNTTEQVRS---GNEITCYENF ::: : :: ::. :.. . : .:. .. . ::. . . :. . : : . CCDS12 RRPCYSWGVCAAI--WALVLCHLGLVFGLEAPGGWLDHSNTSLGINTPVNGSPV-CLEAW 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KB9 TDNQLDVVLPVRLELCLVLFFIPMAVTIFCYWRFVWIMLSQPHVGAQRRRRAVGLAVVTL . :.:. : :.:::.:.:.: ::: . :.. . .:. ::. .: .: CCDS12 DPASAG---PARFSLSLLLFFLPLAITAFCYVGCLRA-LARSGLTHRRKLRAAWVAGGAL 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KB9 LNFLVCFGPYNVSHLVGY-HQRKSPWWRSIAVVFSSLNASLDPLLFYFSSSVVRRAFGRG :..:.: ::::.:..... . . ::..... .. .. :.::. .. . : : : CCDS12 LTLLLCVGPYNASNVASFLYPNLGGSWRKLGLITGAWSVVLNPLV----TGYLGR--GPG 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 pF1KB9 LQVL---RNQGSSLLGRRGKDTAEGTNEDRGVGQGEGMPSSDFTTE :... :.:: CCDS12 LKTVCAARTQGGKSQK 290 300 >>CCDS318.1 PTAFR gene_id:5724|Hs108|chr1 (342 aa) initn: 359 init1: 260 opt: 392 Z-score: 391.7 bits: 80.8 E(32554): 1.7e-15 Smith-Waterman score: 416; 26.2% identity (60.5% similar) in 309 aa overlap (1-293:9-313) 10 20 30 40 50 pF1KB9 MLPDWKSSLILMAYIIIFLTGLPANLLALRAFVGRIRQPQPAPVHILLLSLT : ... .:. ..: :::. :. :: .: .:. . ..:....:: CCDS31 MEPHDSSHMDSEFRYTLFPIVYSIIFVLGVIANGYVLWVFARLYPCKKFNEIKIFMVNLT 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KB9 LADLLLLLLLPFKIIEAASNFRWYLPKVVCALTSFGFYSSIYCSTWLLAGISIERYLGVA .::.:.:. ::. :. .. : ::: .: ... :. . :::. .:. :. .:. .:. CCDS31 MADMLFLITLPLWIVYYQNQGNWILPKFLCNVAGCLFFINTYCSVAFLGVITYNRFQAVT 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KB9 FPVQYKLSRRPLYGVIAALVAWVMSFGHCTIVIIVQYLNTT-EQVRSGNEITCYENFTDN :.. . :. .:: :: : . .:.. ::. ... ::: :.:.. . CCDS31 RPIKTAQANTRKRGISLSLVIWVAIVGAASYFLILDSTNTVPDSAGSGNVTRCFEHYEKG 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 pF1KB9 QLDVVLPVRLELCLVL-FFIPMAVTIFCYWRFVWIMLSQPHVGAQR----RRRAVGLAVV .. :.. ... .:. ::. . . .:: .. .: :: : :: .:::. .. . CCDS31 SVPVLI---IHIFIVFSFFLVFLIILFCNLVIIRTLLMQP-VQQQRNAEVKRRALWMVCT 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 pF1KB9 TLLNFLVCFGPYNVSHL------VGYHQRKSPWW----RSIAVVFSSLNASLDPLLFYFS .: :..:: :..: .: .:... : ..... . : : :::... : CCDS31 VLAVFIICFVPHHVVQLPWTLAELGFQDSKFHQAINDAHQVTLCLLSTNCVLDPVIYCFL 240 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 330 pF1KB9 SSVVRRAFGRGLQVLRNQGSSLLGRRGKDTAEGTNEDRGVGQGEGMPSSDFTTE .. :. . . . .:. 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