FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9828, 330 aa
1>>>pF1KB9828 330 - 330 aa - 330 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2307+/-0.000861; mu= 16.0372+/- 0.051
mean_var=108.4848+/-32.034, 0's: 0 Z-trim(106.4): 261 B-trim: 1053 in 2/48
Lambda= 0.123137
statistics sampled from 8519 (8940) to 8519 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.625), E-opt: 0.2 (0.275), width: 16
Scan time: 2.680
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12461.1 FFAR2 gene_id:2867|Hs108|chr19 ( 330) 2187 399.7 1.7e-111
CCDS12459.1 FFAR3 gene_id:2865|Hs108|chr19 ( 346) 857 163.5 2.3e-40
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CCDS14115.1 P2RY8 gene_id:286530|Hs108|chrY ( 359) 443 89.9 3.3e-18
CCDS4032.1 F2R gene_id:2149|Hs108|chr5 ( 425) 427 87.2 2.6e-17
CCDS12458.1 FFAR1 gene_id:2864|Hs108|chr19 ( 300) 424 86.5 3e-17
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CCDS4031.1 F2RL2 gene_id:2151|Hs108|chr5 ( 374) 376 78.1 1.3e-14
CCDS12350.1 F2RL3 gene_id:9002|Hs108|chr19 ( 385) 374 77.7 1.7e-14
CCDS14398.1 P2RY4 gene_id:5030|Hs108|chrX ( 365) 373 77.5 1.8e-14
CCDS4033.1 F2RL1 gene_id:2150|Hs108|chr5 ( 397) 372 77.4 2.2e-14
CCDS14439.1 CYSLTR1 gene_id:10800|Hs108|chrX ( 337) 351 73.6 2.6e-13
CCDS8553.1 LPAR5 gene_id:57121|Hs108|chr12 ( 372) 351 73.6 2.8e-13
CCDS7950.1 APLNR gene_id:187|Hs108|chr11 ( 380) 341 71.8 9.6e-13
CCDS9482.1 OXGR1 gene_id:27199|Hs108|chr13 ( 337) 339 71.4 1.1e-12
CCDS14441.1 LPAR4 gene_id:2846|Hs108|chrX ( 370) 327 69.3 5.3e-12
CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14 ( 391) 326 69.2 6.2e-12
CCDS3169.1 P2RY1 gene_id:5028|Hs108|chr3 ( 373) 322 68.5 9.9e-12
CCDS2148.1 GPR17 gene_id:2840|Hs108|chr2 ( 367) 321 68.3 1.1e-11
CCDS8219.1 P2RY2 gene_id:5029|Hs108|chr11 ( 377) 321 68.3 1.1e-11
CCDS12669.1 GPR4 gene_id:2828|Hs108|chr19 ( 362) 319 67.9 1.4e-11
CCDS9491.1 GPR18 gene_id:2841|Hs108|chr13 ( 331) 318 67.7 1.5e-11
CCDS10429.1 SSTR5 gene_id:6755|Hs108|chr16 ( 364) 310 66.3 4.3e-11
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CCDS9879.1 GPR65 gene_id:8477|Hs108|chr14 ( 337) 309 66.1 4.6e-11
CCDS5298.1 CCR6 gene_id:1235|Hs108|chr6 ( 374) 304 65.3 9.1e-11
>>CCDS12461.1 FFAR2 gene_id:2867|Hs108|chr19 (330 aa)
initn: 2187 init1: 2187 opt: 2187 Z-score: 2115.3 bits: 399.7 E(32554): 1.7e-111
Smith-Waterman score: 2187; 99.7% identity (99.7% similar) in 330 aa overlap (1-330:1-330)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MLPDWKSSLILMAYIIIFLTGLPANLLALRAFVGRIRQPQPAPVHILLLSLTLADLLLLL
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CCDS12 MLPDWKSSLILMAYIIIFLTGLPANLLALRAFVGRIRQPQPAPVHILLLSLTLADLLLLL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 LLPFKIIEAASNFRWYLPKVVCALTSFGFYSSIYCSTWLLAGISIERYLGVAFPVQYKLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LLPFKIIEAASNFRWYLPKVVCALTSFGFYSSIYCSTWLLAGISIERYLGVAFPVQYKLS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 RRPLYGVIAALVAWVMSFGHCTIVIIVQYLNTTEQVRSGNEITCYENFTDNQLDVVLPVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RRPLYGVIAALVAWVMSFGHCTIVIIVQYLNTTEQVRSGNEITCYENFTDNQLDVVLPVR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 LELCLVLFFIPMAVTIFCYWRFVWIMLSQPHVGAQRRRRAVGLAVVTLLNFLVCFGPYNV
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CCDS12 LELCLVLFFIPMAVTIFCYWRFVWIMLSQPLVGAQRRRRAVGLAVVTLLNFLVCFGPYNV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 SHLVGYHQRKSPWWRSIAVVFSSLNASLDPLLFYFSSSVVRRAFGRGLQVLRNQGSSLLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SHLVGYHQRKSPWWRSIAVVFSSLNASLDPLLFYFSSSVVRRAFGRGLQVLRNQGSSLLG
250 260 270 280 290 300
310 320 330
pF1KB9 RRGKDTAEGTNEDRGVGQGEGMPSSDFTTE
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RRGKDTAEGTNEDRGVGQGEGMPSSDFTTE
310 320 330
>>CCDS12459.1 FFAR3 gene_id:2865|Hs108|chr19 (346 aa)
initn: 656 init1: 322 opt: 857 Z-score: 838.1 bits: 163.5 E(32554): 2.3e-40
Smith-Waterman score: 857; 42.9% identity (75.5% similar) in 310 aa overlap (9-315:16-314)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MLPDWKSSLILMAYIIIFLTGLPANLLALRAFVGRIRQPQPAPVHILLLSLTL
... .:.. ::.::: ::::: .:::.. : .:. : .:::.::
CCDS12 MDTGPDQSYFSGNHWFVFSVYLLTFLVGLPLNLLALVVFVGKL-QRRPVAVDVLLLNLTA
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 ADLLLLLLLPFKIIEAASNFRWYLPKVVCALTSFGFYSSIYCSTWLLAGISIERYLGVAF
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CCDS12 SDLLLLLFLPFRMVEAANGMHWPLPFILCPLSGFIFFTTIYLTALFLAAVSIERFLSVAH
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 PVQYKLSRRPLYGV--IAALVAWVMSFGHCTIVIIVQYLNTTEQVRSGNEITCYENFTDN
:. :: :: : ..... :... .::..: .... . . .:.. ::: .: .
CCDS12 PLWYKT--RPRLGQAGLVSVACWLLASAHCSVVYVIEFSGDISH-SQGTNGTCYLEFRKD
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 QLDVVLPVRLELCLVLFFIPMAVTIFCYWRFVWIMLSQPHVGAQRR-RRAVGLAVVTLLN
:: ..::::::. .::: .:. .: .:: :.:::. . :..:: ::..:: ..::::
CCDS12 QLAILLPVRLEMAVVLFVVPLIITSYCYSRLVWIL---GRGGSHRRQRRVAGLLAATLLN
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 FLVCFGPYNVSHLVGYHQRKSPWWRSIAVVFSSLNASLDPLLFYFSSSVVRRAFGRGLQV
::::::::::::.::: .:: :: ....:.::. .::...::::: . : . :.
CCDS12 FLVCFGPYNVSHVVGYICGESPAWRIYVTLLSTLNSCVDPFVYYFSSSGFQADFHELLRR
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330
pF1KB9 LRNQGSSLLGRRGKDTAEGTNEDRGVGQGEGMPSSDFTTE
: .: :. .... .:..:
CCDS12 L----CGLWGQWQQESSMELKEQKGGEEQRADRPAERKTSEHSQGCGTGGQVACAES
300 310 320 330 340
>>CCDS14115.1 P2RY8 gene_id:286530|Hs108|chrX (359 aa)
initn: 395 init1: 226 opt: 443 Z-score: 440.5 bits: 89.9 E(32554): 3.3e-18
Smith-Waterman score: 443; 30.5% identity (65.5% similar) in 275 aa overlap (12-277:28-297)
10 20 30 40
pF1KB9 MLPDWKSSLILMAYIIIFLTGLPANLLALRAFVGRIRQPQPAPV
..: .. ...:.::..: .. :. :. .:
CCDS14 MQVPNSTGPDNATLQMLRNPAIAVALPVVYSLVAAVSIPGNLFSLWVLCRRM-GPR-SPS
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KB9 HILLLSLTLADLLLLLLLPFKIIEAASNFRWYLPKVVCALTSFGFYSSIYCSTWLLAGIS
:....:...::.: .:::.: . .: . ..: ... .::...: : .. ::
CCDS14 VIFMINLSVTDLMLASVLPFQIYYHCNRHHWVFGVLLCNVVTVAFYANMYSSILTMTCIS
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110 120 130 140 150 160
pF1KB9 IERYLGVAFPVQYKLSRRPLYGVIAALVAWVMSFGHCTIVIIVQYLNTTEQVRSGNEITC
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CCDS14 VERFLGVLYPLSSKRWRRRRYAVAACAGTWLLLL---TALSPLARTDLTYPVHALGIITC
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 YENFTDNQLDVVL--PVRL-ELCLVLFFIPMAVTIFCYWRFVWIMLSQPHV-GAQRRRRA
.. . ..: : : : . ..::.::...:. :: . .: .. : ..::::
CCDS14 FDVLKWTMLPSVAMWAVFLFTIFILLFLIPFVITVACYTATILKLLRTEEAHGREQRRRA
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270
pF1KB9 VGLAVVTLLNFLVCFGPYN---VSHLVG--YHQRKSPWWRSIAVVFSSLNASLDPLLFYF
::::.:.:: :..::.: : ..:.:. .. .. .... .: :: :::...::
CCDS14 VGLAAVVLLAFVTCFAPNNFVLLAHIVSRLFYGKSYYHVYKLTLCLSCLNNCLDPFVYYF
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 SSSVVRRAFGRGLQVLRNQGSSLLGRRGKDTAEGTNEDRGVGQGEGMPSSDFTTE
.:
CCDS14 ASREFQLRLREYLGCRRVPRDTLDTRRESLFSARTTSVRSEAGAHPEGMEGATRPGLQRQ
300 310 320 330 340 350
>>CCDS14115.1 P2RY8 gene_id:286530|Hs108|chrY (359 aa)
initn: 395 init1: 226 opt: 443 Z-score: 440.5 bits: 89.9 E(32554): 3.3e-18
Smith-Waterman score: 443; 30.5% identity (65.5% similar) in 275 aa overlap (12-277:28-297)
10 20 30 40
pF1KB9 MLPDWKSSLILMAYIIIFLTGLPANLLALRAFVGRIRQPQPAPV
..: .. ...:.::..: .. :. :. .:
CCDS14 MQVPNSTGPDNATLQMLRNPAIAVALPVVYSLVAAVSIPGNLFSLWVLCRRM-GPR-SPS
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KB9 HILLLSLTLADLLLLLLLPFKIIEAASNFRWYLPKVVCALTSFGFYSSIYCSTWLLAGIS
:....:...::.: .:::.: . .: . ..: ... .::...: : .. ::
CCDS14 VIFMINLSVTDLMLASVLPFQIYYHCNRHHWVFGVLLCNVVTVAFYANMYSSILTMTCIS
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110 120 130 140 150 160
pF1KB9 IERYLGVAFPVQYKLSRRPLYGVIAALVAWVMSFGHCTIVIIVQYLNTTEQVRSGNEITC
.::.::: .:.. : :: :.: : .:.. . : . . . : :.. . :::
CCDS14 VERFLGVLYPLSSKRWRRRRYAVAACAGTWLLLL---TALSPLARTDLTYPVHALGIITC
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 YENFTDNQLDVVL--PVRL-ELCLVLFFIPMAVTIFCYWRFVWIMLSQPHV-GAQRRRRA
.. . ..: : : : . ..::.::...:. :: . .: .. : ..::::
CCDS14 FDVLKWTMLPSVAMWAVFLFTIFILLFLIPFVITVACYTATILKLLRTEEAHGREQRRRA
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270
pF1KB9 VGLAVVTLLNFLVCFGPYN---VSHLVG--YHQRKSPWWRSIAVVFSSLNASLDPLLFYF
::::.:.:: :..::.: : ..:.:. .. .. .... .: :: :::...::
CCDS14 VGLAAVVLLAFVTCFAPNNFVLLAHIVSRLFYGKSYYHVYKLTLCLSCLNNCLDPFVYYF
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 SSSVVRRAFGRGLQVLRNQGSSLLGRRGKDTAEGTNEDRGVGQGEGMPSSDFTTE
.:
CCDS14 ASREFQLRLREYLGCRRVPRDTLDTRRESLFSARTTSVRSEAGAHPEGMEGATRPGLQRQ
300 310 320 330 340 350
>>CCDS4032.1 F2R gene_id:2149|Hs108|chr5 (425 aa)
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Smith-Waterman score: 427; 27.5% identity (62.5% similar) in 291 aa overlap (1-282:96-380)
10 20 30
pF1KB9 MLPDWKSSLILMAYIIIFLTGLPANLLALR
. .: . .. .: .:...:: :..:.
CCDS40 LTEYRLVSINKSSPLQKQLPAFISEDASGYLTSSWLTLFVPSVYTGVFVVSLPLNIMAIV
70 80 90 100 110 120
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 AFVGRIRQPQPAPVHILLLSLTLADLLLLLLLPFKIIEAASNFRWYLPKVVCALTSFGFY
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CCDS40 VFILKMKVKKPAVVY--MLHLATADVLFVSVLPFKISYYFSGSDWQFGSELCRFVTAAFY
130 140 150 160 170 180
100 110 120 130 140
pF1KB9 SSIYCSTWLLAGISIERYLGVAFPVQYKLSRRPL-YGVIAALVAWVMSFGHCTIVIIVQY
..: : :.. :::.:.:.:..:.: .:: : : . .. :. :..... :. .
CCDS40 CNMYASILLMTVISIDRFLAVVYPMQ-SLSWRTLGRASFTCLAIWALAIAG---VVPLLL
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pF1KB9 LNTTEQVRSGNEITCYENFTDNQLDVVLPVRLE-LCLVLFFIPMAVTIFCYWRFVWIMLS
. : :: . : ::.. .... :. . . :.::.:. .. :: .. . :
CCDS40 KEQTIQVPGLNITTCHDVLNETLLEGYYAYYFSAFSAVFFFVPLIISTVCYVSIIRCLSS
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210 220 230 240 250 260
pF1KB9 QPHVGAQRRRRAVGLAVVTLLNFLVCFGPYNVSHLVGY----HQRKSP---WWRSIAVVF
. .. ... ::. :..... :..:::: :: .. : : . . . :
CCDS40 SAVANRSKKSRALFLSAAVFCIFIICFGPTNVLLIAHYSFLSHTSTTEAAYFAYLLCVCV
300 310 320 330 340 350
270 280 290 300 310 320
pF1KB9 SSLNASLDPLLFYFSSSVVRRAFGRGLQVLRNQGSSLLGRRGKDTAEGTNEDRGVGQGEG
::.. .:::..:..:: .:
CCDS40 SSISCCIDPLIYYYASSECQRYVYSILCCKESSDPSSYNSSGQLMASKMDTCSSNLNNSI
360 370 380 390 400 410
>>CCDS12458.1 FFAR1 gene_id:2864|Hs108|chr19 (300 aa)
initn: 370 init1: 213 opt: 424 Z-score: 423.1 bits: 86.5 E(32554): 3e-17
Smith-Waterman score: 438; 30.5% identity (60.7% similar) in 308 aa overlap (4-295:2-295)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MLPDWKSSLILMAYIIIFLTGLPANLLALRAFVGRIRQPQPAPVHILLLSLTLADLLLLL
: .: . :. : :.: :.::.:. ... : . .: . :.: .:::: .
CCDS12 MDLPPQLSFGLYVAAFALGFPLNVLAIRGATAHARL-RLTPSLVYALNLGCSDLLLTV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 LLPFKIIEAASNFRWYLPKVVCALTSFGFYSSIYCSTWLLAGISIERYLGVAFPVQYKLS
::.: .:: .. : :: .: . . . . .: . .::..: ::::.:::. :.
CCDS12 SLPLKAVEALASGAWPLPASLCPVFAVAHFFPLYAGGGFLAALSAGRYLGAAFPLGYQAF
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160
pF1KB9 RRPLY--GVIAALVAWVMSFGHCTIVIIVQ-------YLNTTEQVRS---GNEITCYENF
::: : :: ::. :.. . : .:. .. . ::. . . :. . : : .
CCDS12 RRPCYSWGVCAAI--WALVLCHLGLVFGLEAPGGWLDHSNTSLGINTPVNGSPV-CLEAW
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 TDNQLDVVLPVRLELCLVLFFIPMAVTIFCYWRFVWIMLSQPHVGAQRRRRAVGLAVVTL
. :.:. : :.:::.:.:.: ::: . :.. . .:. ::. .: .:
CCDS12 DPASAG---PARFSLSLLLFFLPLAITAFCYVGCLRA-LARSGLTHRRKLRAAWVAGGAL
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB9 LNFLVCFGPYNVSHLVGY-HQRKSPWWRSIAVVFSSLNASLDPLLFYFSSSVVRRAFGRG
:..:.: ::::.:..... . . ::..... .. .. :.::. .. . : : :
CCDS12 LTLLLCVGPYNASNVASFLYPNLGGSWRKLGLITGAWSVVLNPLV----TGYLGR--GPG
240 250 260 270 280
290 300 310 320 330
pF1KB9 LQVL---RNQGSSLLGRRGKDTAEGTNEDRGVGQGEGMPSSDFTTE
:... :.::
CCDS12 LKTVCAARTQGGKSQK
290 300
>>CCDS318.1 PTAFR gene_id:5724|Hs108|chr1 (342 aa)
initn: 359 init1: 260 opt: 392 Z-score: 391.7 bits: 80.8 E(32554): 1.7e-15
Smith-Waterman score: 416; 26.2% identity (60.5% similar) in 309 aa overlap (1-293:9-313)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MLPDWKSSLILMAYIIIFLTGLPANLLALRAFVGRIRQPQPAPVHILLLSLT
: ... .:. ..: :::. :. :: .: .:. . ..:....::
CCDS31 MEPHDSSHMDSEFRYTLFPIVYSIIFVLGVIANGYVLWVFARLYPCKKFNEIKIFMVNLT
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 LADLLLLLLLPFKIIEAASNFRWYLPKVVCALTSFGFYSSIYCSTWLLAGISIERYLGVA
.::.:.:. ::. :. .. : ::: .: ... :. . :::. .:. :. .:. .:.
CCDS31 MADMLFLITLPLWIVYYQNQGNWILPKFLCNVAGCLFFINTYCSVAFLGVITYNRFQAVT
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 FPVQYKLSRRPLYGVIAALVAWVMSFGHCTIVIIVQYLNTT-EQVRSGNEITCYENFTDN
:.. . :. .:: :: : . .:.. ::. ... ::: :.:.. .
CCDS31 RPIKTAQANTRKRGISLSLVIWVAIVGAASYFLILDSTNTVPDSAGSGNVTRCFEHYEKG
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220
pF1KB9 QLDVVLPVRLELCLVL-FFIPMAVTIFCYWRFVWIMLSQPHVGAQR----RRRAVGLAVV
.. :.. ... .:. ::. . . .:: .. .: :: : :: .:::. .. .
CCDS31 SVPVLI---IHIFIVFSFFLVFLIILFCNLVIIRTLLMQP-VQQQRNAEVKRRALWMVCT
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.: :..:: :..: .: .:... : ..... . : : :::... :
CCDS31 VLAVFIICFVPHHVVQLPWTLAELGFQDSKFHQAINDAHQVTLCLLSTNCVLDPVIYCFL
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280 290 300 310 320 330
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.. :. . . . .:.
CCDS31 TKKFRKHLTEKFYSMRSSRKCSRATTDTVTEVVVPFNQIPGNSLKN
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::.:... :
CCDS58 DPFLYFLMSKTRNHSTAYLTK
340 350
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10 20 30
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CCDS40 ITVKIKCPEESASHLHVKNATMGYLTSSLSTKLIPAIYLLVFVVGVPANAVTLWMLFFRT
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CCDS40 RSICTT---VFYTNLAIADFLFCVTLPFKIAYHLNGNNWVFGEVLCRATTVIFYGNMYCS
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CCDS40 ILLLACISINRYLAIVHPFTYRGLPKHTYALVTCGLVWATVFLYMLPFFI---LKQEYYL
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CCDS40 -RWLWYVKASLLILVIFTICFAPSNIILIIHHANYYYNNTDGLYFIYLIALCLGSLNSCL
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CCDS40 DPFLYFLMSKTRNHSTAYLTK
360 370
>>CCDS12350.1 F2RL3 gene_id:9002|Hs108|chr19 (385 aa)
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10 20
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CCDS12 PSILPAPRGYPGQVCANDSDTLELPDSSRALLLGWVPTRLVPALYGLVLVVGLPANGLAL
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CCDS12 --WVLATQAPR-LPSTMLLMNLAAADLLLALALPPRIAYHLRGQRWPFGEAACRLATAAL
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CCDS12 YGHMYGSVLLLAAVSLDRYLALVHPLRARALRGRRLALGLCMAAWLMA-AALALPLTLQR
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CCDS12 -QTFRLARS-DRVLCHDALPLDAQASHWQPAFTCLALLGCFLPLLAMLLCYG----ATLH
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CCDS12 TLNSCVDPFIYYYVSAEFRDKVRAGL-FQRSPGDTVA---SKASAEGGS--RGMGTHSSL
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CCDS12 LQ
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18511270 residues in 32554 library sequences
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start: Fri Nov 4 19:31:33 2016 done: Fri Nov 4 19:31:34 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]